FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1399, 1849 aa 1>>>pF1KE1399 1849 - 1849 aa - 1849 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0534+/-0.000489; mu= -16.3474+/- 0.031 mean_var=514.8025+/-106.827, 0's: 0 Z-trim(121.9): 211 B-trim: 632 in 1/59 Lambda= 0.056527 statistics sampled from 38907 (39148) to 38907 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.459), width: 16 Scan time: 13.000 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016872876 (OMIM: 603290,613436) PREDICTED: SH3 (1849) 12348 1023.4 0 XP_016872877 (OMIM: 603290,613436) PREDICTED: SH3 (1849) 12348 1023.4 0 NP_036441 (OMIM: 603290,613436) SH3 and multiple a (1849) 12348 1023.4 0 XP_005277989 (OMIM: 603290,613436) PREDICTED: SH3 (1470) 9728 809.6 0 XP_016872879 (OMIM: 603290,613436) PREDICTED: SH3 (1279) 8326 695.3 1e-198 NP_573573 (OMIM: 603290,613436) 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8161 opt: 8161 Z-score: 3615.9 bits: 681.8 E(85289): 1.1e-194 Smith-Waterman score: 8161; 100.0% identity (100.0% similar) in 1232 aa overlap (618-1849:30-1261) 590 600 610 620 630 640 pF1KE1 RDSQAETRADRSKKLFRHYTVGSYDSFDTSSDCIIEEKTVVLQKKDNEGFGFVLRGAKAD :::::::::::::::::::::::::::::: NP_573 MMMNVPGGGAAAVMMTGYNNGRCPRNSLYSDCIIEEKTVVLQKKDNEGFGFVLRGAKAD 10 20 30 40 50 650 660 670 680 690 700 pF1KE1 TPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAWQAGLRTGDFLIEVNNENVVKVGHRQVVNMIRQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_573 TPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAWQAGLRTGDFLIEVNNENVVKVGHRQVVNMIRQ 60 70 80 90 100 110 710 720 730 740 750 760 pF1KE1 GGNHLVLKVVTVTRNLDPDDTARKKAPPPPKRAPTTALTLRSKSMTSELEELVDKASVRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_573 GGNHLVLKVVTVTRNLDPDDTARKKAPPPPKRAPTTALTLRSKSMTSELEELVDKASVRK 120 130 140 150 160 170 770 780 790 800 810 820 pF1KE1 KKDKPEEIVPASKPSRAAENMAVEPRVATIKQRPSSRCFPAGSDMNSVYERQGIAVMTPT 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