Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1027
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1027, 1035 aa
1>>>pF1KE1027 1035 - 1035 aa - 1035 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4360+/-0.00084; mu= 5.9276+/- 0.051
mean_var=270.5013+/-55.063, 0's: 0 Z-trim(117.0): 14 B-trim: 275 in 1/53
Lambda= 0.077981
statistics sampled from 17668 (17682) to 17668 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.543), width: 16
Scan time: 6.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34708.1 GIGYF1 gene_id:64599|Hs108|chr7 (1035) 7091 811.5 0
CCDS33401.1 GIGYF2 gene_id:26058|Hs108|chr2 (1299) 1465 178.6 7.5e-44
CCDS46543.1 GIGYF2 gene_id:26058|Hs108|chr2 (1293) 1206 149.5 4.4e-35
CCDS46542.1 GIGYF2 gene_id:26058|Hs108|chr2 (1320) 870 111.7 1.1e-23
>>CCDS34708.1 GIGYF1 gene_id:64599|Hs108|chr7 (1035 aa)
initn: 7091 init1: 7091 opt: 7091 Z-score: 4322.8 bits: 811.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7091; 100.0% identity (100.0% similar) in 1035 aa overlap (1-1035:1-1035)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAETLNFGPEWLRALSGGGSVASPPPSPAMPKYKLADYRYGREEMLALYVKENKVPEEL
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CCDS34 MAAETLNFGPEWLRALSGGGSVASPPPSPAMPKYKLADYRYGREEMLALYVKENKVPEEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QDKEFAAVLQDEPLQPLALEPLTEEEQRNFSLSVNSVAVLRLMGKGAGPPLAGTSRGRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QDKEFAAVLQDEPLQPLALEPLTEEEQRNFSLSVNSVAVLRLMGKGAGPPLAGTSRGRGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TRSRGRGRGDSCFYQRSIEEGDGAFGRSPREIQRSQSWDDRGERRFEKSARRDGARCGFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TRSRGRGRGDSCFYQRSIEEGDGAFGRSPREIQRSQSWDDRGERRFEKSARRDGARCGFE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EGGAGPRKEHARSDSENWRSLREEQEEEEEGSWRLGAGPRRDGDRWRSASPDGGPRSAGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EGGAGPRKEHARSDSENWRSLREEQEEEEEGSWRLGAGPRRDGDRWRSASPDGGPRSAGW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 REHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGGSSHLRRCRAPEGFEEDKDGLPEWCLDDED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 REHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGGSSHLRRCRAPEGFEEDKDGLPEWCLDDED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELDFQGLEEEEEPSEGLEEEGPEAGGKELTPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELDFQGLEEEEEPSEGLEEEGPEAGGKELTPLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 PQEEKSSSPSPLPTLGPLWGTNGDGDETAEKEPPAAEDDIRGIQLSPGVGSSAGPPGDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PQEEKSSSPSPLPTLGPLWGTNGDGDETAEKEPPAAEDDIRGIQLSPGVGSSAGPPGDLE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 DDEGLKHLQQEAEKLVASLQDSSLEEEQFTAAMQTQGLRHSAAATALPLSHGAARKWFYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DDEGLKHLQQEAEKLVASLQDSSLEEEQFTAAMQTQGLRHSAAATALPLSHGAARKWFYK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 DPQGEIQGPFTTQEMAEWFQAGYFSMSLLVKRGCDEGFQPLGEVIKMWGRVPFAPGPSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DPQGEIQGPFTTQEMAEWFQAGYFSMSLLVKRGCDEGFQPLGEVIKMWGRVPFAPGPSPP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 PLLGNMDQERLKKQQELAAAALYQQLQHQQFLQLVSSRQLPQCALREKAALGDLTPPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLLGNMDQERLKKQQELAAAALYQQLQHQQFLQLVSSRQLPQCALREKAALGDLTPPPPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 PPQQQQQQLTAFLQQLQALKPPRGGDQNLLPTMSRSLSVPDSGRLWDVHTSASSQSGGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PPQQQQQQLTAFLQQLQALKPPRGGDQNLLPTMSRSLSVPDSGRLWDVHTSASSQSGGEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 SLWDIPINSSTQGPILEQLQLQHKFQERREVELRAKREEEERKRREEKRRQQQQEEQKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLWDIPINSSTQGPILEQLQLQHKFQERREVELRAKREEEERKRREEKRRQQQQEEQKRR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 QEEEELFRRKHVRQQELLLKLLQQQQAVPVPPAPSSPPPLWAGLAKQGLSMKTLLELQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QEEEELFRRKHVRQQELLLKLLQQQQAVPVPPAPSSPPPLWAGLAKQGLSMKTLLELQLE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 GERQLHKQPPPREPARAQAPNHRVQLGGLGTAPLNQWVSEAGPLWGGPDKSGGGSSGLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GERQLHKQPPPREPARAQAPNHRVQLGGLGTAPLNQWVSEAGPLWGGPDKSGGGSSGLGL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 WEDTPKSGGSLVRGLGLKNSRSSPSLSDSYSHLSGRPIRKKTEEEEKLLKLLQGIPRPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WEDTPKSGGSLVRGLGLKNSRSSPSLSDSYSHLSGRPIRKKTEEEEKLLKLLQGIPRPQD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 GFTQWCEQMLHTLSATGSLDVPMAVAILKEVESPYDVHDYIRSCLGDTLEAKEFAKQFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GFTQWCEQMLHTLSATGSLDVPMAVAILKEVESPYDVHDYIRSCLGDTLEAKEFAKQFLE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 RRAKQKASQQRQQQQEAWLSSASLQTAFQANHSTKLGPGEGSKAKRRALMLHSDPSILGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RRAKQKASQQRQQQQEAWLSSASLQTAFQANHSTKLGPGEGSKAKRRALMLHSDPSILGY
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KE1 SLHGSSGEIESVDDY
:::::::::::::::
CCDS34 SLHGSSGEIESVDDY
1030
>>CCDS33401.1 GIGYF2 gene_id:26058|Hs108|chr2 (1299 aa)
initn: 2248 init1: 713 opt: 1465 Z-score: 900.8 bits: 178.6 E(32554): 7.5e-44
Smith-Waterman score: 2593; 51.8% identity (72.1% similar) in 842 aa overlap (1-748:1-804)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAAET--LNFGPEWLRALSGGGSVASPPPSPAMPKYKLADYRYGREEMLALYVKENKVPE
::::: ::::::::::::.:::..::: :::.::::::::::::::::::..:.::.:
CCDS33 MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 ELQDKEFAAVLQDEPLQPLALEPLTEEEQRNFSLSVNSVAVLRLMGKGAGPPLAGTSRGR
.: :::: .::.::: :::: :.:::::::::.::::.::::: :.:.: ..:. :::
CCDS33 DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GSTRSRGRGRGDSCFYQRSIEEGDGAFGRSP-REIQRSQSWDDRGERRFEKSARRDGARC
.:.:.::::::. :::::..: .:.:::. ::..:::::..::.::::: .:.: .:
CCDS33 SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGRP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 GFEEGG---AGPRKEHARSDSENWRSLREEQE-EEEEGSWRLGAGPRRDGDRWRSASPDG
.::::: .: ..: ::.::::: .::::. :.:.:.::: :: ::::.::: ::::
CCDS33 NFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDGGWRL-AGSRRDGERWRPHSPDG
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GPRSAGWREHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGGSSHLRRCRAPEG-FEEDKDGLP
::::::::: ::::.::::.: :: .. :: :: :. : ...:.:.::
CCDS33 -PRSAGWREHMERRRRFEFDFR-DR-----DDERG------YRRVRSGSGSIDDDRDSLP
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE1 EWCLDDEDEEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELDFQGLEEEEEPSE----------
::::.: .:::::::.::::: ::: :::::::::.::. ..: :: :.
CCDS33 EWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSEGSHNEEAK
290 300 310 320 330 340
350 360
pF1KE1 ----------------GLE--EEGPEAGGKELTPLPPQEEKS------------------
:.: :: :..... : :....:
CCDS33 EPDKTNKKEGEKTDRVGVEASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKDEPKTEQTE
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400
pF1KE1 ----------SSPSPLPTLG---------PLWGTNGDGDETAEKEPPAAEDD---IRGIQ
: :. .:. : :: .: :: . . .: ..
CCDS33 KAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNPSPTLRPVE
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 L----SPGVGSSAGPPGDLEDDEGLKHLQQEAEKLVASLQDSSLEEEQFTAAMQTQGLRH
.::.:: . : .:.::::::.:.:::.:: ::::.:..:.... .: .:
CCDS33 TPVVGAPGMGSVSTEP---DDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQ----EH
470 480 490 500 510
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 SAAATALPLSHGAARKWFYKDPQGEIQGPFTTQEMAEWFQAGYFSMSLLVKRGCDEGFQP
: ....:: : : .::.::::::::::::..::::::::::::.:::::::.:::.:::
CCDS33 RAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQP
520 530 540 550 560 570
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 LGEVIKMWGRVPFAPGPSPPPLLGNMDQERLKKQQELAAAALYQQLQHQQFLQLVSSRQL
::...::::::::.:::.::: .:..::::: .::::.: ::: .:: :. :.. ..:
CCDS33 LGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTA--LYQ-MQHLQYQQFLIQQQY
580 590 600 610 620 630
590 600 610 620 630
pF1KE1 PQC-ALREKAALGDLTPPPPPPPQQQQQQLTAFLQQLQALKPPRGGDQNLLPTMSRSLSV
: : ..::::.. ::::::. .:::.:.:: : .:::..:...::.::
CCDS33 AQVLAQQQKAALSS----------QQQQQLALLLQQFQTLKM-RISDQNIIPSVTRSVSV
640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 PDSGRLWDVHTSASSQSGGEA-SLWDIPINSSTQGPILEQLQLQHKF------QERREVE
::.: .:... .::. . :. :.::.:....: :: ::::: .: :::::.:
CCDS33 PDTGSIWELQPTASQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQERREAE
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740
pF1KE1 LRAKREEEERKRREEKRRQQ------QQEEQKRRQEEEELFRRKHVRQQELLLKLLQQQQ
.:::::::::::.:: :::: ::::...:.::::: ::: :.: : . .:.
CCDS33 MRAKREEEERKRQEELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEELARRK---QEEALRRQREQEI
750 760 770 780 790 800
750 760 770 780 790 800
pF1KE1 AVPVPPAPSSPPPLWAGLAKQGLSMKTLLELQLEGERQLHKQPPPREPARAQAPNHRVQL
:.
CCDS33 ALRRQREEEERQQQEEALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQRRLE
810 820 830 840 850 860
>--
initn: 605 init1: 504 opt: 730 Z-score: 453.9 bits: 95.9 E(32554): 5.8e-19
Smith-Waterman score: 814; 39.7% identity (66.7% similar) in 411 aa overlap (672-1035:902-1299)
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 SGRLWDVHTSASSQSGGEASLWDIPINSSTQGPILEQLQLQHKFQERREVELRAKREEEE
: :..:: :.. :. ...: .. .
CCDS33 AARLRHEEEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQ
880 890 900 910 920 930
710 720 730 740 750
pF1KE1 RKRREEKRRQQQ---QEEQKRRQEEEELFRRKHVRQQELLLKLLQQQQAVPVPPAPSSPP
.. . : : :: ..:.:. .:... :::. :.: ::::: .
CCDS33 QSNTTACQSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSG---
940 950 960 970 980
760 770 780 790 800
pF1KE1 PLWAGLAKQGLSMKTLLELQLEGERQLHKQPPPRE----PARAQAPNH---RVQLGG---
:....: . . :.:::.: : ::..:: .. : ::. .: ....:.
CCDS33 --WGNVSKPSGTTKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVW
990 1000 1010 1020 1030 1040
810 820 830 840 850 860
pF1KE1 --LGTAPLNQWVSE-AGPLWGGPDKSGGGSSGLGLWEDTPKSGGSLVRGLGLKNSRSSPS
..:.: :::.:. .. .:.. : . .:..:.:.:. : : :. :: ... :
CCDS33 GSINTGPPNQWASDLVSSIWSNADTK---NSNMGFWDDAVKEVGP--RNSTNKN-KNNAS
1050 1060 1070 1080 1090 1100
870 880 890 900 910 920
pF1KE1 LSDSYSHLSGRPIRKKTEEEEKLLKLLQGIPRPQDGFTQWCEQMLHTLSATGSLDVPMAV
:: : . .:.: ::.:::::::::.::. . :::::::::::::.:.....:::: :
CCDS33 LSKSVG-VSNRQ-NKKVEEEEKLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFV
1110 1120 1130 1140 1150
930 940 950 960 970
pF1KE1 AILKEVESPYDVHDYIRSCLGDTLEAKEFAKQFLERRAKQKASQQRQQQQ----------
..::::::::.::::::. :::: ::::::::::::::::::.:::::::
CCDS33 SFLKEVESPYEVHDYIRAYLGDTSEAKEFAKQFLERRAKQKANQQRQQQQLPQQQQQQPP
1160 1170 1180 1190 1200 1210
980 990 1000 1010
pF1KE1 -----------EAW-LSSASLQTAFQANHSTKLGPG----EGSKAKRRALMLHSDPSILG
.: .. ..:...::.:.:.. . ...: :.. :...:::.::
CCDS33 QQPPQQPQQQDSVWGMNHSTLHSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVRADPSLLG
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1020 1030
pF1KE1 YSLHGSS-----GEIESVDDY
.:...:: ::::..:::
CCDS33 FSVNASSERLNMGEIETLDDY
1280 1290
>>CCDS46543.1 GIGYF2 gene_id:26058|Hs108|chr2 (1293 aa)
initn: 2226 init1: 713 opt: 1206 Z-score: 743.3 bits: 149.5 E(32554): 4.4e-35
Smith-Waterman score: 2540; 51.1% identity (71.5% similar) in 842 aa overlap (1-748:1-798)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAAET--LNFGPEWLRALSGGGSVASPPPSPAMPKYKLADYRYGREEMLALYVKENKVPE
::::: ::::::::::::.:::..::: :::.::::::::::::::::::..:.::.:
CCDS46 MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 ELQDKEFAAVLQDEPLQPLALEPLTEEEQRNFSLSVNSVAVLRLMGKGAGPPLAGTSRGR
.: :::: .::.::: :::: :.:::::::::.::::.::::: :.:.: ..:. :::
CCDS46 DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GSTRSRGRGRGDSCFYQRSIEEGDGAFGRSP-REIQRSQSWDDRGERRFEKSARRDGARC
.:.:.::::::. :::::..: .:.:::. ::..:::::..::.::::: .:.: .:
CCDS46 SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGRP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 GFEEGG---AGPRKEHARSDSENWRSLREEQE-EEEEGSWRLGAGPRRDGDRWRSASPDG
.::::: .: ..: ::.::::: .::::. :.:.:.::: :: ::::.:::
CCDS46 NFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDGGWRL-AGSRRDGERWR------
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GPRSAGWREHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGGSSHLRRCRAPEG-FEEDKDGLP
:.: ::::: ::::.::::.: :: .. :: :: :. : ...:.:.::
CCDS46 -PHSPGWREHMERRRRFEFDFR-DR-----DDERG------YRRVRSGSGSIDDDRDSLP
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE1 EWCLDDEDEEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELDFQGLEEEEEPSE----------
::::.: .:::::::.::::: ::: :::::::::.::. ..: :: :.
CCDS46 EWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSEGSHNEEAK
290 300 310 320 330 340
350 360
pF1KE1 ----------------GLE--EEGPEAGGKELTPLPPQEEKS------------------
:.: :: :..... : :....:
CCDS46 EPDKTNKKEGEKTDRVGVEASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKDEPKTEQTE
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400
pF1KE1 ----------SSPSPLPTLG---------PLWGTNGDGDETAEKEPPAAEDD---IRGIQ
: :. .:. : :: .: :: . . .: ..
CCDS46 KAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNPSPTLRPVE
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 L----SPGVGSSAGPPGDLEDDEGLKHLQQEAEKLVASLQDSSLEEEQFTAAMQTQGLRH
.::.:: . : .:.::::::.:.:::.:: ::::.:..:.... .: .:
CCDS46 TPVVGAPGMGSVSTEP---DDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQ----EH
470 480 490 500 510
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 SAAATALPLSHGAARKWFYKDPQGEIQGPFTTQEMAEWFQAGYFSMSLLVKRGCDEGFQP
: ....:: : : .::.::::::::::::..::::::::::::.:::::::.:::.:::
CCDS46 RAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQP
520 530 540 550 560 570
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 LGEVIKMWGRVPFAPGPSPPPLLGNMDQERLKKQQELAAAALYQQLQHQQFLQLVSSRQL
::...::::::::.:::.::: .:..::::: .::::.: ::: .:: :. :.. ..:
CCDS46 LGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTA--LYQ-MQHLQYQQFLIQQQY
580 590 600 610 620 630
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::.: .:... .::. . :. :.::.:....: :: ::::: .: :::::.:
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:.
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