Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1015
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1015, 330 aa
1>>>pF1KE1015 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8843+/-0.000814; mu= 13.0531+/- 0.049
mean_var=72.3715+/-14.433, 0's: 0 Z-trim(107.2): 42 B-trim: 3 in 1/49
Lambda= 0.150762
statistics sampled from 9368 (9405) to 9368 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 2.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8168.1 AIP gene_id:9049|Hs108|chr11 ( 330) 2233 494.8 4e-140
CCDS11075.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 ( 384) 1175 264.7 8.6e-71
CCDS67131.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 ( 372) 1048 237.1 1.7e-62
CCDS67130.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 ( 362) 1009 228.6 6.1e-60
CCDS67132.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 ( 262) 893 203.3 1.8e-52
CCDS32539.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 ( 324) 891 202.9 2.9e-52
CCDS67133.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 ( 360) 777 178.1 9.4e-45
CCDS32540.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 ( 321) 635 147.2 1.7e-35
>>CCDS8168.1 AIP gene_id:9049|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 2233 init1: 2233 opt: 2233 Z-score: 2629.1 bits: 494.8 E(32554): 4e-140
Smith-Waterman score: 2233; 99.7% identity (100.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGELPDFQDGTKATFHYRTLHSDDEGTVLDDSRARGKPM
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CCDS81 MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGELPDFQDGTKATFHYRTLHSDDEGTVLDDSRARGKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDIKHVVLYPLVAKSLRNIAVGKDPLEGQRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDIKHVVLYPLVAKSLRNIAVGKDPLEGQRH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 CCGVAQMREHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CCGVAQMREHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPEWIQLDKQITPLLLNYCQC
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CCDS81 LIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPEWIQLDQQITPLLLNYCQC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLVVEEYYEVLDHCSSILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALAP
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CCDS81 KLVVEEYYEVLDHCSSILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALAP
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE1 VVSRELRALEARIRQKDEEDKARFRGIFSH
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CCDS81 VVSRELRALEARIRQKDEEDKARFRGIFSH
310 320 330
>>CCDS11075.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 (384 aa)
initn: 1161 init1: 1141 opt: 1175 Z-score: 1384.4 bits: 264.7 E(32554): 8.6e-71
Smith-Waterman score: 1175; 49.7% identity (78.0% similar) in 328 aa overlap (3-330:2-329)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGELPDFQDGTKATFHYRTLHSDDEGTVLDDSRARGKPM
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CCDS11 MDAALLLNVEGVKKTILHGGTGELPNFITGSRVIFHFRTMKCDEERTVIDDSRQVGQPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDIKHVVLYPLVAKSLRNIAVGKDPLEGQRH
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CCDS11 HIIIGNMFKLEVWEILLTSMRVHEVAEFWCDTIHTGVYPILSRSLRQMAQGKDPTEWHVH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 CCGVAQMREHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVP
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CCDS11 TCGLANMFAYHTLGYEDLDELQKEPQPLVFVIELLQVDAPSDYQRETWNLSNHEKMKAVP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPEWIQLDKQITPLLLNYCQC
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CCDS11 VLHGEGNRLFKLGRYEEASSKYQEAIICLRNLQTKEKPWEVQWLKLEKMINTLILNYCQC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLVVEEYYEVLDHCSSILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALAP
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CCDS11 LLKKEEYYEVLEHTSDILRHHPGIVKAYYVRARAHAEVWNEAEAKADLQKVLELEPSMQK
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE1 VVSRELRALEARIRQKDEEDKARFRGIFSH
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CCDS11 AVRRELRLLENRMAEKQEEERLRCRNMLSQGATQPPAEPPTEPPAQSSTEPPAEPPTAPS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS67131.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 (372 aa)
initn: 1099 init1: 1045 opt: 1048 Z-score: 1235.3 bits: 237.1 E(32554): 1.7e-62
Smith-Waterman score: 1096; 48.2% identity (75.0% similar) in 328 aa overlap (3-330:2-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGELPDFQDGTKATFHYRTLHSDDEGTVLDDSRARGKPM
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CCDS67 MDAALLLNVEGVKKTILHGGTGELPNFITGSR------------ERTVIDDSRQVGQPM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDIKHVVLYPLVAKSLRNIAVGKDPLEGQRH
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CCDS67 HIIIGNMFKLEVWEILLTSMRVHEVAEFWCDTIHTGVYPILSRSLRQMAQGKDPTEWHVH
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 CCGVAQMREHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVP
::.:.: . .::. ::: ::..::::.: .:.:.:..:. ::.. : ....:: ::::
CCDS67 TCGLANMFAYHTLGYEDLDELQKEPQPLVFVIELLQVDAPSDYQRETWNLSNHEKMKAVP
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPEWIQLDKQITPLLLNYCQC
..: :::::.. :. .::..:: .:: ::.::: ::.: .:..:.:.:. :.::::::
CCDS67 VLHGEGNRLFKLGRYEEASSKYQEAIICLRNLQTKEKPWEVQWLKLEKMINTLILNYCQC
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLVVEEYYEVLDHCSSILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALAP
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CCDS67 LLKKEEYYEVLEHTSDILRHHPGIVKAYYVRARAHAEVWNEAEAKADLQKVLELEPSMQK
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE1 VVSRELRALEARIRQKDEEDKARFRGIFSH
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CCDS67 AVRRELRLLENRMAEKQEEERLRCRNMLSQGATQPPAEPPTEPPAQSSTEPPAEPPTAPS
290 300 310 320 330 340
>>CCDS67130.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 (362 aa)
initn: 1053 init1: 999 opt: 1009 Z-score: 1189.6 bits: 228.6 E(32554): 6.1e-60
Smith-Waterman score: 1037; 46.0% identity (72.9% similar) in 328 aa overlap (3-330:2-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGELPDFQDGTKATFHYRTLHSDDEGTVLDDSRARGKPM
: : .:..: ... : ::::.: :... :.::
CCDS67 MDAALLLNVEGVKKTILHGGTGELPNFITGSRV----------------------GQPM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDIKHVVLYPLVAKSLRNIAVGKDPLEGQRH
..:::. ::: ::: .. .:: :.:.: :: :. .::....:::..: :::: : . :
CCDS67 HIIIGNMFKLEVWEILLTSMRVHEVAEFWCDTIHTGVYPILSRSLRQMAQGKDPTEWHVH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 CCGVAQMREHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVP
::.:.: . .::. ::: ::..::::.: .:.:.:..:. ::.. : ....:: ::::
CCDS67 TCGLANMFAYHTLGYEDLDELQKEPQPLVFVIELLQVDAPSDYQRETWNLSNHEKMKAVP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPEWIQLDKQITPLLLNYCQC
..: :::::.. :. .::..:: .:: ::.::: ::.: .:..:.:.:. :.::::::
CCDS67 VLHGEGNRLFKLGRYEEASSKYQEAIICLRNLQTKEKPWEVQWLKLEKMINTLILNYCQC
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLVVEEYYEVLDHCSSILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALAP
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CCDS67 LLKKEEYYEVLEHTSDILRHHPGIVKAYYVRARAHAEVWNEAEAKADLQKVLELEPSMQK
220 230 240 250 260 270
310 320 330
pF1KE1 VVSRELRALEARIRQKDEEDKARFRGIFSH
.: :::: :: :. .:.::.. : :...:.
CCDS67 AVRRELRLLENRMAEKQEEERLRCRNMLSQGATQPPAEPPTEPPAQSSTEPPAEPPTAPS
280 290 300 310 320 330
>>CCDS67132.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 (262 aa)
initn: 881 init1: 544 opt: 893 Z-score: 1055.5 bits: 203.3 E(32554): 1.8e-52
Smith-Waterman score: 893; 48.3% identity (75.7% similar) in 259 aa overlap (3-261:2-252)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGELPDFQDGTKATFHYRTLHSDDEGTVLDDSRARGKPM
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CCDS67 MDAALLLNVEGVKKTILHGGTGELPNFITGSRVIFHFRTMKCDEERTVIDDSRQVGQPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDIKHVVLYPLVAKSLRNIAVGKDPLEGQRH
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CCDS67 HIIIGNMFKLEVWEILLTSMRVHEVAEFWCDTIHTGVYPILSRSLRQMAQGKDPTEWHVH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 CCGVAQMREHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVP
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CCDS67 TCGLANMFAYHTLGYEDLDELQKEPQPLVFVIELL--------QRETWNLSNHEKMKAVP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPEWIQLDKQITPLLLNYCQC
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CCDS67 VLHGEGNRLFKLGRYEEASSKYQEAIICLRNLQTKEKPWEVQWLKLEKMINTLILNYCQC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLVVEEYYEVLDHCSSILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALAP
: :::::::.: :.:: ..
CCDS67 LLKKEEYYEVLEHTSDILRHHPGARGCRGGQ
240 250 260
>>CCDS32539.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 (324 aa)
initn: 948 init1: 891 opt: 891 Z-score: 1051.7 bits: 202.9 E(32554): 2.9e-52
Smith-Waterman score: 891; 50.0% identity (79.4% similar) in 248 aa overlap (83-330:22-269)
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SRARGKPMELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDIKHVVLYPLVAKSLRNIAVGK
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CCDS32 MDAALLLNVEGVKKTILHGGTGELPNFITGSRHTGVYPILSRSLRQMAQGK
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DPLEGQRHCCGVAQMREHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKVESPGTYQQDPWAMTD
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CCDS32 DPTEWHVHTCGLANMFAYHTLGYEDLDELQKEPQPLVFVIELLQVDAPSDYQRETWNLSN
60 70 80 90 100 110
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 EEKAKAVPLIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPEWIQLDKQITP
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CCDS32 HEKMKAVPVLHGEGNRLFKLGRYEEASSKYQEAIICLRNLQTKEKPWEVQWLKLEKMINT
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LLLNYCQCKLVVEEYYEVLDHCSSILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVL
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CCDS32 LILNYCQCLLKKEEYYEVLEHTSDILRHHPGIVKAYYVRARAHAEVWNEAEAKADLQKVL
180 190 200 210 220 230
300 310 320 330
pF1KE1 ELDPALAPVVSRELRALEARIRQKDEEDKARFRGIFSH
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CCDS32 ELEPSMQKAVRRELRLLENRMAEKQEEERLRCRNMLSQGATQPPAEPPTEPPAQSSTEPP
240 250 260 270 280 290
CCDS32 AEPPTAPSAELSAGPPAEPATEPPPSPGHSLQH
300 310 320
>>CCDS67133.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 (360 aa)
initn: 1058 init1: 772 opt: 777 Z-score: 917.0 bits: 178.1 E(32554): 9.4e-45
Smith-Waterman score: 1021; 46.0% identity (72.0% similar) in 328 aa overlap (3-330:2-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGELPDFQDGTKATFHYRTLHSDDEGTVLDDSRARGKPM
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CCDS67 MDAALLLNVEGVKKTILHGGTGELPNFITGSRVIFHFRTMKCDEERTVIDDSRQVGQPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDIKHVVLYPLVAKSLRNIAVGKDPLEGQRH
..:::. ::: ::: .. .:: :.:.: :: :. .::....:::..: :::: : . :
CCDS67 HIIIGNMFKLEVWEILLTSMRVHEVAEFWCDTIHTGVYPILSRSLRQMAQGKDPTEWHVH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 CCGVAQMREHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVP
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CCDS67 TCGLANMFAYHTLGYEDLDELQKEPQPLVFVIELLQVDAPSDYQRETWNLSNHEKMKAVP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPEWIQLDKQITPLLLNYCQC
..: :::::.. :. .::..:: .:: ::.::: : :
CCDS67 VLHGEGNRLFKLGRYEEASSKYQEAIICLRNLQTK------------------------C
180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLVVEEYYEVLDHCSSILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALAP
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CCDS67 LLKKEEYYEVLEHTSDILRHHPGIVKAYYVRARAHAEVWNEAEAKADLQKVLELEPSMQK
220 230 240 250 260 270
310 320 330
pF1KE1 VVSRELRALEARIRQKDEEDKARFRGIFSH
.: :::: :: :. .:.::.. : :...:.
CCDS67 AVRRELRLLENRMAEKQEEERLRCRNMLSQGATQPPAEPPTEPPAQSSTEPPAEPPTAPS
280 290 300 310 320 330
>>CCDS32540.1 AIPL1 gene_id:23746|Hs108|chr17 (321 aa)
initn: 934 init1: 618 opt: 635 Z-score: 750.8 bits: 147.2 E(32554): 1.7e-35
Smith-Waterman score: 806; 40.2% identity (62.5% similar) in 328 aa overlap (3-330:2-266)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGELPDFQDGTKATFHYRTLHSDDEGTVLDDSRARGKPM
: : .:..: ... : ::::.: :... ::.::.. :.: ::.:::: :.::
CCDS32 MDAALLLNVEGVKKTILHGGTGELPNFITGSRVIFHFRTMKCDEERTVIDDSRQVGQPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDIKHVVLYPLVAKSLRNIAVGKDPLEGQRH
..:::. ::: ::: .. .:: :.:.: ::
CCDS32 HIIIGNMFKLEVWEILLTSMRVHEVAEFWCDTI---------------------------
60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 CCGVAQMREHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVP
:..:. ::.. : ....:: ::::
CCDS32 ------------------------------------VDAPSDYQRETWNLSNHEKMKAVP
100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPEWIQLDKQITPLLLNYCQC
..: :::::.. :. .::..:: .:: ::.::: ::.: .:..:.:.:. :.::::::
CCDS32 VLHGEGNRLFKLGRYEEASSKYQEAIICLRNLQTKEKPWEVQWLKLEKMINTLILNYCQC
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLVVEEYYEVLDHCSSILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALAP
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CCDS32 LLKKEEYYEVLEHTSDILRHHPGIVKAYYVRARAHAEVWNEAEAKADLQKVLELEPSMQK
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CCDS32 AVRRELRLLENRMAEKQEEERLRCRNMLSQGATQPPAEPPTEPPAQSSTEPPAEPPTAPS
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