Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1071
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1071, 765 aa
1>>>pF1KE1071 765 - 765 aa - 765 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3169+/-0.00128; mu= 4.1839+/- 0.077
mean_var=341.9358+/-70.781, 0's: 0 Z-trim(112.5): 89 B-trim: 585 in 1/50
Lambda= 0.069359
statistics sampled from 13147 (13225) to 13147 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.727), E-opt: 0.2 (0.406), width: 16
Scan time: 4.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS48155.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX ( 765) 5142 529.2 9.4e-150
CCDS59175.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX ( 748) 3936 408.5 2e-113
CCDS3330.1 LRCH3 gene_id:84859|Hs108|chr3 ( 712) 1251 139.8 1.4e-32
CCDS53866.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13 ( 696) 1116 126.3 1.6e-28
CCDS31972.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13 ( 728) 1116 126.3 1.7e-28
CCDS53865.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13 ( 763) 1116 126.4 1.8e-28
CCDS34706.1 LRCH4 gene_id:4034|Hs108|chr7 ( 683) 1037 118.4 3.9e-26
>>CCDS48155.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX (765 aa)
initn: 5142 init1: 5142 opt: 5142 Z-score: 2802.0 bits: 529.2 E(32554): 9.4e-150
Smith-Waterman score: 5142; 100.0% identity (100.0% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGGGGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLFGQPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGGGGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLFGQPF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGSGYDLTDTTQADLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGSGYDLTDTTQADLSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLPKYLFDLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLPKYLFDLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIRRNNLHVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIRRNNLHVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDNGEKRLST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDNGEKRLST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TEPSDDDTVSLHSQVSESNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVYDFVDPNTEDVAVPEQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TEPSDDDTVSLHSQVSESNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVYDFVDPNTEDVAVPEQG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 NAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLAEEEDDDLKEVTDLRKIAAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLAEEEDDDLKEVTDLRKIAAQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 LQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPLTWQPLENQKDQIDEQPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPLTWQPLENQKDQIDEQPW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 PESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQDSDNANMSTQSPVSSEEYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQDSDNANMSTQSPVSSEEYD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 RTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHLREEREQIRQLRNNLESRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHLREEREQIRQLRNNLESRL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 KVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLDACK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLDACK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KE1 KLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQLSVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQLSVA
730 740 750 760
>>CCDS59175.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX (748 aa)
initn: 4403 init1: 3926 opt: 3936 Z-score: 2150.0 bits: 408.5 E(32554): 2e-113
Smith-Waterman score: 4991; 97.8% identity (97.8% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGGGGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLFGQPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGGGGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLFGQPF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGSGYDLTDTTQADLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGSGYDLTDTTQADLSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLPKYLFDLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLPKYLFDLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIRRNNLHVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIRRNNLHVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDNGEKRLST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDNGEKRLST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TEPSDDDTVSLHSQVSESNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVYDFVDPNTEDVAVPEQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TEPSDDDTVSLHSQVSESNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVYDFVDPNTEDVAVPEQG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 NAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLAEEEDDDLKEVTDLRKIAAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLAEEEDDDLKEVTDLRKIAAQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 LQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPLTWQPLENQKDQIDEQPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPLTWQPLENQKDQIDEQPW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 PESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQDSDNANMSTQSPVSSEEYD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS59 PESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDE-----------------EYD
550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 RTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHLREEREQIRQLRNNLESRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHLREEREQIRQLRNNLESRL
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 KVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLDACK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLDACK
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760
pF1KE1 KLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQLSVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQLSVA
710 720 730 740
>>CCDS3330.1 LRCH3 gene_id:84859|Hs108|chr3 (712 aa)
initn: 1471 init1: 987 opt: 1251 Z-score: 698.2 bits: 139.8 E(32554): 1.4e-32
Smith-Waterman score: 1470; 41.9% identity (65.8% similar) in 714 aa overlap (44-700:17-710)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 GGCGGGGSSGGCGTAGGGGGGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLFGQPFPN-GPPWNPGSLQ
::.. .: . : . :: ..::: .
CCDS33 MAAAGLVAVAAAAEYSGTVASGGNLPGVHCGPSSGAGPGFGPGSWS
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 PQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFP--GSGYDLTDTTQADLSRNRFTEIPSDV
::::::::::. .:.:::::::::.:: ....::::::.:::::::..::: ..
CCDS33 -----RSLDRALEEAAVTGVLSLSGRKLREFPRGAANHDLTDTTRADLSRNRLSEIPIEA
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 WLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLPKYLFDLPLKVLVVSNNK
:. ::.::::.:::. ::::: ::: ::.:::::: ::::: .: .::::::..::::
CCDS33 CHFVSLENLNLYQNCIRYIPEAILNLQALTFLNISRNQLSTLPVHLCNLPLKVLIASNNK
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIRRNNLHVLPDELGDLPLV
:::.:::::.:. :::::.::::::..:.:.:.:..::.::.:::.: ::.::..:::.
CCDS33 LVSLPEEIGHLRHLMELDVSCNEIQTIPSQIGNLEALRDLNVRRNHLVHLPEELAELPLI
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 KLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKYLNIQACCRMD
.:::::::.: ::::::.:.:::.: ::::::: ::::::.:::::::::::::::
CCDS33 RLDFSCNKITTIPVCYRNLRHLQTITLDNNPLQSPPAQICIKGKVHIFKYLNIQAC---K
230 240 250 260 270
320 330 340 350 360
pF1KE1 KKPDSLDLPSLSKRMPSQPLT--DSMEDFYPNKNHGP-DSGIGS-DNGEKRLSTTEPSDD
:: ::. ..: :: . :..: .. .: :::..: :.:.:: : .::.:.
CCDS33 IAPD---LPDYDRR----PLGFGSCHEELYSSRPYGALDSGFNSVDSGDKRWSGNEPTDE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KE1 DTVSLHSQVSESNREQTSRNDSH-------IIGSKTDSQKDQEVYDFVDPNT---EDVAV
. .: .:.: ..:: : .:. .. .. ..: . :..: : :.. :
CCDS33 FS-DLPLRVAEITKEQRLRRESQYQENRGSLVVTNGGVEHDLDQIDYIDSCTAEEEEAEV
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KE1 PE-QG---NAHIGSFVSFFKGKEKCSEKS-------RKNEELGDEKRLEKEQLLAEEEDD
. .: .. ..:..... .. : : :. .. : .: ... . : ..
CCDS33 RQPKGPDPDSLSSQFMAYIEQRRISHEGSPVKPVAIREFQKTEDMRRYLHQNRVPAEPSS
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KE1 DLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEK----SVSADEV-----
:. .. ... :. .:. . : . : . : :: ... : :
CCDS33 LLSLSASHNQLSHTDLELHQRREQLVERTRREAQLAALQYEEEKIRTKQIQRDAVLDFVK
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 -NSPLSPLTWQPLENQKDQID-EQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSS
.. :: .:: : .: : :.: . .. : . .. .. .::.
CCDS33 QKASQSPQKQHPLL---DGVDGECPFPSRRSQHTDDSALCMSLSGLNQVGCAATLPHSSA
520 530 540 550 560
580 590 600 610 620
pF1KE1 GNENDEQDSDNANMST-------QSPVSS-------EEYDRTDGFSHSPFGLKPRSAFSR
. .: :: .:. .::. : .. .: ..: :.. .. ..
CCDS33 FTPLKSDDRPNALLSSPATETVHHSPAYSFPAAIQRNQPQRPESFLFRA-GVRAETNKGH
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670
pF1KE1 SSRQEYGAA---DPGFTMRRKMEHLREER-EQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGV
.: .:: : .. . . :::. : : :::...: :::: :: :.:::: :::
CCDS33 ASPLPPSAAPTTDSTDSITGQNSRQREEELELIDQLRKHIEYRLKVSLPCDLGAALTDGV
630 640 650 660 670 680
680 690 700 710 720 730
pF1KE1 VLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHIL
::::::::.::::: :::::::::
CCDS33 VLCHLANHVRPRSVPSIHVPSPAVVS
690 700 710
>>CCDS53866.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13 (696 aa)
initn: 1980 init1: 966 opt: 1116 Z-score: 625.3 bits: 126.3 E(32554): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 1993; 49.0% identity (69.7% similar) in 747 aa overlap (29-759:37-693)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGG--GGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLF
:: : :::::::::.:: :
CCDS53 EPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGG-----------F
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGS---GYDLTDT
. :. : :.::::::..:: :.::.:::..:: . :.::.::
CCDS53 NLPLNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDT
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 TQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLP
.:::::.::..:.: .. :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
CCDS53 VQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
: ::::::..::::: :.:::::.::.:::::.::::: .::::.:.:.::::::.:
CCDS53 ACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG
:: :.:::.:: :: :::.::::::: ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
CCDS53 RNYLKVLPQELVDLSLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
::::::::.:::: . : ::: : .. . : . :. .: :::.::::
CCDS53 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE1 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D
:.::::.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: :
CCDS53 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
.. . : ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ...
CCDS53 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPL
: :. . .::. :..:::. . . ::.. :.:: .: : :.
CCDS53 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPN-----GLSTDIT----------ERSV----LN--LYPM
450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 -TWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQD
. . :: : . .. : :. :. ..... . .:.:. :
CCDS53 GSAEALELQDSALNGQIQLETSPVC----------EVQSD------LTLQSNGS----QY
490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 SDNANMSTQSPVSSEEYDRTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHL
: : .. .::. : . : .::::::::.: : .:. . :: ::.:::::..
CCDS53 SPN-EIRENSPAVSPTTNST-----APFGLKPRSVFLRPQRN-LESIDPQFTIRRKMEQM
530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 REEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPK
:::.: ..:::...: :::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS53 REEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPK
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 LSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQL
::::::::::::::.::.:::: .:.::::::::::.::::::.:.::::.. .:::
CCDS53 LSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILEEKGLVKVGITIQALLDITVTKALFT
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 SVA
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10 20 30 40 50
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:: : :::::::::.:: :
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10 20 30 40 50
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. :. : :.::::::..:: :.::.:::..:: . :.::.::
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.:::::.::..:.: .. :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
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pF1KE1 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
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:: :.:::.:: :: :::.::::::: ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
CCDS31 RNYLKVLPQELVDLSLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
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pF1KE1 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
::::::::.:::: . : ::: : .. . : . :. .: :::.::::
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:.::::.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: :
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pF1KE1 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
.. . : ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ...
CCDS31 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
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pF1KE1 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPL
: :. . .::. :..:::. . . ::.. :.:: .: : :.
CCDS31 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPN-----GLSTDIT----------ERSV----LN--LYPM
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530 540 550 560 570 580
pF1KE1 -TWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQD
. . :: : . .. : :. :. ..... . .:.:. :
CCDS31 GSAEALELQDSALNGQIQLETSPVC----------EVQSD------LTLQSNGS----QY
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590 600 610 620 630 640
pF1KE1 SDNANMSTQSPVSSEEYDRTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHL
: : .. .::. : . : .::::::::.: : .:. . :: ::.:::::..
CCDS31 SPN-EIRENSPAVSPTTNST-----APFGLKPRSVFLRPQRN-LESIDPQFTIRRKMEQM
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pF1KE1 REEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPK
:::.: ..:::...: :::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS31 REEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPK
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 LSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQL
::::::::::::::.::.:::: . :: : ::. . .. ::..:: :
CCDS31 LSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPT
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 SVA
CCDS31 SALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
700 710 720
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10 20 30 40 50
pF1KE1 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGG--GGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLF
:: : :::::::::.:: :
CCDS53 EPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGG-----------F
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGS---GYDLTDT
. :. : :.::::::..:: :.::.:::..:: . :.::.::
CCDS53 NLPLNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDT
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 TQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLP
.:::::.::..:.: .. :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
CCDS53 VQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
: ::::::..::::: :.:::::.::.:::::.::::: .::::.:.:.::::::.:
CCDS53 ACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVR
160 170 180 190 200 210
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pF1KE1 RNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG
:: :.:::.:: :: :::.::::::: ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
CCDS53 RNYLKVLPQELVDLSLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
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pF1KE1 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
::::::::.:::: . : ::: : .. . : . :. .: :::.::::
CCDS53 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE1 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D
:.::::.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: :
CCDS53 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD
330 340 350 360 370 380
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pF1KE1 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
.. . : ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ...
CCDS53 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
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pF1KE1 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKP---KQTVECEKSVSADEVNSPL
: :. . .::. :..:::. . ::. : ...: . :. ...
CCDS53 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPNGLSTDITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLET
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pF1KE1 SPLTWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDE
::. : :.: .. . : .: :. : . : .:.. . .
CCDS53 SPVC----EVQSDLTLQSNGSQYSP----NEIRENSPAV--------SPTTNSTAPFGLK
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pF1KE1 QDSDNANMSTQSPVSSEEYDRTDGFSHSPFGLKPR----SAFSRSSRQEYGAADPGFTMR
:: : . :.: . ... .. : ... . ..: : .:. . :: ::.:
CCDS53 PRSDPALI--LPPISFNTLTQAQTWDSSSYSVPSEGDSDNVFLRPQRN-LESIDPQFTIR
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pF1KE1 RKMEHLREEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVP
::::..:::.: ..:::...: :::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::
CCDS53 RKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVP
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pF1KE1 SPAVPKLSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPT
::::::::::::::::::::.::.:::: . :: : ::. . .. ::..:: :
CCDS53 SPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGE
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760
pF1KE1 TKASQLSVA
CCDS53 KAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
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pF1KE1 AGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLFGQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILS
: .:: : . :: .:::::: ..: :.
CCDS34 MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPG--LPGR--RSAERALEEAVATGTLN
10 20 30 40
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pF1KE1 LSGRKLRDFP-GSG--YDLTDTTQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPE
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CCDS34 LSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGLSLYHNCLRCLNP
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pF1KE1 AIKNLQMLTYLNISRNLLSTLPKYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISC
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CCDS34 ALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIGTLGSLRQLDVSS
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 NEIQVLPQQMGKLHSLRELNIRRNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHH
::.: ::... : :::.::.:::.: .::.::::::::.::::::.:..::: . .:.:
CCDS34 NELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRVSRIPVSFCRLRH
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pF1KE1 LQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPS-QPL
::::.::.:::: ::::.:::::.::::::. .: : . : :: : :: .:
CCDS34 LQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSALGDL--APS---RPPSFSPC
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pF1KE1 TDSMEDFYPNKNH--GPDSGIGS-DNGEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSESNREQTSRND
::..:.. . : :::. : :.: :: : .: : :. : ..:: :: . .
CCDS34 --PAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNE-STDEFSELSFRISELAREPRGPRE
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 SHIIGSKTDSQKDQEVYDFVDPNT--EDVAVPEQGNA--HIGSFVSFFKGKEKCSEKSRK
. :: .. : ::.: .. :: :.:.. . .: : .. . .::.
CCDS34 RKEDGS---ADGDPVQIDFIDSHVPGED---EERGTVEEQRPPELSPGAGDRERAPSSRR
350 360 370 380 390
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pF1KE1 NEELGDEKRLEKEQLLAEEEDDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQ
.: :.:.: . : :. : ::.. : ..: . . :..
CCDS34 EEPAGEERR----------RPDTLQ------------LWQERERRQQQQSGAW--GAPRK
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pF1KE1 TVECEKSVSADEVNSPLSPLTWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEY
. .. : : . . .. : ..: . :.:
CCDS34 DSLLKPGLRA--VVGGAAAVSTQAMHNGS--------PKSSA------------------
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:. ...: : . ..: :. . . . :.: .: : . ::
CCDS34 ----SQAGAAAG-----QGAPAPAPASQEPLPIA--GPATAPAPRPLGSIQRPNSFLFRS
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CCDS34 SSQSGSGPSSPDSVLRPRRYPQVPDEKDLMTQLRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVILC
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pF1KE1 HLANHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILE--
.:::..::::: :::::::::::: : :.:::.::.::.:.:: . :: : .:.
CCDS34 QLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARKNVESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQGT
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:::
CCDS34 ARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWPPSGLGGFVVFYVVLMLLLYVTYTRLLGS
640 650 660 670 680
765 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 19:28:15 2016 done: Sat Nov 5 19:28:16 2016
Total Scan time: 4.170 Total Display time: 0.170
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]