Result of FASTA (omim) for
pF1KE1071
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1071, 765 aa
1>>>pF1KE1071 765 - 765 aa - 765 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3367+/-0.000493; mu= 3.8659+/- 0.031
mean_var=360.8277+/-76.590, 0's: 0 Z-trim(119.9): 140 B-trim: 891 in 2/50
Lambda= 0.067519
statistics sampled from 34357 (34506) to 34357 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.405), width: 16
Scan time: 12.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001157685 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat an ( 696) 1127 124.6 1.4e-27
NP_055931 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and c ( 728) 1127 124.6 1.4e-27
NP_001157683 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat an ( 763) 1127 124.7 1.5e-27
XP_016875972 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-ric ( 731) 1116 123.6 3e-27
XP_016875973 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-ric ( 477) 825 95.0 7.9e-19
NP_036557 (OMIM: 179555) ras suppressor protein 1 ( 277) 359 49.3 2.6e-05
NP_665894 (OMIM: 605247) p53-induced protein with ( 893) 333 47.4 0.00031
XP_011518513 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 893) 333 47.4 0.00031
NP_665893 (OMIM: 605247) p53-induced protein with ( 910) 333 47.4 0.00032
XP_011518512 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 910) 333 47.4 0.00032
XP_011518511 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 920) 333 47.4 0.00032
XP_005253063 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 934) 333 47.4 0.00032
XP_005253062 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 934) 333 47.4 0.00032
XP_005253064 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 934) 333 47.4 0.00032
XP_005252609 (OMIM: 179555) PREDICTED: ras suppres ( 277) 317 45.2 0.00044
XP_016872192 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 317 45.6 0.0007
XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 317 45.6 0.0007
NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582) 317 45.6 0.0007
NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582) 317 45.6 0.0007
NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repea ( 582) 317 45.6 0.0007
XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 317 45.6 0.0007
XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 331) 307 44.3 0.00097
XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 465) 307 44.5 0.0012
NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-conta ( 524) 307 44.6 0.0013
XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 524) 307 44.6 0.0013
NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog (1630) 315 46.0 0.0015
NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog (1655) 315 46.0 0.0016
XP_006717379 (OMIM: 610933,614436) PREDICTED: E3 u ( 690) 305 44.5 0.0018
NP_001177652 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 696) 305 44.5 0.0018
NP_612370 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-prote ( 723) 305 44.6 0.0018
NP_001005374 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 723) 305 44.6 0.0018
XP_016870772 (OMIM: 610933,614436) PREDICTED: E3 u ( 723) 305 44.6 0.0018
NP_001005373 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 723) 305 44.6 0.0018
XP_016857089 (OMIM: 612890) PREDICTED: volume-regu ( 858) 302 44.4 0.0025
XP_016857090 (OMIM: 612890) PREDICTED: volume-regu ( 858) 302 44.4 0.0025
XP_016857088 (OMIM: 612890) PREDICTED: volume-regu ( 858) 302 44.4 0.0025
NP_060573 (OMIM: 612890) volume-regulated anion ch ( 858) 302 44.4 0.0025
XP_011539991 (OMIM: 612890) PREDICTED: volume-regu ( 858) 302 44.4 0.0025
XP_016857091 (OMIM: 612890) PREDICTED: volume-regu ( 858) 302 44.4 0.0025
NP_001127951 (OMIM: 612890) volume-regulated anion ( 858) 302 44.4 0.0025
XP_016857384 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1255) 301 44.5 0.0034
XP_016857383 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1438) 301 44.5 0.0037
XP_016857382 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1472) 301 44.6 0.0037
XP_016857381 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1490) 301 44.6 0.0038
NP_001317564 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-co (1495) 301 44.6 0.0038
XP_011518514 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 788) 295 43.6 0.0038
XP_005253065 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced ( 788) 295 43.6 0.0038
XP_016857379 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1528) 301 44.6 0.0038
NP_065845 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-conta (1537) 301 44.6 0.0038
XP_016857378 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1537) 301 44.6 0.0038
>>NP_001157685 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and ca (696 aa)
initn: 1991 init1: 977 opt: 1127 Z-score: 616.1 bits: 124.6 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 2004; 49.1% identity (69.9% similar) in 747 aa overlap (29-759:37-693)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGG--GGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLF
:: : :::::::::.:: :
NP_001 EPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGG-----------F
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGS---GYDLTDT
. :. : :.::::::..:: :.::.:::..:: . :.::.::
NP_001 NLPLNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDT
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 TQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLP
.:::::.::..:.: .. :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
NP_001 VQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
: ::::::..::::: :.:::::.::.:::::.::::: .::::.:.:.::::::.:
NP_001 ACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG
:: :.:::.:: ::::::.::::::: ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
NP_001 RNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
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NP_001 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE1 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D
:.::::.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: :
NP_001 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
.. . : ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ...
NP_001 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPL
: :. . .::. :..:::. . . ::.. :.:: .: : :.
NP_001 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPN-----GLSTDIT----------ERSV----LN--LYPM
450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 -TWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQD
. . :: : . .. : :. :. ..... . .:.:. :
NP_001 GSAEALELQDSALNGQIQLETSPVC----------EVQSD------LTLQSNGS----QY
490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 SDNANMSTQSPVSSEEYDRTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHL
: : .. .::. : . : .::::::::.: : .:. . :: ::.:::::..
NP_001 SPN-EIRENSPAVSPTTNST-----APFGLKPRSVFLRPQRN-LESIDPQFTIRRKMEQM
530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 REEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPK
:::.: ..:::...: :::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_001 REEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPK
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 LSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQL
::::::::::::::.::.:::: .:.::::::::::.::::::.:.::::.. .:::
NP_001 LSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILEEKGLVKVGITIQALLDITVTKALFT
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 SVA
>>NP_055931 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and calpo (728 aa)
initn: 1843 init1: 977 opt: 1127 Z-score: 615.9 bits: 124.6 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1860; 47.4% identity (68.2% similar) in 742 aa overlap (29-754:37-687)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGG--GGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLF
:: : :::::::::.:: :
NP_055 EPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGG-----------F
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGS---GYDLTDT
. :. : :.::::::..:: :.::.:::..:: . :.::.::
NP_055 NLPLNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDT
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 TQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLP
.:::::.::..:.: .. :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
NP_055 VQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
: ::::::..::::: :.:::::.::.:::::.::::: .::::.:.:.::::::.:
NP_055 ACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG
:: :.:::.:: ::::::.::::::: ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
NP_055 RNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
::::::::.:::: . : ::: : .. . : . :. .: :::.::::
NP_055 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE1 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D
:.::::.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: :
NP_055 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD
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410 420 430 440 450 460
pF1KE1 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
.. . : ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ...
NP_055 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPL
: :. . .::. :..:::. . . ::.. :.:: .: : :.
NP_055 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPN-----GLSTDIT----------ERSV----LN--LYPM
450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 -TWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQD
. . :: : . .. : :. :. ..... . .:.:. :
NP_055 GSAEALELQDSALNGQIQLETSPVC----------EVQSD------LTLQSNGS----QY
490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 SDNANMSTQSPVSSEEYDRTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHL
: : .. .::. : . : .::::::::.: : .:. . :: ::.:::::..
NP_055 SPN-EIRENSPAVSPTTNST-----APFGLKPRSVFLRPQRN-LESIDPQFTIRRKMEQM
530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 REEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPK
:::.: ..:::...: :::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_055 REEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPK
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 LSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQL
::::::::::::::.::.:::: . :: : ::. . .. ::..:: :
NP_055 LSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPT
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 SVA
NP_055 SALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
700 710 720
>>NP_001157683 (OMIM: 610368) leucine-rich repeat and ca (763 aa)
initn: 1843 init1: 977 opt: 1127 Z-score: 615.7 bits: 124.7 E(85289): 1.5e-27
Smith-Waterman score: 1824; 45.9% identity (67.4% similar) in 748 aa overlap (29-754:37-722)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGG--GGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLF
:: : :::::::::.:: :
NP_001 EPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGG-----------F
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGS---GYDLTDT
. :. : :.::::::..:: :.::.:::..:: . :.::.::
NP_001 NLPLNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDT
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 TQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLP
.:::::.::..:.: .. :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
NP_001 VQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
: ::::::..::::: :.:::::.::.:::::.::::: .::::.:.:.::::::.:
NP_001 ACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG
:: :.:::.:: ::::::.::::::: ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
NP_001 RNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
::::::::.:::: . : ::: : .. . : . :. .: :::.::::
NP_001 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE1 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D
:.::::.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: :
NP_001 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
.. . : ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ...
NP_001 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKP---KQTVECEKSVSADEVNSPL
: :. . .::. :..:::. . ::. : ...: . :. ...
NP_001 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPNGLSTDITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLET
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 SPLTWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDE
::. : :.: .. . : .: :. : . : .:.. . .
NP_001 SPVC----EVQSDLTLQSNGSQYSP----NEIRENSPAV--------SPTTNSTAPFGLK
510 520 530 540
590 600 610 620 630
pF1KE1 QDSDNANMSTQSPVSSEEYDRTDGFSHSPFGLKPR----SAFSRSSRQEYGAADPGFTMR
:: : . :.: . ... .. : ... . ..: : .:. . :: ::.:
NP_001 PRSDPALI--LPPISFNTLTQAQTWDSSSYSVPSEGDSDNVFLRPQRN-LESIDPQFTIR
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 RKMEHLREEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVP
::::..:::.: ..:::...: :::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::
NP_001 RKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVP
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 SPAVPKLSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPT
::::::::::::::::::::.::.:::: . :: : ::. . .. ::..:: :
NP_001 SPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGE
670 680 690 700 710 720
760
pF1KE1 TKASQLSVA
NP_001 KAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
730 740 750 760
>>XP_016875972 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-rich re (731 aa)
initn: 1980 init1: 966 opt: 1116 Z-score: 610.1 bits: 123.6 E(85289): 3e-27
Smith-Waterman score: 1957; 47.4% identity (68.9% similar) in 753 aa overlap (29-759:37-728)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGG--GGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLF
:: : :::::::::.:: :
XP_016 EPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGG-----------F
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGS---GYDLTDT
. :. : :.::::::..:: :.::.:::..:: . :.::.::
XP_016 NLPLNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDT
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 TQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLP
.:::::.::..:.: .. :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
XP_016 VQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
: ::::::..::::: :.:::::.::.:::::.::::: .::::.:.:.::::::.:
XP_016 ACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG
:: :.:::.:: :: :::.::::::: ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
XP_016 RNYLKVLPQELVDLSLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
::::::::.:::: . : ::: : .. . : . :. .: :::.::::
XP_016 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE1 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D
:.::::.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: :
XP_016 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
.. . : ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ...
XP_016 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKP---KQTVECEKSVSADEVNSPL
: :. . .::. :..:::. . ::. : ...: . :. ...
XP_016 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPNGLSTDITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLET
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 SPLTWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDE
::. : :.: .. . : .: :. : . : .:.. . .
XP_016 SPVC----EVQSDLTLQSNGSQYSP----NEIRENSPAV--------SPTTNSTAPFGLK
510 520 530 540
590 600 610 620 630
pF1KE1 QDSDNANMSTQSPVSSEEYDRTDGFSHSPFGLKPR----SAFSRSSRQEYGAADPGFTMR
:: : . :.: . ... .. : ... . ..: : .:. . :: ::.:
XP_016 PRSDPALI--LPPISFNTLTQAQTWDSSSYSVPSEGDSDNVFLRPQRN-LESIDPQFTIR
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 RKMEHLREEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVP
::::..:::.: ..:::...: :::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::
XP_016 RKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVP
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 SPAVPKLSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPT
::::::::::::::::::::.::.:::: .:.::::::::::.::::::.:.::::.. .
XP_016 SPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILEEKGLVKVGITIQALLDITV
670 680 690 700 710 720
760
pF1KE1 TKASQLSVA
:::
XP_016 TKALFT
730
>>XP_016875973 (OMIM: 610368) PREDICTED: leucine-rich re (477 aa)
initn: 1095 init1: 704 opt: 825 Z-score: 459.0 bits: 95.0 E(85289): 7.9e-19
Smith-Waterman score: 1072; 41.3% identity (65.0% similar) in 508 aa overlap (269-759:1-474)
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIF
...:::..:.::::: :::::: :::::::
XP_016 MKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIF
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDNGEKRL
:::.:::: . : ::: : .. . : . :. .: :::.:::::.:::
XP_016 KYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDNGDKRL
40 50 60 70 80
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 STTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------DFVDPN
:.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: : .. .
XP_016 SATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSG
90 100 110 120 130 140
420 430 440 450 460
pF1KE1 TEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEEDDDLK
: ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ...: :.
XP_016 EERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQDMDIA
150 160 170 180 190
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 EVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKP---KQTVECEKSVSADEVNSPLSPLTW
. .::. :..:::. . ::. : ...: . :. ... ::.
XP_016 MIEQLRE-AVDLLQDPNGLSTDITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVC-
200 210 220 230 240 250
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 QPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQDSDN
: :.: .. . : .: :. : . : .:.. . . ::
XP_016 ---EVQSDLTLQSNGSQYSP----NEIRENSPAV--------SPTTNSTAPFGLKPRSDP
260 270 280 290
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 ANMSTQSPVSSEEYDRTDGFSHSPFGLKPR----SAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEH
: . :.: . ... .. : ... . ..: : .:. . :: ::.:::::.
XP_016 ALI--LPPISFNTLTQAQTWDSSSYSVPSEGDSDNVFLRPQRN-LESIDPQFTIRRKMEQ
300 310 320 330 340 350
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 LREEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVP
.:::.: ..:::...: :::: : .:.:::::::::::::.:::::::::::::::::::
XP_016 MREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVP
360 370 380 390 400 410
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 KLSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQ
:::::::::::::::.::.:::: .:.::::::::::.::::::.:.::::.. .:::
XP_016 KLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILEEKGLVKVGITIQALLDITVTKALF
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 LSVA
XP_016 T
>>NP_036557 (OMIM: 179555) ras suppressor protein 1 isof (277 aa)
initn: 410 init1: 173 opt: 359 Z-score: 216.4 bits: 49.3 E(85289): 2.6e-05
Smith-Waterman score: 359; 33.6% identity (64.7% similar) in 235 aa overlap (78-301:3-237)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 VPIPVPTLFGQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGI--LSLSGRKLRD-FP
.:: . .::. .. ...: : . . .
NP_036 MSKSLKKLVEESREKNQPEVDMSDRGISNMLD
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 GSG-YDLTDTTQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLN
.: . :. :: ::.:..: .: .. . ::.::...: :. .: :..:: : .::
NP_036 VNGLFTLSHITQLVLSHNKLTMVPPNIAELKNLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQKLKHLN
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 ISRNLLSTLPKYLFDLP-LKVLVVSNNKLV--SIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQ
.. : :.:::. . .:: :.:: .. :.: :.: .. : : : .: :....:: .
NP_036 LGMNRLNTLPRGFGSLPALEVLDLTYNNLSENSLPGNFFYLTTLRALYLSDNDFEILPPD
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KE1 MGKLHSLRELNIRRNNLHVLPDELGDLPLVK-LDFSCNKVTEIPVCYRKLH---HLQVII
.::: .:. :..: :.: :: :.:.: .: : .. :..: .: .: . ::.
NP_036 IGKLTKLQILSLRDNDLISLPKEIGELTQLKELHIQGNRLTVLPPELGNLDLTGQKQVFK
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMED
.::: .: :. : :.:.:.
NP_036 AENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIRSETYKYLYGRHMQANPEPPKKNNDKSKKISRKPL
220 230 240 250 260 270
>>NP_665894 (OMIM: 605247) p53-induced protein with a de (893 aa)
initn: 356 init1: 146 opt: 333 Z-score: 196.9 bits: 47.4 E(85289): 0.00031
Smith-Waterman score: 333; 36.2% identity (65.4% similar) in 185 aa overlap (100-282:114-295)
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGSGYDLTDTTQADLSRNRFTEIPSD
: ..:.. :. .. ::: : . .:.
NP_665 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLSGLAHLAHLDLSFNSLETLPAC
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLPKYLFDLP-LKVLVVSN
: . : .: : :::.. .:::. : ::.:....: :.::: : : :. : .:.
NP_665 VLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLDLSQ
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIRRNNLHVLPDELGDLP
: : ..: ::: : .:.::... :..: :: ... :.::: : .. : : .: .:. ::
NP_665 NLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLARLP
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LV-KLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKYLNIQACC
:. .::. :.. ..: .: . :..:::
NP_665 LLTRLDLRDNQLRDLPP---ELLDAPFVRLQGNPLGEASPDAPSSPVAALIPEMPRLFLT
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDNGEKRLSTTEPSDDD
NP_665 SDLDSFPVTPQGCSVTLACGVRLQFPAGATATPITIRYRLLLPEPGLVPLGPHDALLSHV
330 340 350 360 370 380
>>XP_011518513 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced dea (893 aa)
initn: 356 init1: 146 opt: 333 Z-score: 196.9 bits: 47.4 E(85289): 0.00031
Smith-Waterman score: 333; 36.2% identity (65.4% similar) in 185 aa overlap (100-282:114-295)
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGSGYDLTDTTQADLSRNRFTEIPSD
: ..:.. :. .. ::: : . .:.
XP_011 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLSGLAHLAHLDLSFNSLETLPAC
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLPKYLFDLP-LKVLVVSN
: . : .: : :::.. .:::. : ::.:....: :.::: : : :. : .:.
XP_011 VLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLDLSQ
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIRRNNLHVLPDELGDLP
: : ..: ::: : .:.::... :..: :: ... :.::: : .. : : .: .:. ::
XP_011 NLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLARLP
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LV-KLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKYLNIQACC
:. .::. :.. ..: .: . :..:::
XP_011 LLTRLDLRDNQLRDLPP---ELLDAPFVRLQGNPLGEASPDAPSSPVAALIPEMPRLFLT
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDNGEKRLSTTEPSDDD
XP_011 SDLDSFPVTPQGCSVTLACGVRLQFPAGATATPITIRYRLLLPEPGLVPLGPHDALLSHV
330 340 350 360 370 380
>>NP_665893 (OMIM: 605247) p53-induced protein with a de (910 aa)
initn: 356 init1: 146 opt: 333 Z-score: 196.8 bits: 47.4 E(85289): 0.00032
Smith-Waterman score: 333; 36.2% identity (65.4% similar) in 185 aa overlap (100-282:114-295)
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFPGSGYDLTDTTQADLSRNRFTEIPSD
: ..:.. :. .. ::: : . .:.
NP_665 QLPQSLSCLRSLVLKGGQRRDTLGACLRGALTNLPAGLSGLAHLAHLDLSFNSLETLPAC
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLPKYLFDLP-LKVLVVSN
: . : .: : :::.. .:::. : ::.:....: :.::: : : :. : .:.
NP_665 VLQMRGLGALLLSHNCLSELPEALGALPALTFLTVTHNRLQTLPPALGALSTLQRLDLSQ
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIRRNNLHVLPDELGDLP
: : ..: ::: : .:.::... :..: :: ... :.::: : .. : : .: .:. ::
NP_665 NLLDTLPPEIGGLGSLLELNLASNRLQSLPASLAGLRSLRLLVLHSNLLASVPADLARLP
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LV-KLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKGKVHIFKYLNIQACC
:. .::. :.. ..: .: . :..:::
NP_665 LLTRLDLRDNQLRDLPP---ELLDAPFVRLQGNPLGEASPDAPSSPVAALIPEMPRLFLT
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDNGEKRLSTTEPSDDD
NP_665 SDLDSFPVTPQGCSVTLACGVRLQFPAGATATPITIRYRLLLPEPGLVPLGPHDALLSHV
330 340 350 360 370 380
>>XP_011518512 (OMIM: 605247) PREDICTED: p53-induced dea (910 aa)
initn: 356 init1: 146 opt: 333 Z-score: 196.8 bits: 47.4 E(85289): 0.00032
Smith-Waterman score: 333; 36.2% identity (65.4% similar) in 185 aa overlap (100-282:114-295)
70 80 90 100 110 120
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