Result of FASTA (omim) for
pF1KE1028
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1028, 1217 aa
1>>>pF1KE1028 1217 - 1217 aa - 1217 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.7601+/-0.000875; mu= -38.1420+/- 0.054
mean_var=785.7173+/-160.964, 0's: 0 Z-trim(114.2): 169 B-trim: 33 in 1/54
Lambda= 0.045755
statistics sampled from 23735 (23858) to 23735 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 17.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005436 (OMIM: 606062,610759) structural mainten (1217) 7753 529.1 6.5e-149
XP_011516455 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1099) 807 70.6 6.4e-11
XP_011516454 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1115) 807 70.6 6.4e-11
XP_011510614 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural (1216) 578 55.5 2.5e-06
NP_001275682 (OMIM: 605575) structural maintenance (1263) 578 55.5 2.5e-06
NP_001002800 (OMIM: 605575) structural maintenance (1288) 578 55.5 2.6e-06
NP_005487 (OMIM: 605575) structural maintenance of (1288) 578 55.5 2.6e-06
XP_011510613 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural (1288) 578 55.5 2.6e-06
XP_016860980 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural ( 952) 444 46.6 0.00093
XP_006713522 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural (1210) 446 46.8 0.001
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XP_011516452 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 433 45.9 0.0018
XP_016869701 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 433 45.9 0.0018
XP_016869700 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 433 45.9 0.0018
XP_016869698 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 433 45.9 0.0018
XP_016869699 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1147) 433 45.9 0.0018
NP_001036016 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197) 433 45.9 0.0018
NP_006435 (OMIM: 605576) structural maintenance of (1197) 433 45.9 0.0018
NP_001036015 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197) 433 45.9 0.0018
XP_016869695 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 433 45.9 0.0018
NP_001252531 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197) 433 45.9 0.0018
XP_016869696 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 433 45.9 0.0018
XP_011516450 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 433 45.9 0.0018
XP_016869697 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 433 45.9 0.0018
XP_006716996 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 433 45.9 0.0018
XP_011516451 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural (1197) 433 45.9 0.0018
XP_011528447 (OMIM: 608685) PREDICTED: structural (1101) 423 45.3 0.0027
NP_001278430 (OMIM: 608685) structural maintenance (1161) 423 45.3 0.0028
NP_001268392 (OMIM: 300040,300590) structural main (1211) 421 45.1 0.0032
NP_006297 (OMIM: 300040,300590) structural mainten (1233) 421 45.2 0.0033
>>NP_005436 (OMIM: 606062,610759) structural maintenance (1217 aa)
initn: 7753 init1: 7753 opt: 7753 Z-score: 2794.4 bits: 529.1 E(85289): 6.5e-149
Smith-Waterman score: 7753; 100.0% identity (100.0% similar) in 1217 aa overlap (1-1217:1-1217)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKND
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 ETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ETEGKREKINELLKYIEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIK
250 260 270 280 290 300
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pF1KE1 QRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEER
310 320 330 340 350 360
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pF1KE1 GIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDL
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pF1KE1 EDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQ
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pF1KE1 QALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNF
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550 560 570 580 590 600
pF1KE1 ECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDVRDTAY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 PETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDCITLEGDQVSH
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pF1KE1 RGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQ
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730 740 750 760 770 780
pF1KE1 IETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DQVEQELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKS
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pF1KE1 MERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNV
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pF1KE1 LELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERG
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pF1KE1 SGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFY
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pF1KE1 LFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210
pF1KE1 ITAEMAKDFVEDDTTHG
:::::::::::::::::
NP_005 ITAEMAKDFVEDDTTHG
1210
>>XP_011516455 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural main (1099 aa)
initn: 348 init1: 142 opt: 807 Z-score: 317.1 bits: 70.6 E(85289): 6.4e-11
Smith-Waterman score: 958; 25.7% identity (61.6% similar) in 1124 aa overlap (1-1060:1-1061)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLS-DEFSHLRPE
:.::..:..::.:: ..: :. :. :.:.: :::::::.. .: :.:. ...:..:
XP_011 MHIKSIILEGFKSYAQRTEVNGFDPLFNAITGLNGSGKSNILDSICFLLGISNLSQVRAS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 QRLALLHEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRL-PIDKE---EVSL-RRVIGAKKDQYFLDKK
. :.... . .: : : :::::.. :. : :... :.:. . ...:...
XP_011 NLQDLVYKNGQAGITKASVSITFDNSDKKQSPLGFEVHDEITVTRQVVIGGRNKYLINGV
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pF1KE1 MVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEE
.... :..:. :.:.. .::.... ::.:... . . :....:.::::.:. .:
XP_011 NANNTRVQDLFCSVGLNVNNPHFLIMQGRITKVLNMKPPEILSMIEEAAGTRMYEYKK--
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pF1KE1 SISLMKETEGKREKINELLKYIEERLH-TLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELN
:. .: : :. :..:. .::.. :... ::: ..: ...:. : .:. :.
XP_011 -IAAQKTIEKKEAKLKEIKTILEEEITPTIQKLKEERSSYLEYQKVMREIEH------LS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 ETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSA
. . : :. .:. .....:.. : ::. ..... : ::.:...: :.:
XP_011 RLYIAYQFLLAE-DTKVRSAEELKEMQ----DKVIKLQEELSENDKKIKALNHEIEEL--
240 250 260 270 280
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pF1KE1 ERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAET---EPK
:.... :. . . .: : . . . . ..: : : :.::: .. . :
XP_011 EKRKD-KETGGILRSLEDALAEAQRVNTKSQSAFDLKKKNLACEESKRKELEKNMVEDSK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE1 FNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKS-LDQAINDK
..:::: . :. .: :: .. :. ... ... . .. :.: : :
XP_011 TLAAKEKEVKKITDGLHALQEASNKDAEA-----LAAAQQHFNAVSAGLSSNEDGAEATL
350 360 370 380 390
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pF1KE1 KRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYE-------VKNKK
:. : ..:. .... .. . .. .:.:.. .:.:...: : . :: :
XP_011 AGQMMACKNDISKAQTEAKQAQMKLKHAQQELKNKQAEVKKMDSGYRKDQEALEAVKRLK
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pF1KE1 DELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRK
..:..: . : ::: :. .: ::..: . :. : .:.: . .. .: :
XP_011 EKLEAEMKKLNYEENKEE-SLLEKRRQLSRDIGRLKE-TYEALLARFPNL-----RFAYK
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pF1KE1 GINQHV-QNGYHGIVMNNFEC-EPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMN
... .: .:.: . . . . : .:..::.::. .::. ::. : :.: . .
XP_011 DPEKNWNRNCVKGLVASLISVKDTSATTALELVAGERLYNVVVDT-EVTGKKLLE--RGE
520 530 540 550 560
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pF1KE1 LPGEVTFLPLNKLDVRDTAYPET-----NDAIP-----MISKLRYNPRFDKAFKHVFGKT
: . :..::::...: : ::: : . : .: ..:.:...::.. ::: :
XP_011 LKRRYTIIPLNKISARCIA-PETLRVAQNLVGPDNVHVALSLVEYKPELQKAMEFVFGTT
570 580 590 600 610 620
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pF1KE1 LICRSMEVSTQLA--RAFTMDCITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRL-------ELQKD
..: .:. . ..: . . .:: :: . .:.:.:: . : : ..: .
XP_011 FVCDNMDNAKKVAFDKRIMTRTVTLGGDVFDPHGTLSGGARSQAASILTKFQELKDVQDE
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730
pF1KE1 VRKAEEELGELEAKLN---------ENLRRNIERINNEIDQLMNQMQQ--IETQQRKFKA
.: :.:: :: .: ..:... : ..: : :....:: . ::... :
XP_011 LRIKENELRALEEELAGLKNTAEKYRQLKQQWEMKTEEADLLQTKLQQSSYHKQQEELDA
690 700 710 720 730 740
740 750 760 770 780
pF1KE1 SRDSIL-SE--MKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLH-AMESTRESLK-AELGTDL
. .: :: .: :: ....:. . . .... :: . .......: :. .:
XP_011 LKKTIEESEETLKNTKEIQRKAEEKYEVLENKMKNAEAERERELKDAQKKLDCAKTKADA
750 760 770 780 790 800
790 800 810 820 830
pF1KE1 LSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQEN----RQL--LNERIK-LEGIITRVETYLNENLRK
:. : :..:.:.. :...:..:. .:: .:: :: :. : . . . .: ..
XP_011 SSKKMKEKQQEVEAITLELEELKREHTSYKQQLEAVNEAIKSYESQIEVMAAEVAKN-KE
810 820 830 840 850 860
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 RLDQVEQELNELRE--TEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKE
......:... .: : ::. : .:. ... .:.. . ..::..:.: . .:
XP_011 SVNKAQEEVTKQKEVITAQDTVIKAKYAEVAKHKEQNNDSQLKIKELDHNISKHK---RE
870 880 890 900 910 920
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 LQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEK
. . . ..: :.. : :: . ..: . : ... .: .. :.:: ..
XP_011 AEDGAAKVSKMLKDY-DWINAE-RHLFGQPN-SAYDFKTNN------------PKEAGQR
930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 YQTLSLKQLFRKLEQCNTELKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIME
: ::.. . .: . .:: .:.. ... :. . :.:... .. ..:.
XP_011 LQ---------KLQEMKEKLGR--NVNMRAMNVLTEAEERYNDLMKKKRIVENDKSKILT
970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE1 LMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGE
.. :. .: .:.......:.:.:. .:. :.::..: :. .:
XP_011 TIEDLDQKKNQALNIAWQKVNKDFGSIFSTLLPGANAMLAPPEGQTVLDGLEFKVALGNT
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE1 SERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDP
XP_011 WKENLTELSGGQRQKQQNHTTG
1080 1090
>>XP_011516454 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural main (1115 aa)
initn: 348 init1: 142 opt: 807 Z-score: 317.0 bits: 70.6 E(85289): 6.4e-11
Smith-Waterman score: 958; 25.7% identity (61.6% similar) in 1124 aa overlap (1-1060:1-1061)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLS-DEFSHLRPE
:.::..:..::.:: ..: :. :. :.:.: :::::::.. .: :.:. ...:..:
XP_011 MHIKSIILEGFKSYAQRTEVNGFDPLFNAITGLNGSGKSNILDSICFLLGISNLSQVRAS
10 20 30 40 50 60
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:.... :. . . .: : . . . . ..: : : :.::: .. . :
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:. : ..:. .... .. . .. .:.:.. .:.:...: : . :: :
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..:..: . : ::: :. .: ::..: . :. : .:.: . .. .: :
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..: .:. . ..: . . .:: :: . .:.:.:: . : : ..: .
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XP_011 SSKKMKEKQQEVEAITLELEELKREHTSYKQQLEAVNEAIKSYESQIEVMAAEVAKN-KE
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pF1KE1 RLDQVEQELNELRE--TEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKE
......:... .: : ::. : .:. ... .:.. . ..::..:.: . .:
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XP_011 EDLEAIKNPDSITNQIALLEARCHEMKPNLGAIAEYKKKEELYLQRVAELDKITYERDSF
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pF1KE1 GESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKC
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pF1KE1 DPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGV-KFRN
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XP_011 KPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIIISLRNNMFEISDRLIGIYKTYN
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pF1KE1 KVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG
.. . : :.:
XP_011 ITKSVAVNPKEIASKGLC
1200 1210
>>NP_001275682 (OMIM: 605575) structural maintenance of (1263 aa)
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10 20 30
pF1KE1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVI
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pF1KE1 VGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISA------FVEIIFDN
.: ::::::: . .. ::.. . ...: .. .:.:.. . :.. : .:: .
NP_001 IGPNGSGKSNVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKE
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pF1KE1 SDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQ---YFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQ
.:. : . . . :. : .:. : .. : : .:: :::.: :.. .. ... :
NP_001 GDDYEVIPNSNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQ
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pF1KE1 GKINQMA-------TAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKE---ESISLMKETEGKREKINE
:...:.: : : :. :... : .: . . . ...: .: ::.:.
NP_001 GEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRG--EKLNR
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pF1KE1 LLKYIEERLHTLEEEKEELAQY-----QKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKR
. :..:.. .:: ::. .. . . : .. .: :: : . .. :. ...
NP_001 V-KMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIY-----ELQKRIAEMETQK
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pF1KE1 ETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLE
: : .... . .. ..:. ...:.. . :.. . . : : .:.. :.:.
NP_001 EKIHEDTKEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIE----ENKEKF---TQLD
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pF1KE1 LKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLA
:. .....: . . :.: :. :: ::.:: .. :... : ..: :. :
NP_001 LEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFKSIPAKSN---NIINETTTRNNALEK
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370 380 390 400 410 420
pF1KE1 QATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIK-KELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEA
. .:. : . .: :. ...: . ::: ......:. . .. . ...:. .
NP_001 EKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLS
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pF1KE1 NKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAA
.. . : .: . : .. ..: ....: . ..: .:.. : : :.
NP_001 RHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEGKLPQTEQE----LKEKEKELQKLTQ
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pF1KE1 KREDLEK--KQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECE
.. .... .. . .. .:. : : .:::: . .. . .. : .: ....
NP_001 EETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVLDAIIQEKKSGRIP-GIYG-RLGDLGAI
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: . . . : : .::: ... . . ....:. : .::. :.:. : .
NP_001 DEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKRQNI-GVATFIGLDKMAVWAKKMTEI
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pF1KE1 AYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLA--RAFTMDCITLEGD
::.. . . :.. . .. .:: .. ::. ... .:..: . .::.:.
NP_001 QTPENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRDTLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQ
660 670 680 690 700 710
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 QVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRR--NIERINNEIDQL
. . :..::: . :.:. . .. .:::....:..:... .. .:.. . ....
NP_001 IIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKMESQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEER
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XP_011 ELDNRSLEEILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCI
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80
pF1KE1 VGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISA------FVEIIFDN
.: ::::::: . .. ::.. . ...: .. .:.:.. . :.. : .:: .
XP_011 IGPNGSGKSNVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKE
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 SDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQ---YFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQ
.:. : . . . :. : .:. : .. : : .:: :::.: :.. .. ... :
XP_011 GDDYEVIPNSNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQ
180 190 200 210 220
150 160 170 180 190
pF1KE1 GKINQMA-------TAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKE---ESISLMKETEGKREKINE
:...:.: : : :. :... : .: . . . ...: .: ::.:.
XP_011 GEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRG--EKLNR
230 240 250 260 270 280
200 210 220 230 240
pF1KE1 LLKYIEERLHTLEEEKEELAQY-----QKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKR
. :..:.. .:: ::. .. . . : .. .: :: : . .. :. ...
XP_011 V-KMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIY-----ELQKRIAEMETQK
290 300 310 320 330 340
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLE
: : .... . .. ..:. ...:.. . :.. . . : : .:.. :.:.
XP_011 EKIHEDTKEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIE----ENKEKF---TQLD
350 360 370 380 390
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLA
:. .....: . . :.: :. :: ::.:: .. :... : ..: :. :
XP_011 LEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFKSIPAKSN---NIINETTTRNNALEK
400 410 420 430 440 450
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 QATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIK-KELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEA
. .:. : . .: :. ...: . ::: ......:. . .. . ...:. .
XP_011 EKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLS
460 470 480 490 500 510
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 NKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAA
.. . : .: . : .. ..: ....: . ..: .:.. : : :.
XP_011 RHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEGKLPQTEQE----LKEKEKELQKLTQ
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pF1KE1 KREDLEK--KQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECE
.. .... .. . .. .:. : : .:::: . .. . .. : .: ....
XP_011 EETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVLDAIIQEKKSGRIP-GIYG-RLGDLGAI
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pF1KE1 PAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDV-----RDT
: . . . : : .::: ... . . ....:. : .::. :.:. : .
XP_011 DEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKRQNI-GVATFIGLDKMAVWAKKMTEI
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pF1KE1 AYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLA--RAFTMDCITLEGD
::.. . . :.. . .. .:: .. ::. ... .:..: . .::.:.
XP_011 QTPENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRDTLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQ
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pF1KE1 QVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRR--NIERINNEIDQL
. . :..::: . :.:. . .. .:::....:..:... .. .:.. . ....
XP_011 IIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKMESQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEER
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pF1KE1 MNQMQQIETQQR----KFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFM---PKQRSLQSLEASL
. .... : ..: :: :: . .. . ..:. . .. : . . : ... . :: ..
XP_011 VVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVKELEANVLATAPDKKKQKLLEENV
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pF1KE1 HAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERI-KLEGIIT
:... ... :: . . .... . :. : ... ::.. . .:... . . ::
XP_011 SAFKTEYDAV-AEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNHKLKA-QQDKLDKINKQLDECASAIT
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pF1KE1 RVETYL---NENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTV-LTATTSELE-AINKRVKDTMARSE
.... . ..::.: :.: . .:...:: . ::: . :: . ::.: : :
XP_011 KAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTAELKSLEDKAAEVVKNTNAAEE
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pF1KE1 DLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMK
.: . . . ..::. .: . ..:. . .:. .... ... .: .. ..
XP_011 SLPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDAL-SIKLKLEQIDGHIAEHNSKIKYWHKEIS
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pF1KE1 KIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQL--FRKLEQCNTE---LKKYSHVNKKALDQFVNFSEQ
:: : . .. .:. ..:: ..: ... .. ... :. : : : .......
XP_011 KIS-LHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLEARCHEMKPNLGAIAEYKKK
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pF1KE1 KEKLIKRQEELDR-GYK--SIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKA
.: ..: :::. :. :. . .. :. .. . .. : ......: .: :. :: :
XP_011 EELYLQRVAELDKITYERDSFRQAYEDLRKQRLNEFMAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDA
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pF1KE1 TLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQ
: . : :.: :. :: : . ...
XP_011 ELEL-----------------------------VDSLDPFSE-GIMFSVRPPKKSWKKIF
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1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE1 QLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITT
.::::.:.: .:::.::... :.:.:..:::: ::: .. . :. .:.: . .::::
XP_011 NLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIII
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1180 1190 1200 1210
pF1KE1 TFRPELLESADKFYGV-KFRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG
..: ...: .:.. :. : : .. . : :.:
XP_011 SLRNNMFEISDRLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIASKGLC
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>>XP_016860980 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural main (952 aa)
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: . ..:... : . :.:.: . .
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pF1KE1 KEEKEQLSAERQ--EQIKQR-TKLELKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQ
:. ...:. . :. :.. :.:.:. .....: . . :.: :. :: ::.:: .
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......:. . .. . ...:. . .. . : .: . : .. ..: ....
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. .. . .. : .: .... : . . . : : .::: ... . . ...
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.:. : .::. :.:. : . ::.. . . :.. . .. .:: .. ::.
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... .:..: . .::.:. . . :..::: . :.:. . .. .:::...
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.. : . . : ... . :: .. :... ... :: . . .... . :. :
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... ::.. . .:... . . ::.... . ..::.: :.: . .:...:: .
XP_016 KLKA-QQDKLDKINKQLDECASAITKAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVD
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pF1KE1 -LTATTSELE-AINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAIN
::: . :: . ::.: : :.: . . . ..::. .: . ..:. . .:.
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pF1KE1 HDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQL--FRKLEQCNT
.... ... .: .. ..:: : . .. .:. ..:: ..: ... .. ..
XP_016 LKLEQIDGHIAEHNSKIKYWHKEISKIS-LHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITN
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pF1KE1 E---LKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDR-GYK--SIMELMNVLELRKYEA
. :. : : : ........: ..: :::. :. :. . .. :. .. .
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pF1KE1 IQLTFKQVSKNFSEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVP
.. : ......: .: :. :: : : . :
XP_016 FMAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDAELEL-----------------------------VD
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pF1KE1 SVDQFTGVGIRVSFTGKQGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQA
:.: :. :: : . ... .::::.:.: .:::.::... :.:.:..:::: :
XP_016 SLDPFSE-GIMFSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAA
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pF1KE1 LDAQHRKAVSDMIMELAVHAQFITTTFRPELLESADKFYGV-KFRNKVSHIDVITAEMAK
:: .. . :. .:.: . .:::: ..: ...: .:.. :. : : .. . : :.:
XP_016 LDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIIISLRNNMFEISDRLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIAS
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1210
pF1KE1 DFVEDDTTHG
XP_016 KGLC
950
>>XP_006713522 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural main (1210 aa)
initn: 468 init1: 221 opt: 446 Z-score: 187.7 bits: 46.8 E(85289): 0.001
Smith-Waterman score: 775; 22.6% identity (56.5% similar) in 1261 aa overlap (1-1206:82-1205)
10 20 30
pF1KE1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVI
..: ... :.:.:: . :. :: .. . :
XP_006 ELDNRSLEEILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCI
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80
pF1KE1 VGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALLHEGTGPRVISA------FVEIIFDN
.: ::::::: . .. ::.. . ...: .. .:.:.. . :.. : .:: .
XP_006 IGPNGSGKSNVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE1 SDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQ---YFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQ
.:. : . . . :. : .:. : .. : : .:: :::.: :.. .. ... :
XP_006 GDDYEVIPNSNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQ
180 190 200 210 220
150 160 170 180 190
pF1KE1 GKINQMA-------TAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKE---ESISLMKETEGKREKINE
:...:.: : : :. :... : .: . . . ...: .: ::.:.
XP_006 GEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRG--EKLNR
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 LLKYIEERLHTLEEEKEELAQY-----QKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKR
. :..:.. .:: ::. .. . . : .. .: :: : . .. :. ...
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290 300 310 320 330 340
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pF1KE1 ETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLE
: : .... . .. ..:. ...:.. . :.. . . : : .:.. :.:.
XP_006 EKIHEDTKEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIE----ENKEKF---TQLD
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pF1KE1 LKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLA
:. .....: . . :.: :. :: ::.:: :.:. : . :
XP_006 LEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEE-----------FKSIPAKSNNII----
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pF1KE1 QATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEAN
. : :.. :. ::...: .:. . :: :.. ...: : .
XP_006 NETTTRNNALEKE--------KEKEEKKLKEVMDSL-------KQETQGLQK-----EKE
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pF1KE1 KEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAK
:::.:. :: :. .. :. :..: .: :.:. .:: .
XP_006 KEKELQ---KLTQEETNFKSLVHDLFQKVEEAKS---------------------SLAMN
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pF1KE1 REDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAF
: . ::. .:.: . : :: .. : : . .... :.
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520 530 540 550
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.: .. : : .::: ... . . ....:. : .::. :.:. : . :
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560 570 580 590 600
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pF1KE1 ETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLA--RAFTMDCITLEGDQVS
:.. . . :.. . .. .:: .. ::. ... .:..: . .::.:. .
XP_006 ENTPRLFDLVKVK-DEKIRQAFYFALRDTLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQIIE
610 620 630 640 650 660
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pF1KE1 HRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRR--NIERINNEIDQLMNQ
. :..::: . :.:. . .. .:::....:..:... .. .:.. . .... . .
XP_006 QSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKMESQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEERVVK
670 680 690 700 710 720
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pF1KE1 MQQIETQQR----KFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFM---PKQRSLQSLEASLHAM
... : ..: :: :: . .. . ..:. . .. : . . : ... . :: .. :.
XP_006 LRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVKELEANVLATAPDKKKQKLLEENVSAF
730 740 750 760 770 780
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pF1KE1 ESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERI-KLEGIITRVE
.. ... :: . . .... . :. : ... ::.. . .:... . . ::...
XP_006 KTEYDAV-AEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNHKLKA-QQDKLDKINKQLDECASAITKAQ
790 800 810 820 830 840
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pF1KE1 TYL---NENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTV-LTATTSELE-AINKRVKDTMARSEDLD
. . ..::.: :.: . .:...:: . ::: . :: . ::.: : :.:
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