Result of FASTA (omim) for pF1KE1056
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1056, 1270 aa
  1>>>pF1KE1056 1270 - 1270 aa - 1270 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1019+/-0.000477; mu= 16.0299+/- 0.030
 mean_var=192.0101+/-39.275, 0's: 0 Z-trim(115.6): 266  B-trim: 661 in 1/53
 Lambda= 0.092558
 statistics sampled from 25846 (26141) to 25846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.306), width:  16
 Scan time: 13.460

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001348 (OMIM: 603115) ATP-dependent RNA helicas (1270) 8558 1157.0       0
NP_001107869 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA heli ( 994) 1542 220.0 6.3e-56
NP_065916 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA helicas (1008) 1072 157.3 4.9e-37
XP_016865224 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT ( 971)  892 133.2 8.3e-30
NP_001332905 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent (1130)  892 133.3 9.2e-30
XP_016865222 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1139)  892 133.3 9.2e-30
XP_011541888 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1162)  892 133.3 9.3e-30
NP_001332904 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent (1268)  892 133.4 9.9e-30
XP_016865220 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1277)  892 133.4 9.9e-30
XP_011541884 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1406)  892 133.4 1.1e-29
NP_073739 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent RN (1430)  892 133.4 1.1e-29
XP_016865219 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1430)  892 133.4 1.1e-29
XP_011541883 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1439)  892 133.4 1.1e-29
NP_001332894 (OMIM: 612720) ATP-dependent RNA heli ( 733)  772 117.1 4.6e-25
NP_001332893 (OMIM: 612720) ATP-dependent RNA heli (1318)  772 117.3 6.8e-25
NP_061903 (OMIM: 612720) ATP-dependent RNA helicas (1369)  772 117.4 6.9e-25
XP_016861406 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1155)  732 111.9 2.5e-23
NP_055781 (OMIM: 616423) putative ATP-dependent RN (1155)  732 111.9 2.5e-23
XP_016861405 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1157)  732 111.9 2.5e-23
XP_006713096 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1162)  732 111.9 2.5e-23
XP_016861404 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1162)  732 111.9 2.5e-23
XP_011531800 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1166)  732 111.9 2.5e-23
XP_011531799 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1166)  732 111.9 2.5e-23
XP_011531798 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1166)  732 111.9 2.5e-23
NP_001317919 (OMIM: 616423) putative ATP-dependent (1166)  732 111.9 2.5e-23
XP_011531796 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1194)  732 112.0 2.6e-23
XP_011531797 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1194)  732 112.0 2.6e-23
NP_619520 (OMIM: 616423) putative ATP-dependent RN (1194)  732 112.0 2.6e-23
XP_011531795 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1228)  732 112.0 2.6e-23
XP_016861403 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1238)  732 112.0 2.6e-23
XP_011531793 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1265)  732 112.0 2.7e-23
XP_011531792 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1265)  732 112.0 2.7e-23
XP_011531794 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1265)  732 112.0 2.7e-23
XP_005259500 (OMIM: 615475) PREDICTED: probable AT (1143)  629 98.2 3.4e-19
NP_055496 (OMIM: 615475) probable ATP-dependent RN (1143)  629 98.2 3.4e-19
XP_011525852 (OMIM: 615475) PREDICTED: probable AT (1143)  629 98.2 3.4e-19
XP_011525853 (OMIM: 615475) PREDICTED: probable AT (1143)  629 98.2 3.4e-19
XP_016879402 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1192)  568 90.1   1e-16
XP_005256326 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1192)  568 90.1   1e-16
XP_011521786 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1227)  568 90.1   1e-16
XP_011521787 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1227)  568 90.1   1e-16
NP_054722 (OMIM: 605584) pre-mRNA-splicing factor  (1227)  568 90.1   1e-16
NP_001309145 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli ( 945)  530 84.9 2.9e-15
NP_001309146 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1129)  530 85.0 3.3e-15
NP_001309149 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1152)  530 85.0 3.3e-15
NP_001309148 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1169)  530 85.0 3.3e-15
NP_001309147 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1179)  530 85.0 3.4e-15
NP_001289552 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1181)  530 85.0 3.4e-15
NP_001309150 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1218)  530 85.0 3.4e-15
NP_004932 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA helicas (1220)  530 85.0 3.4e-15


>>NP_001348 (OMIM: 603115) ATP-dependent RNA helicase A   (1270 aa)
 initn: 8558 init1: 8558 opt: 8558  Z-score: 6187.1  bits: 1157.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8558; 100.0% identity (100.0% similar) in 1270 aa overlap (1-1270:1-1270)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGDVKNFLYAWCGKRKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVQVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGDVKNFLYAWCGKRKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVQVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 AARDFVNYLVRINEIKSEEVPAFGVASPPPLTDTPDTTANAEGDLPTTMGGPLPPHLALK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AARDFVNYLVRINEIKSEEVPAFGVASPPPLTDTPDTTANAEGDLPTTMGGPLPPHLALK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 AENNSEVGASGYGVPGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEVQATLESEEVDLNAGLHGNWTLEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AENNSEVGASGYGVPGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEVQATLESEEVDLNAGLHGNWTLEN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 AKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 SCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEPYKVNLSQDLEHQLQNIIQELNLEILPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEPYKVNLSQDLEHQLQNIIQELNLEILPP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 PEDPSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEDPSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 SMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 VPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVRFESILP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVRFESILP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 RPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 LMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 GEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGW
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 NLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 TINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE1 RFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE1 ALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINEGKRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINEGKRL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE1 GYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE1 KEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE1 LIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQSDGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQSDGQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE1 IVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE1 PSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYG
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE1 GSANSFRAGYGAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSANSFRAGYGAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGY
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270
pF1KE1 FGQGRGGGGY
       ::::::::::
NP_001 FGQGRGGGGY
             1270

>>NP_001107869 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA helicase  (994 aa)
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pF1KE1 D-HDLQAI-LQE-RELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQ
         .::. : .:. :: ::   ...:... :....:..: : ::::::::: :::::..:.
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         ... : :: ::::::::.::::::: ::.:    :.: ::..:..: ::: ..::..:
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       :.:..:. :..   . ..::...::::::....: :..:..:...   .....:::::..
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       .  : ::: :::.:.. : :.:: ::.::: :.  ..::  :..... :        . .
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pF1KE1 VLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILS
       .:::::::. : :..  :  .  : :               .: .::  .: :: :....
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       ::::::::::.:::::::. : :   : ..::...... :.::.: .:::::::::.:: 
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       :.:: .  :   :. .. ::..::::.:. :.::.::::::. ::.. ..::  .::. .
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pF1KE1 EHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEP
        . : ::.::: ..::::::  ::.::.::..:::...: .:   : . ::::.  : .:
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       :.   :: ...  .:. .: .  :::......:..:..::  : . :  .: .  :.  :
NP_001 FVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNT
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pF1KE1 LRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHK--
       :.:  . : :. : :...::  .    .  .: . ::.  .. ...  :.::.:   .  
NP_001 LQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNE-KIIKAVICAGLYPKVAKIRLN
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pF1KE1 --EKRKILT----TEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTL
         .:::..     :.:  : .: .:::    . :..:   ....  :.:: .:     : 
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pF1KE1 VTPLQLLLFASK-KVQSDG--QIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQP
       :.:  ::.:..  ..:.:.  . . ::.:: .:   . :  .  ::  .. :. :  ..:
NP_001 VSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESP
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pF1KE1 AIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGS
         ..  :                                                     
NP_001 HPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS                
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>>NP_065916 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA helicase DH  (1008 aa)
 initn: 1409 init1: 837 opt: 1072  Z-score: 785.8  bits: 157.3 E(85289): 4.9e-37
Smith-Waterman score: 1736; 37.9% identity (68.3% similar) in 817 aa overlap (345-1125:161-971)

          320       330       340       350       360       370    
pF1KE1 LAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQISMDLKNELMYQLEQ
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pF1KE1 D-HDLQAI-LQE-RELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQ
         .::. : .:. :: ::   ...:... :....:..: : ::::::::: :::::..:.
NP_065 KKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIE
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pF1KE1 NDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEE--PGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFC
         ... : :: ::::::::.::::::: ::.:    :.: ::..:..: ::: ..::..:
NP_065 RGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYC
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pF1KE1 TVGVLLRKLEAG--IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATID
       :.:..:. :..   . ..::...::::::....: :..:..:...   .....:::::..
NP_065 TTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLN
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pF1KE1 TSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDK--------DDD
       .  : ::: :::.:.. : :.:: ::.::: :.  ..::  :..... :        . .
NP_065 AEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQ
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pF1KE1 GGEDDDANCNLICGD-------EYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGA
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NP_065 EKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGA
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pF1KE1 VLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILS
       .:::::::. : :..  :  .  : : .. :.:::: .:  .: .::  .: :: :....
NP_065 ILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIA
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pF1KE1 TNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGF
       ::::::::::.:::::::. : :   : ..::...... :.::.: .:::::::::.:: 
NP_065 TNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGH
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pF1KE1 CFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEA
       :.:: .  :   :. .. ::..::::.:. :.::.::::::. ::.. ..::  .::. .
NP_065 CYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLS
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pF1KE1 EHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEP
        . : ::.::: ..::::::  ::.::.::..:::...: .:   : . ::::.  : .:
NP_065 IRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP
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pF1KE1 FINE-GK-RLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMAT
       :.   :: ...  .:. .: .  :::......:..:..::  : . :  .: .  :.  :
NP_065 FVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNT
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pF1KE1 LRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHK--
       :.:  . : :. : :...::  .    .  .: . ::.  .. ...  :.::.:   .  
NP_065 LQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNE-KIIKAVICAGLYPKVAKIRLN
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        1010          1020      1030      1040      1050      1060 
pF1KE1 --EKRKILT----TEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTL
         .:::..     :.:  : .: .:::    . :..:   ....  :.:: .:     : 
NP_065 LGKKRKMVKVYTKTDGLVA-VHPKSVNVE--QTDFHYN--WLIYHLKMRTSSIYLYDCTE
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pF1KE1 VTPLQLLLFASK-KVQSDG--QIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQP
       :.:  ::.:..  ..:.:.  . . ::.:: .:   . :  .  ::  .. :. :  ..:
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pF1KE1 AIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGS
         ..  :                                                     
NP_065 HPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS                
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>>XP_016865224 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable ATP-de  (971 aa)
 initn: 889 init1: 468 opt: 892  Z-score: 656.1  bits: 133.2 E(85289): 8.3e-30
Smith-Waterman score: 950; 33.3% identity (59.8% similar) in 639 aa overlap (601-1181:101-733)

              580       590       600       610       620          
pF1KE1 QEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDGGEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMS----Q
                                     :. :...     :.. . : :  ..    .
XP_016 NGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSLVQTNGSDLSAEDRELLKAYHHS
               80        90       100       110       120       130

        630       640       650       660       670          680   
pF1KE1 LNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPH-FG--SHRYQI
       ...... ..::  ::  :      ::::.::::.. :  .. .. .. . :.  .::::.
XP_016 FDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIVGLRDRILFDDKRFADSTHRYQV
              140       150       160       170       180       190

           690       700       710       720       730       740   
pF1KE1 LPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHN
       . :::..   .:.::.   :.:: :.::::::::::::.::::.:::: : : : : : :
XP_016 FMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSITVNDVVFVIDSGKVKEKSFDALN
              200       210       220       230       240       250

           750       760       770       780       790       800   
pF1KE1 NMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIAL
        .:    :: ::..  :::::::: :::.::.: :: ::. .   .:::..: ::.:. :
XP_016 FVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLRFQNMLEFQTPELLRMPLQELCL
              260       270       280       290       300       310

           810         820       830       840       850       860 
pF1KE1 SIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIE
         :::   .  :..:: :: ::::   : .: . :. .::.:. ..:: ::  :: ::.:
XP_016 HTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTIDAMDTWEDLTELGYHLADLPVE
              320       330       340       350       360       370

             870       880       890           900        910      
pF1KE1 PRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----NEGKRLGYIHRN-FAGNRFSDHV
       :..:::.. . ..   : : ::: .  . .::.       :: ... :. :... ::::.
XP_016 PHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQASQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHM
              380       390       400       410       420       430

        920       930       940       950       960       970      
pF1KE1 ALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLT
       ::: .::::. ::  : :    :::.. :..::...    ..::   :  ::: .     
XP_016 ALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIIIGMRTQLLGQLRASGFVRARGGG
              440       450         460       470       480        

        980       990      1000      1010       1020               
pF1KE1 QVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT-TEGRNALIHKSSVNC------
       ..   .  ..:  :: . :. :.:::. .  ..  .::  . ... .: .::        
XP_016 DIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLTGPKEKKVRFHPASVLSQPQYKK
      490       500       510       520       530       540        

      1030         1040      1050       1060      1070             
pF1KE1 --PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTLVTPLQLLLF------ASKKVQ-
         : ..:       :. .... :  :. :  . .  . :::. .:.:      ::. .: 
XP_016 IPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTPVTILVFCGPARLASNALQE
      550       560       570       580       590       600        

                    1080                1090      1100      1110   
pF1KE1 -------------SDGQI----------VLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVE
                    ::...          . .:.:... .  :::. .  ::   ..: ..
XP_016 PSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFTLEPEAASLLLQLRQKWHSLFLR
      610       620       630       640       650       660        

          1120       1130      1140      1150      1160      1170  
pF1KE1 VTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSG
         . :.   ::.: .. : .  . . .. ..::..   :    :. ::: .  .   .:.
XP_016 RMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLS-TEEQSAGLQQPSG---IGQRPRPMSSEELPLASS
      670       680       690        700          710       720    

           1180      1190      1200      1210      1220      1230  
pF1KE1 YRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGYGAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGG
       .: ..:  :                                                   
XP_016 WRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQKYKDRGILHPKRGTEDRSDQSS
          730       740       750       760       770       780    

>>NP_001332905 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent RNA  (1130 aa)
 initn: 1180 init1: 468 opt: 892  Z-score: 655.4  bits: 133.3 E(85289): 9.2e-30
Smith-Waterman score: 961; 29.4% identity (51.1% similar) in 898 aa overlap (505-1181:10-901)

          480       490       500       510       520       530    
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAY
                                     ..::::::.::::  .::::. :::..: .
NP_001                      MAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLLQKH
                                    10        20        30         

          540       550       560       570       580       590    
pF1KE1 PEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKK
       : ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : ..     : ::
NP_001 PTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLKYKK
      40        50        60        70        80        90         

                                                  600              
pF1KE1 DKD----------------------------------------DDGGE-------DDDAN
       .:.                                        ::::.       . :.:
NP_001 EKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEKDVN
     100       110       120       130       140       150         

                                    610                            
pF1KE1 C-----------------------------NLICGD------------------------
       :                             .::  .                        
NP_001 CLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAGRGF
     160       170       180       190       200       210         

                                                         620       
pF1KE1 -----------------------------------------------EYGPETRLSMSQL
                                                      :.:   . :. : 
NP_001 ASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSLVQT
     220       230       240       250       260       270         

                           630       640       650       660       
pF1KE1 N--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQ
       :                    .... ..::  ::  :      ::::.::::.. :  ..
NP_001 NGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIVGLR
     280       290       300       310       320       330         

       670          680       690       700       710       720    
pF1KE1 KHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSITIND
        .. .. . :.  .::::.. :::..   .:.::.   :.:: :.::::::::::::.::
NP_001 DRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSITVND
     340       350       360       370       380       390         

          730       740       750       760       770       780    
pF1KE1 VVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRARFER
       ::.:::: : : : : : : .:    :: ::..  :::::::: :::.::.: :: ::. 
NP_001 VVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLRFQN
     400       410       420       430       440       450         

          790       800       810         820       830       840  
pF1KE1 LETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELDAL
       .   .:::..: ::.:. :  :::   .  :..:: :: ::::   : .: . :. .::.
NP_001 MLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTIDAM
     460       470       480       490       500       510         

            850       860       870       880       890            
pF1KE1 DANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----NEGK
       :. ..:: ::  :: ::.::..:::.. . ..   : : ::: .  . .::.       :
NP_001 DTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQASQK
     520       530       540       550       560       570         

      900        910       920       930       940       950       
pF1KE1 RLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAK
       : ... :. :... ::::.::: .::::. ::  : :    :::.. :..::...    .
NP_001 RAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIIIGMR
     580       590       600       610         620       630       

       960       970       980       990      1000      1010       
pF1KE1 VQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT-TE
       .::   :  ::: .     ..   .  ..:  :: . :. :.:::. .  ..  .::  .
NP_001 TQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLTGPK
       640       650       660       670       680       690       

       1020              1030         1040      1050       1060    
pF1KE1 GRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTLVTP
        ... .: .::          : ..:       :. .... :  :. :  . .  . :::
NP_001 EKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTP
       700       710       720       730       740       750       

         1070                          1080                1090    
pF1KE1 LQLLLF------ASKKVQ--------------SDGQI----------VLVDDWIKLQISH
       . .:.:      ::. .:              ::...          . .:.:... .  
NP_001 VTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFTLEP
       760       770       780       790       800       810       

         1100      1110      1120       1130      1140      1150   
pF1KE1 EAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGST
       :::. .  ::   ..: ..  . :.   ::.: .. : .  . . .. ..::..   :  
NP_001 EAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLS-TEEQSAGLQQPSG--
       820       830       840       850       860        870      

          1160      1170      1180      1190      1200      1210   
pF1KE1 RYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGYGAG
         :. ::: .  .   .:..: ..:  :                                
NP_001 -IGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQKYK
           880       890       900       910       920       930   

>>XP_016865222 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable ATP-de  (1139 aa)
 initn: 1180 init1: 468 opt: 892  Z-score: 655.3  bits: 133.3 E(85289): 9.2e-30
Smith-Waterman score: 961; 29.4% identity (51.1% similar) in 898 aa overlap (505-1181:10-901)

          480       490       500       510       520       530    
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAY
                                     ..::::::.::::  .::::. :::..: .
XP_016                      MAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLLQKH
                                    10        20        30         

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pF1KE1 PEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKK
       : ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : ..     : ::
XP_016 PTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLKYKK
      40        50        60        70        80        90         

                                                  600              
pF1KE1 DKD----------------------------------------DDGGE-------DDDAN
       .:.                                        ::::.       . :.:
XP_016 EKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEKDVN
     100       110       120       130       140       150         

                                    610                            
pF1KE1 C-----------------------------NLICGD------------------------
       :                             .::  .                        
XP_016 CLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAGRGF
     160       170       180       190       200       210         

                                                         620       
pF1KE1 -----------------------------------------------EYGPETRLSMSQL
                                                      :.:   . :. : 
XP_016 ASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSLVQT
     220       230       240       250       260       270         

                           630       640       650       660       
pF1KE1 N--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQ
       :                    .... ..::  ::  :      ::::.::::.. :  ..
XP_016 NGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIVGLR
     280       290       300       310       320       330         

       670          680       690       700       710       720    
pF1KE1 KHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSITIND
        .. .. . :.  .::::.. :::..   .:.::.   :.:: :.::::::::::::.::
XP_016 DRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSITVND
     340       350       360       370       380       390         

          730       740       750       760       770       780    
pF1KE1 VVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRARFER
       ::.:::: : : : : : : .:    :: ::..  :::::::: :::.::.: :: ::. 
XP_016 VVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLRFQN
     400       410       420       430       440       450         

          790       800       810         820       830       840  
pF1KE1 LETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELDAL
       .   .:::..: ::.:. :  :::   .  :..:: :: ::::   : .: . :. .::.
XP_016 MLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTIDAM
     460       470       480       490       500       510         

            850       860       870       880       890            
pF1KE1 DANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----NEGK
       :. ..:: ::  :: ::.::..:::.. . ..   : : ::: .  . .::.       :
XP_016 DTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQASQK
     520       530       540       550       560       570         

      900        910       920       930       940       950       
pF1KE1 RLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAK
       : ... :. :... ::::.::: .::::. ::  : :    :::.. :..::...    .
XP_016 RAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIIIGMR
     580       590       600       610         620       630       

       960       970       980       990      1000      1010       
pF1KE1 VQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT-TE
       .::   :  ::: .     ..   .  ..:  :: . :. :.:::. .  ..  .::  .
XP_016 TQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLTGPK
       640       650       660       670       680       690       

       1020              1030         1040      1050       1060    
pF1KE1 GRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTLVTP
        ... .: .::          : ..:       :. .... :  :. :  . .  . :::
XP_016 EKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTP
       700       710       720       730       740       750       

         1070                          1080                1090    
pF1KE1 LQLLLF------ASKKVQ--------------SDGQI----------VLVDDWIKLQISH
       . .:.:      ::. .:              ::...          . .:.:... .  
XP_016 VTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFTLEP
       760       770       780       790       800       810       

         1100      1110      1120       1130      1140      1150   
pF1KE1 EAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGST
       :::. .  ::   ..: ..  . :.   ::.: .. : .  . . .. ..::..   :  
XP_016 EAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLS-TEEQSAGLQQPSG--
       820       830       840       850       860        870      

          1160      1170      1180      1190      1200      1210   
pF1KE1 RYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGYGAG
         :. ::: .  .   .:..: ..:  :                                
XP_016 -IGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQKYK
           880       890       900       910       920       930   

>>XP_011541888 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable ATP-de  (1162 aa)
 initn: 1251 init1: 468 opt: 892  Z-score: 655.2  bits: 133.3 E(85289): 9.3e-30
Smith-Waterman score: 1275; 33.7% identity (54.6% similar) in 879 aa overlap (385-1070:190-1063)

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE1 ATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATG
                                     :. ::: . . ::.. :..:.::.: : ::
XP_011 NREMSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETG
     160       170       180       190       200       210         

          420       430       440       450       460       470    
pF1KE1 CGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVR
        :::::.:::.::: ..:  .  : :  :::::..:..:::::: :: :. :.. ::..:
XP_011 SGKTTQIPQFLLDDCFKN--GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIR
     220       230         240       250       260       270       

          480       490       500          510       520       530 
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG---IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVV
       .:: .  :.. . ::: ::::: : ::   .  ..::::::.::::  .::::. :::..
XP_011 LESRVS-PKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLL
       280        290       300       310       320       330      

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE1 QAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDK
       : .: ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : ..     :
XP_011 QKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLK
        340       350       360       370       380       390      

                                                     600           
pF1KE1 KKKDKD----------------------------------------DDGGE-------DD
        ::.:.                                        ::::.       . 
XP_011 YKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEK
        400       410       420       430       440       450      

                                       610                         
pF1KE1 DANC-----------------------------NLICGD---------------------
       :.::                             .::  .                     
XP_011 DVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAG
        460       470       480       490       500       510      

                                                            620    
pF1KE1 --------------------------------------------------EYGPETRLSM
                                                         :.:   . :.
XP_011 RGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSL
        520       530       540       550       560       570      

                              630       640       650       660    
pF1KE1 SQLN--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIY
        : :                    .... ..::  ::  :      ::::.::::.. : 
XP_011 VQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIV
        580       590       600       610       620       630      

          670          680       690       700       710       720 
pF1KE1 TMQKHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSIT
        .. .. .. . :.  .::::.. :::..   .:.::.   :.:: :.::::::::::::
XP_011 GLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSIT
        640       650       660       670       680       690      

             730       740       750       760       770       780 
pF1KE1 INDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRAR
       .::::.:::: : : : : : : .:    :: ::..  :::::::: :::.::.: :: :
XP_011 VNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLR
        700       710       720       730       740       750      

             790       800       810         820       830         
pF1KE1 FERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLREL
       :. .   .:::..: ::.:. :  :::   .  :..:: :: ::::   : .: . :. .
XP_011 FQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTI
        760       770       780       790       800       810      

     840       850       860       870       880       890         
pF1KE1 DALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----N
       ::.:. ..:: ::  :: ::.::..:::.. . ..   : : ::: .  . .::.     
XP_011 DAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQA
        820       830       840       850       860       870      

         900        910       920       930       940       950    
pF1KE1 EGKRLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTW
         :: ... :. :... ::::.::: .::::. ::  : :    :::.. :..::...  
XP_011 SQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIII
        880       890       900       910         920       930    

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KE1 EAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT
         ..::   :  ::: .     ..   .  ..:  :: . :. :.:::. .  ..  .::
XP_011 GMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLT
          940       950       960       970       980       990    

          1020              1030         1040      1050       1060 
pF1KE1 -TEGRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTL
         . ... .: .::          : ..:       :. .... :  :. :  . .  . 
XP_011 GPKEKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSA
         1000      1010      1020      1030      1040      1050    

            1070      1080      1090      1100      1110      1120 
pF1KE1 VTPLQLLLFASKKVQSDGQIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII
       :::. .:.:                                                   
XP_011 VTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFT
         1060      1070      1080      1090      1100      1110    

>>NP_001332904 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent RNA  (1268 aa)
 initn: 1251 init1: 468 opt: 892  Z-score: 654.8  bits: 133.4 E(85289): 9.9e-30
Smith-Waterman score: 1313; 31.9% identity (53.6% similar) in 1021 aa overlap (385-1181:28-1039)

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE1 ATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATG
                                     :. ::: . . ::.. :..:.::.: : ::
NP_001    MSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETG
                  10        20        30        40        50       

          420       430       440       450       460       470    
pF1KE1 CGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVR
        :::::.:::.::: ..:  .  : :  :::::..:..:::::: :: :. :.. ::..:
NP_001 SGKTTQIPQFLLDDCFKN--GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIR
        60        70          80        90       100       110     

          480       490       500          510       520       530 
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG---IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVV
       .:: .  :.. . ::: ::::: : ::   .  ..::::::.::::  .::::. :::..
NP_001 LESRVS-PKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLL
         120        130       140       150       160       170    

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE1 QAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDK
       : .: ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : ..     :
NP_001 QKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLK
          180       190       200       210       220       230    

                                                     600           
pF1KE1 KKKDKD----------------------------------------DDGGE-------DD
        ::.:.                                        ::::.       . 
NP_001 YKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEK
          240       250       260       270       280       290    

                                       610                         
pF1KE1 DANC-----------------------------NLICGD---------------------
       :.::                             .::  .                     
NP_001 DVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAG
          300       310       320       330       340       350    

                                                            620    
pF1KE1 --------------------------------------------------EYGPETRLSM
                                                         :.:   . :.
NP_001 RGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSL
          360       370       380       390       400       410    

                              630       640       650       660    
pF1KE1 SQLN--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIY
        : :                    .... ..::  ::  :      ::::.::::.. : 
NP_001 VQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIV
          420       430       440       450       460       470    

          670          680       690       700       710       720 
pF1KE1 TMQKHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSIT
        .. .. .. . :.  .::::.. :::..   .:.::.   :.:: :.::::::::::::
NP_001 GLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSIT
          480       490       500       510       520       530    

             730       740       750       760       770       780 
pF1KE1 INDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRAR
       .::::.:::: : : : : : : .:    :: ::..  :::::::: :::.::.: :: :
NP_001 VNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLR
          540       550       560       570       580       590    

             790       800       810         820       830         
pF1KE1 FERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLREL
       :. .   .:::..: ::.:. :  :::   .  :..:: :: ::::   : .: . :. .
NP_001 FQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTI
          600       610       620       630       640       650    

     840       850       860       870       880       890         
pF1KE1 DALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----N
       ::.:. ..:: ::  :: ::.::..:::.. . ..   : : ::: .  . .::.     
NP_001 DAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQA
          660       670       680       690       700       710    

         900        910       920       930       940       950    
pF1KE1 EGKRLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTW
         :: ... :. :... ::::.::: .::::. ::  : :    :::.. :..::...  
NP_001 SQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIII
          720       730       740       750         760       770  

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KE1 EAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT
         ..::   :  ::: .     ..   .  ..:  :: . :. :.:::. .  ..  .::
NP_001 GMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLT
            780       790       800       810       820       830  

          1020              1030         1040      1050       1060 
pF1KE1 -TEGRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTL
         . ... .: .::          : ..:       :. .... :  :. :  . .  . 
NP_001 GPKEKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSA
            840       850       860       870       880       890  

            1070                          1080                1090 
pF1KE1 VTPLQLLLF------ASKKVQ--------------SDGQI----------VLVDDWIKLQ
       :::. .:.:      ::. .:              ::...          . .:.:... 
NP_001 VTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFT
            900       910       920       930       940       950  

            1100      1110      1120       1130      1140      1150
pF1KE1 ISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMI
       .  :::. .  ::   ..: ..  . :.   ::.: .. : .  . .  . :: :..   
NP_001 LEPEAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLSTEEQSA-GLQQPS
            960       970       980       990      1000       1010 

             1160      1170      1180      1190      1200      1210
pF1KE1 GSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGY
       :    :. ::: .  .   .:..: ..:  :                             
NP_001 G---IGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQ
               1020      1030      1040      1050      1060        

             1220      1230      1240      1250      1260      1270
pF1KE1 GAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGYFGQGRGGGGY
                                                                   
NP_001 KYKDRGILHPKRGTEDRSDQSSLKSTDSSSYPSPCASPSPPSSGKGSKSPSPRPNMPVRY
     1070      1080      1090      1100      1110      1120        

>>XP_016865220 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable ATP-de  (1277 aa)
 initn: 1251 init1: 468 opt: 892  Z-score: 654.7  bits: 133.4 E(85289): 9.9e-30
Smith-Waterman score: 1313; 31.9% identity (53.6% similar) in 1021 aa overlap (385-1181:28-1039)

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE1 ATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATG
                                     :. ::: . . ::.. :..:.::.: : ::
XP_016    MSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETG
                  10        20        30        40        50       

          420       430       440       450       460       470    
pF1KE1 CGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVR
        :::::.:::.::: ..:  .  : :  :::::..:..:::::: :: :. :.. ::..:
XP_016 SGKTTQIPQFLLDDCFKN--GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIR
        60        70          80        90       100       110     

          480       490       500          510       520       530 
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG---IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVV
       .:: .  :.. . ::: ::::: : ::   .  ..::::::.::::  .::::. :::..
XP_016 LESRVS-PKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLL
         120        130       140       150       160       170    

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE1 QAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDK
       : .: ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : ..     :
XP_016 QKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLK
          180       190       200       210       220       230    

                                                     600           
pF1KE1 KKKDKD----------------------------------------DDGGE-------DD
        ::.:.                                        ::::.       . 
XP_016 YKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEK
          240       250       260       270       280       290    

                                       610                         
pF1KE1 DANC-----------------------------NLICGD---------------------
       :.::                             .::  .                     
XP_016 DVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAG
          300       310       320       330       340       350    

                                                            620    
pF1KE1 --------------------------------------------------EYGPETRLSM
                                                         :.:   . :.
XP_016 RGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSL
          360       370       380       390       400       410    

                              630       640       650       660    
pF1KE1 SQLN--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIY
        : :                    .... ..::  ::  :      ::::.::::.. : 
XP_016 VQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIV
          420       430       440       450       460       470    

          670          680       690       700       710       720 
pF1KE1 TMQKHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSIT
        .. .. .. . :.  .::::.. :::..   .:.::.   :.:: :.::::::::::::
XP_016 GLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSIT
          480       490       500       510       520       530    

             730       740       750       760       770       780 
pF1KE1 INDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRAR
       .::::.:::: : : : : : : .:    :: ::..  :::::::: :::.::.: :: :
XP_016 VNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLR
          540       550       560       570       580       590    

             790       800       810         820       830         
pF1KE1 FERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLREL
       :. .   .:::..: ::.:. :  :::   .  :..:: :: ::::   : .: . :. .
XP_016 FQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTI
          600       610       620       630       640       650    

     840       850       860       870       880       890         
pF1KE1 DALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----N
       ::.:. ..:: ::  :: ::.::..:::.. . ..   : : ::: .  . .::.     
XP_016 DAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQA
          660       670       680       690       700       710    

         900        910       920       930       940       950    
pF1KE1 EGKRLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTW
         :: ... :. :... ::::.::: .::::. ::  : :    :::.. :..::...  
XP_016 SQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIII
          720       730       740       750         760       770  

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KE1 EAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT
         ..::   :  ::: .     ..   .  ..:  :: . :. :.:::. .  ..  .::
XP_016 GMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLT
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pF1KE1 -TEGRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTL
         . ... .: .::          : ..:       :. .... :  :. :  . .  . 
XP_016 GPKEKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSA
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pF1KE1 VTPLQLLLF------ASKKVQ--------------SDGQI----------VLVDDWIKLQ
       :::. .:.:      ::. .:              ::...          . .:.:... 
XP_016 VTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFT
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pF1KE1 ISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMI
       .  :::. .  ::   ..: ..  . :.   ::.: .. : .  . .  . :: :..   
XP_016 LEPEAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLSTEEQSA-GLQQPS
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pF1KE1 GSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGY
       :    :. ::: .  .   .:..: ..:  :                             
XP_016 G---IGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQ
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>>XP_011541884 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable ATP-de  (1406 aa)
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pF1KE1 CGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVR
        :::::.:::.::: ..:  .  : :  :::::..:..:::::: :: :. :.. ::..:
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pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG---IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVV
       .:: .  :.. . ::: ::::: : ::   .  ..::::::.::::  .::::. :::..
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pF1KE1 QAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDK
       : .: ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : ..     :
XP_011 QKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLK
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        ::.:.                                        ::::.       . 
XP_011 YKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEK
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pF1KE1 DANC-----------------------------NLICGD---------------------
       :.::                             .::  .                     
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                                                         :.:   . :.
XP_011 RGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSL
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        : :                    .... ..::  ::  :      ::::.::::.. : 
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pF1KE1 TMQKHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSIT
        .. .. .. . :.  .::::.. :::..   .:.::.   :.:: :.::::::::::::
XP_011 GLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSIT
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pF1KE1 INDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRAR
       .::::.:::: : : : : : : .:    :: ::..  :::::::: :::.::.: :: :
XP_011 VNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLR
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pF1KE1 FERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLREL
       :. .   .:::..: ::.:. :  :::   .  :..:: :: ::::   : .: . :. .
XP_011 FQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTI
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pF1KE1 DALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----N
       ::.:. ..:: ::  :: ::.::..:::.. . ..   : : ::: .  . .::.     
XP_011 DAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQA
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XP_011 SQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIII
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pF1KE1 EAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT
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XP_011 VTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFT
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1270 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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