Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1434
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1434, 784 aa
1>>>pF1KE1434 784 - 784 aa - 784 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7763+/-0.00125; mu= 18.1354+/- 0.074
mean_var=109.6179+/-22.727, 0's: 0 Z-trim(101.8): 183 B-trim: 254 in 1/52
Lambda= 0.122499
statistics sampled from 6535 (6752) to 6535 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 1.760
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs109|chr4 ( 784) 5157 923.8 0
CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs109|chr4 ( 811) 1205 225.3 3.1e-58
CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs109|chr4 ( 786) 1182 221.3 5.1e-57
CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs109|chr4 ( 796) 1174 219.8 1.4e-56
CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs109|chrX (1041) 529 106.0 3.4e-22
CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs109|chrX (1059) 529 106.0 3.5e-22
CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs109|chrX (1049) 525 105.3 5.6e-22
CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs109|chr9 ( 839) 512 102.9 2.4e-21
CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs109|chr4 ( 904) 404 83.8 1.4e-15
CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs109|chr1 ( 858) 358 75.7 3.7e-13
>>CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs109|chr4 (784 aa)
initn: 5157 init1: 5157 opt: 5157 Z-score: 4933.9 bits: 923.8 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 5157; 100.0% identity (100.0% similar) in 784 aa overlap (1-784:1-784)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLEELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLEELE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IDASDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECLELRDTDLDTFHFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IDASDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECLELRDTDLDTFHFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVFLVPCLLSQHLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVFLVPCLLSQHLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLTLKNLTNIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLTLKNLTNIDI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SKNSFHSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRIHSVTGCIPKTLEILDVSNNNLNLFSLNLPQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SKNSFHSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRIHSVTGCIPKTLEILDVSNNNLNLFSLNLPQLK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 ELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 FLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 FLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 LILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 QELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 QELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 HFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 HFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRA
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 AIKS
::::
CCDS37 AIKS
>>CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs109|chr4 (811 aa)
initn: 812 init1: 515 opt: 1205 Z-score: 1159.1 bits: 225.3 E(33420): 3.1e-58
Smith-Waterman score: 1234; 30.9% identity (62.7% similar) in 789 aa overlap (13-782:9-775)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
.. :. .. : .:. . . :. :: ..:. :: :. .::::
CCDS34 MRLIRNIYIFCSIVMTAEGDAPELPEERELMTNCSNMSLRKVPADLTPATTTLDLS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
: . ...::.. .:..:.: : :. .. .: :..:::: : :. : .:.
CCDS34 YNLLFQLQSSDFHSVSKLRVLILCHNRIQQLDLKTFEFNKELRYLDLSNNRLK--SVTWY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE1 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLE--E
:..: .:.: : . :. .....:.:: ... .:::..:: .. :.
CCDS34 L-LAGLRYLDLSFNDFDTMPICEEAGNMSHLEILGLSG----AKIQKSDFQKIAHLHLNT
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LEIDASDLQSYEPKSLKSIQNVS-HLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECLELRDTDLDTF
. . : :: :: ..... :..: : .. .: . : .. . ::. . : .
CCDS34 VFLGFRTLPHYEEGSLPILNTTKLHIVLPMDTNFWVL--LRDGIKTSKILEMTNIDGKSQ
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 HFS-ELSTGET--NSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGVGN
: :.. . . :. . . . .: . ..:: ..... . : . .... . :..:
CCDS34 FVSYEMQRNLSLENAKTSVLLLNKVDLLWDDLFLILQFVWHTS-VEHFQIRNVTFGG---
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFY-DLSTLYSLTER--VKRITVENSKVFLV
.: . .: ... ::. :. .: .:: . . .: : . .. .:. :...
CCDS34 -KAYLDHNSFDYSNTVMRTIKLEHV-HFRVFYIQQDKIYLLLTKMDIENLTISNAQM---
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PCLLSQHLKS-LEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLL
: .: . . ..::....:....: .: . : :.:::: :.: .: .. .
CCDS34 PHMLFPNYPTKFQYLNFANNILTDELFKRTI---QLPHLKTLILNGNKLETLSLVS-CFA
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KE1 TLKNLTNIDISKNSF-HSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRIH-SVTGCIPKTLEILDVSNNN
. : ..:.:.: . :. :.:.::: . .::: ... :: :.::...:::..::.
CCDS34 NNTPLEHLDLSQNLLQHKNDENCSWPETVVNMNLSYNKLSDSVFRCLPKSIQILDLNNNQ
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 LNLF---SLNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTL
.. ...: :.:: :. : : :: : . : ::.: : : . : . ..: . .
CCDS34 IQTVPKETIHLMALRELNIAFNFLTDLPGCSHFSRLSVLNIEMNFILSPSLDFVQSCQEV
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 KTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSEC
:::.:: : : :.::. .: : . ... : .: :. : ..:: ...::.: :
CCDS34 KTLNAGRNPFRCTCELKNFIQLETYSEVMMVGWSDSYTCEYPLNLRGTRLKDVHLHELSC
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 HRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMM----WAWLQAKRKPRKAPSRNICY
. . :. . ...: : .. : .: ::..:. .: .... .. .::. .
CCDS34 NTALLIVTIVVIMLVLGLAVAFCCLHFDLPWYLRMLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRF
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 DAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVF
::.::::.:. ::.: .. .::. . . .::.. : ::: : .::.. ::::.:..:
CCDS34 HAFISYSEHDSLWVKNELIPNLEKEDGSILICLYESYFDPGKSISENIVSFIEKSYKSIF
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 VLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTY
::: :::..:::.::. :.: :: ::.: :::::::: :: :. ::. ... :.:
CCDS34 VLSPNFVQNEWCHYEFYFAHHNLFHENSDHIILILLEPIPFYCIPTRYHKLKALLEKKAY
700 710 720 730 740 750
770 780
pF1KE1 LEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
:::: :. . ::.::::::
CCDS34 LEWPKDRRKCGLFWANLRAAINVNVLATREMYELQTFTELNEESRGSTISLMRTDCL
760 770 780 790 800 810
>>CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs109|chr4 (786 aa)
initn: 975 init1: 467 opt: 1182 Z-score: 1137.3 bits: 221.3 E(33420): 5.1e-57
Smith-Waterman score: 1248; 30.3% identity (65.2% similar) in 775 aa overlap (28-782:21-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
:: . . . :...: .:. :.. . :..:
CCDS33 MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
.: :. . .::. .:. :... : :. .. . :. ::.::::.: : ..:
CCDS33 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISC---
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLEELE
.: .: :.: : . .: . :.....:..: ... . : . .: :.. . :
CCDS33 HPTVNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTH-LEKSSVLPIAHLNISKVLL
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE1 IDASDL-QSYEPKSLKSIQNVS-HLILHM-KQHILLLEIFVDVT-----SSVECLELRDT
. . .. .:..:..... : :... :. ..:.. : .. :...:. :.:.
CCDS33 VLGETYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCV-LEDN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGV
. : .: :. .:: ....:. :.. : .:......:. . . . . ... :.:
CCDS33 KCSYF-LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTT-VWYFSISNVKLQGQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GNFRASD-NDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVFLV
.:: : . . ... .. . .:. :.. .:.. .: .:: ... .:
CCDS33 LDFRDFDYSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNM-----NIKNFTVSGTR--MV
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLT
: .... . .::.:.::... ..: : :.::::..:.: : : .:
CCDS33 HMLCPSKISPFLHLDFSNNLLTDTVFEN--C-GHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQ
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KE1 LKNLTNIDISKNS--FHSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRI-HSVTGCIPKTLEILDVSNNN
.:.: ..:::.:: . :.: ... ::.::. . .. :.: ...::. .:.
CCDS33 MKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNK
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 LNLFS---LNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTL
.. . ..: :.:: .. :.: :: . . : :: :..:... : . ..: . .
CCDS33 IKSIPKQVVKLEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKM
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 KTLEAGGNNFICSCEFLSFTQE-QQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSE
....:: : : :.::. :... .:. ..:: :: .: :: : :: ..: ..:
CCDS33 RSIKAGDNPFQCTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELS
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 CHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAP----SRNIC
:. : :. . ....: . . :: . ::..:. : :..:. :. : .::.
CCDS33 CNITLLIVTIVATMLVLAVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQ
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 YDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTV
. ::.::: .:..::.: .. .:: . ...:::.:.:.::: :..::: ::::.:..
CCDS33 FHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLE--KEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSI
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 FVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKT
:::: :::.::::.::: :.: :: :.... :::::::: . .::. . ::...: .:
CCDS33 FVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRT
700 710 720 730 740 750
770 780
pF1KE1 YLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
::::: ....: ::.::::::
CCDS33 YLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK
760 770 780
>>CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs109|chr4 (796 aa)
initn: 1016 init1: 462 opt: 1174 Z-score: 1129.6 bits: 219.8 E(33420): 1.4e-56
Smith-Waterman score: 1265; 31.5% identity (64.8% similar) in 793 aa overlap (11-781:17-780)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAV
: .:: .. . :. .. :. :. .: .:. : .
CCDS34 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDK------SKRGLIHVPKDLPLKT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KSLDLSNNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSN
: ::.:.: :. .. ::.. .: .: :. : :. .. . :. .::.::::.: :..
CCDS34 KVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLT
.: .:. :. :.: : .:.: . :..:..:..: .. : :.:. :. ..
CCDS34 ISC---HPIVSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAM----KLQKLDLLPIA
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 FLEELEIDASDLQSYEPKS--LKSIQNVSHLILHMKQHIL-LLEIFVDVT-SSVECLELR
:. : ::..: : .:.: .. ::. : :. : :... ... ::.:
CCDS34 HLH-LSYILLDLRNYYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE1 DTDLD-----TF--HFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELE
. :. .: .:::. : : . .::. ... : . : .:...: . . :.
CCDS34 NIKLNDDNCQVFIKFLSELTRGST---LLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFL-WPKPVEYLN
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 FDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITV
. . :. . ..: ..: . . ...:::. :: .... ..::.. ... . .
CCDS34 IYNLTI--IESIR--EEDFTYSKTTLKALTIE--HITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMML
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 ENSKVFLVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLE
: . .. : . .....:....:.... ... : .. .:.::::..: : .:
CCDS34 TISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNFTQNVFTDSIFEK--C-STLVKLETLILQKNGLKDLF
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 KTGETLLTLKNLTNIDISKNSFHS--MPETCQWPEKMKYLNLSSTRI-HSVTGCIPKTLE
:.: . .: .:.: ::..: :.: : :.. :::::. . :: :.: ..
CCDS34 KVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIK
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KE1 ILDVSNNNLNLFS---LNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKE
.::. .:... ..: :.:: .. :.: :: . . : :: :..:... : .
CCDS34 VLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSAD
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 QLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQE-QQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQ
..: . .....:: : : :.::. :... .:. ..:: :: .: :: : ::. ..
CCDS34 FFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLK
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 DVRLSVSECHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAP-
: ..: :. : :. . ....: . . :: . ::..:. : :..:. :. :
CCDS34 DFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPL
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 ---SRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDS
.::. . ::.::::.:. ::.. .: ::. . ...:::.:.:.::: :..:::.
CCDS34 EELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSELVPYLEKED--IQICLHERNFVPGKSIVENIINC
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 IEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKL
::::.:..:::: :::.::::.::: :.: :: :... :::::::: ...::... ::
CCDS34 IEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKL
700 710 720 730 740 750
760 770 780
pF1KE1 RKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
. .:. .:::.:: ....: ::.:.:::
CCDS34 KALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS
760 770 780 790
>>CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs109|chrX (1041 aa)
initn: 464 init1: 212 opt: 529 Z-score: 512.1 bits: 106.0 E(33420): 3.4e-22
Smith-Waterman score: 666; 26.5% identity (57.0% similar) in 825 aa overlap (42-782:212-1022)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 GVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLSNNRITYISNSD
::. .: : ....: :::..: :::. :
CCDS14 YFNKVCEKTNIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPKLPSSLRKLFLSNTQIKYISEED
190 200 210 220 230 240
80 90 100 110
pF1KE1 LQRCVNLQALVLTSN---------------GINTIEED--SFSSLGSLEHLDLSYNYLSN
.. .:: : :..: : .:. : .:..: .:..:.:: . : .
CCDS14 FKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSLRK
250 260 270 280 290 300
120 130 140 150 160
pF1KE1 LSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETS---LFSHLTKLQILRV------GNMDTFTKI
....::: . : :.: : : .:: . ... : .:.:: . :.. .:
CCDS14 INAAWFKNMPHLKVLDLEFN-Y-LVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYPQHINI
310 320 330 340 350
170 180 190 200 210
pF1KE1 QRKDFAGLTFLEELEIDA---SDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMK----------QHIL
.: .:. : :. :.. . ..:. . . : .. :.: . : .. :..
CCDS14 SR-NFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQIDFKLFQNFS
360 370 380 390 400 410
220 230 240 250 260
pF1KE1 LLEIFVDVTSSVECL--ELRDTDLDTFHFSEL-----STG---ETNSLIKKFTFRNVKIT
:::. . . : . :.. .. :.. :: . .: . .:: .:
CCDS14 NLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSSSFQRHIRKRRSTDFEFDPHSNFYHFTRPLIKPQ
420 430 440 450 460 470
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 DESLFQVMKL-LNQISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLT-IRRLHIP
. ... : ::.: . .:.. . :. :..: .:.. . .. .. : .
CCDS14 CAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLT
480 490 500 510 520 530
330 340 350 360 370
pF1KE1 RFYLFYD-LSTLYSLTERVKRITVENSKVFLVPCLLS-----QHLKSLEYLDLSENLMVE
: .: :.: :.. ::. : . . :.. .:. :.::.: .
CCDS14 NNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNNI--
540 550 560 570 580 590
380 390 400 410 420
pF1KE1 EYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGET-----LLTLKNLTNIDISKNSFHSMP
: .. . :: :.. :.: : . .. . ::::: .:.: : .. .:
CCDS14 -YTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIP
600 610 620 630 640 650
430 440 450 460 470
pF1KE1 ETC--QWPEKMKYLNLSSTRIH----SVTGCIPKTLEILDVSNNNLNLFSLNLPQ----L
. . : .. :..... .. .. .:. ::.::. .:.: ... .: . :
CCDS14 NEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPR-LELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSL
660 670 680 690 700 710
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 KELYISRNKLMTLPDASL--LPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKT--LEAGGNNF
. : .:.:.. ::.. : . : : .: : . :..: :.. : : :: :: :
CCDS14 RTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPF
720 730 740 750 760 770
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 ICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMC
:.:.. .: . .. .: : .. .: ::. ::... ...:.. ::.. .
CCDS14 ECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLVDVICASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVIL-FF
780 790 800 810 820 830
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 CALFL--LILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKP-RKAPSRNICYDAFVSYSERDA
..:. ...:... : :. : . ... :: : :. . . :::..::. .::
CCDS14 FTFFITTMVMLAALAHHLFY--WDVWFIYNVCLAKVKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDA
840 850 860 870 880 890
660 670 680 690 700
pF1KE1 Y---WVENLMVQELE-NFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFV
:: : . .:: . . :::..::. :: ::::...::..:.::::::.....
CCDS14 SVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYA
900 910 920 930 940 950
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 KSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDE
:: : . .. ::.::: :. :.:::::. ... .. .::. . .. :.:: :.
CCDS14 KSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHS---QYLRLRQRICKSSILQWP-DN
960 970 980 990 1000
770 780
pF1KE1 AQREG-FWVNLRAAIKS
. :: :: .:: ..
CCDS14 PKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY
1010 1020 1030 1040
>>CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs109|chrX (1059 aa)
initn: 464 init1: 212 opt: 529 Z-score: 512.0 bits: 106.0 E(33420): 3.5e-22
Smith-Waterman score: 666; 26.5% identity (57.0% similar) in 825 aa overlap (42-782:230-1040)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 GVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLSNNRITYISNSD
::. .: : ....: :::..: :::. :
CCDS14 YFNKVCEKTNIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPKLPSSLRKLFLSNTQIKYISEED
200 210 220 230 240 250
80 90 100 110
pF1KE1 LQRCVNLQALVLTSN---------------GINTIEED--SFSSLGSLEHLDLSYNYLSN
.. .:: : :..: : .:. : .:..: .:..:.:: . : .
CCDS14 FKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSLRK
260 270 280 290 300 310
120 130 140 150 160
pF1KE1 LSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETS---LFSHLTKLQILRV------GNMDTFTKI
....::: . : :.: : : .:: . ... : .:.:: . :.. .:
CCDS14 INAAWFKNMPHLKVLDLEFN-Y-LVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYPQHINI
320 330 340 350 360 370
170 180 190 200 210
pF1KE1 QRKDFAGLTFLEELEIDA---SDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMK----------QHIL
.: .:. : :. :.. . ..:. . . : .. :.: . : .. :..
CCDS14 SR-NFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQIDFKLFQNFS
380 390 400 410 420 430
220 230 240 250 260
pF1KE1 LLEIFVDVTSSVECL--ELRDTDLDTFHFSEL-----STG---ETNSLIKKFTFRNVKIT
:::. . . : . :.. .. :.. :: . .: . .:: .:
CCDS14 NLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSSSFQRHIRKRRSTDFEFDPHSNFYHFTRPLIKPQ
440 450 460 470 480 490
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 DESLFQVMKL-LNQISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLT-IRRLHIP
. ... : ::.: . .:.. . :. :..: .:.. . .. .. : .
CCDS14 CAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLT
500 510 520 530 540 550
330 340 350 360 370
pF1KE1 RFYLFYD-LSTLYSLTERVKRITVENSKVFLVPCLLS-----QHLKSLEYLDLSENLMVE
: .: :.: :.. ::. : . . :.. .:. :.::.: .
CCDS14 NNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNNI--
560 570 580 590 600 610
380 390 400 410 420
pF1KE1 EYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGET-----LLTLKNLTNIDISKNSFHSMP
: .. . :: :.. :.: : . .. . ::::: .:.: : .. .:
CCDS14 -YTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIP
620 630 640 650 660 670
430 440 450 460 470
pF1KE1 ETC--QWPEKMKYLNLSSTRIH----SVTGCIPKTLEILDVSNNNLNLFSLNLPQ----L
. . : .. :..... .. .. .:. ::.::. .:.: ... .: . :
CCDS14 NEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPR-LELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSL
680 690 700 710 720 730
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 KELYISRNKLMTLPDASL--LPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKT--LEAGGNNF
. : .:.:.. ::.. : . : : .: : . :..: :.. : : :: :: :
CCDS14 RTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPF
740 750 760 770 780 790
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 ICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMC
:.:.. .: . .. .: : .. .: ::. ::... ...:.. ::.. .
CCDS14 ECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLVDVICASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVIL-FF
800 810 820 830 840 850
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 CALFL--LILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKP-RKAPSRNICYDAFVSYSERDA
..:. ...:... : :. : . ... :: : :. . . :::..::. .::
CCDS14 FTFFITTMVMLAALAHHLFY--WDVWFIYNVCLAKVKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDA
860 870 880 890 900
660 670 680 690 700
pF1KE1 Y---WVENLMVQELE-NFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFV
:: : . .:: . . :::..::. :: ::::...::..:.::::::.....
CCDS14 SVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYA
910 920 930 940 950 960
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 KSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDE
:: : . .. ::.::: :. :.:::::. ... .. .::. . .. :.:: :.
CCDS14 KSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHS---QYLRLRQRICKSSILQWP-DN
970 980 990 1000 1010 1020
770 780
pF1KE1 AQREG-FWVNLRAAIKS
. :: :: .:: ..
CCDS14 PKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY
1030 1040 1050
>>CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs109|chrX (1049 aa)
initn: 325 init1: 213 opt: 525 Z-score: 508.2 bits: 105.3 E(33420): 5.6e-22
Smith-Waterman score: 700; 28.7% identity (58.2% similar) in 794 aa overlap (36-784:273-1035)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 WMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSG---SLNSIPSGLTEAVKSLDLSNN
::..: .:.. ..::: .: : : .:
CCDS14 DDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAF-DALTE-LKVLRLHSN
250 260 270 280 290 300
70 80 90 100 110
pF1KE1 RITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGI-NTIEEDSFSS-LGSLEHLDLSYN-----YLSNL
. .. .. .:: : :..: . . : . .: : :: .::::.: : ...
CCDS14 SLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASM
310 320 330 340 350 360
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 S-SSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDT-FTKIQRKD-FAG
. :. :. :.:: .: . : .: : .: : : .:: :.: .. : : :: . :
CCDS14 NLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNL-SPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQ
370 380 390 400 410
180 190 200 210 220
pF1KE1 LTFLEELEIDASDLQ-SYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHIL-LLEIFVDVTSSVEC-LEL
. :. ...... .. : . . . .:. . .. ..: :. : . : ..
CCDS14 FKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKN
420 430 440 450 460 470
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 RDTDLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTL
..... . . : . :.: .: :. : :: .: . .. .: :: .:: : . ::
CCDS14 KEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFF-VKSSDFQHLSFLKCLN-LSGNLISQ----TL
480 490 500 510 520 530
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 NGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVF
:: ..:. . : .: .. . : . :: : .. : .: ... . . :. .
CCDS14 NG-SEFQPLAELRYLDFSN-NRLDL--LHSTAFEELHKLEVL-DISSNSHYFQSEGITHM
540 550 560 570 580
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 LVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGET-
: ....:: :. : ...: . .. : ::.:: .: ::: : . :..
CCDS14 LN---FTKNLKVLQKLMMNDNDISSSTSRTMESE----SLRTLEFRGNHLDVLWREGDNR
590 600 610 620 630 640
410 420 430 440 450
pF1KE1 -LLTLKNLTNI---DISKNSFHSMPETC--QWPEKMKYLNLSSTRIHSVT----GCIPKT
: .::: .. ::::::. .: : ..: :.:... ..: . :. :.
CCDS14 YLQLFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCL-KN
650 660 670 680 690 700
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 LEILDVSNNNLNLFSLNLPQ----LKELYISRNKLMTLPDASLLP--MLLVLKISRNAIT
:: ::.:.:.:. : . ::.: .. :.. .: : .: : .: : :
CCDS14 LETLDLSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQ
710 720 730 740 750 760
520 530 540 550 560
pF1KE1 TFSKEQL--DSFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPA-NYLCDSPSH
..: .. . ...:: : : :.:.:. . :. ..: : . : . : .:.
CCDS14 MIQKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVW-WVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGA
770 780 790 800 810
570 580 590 600 610 620
pF1KE1 VRGQQVQDVRLSVSECHRTALVS---GMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQ
.::.: .. : . : : :. .. .:::....:. . : .::. . . .
CCDS14 HKGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLY-FWDVWYI---YHFCK
820 830 840 850 860 870
630 640 650 660 670 680
pF1KE1 AKRKP-RKAPSRNICYDAFVSYSERD---AYWVENLMVQELEN-FNPPFKLCLHKRDFIP
:: : .. : . :::::. :. .: . :: .: .::. . :.:::..::..:
CCDS14 AKIKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLP
880 890 900 910 920 930
690 700 710 720 730 740
pF1KE1 GKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLE-PI
:. ...:. .::. :.:::::......:.: : . .:: ::.::. :. :::.:: :.
CCDS14 GQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPF
940 950 960 970 980 990
750 760 770 780
pF1KE1 EKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
.:. .: .::: . .. :::: . . :: :. :. .
CCDS14 QKS----KFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
1000 1010 1020 1030 1040
>>CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs109|chr9 (839 aa)
initn: 580 init1: 239 opt: 512 Z-score: 497.0 bits: 102.9 E(33420): 2.4e-21
Smith-Waterman score: 690; 27.3% identity (55.7% similar) in 795 aa overlap (79-782:57-815)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 GLTEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLS
. : :. : . . :: :. :. ::::
CCDS68 EPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLDLSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLS
30 40 50 60 70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 YNYLSNLSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRK
.... .. .. :: :. : : ::: ..:. . :: :..:: : :. ......
CCDS68 RCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLA-LGAFSGLSSLQKL-VAVETNLASLENF
90 100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 DFAGLTFLEELEIDASDLQSYE-PKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECL
.. : :.::.. . .::.. :. .... :. :: : .. .:. :
CCDS68 PIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHLDLSSNK-----------IQSIYCT
150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 ELRDT-DLDTFHFS-ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESL---FQVMKLLNQ-ISGLLE
.:: .. ...: .:: . : .:. .:..... .: :. ..... :.::
CCDS68 DLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMN-FIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSLNVMKTCIQGLAG
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330
pF1KE1 LEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVE---TLTIRRLHIPRF-YLFYDLSTLYSLTER
:: .: :.:: : . .: . .: .:::..... . : . :. :..
CCDS68 LEVHRLVL---GEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDIIDLFNCLTN
260 270 280 290 300
340 350 360 370
pF1KE1 VKR-----ITVENSKVF----------LVPCLLSQ----HLKSLEYLDLSENLMVEEYLK
:. .:.: : : :: : ..: .::::. : .. :
CCDS68 VSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTSN-----KGG
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410
pF1KE1 NSACEDAWPSLQTLILRQNHLA-----SLEKTGET------------------LLTLKNL
:. : :::. : : .: :. : : : .: :..:
CCDS68 NAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLGLEQL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KE1 TNIDISKNSFHSMPETCQWP--EKMKYLNLSSTRIHSVTGCIPK---TLEILDVSNNNL-
..:........: : . ... ::..: :. . . . : . .::.: ...:..
CCDS68 EHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAGNSFQ
430 440 450 460 470 480
470 480 490
pF1KE1 ------------NLFSLNLPQ----------------LKELYISRNKLMTLPD--ASLLP
:: :.: : :. : .:.:....: . :
CCDS68 ENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPYKCLN
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 MLLVLKISRNAITTFSKEQLDSF-HTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDW
: :: : : : : .:..:. : .: :. :.: :.:: :: : . ..:..
CCDS68 SLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLVEV
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KE1 PANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYM
. : .:: .:. : . :... :. . . :. :.. ...:: ..:. ...
CCDS68 E-RMECATPSDKQGMPV--LSLNIT-CQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFY--FHL
610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KE1 KMMWAWLQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRD
.. . .. : ..:: ::::: :: .: ::.: .:..::. :::.:::: ::
CCDS68 MLLAGCIKYGR------GENI-YDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRD
660 670 680 690 700 710
680 690 700 710 720 730
pF1KE1 FIPGKWIIDNII-DSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILL
:::: : ::: ....::.:.. :.:..:..:.:: .: .... : . . :.:.:
CCDS68 FIPGVAIAANIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVL
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780
pF1KE1 EPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
. .:: . :. .: .... .::::: . :. :: :: :.
CCDS68 QKVEKTLLRQQV-ELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTG
780 790 800 810 820 830
CCDS68 CNWQEATSI
>>CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs109|chr4 (904 aa)
initn: 346 init1: 137 opt: 404 Z-score: 393.5 bits: 83.8 E(33420): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 553; 24.1% identity (57.5% similar) in 804 aa overlap (21-784:145-899)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGL
...: .:. ..::. . . :. ..
CCDS38 SDKTFAFCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLITLDLSHNGLSSTKLGTQVQL----
120 130 140 150 160 170
60 70 80 90 100
pF1KE1 TEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQRCVN--LQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLS
: .. : ::::.: ... .:. .: :. : :.:: :. . : ..: : : :.
CCDS38 -ENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFANSSLKKLELSSNQIKEFSPGCFHAIGRLFGLFLN
180 190 200 210 220
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 YNYLS-NLSSSWFKPLSSLTFLNL-LGNPYKTLGETSLFSHL--TKLQILRVGNMDTFTK
:. .:. . :.. .. :: :.: . .. : : :.: .: . ......
CCDS38 NVQLGPSLTEKLCLELANTSIRNLSLSNSQLSTTSNTTFLGLKWTNLTMLDL-SYNNLNV
230 240 250 260 270 280
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IQRKDFAGLTFLEELEIDASDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSV
. .:: : :: . .. ...: .::... :: . :..:. :. . :.
CCDS38 VGNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRY--LNLKRS------FTKQSISL
290 300 310 320 330 340
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 ECLELRDTDLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEF
: .: : :. :. : .... :... . . :...::..:..
CCDS38 ASLP----KIDDFSFQWLKCLE-----------HLNMEDNDIPGIKS--NMFTGLINLKY
350 360 370 380
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 DDCTLNGVGNFRASDNDRVID----PGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKR
. . :. ..:. :. .. : .. .:: .. . : :. : : ...
CCDS38 LSLS-NSFTSLRTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNE
390 400 410 420 430 440
350 360 370 380 390
pF1KE1 ITVENSKVFLVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAW-PSLQTLILRQNHL
: : : .:. ..:: . . : ..::. . : :::: :.::. :
CCDS38 IGQE---------LTGQEWRGLENI-FEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLMLRRVAL
450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 ASLEKTGETLLTLKNLTNIDISKNSFHSM-PETCQWPEKMKYLNLSSTRI-----HSVTG
..... . :.::: .:.:.:.. .. . . ::.. :.:. . . :. :
CCDS38 KNVDSSPSPFQPLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLEKLEILDLQHNNLARLWKHANPG
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500
pF1KE1 CIP-------KTLEILDVSNNNLNLFSL----NLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLL
: . :.::.. .:... . . .: .:: . .. :.: ::: ::.. .
CCDS38 G-PIYFLKGLSHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNTLP-ASVFNNQV
560 570 580 590 600 610
510 520 530 540 550
pF1KE1 VLK---ISRNAITTFSKEQLD-SFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLS-FTQEQQALAKVLID
:: ...: ::. :. . .:..: :. : : :.:: .. :.. . . .
CCDS38 SLKSLNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTNIPE
620 630 640 650 660 670
560 570 580 590 600 610
pF1KE1 WPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTA--LVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGL
..:::..: : .: :. ...: :. .: . : . .:::.. :: .:.:
CCDS38 LSSHYLCNTPPHYHGFPVR--LFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEG-
680 690 700 710 720
620 630 640 650 660 670
pF1KE1 WYMKMMWAWLQAKR----KPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFK
: ....: ....: : .... : :.. .. .: :: . . .:. . .:
CCDS38 WRISFYWN-VSVHRVLGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDKDWVWE-HFSSMEKEDQSLK
730 740 750 760 770 780
680 690 700 710 720 730
pF1KE1 LCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCK-YELDFSHFRLFDENND
.::..::: : . .. :..::..:.: .::......:. :: ... . . ...: :
CCDS38 FCLEERDFEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLD
790 800 810 820 830 840
740 750 760 770 780
pF1KE1 AAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
. ::..:: : . . .: : ..... :.::... . .: .:..:. :
CCDS38 SIILVFLEEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH
850 860 870 880 890 900
>>CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs109|chr1 (858 aa)
initn: 475 init1: 147 opt: 358 Z-score: 349.8 bits: 75.7 E(33420): 3.7e-13
Smith-Waterman score: 530; 24.1% identity (55.3% similar) in 796 aa overlap (44-767:64-821)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 IISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQ
.:.: . : .. :.:... ...
CCDS31 RFCNLTQVPQVLNTTERLLLSFNYIRTVTASSFP--FLEQLQLLELGSQYTPLTIDKEAF
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 RCV-NLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSN--LSSSWFKPLSSLTFLN
: . ::. : : :. : .. :.:..: : .: : . ::. :....:. :..:: :.
CCDS31 RNLPNLRILDLGSSKIYFLHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLD
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180
pF1KE1 LLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRK--DFAGLTFLEELEIDASDLQS
: : ..: :..:..:. . .. . : ... . : : : . . :..: :
CCDS31 LSKNQIRSLYLHPSFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPLQGKT-LSFFSLAANSLYS
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220
pF1KE1 YEP----KSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEI---FVDVTSSVECLEL------------
: .. ..:. :: .. . ..: : .. :. . . :
CCDS31 RVSVDWGKCMNPFRNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFG
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270
pF1KE1 ----RDTDLDTF---------HFSELSTGETNSLIKKF--TFRNVKITDESLFQVMKLLN
.: : .:: :. .:: : . :: .. :....:. . . .. :. .
CCDS31 FHNIKDPDQNTFAGLARSSVRHL-DLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINKIAD
280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 Q-ISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYS
. . :: .:. . . : .:.. .:. :: . ... :: .. : . ..
CCDS31 EAFYGLDNLQVLNLSYNLLGELYSSN---FYGLPKVAYIDLQKNHIA---IIQDQT--FK
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380
pF1KE1 LTERVKRITVEN---SKVFLVPCL----LS-QHLKSLEYLDLSENL--MVEEYLKNSACE
. :... . ... . . ..: . :: ..: .: ..:. :: . :. :.:
CCDS31 FLEKLQTLDLRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLPKINLTANLIHLSENRLENLDIL
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430
pF1KE1 DAW---PSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLTLK-NLTNIDISKNSFHSMPET--CQWPEK
: :: ::: ::...: .:. . . .: .. ...: .. :: : :
CCDS31 YFLLRVPHLQILILNQNRFSSC--SGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELC-WD--
450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 MKYLNLSSTRIHSVTGCIPKTLEILDVSNNNLN-----LFSLNLPQLKELYISRNKLMTL
. .:: : :..: ...: :: .:: .: :. : .. :.: .:
CCDS31 -VFEGLS----H---------LQVLYLNHNYLNSLPPGVFS-HLTALRGLSLNSNRLTVL
500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 PDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALA
.: : .: :::: . . . : : .:..:. :.::: ::. .: . .
CCDS31 SHNDLPANLEILDISRNQLLAPNP---DVFVSLSVLDITHNKFICECELSTFINWLNHTN
550 560 570 580 590
560 570 580 590 600
pF1KE1 KVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFL-------LILLT
.. ::. : :. : :. ::. : . ..... .::. :.:.:
CCDS31 VTIAGPPADIYCVYPDSFSG--VSLFSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMT
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 GVLCHRFHGLWYMKMMWAW-LQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELE
. .:.:. .. . : : : .:. . :::.. .: .: ::.: ....:.
CCDS31 ILTVTKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLD
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 N-FNPP--FKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSH
. .. :.::...:::.::. : :: :.: .:.: : ..:..:... :: .....
CCDS31 TQYSDQNRFNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQ
720 730 740 750 760 770
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 FRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAA
: ... :.: :.... . . . .. ..: ... . ::.:: :
CCDS31 GRCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQL-MKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQ
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 IKS
CCDS31 ILKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS
840 850
784 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Feb 19 20:47:08 2021 done: Fri Feb 19 20:47:09 2021
Total Scan time: 1.760 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]