Result of FASTA (ccds) for pF1KE1399
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1399, 1849 aa
  1>>>pF1KE1399 1849 - 1849 aa - 1849 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0855+/-0.00114; mu= -4.8984+/- 0.069
 mean_var=424.6942+/-85.694, 0's: 0 Z-trim(113.8): 87  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.062235
 statistics sampled from 14365 (14440) to 14365 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.444), width:  16
 Scan time:  6.350

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS76448.1 SHANK2 gene_id:22941|Hs108|chr11       (1261) 8161 748.6 3.4e-215
CCDS12799.1 SHANK1 gene_id:50944|Hs108|chr19       (2161) 1904 187.0 6.6e-46


>>CCDS76448.1 SHANK2 gene_id:22941|Hs108|chr11            (1261 aa)
 initn: 8161 init1: 8161 opt: 8161  Z-score: 3976.9  bits: 748.6 E(32554): 3.4e-215
Smith-Waterman score: 8161; 100.0% identity (100.0% similar) in 1232 aa overlap (618-1849:30-1261)

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE1 RDSQAETRADRSKKLFRHYTVGSYDSFDTSSDCIIEEKTVVLQKKDNEGFGFVLRGAKAD
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76  MMMNVPGGGAAAVMMTGYNNGRCPRNSLYSDCIIEEKTVVLQKKDNEGFGFVLRGAKAD
                10        20        30        40        50         

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE1 TPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAWQAGLRTGDFLIEVNNENVVKVGHRQVVNMIRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAWQAGLRTGDFLIEVNNENVVKVGHRQVVNMIRQ
      60        70        80        90       100       110         

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE1 GGNHLVLKVVTVTRNLDPDDTARKKAPPPPKRAPTTALTLRSKSMTSELEELVDKASVRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GGNHLVLKVVTVTRNLDPDDTARKKAPPPPKRAPTTALTLRSKSMTSELEELVDKASVRK
     120       130       140       150       160       170         

       770       780       790       800       810       820       
pF1KE1 KKDKPEEIVPASKPSRAAENMAVEPRVATIKQRPSSRCFPAGSDMNSVYERQGIAVMTPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KKDKPEEIVPASKPSRAAENMAVEPRVATIKQRPSSRCFPAGSDMNSVYERQGIAVMTPT
     180       190       200       210       220       230         

       830       840       850       860       870       880       
pF1KE1 VPGSPKAPFLGIPRGTMRRQKSIDSRIFLSGITEEERQFLAPPMLKFTRSLSMPDTSEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VPGSPKAPFLGIPRGTMRRQKSIDSRIFLSGITEEERQFLAPPMLKFTRSLSMPDTSEDI
     240       250       260       270       280       290         

       890       900       910       920       930       940       
pF1KE1 PPPPQSVPPSPPPPSPTTYNCPKSPTPRVYGTIKPAFNQNSAAKVSPATRSDTVATMMRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PPPPQSVPPSPPPPSPTTYNCPKSPTPRVYGTIKPAFNQNSAAKVSPATRSDTVATMMRE
     300       310       320       330       340       350         

       950       960       970       980       990      1000       
pF1KE1 KGMYFRRELDRYSLDSEDLYSRNAGPQANFRNKRGQMPENPYSEVGKIASKAVYVPAKPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KGMYFRRELDRYSLDSEDLYSRNAGPQANFRNKRGQMPENPYSEVGKIASKAVYVPAKPA
     360       370       380       390       400       410         

      1010      1020      1030      1040      1050      1060       
pF1KE1 RRKGMLVKQSNVEDSPEKTCSIPIPTIIVKEPSTSSSGKSSQGSSMEIDPQAPEPPSQLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RRKGMLVKQSNVEDSPEKTCSIPIPTIIVKEPSTSSSGKSSQGSSMEIDPQAPEPPSQLR
     420       430       440       450       460       470         

      1070      1080      1090      1100      1110      1120       
pF1KE1 PDESLTVSSPFAAAIAGAVRDREKRLEARRNSPAFLSTDLGDEDVGLGPPAPRTRPSMFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PDESLTVSSPFAAAIAGAVRDREKRLEARRNSPAFLSTDLGDEDVGLGPPAPRTRPSMFP
     480       490       500       510       520       530         

      1130      1140      1150      1160      1170      1180       
pF1KE1 EEGDFADEDSAEQLSSPMPSATPREPENHFVGGAEASAPGEAGRPLNSTSKAQGPESSPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EEGDFADEDSAEQLSSPMPSATPREPENHFVGGAEASAPGEAGRPLNSTSKAQGPESSPA
     540       550       560       570       580       590         

      1190      1200      1210      1220      1230      1240       
pF1KE1 VPSASSGTAGPGNYVHPLTGRLLDPSSPLALALSARDRAMKESQQGPKGEAPKADLNKPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VPSASSGTAGPGNYVHPLTGRLLDPSSPLALALSARDRAMKESQQGPKGEAPKADLNKPL
     600       610       620       630       640       650         

      1250      1260      1270      1280      1290      1300       
pF1KE1 YIDTKMRPSLDAGFPTVTRQNTRGPLRRQETENKYETDLGRDRKGDDKKNMLIDIMDTSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YIDTKMRPSLDAGFPTVTRQNTRGPLRRQETENKYETDLGRDRKGDDKKNMLIDIMDTSQ
     660       670       680       690       700       710         

      1310      1320      1330      1340      1350      1360       
pF1KE1 QKSAGLLMVHTVDATKLDNALQEEDEKAEVEMKPDSSPSEVPEGVSETEGALQISAAPEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QKSAGLLMVHTVDATKLDNALQEEDEKAEVEMKPDSSPSEVPEGVSETEGALQISAAPEP
     720       730       740       750       760       770         

      1370      1380      1390      1400      1410      1420       
pF1KE1 TTVPGRTIVAVGSMEEAVILPFRIPPPPLASVDLDEDFIFTEPLPPPLEFANSFDIPDDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TTVPGRTIVAVGSMEEAVILPFRIPPPPLASVDLDEDFIFTEPLPPPLEFANSFDIPDDR
     780       790       800       810       820       830         

      1430      1440      1450      1460      1470      1480       
pF1KE1 AASVPALSDLVKQKKSDTPQSPSLNSSQPTNSADSKKPASLSNCLPASFLPPPESFDAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AASVPALSDLVKQKKSDTPQSPSLNSSQPTNSADSKKPASLSNCLPASFLPPPESFDAVA
     840       850       860       870       880       890         

      1490      1500      1510      1520      1530      1540       
pF1KE1 DSGIEEVDSRSSSDHHLETTSTISTVSSISTLSSEGGENVDTCTVYADGQAFMVDKPPVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DSGIEEVDSRSSSDHHLETTSTISTVSSISTLSSEGGENVDTCTVYADGQAFMVDKPPVP
     900       910       920       930       940       950         

      1550      1560      1570      1580      1590      1600       
pF1KE1 PKPKMKPIIHKSNALYQDALVEEDVDSFVIPPPAPPPPPGSAQPGMAKVLQPRTSKLWGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PKPKMKPIIHKSNALYQDALVEEDVDSFVIPPPAPPPPPGSAQPGMAKVLQPRTSKLWGD
     960       970       980       990      1000      1010         

      1610      1620      1630      1640      1650      1660       
pF1KE1 VTEIKSPILSGPKANVISELNSILQQMNREKLAKPGEGLDSPMGAKSASLAPRSPEIMST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VTEIKSPILSGPKANVISELNSILQQMNREKLAKPGEGLDSPMGAKSASLAPRSPEIMST
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

      1670      1680      1690      1700      1710      1720       
pF1KE1 ISGTRSTTVTFTVRPGTSQPITLQSRPPDYESRTSGTRRAPSPVVSPTEMNKETLPAPLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ISGTRSTTVTFTVRPGTSQPITLQSRPPDYESRTSGTRRAPSPVVSPTEMNKETLPAPLS
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

      1730      1740      1750      1760      1770      1780       
pF1KE1 AATASPSPALSDVFSLPSQPPSGDLFGLNPAGRSRSPSPSILQQPISNKPFTTKPVHLWT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AATASPSPALSDVFSLPSQPPSGDLFGLNPAGRSRSPSPSILQQPISNKPFTTKPVHLWT
    1140      1150      1160      1170      1180      1190         

      1790      1800      1810      1820      1830      1840       
pF1KE1 KPDVADWLESLNLGEHKEAFMDNEIDGSHLPNLQKEDLIDLGVTRVGHRMNIERALKQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KPDVADWLESLNLGEHKEAFMDNEIDGSHLPNLQKEDLIDLGVTRVGHRMNIERALKQLL
    1200      1210      1220      1230      1240      1250         

         
pF1KE1 DR
       ::
CCDS76 DR
    1260 

>>CCDS12799.1 SHANK1 gene_id:50944|Hs108|chr19            (2161 aa)
 initn: 3495 init1: 1732 opt: 1904  Z-score: 937.6  bits: 187.0 E(32554): 6.6e-46
Smith-Waterman score: 3934; 41.8% identity (61.2% similar) in 1931 aa overlap (1-1669:1-1875)

               10        20         30           40         50     
pF1KE1 MPRSPTSSEDEMAQSFSDYSVG-SESDSSKE---ETIYDTIRATAEKPGG-ARTEESQGN
       : .::..::::  .: :.   : :::::: .   .    :    .  ::. : ..  :: 
CCDS12 MTHSPATSEDEERHSASECPEGGSESDSSPDGPGRGPRGTRGQGSGAPGSLASVRGLQGR
               10        20        30        40        50        60

                     60        70        80        90       100    
pF1KE1 TL-----------VIRVVIHDLQQTKCIRFNPDATVWVAKQRILCTLTQSLKDVLNYGLF
       ..           :.:. : ::.::::.:::::::.:.:::..::.:..::.::::::::
CCDS12 SMSVPDDAHFSMMVFRIGIPDLHQTKCLRFNPDATIWTAKQQVLCALSESLQDVLNYGLF
               70        80        90       100       110       120

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE1 QPASNGRDGKFLDEERLLREYPQPVGEGVPSLEFRYKKRVYKQASLDEKQLAKLHTKTNL
       :::..:::..::.::::::::::   .::: :::::: :::::..:::::::::::::.:
CCDS12 QPATSGRDANFLEEERLLREYPQSFEKGVPYLEFRYKTRVYKQTNLDEKQLAKLHTKTGL
              130       140       150       160       170       180

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE1 KKCMDHIQHRLVEKITKMLDRGLDPNFHDPETGETPLTLAAQLDDSVEVIKALKNGGAHL
       :: ....:    .:....::.:::::.:: ..:::::::::: . :::::..:  ::::.
CCDS12 KKFLEYVQLGTSDKVARLLDKGLDPNYHDSDSGETPLTLAAQTEGSVEVIRTLCLGGAHI
              190       200       210       220       230       240

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE1 DFRAKDGMTALHKAARARNQVALKTLLELGASPDYKDSYGLTPLYHTAIVGGDPYCCELL
       ::::.:::::::::: ::. .:: .::.::.::.:::  :::::.:::.::::: :::::
CCDS12 DFRARDGMTALHKAACARHCLALTALLDLGGSPNYKDRRGLTPLFHTAMVGGDPRCCELL
              250       260       270       280       290       300

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE1 LHEHATVCCKDENGWHEIHQACRYGHVQHLEHLLFYGADMSAQNASGNTALHICALYNQD
       : ..: .   :::::.::::::. :: :::::::::::. .:::::::::::::::::..
CCDS12 LFNRAQLGIADENGWQEIHQACQRGHSQHLEHLLFYGAEPGAQNASGNTALHICALYNKE
              310       320       330       340       350       360

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE1 SCARVLLFRGGNKELKNYNSQTPFQVAIIAGNFELAEYIKNHKETDIVPFREAPAYSNRR
       .:::.::.::..:..:: :.:::::::.:::::::.: :.::.: :.:::.:.: :. ::
CCDS12 TCARILLYRGADKDVKNNNGQTPFQVAVIAGNFELGELIRNHREQDVVPFQESPKYAARR
              370       380       390       400       410       420

          410        420       430       440            450        
pF1KE1 RRPPNT-LAAPRVLLRSNSDNNLNASAPDWAVCSTATSHRSLSP-----QLLQQMPSKPE
       : ::.: :..: .:::.:::...  . ::: : :.  .  : .:     .  :..:: : 
CCDS12 RGPPGTGLTVPPALLRANSDTSM--ALPDWMVFSAPGAASSGAPGPTSGSQGQSQPSAPT
              430       440         450       460       470        

           460        470       480       490          500         
pF1KE1 -----GAAKTIGSYVP-GPRSRSPSLNRLGGAGEDGKRPQPLWH---VGSPF-----ALG
            :. .. .:  : : :.:::: .:     ::.:: ::  .    :.:      . :
CCDS12 TKLSSGTLRSASS--PRGARARSPSRGR---HPEDAKR-QPRGRPSSSGTPREGPAGGTG
      480       490         500          510        520       530  

          510       520       530       540       550       560    
pF1KE1 ANKDSLSAFEYPGPKRKLYSAVPGRLFVAVKPYQPQVDGEIPLHRGDRVKVLSIGEGGFW
       ..    ...   : .:::::::::: :.::: :: :..::: : .:...:::::::::::
CCDS12 GSGGPGGSLGSRGRRRKLYSAVPGRSFMAVKSYQAQAEGEISLSKGEKIKVLSIGEGGFW
            540       550       560       570       580       590  

          570       580       590       600       610              
pF1KE1 EGSARGHIGWFPAECVEEVQCKPRDSQAETRADRSKKLFRHYTVGSYDSFDT--------
       ::...:..::::..:.:::  . ..:. :.:.:..:.::::::::::::::.        
CCDS12 EGQVKGRVGWFPSDCLEEVANRSQESKQESRSDKAKRLFRHYTVGSYDSFDAPSLMDGIG
            600       610       620       630       640       650  

         620       630       640       650       660       670     
pF1KE1 -SSDCIIEEKTVVLQKKDNEGFGFVLRGAKADTPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAW
        .:: ::.::::.:::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGSDYIIKEKTVLLQKKDSEGFGFVLRGAKAQTPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAW
            660       670       680       690       700       710  

         680       690       700       710       720       730     
pF1KE1 QAGLRTGDFLIEVNNENVVKVGHRQVVNMIRQGGNHLVLKVVTVTRNLDPDDTARKKAPP
       .:::: ::::::::..::::::::::::::::::: :..::: :::. : :....:::: 
CCDS12 RAGLRMGDFLIEVNGQNVVKVGHRQVVNMIRQGGNTLMVKVVMVTRHPDMDEAVHKKAPQ
            720       730       740       750       760       770  

         740       750       760       770       780       790     
pF1KE1 PPKRAPTTALTLRSKSMTSELEELVDKASVRKKKDKPEEIVPASKPSRAAENMAV---EP
         :: :  ...::::::::::::.       . ...:   ::. . .:.. .::.   . 
CCDS12 QAKRLPPPTISLRSKSMTSELEEM-------EYEQQPAP-VPSMEKKRTVYQMALNKLDE
            780       790              800        810       820    

            800       810         820              830       840   
pF1KE1 RVATIKQRPSSRCFPAGSDMNSV--YERQGIAVMTPTV-------PGSPKAPFLGIPRGT
        .:. .:  :.   :. . . :.  .. .:. .   .        :.  .  ::    : 
CCDS12 ILAAAQQTISASESPGPGGLASLGKHRPKGFFATESSFDPHHRAQPSYERPSFLPPGPGL
          830       840       850       860       870       880    

           850       860       870       880       890          900
pF1KE1 MRRQKSIDSRIFLSGITEEERQFLAPPMLKFTRSLSMPDTSEDIPPPPQSVPPSPP---P
       : :::::       : .:..: .:::: .::.::::.:  :::::::: . :: ::   :
CCDS12 MLRQKSI-------GAAEDDRPYLAPPAMKFSRSLSVPG-SEDIPPPPTTSPPEPPYSTP
          890              900       910        920       930      

              910       920           930       940       950      
pF1KE1 PSPTTYNCPKSPTPRVYGTIKPA----FNQNSAAKVSPATRSDTVATMMREKGMYFRREL
       : :.. .   .:.::  : ..:.    .  .: :. .  .  :: .   :::..:    :
CCDS12 PVPSS-SGRLTPSPR-GGPFNPGSGGPLPASSPASFDGPSPPDTRVGS-REKSLYHSGPL
        940        950        960       970       980        990   

                                        960       970        980   
pF1KE1 D--------------------------------RYSLDSEDLYSRNA-GPQANFRNKRGQ
                                        . . . .:   : : ::: ..:. :: 
CCDS12 PPAHHHPPHHHHHHAPPPQPHHHHAHPPHPPEMETGGSPDDPPPRLALGPQPSLRGWRGG
          1000      1010      1020      1030      1040      1050   

                   990                        1000       1010      
pF1KE1 MPE------NP--YSEVG------------------KIASKAVYVPAKPAR-RKGMLVKQ
        :       .:  .. .:                  . :: :.::::. .: ::: ::::
CCDS12 GPSPTPGAPSPSHHGSAGGGGGSSQGPALRYFQLPPRAASAAMYVPARSGRGRKGPLVKQ
          1060      1070      1080      1090      1100      1110   

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pF1KE1 SNVEDSPEK---------------------------TCSIPIPTIIVKEPSTSSSGKSSQ
       ..::  :.:                             ::::::::.: :::::::.:::
CCDS12 TKVEGEPQKGGGLPPAPSPTSPASPQPPPAVAAPSEKNSIPIPTIIIKAPSTSSSGRSSQ
          1120      1130      1140      1150      1160      1170   

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pF1KE1 GSSMEIDPQA-PEP---------------------------PSQLRPD--ESLTVSSPFA
       ::: : .: . :::                           :.   :.   .:  .: :.
CCDS12 GSSTEAEPPTQPEPTGGGGGGGSSPSPAPAMSPVPPSPSPVPTPASPSGPATLDFTSQFG
          1180      1190      1200      1210      1220      1230   

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pF1KE1 AAIAGAVRDREK--RLEARRNSPAFLSTDLGDEDVGLG------PPAPRTRPSMFPEEGD
       ::..::.: ::   . :::: :  ::::: :::: : :       :.:: : :   .:: 
CCDS12 AALVGAAR-REGGWQNEARRRSTLFLSTDAGDEDGGDGGLGTGAAPGPRLRHSKSIDEGM
          1240       1250      1260      1270      1280      1290  

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pF1KE1 FADEDSAEQLSSPMPSATPREPENHFVGGAEASAPGEAGRPLNSTSKAQGPESSPAVPSA
       :              :: :     ..   . .:. : .:   .: . . :  ::     :
CCDS12 F--------------SAEP-----YLRLESAGSGAGYGGYGAGSRAYGGGGGSS-----A
                              1300      1310      1320             

            1200      1210      1220      1230      1240      1250 
pF1KE1 SSGTAGPGNYVHPLTGRLLDPSSPLALALSARDRAMKESQQGPKGEAPKADLNKPLYIDT
        ..   :   ::::::. :::.:::.:::.::.::.:::..:  .  :     .: :   
CCDS12 FTSFLPPRPLVHPLTGKALDPASPLGLALAARERALKESSEGGGAPQPPPRPPSPRYEAP
     1330      1340      1350      1360      1370      1380        

               1260      1270      1280      1290            1300  
pF1KE1 KMRP---SLDAGFPTVTRQNTRGPLRRQETENKYETDLGRDRKG------DDKKNMLIDI
          :   :  :    : :    .:    . :  :.. :: ..:.        ....:  .
CCDS12 PPTPHHHSPHAHHEPVLRLWGASPPDPARRELGYRAGLGSQEKSLPASPPAARRSLLHRL
     1390      1400      1410      1420      1430      1440        

           1310             1320      1330      1340       1350    
pF1KE1 MDTSQQKSAGLLMV-------HTVDATKLDNALQEEDEKAEVEMKP-DSSPSEVPEGVSE
         :.   .  ::..       :   .    .:  :: :.  ....  ..   ..:   ..
CCDS12 PPTAPGVGPLLLQLGTEPPAPHPGVSKPWRSAAPEEPERLPLHVRFLENCQPRAPVTSGR
     1450      1460      1470      1480      1490      1500        

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pF1KE1 TEGALQISAAPEPT---TVPGRTIVAVGSMEEAVILPFRIPPPPLASVDL-DEDFIFTEP
          . .  ..: :.   .::       .: :..  ::. . :::  :::. : .:.:.::
CCDS12 GPPSEDGPGVPPPSPRRSVPPSPTSPRASEENG--LPLLVLPPPAPSVDVEDGEFLFVEP
     1510      1520      1530      1540        1550      1560      

             1420      1430        1440              1450      1460
pF1KE1 LPPPLEFANSFDIPDDRAASVPA--LSDLVKQKKSDTP--------QSPSLNSSQPTNSA
       :::::::.:::. :..  .  :   : :         :          :.:.:.  . ..
CCDS12 LPPPLEFSNSFEKPESPLTPGPPHPLPDTPAPATPLPPVPPPAVAAAPPTLDSTASSLTS
       1570      1580      1590      1600      1610      1620      

                1470       1480                    1490      1500  
pF1KE1 DSKKPASLS---NCLPASFLPP-PESFDAVA--------------DSGIEEVDSRSSSDH
        ... :.:.   .  :..  :: : .  : :              :::::::::::::::
CCDS12 YDSEVATLTQGASAAPGDPHPPGPPAPAAPAPAAPQPGPDPPPGTDSGIEEVDSRSSSDH
       1630      1640      1650      1660      1670      1680      

           1510      1520                    1530      1540        
pF1KE1 HLETTSTISTVSSISTLS--SEGG------------ENVDTCTVYADGQAFMVDKPPVPP
        ::: :. ::.::.:. .  : ::            : .:: ..: :::::  .. : ::
CCDS12 PLETISSASTLSSLSAEGGGSAGGGGGAGAGVASGPELLDTYVAYLDGQAFGGSSTPGPP
       1690      1700      1710      1720      1730      1740      

     1550        1560      1570      1580          1590            
pF1KE1 KPK--MKPIIHKSNALYQDALVEEDVDSFVIPPPAPPPPP----GSAQPGMAKVLQ---P
        :   : :   .. ::  .. ..   .. .  : .:  :     :..  :.  .     :
CCDS12 YPPQLMTPSKLRGRALGASGGLRPGPSGGLRDPVTPTSPTVSVTGAGTDGLLALRACSGP
       1750      1760      1770      1780      1790      1800      

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pF1KE1 RTSKLWGDVTEIKSPILSGPKANVISELNSILQQMNREKLAKPGEGLDSPMGAKSAS-LA
        :. . :  . ..  .   :  .. :   ..:    .:  . :   : .:..  .:: ::
CCDS12 PTAGVAGGPVAVEPEVPPVPLPTASSLPRKLLPW--EEGPGPPPPPLPGPLAQPQASALA
       1810      1820      1830      1840        1850      1860    

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pF1KE1 PRSPEIMSTISGTRSTTVTFTVRPGTSQPITLQSRPPDYESRTSGTRRAPSPVVSPTEMN
         .  :.: .:                                                 
CCDS12 TVKASIISELSSKLQQFGGSSAAGGALPWARGGSGGGGDSHHGGASYVPERTSSLQRQRL
         1870      1880      1890      1900      1910      1920    




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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