Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0895
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0895, 313 aa
1>>>pF1KE0895 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6211+/-0.00118; mu= 13.5671+/- 0.069
mean_var=163.8674+/-60.966, 0's: 0 Z-trim(102.3): 443 B-trim: 400 in 1/48
Lambda= 0.100191
statistics sampled from 6343 (6899) to 6343 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 2.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 2043 308.3 4.9e-84
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1215 188.6 5.2e-48
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1184 184.2 1.2e-46
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1178 183.3 2.2e-46
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1173 182.6 3.5e-46
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1168 181.8 5.8e-46
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1167 181.7 6.4e-46
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1149 179.1 3.9e-45
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1148 179.0 4.4e-45
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1136 177.3 1.5e-44
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1131 176.5 2.4e-44
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1121 175.1 6.9e-44
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1116 174.3 1.1e-43
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1115 174.2 1.2e-43
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1113 173.9 1.4e-43
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1111 173.6 1.7e-43
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1105 172.8 3.2e-43
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1097 171.6 7.1e-43
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1093 171.0 1.1e-42
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1091 170.7 1.3e-42
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1081 169.3 3.5e-42
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1080 169.1 3.9e-42
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 1069 167.6 1.2e-41
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1068 167.4 1.3e-41
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1053 165.2 5.8e-41
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1048 164.5 9.6e-41
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1048 164.6 1e-40
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1047 164.4 1.1e-40
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 1039 163.2 2.4e-40
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 1022 160.7 1.3e-39
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1018 160.2 2e-39
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 981 154.8 7.9e-38
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 978 154.4 1.1e-37
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 972 153.5 2e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 972 153.5 2e-37
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 956 151.2 9.7e-37
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 951 150.5 1.6e-36
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 947 149.9 2.4e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 946 149.8 2.6e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 941 149.0 4.3e-36
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 940 149.0 5.1e-36
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 939 148.8 5.3e-36
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 938 148.6 5.8e-36
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 937 148.5 6.5e-36
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 931 147.6 1.2e-35
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 930 147.5 1.3e-35
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 925 146.7 2.2e-35
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 925 146.7 2.2e-35
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 918 145.7 4.4e-35
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 918 145.7 4.5e-35
>>CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 (313 aa)
initn: 2043 init1: 2043 opt: 2043 Z-score: 1622.2 bits: 308.3 E(32554): 4.9e-84
Smith-Waterman score: 2043; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LRKLVNRKITSSS
:::::::::::::
CCDS32 LRKLVNRKITSSS
310
>>CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1212 init1: 1212 opt: 1215 Z-score: 975.4 bits: 188.6 E(32554): 5.2e-48
Smith-Waterman score: 1215; 56.3% identity (82.8% similar) in 309 aa overlap (5-312:3-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
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CCDS68 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNLLIILAIGSDLHLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAY
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CCDS68 FFLANLSFVDMGLTSSTVTKMLVNIQTRHHTISYTGCLTQMYFFLMFGDLDSFFLAAMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCD
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CCDS68 DRYVAICHPLCYSTVMRPQVCALMLALCWVLTNIVALTHTFLMARLSFCVTGEIAHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFST
.::.:.:::.:: .:........: :. .::.::..:: .:. ::..: . :: :::::
CCDS68 ITPVLKLSCSDTHINEMMVFVLGGTVLIVPFLCIVTSYIHIVPAILRVRTRGGVGKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGA
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CCDS68 CSSHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVTPMLNPFIYSLRNKDMKGA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 LRKLVN-RKITSSS
:..: . :.:.::
CCDS68 LKRLFSHRSIVSS
300 310
>>CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 1228 init1: 1180 opt: 1184 Z-score: 951.2 bits: 184.2 E(32554): 1.2e-46
Smith-Waterman score: 1184; 55.5% identity (82.3% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
: .:::: :.:.:::: .:::..: ..::. :::. ..::::::. : .:::::::::
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAY
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CCDS11 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCD
::.:::: ::::. ::: :: ::. :... : .. : :::::: ::... .::.:::
CCDS11 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFST
.. .:.:. .:: ::. :.:..:.... ::. ::.:::::. .:.::::. : :::::
CCDS11 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGA
:.::::::.:::::.::.::: :. .:.:. . :.:::.::::::::::::::::.:::
CCDS11 CGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LRKLVNRKITSSS
: .....: :
CCDS11 LSRVIHQKKTFFSL
310
>>CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 (322 aa)
initn: 1206 init1: 1162 opt: 1178 Z-score: 946.4 bits: 183.3 E(32554): 2.2e-46
Smith-Waterman score: 1178; 55.7% identity (82.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
: :.::.:.:.:.:::: .:::....:.::. :::. :.:::::.: :..:::::::::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAY
:::..:.:.:. ... :.::::...:: :. : :. : ::: ::. .:: .:. :::
CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCD
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CCDS35 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFST
: .:.:::.:::.:.. :. .: .: ::.:::.::..: :.:...::. : ::.::
CCDS35 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGA
:.::::::...: : ::.:. : : :. :. ..:.:::::::::::::::::.:.:::
CCDS35 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LRKLVNRKITSSS
::::..:
CCDS35 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
310 320
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1199 init1: 1170 opt: 1173 Z-score: 942.6 bits: 182.6 E(32554): 3.5e-46
Smith-Waterman score: 1173; 55.6% identity (82.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
: ::.:.:.:.:::::..:.:. ::: .:. :::. :.:::::::..:::: ::::::
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAY
:::.:::.::.:.. .:.::::.. ...::. :: :::: .: .:. ..:.:::
CCDS10 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCD
:.:::.::::::. :. .:: :::..::. . . : : :::: : ::... . :.:::
CCDS10 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFST
.::.:.:::.:: .:...:: ...:. :::.:::::: .: ...::::. :: :::::
CCDS10 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGA
:.:::.:: :::.: :.::. : : .. :. ..:.::.::::::::::::::: ::::
CCDS10 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LRKLVNRKITSSS
:.:.:.: . :
CCDS10 LKKVVGRVVFSV
310
>>CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1168 init1: 1168 opt: 1168 Z-score: 938.7 bits: 181.8 E(32554): 5.8e-46
Smith-Waterman score: 1168; 55.0% identity (82.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
:. .::.:.:.:.:: : :::....:.::. :::. :.::::::: : .::::::::.
CCDS35 MKRENQSSVSEFLLLDLPIWPEQQAVFFTLFLGMYLITVLGNLLIILLIRLDSHLHTPMF
10 20 30 40 50 60
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]