Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1050
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1050, 476 aa
1>>>pF1KE1050 476 - 476 aa - 476 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3166+/-0.000975; mu= -6.5396+/- 0.059
mean_var=408.3491+/-86.220, 0's: 0 Z-trim(117.9): 81 B-trim: 646 in 2/53
Lambda= 0.063469
statistics sampled from 18643 (18735) to 18643 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.838), E-opt: 0.2 (0.576), width: 16
Scan time: 3.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5708.1 TRIP6 gene_id:7205|Hs108|chr7 ( 476) 3499 334.0 2.1e-91
CCDS3291.1 LPP gene_id:4026|Hs108|chr3 ( 612) 1296 132.4 1.3e-30
CCDS5883.1 ZYX gene_id:7791|Hs108|chr7 ( 572) 1011 106.3 9e-23
CCDS9581.1 AJUBA gene_id:84962|Hs108|chr14 ( 538) 812 88.0 2.6e-17
CCDS59375.1 WTIP gene_id:126374|Hs108|chr19 ( 430) 797 86.6 5.8e-17
CCDS2729.1 LIMD1 gene_id:8994|Hs108|chr3 ( 676) 776 84.8 3.1e-16
CCDS163.1 FBLIM1 gene_id:54751|Hs108|chr1 ( 373) 719 79.4 7.4e-15
CCDS30609.1 FBLIM1 gene_id:54751|Hs108|chr1 ( 276) 666 74.4 1.7e-13
>>CCDS5708.1 TRIP6 gene_id:7205|Hs108|chr7 (476 aa)
initn: 3499 init1: 3499 opt: 3499 Z-score: 1754.5 bits: 334.0 E(32554): 2.1e-91
Smith-Waterman score: 3499; 100.0% identity (100.0% similar) in 476 aa overlap (1-476:1-476)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSGPTWLPPKQPEPARAPQGRAIPRGTPGPPPAHGAALQPHPRVNFCPLPSEQCYQAPGG
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CCDS57 MSGPTWLPPKQPEPARAPQGRAIPRGTPGPPPAHGAALQPHPRVNFCPLPSEQCYQAPGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PEDRGPAWVGSHGVLQHTQGLPADRGGLRPGSLDAEIDLLSSTLAELNGGRGHASRRPDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PEDRGPAWVGSHGVLQHTQGLPADRGGLRPGSLDAEIDLLSSTLAELNGGRGHASRRPDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QAYEPPPPPAYRTGSLKPNPASPLPASPYGGPTPASYTTASTPAGPAFPVQVKVAQPVRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QAYEPPPPPAYRTGSLKPNPASPLPASPYGGPTPASYTTASTPAGPAFPVQVKVAQPVRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 CGPPRRGASQASGPLPGPHFPLPGRGEVWGPGYRSQREPGPGAKEEAAGVSGPAGRGRGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CGPPRRGASQASGPLPGPHFPLPGRGEVWGPGYRSQREPGPGAKEEAAGVSGPAGRGRGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 EHGPQVPLSQPPEDELDRLTKKLVHDMNHPPSGEYFGQCGGCGEDVVGDGAGVVALDRVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EHGPQVPLSQPPEDELDRLTKKLVHDMNHPPSGEYFGQCGGCGEDVVGDGAGVVALDRVF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 HVGCFVCSTCRAQLRGQHFYAVERRAYCEGCYVATLEKCATCSQPILDRILRAMGKAYHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 HVGCFVCSTCRAQLRGQHFYAVERRAYCEGCYVATLEKCATCSQPILDRILRAMGKAYHP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GCFTCVVCHRGLDGIPFTVDATSQIHCIEDFHRKFAPRCSVCGGAIMPEPGQEETVRIVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GCFTCVVCHRGLDGIPFTVDATSQIHCIEDFHRKFAPRCSVCGGAIMPEPGQEETVRIVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE1 LDRSFHIGCYKCEECGLLLSSEGECQGCYPLDGHILCKACSAWRIQELSATVTTDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LDRSFHIGCYKCEECGLLLSSEGECQGCYPLDGHILCKACSAWRIQELSATVTTDC
430 440 450 460 470
>>CCDS3291.1 LPP gene_id:4026|Hs108|chr3 (612 aa)
initn: 1268 init1: 1032 opt: 1296 Z-score: 663.0 bits: 132.4 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 1361; 47.9% identity (62.9% similar) in 501 aa overlap (89-475:113-611)
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GGPEDRGPAWVGSHGVLQHTQGLPADRGGLRPGSLDAEIDLLSSTLAELNGGRGHASRRP
: .::::::: :.: ::.:. . . : :
CCDS32 SISGNFPPPPPLDEEAFKVQGNPGGKTLEERRSSLDAEIDSLTSILADLECSSPYKPRPP
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150
pF1KE1 DRQ--AYEPPP----------------PP--AYRTGSLKPNPA---SPLPASPYGG----
. . . :: :: : . ..:::.:: .:.:..: :
CCDS32 QSSTGSTASPPVSTPVTGHKRMVIPNQPPLTATKKSTLKPQPAPQAGPIPVAPIGTLKPQ
150 160 170 180 190 200
160 170 180
pF1KE1 --PTPASYTTASTPAGPAFPVQVKVAQP---------------------------VRG-C
:.::::::::: . :.: :::: ::: : : :
CCDS32 PQPVPASYTTASTSSRPTFNVQVKSAQPSPHYMAAPSSGQIYGSGPQGYNTQPVPVSGQC
210 220 230 240 250 260
190 200 210
pF1KE1 GPP--RRGASQASGPLPGPHFPLPGRGEV------------WGPGY--RS----------
:: : : . : : :: . : :: : . :::: :.
CCDS32 PPPSTRGGMDYAYIPPPGLQ-PEPGYGYAPNQGRYYEGYYAAGPGYGGRNDSDPTYGQQG
270 280 290 300 310 320
220 230 240
pF1KE1 -----QREPG---PGA-KEEAAG---VSGPAGR------------------GRGGEHGPQ
.:::: ::: ... : :.:: :..:. ::.
CCDS32 HPNTWKREPGYTPPGAGNQNPPGMYPVTGPKKTYITDPVSAPCAPPLQPKGGHSGQLGPS
330 340 350 360 370 380
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 -VPLSQPPEDELDRLTKKLVHDMNHPPSGEYFGQCGGCGEDVVGDGAGVVALDRVFHVGC
: : :::::..::::...::..::. ::::.:. :::.:::.:.: .:.:.:::: :
CCDS32 SVAPSFRPEDELEHLTKKMLYDMENPPADEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDC
390 400 410 420 430 440
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVCSTCRAQLRGQHFYAVERRAYCEGCYVATLEKCATCSQPILDRILRAMGKAYHPGCFT
:.: : .:::: :::::..:::: ::. :::.: .::.::..::::: :::::: :::
CCDS32 FTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCSKPIMERILRATGKAYHPHCFT
450 460 470 480 490 500
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 CVVCHRGLDGIPFTVDATSQIHCIEDFHRKFAPRCSVCGGAIMPEPGQEETVRIVALDRS
::.:::.:::::::::: . ::::::::.::::::::: ::: ::::::::::::::.
CCDS32 CVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIHCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRD
510 520 530 540 550 560
430 440 450 460 470
pF1KE1 FHIGCYKCEECGLLLSSEGECQGCYPLDGHILCKACSAWRIQELSATVTTDC
::. ::.::.:: ::: ::. :::::::::::::.:.. ::. :.: ..::
CCDS32 FHVHCYRCEDCGGLLS-EGDNQGCYPLDGHILCKTCNSARIRVLTAKASTDL
570 580 590 600 610
>>CCDS5883.1 ZYX gene_id:7791|Hs108|chr7 (572 aa)
initn: 1056 init1: 860 opt: 1011 Z-score: 522.3 bits: 106.3 E(32554): 9e-23
Smith-Waterman score: 1035; 36.9% identity (56.6% similar) in 518 aa overlap (12-466:74-571)
10 20 30
pF1KE1 MSGPTWLPPKQPEPARAPQGR----AIPRGTPGPPPAHGAA
: : : .: :. . : ::: .
CCDS58 SEPPPAPGAQRAQMGRVGEIPPPPPEDFPLPPPPLAGDGDDAEGALGGAFPPPPPPIEES
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 LQPHPRVNFCPLPSEQCYQAPGGPEDRGPAWVGSHGVLQHTQGLPADRGGLRPGSLDAEI
. : :: : . : ::..: : .. . : . . .:.: ::
CCDS58 FPP------APLEEEIFPSPPPPPEEEG----GPEAPIP-----PPPQPREKVSSIDLEI
110 120 130 140
100 110 120 130 140
pF1KE1 DLLSSTLAELNGGRGHASRRPDRQAYEPPP------------PPAYRTGSLKP--NPAS-
: ::: : ... . .: ..: ::: : : :. : : .:.:
CCDS58 DSLSSLLDDMTKNDPFKARVS--SGYVPPPVATPFSSKSSTKPAAGGTAPLPPWKSPSSS
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190
pF1KE1 -PLPASPYGGPTPASYTTASTPAGPAFPVQVKV---AQPVRGCGPPRRGASQASGPLPGP
::: : . . ... . : : ::..: .::: . :: ::.: :.:
CCDS58 QPLPQVPAPAQSQTQFHVQPQPQ-PKPQVQLHVQSQTQPVSLANTQPRGPP-ASSPAPAP
210 220 230 240 250 260
200 210 220
pF1KE1 HF--------PLPGRGEVWGPG-----------------------------YRSQREPGP
.: :. .. .:: : .::: :
CCDS58 KFSPVTPKFTPVASKFSPGAPGGSGSQPNQKLGHPEALSAGTGSPQPPSFTYAQQREK-P
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270
pF1KE1 GAKEEAAGVSGPA-GRGRGGEHGPQVPLSQPPEDELDRLTKKLVHDMNHPPSGEYFGQ--
..:. : :: .... : ::. .::..::..:..::.:: . .
CCDS58 RVQEKQHPVPPPAQNQNQVRSPGAPGPLTLKEVEELEQLTQQLMQDMEHPQRQNVAVNEL
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 CGGCGEDVVGDGAGVVALDRVFHVGCFVCSTCRAQLRGQHFYAVERRAYCEGCYVATLEK
:: : . .. .: :: ..::..::.: : ::.::.::..: ::::::. ::::
CCDS58 CGRCHQPLARAQPAVRALGQLFHIACFTCHQCAQQLQGQQFYSLEGAPYCEGCYTDTLEK
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 CATCSQPILDRILRAMGKAYHPGCFTCVVCHRGLDGIPFTVDATSQIHCIEDFHRKFAPR
: ::..:: ::.::: :::::: ::::::: : :.: : :: ... ::. :.:...:::
CCDS58 CNTCGEPITDRMLRATGKAYHPHCFTCVVCARPLEGTSFIVDQANRPHCVPDYHKQYAPR
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 CSVCGGAIMPEPGQEETVRIVALDRSFHIGCYKCEECGLLLSSEGECQGCYPLDGHILCK
::::. ::::::..::::.::::..::. :::::.:: :: :.. .::.:::::.::.
CCDS58 CSVCSEPIMPEPGRDETVRVVALDKNFHMKCYKCEDCGKPLSIEADDNGCFPLDGHVLCR
510 520 530 540 550 560
460 470
pF1KE1 ACSAWRIQELSATVTTDC
: . : :
CCDS58 KCHTARAQT
570
>>CCDS9581.1 AJUBA gene_id:84962|Hs108|chr14 (538 aa)
initn: 830 init1: 496 opt: 812 Z-score: 424.2 bits: 88.0 E(32554): 2.6e-17
Smith-Waterman score: 839; 34.9% identity (56.8% similar) in 502 aa overlap (3-465:51-528)
10 20
pF1KE1 MSGPTWLPPKQP-EPARAPQG----RAIPRGT
: : : .: :::: :: . ::.
CCDS95 ESSRSGSDGTPGPGKGRLSGLGGPRKSGPRGATGGPGDEPLEPARE-QGSLDAERNQRGS
30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 PGPPPAHGAALQPHPRVNFCPLPSEQCYQAPGGPEDRGPAWVGSHGVLQHTQGLPADRGG
: .:. : . ::: : : .:: .. .. . ... :.. .
CCDS95 FEAPRYEGSFPAGPPPTRALPLP--QSLPPDFRLEPTAPA-LSPRSSFASSSASDASKPS
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 LRPGSLDAEIDLLSSTLAELNGGRGHASRRPD--RQAYEPPPPPAYRTGSLKPNPASP-L
::: ::... : :: : : . ..:. : :: : ::.: :
CCDS95 SPRGSL-----LLDGAGAGGAGGSRPCSNRTSGISMGYDQ------RHGS--PLPAGPCL
140 150 160 170 180
150 160 170 180 190
pF1KE1 PASPYGGPTPASYTTASTP-AGPAFPVQVK--VAQPVRGCG--------PPRRGASQA-S
. : .: .::.:. ...: : : . . . :: : : :: :. : .
CCDS95 FGPPLAG-APAGYSPGGVPSAYPELHAALDRLYAQRPAGFGCQESRHSYPPALGSPGALA
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240
pF1KE1 GPLPGPHFPLPGRGEVWGPGYRSQREPGP---GAK--EEAAGV----SGPAGRGRG--GE
: : :: :: :: .: : ::. .: ... : .:: : ::
CCDS95 GAGVGAAGPLERRGA--QPGRHSVTGYGDCAVGARYQDELTALLRLTVGTGGREAGARGE
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290
pF1KE1 HGPQVP--LSQPPEDELDRLTKKLVHDMNHPPSGE-YFGQCGGCGEDVVGDGAGVVALDR
. : : .:: . . .. : .: . : ::: : :.. . :.. . :::
CCDS95 PSGIEPSGLEEPPGPFVPEAARA---RMREPEAREDYFGTCIKCNKGIYGQSNACQALDS
310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 VFHVGCFVCSTCRAQLRGQHFYAVERRAYCEGCYVAT-----LEKCATCSQPILDRILRA
..:. :::: .: :: . ::.:. .::: :. . ::: .:.. ::..::.:
CCDS95 LYHTQCFVCCSCGRTLRCKAFYSVNGSVYCEEDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLILEKILQA
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 MGKAYHPGCFTCVVCHRGLDGIPFTVDATSQIHCIEDFHRKFAPRCSVCGGAIMPEPGQE
:::.:::::: :.::.. ::::::::: ..:..:. :.:...::.:..:: :.: : :
CCDS95 MGKSYHPGCFRCIVCNKCLDGIPFTVDFSNQVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEGCE
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ETVRIVALDRSFHIGCYKCEECGLLLSSEGECQGCYPLDGHILCKACSAWRIQELSATVT
. ::....::..:. ::.::.: . ::.: : :.:::::.::..: :.
CCDS95 DIVRVISMDRDYHFECYHCEDCRMQLSDEEGCC-CFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQPPAN
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 TDC
CCDS95 YI
>>CCDS59375.1 WTIP gene_id:126374|Hs108|chr19 (430 aa)
initn: 865 init1: 475 opt: 797 Z-score: 418.0 bits: 86.6 E(32554): 5.8e-17
Smith-Waterman score: 812; 35.9% identity (57.8% similar) in 412 aa overlap (80-466:28-416)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 PSEQCYQAPGGPEDRGPAWVGSHGVLQHTQGLPA-DRGGLRPGSLDAEIDLLSSTLAELN
: :. : : ::: : :
CCDS59 MQRSRAGADEAALLLAGLALRELEPGCGSPGRGRRGPRPGPGDEAAPAL--------
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 GGRGHASRRPDRQAYEPPPPPAYRTGSLKPNPAS-P-LPASPYGGPTPA-SYTTASTPAG
: ::..: :. : . : : :. : : :.: :.: . . . .. .:
CCDS59 GRRGKGSGGPEAGA------DGLSRGERGPRRAAVPELSAQPAGSPRASLAGSDGGGGGG
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210
pF1KE1 PAFPVQVKVAQPVRGCGPPRRGASQASGPLPGPHFPLPG--RGEVWGPGYRSQREP----
: .... : : :: : :. : ::: : : :. : . : :..
CCDS59 SARSSGISLGYDQRH-GSPRSGRSD---PRPGPGPPSVGSARSSVSSLGSRGSAGAYADF
110 120 130 140 150
220 230 240 250 260
pF1KE1 -GPGAKEEAAGVSGPAGRGRGGEHGPQVPLSQPP---------EDELDRLTKKLVHDMNH
::: : ::: . : .:: :: : .:. ::..: . ..
CCDS59 LPPGACPAPARSPEPAGP--APFPLPALPL--PPGREGGPSAAERRLEALTRELERALEA
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 PPSGEYFGQCGGCGEDVVGDGAGVVALDRVFHVGCFVCSTCRAQLRGQHFYAVERRAYCE
. .::: : :: . : . :. ..:. ::.:..: .:::. :: : ...::.
CCDS59 RTARDYFGICIKCGLGIYGAQQACQAMGSLYHTDCFTCDSCGRRLRGKAFYNVGEKVYCQ
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 GCYV-----ATLEKCATCSQPILDRILRAMGKAYHPGCFTCVVCHRGLDGIPFTVDATSQ
.. : .::..:.. :.. ::.:.::.:::::: : ::.. :::.:::::. ..
CCDS59 EDFLYSGFQQTADKCSVCGHLIMEMILQALGKSYHPGCFRCSVCNECLDGVPFTVDVENN
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 IHCIEDFHRKFAPRCSVCGGAIMPEPGQEETVRIVALDRSFHIGCYKCEECGLLLSSEGE
:.:..:.: :::.:. :. :.: : : :.:.:..::..:..::.::.::: ::.: :
CCDS59 IYCVRDYHTVFAPKCASCARPILPAQGCETTIRVVSMDRDYHVACYHCEDCGLQLSGE-E
340 350 360 370 380 390
450 460 470
pF1KE1 CQGCYPLDGHILCKACSAWRIQELSATVTTDC
. :::: ::.::. : :.:
CCDS59 GRRCYPLAGHLLCRRCHLRRLQPGPLPSPTVHVTEL
400 410 420 430
>>CCDS2729.1 LIMD1 gene_id:8994|Hs108|chr3 (676 aa)
initn: 787 init1: 450 opt: 776 Z-score: 405.1 bits: 84.8 E(32554): 3.1e-16
Smith-Waterman score: 806; 30.7% identity (56.4% similar) in 512 aa overlap (1-467:185-664)
10 20
pF1KE1 MSGPTWLPPKQPEPARAPQ-GRAIPRGTPG
...: : .:. .:. : .. : :.
CCDS27 ATSEMSAFHQPGPCEDPSCLTHGDYYDNLSLASPKW----GDKPGVSPSIGLSVGSGWPS
160 170 180 190 200 210
30 40 50 60 70
pF1KE1 PPPAHGAALQP---HPRVNFCPLPSEQCYQAPG--GPEDRG--------PAWVGSHGVLQ
: . .: :: .: : . .. : : .. : :. . : . :
CCDS27 SPGSDPPLPKPCGDHP-LNHRQLSLSSSRSSEGSLGGQNSGIGGRSSEKPTGLWSTASSQ
220 230 240 250 260
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 H-TQGLPA---DRGGLRPGSLDAEIDLLSSTLAELNGGRGHASRRPDRQAYEPPPPPAYR
. . :::. . :. : .. . .:. :: .: : . . :
CCDS27 RVSPGLPSPNLENGAPAVGPVQPRTPSVSAPLALSCPRQGGLPRSNSGLGGEV-------
270 280 290 300 310 320
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 TGSL-KPNPASPLPASPYGGPTPASYTTASTPAGPAFPVQVKVAQPVRGCGPPRRGASQA
.: . ::: ..: : : : :: ..:.:. ..:. : ..:: .
CCDS27 SGVMSKPN-VDPQPWFQDG---PKSYLSSSAPS----------SSPA-GLDGSQQGAVPG
330 340 350 360
200 210 220 230 240
pF1KE1 SGPLPGPHFPLPGRGEVWGPGYRSQREPGPGAKEEAAGVSGPAGRGRGGEHG--------
:: :: : : .: : .: .. : . :: : . : :
CCDS27 LGPKPG--CTDLGTGPKLSP--TSLVHPVMSTLPELSCKEGPLGWSSDGSLGSVLLDSPS
370 380 390 400 410 420
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