Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1429
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1429, 536 aa
1>>>pF1KE1429 536 - 536 aa - 536 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0686+/-0.000852; mu= 14.2432+/- 0.051
mean_var=72.9477+/-14.314, 0's: 0 Z-trim(106.9): 76 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.150165
statistics sampled from 9309 (9387) to 9309 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 1.640
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs109|chr12 ( 536) 3542 776.8 0
CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs109|chr12 ( 516) 3282 720.5 1.2e-207
CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs109|chr12 ( 495) 3262 716.1 2.4e-206
CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs109|chr7 ( 769) 2005 443.9 3.3e-124
CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs109|chr2 ( 535) 1980 438.4 1e-122
CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs109|chr2 ( 545) 1980 438.4 1e-122
CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs109|chr7 ( 634) 1978 438.0 1.6e-122
CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs109|chr7 ( 709) 1978 438.0 1.8e-122
CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs109|chr2 ( 519) 1934 428.4 9.9e-120
CCDS86900.1 PDE1A gene_id:5136|Hs109|chr2 ( 529) 1934 428.4 1e-119
CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs109|chr2 ( 501) 1760 390.7 2.1e-108
CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs109|chr8 ( 456) 601 139.6 7.6e-33
CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs109|chr8 ( 482) 601 139.6 8e-33
CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs109|chr6 ( 450) 590 137.2 3.9e-32
CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs109|chr19 ( 647) 528 123.9 6e-28
CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs109|chr19 ( 825) 528 123.9 7.5e-28
CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs109|chr19 ( 860) 528 123.9 7.8e-28
CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs109|chr19 ( 864) 528 123.9 7.8e-28
CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs109|chr19 ( 886) 528 123.9 8e-28
CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs109|chr5 ( 673) 526 123.4 8.4e-28
CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs109|chr5 ( 679) 526 123.4 8.5e-28
CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs109|chr5 ( 687) 526 123.4 8.6e-28
CCDS87297.1 PDE4D gene_id:5144|Hs109|chr5 ( 699) 526 123.4 8.7e-28
CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs109|chr5 ( 745) 526 123.4 9.2e-28
CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs109|chr5 ( 748) 526 123.4 9.3e-28
CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs109|chr5 ( 809) 526 123.5 9.9e-28
CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs109|chr19 ( 606) 521 122.3 1.6e-27
CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs109|chr1 ( 564) 520 122.1 1.8e-27
CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs109|chr19 ( 680) 521 122.4 1.8e-27
CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs109|chr19 ( 712) 521 122.4 1.9e-27
CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs109|chr1 ( 503) 517 121.4 2.5e-27
CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs109|chr1 ( 721) 519 121.9 2.6e-27
CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs109|chr1 ( 736) 519 121.9 2.6e-27
CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs109|chr5 ( 507) 516 121.2 2.9e-27
CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs109|chr5 ( 518) 516 121.2 3e-27
CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 433) 503 118.4 1.8e-26
CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 459) 503 118.4 1.9e-26
CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 465) 503 118.4 1.9e-26
CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 466) 503 118.4 1.9e-26
CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 491) 503 118.4 2e-26
CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 492) 503 118.4 2e-26
CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 507) 503 118.4 2.1e-26
CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 526) 503 118.4 2.1e-26
CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 533) 503 118.4 2.1e-26
CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 540) 503 118.4 2.2e-26
CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 552) 503 118.4 2.2e-26
CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 567) 503 118.4 2.3e-26
CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs109|chr21 ( 593) 503 118.4 2.4e-26
CCDS31754.1 PDE3A gene_id:5139|Hs109|chr12 (1141) 474 112.2 3.3e-24
CCDS73345.1 PDE2A gene_id:5138|Hs109|chr11 ( 920) 446 106.1 1.8e-22
>>CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs109|chr12 (536 aa)
initn: 3542 init1: 3542 opt: 3542 Z-score: 4145.7 bits: 776.8 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 3542; 100.0% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (1-536:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MELSPRSPPEMLEESDCPSPLELKSAPSKKMWIKLRSLLRYMVKQLENGEINIEELKKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MELSPRSPPEMLEESDCPSPLELKSAPSKKMWIKLRSLLRYMVKQLENGEINIEELKKNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EYTASLLEAVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 EYTASLLEAVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KFRSIVHAVQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KFRSIVHAVQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RTIVFELLTRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RTIVFELLTRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RTGMVHCLSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RTGMVHCLSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FRLMQDDEMNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 FRLMQDDEMNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 ALSLLLHAADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ALSLLLHAADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 QIGFIDFIVEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQPSFQWRQPSLDVEVGDPNPDVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QIGFIDFIVEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQPSFQWRQPSLDVEVGDPNPDVVS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE1 FRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITNQMSIDELSPCEEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 FRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITNQMSIDELSPCEEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
490 500 510 520 530
>>CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs109|chr12 (516 aa)
initn: 3282 init1: 3282 opt: 3282 Z-score: 3841.5 bits: 720.5 E(33420): 1.2e-207
Smith-Waterman score: 3282; 100.0% identity (100.0% similar) in 498 aa overlap (39-536:19-516)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 PEMLEESDCPSPLELKSAPSKKMWIKLRSLLRYMVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MANPVPVQRSHLQGPILRLRYMVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 AVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFELL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLLRTGMVHCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLLRTGMVHCL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDDE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 MNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLLHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLLHA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 ADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQSQIGFIDFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQSQIGFIDFI
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQPSFQWRQPSLDVEVGDPNPDVVSFRSTWVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQPSFQWRQPSLDVEVGDPNPDVVSFRSTWVKR
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KE1 IQENKQKWKERAASGITNQMSIDELSPCEEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IQENKQKWKERAASGITNQMSIDELSPCEEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
470 480 490 500 510
>>CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs109|chr12 (495 aa)
initn: 3262 init1: 3262 opt: 3262 Z-score: 3818.4 bits: 716.1 E(33420): 2.4e-206
Smith-Waterman score: 3262; 100.0% identity (100.0% similar) in 495 aa overlap (42-536:1-495)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 LEESDCPSPLELKSAPSKKMWIKLRSLLRYMVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLEAVY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLEAVY
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 IDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHAVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHAVQA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 GIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFELLTRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFELLTRH
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 NLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLLRTGMVHCLSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLLRTGMVHCLSEI
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 ELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDDEMNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDDEMNI
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 FINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLLHAADI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLLHAADI
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 SHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQSQIGFIDFIVEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQSQIGFIDFIVEP
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 TFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQPSFQWRQPSLDVEVGDPNPDVVSFRSTWVKRIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQPSFQWRQPSLDVEVGDPNPDVVSFRSTWVKRIQE
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530
pF1KE1 NKQKWKERAASGITNQMSIDELSPCEEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NKQKWKERAASGITNQMSIDELSPCEEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
460 470 480 490
>>CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs109|chr7 (769 aa)
initn: 2051 init1: 1243 opt: 2005 Z-score: 2343.5 bits: 443.9 E(33420): 3.3e-124
Smith-Waterman score: 2023; 61.0% identity (81.9% similar) in 518 aa overlap (5-499:77-584)
10 20 30
pF1KE1 MELSPRSPPEMLEESDCPSPLELKSAPSKKMWIK
:: : :.: . :: . : .. .:
CCDS55 SKSQNCLWNSLIDGLTGNVKEKPRPTIVHDPRPPEEILAD-------ELPQLDSPEVLVK
50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 LRSLLRYMVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLEAVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVP
:: .::::: :: .. .:::::::.:..::.:::::::..:::::::....:::::
CCDS55 TSFRLRSLVKQLERGEASVVDLKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVP
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 SEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAV
::::::::::::.: ::..:::.:.:::::::::::::::.::: . :: .: ::
CCDS55 SEVRDWLASTFTRQMGMMLRRSDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAV
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 LNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFELLTRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETG
.. ::..: : :::::::.:. ::::. : .:::::..:::::::: :.::..:::.:
CCDS55 IEALKDVDKWSFDVFSLNEASGDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVG
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 YGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLLRTGMVHCLSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSF
:.:.:::::: .:::::::::: .: .::... :.:.:..::::.:::::::::::::.:
CCDS55 YSKHKNPYHNLMHAADVTQTVHYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNF
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 HIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDDE-MNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLA
::::.:. ::.:::::::::::.:...::.:::: :::.:::.::.. :.:.::::::.:
CCDS55 HIQTRSDPAILYNDRSVLENHHLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMA
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 TDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLLHAADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFF
:::::::::.:.::::::: : :.:::::::.::.::::::.: : .: ::: .:.::::
CCDS55 TDMSCHFQQIKAMKTALQQPEAIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFF
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 RQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQSQIGFIDFIVEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSK
::::.:::::::::::::: ::.:::::.:::::::::::.::::..:: :.:: :: :.
CCDS55 RQGDREAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQ
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490
pF1KE1 SKNQPSFQWRQPSLD-VEVGD---------------P-NPDVVS-----FRSTWVKRIQE
. . . :. ::. . .: : : .:.: :..::.. ..
CCDS55 TGGTGQ---RRSSLNSISSSDAKRSGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHI
520 530 540 550 560 570
500 510 520 530
pF1KE1 NKQKWKERAASGITNQMSIDELSPCEEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
:...:. .
CCDS55 NRERWRAKVPKEEKAKKEAEEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQV
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10 20 30 40 50 60
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.:: . . : . ..::: .:...:: .::::: :..:. .::::.
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::.::.::::::::::..:::::::.....:.::::::::::::::.. .. ::::
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::::::::::::::::::.:.:: :: .: .::. ::..: : ::::.::.:. .:.:
CCDS33 KFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RTIVFELLTRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLL
. ...::.::..::.:::::. :..: .:::.::.:::::::: ::::::::::: ..:
CCDS33 KFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIML
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pF1KE1 RTGMVHCLSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSV
.::..: :.:.:.::..:::::::::::::::.:::::.:. ::.:::::::::::.:..
CCDS33 HTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAA
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.::::..::::.:::.::.. .:: :::::::.:::: ::::.:.....::: : ::. :
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..::.:::::::::.:.: .: ::: ::::::: :::::::::::::::::: ::.::::
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::::::::::::::.::: .:: : :: .: ::.... . .. ....:
CCDS33 QIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSN
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pF1KE1 ----------NPD-------VVSFRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITNQMSIDELSPCE
.:: . ::... : ::.::..::: ::
CCDS33 TKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQEARTSSQKCEFIHQ
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520 530
pF1KE1 EEAPPSPAEDEHNQNGNLD
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10 20 30 40 50 60
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.:: . . : . ..::: .:...:: .::::: :..:. .::::.
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pF1KE1 EYTASLLEAVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKP
::.::.::::::::::..:::::::.....:.::::::::::::::.. .. ::::
CCDS22 EYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKP
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pF1KE1 KFRSIVHAVQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHAL
::::::::::::::::::.:.:: :: .: .::. ::..: : ::::.::.:. .:.:
CCDS22 KFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSL
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pF1KE1 RTIVFELLTRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLL
. ...::.::..::.:::::. :..: .:::.::.:::::::: ::::::::::: ..:
CCDS22 KFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIML
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250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RTGMVHCLSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSV
.::..: :.:.:.::..:::::::::::::::.:::::.:. ::.:::::::::::.:..
CCDS22 HTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAA
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pF1KE1 FRLMQDDEMNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPK
.::::..::::.:::.::.. .:: :::::::.:::: ::::.:.....::: : ::. :
CCDS22 YRLMQEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAK
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pF1KE1 ALSLLLHAADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQS
..::.:::::::::.:.: .: ::: ::::::: :::::::::::::::::: ::.::::
CCDS22 TMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQS
360 370 380 390 400 410
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pF1KE1 QIGFIDFIVEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQPSFQWRQPSL-DVEVGDP-----
::::::::::::::.::: .:: : :: .: ::.... . .. ....:
CCDS22 QIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KE1 ----------NPD-------VVSFRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITN-QMSIDELSPC
.:: . ::... : ::.::..::: ::.: .. . . ..:
CCDS22 TKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNA
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520 530
pF1KE1 EEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
::.
CCDS22 EEKHDETHS
540
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.. .:::::::.:..::.:::::::..:::::::....:::::::::::::::::.:
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::..:::.:.:::::::::::::::.::: . :: .: ::.. ::..: : ::::::
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pF1KE1 NQAADDHALRTIVFELLTRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADV
:.:. ::::. : .:::::..:::::::: :.::..:::.::.:.:::::: .:::::
CCDS54 NEASGDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADV
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pF1KE1 TQTVHCFLLRTGMVHCLSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSV
::::: .: .::... :.:.:..::::.:::::::::::::.:::::.:. ::.::::::
CCDS54 TQTVHYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSV
240 250 260 270 280 290
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pF1KE1 LENHHISSVFRLMQDDE-MNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTAL
:::::.:...::.:::: :::.:::.::.. :.:.::::::.::::::::::.:.:::::
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:: : :.:::::::.::.::::::.: : .: ::: .:.::::::::.::::::::::::
CCDS54 QQPEAIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLC
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:: ::.:::::.:::::::::::.::::..:: :.:: :: :.. . . :. ::. .
CCDS54 DRKSTMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQ---RRSSLNSI
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pF1KE1 EVGD---------------P-NPDVVS-----FRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITNQM
.: : : .:.: :..::.. .. :...:. .
CCDS54 SSSDAKRSGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKK
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510 520 530
pF1KE1 SIDELSPCEEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
CCDS54 EAEEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSK
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10 20 30 40 50
pF1KE1 MELSPRSPPEMLEESDCPSPLELKSAPSKKMWIKLRSL---------LRYMVKQLENGEI
:: . .:: . : :. .:.:..::.: :: .::::: ::
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pF1KE1 NIEELKKNLEYTASLLEAVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARA
.. .:::::::.:..::.:::::::..:::::::....:::::::::::::::::.:
CCDS55 SVVDLKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGM
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pF1KE1 KGRRAEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSL
::..:::.:.:::::::::::::::.::: . :: .: ::.. ::..: : ::::::
CCDS55 MLRRSDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSL
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pF1KE1 NQAADDHALRTIVFELLTRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADV
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CCDS55 NEASGDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADV
180 190 200 210 220 230
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pF1KE1 TQTVHCFLLRTGMVHCLSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSV
::::: .: .::... :.:.:..::::.:::::::::::::.:::::.:. ::.::::::
CCDS55 TQTVHYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSV
240 250 260 270 280 290
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pF1KE1 LENHHISSVFRLMQDDE-MNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTAL
:::::.:...::.:::: :::.:::.::.. :.:.::::::.::::::::::.:.:::::
CCDS55 LENHHLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTAL
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pF1KE1 QQLERIDKPKALSLLLHAADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLC
:: : :.:::::::.::.::::::.: : .: ::: .:.::::::::.::::::::::::
CCDS55 QQPEAIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLC
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pF1KE1 DRTSTLVAQSQIGFIDFIVEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQPSFQWRQPSLD-V
:: ::.:::::.:::::::::::.::::..:: :.:: :: :.. . . :. ::. .
CCDS55 DRKSTMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQ---RRSSLNSI
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pF1KE1 EVGD---------------P-NPDVVS-----FRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITNQM
.: : : .:.: :..::.. .. :...:. .
CCDS55 SSSDAKRSGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKK
480 490 500 510 520 530
510 520 530
pF1KE1 SIDELSPCEEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
CCDS55 EAEEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSK
540 550 560 570 580 590
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pF1KE1 PEMLEESDCPSPLELKSAPSKKMWIKLRSLLRYMVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLE
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CCDS58 MDDHVTIRKKHLQRPIFRLRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLE
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pF1KE1 AVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHA
::::::::..:::::::.....:.::::::::::::::.. .. ::::::::::::
CCDS58 AVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHA
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pF1KE1 VQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFELL
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CCDS58 VQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELF
110 120 130 140 150 160
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pF1KE1 TRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLLRTGMVHCL
::..::.:::::. :..: .:::.::.:::::::: ::::::::::: ..:.::..: :
CCDS58 TRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWL
170 180 190 200 210 220
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pF1KE1 SEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDDE
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CCDS58 TELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQEEE
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 MNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLLHA
:::.:::.::.. .:: :::::::.:::: ::::.:.....::: : ::. :..::.:::
CCDS58 MNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLILHA
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pF1KE1 ADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQSQIGFIDFI
::::::.:.: .: ::: ::::::: :::::::::::::::::: ::.::::::::::::
CCDS58 ADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDFI
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KE1 VEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQPSFQWRQPSL-DVEVGDP-------------
::::::.::: .:: : :: .: ::.... . .. ....:
CCDS58 VEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGSMSDG
410 420 430 440 450 460
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pF1KE1 --NPD-------VVSFRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITNQMSIDELSPCEEEAPPSPA
.:: . ::... : ::.::..::: ::
CCDS58 SYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQEARTSSQKCEFIHQ
470 480 490 500 510
530
pF1KE1 EDEHNQNGNLD
>>CCDS86900.1 PDE1A gene_id:5136|Hs109|chr2 (529 aa)
initn: 2015 init1: 1934 opt: 1934 Z-score: 2263.1 bits: 428.4 E(33420): 1e-119
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 PEMLEESDCPSPLELKSAPSKKMWIKLRSLLRYMVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLE
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CCDS86 MDDHVTIRKKHLQRPIFRLRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLE
10 20 30 40
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pF1KE1 AVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHA
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