Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0986
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0986, 601 aa
1>>>pF1KE0986 601 - 601 aa - 601 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5239+/-0.00104; mu= 3.8987+/- 0.061
mean_var=254.9902+/-58.237, 0's: 0 Z-trim(111.3): 506 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.080318
statistics sampled from 11719 (12305) to 11719 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.712), E-opt: 0.2 (0.378), width: 16
Scan time: 3.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8978.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 ( 601) 4048 483.0 4.8e-136
CCDS8979.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 ( 528) 3569 427.4 2.2e-119
CCDS30999.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 ( 588) 2323 283.1 6.9e-76
CCDS31000.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 ( 568) 2321 282.8 8e-76
CCDS8530.1 DYRK4 gene_id:8798|Hs108|chr12 ( 520) 1312 165.9 1.2e-40
CCDS12543.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 629) 982 127.7 4.3e-29
CCDS13654.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 529) 963 125.5 1.8e-28
CCDS42926.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 584) 963 125.5 1.9e-28
CCDS13653.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 754) 963 125.6 2.3e-28
CCDS42925.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 763) 963 125.6 2.3e-28
CCDS46075.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 589) 896 117.7 4.1e-26
CCDS12544.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 601) 896 117.8 4.2e-26
CCDS75666.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1171) 668 91.6 6e-18
CCDS75667.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1198) 668 91.6 6.1e-18
CCDS868.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1075) 661 90.8 9.9e-18
CCDS41634.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1194) 661 90.8 1.1e-17
CCDS867.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1210) 661 90.8 1.1e-17
CCDS7884.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1215) 661 90.8 1.1e-17
CCDS4488.1 PRPF4B gene_id:8899|Hs108|chr6 (1007) 607 84.5 7.2e-16
CCDS12555.1 HIPK4 gene_id:147746|Hs108|chr19 ( 616) 588 82.1 2.4e-15
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 513 73.1 6.6e-13
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 488 70.7 9.9e-12
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 488 70.7 1e-11
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 465 67.6 3.2e-11
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 463 67.3 3.8e-11
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 450 65.8 9.4e-11
>>CCDS8978.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 (601 aa)
initn: 4048 init1: 4048 opt: 4048 Z-score: 2556.0 bits: 483.0 E(32554): 4.8e-136
Smith-Waterman score: 4048; 100.0% identity (100.0% similar) in 601 aa overlap (1-601:1-601)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLTRKPSAAAPAAYPTGRGGDSAVRQLQASPGLGAGATRSGVGTGPPSPIALPPLRASNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MLTRKPSAAAPAAYPTGRGGDSAVRQLQASPGLGAGATRSGVGTGPPSPIALPPLRASNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AAAAHTIGGSKHTMNDHLHVGSHAHGQIQVQQLFEDNSNKRTVLTTQPNGLTTVGKTGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 AAAAHTIGGSKHTMNDHLHVGSHAHGQIQVQQLFEDNSNKRTVLTTQPNGLTTVGKTGLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VVPERQLDSIHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQYMQKLTAFEHHEIFSYPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VVPERQLDSIHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQYMQKLTAFEHHEIFSYPE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IYFLGLNAKKRQGMTGGPNNGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKGSFGQVVKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IYFLGLNAKKRQGMTGGPNNGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKGSFGQVVKAY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DHKVHQHVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENFTFRNHICMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 DHKVHQHVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENFTFRNHICMT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FELLSMNLYELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLDALHKNRIIHCDLKPENILLKQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FELLSMNLYELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLDALHKNRIIHCDLKPENILLKQQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 RSGIKVIDFGSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPIDMWSLGCILAELLTGYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 RSGIKVIDFGSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPIDMWSLGCILAELLTGYP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 LLPGEDEGDQLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNFVSSKGYPRYCTVTTLSDGSVVLNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LLPGEDEGDQLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNFVSSKGYPRYCTVTTLSDGSVVLNGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 RSRRGKLRGPPESREWGNALKGCDDPLFLDFLKQCLEWDPAVRMTPGQALRHPWLRRRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 RSRRGKLRGPPESREWGNALKGCDDPLFLDFLKQCLEWDPAVRMTPGQALRHPWLRRRLP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 KPPTGEKTSVKRITESTGAITSISKLPPPSSSASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KPPTGEKTSVKRITESTGAITSISKLPPPSSSASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLV
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 S
:
CCDS89 S
>>CCDS8979.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 (528 aa)
initn: 3569 init1: 3569 opt: 3569 Z-score: 2256.7 bits: 427.4 E(32554): 2.2e-119
Smith-Waterman score: 3569; 100.0% identity (100.0% similar) in 528 aa overlap (74-601:1-528)
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TGPPSPIALPPLRASNAAAAAHTIGGSKHTMNDHLHVGSHAHGQIQVQQLFEDNSNKRTV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MNDHLHVGSHAHGQIQVQQLFEDNSNKRTV
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LTTQPNGLTTVGKTGLPVVPERQLDSIHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LTTQPNGLTTVGKTGLPVVPERQLDSIHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQY
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 MQKLTAFEHHEIFSYPEIYFLGLNAKKRQGMTGGPNNGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MQKLTAFEHHEIFSYPEIYFLGLNAKKRQGMTGGPNNGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYE
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VLKVIGKGSFGQVVKAYDHKVHQHVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VLKVIGKGSFGQVVKAYDHKVHQHVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMN
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 VIHMLENFTFRNHICMTFELLSMNLYELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLDALHKNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VIHMLENFTFRNHICMTFELLSMNLYELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLDALHKNR
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 IIHCDLKPENILLKQQGRSGIKVIDFGSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IIHCDLKPENILLKQQGRSGIKVIDFGSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPI
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 DMWSLGCILAELLTGYPLLPGEDEGDQLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNFVSSKGYPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 DMWSLGCILAELLTGYPLLPGEDEGDQLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNFVSSKGYPR
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 YCTVTTLSDGSVVLNGGRSRRGKLRGPPESREWGNALKGCDDPLFLDFLKQCLEWDPAVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YCTVTTLSDGSVVLNGGRSRRGKLRGPPESREWGNALKGCDDPLFLDFLKQCLEWDPAVR
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 MTPGQALRHPWLRRRLPKPPTGEKTSVKRITESTGAITSISKLPPPSSSASKLRTNLAQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MTPGQALRHPWLRRRLPKPPTGEKTSVKRITESTGAITSISKLPPPSSSASKLRTNLAQM
460 470 480 490 500 510
590 600
pF1KE0 TDANGNIQQRTVLPKLVS
::::::::::::::::::
CCDS89 TDANGNIQQRTVLPKLVS
520
>>CCDS30999.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 (588 aa)
initn: 2225 init1: 2174 opt: 2323 Z-score: 1475.9 bits: 283.1 E(32554): 6.9e-76
Smith-Waterman score: 2333; 61.7% identity (83.2% similar) in 564 aa overlap (40-601:47-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 APAAYPTGRGGDSAVRQLQASPGLGAGATRSGVGTGPPSPIALPPLRASNAAAAAHTIGG
:.: .: : :: : : .. :
CCDS30 GAGLPPQQRRLGDGVYDTFMMIDETKCPPCSNVLCNPSEP---PPPRRLNMTTEQFTGDH
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SKHTMNDHLHVGSHAHGQIQVQQLFEDNSNKRTVLTTQPNGLTTVGKTGLPVVPERQLDS
..: .. :...:.:::.. .:... : : .:.. : . : .. :
CCDS30 TQHFLDG---------GEMKVEQLFQEFGNRKSN-TIQSDGISDSEKCSPTVSQGKSSDC
80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 IHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQYMQKLTAFEHHEIFSYPEIYFLGLNAK
.. ...:.: :..:.:::::.::: ..:::.:. ::..::::::.: :::
CCDS30 LNTVKSNSSSKAP-------KVVPLTPEQALKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGPNAK
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 KRQGMTGGPNNGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKGSFGQVVKAYDHKVHQHVA
::.:. :::::::::: .:.:..::.::.::::::::.:::::::::...::::..:.::
CCDS30 KRHGVIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQYVA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENFTFRNHICMTFELLSMNLY
::::::::::::::::::::::::.:::: ..::::::::.::::::.::.:::::..::
CCDS30 LKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSIDLY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLDALHKNRIIHCDLKPENILLKQQGRSGIKVIDF
::::::::::::. ::::::.:::: :::::::.::::::::::::::..:::. :::::
CCDS30 ELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSSTKVIDF
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 GSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPIDMWSLGCILAELLTGYPLLPGEDEGD
::::.:.:..:::::::::::::.:::.::. :::.::.:::::::::: ::.:::::::
CCDS30 GSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGD
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 QLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNFVSSKGYPRYCTVTTLSDGSVVLNGGRSRRGKLRG
:::::.:::::: :::. ::::: :..::: ::::.::: .:: ::: :::::::: ::
CCDS30 QLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRRGKKRG
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 PPESREWGNALKGCDDPLFLDFLKQCLEWDPAVRMTPGQALRHPWLRRRLPKP-PTGEKT
:: :..::.::::::: ::..:::.::.:::..:.::.:::::::. . .:.: : .:.
CCDS30 PPGSKDWGTALKGCDDYLFIEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTIDKV
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SVKRITESTGAITSI-SKLPPPSSSASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLVS
: ::... ..:. .. ::::: . :.::..:: :...::.: .:::::.:
CCDS30 SGKRVVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANL--MSETNGSIPLCSVLPKLIS
540 550 560 570 580
>>CCDS31000.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 (568 aa)
initn: 2225 init1: 2174 opt: 2321 Z-score: 1474.8 bits: 282.8 E(32554): 8e-76
Smith-Waterman score: 2333; 61.7% identity (83.2% similar) in 564 aa overlap (40-601:27-568)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 APAAYPTGRGGDSAVRQLQASPGLGAGATRSGVGTGPPSPIALPPLRASNAAAAAHTIGG
:.: .: : :: : : .. :
CCDS31 MKWKEKLGDGVYDTFMMIDETKCPPCSNVLCNPSEP---PPPRRLNMTTEQFTGDH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SKHTMNDHLHVGSHAHGQIQVQQLFEDNSNKRTVLTTQPNGLTTVGKTGLPVVPERQLDS
..: .. :...:.:::.. .:... : : .:.. : . : .. :
CCDS31 TQHFLDG---------GEMKVEQLFQEFGNRKSN-TIQSDGISDSEKCSPTVSQGKSSDC
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 IHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQYMQKLTAFEHHEIFSYPEIYFLGLNAK
.. ...:.: :..:.:::::.::: ..:::.:. ::..::::::.: :::
CCDS31 LNTVKSNSSSKAP-------KVVPLTPEQALKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGPNAK
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 KRQGMTGGPNNGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKGSFGQVVKAYDHKVHQHVA
::.:. :::::::::: .:.:..::.::.::::::::.:::::::::...::::..:.::
CCDS31 KRHGVIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQYVA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENFTFRNHICMTFELLSMNLY
::::::::::::::::::::::::.:::: ..::::::::.::::::.::.:::::..::
CCDS31 LKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSIDLY
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLDALHKNRIIHCDLKPENILLKQQGRSGIKVIDF
::::::::::::. ::::::.:::: :::::::.::::::::::::::..:::. :::::
CCDS31 ELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSLDALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSSTKVIDF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 GSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPIDMWSLGCILAELLTGYPLLPGEDEGD
::::.:.:..:::::::::::::.:::.::. :::.::.:::::::::: ::.:::::::
CCDS31 GSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPGEDEGD
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 QLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNFVSSKGYPRYCTVTTLSDGSVVLNGGRSRRGKLRG
:::::.:::::: :::. ::::: :..::: ::::.::: .:: ::: :::::::: ::
CCDS31 QLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYCSVTTQADGRVVLVGGRSRRGKKRG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 PPESREWGNALKGCDDPLFLDFLKQCLEWDPAVRMTPGQALRHPWLRRRLPKP-PTGEKT
:: :..::.::::::: ::..:::.::.:::..:.::.:::::::. . .:.: : .:.
CCDS31 PPGSKDWGTALKGCDDYLFIEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISKSVPRPLTTIDKV
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SVKRITESTGAITSI-SKLPPPSSSASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLVS
: ::... ..:. .. ::::: . :.::..:: :...::.: .:::::.:
CCDS31 SGKRVVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANL--MSETNGSIPLCSVLPKLIS
520 530 540 550 560
>>CCDS8530.1 DYRK4 gene_id:8798|Hs108|chr12 (520 aa)
initn: 1450 init1: 1307 opt: 1312 Z-score: 843.4 bits: 165.9 E(32554): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 1467; 53.4% identity (77.8% similar) in 414 aa overlap (141-549:23-419)
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LTTVGKTGLPVVPERQLDSIHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQYMQKLTAF
:. : : . . .: .:.: . ..:. .
CCDS85 MPASELKASEIPFHPSIKTQDPKAEEKSPKKQKVTLTAAEALKLFKNQLSPY
10 20 30 40 50
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CCDS85 EQSEILGYAELWFLGLEAKKLDTAPEKFSKTSFDDEHGFYLKVLHDHIAYRYEVLETIGK
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pF1KE0 GSFGQVVKAYDHKVHQHVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLEN
::::::.: ::: .. ::::..::.::::.:: :..::: :::.:::::.::.:: .
CCDS85 GSFGQVAKCLDHKNNELVALKIIRNKKRFHQQALMELKILEALRKKDKDNTYNVVHMKDF
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: ::::.:.:::::..:::::.:.:.:::::: .::.:. :.:.::. : ..:::::::
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CCDS85 PENIVLYQKGQASVKVIDFGSSCYEHQKVYTYIQSRFYRSPEVILGHPYDVAIDMWSLGC
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: ::: :::::.:::.: .::::..:.::.: ......: ..: .:::.:. :
CCDS85 ITAELYTGYPLFPGENEVEQLACIMEVLGLPPAGFIQTASRRQTFFDSKGFPKNIT----
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CCDS85 -----------NNRGKKRYP-DSKDLTMVLKTYDTS-FLDFLRRCLVWEPSLRMTPDQAL
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CCDS85 KHAWIHQSRNLKPQPRPQTLRKSNSFFPSETRKDKVQGCHHSSRKADEITKETTEKTKDS
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. :::... . :. : :::::. .:. .. :::. ..::::
CCDS12 EVYYAKKKRRAQQAPPQDSSNKKEKKVLNHGYDDDNHDYIVRSGERWLERYEIDSLIGKG
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CCDS12 SFGQVVKAYDHQTQELVAIKIIKNKKAFLNQAQIELRLLELMNQHDTEMKYYIVHLKRHF
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:::.:. :: ::. : .: ::. ..:.::.: .:: . .:... . . :. :
CCDS12 CILVEMHTGEPLFSGSNEVDQMNRIVEVLGIPPAAMLDQAPKARKYFERLPGGGWTLRRT
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.: .: .:: : : : .:. :. .. : : : :.. . ::..:
CCDS12 KELRKD----YQGPGTRRLQEVLGVQTGGPGGRRAGEPGHSPADYLRFQDLVLRMLEYEP
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CCDS12 AARISPLGALQHGFFRRTADEATNTGPAGSSASTSPAPLDTCPSSSTASSISSSGGSSGS
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.: ::
CCDS12 SSDNRTYRYSNRYCGGPGPPITDCEMNSPQVPPSQPLRPWAGGDVPHKTHQAPASASSLP
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CCDS13 YQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLG
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CCDS13 RAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKKTADE---GTNTS-NSV
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CCDS13 STSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGASAISCSSWLVRH
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CCDS42 QAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVS
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CCDS42 LNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRI
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CCDS42 RAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKKTADEG-TNTSNSVSTS
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CCDS13 FRDPATAPLRKLSVDLIK--TYKH-----INEVYYAKKKRRHQQGQGDDSSHKKERKVYN
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CCDS13 DGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFL
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CCDS13 NQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGV
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CCDS13 SLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQR
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CCDS13 IYQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVL
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CCDS13 GIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTW-NLKKTKDGKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGG
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CCDS13 RRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKKTADEG-TNTSNSVST
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CCDS13 SPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGRARSDPTHQHRHSGGHFTAAVQAMDCETHS
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CCDS42 RRMPQTFRDPATAPLRKLSVDLIKTYKHINEVYYAKKKRRHQQGQGDDSSHKKERKVYND
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pF1KE0 GYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKGSFGQVVKAYDHKVHQHVALKMVRNEKRFHR
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CCDS42 GYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLN
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pF1KE0 QAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENFTFRNHICMTFELLSMNLYELIKKNKFQGFS
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CCDS42 QAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVS
200 210 220 230 240 250
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pF1KE0 LPLVRKFAHSILQCLD--ALHKNRIIHCDLKPENILLKQQGRSGIKVIDFGSSCYEHQRV
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CCDS42 LNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRI
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pF1KE0 MPSQKLLDASKRAKNFVSSKGYPRYCTVTTLSDGSVVLNGGRSRR-----GKLRGPPESR
.: ..:: . .:..: . . .. .::. . .:. : : : .:
CCDS42 IPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTW-NLKKTKDGKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGR
380 390 400 410 420 430
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pF1KE0 EWGNALKGCDDPL-FLDFLKQCLEWDPAVRMTPGQALRHPWLRRRLPKPPTGEKTSVK--
. :.. . : : : :.. . :..:: .:. : ::.: .... . :. ..::.
CCDS42 RAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKKTADEG-TNTSNSVSTS
440 450 460 470 480 490
560 570 580 590 600
pF1KE0 ---RITESTGAITSISKLPPPSSSASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLVS
. ..:.:. .: :. ::..:
CCDS42 PAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGRARSDPTHQHRHSGGHFTAAVQAMDCETHSP
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601 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]