Result of FASTA (ccds) for pF1KE0990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0990, 625 aa
  1>>>pF1KE0990 625 - 625 aa - 625 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4174+/-0.00104; mu= -0.0502+/- 0.061
 mean_var=301.6698+/-67.986, 0's: 0 Z-trim(111.1): 138  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.073843
 statistics sampled from 11974 (12106) to 11974 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.372), width:  16
 Scan time:  4.090

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33697.1 IRAK2 gene_id:3656|Hs108|chr3          ( 625) 4230 465.0 1.3e-130
CCDS35444.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX          ( 682)  643 82.9 1.5e-15
CCDS14740.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX          ( 712)  643 82.9 1.6e-15
CCDS35443.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX          ( 633)  614 79.8 1.2e-14


>>CCDS33697.1 IRAK2 gene_id:3656|Hs108|chr3               (625 aa)
 initn: 4230 init1: 4230 opt: 4230  Z-score: 2458.3  bits: 465.0 E(32554): 1.3e-130
Smith-Waterman score: 4230; 99.8% identity (100.0% similar) in 625 aa overlap (1-625:1-625)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKIKSMERVQGVSITREL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKIKSMERVQGVSITREL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 LWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFPDSVKPEKPLAASV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFPDSVKPEKPLAASV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 RKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQPAFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQPAFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFST
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SIPKQEKLLSLAGDSLFWSEADVVQATDDFNQNRKISQGTFADVYRGHRHGKPFVFKKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SIPKQEKLLSLAGDSLFWSEADVVQATDDFNQNRKISQGTFADVYRGHRHGKPFVFKKLR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 ETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQFHSFIYPYMANGSLQDRLQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQFHSFIYPYMANGSLQDRLQG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 QGGSDPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLHGLEIIHSNVKSSNVLLDQNLTPKLAHPMAHLCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QGGSDPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLHGLEIIHSNVKSSNVLLDQNLTPKLAHPMAHLCP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 VNKRSKYTMMKTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLTKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VNKRSKYTMMKTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLTKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 PVYLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACL
       ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PVYLKDLLLSDIPSSTASLCSRKTGVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 CLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERLRGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERLRGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDAS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 SSMSVAPWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSMSVAPWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINE
              550       560       570       580       590       600

              610       620     
pF1KE0 AKRKLMENILLYKEEKVDSIELFGP
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AKRKLMENILLYKEEKVDSIELFGP
              610       620     

>>CCDS35444.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX               (682 aa)
 initn: 647 init1: 194 opt: 643  Z-score: 392.6  bits: 82.9 E(32554): 1.5e-15
Smith-Waterman score: 881; 30.0% identity (58.2% similar) in 660 aa overlap (4-623:18-657)

                             10        20        30        40      
pF1KE0               MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI-
                        ..:..: ::.  . . ::::   :: .::. .. : :.::   
CCDS35 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE
               10        20        30        40        50        60

          50        60        70        80        90       100     
pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA
       .: .:. .:      :: :  :.: : .:: .: .:.: :: .::  :.: :    :.:.
CCDS35 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-PA---PLPS
                     70        80        90       100           110

         110       120       130       140       150        160    
pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS
        : .. :.     .  .::  . .  :   .:: .:.   ...:. : .   :   .: :
CCDS35 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS
               120       130       140       150       160         

          170       180       190           200       210       220
pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT
       :    :. .     :.. :  :. .::  :   :   :   .. ..: .:... ::..: 
CCDS35 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG
        170           180       190       200       210       220  

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ
       :. :::.  ..  .. :.:.:.:     .... : .:..   :  :::..   :.::   
CCDS35 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG
            230       240       250       260       270       280  

              290       300        310       320         330       
pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK
       :. ..: .. ::::.:::. :  .  :: ::::..:  :   :...::  .  .::...:
CCDS35 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK
            290       300       310       320       330       340  

       340       350        360         370        380       390   
pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT
       :::::::. :::::.   .:..     .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:.
CCDS35 SSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLA
            350       360       370       380       390       400  

           400       410       420        430       440       450  
pF1KE0 KRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRSPV-YLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAK
         .: :: :.:. :.:.:  :. .. . . :::::.  :   . ..: : .. ..  .: 
CCDS35 VDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLKDLVEEEAEEAGVALRSTQSTLQAGLAA
            410       420       430       440       450       460  

                     460       470       480       490       500   
pF1KE0 E---------ICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERL
       .         : .:.:.   :  : . . .:.  :: ::.::      .    . :    
CCDS35 DAWAAPIAMQIYKKHLDPRPGPCPPELGLGLGQLACCCLHRRAKRRPPMTQENSYVSSTG
            470       480       490       500       510       520  

           510       520       530       540          550       560
pF1KE0 RGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDASSSM---SVAPWAGAATPLLPTEN
       :..    ::. :.  .:.:... :. .   :. .... :.   :.:  .   ::  : . 
CCDS35 RAHSGAAPWQPLAAPSGASAQAAEQLQRGPNQPVESDESLGGLSAALRSWHLTPSCPLDP
            530       540       550       560       570       580  

              570       580                   590         600      
pF1KE0 GEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEP---PQDV---------TETSW--QIEINEAKRKLM
       .   ::     ..:...:.  :  :   :  :         . .:   :: :: :..:..
CCDS35 AP--LREAGCPQGDTAGESSWGSGPGSRPTAVEGLALGSSASSSSEPPQIIINPARQKMV
              590       600       610       620       630       640

        610       620                            
pF1KE0 ENILLYKEEKVDSIELFGP                       
       ... ::..  .::..:.                         
CCDS35 QKLALYEDGALDSLQLLSSSSLPGLGLEQDRQGPEESDEFQS
              650       660       670       680  

>>CCDS14740.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX               (712 aa)
 initn: 616 init1: 194 opt: 643  Z-score: 392.3  bits: 82.9 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 828; 31.2% identity (59.6% similar) in 574 aa overlap (4-554:18-567)

                             10        20        30        40      
pF1KE0               MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI-
                        ..:..: ::.  . . ::::   :: .::. .. : :.::   
CCDS14 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE
               10        20        30        40        50        60

          50        60        70        80        90       100     
pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA
       .: .:. .:      :: :  :.: : .:: .: .:.: :: .::  :.: :    :.:.
CCDS14 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-P---APLPS
                     70        80        90       100           110

         110       120       130       140       150        160    
pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS
        : .. :.     .  .::  . .  :   .:: .:.   ...:. : .   :   .: :
CCDS14 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS
               120       130       140       150       160         

          170       180       190           200       210       220
pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT
       :    :. .     :.. :  :. .::  :   :   :   .. ..: .:... ::..: 
CCDS14 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG
        170           180       190       200       210       220  

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ
       :. :::.  ..  .. :.:.:.:     .... : .:..   :  :::..   :.::   
CCDS14 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG
            230       240       250       260       270       280  

              290       300        310       320         330       
pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK
       :. ..: .. ::::.:::. :  .  :: ::::..:  :   :...::  .  .::...:
CCDS14 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK
            290       300       310       320       330       340  

       340       350        360         370        380       390   
pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT
       :::::::. :::::.   .:..     .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:.
CCDS14 SSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLA
            350       360       370       380       390       400  

           400       410       420        430       440       450  
pF1KE0 KRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRSPV-YLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAK
         .: :: :.:. :.:.:  :. .. . . :::::.  :   . ..: : .. ..  .: 
CCDS14 VDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLKDLVEEEAEEAGVALRSTQSTLQAGLAA
            410       420       430       440       450       460  

                     460       470       480       490       500   
pF1KE0 E---------ICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERL
       .         : .:.:.   :  : . . .:.  :: ::.::      .  .:    :.:
CCDS14 DAWAAPIAMQIYKKHLDPRPGPCPPELGLGLGQLACCCLHRRAKRRPPMT-QVYERLEKL
            470       480       490       500       510        520 

           510       520       530       540       550       560   
pF1KE0 RGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDASSSMSVAPWAGAATPLLPTENGEG
       ..  . .:  : ::...    .:.:.. :....   :..   :::   :.:         
CCDS14 QAVVAGVP--GHSEAASCIPPSPQENSYVSSTGRAHSGA---APWQPLAAPSGASAQAAE
               530       540       550          560       570      

           570       580       590       600       610       620   
pF1KE0 RLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINEAKRKLMENILLYKEEKVDSIELF
                                                                   
CCDS14 QLQRGPNQPVESDESLGGLSAALRSWHLTPSCPLDPAPLREAGCPQGDTAGESSWGSGPG
        580       590       600       610       620       630      

>>CCDS35443.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX               (633 aa)
 initn: 738 init1: 194 opt: 614  Z-score: 376.3  bits: 79.8 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 765; 30.6% identity (57.7% similar) in 643 aa overlap (4-623:18-608)

                             10        20        30        40      
pF1KE0               MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI-
                        ..:..: ::.  . . ::::   :: .::. .. : :.::   
CCDS35 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE
               10        20        30        40        50        60

          50        60        70        80        90       100     
pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA
       .: .:. .:      :: :  :.: : .:: .: .:.: :: .::  :.: :    :.:.
CCDS35 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-PA---PLPS
                     70        80        90       100           110

         110       120       130       140       150        160    
pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS
        : .. :.     .  .::  . .  :   .:: .:.   ...:. : .   :   .: :
CCDS35 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS
               120       130       140       150       160         

          170       180       190           200       210       220
pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT
       :    :. .     :.. :  :. .::  :   :   :   .. ..: .:... ::..: 
CCDS35 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG
        170           180       190       200       210       220  

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ
       :. :::.  ..  .. :.:.:.:     .... : .:..   :  :::..   :.::   
CCDS35 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG
            230       240       250       260       270       280  

              290       300        310       320         330       
pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK
       :. ..: .. ::::.:::. :  .  :: ::::..:  :   :...::  .  .::...:
CCDS35 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK
            290       300       310       320       330       340  

       340       350        360         370        380       390   
pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT
       :::::::. :::::.   .:..     .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:.
CCDS35 SSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLA
            350       360       370       380       390       400  

           400       410         420             430        440    
pF1KE0 KRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNN--RSP--VY--LKDL--LLSEIPS-STASLCSRKT
         .: :: :.:. :.:.:  :. ..  :.   ::  :. :  ... .:. : :. :   .
CCDS35 VDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLVYERLEKLQAVVAGVPGHSEAASCIPPS
            410       420       430       440       450       460  

          450       460       470        480       490       500   
pF1KE0 GVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATA-ACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERL
         :: ...   . .  .::.      : . :.: :   :.:  ..  :   :....   :
CCDS35 PQENSYVSSTGRAH--SGAAPWQPLAAPSGASAQAAEQLQRGPNQPVESDESLGGLSAAL
            470         480       490       500       510       520

           510       520       530       540       550       560   
pF1KE0 RGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDASSSMSVAPWAGAATPLLPTENGEG
       :. . : :   :. .    .. :.  : . .::           : :..    ::   ::
CCDS35 RSWH-LTPSCPLDPAPLREAGCPQ-GDTAGESS-----------W-GSGPGSRPTAV-EG
               530       540        550                   560      

           570       580       590       600       610       620   
pF1KE0 RLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINEAKRKLMENILLYKEEKVDSIELF
          . .:  :.::::      :::        : :: :..:..... ::..  .::..:.
CCDS35 ---LALGSSASSSSE------PPQ--------IIINPARQKMVQKLALYEDGALDSLQLL
            570             580               590       600        

                                
pF1KE0 GP                       
                                
CCDS35 SSSSLPGLGLEQDRQGPEESDEFQS
      610       620       630   




625 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 20:41:11 2016 done: Sat Nov  5 20:41:11 2016
 Total Scan time:  4.090 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com