FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0886, 323 aa
1>>>pF1KE0886 323 - 323 aa - 323 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6738+/-0.000484; mu= 20.0350+/- 0.030
mean_var=102.9513+/-27.440, 0's: 0 Z-trim(108.8): 324 B-trim: 1013 in 1/50
Lambda= 0.126403
statistics sampled from 16503 (16928) to 16503 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 6.120
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 739 146.0 9.6e-35
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 739 146.0 9.6e-35
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 739 146.0 9.8e-35
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 674 134.2 3.7e-31
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 637 127.4 3.8e-29
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 532 108.2 2.2e-23
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 532 108.3 2.2e-23
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 529 107.7 3.3e-23
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 525 107.0 5.4e-23
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 523 106.6 6.9e-23
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 518 105.7 1.3e-22
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 503 103.0 8.8e-22
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 503 103.0 8.8e-22
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 503 103.0 8.8e-22
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 490 100.6 4.5e-21
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 487 100.0 6.6e-21
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 477 98.2 2.3e-20
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 425 88.7 1.6e-17
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 386 81.6 2.3e-15
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 375 79.6 9.4e-15
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 374 79.4 1e-14
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 208 49.4 1.6e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 191 46.1 0.00012
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 177 43.6 0.00074
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 177 43.6 0.00074
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 177 43.6 0.00078
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 176 43.3 0.00078
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 177 43.7 0.00078
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 177 43.7 0.00078
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 177 43.8 0.00087
NP_444264 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 420) 169 42.2 0.0022
NP_001138228 (OMIM: 607449) neuropeptide FF recept ( 423) 169 42.2 0.0022
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 167 41.7 0.0025
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 167 41.7 0.0025
NP_004876 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 522) 169 42.4 0.0025
NP_004113 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 289) 166 41.5 0.0026
NP_940799 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 366) 166 41.6 0.003
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 165 41.3 0.0031
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 165 41.4 0.0033
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 164 41.3 0.004
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 162 40.8 0.0047
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 162 40.8 0.0047
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 162 40.9 0.005
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 162 40.9 0.0051
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 162 40.9 0.0053
NP_001139739 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 161 40.7 0.0057
NP_001139738 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 161 40.7 0.0057
NP_061843 (OMIM: 605188) probable G-protein couple ( 370) 161 40.7 0.0057
XP_005250508 (OMIM: 605188) PREDICTED: probable G- ( 370) 161 40.7 0.0057
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1194; 56.7% identity (81.8% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-305)
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70 80 90 100 110 120
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310 320
pF1KE0 LRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
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XP_011 LRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1194; 56.7% identity (81.8% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPVY
: : ::.:.:.:::::: ::.::.: ...::.:::.:.:::::::. . .:: ::::.:
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAMAY
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NP_036 DHFVAVCHP---------LHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCAD
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pF1KE0 NVIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSS
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NP_036 NAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPST
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPFIYS
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NP_036 KGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYS
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310 320
pF1KE0 LRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
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NP_036 LRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 1194; 56.7% identity (81.8% similar) in 314 aa overlap (1-314:11-315)
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pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIR
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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XP_011 TCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVV
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::::.::::::::: .::::..:.
XP_011 TPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
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Smith-Waterman score: 788; 40.6% identity (71.7% similar) in 315 aa overlap (1-310:1-306)
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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NP_003 HIPSAAGRYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLN
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pF1KE0 PFIYSLRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
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NP_003 PIIYCLRNQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1079; 51.9% identity (78.2% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-307)
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pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPVY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
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NP_001 TEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSST
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NP_001 KGKYKAFSTCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYS
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pF1KE0 LRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
:::.:.::::::.. .
NP_001 LRNKDVKGALERLLSRADSCP
300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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Smith-Waterman score: 836; 39.0% identity (73.9% similar) in 310 aa overlap (5-313:2-301)
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pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPVY
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 LFLSNLSFSDL-CFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAMA
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSI-IPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCA
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NP_001 YDRYVAICFP---------LHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCG
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DNVIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPS
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NP_001 PNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SKGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPFIY
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NP_001 VEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVY
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 SLRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
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NP_001 SFQNREMQAGIRKVFAFLKH
290 300
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 1173 init1: 507 opt: 532 Z-score: 540.7 bits: 108.3 E(85289): 2.2e-23
Smith-Waterman score: 1062; 50.3% identity (80.1% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPVY
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NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 LFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAMAY
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NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
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NP_002 DRYVAICCP---------LHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGS
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pF1KE0 NVIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSS
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NP_002 RKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSV
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pF1KE0 KGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPFIYS
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NP_002 SKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKP-LHTYSVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYS
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE0 LRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
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NP_002 LRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 866 init1: 503 opt: 529 Z-score: 537.7 bits: 107.7 E(85289): 3.3e-23
Smith-Waterman score: 859; 46.3% identity (69.6% similar) in 313 aa overlap (5-316:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQP-EQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPV
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 YLFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCA
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NP_835 YDRYVAICSP---------LHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCG
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pF1KE0 DNVIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPS
: . ::::: .:::.:.:: . : .. :...:: :::: ::.::...:::.::
NP_835 TNKVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPS
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 SKGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPFIY
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NP_835 AKGKHKAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIY
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 SLRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
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NP_835 SLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 1025 init1: 517 opt: 525 Z-score: 533.8 bits: 107.0 E(85289): 5.4e-23
Smith-Waterman score: 938; 45.0% identity (73.0% similar) in 311 aa overlap (4-314:6-307)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTP
.: : ...:.:::.: .:: : . . .::..: :.::. ...:::.: ::.::
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VYLFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAM
.:.::::::: :::. : .::.: :. ... :: : : :.::: :.: :::.:.::
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE0 AYDRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFC
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NP_006 AYDRYVAICNP---------LLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYC
130 140 150 160 170
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pF1KE0 ADNVIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVP
::: :::::. ::::.:.:: .:::.. .:. . .: :..:. :: :. :.::.
NP_006 DKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIR
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 SSKGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPFI
: .: :.::::.:::. :... ::.. .: :: : : .....::. :.:.:.:
NP_006 SFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLI
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 YSLRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
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NP_006 YSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 928 init1: 500 opt: 523 Z-score: 531.9 bits: 106.6 E(85289): 6.9e-23
Smith-Waterman score: 891; 42.9% identity (73.9% similar) in 310 aa overlap (5-314:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHT
: .: . :.:.:. :. . . ... : .:: ::.:::.::.: :::::::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 PVYLFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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NP_001 MSYDRYAAVCRP---------LHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPL
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