FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1086, 2644 aa
1>>>pF1KE1086 2644 - 2644 aa - 2644 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2438+/-0.00146; mu= 20.9439+/- 0.087
mean_var=73.1617+/-14.494, 0's: 0 Z-trim(97.6): 38 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.149945
statistics sampled from 5156 (5175) to 5156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.469), E-opt: 0.2 (0.155), width: 16
Scan time: 4.030
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS3124.1 ATR gene_id:545|Hs109|chr3 (2644) 17465 3789.2 0
CCDS31669.1 ATM gene_id:472|Hs109|chr11 (3056) 739 171.0 9.2e-41
CCDS127.1 MTOR gene_id:2475|Hs109|chr1 (2549) 625 146.3 2.1e-33
CCDS45430.1 SMG1 gene_id:23049|Hs109|chr16 (3661) 485 116.0 3.8e-24
CCDS75735.1 PRKDC gene_id:5591|Hs109|chr8 (4128) 306 77.3 1.9e-12
>>CCDS3124.1 ATR gene_id:545|Hs109|chr3 (2644 aa)
initn: 17465 init1: 17465 opt: 17465 Z-score: 20401.2 bits: 3789.2 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 17465; 100.0% identity (100.0% similar) in 2644 aa overlap (1-2644:1-2644)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGEHGLELASMIPALRELGSATPEEYNTVVQKPRQILCQFIDRILTDVNVVAVELVKKTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGEHGLELASMIPALRELGSATPEEYNTVVQKPRQILCQFIDRILTDVNVVAVELVKKTD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SQPTSVMLLDFIQHIMKSSPLMFVNVSGSHEAKGSCIEFSNWIITRLLRIAATPSCHLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SQPTSVMLLDFIQHIMKSSPLMFVNVSGSHEAKGSCIEFSNWIITRLLRIAATPSCHLLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KKICEVICSLLFLFKSKSPAIFGVLTKELLQLFEDLVYLHRRNVMGHAVEWPVVMSRFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KKICEVICSLLFLFKSKSPAIFGVLTKELLQLFEDLVYLHRRNVMGHAVEWPVVMSRFLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 QLDEHMGYLQSAPLQLMSMQNLEFIEVTLLTVLTRIIAIVFFRRQELLLWQIGCVLLEYG
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLDEHMGYLQSAPLQLMSMQNLEFIEVTLLMVLTRIIAIVFFRRQELLLWQIGCVLLEYG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SPKIKSLAISFLTELFQLGGLPAQPASTFFSSFLELLKHLVEMDTDQLKLYEEPLSKLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SPKIKSLAISFLTELFQLGGLPAQPASTFFSSFLELLKHLVEMDTDQLKLYEEPLSKLIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TLFPFEAEAYRNIEPVYLNMLLEKLCVMFEDGVLMRLKSDLLKAALCHLLQYFLKFVPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TLFPFEAEAYRNIEPVYLNMLLEKLCVMFEDGVLMRLKSDLLKAALCHLLQYFLKFVPAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YESALQVRKVYVRNICKALLDVLGIEVDAEYLLGPLYAALKMESMEIIEEIQCQTQQENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YESALQVRKVYVRNICKALLDVLGIEVDAEYLLGPLYAALKMESMEIIEEIQCQTQQENL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SSNSDGISPKRRRLSSSLNPSKRAPKQTEEIKHVDMNQKSILWSALKQKAESLQISLEYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSNSDGISPKRRRLSSSLNPSKRAPKQTEEIKHVDMNQKSILWSALKQKAESLQISLEYS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 GLKNPVIEMLEGIAVVLQLTALCTVHCSHQNMNCRTFKDCQHKSKKKPSVVITWMSLDFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLKNPVIEMLEGIAVVLQLTALCTVHCSHQNMNCRTFKDCQHKSKKKPSVVITWMSLDFY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 TKVLKSCRSLLESVQKLDLEATIDKVVKIYDALIYMQVNSSFEDHILEDLCGMLSLPWIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TKVLKSCRSLLESVQKLDLEATIDKVVKIYDALIYMQVNSSFEDHILEDLCGMLSLPWIY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 SHSDDGCLKLTTFAANLLTLSCRISDSYSPQAQSRCVFLLTLFPRRIFLEWRTAVYNWAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHSDDGCLKLTTFAANLLTLSCRISDSYSPQAQSRCVFLLTLFPRRIFLEWRTAVYNWAL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 QSSHEVIRASCVSGFFILLQQQNSCNRVPKILIDKVKDDSDIVKKEFASILGQLVCTLHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QSSHEVIRASCVSGFFILLQQQNSCNRVPKILIDKVKDDSDIVKKEFASILGQLVCTLHG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 MFYLTSSLTEPFSEHGHVDLFCRNLKATSQHECSSSQLKASVCKPFLFLLKKKIPSPVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFYLTSSLTEPFSEHGHVDLFCRNLKATSQHECSSSQLKASVCKPFLFLLKKKIPSPVKL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 AFIDNLHHLCKHLDFREDETDVKAVLGTLLNLMEDPDKDVRVAFSGNIKHILESLDSEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFIDNLHHLCKHLDFREDETDVKAVLGTLLNLMEDPDKDVRVAFSGNIKHILESLDSEDG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 FIKELFVLRMKEAYTHAQISRNNELKDTLILTTGDIGRAAKGDLVPFALLHLLHCLLSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FIKELFVLRMKEAYTHAQISRNNELKDTLILTTGDIGRAAKGDLVPFALLHLLHCLLSKS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 ASVSGAAYTEIRALVAAKSVKLQSFFSQYKKPICQFLVESLHSSQMTALPNTPCQNADVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ASVSGAAYTEIRALVAAKSVKLQSFFSQYKKPICQFLVESLHSSQMTALPNTPCQNADVR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 KQDVAHQREMALNTLSEIANVFDFPDLNRFLTRTLQVLLPDLAAKASPAASALIRTLGKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KQDVAHQREMALNTLSEIANVFDFPDLNRFLTRTLQVLLPDLAAKASPAASALIRTLGKQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 LNVNRREILINNFKYIFSHLVCSCSKDELERALHYLKNETEIELGSLLRQDFQGLHNELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNVNRREILINNFKYIFSHLVCSCSKDELERALHYLKNETEIELGSLLRQDFQGLHNELL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 LRIGEHYQQVFNGLSILASFASSDDPYQGPRDIISPELMADYLQPKLLGILAFFNMQLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRIGEHYQQVFNGLSILASFASSDDPYQGPRDIISPELMADYLQPKLLGILAFFNMQLLS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE1 SSVGIEDKKMALNSLMSLMKLMGPKHVSSVRVKMMTTLRTGLRFKDDFPELCCRAWDCFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSVGIEDKKMALNSLMSLMKLMGPKHVSSVRVKMMTTLRTGLRFKDDFPELCCRAWDCFV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 RCLDHACLGSLLSHVIVALLPLIHIQPKETAAIFHYLIIENRDAVQDFLHEIYFLPDHPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RCLDHACLGSLLSHVIVALLPLIHIQPKETAAIFHYLIIENRDAVQDFLHEIYFLPDHPE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE1 LKKIKAVLQEYRKETSESTDLQTTLQLSMKAIQHENVDVRIHALTSLKETLYKNQEKLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKKIKAVLQEYRKETSESTDLQTTLQLSMKAIQHENVDVRIHALTSLKETLYKNQEKLIK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE1 YATDSETVEPIISQLVTVLLKGCQDANSQARLLCGECLGELGAIDPGRLDFSTTETQGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YATDSETVEPIISQLVTVLLKGCQDANSQARLLCGECLGELGAIDPGRLDFSTTETQGKD
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE1 FTFVTGVEDSSFAYGLLMELTRAYLAYADNSRAQDSAAYAIQELLSIYDCREMETNGPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FTFVTGVEDSSFAYGLLMELTRAYLAYADNSRAQDSAAYAIQELLSIYDCREMETNGPGH
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE1 QLWRRFPEHVREILEPHLNTRYKSSQKSTDWSGVKKPIYLSKLGSNFAEWSASWAGYLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLWRRFPEHVREILEPHLNTRYKSSQKSTDWSGVKKPIYLSKLGSNFAEWSASWAGYLIT
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE1 KVRHDLASKIFTCCSIMMKHDFKVTIYLLPHILVYVLLGCNQEDQQEVYAEIMAVLKHDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KVRHDLASKIFTCCSIMMKHDFKVTIYLLPHILVYVLLGCNQEDQQEVYAEIMAVLKHDD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE1 QHTINTQDIASDLCQLSTQTVFSMLDHLTQWARHKFQALKAEKCPHSKSNRNKVDSMVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QHTINTQDIASDLCQLSTQTVFSMLDHLTQWARHKFQALKAEKCPHSKSNRNKVDSMVST
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE1 VDYEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQEHLGFLQKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VDYEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQEHLGFLQKLY
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE1 AAMHEPDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIHYHGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AAMHEPDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIHYHGVV
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE1 KSMLGLGQLSTVITQVNGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAADGKSTTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KSMLGLGQLSTVITQVNGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAADGKSTTW
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE1 SVRLGQLLLSAKKRDITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGYEYIVRLHMLCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SVRLGQLLLSAKKRDITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGYEYIVRLHMLCEL
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE1 EHSIKPLFQHSPGDSSQEDSLNWVARLEMTQNSYRAKEPILALRRALLSLNKRPDYNEMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EHSIKPLFQHSPGDSSQEDSLNWVARLEMTQNSYRAKEPILALRRALLSLNKRPDYNEMV
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE1 GECWLQSARVARKAGHHQTAYNALLNAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQKGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GECWLQSARVARKAGHHQTAYNALLNAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQKGV
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE1 ELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRFMEETANFESNAIMKKYKDVTACLPEWEDGHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRFMEETANFESNAIMKKYKDVTACLPEWEDGHF
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE1 YLAKYYDKLMPMVTDNKMEKQGDLIRYIVLHFGRSLQYGNQFIYQSMPRMLTLWLDYGTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YLAKYYDKLMPMVTDNKMEKQGDLIRYIVLHFGRSLQYGNQFIYQSMPRMLTLWLDYGTK
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE1 AYEWEKAGRSDRVQMRNDLGKINKVITEHTNYLAPYQFLTAFSQLISRICHSHDEVFVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AYEWEKAGRSDRVQMRNDLGKINKVITEHTNYLAPYQFLTAFSQLISRICHSHDEVFVVL
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE1 MEIIAKVFLAYPQQAMWMMTAVSKSSYPMRVNRCKEILNKAIHMKKSLEKFVGDATRLTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEIIAKVFLAYPQQAMWMMTAVSKSSYPMRVNRCKEILNKAIHMKKSLEKFVGDATRLTD
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE1 KLLELCNKPVDGSSSTLSMSTHFKMLKKLVEEATFSEILIPLQSVMIPTLPSILGTHANH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KLLELCNKPVDGSSSTLSMSTHFKMLKKLVEEATFSEILIPLQSVMIPTLPSILGTHANH
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE1 ASHEPFPGHWAYIAGFDDMVEILASLQKPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKDCRLME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ASHEPFPGHWAYIAGFDDMVEILASLQKPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKDCRLME
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE1 FNSLINKCLRKDAESRRRELHIRTYAVIPLNDECGIIEWVNNTAGLRPILTKLYKEKGVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FNSLINKCLRKDAESRRRELHIRTYAVIPLNDECGIIEWVNNTAGLRPILTKLYKEKGVY
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE1 MTGKELRQCMLPKSAALSEKLKVFREFLLPRHPPIFHEWFLRTFPDPTSWYSSRSAYCRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTGKELRQCMLPKSAALSEKLKVFREFLLPRHPPIFHEWFLRTFPDPTSWYSSRSAYCRS
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KE1 TAVMSMVGYILGLGDRHGENILFDSLTGECVHVDFNCLFNKGETFEVPEIVPFRLTHNMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TAVMSMVGYILGLGDRHGENILFDSLTGECVHVDFNCLFNKGETFEVPEIVPFRLTHNMV
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KE1 NGMGPMGTEGLFRRACEVTMRLMRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEWSKPVKGHSKAPLNET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NGMGPMGTEGLFRRACEVTMRLMRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEWSKPVKGHSKAPLNET
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KE1 GEVVNEKAKTHVLDIEQRLQGVIKTRNRVTGLPLSIEGHVHYLIQEATDENLLCQMYLGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GEVVNEKAKTHVLDIEQRLQGVIKTRNRVTGLPLSIEGHVHYLIQEATDENLLCQMYLGW
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KE1 TPYM
::::
CCDS31 TPYM
>>CCDS31669.1 ATM gene_id:472|Hs109|chr11 (3056 aa)
initn: 787 init1: 456 opt: 739 Z-score: 845.5 bits: 171.0 E(33420): 9.2e-41
Smith-Waterman score: 1223; 22.0% identity (53.1% similar) in 2138 aa overlap (737-2644:993-3056)
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 FASILGQLVCTLHGMFYLTSSLTEPFSEHGHVDLFCRNLKATSQHECSSSQLKA---SVC
:: .:: ... .. . .. .:
CCDS31 MEDVLELLKPLSNVCSLYRRDQDVCKTILNHVLHVVKNLGQSNMDSENTRDAQGQFLTVI
970 980 990 1000 1010 1020
770 780 790 800 810
pF1KE1 KPFLFLLK-KKIPSPVKLAFIDNLHHLCKHLDFREDETDVKAVLG-------TLLNLMED
: : : .: :..:... :. : . . .. . :.: .. ... :
CCDS31 GAFWHLTKERKYIFSVRMALVNCLKTLLEADPY--SKWAILNVMGKDFPVNEVFTQFLAD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
820 830 840 850 860 870
pF1KE1 PDKDVRVAFSGNIKHILESLDSEDGFIKELFVLRMKE-AYTHAQISRNNELKDTLILTTG
..::. . .:...... .... . . . :.... :. .: .. .. ...
CCDS31 NHHQVRMLAAESINRLFQDTKGDSSRLLKALPLKLQQTAFENAYLKAQEGMRE-------
1090 1100 1110 1120 1130
880 890 900 910 920 930
pF1KE1 DIGRAAKGDLVPFALLHLLHCLLSKSASV-SGAAYTEIRALVA-AKSVKLQSFFSQYKKP
....:.. . . . ::. : : : . : .:: : :::: ... . :
CCDS31 -MSHSAENPETLDEIYNRKSVLLTLIAVVLSCSPICEKQALFALCKSVKENGLEPHLVKK
1140 1150 1160 1170 1180 1190
940 950 960 970 980 990
pF1KE1 ICQFLVESLHSSQMTALPNTPCQNADVRKQDVAHQREMALNTLSEIANVFDFPDLNRFLT
. . . :.. .. . . . .. .. .. :. :... : .... ... :
CCDS31 VLEKVSETFGYRRLEDFMASHLDYLVLEWLNL-QDTEYNLSSFPFI--LLNYTNIEDFYR
1200 1210 1220 1230 1240
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE1 RTLQVLLPDLAAKASPAASALIRTLGKQLNVNRREILINNFKYIFSHLV-----------
.::.: :. .. ......:.. . . .: . : :. ...
CCDS31 SCYKVLIPHLVIRSHFDE---VKSIANQIQEDWKSLLTDCFPKILVNILPYFAYEGTRDS
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE1 -CSCSKDELERALHYLKNETEI--ELGSLLRQDFQGLHNELLLRIGEHYQQVFNGLSILA
. ... .. .::.:. . .. :. ... . :::. . : .. . . :
CCDS31 GMAQQRETATKVYDMLKSENLLGKQIDHLFISNLPEIVVELLMTLHEPANSSASQSTDLC
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.:... :: .: . : . : . . :: .:: ... . : . ..: ..
CCDS31 DFSGDLDPAPNPPHFPSHVIKATFAYISNCHKTKLKSILEILSKSPDSYQKILLAICEQA
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:.... ... :. :. .: . . :: : ... .. :
CCDS31 AETNNVYKKHRILKIYHLFVSLLLKDIKSGLGGAWAFVLRDVIYTLIHYINQRPSCIMDV
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::: . . : .: .: :::. :.::.. : :.. ...::.
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:.:.: ... : .: ::: .: .. . :. . . . :. .. ..
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.:...: .:.. : .:.: : :.... . :. .::. ::. . : ...
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:.: .:. ..: .. . : ... .. ::..:. . . . :.: ..
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: : . : . . :. :. : : . . .. . .. .. . .
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: . : :: :. ::... .:: ..:. .. : . . . :.: .: . .:
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..: . : . ::. .: . . .. .: : : . : :.. ..: .
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.:.. : :. . : . . :.. : . :. ... .:. :
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pF1KE1 -FLQKLYAAMHEPDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQI
.: ..: .. :::.. : .. . .: . . :::. . : . :: . :..
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. :..... .:: . . ..:. . ..: ::. . .:::. ::: . ..
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. ..:.. : . : : . :....::.::: .:.... . :.: : : . :
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. .... :: .. . .:: . : :.. :. ..: .:
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.:. .:.: . :: .:.. .. : .: : : : . . . . : .. ::
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. .::. : . .. . ::. . ::.. :... .. ...
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: :..: :. .:. : :: . :
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