Result of FASTA (omim) for pF1KE1013
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1013, 285 aa
  1>>>pF1KE1013 285 - 285 aa - 285 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6592+/-0.000269; mu= 15.1078+/- 0.017
 mean_var=86.0342+/-17.464, 0's: 0 Z-trim(120.5): 27  B-trim: 1937 in 1/56
 Lambda= 0.138273
 statistics sampled from 35815 (35843) to 35815 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.42), width:  16
 Scan time:  8.150

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_011536427 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C  ( 286) 1022 212.9 5.8e-55
NP_001263400 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform b [ ( 474) 1022 213.0 8.6e-55
XP_016874612 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C  ( 474) 1022 213.0 8.6e-55
XP_016874611 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C  ( 474) 1022 213.0 8.6e-55
NP_055140 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform b [Hom ( 474) 1022 213.0 8.6e-55
NP_001098707 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform a [ ( 527) 1022 213.1 9.3e-55
XP_016874610 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C  ( 527) 1022 213.1 9.3e-55
NP_001018080 (OMIM: 609849) coronin-1B [Homo sapie ( 489)  965 201.7 2.3e-51
NP_065174 (OMIM: 609849) coronin-1B [Homo sapiens] ( 489)  965 201.7 2.3e-51
XP_011544016 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coro ( 461)  925 193.7 5.6e-49
NP_009005 (OMIM: 605000,615401) coronin-1A [Homo s ( 461)  925 193.7 5.6e-49
NP_001180262 (OMIM: 605000,615401) coronin-1A [Hom ( 461)  925 193.7 5.6e-49
XP_016878374 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coro ( 463)  884 185.5 1.6e-46
XP_016878375 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coro ( 463)  884 185.5 1.6e-46
XP_011517288 (OMIM: 602159) PREDICTED: coronin-2A  ( 525)  585 125.9 1.6e-28
NP_003380 (OMIM: 602159) coronin-2A [Homo sapiens] ( 525)  585 125.9 1.6e-28
NP_438171 (OMIM: 602159) coronin-2A [Homo sapiens] ( 525)  585 125.9 1.6e-28
NP_001310944 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475)  576 124.1 5.2e-28
NP_001177386 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475)  576 124.1 5.2e-28
NP_001177385 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475)  576 124.1 5.2e-28
NP_001310943 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475)  576 124.1 5.2e-28
NP_006082 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 1 [Hom ( 480)  576 124.1 5.2e-28
NP_001188402 (OMIM: 611668) coronin-7 isoform 3 [H ( 840)  299 69.0 3.5e-11
NP_001188401 (OMIM: 611668) coronin-7 isoform 2 [H ( 907)  299 69.0 3.7e-11
NP_078811 (OMIM: 611668) coronin-7 isoform 1 [Homo ( 925)  299 69.0 3.8e-11


>>XP_011536427 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C isof  (286 aa)
 initn: 1026 init1: 958 opt: 1022  Z-score: 1107.8  bits: 212.9 E(85289): 5.8e-55
Smith-Waterman score: 1023; 53.8% identity (76.7% similar) in 292 aa overlap (1-280:13-284)

                           10            20        30        40    
pF1KE1             MCRGGGAMCAGEEERCAQG----RGLQLWSLEVWGIGFGKARKRKGAS
                   :: :   .   :.:.  .:    :.. : . .:.  ::..  .:. : 
XP_011 MVNTDLPPTPSLMC-GMCLFALQEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLAL
               10         20        30        40        50         

           50        60        70        80        90       100    
pF1KE1 GGPEVAREGGAGLVTPPVLGQNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVYLCGKGDSS
        .:.                  :..::.::.::::::::::::::::.::.:::::::::
XP_011 WNPK------------------NMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSS
      60                          70        80        90       100 

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE1 IRYFEITDEPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHERKCEPIIMT
       ::::::::: :.:::::::::::::::::.::::::::.:::::::.:::::::::::::
XP_011 IRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMT
             110       120       130       140       150       160 

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE1 VPRKSDLFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVPPKHRELRVTKRNI
       :::::::::::::::: ::: ::::.::. :..:.:.::::. ::.: :.:.:.:.:.::
XP_011 VPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNI
             170       180       190       200       210       220 

          230               240       250       260       270      
pF1KE1 LDVRPPSG--------PRRSQSASDAPLSQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQRITALENM
       :: .: ..        :... .....  ..  :. .:.:::.... .  :..::. ::..
XP_011 LDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQ-NEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQ
             230       240        250       260       270       280

        280     
pF1KE1 LCELVDGTD
       . ..     
XP_011 MAKIAA   
                

>>NP_001263400 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform b [Homo  (474 aa)
 initn: 1030 init1: 958 opt: 1022  Z-score: 1104.7  bits: 213.0 E(85289): 8.6e-55
Smith-Waterman score: 1022; 64.4% identity (87.8% similar) in 222 aa overlap (67-280:252-472)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE1 ARKRKGASGGPEVAREGGAGLVTPPVLGQNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVY
                                     :..::.::.::::::::::::::::.::.:
NP_001 MRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIY
             230       240       250       260       270       280 

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE1 LCGKGDSSIRYFEITDEPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHER
       ::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::.::::::::.:::::::.:::::
NP_001 LCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHER
             290       300       310       320       330       340 

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE1 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVPPKHRE
       :::::::::::::::::::::::: ::: ::::.::. :..:.:.::::. ::.: :.:.
NP_001 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRD
             350       360       370       380       390       400 

        220       230               240       250       260        
pF1KE1 LRVTKRNILDVRPPSG--------PRRSQSASDAPLSQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQ
       :.:.:.:::: .: ..        :... .....  ..  :. .:.:::.... .  :..
NP_001 LKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQ-NEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDE
             410       420       430        440       450       460

      270       280     
pF1KE1 RITALENMLCELVDGTD
       ::. ::... ..     
NP_001 RISKLEQQMAKIAA   
              470       

>>XP_016874612 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C isof  (474 aa)
 initn: 1030 init1: 958 opt: 1022  Z-score: 1104.7  bits: 213.0 E(85289): 8.6e-55
Smith-Waterman score: 1022; 64.4% identity (87.8% similar) in 222 aa overlap (67-280:252-472)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE1 ARKRKGASGGPEVAREGGAGLVTPPVLGQNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVY
                                     :..::.::.::::::::::::::::.::.:
XP_016 MRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIY
             230       240       250       260       270       280 

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE1 LCGKGDSSIRYFEITDEPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHER
       ::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::.::::::::.:::::::.:::::
XP_016 LCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHER
             290       300       310       320       330       340 

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE1 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVPPKHRE
       :::::::::::::::::::::::: ::: ::::.::. :..:.:.::::. ::.: :.:.
XP_016 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRD
             350       360       370       380       390       400 

        220       230               240       250       260        
pF1KE1 LRVTKRNILDVRPPSG--------PRRSQSASDAPLSQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQ
       :.:.:.:::: .: ..        :... .....  ..  :. .:.:::.... .  :..
XP_016 LKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQ-NEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDE
             410       420       430        440       450       460

      270       280     
pF1KE1 RITALENMLCELVDGTD
       ::. ::... ..     
XP_016 RISKLEQQMAKIAA   
              470       

>>XP_016874611 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C isof  (474 aa)
 initn: 1030 init1: 958 opt: 1022  Z-score: 1104.7  bits: 213.0 E(85289): 8.6e-55
Smith-Waterman score: 1022; 64.4% identity (87.8% similar) in 222 aa overlap (67-280:252-472)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE1 ARKRKGASGGPEVAREGGAGLVTPPVLGQNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVY
                                     :..::.::.::::::::::::::::.::.:
XP_016 MRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIY
             230       240       250       260       270       280 

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE1 LCGKGDSSIRYFEITDEPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHER
       ::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::.::::::::.:::::::.:::::
XP_016 LCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHER
             290       300       310       320       330       340 

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE1 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVPPKHRE
       :::::::::::::::::::::::: ::: ::::.::. :..:.:.::::. ::.: :.:.
XP_016 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRD
             350       360       370       380       390       400 

        220       230               240       250       260        
pF1KE1 LRVTKRNILDVRPPSG--------PRRSQSASDAPLSQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQ
       :.:.:.:::: .: ..        :... .....  ..  :. .:.:::.... .  :..
XP_016 LKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQ-NEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDE
             410       420       430        440       450       460

      270       280     
pF1KE1 RITALENMLCELVDGTD
       ::. ::... ..     
XP_016 RISKLEQQMAKIAA   
              470       

>>NP_055140 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform b [Homo sa  (474 aa)
 initn: 1030 init1: 958 opt: 1022  Z-score: 1104.7  bits: 213.0 E(85289): 8.6e-55
Smith-Waterman score: 1022; 64.4% identity (87.8% similar) in 222 aa overlap (67-280:252-472)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE1 ARKRKGASGGPEVAREGGAGLVTPPVLGQNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVY
                                     :..::.::.::::::::::::::::.::.:
NP_055 MRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIY
             230       240       250       260       270       280 

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE1 LCGKGDSSIRYFEITDEPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHER
       ::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::.::::::::.:::::::.:::::
NP_055 LCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHER
             290       300       310       320       330       340 

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE1 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVPPKHRE
       :::::::::::::::::::::::: ::: ::::.::. :..:.:.::::. ::.: :.:.
NP_055 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRD
             350       360       370       380       390       400 

        220       230               240       250       260        
pF1KE1 LRVTKRNILDVRPPSG--------PRRSQSASDAPLSQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQ
       :.:.:.:::: .: ..        :... .....  ..  :. .:.:::.... .  :..
NP_055 LKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQ-NEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDE
             410       420       430        440       450       460

      270       280     
pF1KE1 RITALENMLCELVDGTD
       ::. ::... ..     
NP_055 RISKLEQQMAKIAA   
              470       

>>NP_001098707 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform a [Homo  (527 aa)
 initn: 1030 init1: 958 opt: 1022  Z-score: 1104.1  bits: 213.1 E(85289): 9.3e-55
Smith-Waterman score: 1022; 64.4% identity (87.8% similar) in 222 aa overlap (67-280:305-525)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE1 ARKRKGASGGPEVAREGGAGLVTPPVLGQNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVY
                                     :..::.::.::::::::::::::::.::.:
NP_001 MRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIY
          280       290       300       310       320       330    

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE1 LCGKGDSSIRYFEITDEPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHER
       ::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::.::::::::.:::::::.:::::
NP_001 LCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHER
          340       350       360       370       380       390    

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE1 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVPPKHRE
       :::::::::::::::::::::::: ::: ::::.::. :..:.:.::::. ::.: :.:.
NP_001 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRD
          400       410       420       430       440       450    

        220       230               240       250       260        
pF1KE1 LRVTKRNILDVRPPSG--------PRRSQSASDAPLSQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQ
       :.:.:.:::: .: ..        :... .....  ..  :. .:.:::.... .  :..
NP_001 LKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQ-NEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDE
          460       470       480        490       500       510   

      270       280     
pF1KE1 RITALENMLCELVDGTD
       ::. ::... ..     
NP_001 RISKLEQQMAKIAA   
           520          

>>XP_016874610 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C isof  (527 aa)
 initn: 1030 init1: 958 opt: 1022  Z-score: 1104.1  bits: 213.1 E(85289): 9.3e-55
Smith-Waterman score: 1022; 64.4% identity (87.8% similar) in 222 aa overlap (67-280:305-525)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE1 ARKRKGASGGPEVAREGGAGLVTPPVLGQNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVY
                                     :..::.::.::::::::::::::::.::.:
XP_016 MRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIY
          280       290       300       310       320       330    

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE1 LCGKGDSSIRYFEITDEPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHER
       ::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::.::::::::.:::::::.:::::
XP_016 LCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHER
          340       350       360       370       380       390    

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE1 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVPPKHRE
       :::::::::::::::::::::::: ::: ::::.::. :..:.:.::::. ::.: :.:.
XP_016 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRD
          400       410       420       430       440       450    

        220       230               240       250       260        
pF1KE1 LRVTKRNILDVRPPSG--------PRRSQSASDAPLSQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQ
       :.:.:.:::: .: ..        :... .....  ..  :. .:.:::.... .  :..
XP_016 LKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQ-NEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDE
          460       470       480        490       500       510   

      270       280     
pF1KE1 RITALENMLCELVDGTD
       ::. ::... ..     
XP_016 RISKLEQQMAKIAA   
           520          

>>NP_001018080 (OMIM: 609849) coronin-1B [Homo sapiens]   (489 aa)
 initn: 1029 init1: 934 opt: 965  Z-score: 1043.1  bits: 201.7 E(85289): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 1014; 54.5% identity (74.2% similar) in 299 aa overlap (6-283:208-487)

                                        10            20        30 
pF1KE1                          MCRGGGAMCAGEEERCAQG----RGLQLWSLEVWG
                                     :.. : :.:.  .:    :.. : . .:. 
NP_001 LIYNVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVA-EREKAHEGARPMRAIFLADGKVFT
       180       190       200       210        220       230      

              40        50        60        70        80        90 
pF1KE1 IGFGKARKRKGASGGPEVAREGGAGLVTPPVLGQNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPD
        ::..  .:. :   ::                  :.:::.::::.:.:::.::::::::
NP_001 TGFSRMSERQLALWDPE------------------NLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPD
        240       250                         260       270        

             100       110       120       130       140       150 
pF1KE1 SSIVYLCGKGDSSIRYFEITDEPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFY
       .:.::.::::::::::::::.:::..:.::::.::::::::: ::::::.::::::::::
NP_001 TSVVYVCGKGDSSIRYFEITEEPPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFY
      280       290       300       310       320       330        

             160       170       180       190       200       210 
pF1KE1 KLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVP
       ::::::::::.:::::::::::::::::: ::: ::::.::.::.::.:.:::::..:::
NP_001 KLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVP
      340       350       360       370       380       390        

             220        230               240               250    
pF1KE1 PKHRELRVTKRNIL-DVRPPSGPRRSQ--------SASDAPLSQHT--------LETLLE
        :.:.:....::.: : ::  .:  :.        .:.::  :           :: ...
NP_001 SKQRDLKISRRNVLSDSRPAMAPGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQ
      400       410       420       430       440       450        

          260       270       280     
pF1KE1 EIKALRERVQAQEQRITALENMLCELVDGTD
       :..:::  :. : .::  ::..: .. .:  
NP_001 ELRALRALVKEQGDRICRLEEQLGRMENGDA
      460       470       480         

>>NP_065174 (OMIM: 609849) coronin-1B [Homo sapiens]      (489 aa)
 initn: 1029 init1: 934 opt: 965  Z-score: 1043.1  bits: 201.7 E(85289): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 1014; 54.5% identity (74.2% similar) in 299 aa overlap (6-283:208-487)

                                        10            20        30 
pF1KE1                          MCRGGGAMCAGEEERCAQG----RGLQLWSLEVWG
                                     :.. : :.:.  .:    :.. : . .:. 
NP_065 LIYNVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVA-EREKAHEGARPMRAIFLADGKVFT
       180       190       200       210        220       230      

              40        50        60        70        80        90 
pF1KE1 IGFGKARKRKGASGGPEVAREGGAGLVTPPVLGQNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPD
        ::..  .:. :   ::                  :.:::.::::.:.:::.::::::::
NP_065 TGFSRMSERQLALWDPE------------------NLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPD
        240       250                         260       270        

             100       110       120       130       140       150 
pF1KE1 SSIVYLCGKGDSSIRYFEITDEPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFY
       .:.::.::::::::::::::.:::..:.::::.::::::::: ::::::.::::::::::
NP_065 TSVVYVCGKGDSSIRYFEITEEPPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFY
      280       290       300       310       320       330        

             160       170       180       190       200       210 
pF1KE1 KLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVP
       ::::::::::.:::::::::::::::::: ::: ::::.::.::.::.:.:::::..:::
NP_065 KLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVP
      340       350       360       370       380       390        

             220        230               240               250    
pF1KE1 PKHRELRVTKRNIL-DVRPPSGPRRSQ--------SASDAPLSQHT--------LETLLE
        :.:.:....::.: : ::  .:  :.        .:.::  :           :: ...
NP_065 SKQRDLKISRRNVLSDSRPAMAPGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQ
      400       410       420       430       440       450        

          260       270       280     
pF1KE1 EIKALRERVQAQEQRITALENMLCELVDGTD
       :..:::  :. : .::  ::..: .. .:  
NP_065 ELRALRALVKEQGDRICRLEEQLGRMENGDA
      460       470       480         

>>XP_011544016 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coronin-  (461 aa)
 initn: 955 init1: 877 opt: 925  Z-score: 1000.3  bits: 193.7 E(85289): 5.6e-49
Smith-Waterman score: 925; 65.4% identity (84.1% similar) in 208 aa overlap (67-274:254-455)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE1 ARKRKGASGGPEVAREGGAGLVTPPVLGQNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVY
                                     ..:::..:::.:::.::::::.:::..:::
XP_011 VRAVFVSEGKILTTGFSRMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVY
           230       240       250       260       270       280   

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE1 LCGKGDSSIRYFEITDEPPFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHER
       :::::::::::::::.: ::.:::. ::::: :::::.::::::.:.:::::::::::::
XP_011 LCGKGDSSIRYFEITSEAPFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHER
           290       300       310       320       330       340   

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE1 KCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVPPKHRE
       .:::: :::::::::::.:::: : ::.::: :.:::.:.:: :.::::.::::::: ::
XP_011 RCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRE
           350       360       370       380       390       400   

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE1 LRVTKRNILDVRPPSGPRRSQSASDAPLSQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQRITALENM
       :::..   ::    .: ::.   ...  :. ..  : ::.. :.  ::  ..:.  ::  
XP_011 LRVNRG--LD----TGRRRAAPEASGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEET
             410           420       430       440       450       

        280     
pF1KE1 LCELVDGTD
                
XP_011 VQAK     
       460      




285 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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