Result of FASTA (omim) for
pF1KE0971
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0971, 540 aa
1>>>pF1KE0971 540 - 540 aa - 540 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3129+/-0.000694; mu= 2.2144+/- 0.041
mean_var=929.3649+/-212.730, 0's: 0 Z-trim(114.3): 411 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.042071
statistics sampled from 23825 (24124) to 23825 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 9.530
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003812 (OMIM: 603455) receptor-interacting seri ( 540) 3615 236.5 1.6e-61
XP_005251149 (OMIM: 603455) PREDICTED: receptor-in ( 403) 2693 180.3 9.7e-45
XP_011515659 (OMIM: 603455) PREDICTED: receptor-in ( 369) 2456 165.9 2e-40
NP_065690 (OMIM: 263650,605706) receptor-interacti ( 784) 692 59.4 4.6e-08
NP_848605 (OMIM: 608774) ankyrin repeat and protei ( 765) 665 57.8 1.4e-07
XP_011541039 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 766) 665 57.8 1.4e-07
XP_016872964 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 775) 660 57.5 1.8e-07
XP_011541038 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 776) 660 57.5 1.8e-07
XP_011541040 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 702) 588 53.0 3.5e-06
NP_006862 (OMIM: 605817) receptor-interacting seri ( 518) 516 48.4 6.4e-05
XP_016866894 (OMIM: 603453) PREDICTED: receptor-in ( 356) 473 45.5 0.00034
XP_006715300 (OMIM: 603453) PREDICTED: receptor-in ( 356) 473 45.5 0.00034
NP_003795 (OMIM: 603453) receptor-interacting seri ( 671) 466 45.6 0.00058
XP_005249514 (OMIM: 603453) PREDICTED: receptor-in ( 671) 466 45.6 0.00058
>>NP_003812 (OMIM: 603455) receptor-interacting serine/t (540 aa)
initn: 3615 init1: 3615 opt: 3615 Z-score: 1225.7 bits: 236.5 E(85289): 1.6e-61
Smith-Waterman score: 3615; 100.0% identity (100.0% similar) in 540 aa overlap (1-540:1-540)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNGEAICSALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHIHTPLLDSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MNGEAICSALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHIHTPLLDSER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 RFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMMSLSQSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMMSLSQSRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SKSAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SKSAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TFLEAVIQLKKTKLQSVSSAIHLCDKKKMELSLNIPVNHGPQEESCGSSQLHENSGSPET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TFLEAVIQLKKTKLQSVSSAIHLCDKKKMELSLNIPVNHGPQEESCGSSQLHENSGSPET
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SRSLPAPQDNDFLSRKAQDCYFMKLHHCPGNHSWDSTISGSQRAAFCDHKTTPCSSAIIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SRSLPAPQDNDFLSRKAQDCYFMKLHHCPGNHSWDSTISGSQRAAFCDHKTTPCSSAIIN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PLSTAGNSERLQPGIAQQWIQSKREDIVNQMTEACLNQSLDALLSRDLIMKEDYELVSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PLSTAGNSERLQPGIAQQWIQSKREDIVNQMTEACLNQSLDALLSRDLIMKEDYELVSTK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 PTRTSKVRQLLDTTDIQGEEFAKVIVQKLKDNKQMGLQPYPEILVVSRSPSLNLLQNKSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PTRTSKVRQLLDTTDIQGEEFAKVIVQKLKDNKQMGLQPYPEILVVSRSPSLNLLQNKSM
490 500 510 520 530 540
>>XP_005251149 (OMIM: 603455) PREDICTED: receptor-intera (403 aa)
initn: 2693 init1: 2693 opt: 2693 Z-score: 924.2 bits: 180.3 E(85289): 9.7e-45
Smith-Waterman score: 2693; 100.0% identity (100.0% similar) in 403 aa overlap (138-540:1-403)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 HRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGL
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SKWRMMSLSQSRSSKSAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SKWRMMSLSQSRSSKSAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQ
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 PFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCL
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 IELEPVLRTFEEITFLEAVIQLKKTKLQSVSSAIHLCDKKKMELSLNIPVNHGPQEESCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IELEPVLRTFEEITFLEAVIQLKKTKLQSVSSAIHLCDKKKMELSLNIPVNHGPQEESCG
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 SSQLHENSGSPETSRSLPAPQDNDFLSRKAQDCYFMKLHHCPGNHSWDSTISGSQRAAFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSQLHENSGSPETSRSLPAPQDNDFLSRKAQDCYFMKLHHCPGNHSWDSTISGSQRAAFC
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 DHKTTPCSSAIINPLSTAGNSERLQPGIAQQWIQSKREDIVNQMTEACLNQSLDALLSRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DHKTTPCSSAIINPLSTAGNSERLQPGIAQQWIQSKREDIVNQMTEACLNQSLDALLSRD
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 LIMKEDYELVSTKPTRTSKVRQLLDTTDIQGEEFAKVIVQKLKDNKQMGLQPYPEILVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LIMKEDYELVSTKPTRTSKVRQLLDTTDIQGEEFAKVIVQKLKDNKQMGLQPYPEILVVS
340 350 360 370 380 390
530 540
pF1KE0 RSPSLNLLQNKSM
:::::::::::::
XP_005 RSPSLNLLQNKSM
400
>>XP_011515659 (OMIM: 603455) PREDICTED: receptor-intera (369 aa)
initn: 2456 init1: 2456 opt: 2456 Z-score: 846.7 bits: 165.9 E(85289): 2e-40
Smith-Waterman score: 2456; 100.0% identity (100.0% similar) in 369 aa overlap (172-540:1-369)
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 LLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMMSLSQSRSSKSAPEGGTIIYMPPENYEPG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MMSLSQSRSSKSAPEGGTIIYMPPENYEPG
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 QKSRASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QKSRASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPH
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 RARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLKKTKLQSVSSAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLKKTKLQSVSSAI
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 HLCDKKKMELSLNIPVNHGPQEESCGSSQLHENSGSPETSRSLPAPQDNDFLSRKAQDCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HLCDKKKMELSLNIPVNHGPQEESCGSSQLHENSGSPETSRSLPAPQDNDFLSRKAQDCY
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 FMKLHHCPGNHSWDSTISGSQRAAFCDHKTTPCSSAIINPLSTAGNSERLQPGIAQQWIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FMKLHHCPGNHSWDSTISGSQRAAFCDHKTTPCSSAIINPLSTAGNSERLQPGIAQQWIQ
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 SKREDIVNQMTEACLNQSLDALLSRDLIMKEDYELVSTKPTRTSKVRQLLDTTDIQGEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKREDIVNQMTEACLNQSLDALLSRDLIMKEDYELVSTKPTRTSKVRQLLDTTDIQGEEF
280 290 300 310 320 330
510 520 530 540
pF1KE0 AKVIVQKLKDNKQMGLQPYPEILVVSRSPSLNLLQNKSM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKVIVQKLKDNKQMGLQPYPEILVVSRSPSLNLLQNKSM
340 350 360
>>NP_065690 (OMIM: 263650,605706) receptor-interacting s (784 aa)
initn: 570 init1: 263 opt: 692 Z-score: 265.8 bits: 59.4 E(85289): 4.6e-08
Smith-Waterman score: 700; 37.4% identity (61.1% similar) in 380 aa overlap (27-384:31-393)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNGEAICSALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVK---HLHIHT
:. : : ..::. :.. .:.: ::.
NP_065 MEGDGGTPWALALLRTFDAGEFTGWEKVGSGGFGQVYKVRHVHWKTWLAIKCSPSLHVD-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 PLLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEY
: :: ..:.::. .. :.: ::::. ::: :: .:.: ::: .:::..:: .
NP_065 ---DRERMELLEEAKKMEMAKFRYILPVYGICREP--VGLVMEYMETGSLEKLLASE---
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMM
: . : :::::.:: :.:.:.:: :.::::: ::: ::::: ..::::.::::.:
NP_065 P-LPWDLRFRIIHETAVGMNFLHCMAPPLLHLDLKPANILLDAHYHVKISDFGLAK--CN
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 SLSQSRSSKSAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRA-SIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDV
.::.:.. . ::: :.::: . .::: . :::.::.:.. : ::..:.:: :
NP_065 GLSHSHDLSMDGLFGTIAYLPPERIR--EKSRLFDTKHDVYSFAIVIWGVLTQKKPFADE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TNPLQIMYSVSQGHRPVINE--ESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIEL
: :.:: .: .:::: . .. : : .: :.. : .: ::.: . :
NP_065 KNILHIMVKVVKGHRPELPPVCRARPRACSH---LIRLMQRCWQGDPRVRPTFQEITSET
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE0 EPVL-RTFEEITFLEAVIQLKK----------TKLQSVSSAIHLCDKKKMEL--SLNIPV
: . . .:. ...:. ..:. .:. : . :: .:. :
NP_065 EDLCEKPDDEVKETAHDLDVKSPPEPRSEVVPARLKRASAPTFDNDYSLSELLSQLDSGV
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 NH---GPQEESCGSSQLHENSGSPETSRSLPAPQDNDFLSRKAQDCYFMKLHHCPGNHSW
.. ::.: : .::. . :.. : . :. : :: . . : .
NP_065 SQAVEGPEELSRSSSESKLPSSGSGKRLSGVSSVDSAFSSRGSLSLSFEREPSTSDLGTT
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 DSTISGSQRAAFCDHKTTPCSSAIINPLSTAGNSERLQPGIAQQWIQSKREDIVNQMTEA
NP_065 DVQKKKLVDAIVSGDTSKLMKILQPQDVDLALDSGASLLHLAVEAGQEECAKWLLLNNAN
410 420 430 440 450 460
>>NP_848605 (OMIM: 608774) ankyrin repeat and protein ki (765 aa)
initn: 453 init1: 261 opt: 665 Z-score: 257.0 bits: 57.8 E(85289): 1.4e-07
Smith-Waterman score: 679; 34.0% identity (62.8% similar) in 379 aa overlap (9-382:12-359)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNGEAICSALPTIPYHKL-ADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHIHTPLL
.::.. . .: : .. :. . : .::: ::.. :.: :
NP_848 MAADPTELRLGSLPVFTRDDFEGDWRLVASGGFSQVFQARHRRWRTEYAIKCAPCLPP--
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 DSERKDV---LREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEY
:. .:: ..:: ..: .:..:. : :.:..: :::: :.: ::::...: ..
NP_848 DAASSDVNYLIEEAAKMKKIKFQHIVSIYGVCKQP--LGIVMEFMANGSLEKVLSTHS--
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMM
. : :::::.:: .:..:.::.. ::::: ::: :::::...::::.::::::: .
NP_848 --LCWKLRFRIIHETSLAMNFLHSIKPPLLHLDLKPGNILLDSNMHVKISDFGLSKWMEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 SLSQSRSSKSAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVT
: .. .:: .: . :.::: . ..:. . :.:.::.:.. ::.:..:.:.
NP_848 STRMQYIERSALRG-MLSYIPPEMFLESNKA-PGPKYDVYSFAIVIWELLTQKKPYSGF-
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 NPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRAR-MISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEP
: ..:. :. : :: .. : . : .:. :..:.. : :.: .:: :: :: .
NP_848 NMMMIIIRVAAGMRPSLQPVSDQW--PSEAQQMVDLMKRCWDQDPKKRPCFLDITIETDI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VLRTFEEITFLEAVIQLKKTKLQSVSSAIHLCDKKKMELSLNIPVNHGPQEESCGSSQLH
.: ..:.. . . ..: : : . .::: : : .:. .. .
NP_848 LL------SLLQSRVAVPESKA--------LARKVSCKLSLRQP---GEVNEDISQELMD
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ENSGSPETSRSLPAPQDNDFLSRKAQDCYFMKLHHCPGNHSWDSTISGSQRAAFCDHKTT
.::. .:.: . .... : . : .
NP_848 SDSGN-YLKRALQLSDRKNLVPRDEELCIYENKVTPLHFLVAQGSVEQVRLLLAHEVDVD
340 350 360 370 380
>>XP_011541039 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin repeat (766 aa)
initn: 467 init1: 275 opt: 665 Z-score: 257.0 bits: 57.8 E(85289): 1.4e-07
Smith-Waterman score: 673; 34.4% identity (62.7% similar) in 381 aa overlap (9-382:12-360)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNGEAICSALPTIPYHKL-ADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHIHTPLL
.::.. . .: : .. :. . : .::: ::.. :.: :
XP_011 MAADPTELRLGSLPVFTRDDFEGDWRLVASGGFSQVFQARHRRWRTEYAIKCAPCLPP--
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 DSERKDV---LREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEY
:. .:: ..:: ..: .:..:. : :.:..: :::: :.: ::::...: ..
XP_011 DAASSDVNYLIEEAAKMKKIKFQHIVSIYGVCKQP--LGIVMEFMANGSLEKVLSTHS--
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMM
. : :::::.:: .:..:.::.. ::::: ::: :::::...::::.::::::: .
XP_011 --LCWKLRFRIIHETSLAMNFLHSIKPPLLHLDLKPGNILLDSNMHVKISDFGLSKWMEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 SLSQSRSSKSAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVT
: .. .:: .: . :.::: . ..:. . :.:.::.:.. ::.:..:.:.
XP_011 STRMQYIERSALRG-MLSYIPPEMFLESNKA-PGPKYDVYSFAIVIWELLTQKKPYSGF-
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 NPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRAR-MISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEP
: ..:. :. : :: .. : . : .:. :..:.. : :.: .:: :: :: .
XP_011 NMMMIIIRVAAGMRPSLQPVSDQW--PSEAQQMVDLMKRCWDQDPKKRPCFLDITIETDI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VLRTFEEITFLEAVIQLKKTKLQSVSSAIHLCDKKKMELSLNIP--VNHGPQEESCGSSQ
.: ..:.. . . ..: : : . .::: : ::. ..: :.
XP_011 LL------SLLQSRVAVPESKA--------LARKVSCKLSLRQPGEVNEDISQELMDSA-
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LHENSGSPETSRSLPAPQDNDFLSRKAQDCYFMKLHHCPGNHSWDSTISGSQRAAFCDHK
.::. .:.: . .... : . : .
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340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 TTPCSSAIINPLSTAGNSERLQPGIAQQWIQSKREDIVNQMTEACLNQSLDALLSRDLIM
XP_011 VDCQTASGYTPLLIAAQDQQPDLCALLLAHGADANRVDEDGWAPLHFAAQNGDDGTARLL
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10 20 30 40 50
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.::.. . .: : .. :. . : .::: ::.. :.: :
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:. .:: ..:: ..: .:..:. : :.:..: :::: :.: ::::...: ..
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. : :::::.:: .:..:.::.. ::::: ::: :::::...::::.::::::: .
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: .. .:: .: . :.::: . ..:. . :.:.::.:.. ::.:..:.:. ..:
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. :. :. :. : :: .. : . : .:. :..:.. : :.: .:: :
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: :: . .: ..:.. . . ..: : : . .::: : : .
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:. .. . .::. .:.: . .... : . : .
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10 20 30 40 50
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.::.. . .: : .. :. . : .::: ::.. :.: :
XP_011 MAADPTELRLGSLPVFTRDDFEGDWRLVASGGFSQVFQARHRRWRTEYAIKCAPCLPP--
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:. .:: ..:: ..: .:..:. : :.:..: :::: :.: ::::...: ..
XP_011 DAASSDVNYLIEEAAKMKKIKFQHIVSIYGVCKQP--LGIVMEFMANGSLEKVLSTHS--
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pF1KE0 PDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMM
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XP_011 --LCWKLRFRIIHETSLAMNFLHSIKPPLLHLDLKPGNILLDSNMHVKISDFGLSKWMEQ
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 SLSQSRSSKSAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVT
: .. .:: .: . :.::: . ..:. . :.:.::.:.. ::.:..:.:. ..:
XP_011 STRMQYIERSALRG-MLSYIPPEMFLESNKA-PGPKYDVYSFAIVIWELLTQKKPYSELT
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. :. :. :. : :: .. : . : .:. :..:.. : :.: .:: :
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pF1KE0 LKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLKKTKLQSVSSAIHLCDKKKMELSLNIP--VNHGP
: :: . .: ..:.. . . ..: : : . .::: : ::.
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pF1KE0 QEESCGSSQLHENSGSPETSRSLPAPQDNDFLSRKAQDCYFMKLHHCPGNHSWDSTISGS
..: :. .::. .:.: . .... : . : .
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340 350 360 370 380
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pF1KE0 WRVQVAVKHLHIHTPLLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMP
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XP_011 MKKIKFQHIVSIYGVCKQP--LGIVMEFMA
10 20
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::::...: .. . : :::::.:: .:..:.::.. ::::: ::: :::::...:
XP_011 NGSLEKVLSTHS----LCWKLRFRIIHETSLAMNFLHSIKPPLLHLDLKPGNILLDSNMH
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pF1KE0 VKIADFGLSKWRMMSLSQSRSSKSAPEGGTIIYMPPENYEPGQKSRASIKHDIYSYAVIT
:::.::::::: .: .. .:: .: . :.::: . ..:. . :.:.::.:..
XP_011 VKISDFGLSKWMEQSTRMQYIERSALRG-MLSYIPPEMFLESNKA-PGPKYDVYSFAIVI
90 100 110 120 130 140
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150 160 170 180 190 200
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. : :.: .:: :: :: . .: ..:.. . . ..: : : .
XP_011 KRCWDQDPKKRPCFLDITIETDILL------SLLQSRVAVPESKA--------LARKVSC
210 220 230 240
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XP_011 KLSLRQPGEVNEDISQELMDSA----DSGN-YLKRALQLSDRKNLVPRDEELCIYENKVT
250 260 270 280 290 300
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XP_011 PLHFLVAQGSVEQVRLLLAHEVDVDCQTASGYTPLLIAAQDQQPDLCALLLAHGADANRV
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>>NP_006862 (OMIM: 605817) receptor-interacting serine/t (518 aa)
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60 70 80 90 100 110
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340 350 360 370 380 390
540 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:31:11 2016 done: Sat Nov 5 20:31:13 2016
Total Scan time: 9.530 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]