Result of FASTA (omim) for
pF1KE1072
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1072, 771 aa
1>>>pF1KE1072 771 - 771 aa - 771 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1009+/-0.000496; mu= 22.1562+/- 0.031
mean_var=75.5999+/-15.522, 0's: 0 Z-trim(108.1): 84 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.147507
statistics sampled from 16061 (16145) to 16061 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 11.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066000 (OMIM: 615720,615725) probable cationic ( 771) 5029 1080.7 0
NP_004164 (OMIM: 603752) cationic amino acid trans ( 635) 1204 266.6 2.3e-70
XP_016885401 (OMIM: 300443) PREDICTED: cationic am ( 619) 820 184.9 8.8e-46
NP_116192 (OMIM: 300443) cationic amino acid trans ( 619) 820 184.9 8.8e-46
NP_001041629 (OMIM: 300443) cationic amino acid tr ( 619) 820 184.9 8.8e-46
XP_016876205 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affini ( 629) 812 183.2 2.9e-45
XP_005266564 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affini ( 629) 812 183.2 2.9e-45
NP_003036 (OMIM: 104615) high affinity cationic am ( 629) 812 183.2 2.9e-45
XP_016876204 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affini ( 643) 812 183.2 3e-45
XP_016876202 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affini ( 643) 812 183.2 3e-45
XP_016876203 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affini ( 643) 812 183.2 3e-45
XP_005273668 (OMIM: 601872) PREDICTED: cationic am ( 658) 779 176.2 3.9e-43
XP_005273667 (OMIM: 601872) PREDICTED: cationic am ( 658) 779 176.2 3.9e-43
NP_001008539 (OMIM: 601872) cationic amino acid tr ( 658) 779 176.2 3.9e-43
XP_005273669 (OMIM: 601872) PREDICTED: cationic am ( 658) 779 176.2 3.9e-43
XP_016869235 (OMIM: 601872) PREDICTED: cationic am ( 658) 779 176.2 3.9e-43
NP_001158243 (OMIM: 601872) cationic amino acid tr ( 698) 779 176.2 4.1e-43
XP_016869236 (OMIM: 601872) PREDICTED: cationic am ( 657) 757 171.5 1e-41
NP_003037 (OMIM: 601872) cationic amino acid trans ( 697) 757 171.5 1.1e-41
NP_036376 (OMIM: 604235) large neutral amino acids ( 535) 287 71.4 1.1e-11
NP_062823 (OMIM: 607959) asc-type amino acid trans ( 523) 262 66.1 4.3e-10
NP_003477 (OMIM: 600182) large neutral amino acids ( 507) 249 63.3 2.9e-09
XP_016879224 (OMIM: 600182) PREDICTED: large neutr ( 509) 249 63.3 2.9e-09
XP_016881719 (OMIM: 220100,604144) PREDICTED: B(0, ( 399) 211 55.2 6.6e-07
NP_001229965 (OMIM: 220100,604144) B(0,+)-type ami ( 487) 211 55.2 7.6e-07
NP_001119807 (OMIM: 220100,604144) B(0,+)-type ami ( 487) 211 55.2 7.6e-07
XP_011524704 (OMIM: 220100,604144) PREDICTED: B(0, ( 487) 211 55.2 7.6e-07
NP_055085 (OMIM: 220100,604144) B(0,+)-type amino ( 487) 211 55.2 7.6e-07
NP_055146 (OMIM: 607933) cystine/glutamate transpo ( 501) 211 55.2 7.8e-07
XP_011530104 (OMIM: 607933) PREDICTED: cystine/glu ( 506) 211 55.2 7.8e-07
XP_006721349 (OMIM: 600182) PREDICTED: large neutr ( 352) 186 49.8 2.4e-05
XP_011521740 (OMIM: 605641) PREDICTED: Y+L amino a ( 515) 177 48.0 0.00012
XP_011521736 (OMIM: 605641) PREDICTED: Y+L amino a ( 515) 177 48.0 0.00012
XP_011521735 (OMIM: 605641) PREDICTED: Y+L amino a ( 515) 177 48.0 0.00012
NP_001070253 (OMIM: 605641) Y+L amino acid transpo ( 515) 177 48.0 0.00012
NP_003974 (OMIM: 605641) Y+L amino acid transporte ( 515) 177 48.0 0.00012
XP_016879226 (OMIM: 600182) PREDICTED: large neutr ( 332) 174 47.2 0.00013
XP_006723055 (OMIM: 220100,604144) PREDICTED: B(0, ( 260) 171 46.5 0.00017
XP_006723347 (OMIM: 607959) PREDICTED: asc-type am ( 444) 173 47.1 0.00019
XP_016879340 (OMIM: 605641) PREDICTED: Y+L amino a ( 382) 168 46.0 0.00036
XP_016879225 (OMIM: 600182) PREDICTED: large neutr ( 467) 167 45.8 0.00049
NP_001119577 (OMIM: 222700,603593) Y+L amino acid ( 511) 166 45.7 0.0006
XP_006720365 (OMIM: 222700,603593) PREDICTED: Y+L ( 511) 166 45.7 0.0006
XP_011535601 (OMIM: 222700,603593) PREDICTED: Y+L ( 511) 166 45.7 0.0006
XP_011535600 (OMIM: 222700,603593) PREDICTED: Y+L ( 511) 166 45.7 0.0006
NP_001119578 (OMIM: 222700,603593) Y+L amino acid ( 511) 166 45.7 0.0006
NP_001253965 (OMIM: 604235) large neutral amino ac ( 430) 161 44.5 0.0011
XP_011521741 (OMIM: 605641) PREDICTED: Y+L amino a ( 307) 156 43.4 0.0018
XP_011525421 (OMIM: 607959) PREDICTED: asc-type am ( 660) 159 44.3 0.0021
NP_877392 (OMIM: 604235) large neutral amino acids ( 332) 153 42.7 0.003
>>NP_066000 (OMIM: 615720,615725) probable cationic amin (771 aa)
initn: 5029 init1: 5029 opt: 5029 Z-score: 5782.4 bits: 1080.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5029; 100.0% identity (100.0% similar) in 771 aa overlap (1-771:1-771)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSGFFTSLDPRRVQWGAAWYAMHSRILRTKPVESMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 MSGFFTSLDPRRVQWGAAWYAMHSRILRTKPVESMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LGVGSCVGTGMYVVSGLVAKEMAGPGVIVSFIIAAVASILSGVCYAEFGVRVPKTTGSAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LGVGSCVGTGMYVVSGLVAKEMAGPGVIVSFIIAAVASILSGVCYAEFGVRVPKTTGSAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TYSYVTVGEFVAFFIGWNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 TYSYVTVGEFVAFFIGWNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GKGEESYPDLLALLIAVIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFINGKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 GKGEESYPDLLALLIAVIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFINGKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 WAEGQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAITASLVICLTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 WAEGQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAITASLVICLTAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VSVSVILTLMVPYYTIDTESPLMEMFVAHGFYAAKFVVAIGSVAGLTVSLLGSLFPMPRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VSVSVILTLMVPYYTIDTESPLMEMFVAHGFYAAKFVVAIGSVAGLTVSLLGSLFPMPRV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 IYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEMMSIGTLLAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 IYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEMMSIGTLLAYT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSEGDEFSGPATNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSEGDEFSGPATNT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 CGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIYLIKLKKLIGPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 CGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIYLIKLKKLIGPH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 YYTMRIRLGLPGKMDRPTAATGHTVTICVLLLFILMFIFCSFIIFGSDYISEQSWWAILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 YYTMRIRLGLPGKMDRPTAATGHTVTICVLLLFILMFIFCSFIIFGSDYISEQSWWAILL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 VVLMVLLISTLVFVILQQPENPKKLPYMAPCLPFVPAFAMLVNIYLMLKLSTITWIRFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VVLMVLLISTLVFVILQQPENPKKLPYMAPCLPFVPAFAMLVNIYLMLKLSTITWIRFAV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 WCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFSYATEGESQEDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 WCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFSYATEGESQEDW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE1 GGPTEDKGFYYQQMSDAKANGRTSSKAKSKSKHKQNSEALIANDELDYSPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 GGPTEDKGFYYQQMSDAKANGRTSSKAKSKSKHKQNSEALIANDELDYSPE
730 740 750 760 770
>>NP_004164 (OMIM: 603752) cationic amino acid transport (635 aa)
initn: 1055 init1: 815 opt: 1204 Z-score: 1384.4 bits: 266.6 E(85289): 2.3e-70
Smith-Waterman score: 1387; 37.8% identity (65.4% similar) in 709 aa overlap (25-728:17-632)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSGFFTSLDPRRVQWGAAWYAMHSRILRTKPVE-SMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLI
.. : ::.: : .: :.: . :.:.::
NP_004 MARGLPTIASLARLCQKLNRLKPLEDSTME---------TSLRRCLSTLDLT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SLGVGSCVGTGMYVVSGLVAKEMAGPGVIVSFIIAAVASILSGVCYAEFGVRVPKTTGSA
::::. ::.:.::..: ::::.:::.:..:: .:::::.:...::::::.:::.: :::
NP_004 LLGVGGMVGSGLYVLTGAVAKEVAGPAVLLSFGVAAVASLLAALCYAEFGARVPRT-GSA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 YTYSYVTVGEFVAFFIGWNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNG
: ..::..::. ::.::::..:::.:: :: : : :...::. .:.: . ::. .
NP_004 YLFTYVSMGELWAFLIGWNVLLEYIIGGAAVARAWSGYLDSMFSHSIRNFTETHVGSWQV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LGKGEESYPDLLALLIAVIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFINGK
:. :::.:: : .... .:. :.. : .:.......: : .::.: :... . .
NP_004 PLLGH--YPDFLAAGIILLASAFVSCGARVSSWLNHTFSAISLLVILFIVILGFILAQPH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 YWA--EGQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAITASLVICL
:. :: : : :.:::. :.:.:::::.:::.::...:::.:: :.: ::. ::.:
NP_004 NWSADEGGFAPFGFSGVMAGTASCFYAFVGFDVIAASSEEAQNPRRSVPLAIAISLAIAA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 TAYVSVSVILTLMVPYYTIDTESPLMEMFVAHGFYAAKFVVAIGSVAGLTVSLLGSLFPM
::. ::..::::::....: .: : . : .:. : :.:: ::. .... ::. :: .
NP_004 GAYILVSTVLTLMVPWHSLDPDSALADAFYQRGYRWAGFIVAAGSICAMNTVLLSLLFSL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PRVIYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEMMSIGTLL
::..::::.:::.:. .::: :..::.. .. :.:.:.::::..:..:....:.::::
NP_004 PRIVYAMAADGLFFQVFAHVHPRTQVPVAGTLAFGLLTAFLALLLDLESLVQFLSLGTLL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 AYTLVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSEGDEFSGPA
:::.:.. ...::.: : : : : ::
NP_004 AYTFVATSIIVLRFQKSSP-----------------------------PSSPGPASPGPL
410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 TNTCGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIYLIKLKKLI
: :. :..:. .:.: : ... :. : .:: .
NP_004 T-----KQQSSFSDHLQLVG-----TVHASVPEPG-------------------ELKPAL
440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 GPHYYTMRIRLGLPGKMDRPTAATGHTVTICVLLLFILMFIFCSFIIFGSDYISEQSWWA
:. ::. .: . : .:: . ... . . ..::.. . :
NP_004 RPY-------LGF---LD--GYSPGAVVTWALGVMLASAITIGCVLVFGNSTLHLPHWGY
470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 ILLVVL--MVLLISTLVFVILQQPENPKKLPYMAPCLPFVPAFAMLVNIYLMLKLSTITW
:::..: ...:.: ::. :: .. .. : .:..::.....:: :::::: .::
NP_004 ILLLLLTSVMFLLSLLVLGAHQQQY--REDLFQIPMVPLIPALSIVLNICLMLKLSYLTW
520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 IRFAVWCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFSYATEGE
.::..: ..:: .:::::: .: . . :: .::. : : :.:: . : .
NP_004 VRFSIWLLMGLAVYFGYGIRHS--KENQRELPGLNSTH--YVVFPRGSLEETVQ-AMQPP
570 580 590 600 610 620
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 SQEDWGGPTEDKGFYYQQMSDAKANGRTSSKAKSKSKHKQNSEALIANDELDYSPE
:: .:..: :
NP_004 SQ----APAQDPGHME
630
>>XP_016885401 (OMIM: 300443) PREDICTED: cationic amino (619 aa)
initn: 1684 init1: 813 opt: 820 Z-score: 942.9 bits: 184.9 E(85289): 8.8e-46
Smith-Waterman score: 1502; 40.8% identity (64.9% similar) in 679 aa overlap (47-699:26-610)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 AAWYAMHSRILRTKPVESMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLISLGVGSCVGTGMYVVSG
:.::. :.:.::..::::: .:.:.::..:
XP_016 MPWQAFRRFGQKLVRRRTLESGMAETRLARCLSTLDLVALGVGSTLGAGVYVLAG
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 LVAKEMAGPGVIVSFIIAAVASILSGVCYAEFGVRVPKTTGSAYTYSYVTVGEFVAFFIG
:::. :::.... :..::..:.:.:.::::::.:::.. :::: ::::::::. :: :
XP_016 EVAKDKAGPSIVICFLVAALSSVLAGLCYAEFGARVPRS-GSAYLYSYVTVGELWAFTTG
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 WNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNGLGKGEESYPDLLALLIA
::::: :.::::. : : :: ::.: .. ::. . :.. . . :::..:: ..
XP_016 WNLILSYVIGTASVARAWSSAFDNLIGNHISKTLQGSIAL--HVPHVLAEYPDFFALGLV
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KE1 VIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFINGKY--W-----------AE
...: ..:::...: ..:.. .:: : :.::.: :..: : ::
XP_016 LLLTGLLALGASESALVTKVFTGVNLLVLGFVMISG--FVKGDVHNWKLTEEDYELAMAE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE1 ------------GQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAITA
: :.: :. :.:.:::::::::.::: ::::::::.::. :::..:.
XP_016 LNDTYSLGPLGSGGFVPFGFEGILRGAATCFYAFVGFDCIATTGEEAQNPQRSIPMGIVI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SLVICLTAYVSVSVILTLMVPYYTIDTESPLMEMFVAHGFYAAKFVVAIGSVAGLTVSLL
:: .:. :: .:: ::::.::: .. :::: : :. :. :..:::.::. .:..:::
XP_016 SLSVCFLAYFAVSSALTLMMPYYQLQPESPLPEAFLYIGWAPARYVVAVGSLCALSTSLL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 GSLFPMPRVIYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEMM
::.::::::::::: :::::: ::.. . :.::..: .:::..::..:.: .: ::...:
XP_016 GSMFPMPRVIYAMAEDGLLFRVLARIHTGTRTPIIATVVSGIIAAFMAFLFKLTDLVDLM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 SIGTLLAYTLVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSEGD
::::::::.:::.:::.:::::... : : .. ..::
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.:: :::.. :
XP_016 --------------------------------------------ITT-----ESEKLTLW
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: .. . . :: .:. : .: :: .:. .: . .. .
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: . :. . :::..::: .. :: .::.. : . .: ::..: ....::::::...
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.. :: ::.:: ..:. ::::::: .: ::.. . . ..: . :.:
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pF1KE1 EFSGPATNTCGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIYLI
.:: :::.. :
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: .. . . :: .:. : .: :: .:. .: . .. .
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: . :. . :::..::: .. :: .::.. : . .: ::..: ....::::::...
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pF1KE1 STITWIRFAVWCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFSY
.. :: ::.:: ..:. ::::::: .: ::.. . . ..: . :.:
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pF1KE1 ATEGESQEDWGGPTEDKGFYYQQMSDAKANGRTSSKAKSKSKHKQNSEALIANDELDYSP
>>NP_001041629 (OMIM: 300443) cationic amino acid transp (619 aa)
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Smith-Waterman score: 1502; 40.8% identity (64.9% similar) in 679 aa overlap (47-699:26-610)
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pF1KE1 VIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFINGKY--W-----------AE
...: ..:::...: ..:.. .:: : :.::.: :..: : ::
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NP_001 GSMFPMPRVIYAMAEDGLLFRVLARIHTGTRTPIIATVVSGIIAAFMAFLFKLTDLVDLM
360 370 380 390 400 410
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pF1KE1 SIGTLLAYTLVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSEGD
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NP_001 SIGTLLAYSLVSICVLILRYQPDQET--------------KTGEEVELQEEA--------
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pF1KE1 EFSGPATNTCGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIYLI
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NP_001 --------------------------------------------ITT-----ESEKLTLW
450
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pF1KE1 KLKKLIGPHYYTMRIRLGLPGKMDRPTAATGHTVTICVLLLFILMFIFCSFII-FGSDYI
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NP_001 GL-------FFPLN---------SIPTPLSGQIVYVCSSLLAVLLTALCLVLAQWSVPLL
460 470 480 490 500
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pF1KE1 SEQSWWAILLVVLMVLLISTLVFVILQQPENPKKLPYMAPCLPFVPAFAMLVNIYLMLKL
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NP_001 SGDLLWTAV-VVLLLLLIIGIIVVIWRQPQSSTPLHFKVPALPLLPLMSIFVNIYLMMQM
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pF1KE1 STITWIRFAVWCFVGLLIYFGYGIWNSTLEISAREEALHQSTYQRYDVDDPFSVEEGFSY
.. :: ::.:: ..:. ::::::: .: ::.. . . ..: . :.:
NP_001 TAGTWARFGVWMLIGFAIYFGYGIQHSLEEIKSNQPS-RKSRAKTVDLDPGTLYVHSV
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XP_016 AVARENAGPAIVISFLIAALASVLAGLCYGEFGARVPKT-GSAYLYSYVTVGELWAFITG
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>>XP_005266564 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affinity c (629 aa)
initn: 1705 init1: 812 opt: 812 Z-score: 933.6 bits: 183.2 E(85289): 2.9e-45
Smith-Waterman score: 1597; 42.9% identity (69.8% similar) in 658 aa overlap (47-677:26-608)
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pF1KE1 AAWYAMHSRILRTKPVESMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLISLGVGSCVGTGMYVVSG
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XP_005 AVARENAGPAIVISFLIAALASVLAGLCYGEFGARVPKT-GSAYLYSYVTVGELWAFITG
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pF1KE1 WNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNGLGKGEESYPDLLALLIA
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XP_005 LILTGLLTLGVKESAMVNKIFTCINVLVLGFIMVSG--FVKGSVKNWQLTEEDFGNTSGR
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pF1KE1 --------EGQ-----FLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAI
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XP_005 LCLNNDTKEGKPGVGGFMPFGFSGVLSGAATCFYAFVGFDCIATTGEEVKNPQKAIPVGI
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XP_005 LLGSMFPMPRVIYAMAEDGLLFKFLANVNDRTKTPIIATLASGAVAAVMAFLFDLKDLVD
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XP_005 LMSIGTLLAYSLVAACVLVLRYQPEQP--NLVYQMA----------------------ST
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.::.. :: .. .: : .:... : . :.:
XP_005 SDELD-PADQN----ELASTNDSQL-----------------GFLP--------EAE---
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XP_005 LDQGTWVRFAVWMLIGFIIYFGYGLWHSEEASLDADQARTPDGNLDQCK
590 600 610 620
>>NP_003036 (OMIM: 104615) high affinity cationic amino (629 aa)
initn: 1705 init1: 812 opt: 812 Z-score: 933.6 bits: 183.2 E(85289): 2.9e-45
Smith-Waterman score: 1597; 42.9% identity (69.8% similar) in 658 aa overlap (47-677:26-608)
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XP_016 LTKGALWAVFLLAGSALLCAVVTGVIWRQPESKTKLSFKTVLLNYWNRRHCHGLKPPPVS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]