FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1081, 1493 aa 1>>>pF1KE1081 1493 - 1493 aa - 1493 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2609+/-0.00122; mu= 4.6047+/- 0.073 mean_var=227.4480+/-45.910, 0's: 0 Z-trim(108.5): 62 B-trim: 12 in 1/50 Lambda= 0.085042 statistics sampled from 10173 (10225) to 10173 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16 Scan time: 4.900 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1812.1 PLEKHH2 gene_id:130271|Hs108|chr2 (1493) 9831 1220.9 0 CCDS45128.1 PLEKHH1 gene_id:57475|Hs108|chr14 (1364) 3938 497.8 9e-140 >>CCDS1812.1 PLEKHH2 gene_id:130271|Hs108|chr2 (1493 aa) initn: 9831 init1: 9831 opt: 9831 Z-score: 6529.7 bits: 1220.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9831; 99.6% identity (99.9% similar) in 1493 aa overlap (1-1493:1-1493) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 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CCDS45 ---SSTV--HSGET-VEAKPLQPHL-----------------GRESPPHQPCMKLLTFRC 250 260 270 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 QEAQWKALNSPLGKGNSELSKKEQDSSSDELNKKFQSQRLDYSSSSSEANTPSPILTPAL . :.: :.: .:: .. CCDS45 SSASW-------GEG------------------LVTAQR-------------------GM 280 290 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 MPKHPNSLSGKGTQLVPSSHLPPPKLRIPNVFSISAALAKRHLSQPQLSSD---RMFGTN .: .: : :.: : ::.: :.. : ::::: ::::.. :. . . CCDS45 LPGTKTSAREGG----PGSSLTLPKVRAPGTPRDSIQLAKRHHSQPQVGHGHFGRVVNIE 300 310 320 330 340 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 RNAISMIRPLRPQETDLDLVDGDSTEVLENMDTSCDDGLFSYDSLDSPNSDDQEHCDSAK .:.: ..: : . . . : .: :. : . . .::.. : . CCDS45 TEAFSALHPSGLPELESRARSREEPEKME-MEEPPPAG--KNEERESPKALGAE----LE 350 360 370 380 390 400 540 550 560 570 580 590 pF1KE1 KVAY-SKPPTPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRMSEAFNMESVNKNSAATLSYTTSGLYTS .: .::::::::.: :::::::::: ::.:.:. .. ... . .. : ... CCDS45 EVELGNKPPTPPLHQFSSWESRIYAVATSGMRLSDMSPRSNTACCASSPPALVSPGSFSG 410 420 430 440 450 460 600 610 620 630 640 pF1KE1 LIYKNMTTPVYTTLKGKATQISSSPFLDDSSGSEEEDSSRSSSRTS--ESDSRSRSGPGS :.:::.:.::::.:::.:::::. ::.:.::::... ::..: : : :.::. :: :: CCDS45 LVYKNVTVPVYTALKGRATQISNMPFMDESSGSDDDCSSQASFRISVPSSESRKTSGLGS 470 480 490 500 510 520 650 660 670 680 690 700 pF1KE1 PRAMKRGVSLSSVASESDYAIPPDAYSTDTEYSQPEQKLPKTCSSSSDN-G-KNEPLEKS :::.:::::.::..::.:::::::: : :..::.::.:: .: : :.:. : .: :::: CCDS45 PRAIKRGVSMSSLSSEGDYAIPPDACSLDSDYSEPEHKLQRTSSYSTDGLGLGGESLEKS 530 540 550 560 570 580 710 720 730 740 750 760 pF1KE1 GYLLKMSGKVKSWKRRWFVLKGCELPYYKSPSDVIRKPQGHIELSASCSILRGDNKQTVQ ::::::...::.::::::::. .. ::::::::::::::...:.. :.:.::...:: : CCDS45 GYLLKMGSQVKTWKRRWFVLRQGQIMYYKSPSDVIRKPQGQVDLNSRCQIVRGEGSQTFQ 590 600 610 620 630 640 770 780 790 800 810 820 pF1KE1 LTTEKHTYYLTADSPNILEEWIKVLQNALRVQAANPLSLQPEG-KPTMKGLLTKVKHGYS : .::.:::::::::..:::::.:::. :.:::..: .: : :::.:: :::::::.: CCDS45 LISEKKTYYLTADSPSLLEEWIRVLQSLLKVQATGPPALLRGGTKPTVKGWLTKVKHGHS 650 660 670 680 690 700 830 840 850 860 870 880 pF1KE1 KRVWCTLIGKTLYYFRSQEDKFPLGQIKLWEVKVEEVDRSCDSDEDYEASG-RSLLSTHY : :::.:.:: .::.::.::: ::: . . ....:::::::::::::::.: : :::.: CCDS45 KVVWCALVGKIFYYYRSHEDKRPLGCLPVRDAHIEEVDRSCDSDEDYEAGGTRRLLSSHC 710 720 730 740 750 760 890 900 910 920 930 940 pF1KE1 TIVIHPKDQGPTYLLIGSKHEKDTWLYHLTVAAGSNNVNVGSEFEQLVCKLLNIDGEPSS :.:::: ...:::::::.::::::::::::::::.....::. .:::. ::.. .:.:.: CCDS45 TLVIHPTEHSPTYLLIGTKHEKDTWLYHLTVAAGGSSAKVGTAYEQLIGKLMDGEGDPDS 770 780 790 800 810 820 950 960 970 980 990 1000 pF1KE1 QIWRHPTLCHSKEGIISPLTTLPSEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQS .:::: ::.::.:. . :::::::::::::.::::.::::::. :.. ..:::.::::. 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CCDS45 ENALVWIAVNEDGVSILDHNTMQVHITYPYSSVTTFGGCRDDFMLVIRSIPDKSSGKSHI 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE1 EKLLFAMAKPEILEITLLIASYINNFHQQKAAFHHLSAPALLSAQTRGPQARMMGSQPLL :::.: :: :.: : :...:::.: : .. . :. . : .. : : . CCDS45 EKLIFRMAAPKIAEATFIMASYMN--HCTTTVNPPTNPPG--ACQLW----ELDGRQFFS 1310 1320 1330 1340 1350 1490 pF1KE1 SSSRPTKGPTLL : : ::::::: CCDS45 SVSCATKGPTLL 1360 1493 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 23:16:52 2016 done: Sat Nov 5 23:16:53 2016 Total Scan time: 4.900 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]