FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1090, 595 aa
1>>>pF1KE1090 595 - 595 aa - 595 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2611+/-0.000882; mu= 20.4500+/- 0.053
mean_var=84.2531+/-16.659, 0's: 0 Z-trim(107.8): 25 B-trim: 66 in 1/49
Lambda= 0.139727
statistics sampled from 9783 (9808) to 9783 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 3.360
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31930.1 P2RX2 gene_id:22953|Hs108|chr12 ( 497) 799 171.1 3e-42
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CCDS54504.1 P2RX6 gene_id:9127|Hs108|chr22 ( 415) 752 161.6 1.9e-39
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CCDS31933.1 P2RX2 gene_id:22953|Hs108|chr12 ( 447) 702 151.5 2.1e-36
CCDS31935.1 P2RX2 gene_id:22953|Hs108|chr12 ( 379) 699 150.8 2.9e-36
CCDS31934.1 P2RX2 gene_id:22953|Hs108|chr12 ( 399) 666 144.2 3e-34
CCDS56014.1 P2RX5 gene_id:5026|Hs108|chr17 ( 398) 640 139.0 1.1e-32
CCDS11035.1 P2RX5 gene_id:5026|Hs108|chr17 ( 397) 630 136.9 4.6e-32
CCDS61286.1 P2RX2 gene_id:22953|Hs108|chr12 ( 370) 369 84.3 3e-16
>>CCDS9213.1 P2RX7 gene_id:5027|Hs108|chr12 (595 aa)
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Smith-Waterman score: 4176; 99.7% identity (100.0% similar) in 595 aa overlap (1-595:1-595)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPACCSCSDVFQYETNKVTRIQSMNYGTIKWFFHVIIFSYVCFALVSDKLYQRKEPVISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MPACCSCSDVFQYETNKVTRIQSMNYGTIKWFFHVIIFSYVCFALVSDKLYQRKEPVISS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 VHTKVKGIAEVKEEIVENGVKKLVHSVFDTADYTFPLQGNSFFVMTNFLKTEGQEQRLCP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS92 EYPTRRTLCSSDRGCKKGWMDPQSKGIQTGRCVVYEGNQKTCEVSAWCPIEAVEEAPRPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LLNSAENFTVLIKNNIDFPGHNYTTRNILPGLNITCTFHKTQNPQCPIFRLGDIFRETGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDRWFHHCHPKYSFRRLDDKTTNVSLYPGYNFRYAKYYK
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 NFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDRWFHHCRPKYSFRRLDDKTTNVSLYPGYNFRYAKYYK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ENNVEKRTLIKVFGIRFDILVFGTGGKFDIIQLVVYIGSTLSYFGLAAVFIDFLIDTYSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 ENNVEKRTLIKVFGIRFDILVFGTGGKFDIIQLVVYIGSTLSYFGLAAVFIDFLIDTYSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NCCRSHIYPWCKCCQPCVVNEYYYRKKCESIVEPKPTLKYVSFVDESHIRMVNQQLLGRS
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CCDS92 NCCRSHIYPWCKCCQPCVVNEYYYRKKCESIVEPKPTLKYVSFVDESHIRMVNQQLLGRS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LQDVKGQEVPRPAMDFTDLSRLPLALHDTPPIPGQPEEIQLLRKEATPRSRDSPVWCQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LQDVKGQEVPRPAMDFTDLSRLPLALHDTPPIPGQPEEIQLLRKEATPRSRDSPVWCQCG
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pF1KE1 SCLPSQLPESHRCLEELCCRKKPGACITTSELFRKLVLSRHVLQFLLLYQEPLLALDVDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SCLPSQLPESHRCLEELCCRKKPGACITTSELFRKLVLSRHVLQFLLLYQEPLLALDVDS
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550 560 570 580 590
pF1KE1 TNSRLRHCAYRCYATWRFGSQDMADFAILPSCCRWRIRKEFPKSEGQYSGFKSPY
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CCDS92 TNSRLRHCAYRCYATWRFGSQDMADFAILPSCCRWRIRKEFPKSEGQYSGFKSPY
550 560 570 580 590
>>CCDS9214.1 P2RX4 gene_id:5025|Hs108|chr12 (388 aa)
initn: 1061 init1: 437 opt: 1132 Z-score: 1236.2 bits: 238.1 E(32554): 1.6e-62
Smith-Waterman score: 1132; 46.4% identity (73.7% similar) in 377 aa overlap (1-368:1-366)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MPACCSC--SDVFQYETNKVTRIQSMNYGTIKWFFHVIIFSYVC-FALVSDKLYQRKEPV
: .::. . .:.:.: ... :.: . : .. ...:..:: ...: .: ::. . :
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10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 ISSVHTKVKGIAEVKEEIVENGVKKLVHSVFDTADYTFPLQG-NSFFVMTNFLKTEGQEQ
.::: :::::.: : : ..:: ..:.:::..: : ::.::::: . : .: :
CCDS92 VSSVTTKVKGVA------VTN-TSKLGFRIWDVADYVIPAQEENSLFVMTNVILTMNQTQ
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 RLCPEYPTRRTLCSSDRGCKKGWMDPQSKGIQTGRCVVHEGNQKTCEVSAWCPIEAVEEA
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CCDS92 GLCPEIPDATTVCKSDASCTAGSAGTHSNGVSTGRCVAFNGSVKTCEVAAWCPVEDDTHV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PRPALLNSAENFTVLIKNNIDFPGHNYTTRNILPGLNIT----CTFHKTQNPQCPIFRLG
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CCDS92 PQPAFLKAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKRNILPNITTTYLKSCIYDAKTDPFCPIFRLG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDRWFHHCHPKYSFRRLDDKTTNVSLYPGYN
: ...: .:.:.:..::::::.. ::::::: : :.::::::: . .. .. ::::
CCDS92 KIVENAGHSFQDMAVEGGIMGIQVNWDCNLDRAASLCLPRYSFRRLDTRDVEHNVSPGYN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FRYAKYYKE-NNVEKRTLIKVFGIRFDILVFGTGGKFDIIQLVVYIGSTLSYFGLAAVFI
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CCDS92 FRFAKYYRDLAGNEQRTLIKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMINIGSGLALLGMATVLC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 DFLIDTYSSNCCRSHIYPWCKCCQPCVVNEYYYRKKCESIVEPKPTLKYVSFVDESHIRM
:... : : ....:
CCDS92 DIIV-LY---CMKKRLYYREKKYKYVEDYEQGLASELDQ
360 370 380
>>CCDS58282.1 P2RX4 gene_id:5025|Hs108|chr12 (404 aa)
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Smith-Waterman score: 1108; 44.8% identity (71.0% similar) in 393 aa overlap (1-368:1-382)
10 20 30 40
pF1KE1 MPACCSC--SDVFQYETNKVTRIQSMNYGTIKWFFHVIIFSYV--CF-------------
: .::. . .:.:.: ... :.: . : .. ...:..:: :.
CCDS58 MAGCCAALAAFLFEYDTPRIVLIRSRKVGLMNRAVQLLILAYVIGCYHPHLAEVEMESPR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 --ALVSDKLYQRKEPVISSVHTKVKGIAEVKEEIVENGVKKLVHSVFDTADYTFPLQG-N
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CCDS58 RWVFVWEKGYQETDSVVSSVTTKVKGVA------VTN-TSKLGFRIWDVADYVIPAQEEN
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pF1KE1 SFFVMTNFLKTEGQEQRLCPEYPTRRTLCSSDRGCKKGWMDPQSKGIQTGRCVVHEGNQK
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CCDS58 SLFVMTNVILTMNQTQGLCPEIPDATTVCKSDASCTAGSAGTHSNGVSTGRCVAFNGSVK
120 130 140 150 160 170
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pF1KE1 TCEVSAWCPIEAVEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIDFPGHNYTTRNILPGLNIT----C
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CCDS58 TCEVAAWCPVEDDTHVPQPAFLKAAENFTLLVKNNIWYPKFNFSKRNILPNITTTYLKSC
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 TFHKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDRWFHHCHPKYSFR
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CCDS58 IYDAKTDPFCPIFRLGKIVENAGHSFQDMAVEGGIMGIQVNWDCNLDRAASLCLPRYSFR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 RLDDKTTNVSLYPGYNFRYAKYYKE-NNVEKRTLIKVFGIRFDILVFGTGGKFDIIQLVV
::: . .. .. ::::::.::::.. . :.:::::..::::::.::: .:::::: ..
CCDS58 RLDTRDVEHNVSPGYNFRFAKYYRDLAGNEQRTLIKAYGIRFDIIVFGKAGKFDIIPTMI
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 YIGSTLSYFGLAAVFIDFLIDTYSSNCCRSHIYPWCKCCQPCVVNEYYYRKKCESIVEPK
::: :. .:.:.:. :... : : ....:
CCDS58 NIGSGLALLGMATVLCDIIV-LY---CMKKRLYYREKKYKYVEDYEQGLASELDQ
360 370 380 390 400
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pF1KE1 PTLKYVSFVDESHIRMVNQQLLGRSLQDVKGQEVPRPAMDFTDLSRLPLALHDTPPIPGQ
>>CCDS11040.1 P2RX1 gene_id:5023|Hs108|chr17 (399 aa)
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Smith-Waterman score: 978; 43.2% identity (71.6% similar) in 352 aa overlap (10-355:13-353)
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.:.:.: ... ... . :.: ....... :: .... .: :: .
CCDS11 MARRFQEELAAFLFEYDTPRMVLVRNKKVGVIFRLIQLVVLVYVIGWVFLYEKGYQTSSG
10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 VISSVHTKVKGIAEVKEEIVENGVKKLVHSVFDTADYTFPLQG-NSFFVMTNFLKTEGQE
.:::: .:.::.: .. . : .:.:.:::.:: :: ::: :::::. : :
CCDS11 LISSVSVKLKGLAVTQ-------LPGLGPQVWDVADYVFPAQGDNSFVVMTNFIVTPKQT
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pF1KE1 QRLCPEYPTRRTLCSSDRGCKKGWMDPQSKGIQTGRCVVHEGNQKTCEVSAWCPIEAVEE
: : :.: . .:. : :: : ...::.::.::. . . ::::. .:::.:. ..
CCDS11 QGYCAEHP-EGGICKEDSGCTPGKAKRKAQGIRTGKCVAFNDTVKTCEIFGWCPVEVDDD
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pF1KE1 APRPALLNSAENFTVLIKNNIDFPGHNYTTRNILPGLNI----TCTFHKTQNPQCPIFRL
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CCDS11 IPRPALLREAENFTLFIKNSISFPRFKVNRRNLVEEVNAAHMKTCLFHKTLHPLCPVFQL
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: . .:.:.::: .: .::..:: : : :.:: .::.: : :. : .. .: ::.
CCDS11 GYVVQESGQNFSTLAEKGGVVGITIDWHCDLDWHVRHCRPIYEFHGLYEEK---NLSPGF
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:::.:... ::... : :.::::::::::: : .:::::: .. ::: .. ::.:.:.
CCDS11 NFRFARHFVENGTNYRHLFKVFGIRFDILVDGKAGKFDIIPTMTTIGSGIGIFGVATVLC
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:.:.
CCDS11 DLLLLHILPKRHYYKQKKFKYAEDMGPGAAERDLAATSSTLGLQENMRTS
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>>CCDS31931.1 P2RX2 gene_id:22953|Hs108|chr12 (471 aa)
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Smith-Waterman score: 831; 38.5% identity (66.2% similar) in 382 aa overlap (7-376:21-384)
10 20 30 40
pF1KE1 MPACCSC-SDVFQYETNKVTRIQSMNYGTIKWFFHVIIFSY-VCFA
: : ...::: :: ... :.. ...:. : : ..
CCDS31 MAAAQPKYPAGATARRLARGCWSALWDYETPKVIVVRNRRLGVLYRAVQLLILLYFVWYV
10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 LVSDKLYQRKE--PVISSVHTKVKGIAEVKEEIVENGVKKLVHSVFDTADYTFPLQGNSF
.. .: ::..: : ::. ::::::. . :.:.:. .:. : .:.:
CCDS31 FIVQKSYQESETGPE-SSIITKVKGITTSE------------HKVWDVEEYVKPPEGGSV
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: ..: :..: : ::: .. . : :: : : .: ..:..::::: ..: .
CCDS31 FSIITRVEATHSQTQGTCPESIRVHNATCLSDADCVAGELDMLGNGLRTGRCVPYYQGPS
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 KTCEVSAWCPIEAVEEAPRPALLNS-AENFTVLIKNNIDFPGHNYTTRNI---LPGLNIT
::::: .:::.: . : .:.. : :::.::::.: .: ... :: :
CCDS31 KTCEVFGWCPVE--DGASVSQFLGTMAPNFTILIKNSIHYPKFHFSKGNIADRTDGYLKR
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 CTFHKTQNPQCPIFRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDRWFHHCHPKYSF
::::.... ::::.:: : ...:..:...: .::..:. : :::.:: .:.:::::
CCDS31 CTFHEASDLYCPIFKLGFIVEKAGESFTELAHKGGVIGVIINWDCDLDLPASECNPKYSF
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 RRLDDKTTNVSLYPGYNFRYAKYYKENNVEKRTLIKVFGIRFDILVFGTGGKFDIIQLVV
:::: : .: :::::.::::: :.. :::::..:::.:..: : .:::..: ..
CCDS31 RRLDPK--HVPASSGYNFRFAKYYKINGTTTRTLIKAYGIRIDVIVHGQAGKFSLIPTII
290 300 310 320 330 340
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pF1KE1 YIGSTLSYFGLAAVFIDFLIDTY-SSNCCRSHIYPWCKCCQPCVVNEYYYRKKCESIVEP
....:. :... . :... :. ..: :: . : : :
CCDS31 NLATALTSVGVGSFLCDWILLTFMNKNKVYSH-KKFDKVCTPSHPSGSWPVTLARVLGQA
350 360 370 380 390 400
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pF1KE1 KPTLKYVSFVDESHIRMVNQQLLGRSLQDVKGQEVPRPAMDFTDLSRLPLALHDTPPIPG
CCDS31 PPEPGHRSEDQHPSPPSGQEGQQGAECGPAFPPLRPCPISAPSEQMVDTPASEPAQASTP
410 420 430 440 450 460
>>CCDS31932.1 P2RX2 gene_id:22953|Hs108|chr12 (404 aa)
initn: 642 init1: 270 opt: 822 Z-score: 898.2 bits: 175.7 E(32554): 1e-43
Smith-Waterman score: 822; 38.7% identity (66.9% similar) in 372 aa overlap (7-366:21-375)
10 20 30 40
pF1KE1 MPACCSC-SDVFQYETNKVTRIQSMNYGTIKWFFHVIIFSY-VCFA
: : ...::: :: ... :.. ...:. : : ..
CCDS31 MAAAQPKYPAGATARRLARGCWSALWDYETPKVIVVRNRRLGVLYRAVQLLILLYFVWYV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 LVSDKLYQRKE--PVISSVHTKVKGIAEVKEEIVENGVKKLVHSVFDTADYTFPLQGNSF
.. .: ::..: : ::. ::::::. . :.:.:. .:. : .:.:
CCDS31 FIVQKSYQESETGPE-SSIITKVKGITTSE------------HKVWDVEEYVKPPEGGSV
70 80 90 100
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pF1KE1 F-VMTNFLKTEGQEQRLCPE-YPTRRTLCSSDRGCKKGWMDPQSKGIQTGRCV-VHEGNQ
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CCDS31 FSIITRVEATHSQTQGTCPESIRVHNATCLSDADCVAGELDMLGNGLRTGRCVPYYQGPS
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CCDS31 L
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:...
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CCDS56 SLQSAVITKVKGVAFTN-------TSDLGQRIWDVADYVIPAQGENVFFVVTNLIVTPNQ
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pF1KE1 VEEAPRPALLNSAENFTVLIKNNIDFPGHNYTTRNILP----GLNITCTFHKTQNPQCPI
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CCDS56 SSRPEEP-FLKEAEDFTIFIKNHIRFPKFNFSN-NVMDVKDRSFLKSCHFGP-KNHYCPI
180 190 200 210 220 230
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pF1KE1 FRLGDIFRETGDNFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDRWFHHCHPKYSFRRLDDKTTNVSLY
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CCDS56 SGYNFRFARYYRDAAGVEFRTLMKAYGIRFDVMVNGKGAFFCDLV--LIYLIKKREFYRD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]