FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0986, 601 aa 1>>>pF1KE0986 601 - 601 aa - 601 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2028+/-0.000485; mu= 1.9309+/- 0.030 mean_var=516.1877+/-114.342, 0's: 0 Z-trim(118.9): 1217 B-trim: 36 in 1/59 Lambda= 0.056451 statistics sampled from 30569 (32335) to 30569 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16 Scan time: 10.410 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006473 (OMIM: 603496) dual specificity tyrosine ( 601) 4048 345.4 3.2e-94 NP_003574 (OMIM: 603496) dual specificity tyrosine ( 528) 3569 306.3 1.7e-82 XP_016875521 (OMIM: 603496) PREDICTED: dual specif ( 528) 3569 306.3 1.7e-82 NP_003573 (OMIM: 603497) dual specificity tyrosine ( 588) 2323 204.9 6.2e-52 XP_011508363 (OMIM: 603497) PREDICTED: dual specif ( 553) 2321 204.7 6.7e-52 NP_001004023 (OMIM: 603497) dual specificity tyros ( 568) 2321 204.7 6.8e-52 XP_005273372 (OMIM: 603497) PREDICTED: dual specif ( 568) 2321 204.7 6.8e-52 NP_003836 (OMIM: 609181) dual specificity tyrosine ( 520) 1312 122.5 3.6e-27 NP_004705 (OMIM: 604556,615812) dual specificity t ( 629) 982 95.7 4.8e-19 XP_005259455 (OMIM: 604556,615812) PREDICTED: dual ( 629) 982 95.7 4.8e-19 NP_569122 (OMIM: 600855,614104) dual specificity t ( 529) 963 94.1 1.3e-18 NP_567824 (OMIM: 600855,614104) dual specificity t ( 584) 963 94.1 1.4e-18 XP_011527787 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 725) 963 94.3 1.5e-18 XP_016883775 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 734) 963 94.3 1.5e-18 XP_016883774 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 754) 963 94.3 1.6e-18 NP_569120 (OMIM: 600855,614104) dual specificity t ( 754) 963 94.3 1.6e-18 XP_016883773 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 754) 963 94.3 1.6e-18 XP_006724042 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 754) 963 94.3 1.6e-18 XP_011527786 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 761) 963 94.3 1.6e-18 XP_006724039 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 763) 963 94.3 1.6e-18 XP_011527785 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 763) 963 94.3 1.6e-18 XP_006724041 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 763) 963 94.3 1.6e-18 NP_001387 (OMIM: 600855,614104) dual specificity t ( 763) 963 94.3 1.6e-18 XP_006724040 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 763) 963 94.3 1.6e-18 XP_011527784 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 770) 963 94.3 1.6e-18 NP_006474 (OMIM: 604556,615812) dual specificity t ( 589) 896 88.7 6e-17 NP_006475 (OMIM: 604556,615812) dual specificity t ( 601) 896 88.7 6.1e-17 XP_005260990 (OMIM: 600855,614104) PREDICTED: dual ( 535) 699 72.6 3.9e-12 NP_001106710 (OMIM: 606868) homeodomain-interactin (1171) 668 70.6 3.3e-11 XP_016867558 (OMIM: 606868) PREDICTED: homeodomain (1191) 668 70.6 3.4e-11 XP_006715998 (OMIM: 606868) PREDICTED: homeodomain (1191) 668 70.6 3.4e-11 NP_073577 (OMIM: 606868) homeodomain-interacting p (1198) 668 70.6 3.4e-11 XP_011514383 (OMIM: 606868) PREDICTED: homeodomain (1206) 668 70.6 3.4e-11 XP_016856095 (OMIM: 608003) PREDICTED: homeodomain ( 605) 661 69.6 3.5e-11 XP_011514382 (OMIM: 606868) PREDICTED: homeodomain (1349) 668 70.7 3.6e-11 XP_011514381 (OMIM: 606868) PREDICTED: homeodomain (1350) 668 70.7 3.6e-11 XP_011514380 (OMIM: 606868) PREDICTED: homeodomain (1376) 668 70.7 3.6e-11 XP_011514379 (OMIM: 606868) PREDICTED: homeodomain (1377) 668 70.7 3.6e-11 NP_689909 (OMIM: 608003) homeodomain-interacting p (1075) 661 70.0 4.7e-11 NP_001041665 (OMIM: 604424) homeodomain-interactin (1194) 661 70.1 5e-11 XP_016872566 (OMIM: 604424) PREDICTED: homeodomain (1194) 661 70.1 5e-11 NP_001265092 (OMIM: 604424) homeodomain-interactin (1194) 661 70.1 5e-11 NP_001265091 (OMIM: 604424) homeodomain-interactin (1194) 661 70.1 5e-11 XP_016856094 (OMIM: 608003) PREDICTED: homeodomain (1209) 661 70.1 5e-11 XP_005270669 (OMIM: 608003) PREDICTED: homeodomain (1210) 661 70.1 5e-11 NP_938009 (OMIM: 608003) homeodomain-interacting p (1210) 661 70.1 5e-11 XP_005270670 (OMIM: 608003) PREDICTED: homeodomain (1210) 661 70.1 5e-11 XP_005252786 (OMIM: 604424) PREDICTED: homeodomain (1215) 661 70.1 5.1e-11 XP_016872565 (OMIM: 604424) PREDICTED: homeodomain (1215) 661 70.1 5.1e-11 NP_005725 (OMIM: 604424) homeodomain-interacting p (1215) 661 70.1 5.1e-11 >>NP_006473 (OMIM: 603496) dual specificity tyrosine-pho (601 aa) initn: 4048 init1: 4048 opt: 4048 Z-score: 1812.5 bits: 345.4 E(85289): 3.2e-94 Smith-Waterman score: 4048; 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NP_003 KHAWIHQSRNLKPQPRPQTLRKSNSFFPSETRKDKVQGCHHSSRKADEITKETTEKTKDS 400 410 420 430 440 450 >>NP_004705 (OMIM: 604556,615812) dual specificity tyros (629 aa) initn: 1014 init1: 476 opt: 982 Z-score: 462.8 bits: 95.7 E(85289): 4.8e-19 Smith-Waterman score: 991; 39.3% identity (66.0% similar) in 456 aa overlap (153-578:34-482) 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 PERQLDSIHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQYMQKLTAFEHHEIFSYPEIY :.. ..: . ..::.. : .: .: NP_004 PPGHGPFSGFPGPQEHTQVLPDVRLLPRRLPLAFRDATSAPLRKLSV---DLIKTYKHIN 10 20 30 40 50 60 190 200 210 220 230 pF1KE0 FLGLNAKKRQGMTGGPN-----------NGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKG . :::... . :. : :::::. .:. .. :::. ..:::: NP_004 EVYYAKKKRRAQQAPPQDSSNKKEKKVLNHGYDDDNHDYIVRSGERWLERYEIDSLIGKG 70 80 90 100 110 120 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SFGQVVKAYDHKVHQHVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENF :::::::::::.... ::.:...:.: : :: :.:.:: . ..: . . ..:. ..: NP_004 SFGQVVKAYDHQTQELVAIKIIKNKKAFLNQAQIELRLLELMNQHDTEMKYYIVHLKRHF 130 140 150 160 170 180 300 310 320 330 340 pF1KE0 TFRNHICMTFELLSMNLYELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLD--ALHKNRIIHCDL ::::.:..:::::.:::.:.....:.: :: :.::.:... : : . :::::: NP_004 MFRNHLCLVFELLSYNLYDLLRNTHFRGVSLNLTRKLAQQLCTALLFLATPELSIIHCDL 190 200 210 220 230 240 350 360 370 380 390 400 pF1KE0 KPENILLKQQGRSGIKVIDFGSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPIDMWSLG ::::::: . ::.::..:::::: ::.: ::::::::.:::.::. : . ::::::: NP_004 KPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGTPYDLAIDMWSLG 250 260 270 280 290 300 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 CILAELLTGYPLLPGEDEGDQLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNF---VSSKGYPRYCT :::.:. :: ::. : .: ::. ..:.::.: .:: . .:... . . :. : NP_004 CILVEMHTGEPLFSGSNEVDQMNRIVEVLGIPPAAMLDQAPKARKYFERLPGGGWTLRRT 310 320 330 340 350 360 470 480 490 500 510 520 pF1KE0 VTTLSDGSVVLNGGRSRR-----GKLRGPPESREWGNALKGCDDPL-FLDFLKQCLEWDP .: .: .:: : : : .:. :. .. : : : :.. . ::..: NP_004 KELRKD----YQGPGTRRLQEVLGVQTGGPGGRRAGEPGHSPADYLRFQDLVLRMLEYEP 370 380 390 400 410 530 540 550 560 570 pF1KE0 AVRMTPGQALRHPWLRRRLPKP----PTGEKTSVK----RITESTGAITSISKLPPPSSS :.:..: ::.: ..:: . :.: ..:.. :... .:::. :.: NP_004 AARISPLGALQHGFFRRTADEATNTGPAGSSASTSPAPLDTCPSSSTASSISSSGGSSGS 420 430 440 450 460 470 580 590 600 pF1KE0 ASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLVS .: :: NP_004 SSDNRTYRYSNRYCGGPGPPITDCEMNSPQVPPSQPLRPWAGGDVPHKTHQAPASASSLP 480 490 500 510 520 530 >>XP_005259455 (OMIM: 604556,615812) PREDICTED: dual spe (629 aa) initn: 1014 init1: 476 opt: 982 Z-score: 462.8 bits: 95.7 E(85289): 4.8e-19 Smith-Waterman score: 991; 39.3% identity (66.0% similar) in 456 aa overlap (153-578:34-482) 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 PERQLDSIHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQYMQKLTAFEHHEIFSYPEIY :.. ..: . ..::.. : .: .: XP_005 PPGHGPFSGFPGPQEHTQVLPDVRLLPRRLPLAFRDATSAPLRKLSV---DLIKTYKHIN 10 20 30 40 50 60 190 200 210 220 230 pF1KE0 FLGLNAKKRQGMTGGPN-----------NGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKG . :::... . :. : :::::. .:. .. :::. ..:::: XP_005 EVYYAKKKRRAQQAPPQDSSNKKEKKVLNHGYDDDNHDYIVRSGERWLERYEIDSLIGKG 70 80 90 100 110 120 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SFGQVVKAYDHKVHQHVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENF :::::::::::.... ::.:...:.: : :: :.:.:: . ..: . . ..:. ..: XP_005 SFGQVVKAYDHQTQELVAIKIIKNKKAFLNQAQIELRLLELMNQHDTEMKYYIVHLKRHF 130 140 150 160 170 180 300 310 320 330 340 pF1KE0 TFRNHICMTFELLSMNLYELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCLD--ALHKNRIIHCDL ::::.:..:::::.:::.:.....:.: :: :.::.:... : : . :::::: XP_005 MFRNHLCLVFELLSYNLYDLLRNTHFRGVSLNLTRKLAQQLCTALLFLATPELSIIHCDL 190 200 210 220 230 240 350 360 370 380 390 400 pF1KE0 KPENILLKQQGRSGIKVIDFGSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPIDMWSLG ::::::: . ::.::..:::::: ::.: ::::::::.:::.::. : . ::::::: XP_005 KPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGTPYDLAIDMWSLG 250 260 270 280 290 300 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 CILAELLTGYPLLPGEDEGDQLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNF---VSSKGYPRYCT :::.:. :: ::. : .: ::. ..:.::.: .:: . .:... . . :. : XP_005 CILVEMHTGEPLFSGSNEVDQMNRIVEVLGIPPAAMLDQAPKARKYFERLPGGGWTLRRT 310 320 330 340 350 360 470 480 490 500 510 520 pF1KE0 VTTLSDGSVVLNGGRSRR-----GKLRGPPESREWGNALKGCDDPL-FLDFLKQCLEWDP .: .: .:: : : : .:. :. .. : : : :.. . ::..: XP_005 KELRKD----YQGPGTRRLQEVLGVQTGGPGGRRAGEPGHSPADYLRFQDLVLRMLEYEP 370 380 390 400 410 530 540 550 560 570 pF1KE0 AVRMTPGQALRHPWLRRRLPKP----PTGEKTSVK----RITESTGAITSISKLPPPSSS :.:..: ::.: ..:: . :.: ..:.. :... .:::. :.: XP_005 AARISPLGALQHGFFRRTADEATNTGPAGSSASTSPAPLDTCPSSSTASSISSSGGSSGS 420 430 440 450 460 470 580 590 600 pF1KE0 ASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLVS .: :: XP_005 SSDNRTYRYSNRYCGGPGPPITDCEMNSPQVPPSQPLRPWAGGDVPHKTHQAPASASSLP 480 490 500 510 520 530 601 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 18:02:07 2016 done: Sat Nov 5 18:02:09 2016 Total Scan time: 10.410 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]