Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0889
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0889, 322 aa
1>>>pF1KE0889 322 - 322 aa - 322 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9842+/-0.00125; mu= 12.0322+/- 0.073
mean_var=172.5160+/-58.051, 0's: 0 Z-trim(102.9): 444 B-trim: 399 in 1/47
Lambda= 0.097647
statistics sampled from 6604 (7145) to 6604 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 2.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 2109 310.2 1.4e-84
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1563 233.3 1.9e-61
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1557 232.4 3.5e-61
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1275 192.7 3.2e-49
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1239 187.6 1.1e-47
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1178 179.1 4.1e-45
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1163 176.9 1.8e-44
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1116 170.3 1.8e-42
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1098 167.8 1e-41
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1093 167.1 1.7e-41
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1088 166.4 2.8e-41
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1085 166.0 3.7e-41
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1069 163.7 1.7e-40
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1067 163.4 2.1e-40
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1063 162.8 3.1e-40
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1061 162.6 3.8e-40
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1056 161.9 6.1e-40
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1056 161.9 6.1e-40
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1053 161.4 8.2e-40
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1048 160.8 1.4e-39
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1047 160.6 1.5e-39
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1040 159.6 2.9e-39
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1037 159.3 4.2e-39
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1031 158.4 7.5e-39
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1030 158.2 7.7e-39
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1022 157.1 1.7e-38
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 1014 155.9 3.7e-38
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 1011 155.5 5e-38
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 1007 155.0 7.4e-38
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1001 154.2 1.4e-37
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 985 151.9 6.4e-37
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 983 151.6 7.7e-37
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 976 150.6 1.5e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 957 147.9 9.7e-36
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 955 147.6 1.2e-35
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 953 147.3 1.4e-35
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 952 147.2 1.6e-35
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 938 145.2 6.2e-35
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 934 144.7 9.4e-35
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 924 143.3 2.5e-34
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 922 143.0 3e-34
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 919 142.6 4e-34
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 917 142.3 4.8e-34
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 917 142.3 4.8e-34
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 915 142.0 5.9e-34
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 913 141.7 7.2e-34
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 912 141.6 7.8e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 912 141.6 7.9e-34
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 911 141.4 8.6e-34
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 909 141.2 1.1e-33
>>CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 (322 aa)
initn: 2109 init1: 2109 opt: 2109 Z-score: 1632.0 bits: 310.2 E(32554): 1.4e-84
Smith-Waterman score: 2109; 100.0% identity (100.0% similar) in 322 aa overlap (1-322:1-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
::::::::::::::::::::::
CCDS35 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
310 320
>>CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1593 init1: 1559 opt: 1563 Z-score: 1216.5 bits: 233.3 E(32554): 1.9e-61
Smith-Waterman score: 1563; 73.5% identity (92.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
:. :::::::::::: ::: ::::::::.::::::: ::::::::.:::.:::::::::.
CCDS35 MKRENQSSVSEFLLLDLPIWPEQQAVFFTLFLGMYLITVLGNLLIILLIRLDSHLHTPMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
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CCDS35 FFLSHLALTDISLSSVTVPKMLLSMQTQDQSILYAGCVTQMYFFIFFTDLDNFLLTSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
::::::::::.:.::: .. : .::. ::...:. :: :::::::::::::. :::.:::
CCDS35 DRYVAICHPLRYTTIMKEGLCNLLVTVSWILSCTNALSHTLLLAQLSFCADNTIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
: ::::::::: :::.:.:::.. ..: ::..:::.::::::::::. :::::: :::::
CCDS35 LVALLKLSCSDISLNELVIFTVGQAVITLPLICILISYGHIGVTILKAPSTKGIFKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
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CCDS35 CGSHLSVVSLYYGTIIGLYFLPSSSASSDKDVIASVMYTVITPLLNPFIYSLRNRDIKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
:..:..:. ....
CCDS35 LERLFNRATVLSQ
310
>>CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1596 init1: 1557 opt: 1557 Z-score: 1211.9 bits: 232.4 E(32554): 3.5e-61
Smith-Waterman score: 1557; 75.0% identity (92.5% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
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CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
::::::::::::..:: . ::.::: ::...:: .: :::::..::::: . ::: :::
CCDS35 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
:.::::::::: ::.:..::.....: :::.:::::::.::.:::..:::::: :::::
CCDS35 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
::::::::..:: .:.: :..: :.. ::..:....::.::::::::::::::.:.: :
CCDS35 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
: ::.::.
CCDS35 LGKLFSRATFFSW
310
>>CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 1331 init1: 1270 opt: 1275 Z-score: 997.2 bits: 192.7 E(32554): 3.2e-49
Smith-Waterman score: 1275; 59.3% identity (86.6% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
: .::.:.:.::::::::.:::: . .::::.:::::.::::::..::.::::::::::
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
.:::.:...:. :::::.::.:.:::.: .. : :..: :::..:.::.:::...:::
CCDS11 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
::::::: ::::..::. :. ::: :::.. :.:::::.:.: ::::..:::.:::
CCDS11 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
..:::::. ::: .:. .:: . ...::: :: ::..: .::..::.::::::.::
CCDS11 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
::::::::...: :.::::. ..... :. . ...::.::::::::::::::.:.:::
CCDS11 CGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
: ...
CCDS11 LSRVIHQKKTFFSL
310
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1239 init1: 1239 opt: 1239 Z-score: 969.8 bits: 187.6 E(32554): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 1239; 59.0% identity (84.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
:: ::::::::::::: .:.:: ..:..::.:::.::::::::.: ...:: ::::::
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
::::.:...:: :: .:::::: : . .. . ::..: :: ..:.:.:.::.. :::
CCDS10 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
:..::.::::::.. ::.. :..:::: ::.: .::::::.: ::::::. : :.:::
CCDS10 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
. ::::::::: ::.. :.. . ... ::::::.:: :: :.:..::::: ::.::
CCDS10 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
:::::.:: ..: :::..:: : ::.. .:. .:.:.::.::::::::::::::. .:::
CCDS10 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
:.:...:
CCDS10 LKKVVGRVVFSV
310
>>CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 (313 aa)
initn: 1206 init1: 1162 opt: 1178 Z-score: 923.4 bits: 179.1 E(32554): 4.1e-45
Smith-Waterman score: 1178; 55.7% identity (82.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
: :.::.:.:.:.:::: .:::....:.::. :::. :.:::::.: :..:::::::::
CCDS32 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS68 LKRLFSHRSIVSS
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CCDS41 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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CCDS41 LQKMLLKCTVFQQQ
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CCDS11 FFLANLSLADACFVSTTVPKMLANIQIQSQAISYSGCLLQLYFFMLFVMLEAFLLAVMAY
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CCDS11 DCYVAICHPLHYILIMSPGLCIFLVSASWIMNALHSLLHTLLMNSLSFCANHEIPHFFCD
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CCDS11 INPLLSLSCTDPFTNELVIFITGGLTGLIC-VLCLIISYTNVFSTILKIPSAQGKRKAFS
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CCDS11 TCSSHLSVVSLFFGTSFCVDFSSPSTHSAQKDTVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNQEIKS
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CCDS11 SLRKLIWVRKIHSP
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CCDS32 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
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CCDS32 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
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CCDS32 DRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCE
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CCDS32 LTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFPLLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKALST
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CCDS32 LGSLLSRAASCL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]