FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0990, 625 aa 1>>>pF1KE0990 625 - 625 aa - 625 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4174+/-0.00104; mu= -0.0502+/- 0.061 mean_var=301.6698+/-67.986, 0's: 0 Z-trim(111.1): 138 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.073843 statistics sampled from 11974 (12106) to 11974 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16 Scan time: 4.090 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33697.1 IRAK2 gene_id:3656|Hs108|chr3 ( 625) 4230 465.0 1.3e-130 CCDS35444.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX ( 682) 643 82.9 1.5e-15 CCDS14740.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX ( 712) 643 82.9 1.6e-15 CCDS35443.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX ( 633) 614 79.8 1.2e-14 >>CCDS33697.1 IRAK2 gene_id:3656|Hs108|chr3 (625 aa) initn: 4230 init1: 4230 opt: 4230 Z-score: 2458.3 bits: 465.0 E(32554): 1.3e-130 Smith-Waterman score: 4230; 99.8% identity (100.0% similar) in 625 aa overlap (1-625:1-625) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKIKSMERVQGVSITREL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKIKSMERVQGVSITREL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 LWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFPDSVKPEKPLAASV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFPDSVKPEKPLAASV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 RKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQPAFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 RKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQPAFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFST 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 SIPKQEKLLSLAGDSLFWSEADVVQATDDFNQNRKISQGTFADVYRGHRHGKPFVFKKLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 SIPKQEKLLSLAGDSLFWSEADVVQATDDFNQNRKISQGTFADVYRGHRHGKPFVFKKLR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 ETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQFHSFIYPYMANGSLQDRLQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 ETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQFHSFIYPYMANGSLQDRLQG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 QGGSDPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLHGLEIIHSNVKSSNVLLDQNLTPKLAHPMAHLCP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 QGGSDPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLHGLEIIHSNVKSSNVLLDQNLTPKLAHPMAHLCP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 VNKRSKYTMMKTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLTKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 VNKRSKYTMMKTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLTKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 PVYLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACL ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 PVYLKDLLLSDIPSSTASLCSRKTGVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACL 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE0 CLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERLRGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 CLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERLRGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDAS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE0 SSMSVAPWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 SSMSVAPWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINE 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE0 AKRKLMENILLYKEEKVDSIELFGP ::::::::::::::::::::::::: CCDS33 AKRKLMENILLYKEEKVDSIELFGP 610 620 >>CCDS35444.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX (682 aa) initn: 647 init1: 194 opt: 643 Z-score: 392.6 bits: 82.9 E(32554): 1.5e-15 Smith-Waterman score: 881; 30.0% identity (58.2% similar) in 660 aa overlap (4-623:18-657) 10 20 30 40 pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI- ..:..: ::. . . :::: :: .::. .. : :.:: CCDS35 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA .: .:. .: :: : :.: : .:: .: .:.: :: .:: :.: : :.:. 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CCDS35 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-PA---PLPS 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS : .. :. . .:: . . : .:: .:. ...:. : . : .: : CCDS35 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT : :. . :.. : :. .:: : : : .. ..: .:... ::..: CCDS35 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ :. :::. .. .. :.:.:.: .... : .:.. : :::.. :.:: CCDS35 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK :. ..: .. ::::.:::. : . :: ::::..: : :...:: . .::...: CCDS35 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT :::::::. :::::. .:.. .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:. 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CCDS35 ---LALGSSASSSSE------PPQ--------IIINPARQKMVQKLALYEDGALDSLQLL 570 580 590 600 pF1KE0 GP CCDS35 SSSSLPGLGLEQDRQGPEESDEFQS 610 620 630 625 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 20:41:11 2016 done: Sat Nov 5 20:41:11 2016 Total Scan time: 4.090 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]