FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0985, 596 aa 1>>>pF1KE0985 596 - 596 aa - 596 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4311+/-0.000542; mu= -16.2123+/- 0.034 mean_var=743.9414+/-155.217, 0's: 0 Z-trim(122.5): 1385 B-trim: 0 in 0/56 Lambda= 0.047022 statistics sampled from 38989 (40767) to 38989 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16 Scan time: 10.650 The best scores are: opt bits E(85289) NP_149109 (OMIM: 192600,606566) myosin light chain ( 596) 3981 285.7 3e-76 NP_872299 (OMIM: 612147) myosin light chain kinase ( 819) 1504 117.8 1.4e-25 NP_001295230 (OMIM: 612147) myosin light chain kin ( 478) 1460 114.5 8e-25 XP_006721397 (OMIM: 612147) PREDICTED: myosin ligh ( 478) 1460 114.5 8e-25 XP_016861959 (OMIM: 600922,613780) PREDICTED: myos ( 713) 1049 86.9 2.6e-16 XP_016861960 (OMIM: 600922,613780) PREDICTED: myos ( 714) 1049 86.9 2.6e-16 XP_016861958 (OMIM: 600922,613780) PREDICTED: myos ( 991) 1049 87.0 3.2e-16 NP_001308238 (OMIM: 600922,613780) myosin light ch (1738) 1049 87.3 4.5e-16 NP_444254 (OMIM: 600922,613780) myosin light chain (1845) 1049 87.4 4.7e-16 XP_011511162 (OMIM: 600922,613780) PREDICTED: myos (1913) 1049 87.4 4.8e-16 NP_444253 (OMIM: 600922,613780) myosin light chain (1914) 1049 87.4 4.8e-16 XP_011511163 (OMIM: 600922,613780) PREDICTED: myos (1846) 870 75.2 2.1e-12 XP_016877533 (OMIM: 616567) PREDICTED: death-assoc ( 350) 781 68.3 4.9e-11 NP_055141 (OMIM: 616567) death-associated protein ( 370) 781 68.3 5e-11 XP_011519716 (OMIM: 616567) PREDICTED: death-assoc ( 380) 781 68.4 5.1e-11 XP_011519715 (OMIM: 616567) PREDICTED: death-assoc ( 389) 781 68.4 5.2e-11 XP_005251814 (OMIM: 600831) PREDICTED: death-assoc ( 839) 789 69.3 5.8e-11 NP_004929 (OMIM: 600831) death-associated protein (1430) 789 69.6 8.1e-11 NP_001275659 (OMIM: 600831) death-associated prote (1430) 789 69.6 8.1e-11 NP_001275660 (OMIM: 600831) death-associated prote (1430) 789 69.6 8.1e-11 NP_001275658 (OMIM: 600831) death-associated prote (1430) 789 69.6 8.1e-11 XP_005259565 (OMIM: 603289) PREDICTED: death-assoc ( 454) 756 66.8 1.9e-10 NP_001339 (OMIM: 603289) death-associated protein ( 454) 756 66.8 1.9e-10 XP_011519718 (OMIM: 616567) PREDICTED: death-assoc ( 488) 749 66.3 2.7e-10 XP_011519717 (OMIM: 616567) PREDICTED: death-assoc ( 359) 736 65.3 4.1e-10 NP_004751 (OMIM: 604726) serine/threonine-protein ( 414) 721 64.3 9.1e-10 XP_011519719 (OMIM: 616567) PREDICTED: death-assoc ( 316) 692 62.2 3e-09 XP_016877535 (OMIM: 616567) PREDICTED: death-assoc ( 316) 692 62.2 3e-09 XP_016877534 (OMIM: 616567) PREDICTED: death-assoc ( 316) 692 62.2 3e-09 XP_011510472 (OMIM: 604727) PREDICTED: serine/thre ( 372) 682 61.6 5.3e-09 XP_011510471 (OMIM: 604727) PREDICTED: serine/thre ( 372) 682 61.6 5.3e-09 XP_011510470 (OMIM: 604727) PREDICTED: serine/thre ( 372) 682 61.6 5.3e-09 NP_004217 (OMIM: 604727) serine/threonine-protein ( 372) 682 61.6 5.3e-09 XP_006717546 (OMIM: 607957) PREDICTED: calcium/cal ( 355) 678 61.3 6.2e-09 NP_065130 (OMIM: 607957) calcium/calmodulin-depend ( 357) 678 61.3 6.2e-09 XP_006717545 (OMIM: 607957) PREDICTED: calcium/cal ( 362) 678 61.3 6.3e-09 NP_705718 (OMIM: 607957) calcium/calmodulin-depend ( 385) 678 61.4 6.5e-09 NP_003310 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60880 (26926) 723 66.7 1.2e-08 XP_016860312 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (26973) 723 66.7 1.2e-08 NP_597676 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60880 (27051) 723 66.7 1.2e-08 NP_597681 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60880 (27118) 723 66.7 1.2e-08 NP_444256 (OMIM: 600922,613780) myosin light chain (1794) 686 62.7 1.2e-08 NP_444255 (OMIM: 600922,613780) myosin light chain (1863) 686 62.8 1.2e-08 XP_016860311 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (33101) 723 66.8 1.3e-08 NP_596869 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60880 (33423) 723 66.8 1.3e-08 XP_016860310 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34087) 723 66.8 1.3e-08 XP_016860309 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34088) 723 66.8 1.3e-08 XP_006717544 (OMIM: 607957) PREDICTED: calcium/cal ( 366) 662 60.3 1.3e-08 NP_001243779 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34350) 723 66.8 1.3e-08 XP_016860308 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (35622) 723 66.8 1.4e-08 >>NP_149109 (OMIM: 192600,606566) myosin light chain kin (596 aa) initn: 3981 init1: 3981 opt: 3981 Z-score: 1489.8 bits: 285.7 E(85289): 3e-76 Smith-Waterman score: 3981; 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NP_872 SP--LQESSSPGGVKAEEEQRAGAEPG----------------TRPSLARSDDNDHEVGA 410 420 430 440 210 220 230 240 250 260 pF1KE0 SQKEVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAVPSEKSEVGQALCLTAREEDCFQILDDCPP . : :.:: ::. . . : . .: .. : : .::: : NP_872 LGLQQG-KSPG-AGNPEPEQDCAARAPVRAEAVRRMPPGA--------EAGSVVLDDSPA 450 460 470 480 490 270 280 290 300 310 320 pF1KE0 PPAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGGGKFGAVCTCMEKATGLKLAAKVIKKQTPK ::::: ::.: .. ..:. . . ..:.::::.:: : : ::.::: ::::.:: .. : NP_872 PPAPFEHRVVSVKETSISAGYEVCQHEVLGGGRFGQVHRCTEKSTGLPLAAKIIKVKSAK 500 510 520 530 540 550 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 DKEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPHEIVLFMEYIEGGELFERIVDEDYHLTEVD :.: : ::..::::.: :::::: :.:. : .: :::..:::::.::.:: :::::.: NP_872 DREDVKNEINIMNQLSHVNLIQLYDAFESKHSCTLVMEYVDGGELFDRITDEKYHLTELD 560 570 580 590 600 610 390 400 410 420 430 440 pF1KE0 TMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENILCVNTTGHLVKIIDFGLARRYNPNEKLKVN ...:.::::.:. ..:. .:::::::::::::: ::: .:::::::::::.: :::::: NP_872 VVLFTRQICEGVHYLHQHYILHLDLKPENILCVNQTGHQIKIIDFGLARRYKPREKLKVN 620 630 640 650 660 670 450 460 470 480 490 500 pF1KE0 FGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITYMLLSGLSPFLGDDDTETLNNVLSGNWYFD :::::::.::::::. .: :::::.::::::::::::::::. :.::.: ... .: :: NP_872 FGTPEFLAPEVVNYEFVSFPTDMWSVGVITYMLLSGLSPFLGETDAETMNFIVNCSWDFD 680 690 700 710 720 730 510 520 530 540 550 560 pF1KE0 EETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQCLAHPWLNNLAEKAKRCNRRLKSQILLKK .:::..:.::::::: :.::.. ::.:.::: : ::::: ::.: . :::::.::.: NP_872 ADTFEGLSEEAKDFVSRLLVKEKSCRMSATQCLKHEWLNNLPAKASRSKTRLKSQLLLQK 740 750 760 770 780 790 570 580 590 pF1KE0 YLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMALGV :. .:.:::.: .:.::::..:. .: NP_872 YIAQRKWKKHFYVVTAANRLRKFPTSP 800 810 >>NP_001295230 (OMIM: 612147) myosin light chain kinase (478 aa) initn: 1488 init1: 1446 opt: 1460 Z-score: 566.6 bits: 114.5 E(85289): 8e-25 Smith-Waterman score: 1484; 48.7% identity (70.3% similar) in 505 aa overlap (89-588:13-477) 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 SEKGDGTLAQPSTSSQGPKGEGDRGGGPAEGSAGPPAALPQQTATPETSVKKPKAEQGAS :: :: : : :. . ..:: NP_001 MDTPGEMLMTGRGSLGP-------TLTTEAPAAAQPGKQGPP 10 20 30 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 GS----QDPG-KPRVGKKAAEGQAAARRGSPAFLHSPSCPAIISSSEKLLAKKPPSEASE :. : :: .: :... :: ::. :: :. : :. ... :. : :. NP_001 GTGRCLQAPGTEP--GEQTPEG---ARELSP--LQESSSPGGVKAEEEQRAGAEPG---- 40 50 60 70 80 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 LTFEGVPMTHSPTDPRPAKAEEGKNILAESQKEVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAV : : :..... . .. . : :.:: ::. . . : . .: NP_001 ------------TRPSLARSDDNDHEVGALGLQQG-KSPG-AGNPEPEQDCAARAPVRAE 90 100 110 120 130 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 PSEKSEVGQALCLTAREEDCFQILDDCPPPPAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGG .. : : .::: : ::::: ::.: .. ..:. . . ..:.::: NP_001 AVRRMPPGA--------EAGSVVLDDSPAPPAPFEHRVVSVKETSISAGYEVCQHEVLGG 140 150 160 170 180 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 GKFGAVCTCMEKATGLKLAAKVIKKQTPKDKEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPH :.:: : : ::.::: ::::.:: .. ::.: : ::..::::.: :::::: :.:. : NP_001 GRFGQVHRCTEKSTGLPLAAKIIKVKSAKDREDVKNEINIMNQLSHVNLIQLYDAFESKH 190 200 210 220 230 240 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 EIVLFMEYIEGGELFERIVDEDYHLTEVDTMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENIL .: :::..:::::.::.:: :::::.:...:.::::.:. ..:. .::::::::::: NP_001 SCTLVMEYVDGGELFDRITDEKYHLTELDVVLFTRQICEGVHYLHQHYILHLDLKPENIL 250 260 270 280 290 300 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 CVNTTGHLVKIIDFGLARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITY ::: ::: .:::::::::::.: :::::::::::::.::::::. .: :::::.::::: NP_001 CVNQTGHQIKIIDFGLARRYKPREKLKVNFGTPEFLAPEVVNYEFVSFPTDMWSVGVITY 310 320 330 340 350 360 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 MLLSGLSPFLGDDDTETLNNVLSGNWYFDEETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQ :::::::::::. :.::.: ... .: :: .:::..:.::::::: :.::.. ::.:.: NP_001 MLLSGLSPFLGETDAETMNFIVNCSWDFDADTFEGLSEEAKDFVSRLLVKEKSCRMSATQ 370 380 390 400 410 420 540 550 560 570 580 590 pF1KE0 CLAHPWLNNLAEKAKRCNRRLKSQILLKKYLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMA :: : ::::: ::.: . :::::.::.::. .:.:::.: .:.::::..:. .: NP_001 CLKHEWLNNLPAKASRSKTRLKSQLLLQKYIAQRKWKKHFYVVTAANRLRKFPTSP 430 440 450 460 470 pF1KE0 LGV >>XP_006721397 (OMIM: 612147) PREDICTED: myosin light ch (478 aa) initn: 1488 init1: 1446 opt: 1460 Z-score: 566.6 bits: 114.5 E(85289): 8e-25 Smith-Waterman score: 1484; 48.7% identity (70.3% similar) in 505 aa overlap (89-588:13-477) 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 SEKGDGTLAQPSTSSQGPKGEGDRGGGPAEGSAGPPAALPQQTATPETSVKKPKAEQGAS :: :: : : :. . ..:: XP_006 MDTPGEMLMTGRGSLGP-------TLTTEAPAAAQPGKQGPP 10 20 30 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 GS----QDPG-KPRVGKKAAEGQAAARRGSPAFLHSPSCPAIISSSEKLLAKKPPSEASE :. : :: .: :... :: ::. :: :. : :. ... :. : :. XP_006 GTGRCLQAPGTEP--GEQTPEG---ARELSP--LQESSSPGGVKAEEEQRAGAEPG---- 40 50 60 70 80 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 LTFEGVPMTHSPTDPRPAKAEEGKNILAESQKEVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAV : : :..... . .. . : :.:: ::. . . : . .: XP_006 ------------TRPSLARSDDNDHEVGALGLQQG-KSPG-AGNPEPEQDCAARAPVRAE 90 100 110 120 130 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 PSEKSEVGQALCLTAREEDCFQILDDCPPPPAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGG .. : : .::: : ::::: ::.: .. ..:. . . ..:.::: XP_006 AVRRMPPGA--------EAGSVVLDDSPAPPAPFEHRVVSVKETSISAGYEVCQHEVLGG 140 150 160 170 180 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 GKFGAVCTCMEKATGLKLAAKVIKKQTPKDKEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPH :.:: : : ::.::: ::::.:: .. ::.: : ::..::::.: :::::: :.:. : XP_006 GRFGQVHRCTEKSTGLPLAAKIIKVKSAKDREDVKNEINIMNQLSHVNLIQLYDAFESKH 190 200 210 220 230 240 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 EIVLFMEYIEGGELFERIVDEDYHLTEVDTMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENIL .: :::..:::::.::.:: :::::.:...:.::::.:. ..:. .::::::::::: XP_006 SCTLVMEYVDGGELFDRITDEKYHLTELDVVLFTRQICEGVHYLHQHYILHLDLKPENIL 250 260 270 280 290 300 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 CVNTTGHLVKIIDFGLARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITY ::: ::: .:::::::::::.: :::::::::::::.::::::. .: :::::.::::: XP_006 CVNQTGHQIKIIDFGLARRYKPREKLKVNFGTPEFLAPEVVNYEFVSFPTDMWSVGVITY 310 320 330 340 350 360 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 MLLSGLSPFLGDDDTETLNNVLSGNWYFDEETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQ :::::::::::. :.::.: ... .: :: .:::..:.::::::: :.::.. ::.:.: XP_006 MLLSGLSPFLGETDAETMNFIVNCSWDFDADTFEGLSEEAKDFVSRLLVKEKSCRMSATQ 370 380 390 400 410 420 540 550 560 570 580 590 pF1KE0 CLAHPWLNNLAEKAKRCNRRLKSQILLKKYLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMA :: : ::::: ::.: . :::::.::.::. .:.:::.: .:.::::..:. .: XP_006 CLKHEWLNNLPAKASRSKTRLKSQLLLQKYIAQRKWKKHFYVVTAANRLRKFPTSP 430 440 450 460 470 pF1KE0 LGV >>XP_016861959 (OMIM: 600922,613780) PREDICTED: myosin l (713 aa) initn: 979 init1: 952 opt: 1049 Z-score: 413.9 bits: 86.9 E(85289): 2.6e-16 Smith-Waterman score: 1049; 45.9% identity (72.0% similar) in 353 aa overlap (234-586:215-562) 210 220 230 240 250 260 pF1KE0 QKEVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAVPSEKSEVGQALCLTAREEDCFQILDDCPPP ::..::. . . .: .. :: XP_016 RSTSFNVQDLLPDHEYKFRVRAINVYGTSEPSQESELTTVGEKPEEPKDEVEVSDDDEKE 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE0 PAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGGGKFGAVCTCMEKATGLKLAAKVIKKQTPKD : .: : . : . :.: .. .: ::.:::: : .:: : :.: .: . :. XP_016 PE-VDYRTVTINTEQKVSDF-YDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTRKVWAGKFFKAYSAKE 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 KEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPHEIVLFMEYIEGGELFERIVDEDYHLTEVDT :: . :: .:: :.: .:.: :.: .::. .: . ::::::::.:::..::: . XP_016 KENIRQEISIMNCLHHPKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTEREC 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE0 MVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENILCVNTTGHLVKIIDFGLARRYNPNEKLKVNF . ..::: .:. ..::. ..:::::::::.::: :: .:.:::::::: . .::: : XP_016 IKYMRQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRIKLIDFGLARRLENAGSLKVLF 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KE0 GTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITYMLLSGLSPFLGDDDTETLNNVLSGNWYFDE :::::..:::.::. :. :::::.::: :.:.::::::.::.:.::: :: :..: ::. XP_016 GTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDD 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KE0 ETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQCLAHPWLNNLAEKAKRCNRRLKSQILLKKY :.:. .::.::::.:::. ::.. :.. .::: :::: . .: . . :. .::: XP_016 EAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLDCTQCLQHPWL---MKDTKNMEAKKLSKDRMKKY 490 500 510 520 530 570 580 590 pF1KE0 LMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMALGV . .:.:.:. :: : .:..... XP_016 MARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEKLESEDVSQAFLEAV 540 550 560 570 580 590 >>XP_016861960 (OMIM: 600922,613780) PREDICTED: myosin l (714 aa) initn: 979 init1: 952 opt: 1049 Z-score: 413.9 bits: 86.9 E(85289): 2.6e-16 Smith-Waterman score: 1049; 45.9% identity (72.0% similar) in 353 aa overlap (234-586:215-562) 210 220 230 240 250 260 pF1KE0 QKEVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAVPSEKSEVGQALCLTAREEDCFQILDDCPPP ::..::. . . .: .. :: XP_016 RSTSFNVQDLLPDHEYKFRVRAINVYGTSEPSQESELTTVGEKPEEPKDEVEVSDDDEKE 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE0 PAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGGGKFGAVCTCMEKATGLKLAAKVIKKQTPKD : .: : . : . :.: .. .: ::.:::: : .:: : :.: .: . :. XP_016 PE-VDYRTVTINTEQKVSDF-YDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTRKVWAGKFFKAYSAKE 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 KEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPHEIVLFMEYIEGGELFERIVDEDYHLTEVDT :: . :: .:: :.: .:.: :.: .::. .: . ::::::::.:::..::: . XP_016 KENIRQEISIMNCLHHPKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTEREC 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE0 MVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENILCVNTTGHLVKIIDFGLARRYNPNEKLKVNF . ..::: .:. ..::. ..:::::::::.::: :: .:.:::::::: . .::: : XP_016 IKYMRQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRIKLIDFGLARRLENAGSLKVLF 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KE0 GTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITYMLLSGLSPFLGDDDTETLNNVLSGNWYFDE :::::..:::.::. :. :::::.::: :.:.::::::.::.:.::: :: :..: ::. XP_016 GTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDD 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KE0 ETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQCLAHPWLNNLAEKAKRCNRRLKSQILLKKY :.:. .::.::::.:::. ::.. :.. .::: :::: . .: . . :. .::: XP_016 EAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLDCTQCLQHPWL---MKDTKNMEAKKLSKDRMKKY 490 500 510 520 530 570 580 590 pF1KE0 LMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMALGV . .:.:.:. :: : .:..... XP_016 MARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEKLESEEDVSQAFLEA 540 550 560 570 580 590 >>XP_016861958 (OMIM: 600922,613780) PREDICTED: myosin l (991 aa) initn: 952 init1: 952 opt: 1049 Z-score: 412.3 bits: 87.0 E(85289): 3.2e-16 Smith-Waterman score: 1053; 35.4% identity (59.6% similar) in 607 aa overlap (2-586:270-840) 10 20 30 pF1KE0 MATENG-AVELGIQNPSTDKAPKGPTGERPL :.:: : :. . :... : : : XP_016 PEDRGLYKCVAKNDAGQAECSCQVTVDDAPASENTKAPEMKSRRPKSSLPPVLGT-ESDA 240 250 260 270 280 290 40 50 60 70 pF1KE0 AAGKDPGPPDPKKAPDPPTL---KKDAKAPASEK----GDGTLAQPSTSS------QGPK .. : :.: : :: :: . .: :. :.:. : : .:: : . : . XP_016 TVKKKPAPKTPPKAAMPPQIIQFPEDQKVRAGESVELFGKVTGTQPITCTWMKFRKQIQE 300 310 320 330 340 350 80 90 100 110 120 130 pF1KE0 GEGDRGGGPAEGSAGPPAALPQQ-----TATPETSVKKPKAEQGASGSQDPGKPRVGKKA .: . . .:: : :. : :... . .:. . . . : : XP_016 SEHMKVENSENGSKLTILAARQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPA----- 360 370 380 390 400 410 140 150 160 170 180 190 pF1KE0 AEGQAAARRGSPAFLHSPSCPAIISSSEKLLAKKPPSEASELTFEGVPMTHSPTDPRPAK :.: : . : :: :. : ..: ..: . . XP_016 ---------GTP-------CASDIRSSSLTLSWYGSS------YDGGSAVQSYSIEIWDS 420 430 440 450 200 210 220 230 240 pF1KE0 AEEGKNILAESQK---EVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAVPSEKSEVGQALCLTAR :.. . :: .. .: . : . . .... . : . ::..::. . . XP_016 ANKTWKELATCRSTSFNVQDLLPDHEYKFRVRAINVYGT---SEPSQESELTTVGEKPEE 460 470 480 490 500 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 EEDCFQILDDCPPPPAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGGGKFGAVCTCMEKATGL .: .. :: : .: : . : . :.: .. .: ::.:::: : .:: : XP_016 PKDEVEVSDDDEKEPE-VDYRTVTINTEQKVSDF-YDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTRK 510 520 530 540 550 560 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 KLAAKVIKKQTPKDKEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPHEIVLFMEYIEGGELFE :.: .: . :.:: . :: .:: :.: .:.: :.: .::. .: . :::::: XP_016 VWAGKFFKAYSAKEKENIRQEISIMNCLHHPKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFE 570 580 590 600 610 620 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 RIVDEDYHLTEVDTMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENILCVNTTGHLVKIIDFGL ::.:::..::: . . ..::: .:. ..::. ..:::::::::.::: :: .:.::::: XP_016 RIIDEDFELTERECIKYMRQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRIKLIDFGL 630 640 650 660 670 680 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 ARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITYMLLSGLSPFLGDDDTE ::: . .::: ::::::..:::.::. :. :::::.::: :.:.::::::.::.:.: XP_016 ARRLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNE 690 700 710 720 730 740 490 500 510 520 530 540 pF1KE0 TLNNVLSGNWYFDEETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQCLAHPWLNNLAEKAKR :: :: :..: ::.:.:. .::.::::.:::. ::.. :.. .::: :::: . .: XP_016 TLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLDCTQCLQHPWL---MKDTKN 750 760 770 780 790 800 550 560 570 580 590 pF1KE0 CNRRLKSQILLKKYLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMALGV . . :. .:::. .:.:.:. :: : .:..... XP_016 MEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEK 810 820 830 840 850 860 XP_016 LESEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDD 870 880 890 900 910 920 >>NP_001308238 (OMIM: 600922,613780) myosin light chain (1738 aa) initn: 992 init1: 952 opt: 1049 Z-score: 409.6 bits: 87.3 E(85289): 4.5e-16 Smith-Waterman score: 1053; 35.4% identity (59.6% similar) in 607 aa overlap (2-586:1016-1586) 10 20 30 pF1KE0 MATENG-AVELGIQNPSTDKAPKGPTGERPL :.:: : :. . :... : : : NP_001 PEDRGLYKCVAKNDAGQAECSCQVTVDDAPASENTKAPEMKSRRPKSSLPPVLGT-ESDA 990 1000 1010 1020 1030 1040 40 50 60 70 pF1KE0 AAGKDPGPPDPKKAPDPPTL---KKDAKAPASEK----GDGTLAQPSTSS------QGPK .. : :.: : :: :: . .: :. :.:. : : .:: : . : . 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XP_011 MEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEK 1730 1740 1750 1760 1770 1780 XP_011 LESEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDD 1790 1800 1810 1820 1830 1840 596 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 04:48:23 2016 done: Sat Nov 5 04:48:24 2016 Total Scan time: 10.650 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]