Result of FASTA (omim) for
pF1KE0990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0990, 625 aa
1>>>pF1KE0990 625 - 625 aa - 625 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1703+/-0.000453; mu= 2.3868+/- 0.028
mean_var=449.4079+/-103.845, 0's: 0 Z-trim(118.5): 136 B-trim: 1874 in 1/53
Lambda= 0.060500
statistics sampled from 31448 (31607) to 31448 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.371), width: 16
Scan time: 12.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001561 (OMIM: 603304) interleukin-1 receptor-as ( 625) 4230 384.7 5.3e-106
NP_001020413 (OMIM: 300283) interleukin-1 receptor ( 682) 643 71.7 9.8e-12
XP_005274725 (OMIM: 300283) PREDICTED: interleukin ( 708) 643 71.7 1e-11
NP_001560 (OMIM: 300283) interleukin-1 receptor-as ( 712) 643 71.7 1e-11
XP_011529460 (OMIM: 300283) PREDICTED: interleukin ( 603) 622 69.7 3.2e-11
NP_001020414 (OMIM: 300283) interleukin-1 receptor ( 633) 614 69.1 5.4e-11
NP_001135995 (OMIM: 604459,611064) interleukin-1 r ( 535) 451 54.7 9.5e-07
NP_009130 (OMIM: 604459,611064) interleukin-1 rece ( 596) 451 54.8 1e-06
XP_011536733 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 460) 438 53.5 1.9e-06
NP_057207 (OMIM: 606883,607676,610799) interleukin ( 460) 438 53.5 1.9e-06
XP_006719501 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 460) 438 53.5 1.9e-06
XP_005269001 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 460) 438 53.5 1.9e-06
XP_011536734 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 460) 438 53.5 1.9e-06
XP_005269000 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 460) 438 53.5 1.9e-06
XP_011536735 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 460) 438 53.5 1.9e-06
XP_016874879 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 460) 438 53.5 1.9e-06
XP_005269002 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 460) 438 53.5 1.9e-06
NP_001107654 (OMIM: 606883,607676,610799) interleu ( 460) 438 53.5 1.9e-06
XP_016874880 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 336) 434 53.0 2e-06
NP_001138730 (OMIM: 606883,607676,610799) interleu ( 336) 434 53.0 2e-06
XP_006719502 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 336) 434 53.0 2e-06
XP_005269004 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 336) 434 53.0 2e-06
XP_005269006 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 336) 434 53.0 2e-06
XP_005269005 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 336) 434 53.0 2e-06
NP_001138729 (OMIM: 606883,607676,610799) interleu ( 336) 434 53.0 2e-06
NP_001138728 (OMIM: 606883,607676,610799) interleu ( 336) 434 53.0 2e-06
XP_006719503 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 257) 387 48.7 3e-05
XP_006719505 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 257) 387 48.7 3e-05
XP_006719504 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 257) 387 48.7 3e-05
XP_006719506 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTE ( 257) 387 48.7 3e-05
>>NP_001561 (OMIM: 603304) interleukin-1 receptor-associ (625 aa)
initn: 4230 init1: 4230 opt: 4230 Z-score: 2024.1 bits: 384.7 E(85289): 5.3e-106
Smith-Waterman score: 4230; 99.8% identity (100.0% similar) in 625 aa overlap (1-625:1-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKIKSMERVQGVSITREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKIKSMERVQGVSITREL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFPDSVKPEKPLAASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFPDSVKPEKPLAASV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 RKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQPAFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQPAFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SIPKQEKLLSLAGDSLFWSEADVVQATDDFNQNRKISQGTFADVYRGHRHGKPFVFKKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIPKQEKLLSLAGDSLFWSEADVVQATDDFNQNRKISQGTFADVYRGHRHGKPFVFKKLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQFHSFIYPYMANGSLQDRLQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQFHSFIYPYMANGSLQDRLQG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QGGSDPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLHGLEIIHSNVKSSNVLLDQNLTPKLAHPMAHLCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGGSDPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLHGLEIIHSNVKSSNVLLDQNLTPKLAHPMAHLCP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 VNKRSKYTMMKTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLTKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNKRSKYTMMKTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLTKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PVYLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACL
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVYLKDLLLSDIPSSTASLCSRKTGVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 CLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERLRGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERLRGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SSMSVAPWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSMSVAPWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINE
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE0 AKRKLMENILLYKEEKVDSIELFGP
:::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKRKLMENILLYKEEKVDSIELFGP
610 620
>>NP_001020413 (OMIM: 300283) interleukin-1 receptor-ass (682 aa)
initn: 647 init1: 194 opt: 643 Z-score: 331.7 bits: 71.7 E(85289): 9.8e-12
Smith-Waterman score: 881; 30.0% identity (58.2% similar) in 660 aa overlap (4-623:18-657)
10 20 30 40
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI-
..:..: ::. . . :::: :: .::. .. : :.::
NP_001 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA
.: .:. .: :: : :.: : .:: .: .:.: :: .:: :.: : :.:.
NP_001 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-PA---PLPS
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS
: .. :. . .:: . . : .:: .:. ...:. : . : .: :
NP_001 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT
: :. . :.. : :. .:: : : : .. ..: .:... ::..:
NP_001 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ
:. :::. .. .. :.:.:.: .... : .:.. : :::.. :.::
NP_001 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK
:. ..: .. ::::.:::. : . :: ::::..: : :...:: . .::...:
NP_001 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT
:::::::. :::::. .:.. .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:.
NP_001 SSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 KRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRSPV-YLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAK
.: :: :.:. :.:.: :. .. . . :::::. : . ..: : .. .. .:
NP_001 VDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLKDLVEEEAEEAGVALRSTQSTLQAGLAA
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE0 E---------ICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERL
. : .:.:. : : . . .:. :: ::.:: . . :
NP_001 DAWAAPIAMQIYKKHLDPRPGPCPPELGLGLGQLACCCLHRRAKRRPPMTQENSYVSSTG
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 RGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDASSSM---SVAPWAGAATPLLPTEN
:.. ::. :. .:.:... :. . :. .... :. :.: . :: : .
NP_001 RAHSGAAPWQPLAAPSGASAQAAEQLQRGPNQPVESDESLGGLSAALRSWHLTPSCPLDP
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600
pF1KE0 GEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEP---PQDV---------TETSW--QIEINEAKRKLM
. :: ..:...:. : : : : . .: :: :: :..:..
NP_001 AP--LREAGCPQGDTAGESSWGSGPGSRPTAVEGLALGSSASSSSEPPQIIINPARQKMV
590 600 610 620 630 640
610 620
pF1KE0 ENILLYKEEKVDSIELFGP
... ::.. .::..:.
NP_001 QKLALYEDGALDSLQLLSSSSLPGLGLEQDRQGPEESDEFQS
650 660 670 680
>>XP_005274725 (OMIM: 300283) PREDICTED: interleukin-1 r (708 aa)
initn: 586 init1: 194 opt: 643 Z-score: 331.5 bits: 71.7 E(85289): 1e-11
Smith-Waterman score: 819; 28.9% identity (56.0% similar) in 686 aa overlap (4-623:18-683)
10 20 30
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEF---------------
..:..: ::. . . :::: :: .:
XP_005 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFGGWRRAAGGREARGL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70
pF1KE0 -----------ASYVITDLTQLRKI-KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLC
:. .. : :.:: .: .:. .: :: : :.: : .:: .:
XP_005 LAPTPDAPRPAAALIVRDQTELRLCERSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILT
70 80 90 100 110
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 RLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFP
.:.: :: .:: :.: : :.:. : .. :. . .:: . . : .::
XP_005 HLQLLRARDIITAWHP-PA---PLPS-PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFL
120 130 140 150 160
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 GPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF
.:. ...:. : . : .: :: :. . :.. : :. .:: : :
XP_005 SPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPASLWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPF
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 ---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGTFADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFF
: .. ..: .:... ::..: :. :::. .. .. :.:.:.: .... :
XP_005 PFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGGFGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSF
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 QAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQFHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRV
.:.. : :::.. :.:: :. ..: .. ::::.:::. : . :: ::::.
XP_005 LTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNGFYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRL
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360
pF1KE0 SICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVKSSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYT
.: : :...:: . .::...::::::::. :::::. .:.. .. :. .
XP_005 DILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIKSSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSS
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLTKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRSPV-YLKD
:. .:. .: . :::::..:..:.:. .: :: :.:. :.:.: :. .. . . ::::
XP_005 MVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLAVDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLKD
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470
pF1KE0 LLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAKE---------ICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATA
:. : . ..: : .. .. .: . : .:.:. : : . . .:.
XP_005 LVEEEAEEAGVALRSTQSTLQAGLAADAWAAPIAMQIYKKHLDPRPGPCPPELGLGLGQL
470 480 490 500 510 520
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 ACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERLRGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSL
:: ::.:: . . : :.. ::. :. .:.:... :. . :. .
XP_005 ACCCLHRRAKRRPPMTQENSYVSSTGRAHSGAAPWQPLAAPSGASAQAAEQLQRGPNQPV
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580
pF1KE0 DASSSM---SVAPWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEP---PQDV--
... :. :.: . :: : . . :: ..:...:. : : : :
XP_005 ESDESLGGLSAALRSWHLTPSCPLDPAP--LREAGCPQGDTAGESSWGSGPGSRPTAVEG
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620
pF1KE0 -------TETSW--QIEINEAKRKLMENILLYKEEKVDSIELFGP
. .: :: :: :..:..... ::.. .::..:.
XP_005 LALGSSASSSSEPPQIIINPARQKMVQKLALYEDGALDSLQLLSSSSLPGLGLEQDRQGP
650 660 670 680 690 700
XP_005 EESDEFQS
>>NP_001560 (OMIM: 300283) interleukin-1 receptor-associ (712 aa)
initn: 616 init1: 194 opt: 643 Z-score: 331.5 bits: 71.7 E(85289): 1e-11
Smith-Waterman score: 828; 31.2% identity (59.6% similar) in 574 aa overlap (4-554:18-567)
10 20 30 40
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI-
..:..: ::. . . :::: :: .::. .. : :.::
NP_001 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA
.: .:. .: :: : :.: : .:: .: .:.: :: .:: :.: : :.:.
NP_001 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-P---APLPS
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS
: .. :. . .:: . . : .:: .:. ...:. : . : .: :
NP_001 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT
: :. . :.. : :. .:: : : : .. ..: .:... ::..:
NP_001 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ
:. :::. .. .. :.:.:.: .... : .:.. : :::.. :.::
NP_001 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK
:. ..: .. ::::.:::. : . :: ::::..: : :...:: . .::...:
NP_001 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT
:::::::. :::::. .:.. .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:.
NP_001 SSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 KRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRSPV-YLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAK
.: :: :.:. :.:.: :. .. . . :::::. : . ..: : .. .. .:
NP_001 VDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLKDLVEEEAEEAGVALRSTQSTLQAGLAA
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE0 E---------ICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERL
. : .:.:. : : . . .:. :: ::.:: . .: :.:
NP_001 DAWAAPIAMQIYKKHLDPRPGPCPPELGLGLGQLACCCLHRRAKRRPPMT-QVYERLEKL
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 RGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDASSSMSVAPWAGAATPLLPTENGEG
.. . .: : ::... .:.:.. :.... :.. ::: :.:
NP_001 QAVVAGVP--GHSEAASCIPPSPQENSYVSSTGRAHSGA---APWQPLAAPSGASAQAAE
530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 RLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINEAKRKLMENILLYKEEKVDSIELF
NP_001 QLQRGPNQPVESDESLGGLSAALRSWHLTPSCPLDPAPLREAGCPQGDTAGESSWGSGPG
580 590 600 610 620 630
>>XP_011529460 (OMIM: 300283) PREDICTED: interleukin-1 r (603 aa)
initn: 738 init1: 194 opt: 622 Z-score: 322.3 bits: 69.7 E(85289): 3.2e-11
Smith-Waterman score: 735; 29.5% identity (56.5% similar) in 634 aa overlap (4-623:18-578)
10 20 30 40
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI-
..:..: ::. . . :::: :: .::. .. : :.::
XP_011 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA
.: .:. .: :: : :.: : .:: .: .:.: :: .:: :.: : :.:.
XP_011 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-PA---PLPS
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS
: .. :. . .:: . . : .:: .:. ...:. : . : .: :
XP_011 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT
: :. . :.. : :. .:: : : : .. ..: .:... ::..:
XP_011 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ
:. :::. .. .. :.:.:.: .... : .:.. : :::.. :.::
XP_011 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK
:. ..: .. ::::.:::. : . :: ::::..: : :...:: . .::...:
XP_011 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT
:::::::. :::::. .:.. .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:.
XP_011 SSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 KRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRSPV-YLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAK
.: :: :.:. :.:.: :. .. . . ::.. .: . .. . . :.
XP_011 VDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLENSYVSSTGRAHSGAAPWQPLAAPSGAS
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 EICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERLRGRETLLPW
. :..: .. : . :.: :...:. ::. . : :
XP_011 AQAAEQLQRGPNQ-PVESDESL-------------------GGLSAA---LRSWH-LTPS
470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 SGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDASSSMSVAPWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGRE
:. . .. :. : . .:: : :.. :: :: . .:
XP_011 CPLDPAPLREAGCPQ-GDTAGESS-----------W-GSGPGSRPTAV-EG---LALGSS
500 510 520 530 540
580 590 600 610 620
pF1KE0 ADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINEAKRKLMENILLYKEEKVDSIELFGP
:.:::: ::: : :: :..:..... ::.. .::..:.
XP_011 ASSSSE------PPQ--------IIINPARQKMVQKLALYEDGALDSLQLLSSSSLPGLG
550 560 570 580
XP_011 LEQDRQGPEESDEFQS
590 600
>>NP_001020414 (OMIM: 300283) interleukin-1 receptor-ass (633 aa)
initn: 738 init1: 194 opt: 614 Z-score: 318.3 bits: 69.1 E(85289): 5.4e-11
Smith-Waterman score: 765; 30.6% identity (57.7% similar) in 643 aa overlap (4-623:18-608)
10 20 30 40
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKI-
..:..: ::. . . :::: :: .::. .. : :.::
NP_001 MAGGPGPGEPAAPGAQHFLYEVPPWVMCRFYKVMDALEPADWCQFAALIVRDQTELRLCE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KSMERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPA
.: .:. .: :: : :.: : .:: .: .:.: :: .:: :.: : :.:.
NP_001 RSGQRTASV------LWPWINRNARVADLVHILTHLQLLRARDIITAWHP-PA---PLPS
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQ-PAFLQPPEEDAPHS
: .. :. . .:: . . : .:: .:. ...:. : . : .: :
NP_001 -PGTTAPRPSSIPAPAEAEAWSPRKLPSSASTFLSPAFPGSQTHSGPELGLVP---SPAS
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSL-AGDSLF---WSEADVVQATDDFNQNRKISQGT
: :. . :.. : :. .:: : : : .. ..: .:... ::..:
NP_001 LWPPPPSPAP----SSTKPGPESSVSLLQGARPFPFCWPLCEISRGTHNFSEELKIGEGG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQ
:. :::. .. .. :.:.:.: .... : .:.. : :::.. :.::
NP_001 FGCVYRAVMRNTVYAVKRLKENADLEWTAVKQSFLTEVEQLSRFRHPNIVDFAGYCAQNG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE0 FHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGS-DPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLH--GLEIIHSNVK
:. ..: .. ::::.:::. : . :: ::::..: : :...:: . .::...:
NP_001 FYCLVYGFLPNGSLEDRLHCQTQACPPLSWPQRLDILLGTARAIQFLHQDSPSLIHGDIK
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 SSNVLLDQNLTPKLAH-PMAHLCPV--NKRSKYTMM-KTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQLT
:::::::. :::::. .:.. .. :. .:. .:. .: . :::::..:..:.:.
NP_001 SSNVLLDERLTPKLGDFGLARFSRFAGSSPSQSSMVARTQTVRGTLAYLPEEYIKTGRLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440
pF1KE0 KRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNN--RSP--VY--LKDL--LLSEIPS-STASLCSRKT
.: :: :.:. :.:.: :. .. :. :: :. : ... .:. : :. : .
NP_001 VDTDTFSFGVVVLETLAGQRAVKTHGARTKYLVYERLEKLQAVVAGVPGHSEAASCIPPS
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 GVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATA-ACLCLRRRNTSLQEVCGSVAAVEERL
:: ... . . .::. : . :.: : :.: .. : :.... :
NP_001 PQENSYVSSTGRAH--SGAAPWQPLAAPSGASAQAAEQLQRGPNQPVESDESLGGLSAAL
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 RGRETLLPWSGLSEGTGSSSNTPEETDDVDNSSLDASSSMSVAPWAGAATPLLPTENGEG
:. . : : :. . .. :. : . .:: : :.. :: ::
NP_001 RSWH-LTPSCPLDPAPLREAGCPQ-GDTAGESS-----------W-GSGPGSRPTAV-EG
530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 RLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINEAKRKLMENILLYKEEKVDSIELF
. .: :.:::: ::: : :: :..:..... ::.. .::..:.
NP_001 ---LALGSSASSSSE------PPQ--------IIINPARQKMVQKLALYEDGALDSLQLL
570 580 590 600
pF1KE0 GP
NP_001 SSSSLPGLGLEQDRQGPEESDEFQS
610 620 630
>>NP_001135995 (OMIM: 604459,611064) interleukin-1 recep (535 aa)
initn: 417 init1: 231 opt: 451 Z-score: 242.2 bits: 54.7 E(85289): 9.5e-07
Smith-Waterman score: 477; 27.9% identity (55.5% similar) in 438 aa overlap (182-594:78-482)
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSLAGDSLFWSEADVVQATDDFN
::.... : .:. : .....: .:.
NP_001 LSPSEKSYQEGGFPNILFKETANVTVDNVLIPEHNEKGILLKSSI--SFQNIIEGTRNFH
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260
pF1KE0 QNRKISQGTFADVYRGHRHGKPF---VFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPN
.. :..: . .::: . .. . .::. .. :.. .::. .::.. : :::
NP_001 KDFLIGEGEIFEVYRVEIQNLTYAVKLFKQEKKMQCKK--HWKRFL-SELEVLLLFHHPN
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 VLPVLGFCAARQFHSFIYPYMANGSLQDRLQGQGGSDPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLHG
.: . .. . . .::::: ::.: :::: : . :::: :..: :. :..:::.
NP_001 ILELAAYFTETEKFCLIYPYMRNGTLFDRLQCVGDTAPLPWHIRIGILIGISKAIHYLHN
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370
pF1KE0 LE---IIHSNVKSSNVLLDQNLTPKL-----AHPMAHL----CPVNKRSKYTMMKTHLLR
.. .: ....:.:.:::... ::: :: .:: : .: :. . ::
NP_001 VQPCSVICGSISSANILLDDQFQPKLTDFAMAHFRSHLEHQSCTINMTSSSS---KHLW-
230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 TSAAYLPEDFIRVGQLTKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRSPVYLKDLLLSEIPSST
:.::..:: :.:. ..:..: :::. ::::: .. .. . . :.::: .
NP_001 ----YMPEEYIRQGKLSIKTDVYSFGIVIMEVLTGCRVVLDDPKHIQLRDLLRELM----
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 ASLCSRKTGVENVMAKEICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACLCLRRRNT---SLQEVC
.: :... : ..:.: . :.. . : : : : :..::
NP_001 -----EKRGLDS------CLSFLDKKVPPCPRNFSAKLFCLAGRCAATRAKLRPSMDEVL
340 350 360 370
500 510 520 530 540
pF1KE0 GSVAAVEERLRGRETLLPWSGLSEGTGSSS-------NTPEETDDVDNSSLDASSSMSVA
... ... : : : ..:. : . : : :. .:..: :.
NP_001 NTLESTQASLYFAED--PPTSLKSFRCPSPLFLENVPSIPVEDDESQNNNLLPSDEGLRI
380 390 400 410 420 430
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 PWAGAATPLLPTENGEGRLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINEAKRKLM
::. ... : . :. . ::: . :.. : ::
NP_001 DRMTQKTPFECSQSEVMFLSLDKKPESKRNEEAC---NMPSSSCEESWFPKYIVPSQDLR
440 450 460 470 480 490
610 620
pF1KE0 ENILLYKEEKVDSIELFGP
NP_001 PYKVNIDPSSEAPGHSCRSRPVESSCSSKFSWDEYEQYKKE
500 510 520 530
>>NP_009130 (OMIM: 604459,611064) interleukin-1 receptor (596 aa)
initn: 511 init1: 231 opt: 451 Z-score: 241.7 bits: 54.8 E(85289): 1e-06
Smith-Waterman score: 514; 25.6% identity (52.6% similar) in 616 aa overlap (5-594:17-543)
10 20 30 40
pF1KE0 MACYIYQLPSWVLDDLCRNMDALS-EWDWMEFASYVITDLTQLRKIKS
...:: .: .:: .:. . : .: . .. ..:.:..
NP_009 MAGNCGARGALSAHTLLFDLPPALLGELCAVLDSCDGALGWRGLAERLSSSWLDVRHIEK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 MERVQGVSITRELLWWWGMRQATVQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFP
. :: : :::::: :.... :. .:...: .. :: ..: :.
NP_009 YVD-QGKSGTRELLWSWAQKNKTIGDLLQVLQEMGHRRAIHLITNY--------------
70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 DSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEGQPVRMATFPGPGSSPARAHQPAFLQPPEEDAPHSLRS
.: . .: .:: .: :. : .
NP_009 ---------GAVLSPSEKSYQEG---------------------GF--------PNILFK
110 120
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 DLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLSLAGDSLFWSEADVVQATDDFNQNRKISQGTFADVYRG
. :.. . : .. ::.... : .:. : .....: .:... :..: . .:::
NP_009 E--TANVTVD-NVLIPEHNEKGILLKSSI--SFQNIIEGTRNFHKDFLIGEGEIFEVYRV
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 HRHGKPF---VFKKLRETACSSPGSIERFFQAELQICLRCCHPNVLPVLGFCAARQFHSF
. .. . .::. .. :.. .::. .::.. : :::.: . .. . . .
NP_009 EIQNLTYAVKLFKQEKKMQCKK--HWKRFL-SELEVLLLFHHPNILELAAYFTETEKFCL
190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 IYPYMANGSLQDRLQGQGGSDPLPWPQRVSICSGLLCAVEYLHGLE---IIHSNVKSSNV
::::: ::.: :::: : . :::: :..: :. :..:::... .: ....:.:.
NP_009 IYPYMRNGTLFDRLQCVGDTAPLPWHIRIGILIGISKAIHYLHNVQPCSVICGSISSANI
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390
pF1KE0 LLDQNLTPKL-----AHPMAHL----CPVNKRSKYTMMKTHLLRTSAAYLPEDFIRVGQL
:::... ::: :: .:: : .: :. . :: :.::..:: :.:
NP_009 LLDDQFQPKLTDFAMAHFRSHLEHQSCTINMTSSSS---KHLW-----YMPEEYIRQGKL
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 TKRVDIFSCGIVLAEVLTGIPAMDNNRSPVYLKDLLLSEIPSSTASLCSRKTGVENVMAK
. ..:..: :::. ::::: .. .. . . :.::: . .: :...
NP_009 SIKTDVYSFGIVIMEVLTGCRVVLDDPKHIQLRDLLRELM---------EKRGLDS----
360 370 380 390
460 470 480 490 500
pF1KE0 EICQKYLEKGAGRLPEDCAEALATAACLCLRRRNT---SLQEVCGSVAAVEERLRGRETL
: ..:.: . :.. . : : : : :..:: ... ... : :
NP_009 --CLSFLDKKVPPCPRNFSAKLFCLAGRCAATRAKLRPSMDEVLNTLESTQASLYFAED-
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 LPWSGLSEGTGSSS-------NTPEETDDVDNSSLDASSSMSVAPWAGAATPLLPTENGE
: ..:. : . : : :. .:..: :. ::. ...
NP_009 -PPTSLKSFRCPSPLFLENVPSIPVEDDESQNNNLLPSDEGLRIDRMTQKTPFECSQSEV
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 GRLRVIVGREADSSSEACVGLEPPQDVTETSWQIEINEAKRKLMENILLYKEEKVDSIEL
: . :. . ::: . :.. : ::
NP_009 MFLSLDKKPESKRNEEAC---NMPSSSCEESWFPKYIVPSQDLRPYKVNIDPSSEAPGHS
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 FGP
NP_009 CRSRPVESSCSSKFSWDEYEQYKKE
580 590
>>XP_011536733 (OMIM: 606883,607676,610799) PREDICTED: i (460 aa)
initn: 442 init1: 275 opt: 438 Z-score: 236.7 bits: 53.5 E(85289): 1.9e-06
Smith-Waterman score: 489; 25.9% identity (56.0% similar) in 455 aa overlap (41-492:52-447)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 WVLDDLCRNMDALSEWDWMEFASYVITDLTQLRKIKSMERVQGVSITRELLWWWGMRQAT
..:..... .. : : : :::. :: . :
XP_011 LSDFIDPQEGWKKLAVAIKKPSGDDRYNQFHIRRFEALLQT-GKSPTSELLFDWGTTNCT
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 VQQLVDLLCRLELYRAAQIILNWKPAPEIRCPIPAFPDSVKPEKPLAASVRKAEDEQEEG
: .::::: . :.. :...: ::.: :. . ..: :..
XP_011 VGDLVDLLIQNEFFAPASLLL---------------PDAV-PKTANTLPSKEAITVQQKQ
90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 QPVRMATFPGPGSSPARAHQPAFLQPPEEDAPHSLRSDLPTSSDSKDFSTSIPKQEKLLS
.: . .:.. . ... ::. ..:.. .. ::.. : :
XP_011 MP--FCDKDRTLMTPVQNLEQSYM-PPDSSSPENKSLEV---SDTRFHSFS---------
130 140 150 160
200 210 220 230 240
pF1KE0 LAGDSLFWSEADVVQATDDFNQN---RKISQGTFADVYRGHRHGKPFVFKKLRETACSSP
:. .:.. :. . :...: :. ::.:. .. . ::: . .
XP_011 ------FYELKNVTNNFDERPISVGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNTTVAVKKLAAMVDITT
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