Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0990, 625 aa
1>>>pF1KE0990 625 - 625 aa - 625 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4174+/-0.00104; mu= -0.0502+/- 0.061
mean_var=301.6698+/-67.986, 0's: 0 Z-trim(111.1): 138 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.073843
statistics sampled from 11974 (12106) to 11974 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 4.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33697.1 IRAK2 gene_id:3656|Hs108|chr3 ( 625) 4230 465.0 1.3e-130
CCDS35444.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX ( 682) 643 82.9 1.5e-15
CCDS14740.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX ( 712) 643 82.9 1.6e-15
CCDS35443.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX ( 633) 614 79.8 1.2e-14
>>CCDS33697.1 IRAK2 gene_id:3656|Hs108|chr3 (625 aa)
initn: 4230 init1: 4230 opt: 4230 Z-score: 2458.3 bits: 465.0 E(32554): 1.3e-130
Smith-Waterman score: 4230; 99.8% identity (100.0% similar) in 625 aa overlap (1-625:1-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKIKSMERVQGVSITREL
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CCDS33 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKIKSMERVQGVSITREL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFPDSVKPEKPLAASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFPDSVKPEKPLAASV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 RKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQPAFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQPAFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SIPKQEKLLSLAGDSLFWSEADVVQATDDFNQNRKISQGTFADVYRGHRHGKPFVFKKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SIPKQEKLLSLAGDSLFWSEADVVQATDDFNQNRKISQGTFADVYRGHRHGKPFVFKKLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQFHSFIYPYMANGSLQDRLQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQFHSFIYPYMANGSLQDRLQG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QGGSDPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLHGLEIIHSNVKSSNVLLDQNLTPKLAHPMAHLCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QGGSDPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLHGLEIIHSNVKSSNVLLDQNLTPKLAHPMAHLCP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 VNKRSKYTMMKTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLTKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VNKRSKYTMMKTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLTKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PVYLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACL
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PVYLKDLLLSDIPSSTASLCSRKTGVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 CLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERLRGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERLRGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SSMSVAPWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSMSVAPWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINE
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE0 AKRKLMENILLYKEEKVDSIELFGP
:::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AKRKLMENILLYKEEKVDSIELFGP
610 620
>>CCDS35444.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX (682 aa)
initn: 647 init1: 194 opt: 643 Z-score: 392.6 bits: 82.9 E(32554): 1.5e-15
Smith-Waterman score: 881; 30.0% identity (58.2% similar) in 660 aa overlap (4-623:18-657)
10 20 30 40
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI-
..:..: ::. . . :::: :: .::. .. : :.::
CCDS35 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA
.: .:. .: :: : :.: : .:: .: .:.: :: .:: :.: : :.:.
CCDS35 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-PA---PLPS
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS
: .. :. . .:: . . : .:: .:. ...:. : . : .: :
CCDS35 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT
: :. . :.. : :. .:: : : : .. ..: .:... ::..:
CCDS35 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ
:. :::. .. .. :.:.:.: .... : .:.. : :::.. :.::
CCDS35 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK
:. ..: .. ::::.:::. : . :: ::::..: : :...:: . .::...:
CCDS35 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT
:::::::. :::::. .:.. .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:.
CCDS35 SSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 KRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRSPV-YLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAK
.: :: :.:. :.:.: :. .. . . :::::. : . ..: : .. .. .:
CCDS35 VDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLKDLVEEEAEEAGVALRSTQSTLQAGLAA
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE0 E---------ICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERL
. : .:.:. : : . . .:. :: ::.:: . . :
CCDS35 DAWAAPIAMQIYKKHLDPRPGPCPPELGLGLGQLACCCLHRRAKRRPPMTQENSYVSSTG
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 RGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDASSSM---SVAPWAGAATPLLPTEN
:.. ::. :. .:.:... :. . :. .... :. :.: . :: : .
CCDS35 RAHSGAAPWQPLAAPSGASAQAAEQLQRGPNQPVESDESLGGLSAALRSWHLTPSCPLDP
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600
pF1KE0 GEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEP---PQDV---------TETSW--QIEINEAKRKLM
. :: ..:...:. : : : : . .: :: :: :..:..
CCDS35 AP--LREAGCPQGDTAGESSWGSGPGSRPTAVEGLALGSSASSSSEPPQIIINPARQKMV
590 600 610 620 630 640
610 620
pF1KE0 ENILLYKEEKVDSIELFGP
... ::.. .::..:.
CCDS35 QKLALYEDGALDSLQLLSSSSLPGLGLEQDRQGPEESDEFQS
650 660 670 680
>>CCDS14740.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX (712 aa)
initn: 616 init1: 194 opt: 643 Z-score: 392.3 bits: 82.9 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 828; 31.2% identity (59.6% similar) in 574 aa overlap (4-554:18-567)
10 20 30 40
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI-
..:..: ::. . . :::: :: .::. .. : :.::
CCDS14 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA
.: .:. .: :: : :.: : .:: .: .:.: :: .:: :.: : :.:.
CCDS14 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-P---APLPS
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS
: .. :. . .:: . . : .:: .:. ...:. : . : .: :
CCDS14 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT
: :. . :.. : :. .:: : : : .. ..: .:... ::..:
CCDS14 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ
:. :::. .. .. :.:.:.: .... : .:.. : :::.. :.::
CCDS14 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK
:. ..: .. ::::.:::. : . :: ::::..: : :...:: . .::...:
CCDS14 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT
:::::::. :::::. .:.. .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:.
CCDS14 SSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 KRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRSPV-YLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAK
.: :: :.:. :.:.: :. .. . . :::::. : . ..: : .. .. .:
CCDS14 VDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLKDLVEEEAEEAGVALRSTQSTLQAGLAA
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE0 E---------ICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERL
. : .:.:. : : . . .:. :: ::.:: . .: :.:
CCDS14 DAWAAPIAMQIYKKHLDPRPGPCPPELGLGLGQLACCCLHRRAKRRPPMT-QVYERLEKL
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 RGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDASSSMSVAPWAGAATPLLPTENGEG
.. . .: : ::... .:.:.. :.... :.. ::: :.:
CCDS14 QAVVAGVP--GHSEAASCIPPSPQENSYVSSTGRAHSGA---APWQPLAAPSGASAQAAE
530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 RLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINEAKRKLMENILLYKEEKVDSIELF
CCDS14 QLQRGPNQPVESDESLGGLSAALRSWHLTPSCPLDPAPLREAGCPQGDTAGESSWGSGPG
580 590 600 610 620 630
>>CCDS35443.1 IRAK1 gene_id:3654|Hs108|chrX (633 aa)
initn: 738 init1: 194 opt: 614 Z-score: 376.3 bits: 79.8 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 765; 30.6% identity (57.7% similar) in 643 aa overlap (4-623:18-608)
10 20 30 40
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI-
..:..: ::. . . :::: :: .::. .. : :.::
CCDS35 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA
.: .:. .: :: : :.: : .:: .: .:.: :: .:: :.: : :.:.
CCDS35 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-PA---PLPS
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS
: .. :. . .:: . . : .:: .:. ...:. : . : .: :
CCDS35 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT
: :. . :.. : :. .:: : : : .. ..: .:... ::..:
CCDS35 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ
:. :::. .. .. :.:.:.: .... : .:.. : :::.. :.::
CCDS35 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK
:. ..: .. ::::.:::. : . :: ::::..: : :...:: . .::...:
CCDS35 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT
:::::::. :::::. .:.. .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:.
CCDS35 SSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440
pF1KE0 KRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNN--RSP--VY--LKDL--LLSEIPS-STASLCSRKT
.: :: :.:. :.:.: :. .. :. :: :. : ... .:. : :. : .
CCDS35 VDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLVYERLEKLQAVVAGVPGHSEAASCIPPS
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 GVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATA-ACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERL
:: ... . . .::. : . :.: : :.: .. : :.... :
CCDS35 PQENSYVSSTGRAH--SGAAPWQPLAAPSGASAQAAEQLQRGPNQPVESDESLGGLSAAL
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 RGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDASSSMSVAPWAGAATPLLPTENGEG
:. . : : :. . .. :. : . .:: : :.. :: ::
CCDS35 RSWH-LTPSCPLDPAPLREAGCPQ-GDTAGESS-----------W-GSGPGSRPTAV-EG
530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 RLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINEAKRKLMENILLYKEEKVDSIELF
. .: :.:::: ::: : :: :..:..... ::.. .::..:.
CCDS35 ---LALGSSASSSSE------PPQ--------IIINPARQKMVQKLALYEDGALDSLQLL
570 580 590 600
pF1KE0 GP
CCDS35 SSSSLPGLGLEQDRQGPEESDEFQS
610 620 630
625 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:41:11 2016 done: Sat Nov 5 20:41:11 2016
Total Scan time: 4.090 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]