Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1498
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1498, 1591 aa
1>>>pF1KE1498 1591 - 1591 aa - 1591 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4233+/-0.00113; mu= 13.9098+/- 0.068
mean_var=120.2026+/-24.257, 0's: 0 Z-trim(106.3): 129 B-trim: 80 in 2/49
Lambda= 0.116982
statistics sampled from 8747 (8886) to 8747 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 6.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13609.1 TIAM1 gene_id:7074|Hs108|chr21 (1591) 10433 1773.2 0
CCDS34558.1 TIAM2 gene_id:26230|Hs108|chr6 (1701) 1724 303.4 4.2e-81
CCDS34559.1 TIAM2 gene_id:26230|Hs108|chr6 ( 626) 1672 294.4 7.7e-79
>>CCDS13609.1 TIAM1 gene_id:7074|Hs108|chr21 (1591 aa)
initn: 10433 init1: 10433 opt: 10433 Z-score: 9513.5 bits: 1773.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10433; 100.0% identity (100.0% similar) in 1591 aa overlap (1-1591:1-1591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGNAESQHVEHEFYGEKHASLGRKHTSRSLRLSHKTRRTRHASSGKVIHRNSEVSTRSSS
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CCDS13 MGNAESQHVEHEFYGEKHASLGRKHTSRSLRLSHKTRRTRHASSGKVIHRNSEVSTRSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TPSIPQSLAENGLEPFSQDGTLEDFGSPIWVDRVDMGLRPVSYTDSSVTPSVDSSIVLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TPSIPQSLAENGLEPFSQDGTLEDFGSPIWVDRVDMGLRPVSYTDSSVTPSVDSSIVLTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ASVQSMPDTEESRLYGDDATYLAEGGRRQHSYTSNGPTFMETASFKKKRSKSADIWREDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ASVQSMPDTEESRLYGDDATYLAEGGRRQHSYTSNGPTFMETASFKKKRSKSADIWREDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LEFSLSDLSQEHLTSNEEILGSAEEKDCEEARGMETRASPRQLSTCQRANSLGDLYAQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LEFSLSDLSQEHLTSNEEILGSAEEKDCEEARGMETRASPRQLSTCQRANSLGDLYAQKN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SGVTANGGPGSKFAGYCRNLVSDIPNLANHKMPPAAAEETPPYSNYNTLPCRKSHCLSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SGVTANGGPGSKFAGYCRNLVSDIPNLANHKMPPAAAEETPPYSNYNTLPCRKSHCLSEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ATNPQISHSNSMQGRRAKTTQDVNAGEGSEFADSGIEGATTDTDLLSRRSNATNSSYSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATNPQISHSNSMQGRRAKTTQDVNAGEGSEFADSGIEGATTDTDLLSRRSNATNSSYSPT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TGRAFVGSDSGSSSTGDAARQGVYENFRRELEMSTTNSESLEEAGSAHSDEQSSGTLSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TGRAFVGSDSGSSSTGDAARQGVYENFRRELEMSTTNSESLEEAGSAHSDEQSSGTLSSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 GQSDILLTAAQGTVRKAGALAVKNFLVHKKNKKVESATRRKWKHYWVSLKGCTLFFYESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GQSDILLTAAQGTVRKAGALAVKNFLVHKKNKKVESATRRKWKHYWVSLKGCTLFFYESD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 GRSGIDHNSIPKHAVWVENSIVQAVPEHPKKDFVFCLSNSLGDAFLFQTTSQTELENWIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GRSGIDHNSIPKHAVWVENSIVQAVPEHPKKDFVFCLSNSLGDAFLFQTTSQTELENWIT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 AIHSACATAVARHHHKEDTLRLLKSEIKKLEQKIDMDEKMKKMGEMQLSSVTDSKKKKTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AIHSACATAVARHHHKEDTLRLLKSEIKKLEQKIDMDEKMKKMGEMQLSSVTDSKKKKTI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 LDQIFVWEQNLEQFQMDLFRFRCYLASLQGGELPNPKRLLAFASRPTKVAMGRLGIFSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LDQIFVWEQNLEQFQMDLFRFRCYLASLQGGELPNPKRLLAFASRPTKVAMGRLGIFSVS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 SFHALVAARTGETGVRRRTQAMSRSASKRRSRFSSLWGLDTTSKKKQGRPSINQVFGEGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SFHALVAARTGETGVRRRTQAMSRSASKRRSRFSSLWGLDTTSKKKQGRPSINQVFGEGT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 EAVKKSLEGIFDDIVPDGKREKEVVLPNVHQHNPDCDIWVHEYFTPSWFCLPNNQPALTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EAVKKSLEGIFDDIVPDGKREKEVVLPNVHQHNPDCDIWVHEYFTPSWFCLPNNQPALTV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 VRPGDTARDTLELICKTHQLDHSAHYLRLKFLIENKMQLYVPQPEEDIYELLYKEIEICP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VRPGDTARDTLELICKTHQLDHSAHYLRLKFLIENKMQLYVPQPEEDIYELLYKEIEICP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 KVTQSIHIEKSDTAADTYGFSLSSVEEDGIRRLYVNSVKETGLASKKGLKAGDEILEINN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KVTQSIHIEKSDTAADTYGFSLSSVEEDGIRRLYVNSVKETGLASKKGLKAGDEILEINN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 RAADALNSSMLKDFLSQPSLGLLVRTYPELEEGVELLESPPHRVDGPADLGESPLAFLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RAADALNSSMLKDFLSQPSLGLLVRTYPELEEGVELLESPPHRVDGPADLGESPLAFLTS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 NPGHSLCSEQGSSAETAPEETEGPDLESSDETDHSSKSTEQVAAFCRSLHEMNPSDQSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NPGHSLCSEQGSSAETAPEETEGPDLESSDETDHSSKSTEQVAAFCRSLHEMNPSDQSPS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 PQDSTGPQLATMRQLSDADKLRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQKETFLTQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PQDSTGPQLATMRQLSDADKLRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQKETFLTQDE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 LDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTLEDGVRLVPDLEKLEKVDQFKKVLFSLGGSFLYYADRFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTLEDGVRLVPDLEKLEKVDQFKKVLFSLGGSFLYYADRFK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE1 LYSAFCASHTKVPKVLVKAKTDTAFKAFLDAQNPKQQHSSTLESYLIKPIQRILKYPLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LYSAFCASHTKVPKVLVKAKTDTAFKAFLDAQNPKQQHSSTLESYLIKPIQRILKYPLLL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 RELFALTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHINEMQKIHEEFGAVFDQLIAEQTGEKKEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RELFALTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHINEMQKIHEEFGAVFDQLIAEQTGEKKEVA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE1 DLSMGDLLLHTTVIWLNPPASLGKWKKEPELAAFVFKTAVVLVYKDGSKQKKKLVGSHRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DLSMGDLLLHTTVIWLNPPASLGKWKKEPELAAFVFKTAVVLVYKDGSKQKKKLVGSHRL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE1 SIYEDWDPFRFRHMIPTEALQVRALASADAEANAVCEIVHVKSESEGRPERVFHLCCSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SIYEDWDPFRFRHMIPTEALQVRALASADAEANAVCEIVHVKSESEGRPERVFHLCCSSP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE1 ESRKDFLKAVHSILRDKHRRQLLKTESLPSSQQYVPFGGKRLCALKGARPAMSRAVSAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ESRKDFLKAVHSILRDKHRRQLLKTESLPSSQQYVPFGGKRLCALKGARPAMSRAVSAPS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE1 KSLGRRRRRLARNRFTIDSDAVSASSPEKESQQPPGGGDTDRWVEEQFDLAQYEEQDDIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KSLGRRRRRLARNRFTIDSDAVSASSPEKESQQPPGGGDTDRWVEEQFDLAQYEEQDDIK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE1 ETDILSDDDEFCESVKGASVDRDLQERLQATSISQRERGRKTLDSHASRMAQLKKQAALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ETDILSDDDEFCESVKGASVDRDLQERLQATSISQRERGRKTLDSHASRMAQLKKQAALS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590
pF1KE1 GINGGLESASEEVIWVRREDFAPSRKLNTEI
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GINGGLESASEEVIWVRREDFAPSRKLNTEI
1570 1580 1590
>>CCDS34558.1 TIAM2 gene_id:26230|Hs108|chr6 (1701 aa)
initn: 3032 init1: 1367 opt: 1724 Z-score: 1569.5 bits: 303.4 E(32554): 4.2e-81
Smith-Waterman score: 3364; 44.3% identity (70.7% similar) in 1349 aa overlap (230-1535:297-1599)
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LGSAEEKDCEEARGMETRASPRQLSTCQRANSLGDLYAQKNSGVTANGGP--GSKFAGYC
.:: .:: . : : . .: .... :
CCDS34 FLAPGMPDPSLHASFPPGDAKKPFNQSSSLSSLRELYKDANLGSLSPSGIRLSDEYMGTH
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300
pF1KE1 RNLVSDIPNLANHKMPPAAAEETP-PYSNYNTLPCRKSHCLSEGATNP--------QISH
.: . . .. .: .:. : ::.. :::::: . . : ... .::
CCDS34 ASLSNRVSFASDIDVPSRVAHGDPIQYSSF-TLPCRKPKAFVEDTAKKDSLKARMRRISD
330 340 350 360 370 380
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SNSMQGRRAKTTQDVNAGEGSEFADSGIEGATTDTDLLSRRSNATNSSYSPTTGRAFVGS
.. .:. . :. . :::.. :: .: .:: .. :.:. .: . . .
CCDS34 WTGSLSRKKRKLQEPRSKEGSDYFDSRSDGLNTD---VQGSSQASAFLWSGGSTQILSQR
390 400 410 420 430 440
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 DSGSSSTG-DAARQGVYENFRRELEMSTTNSESLEEAGSAHSDEQSSGTLSSPGQSDILL
. .. . : : ::..:::: :::::: ::.:..: :... :.:: .::: : :.:.
CCDS34 SESTHAIGSDPLRQNIYENFMRELEMSRTNTENIET--STETAESSSESLSSLEQLDLLF
450 460 470 480 490 500
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TAAQGTVRKAGALAVKNFLVHKKNKKVESATRRKWKHYWVSLKGCTLFFYESDGRSGIDH
::.::::: : : ... .:..:.: ..:::::.:::.::::::.:::. :....:.
CCDS34 EKEQGVVRKAGWLFFKPLVTVQKERKLELVARRKWKQYWVTLKGCTLLFYETYGKNSMDQ
510 520 530 540 550 560
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 NSIPKHAVWVENSIVQAVPEHPKKDFVFCLSNSLGDAFLFQTTSQTELENWITAIHSACA
.: :. :...:.::::.:::::::. :::::::.::..:::.::::.::::.::.:::::
CCDS34 SSAPRCALFAEDSIVQSVPEHPKKENVFCLSNSFGDVYLFQATSQTDLENWVTAVHSACA
570 580 590 600 610 620
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 TAVARHHHKEDTLRLLKSEIKKLEQKIDMDEKMKKMGEMQLSSVTDSKKKKTILDQIFVW
. :..: :::::::::.. :.: :::::: :::::.:.::: :.: :..:.: .:: :
CCDS34 SLFAKKHGKEDTLRLLKNQTKNLLQKIDMDSKMKKMAELQLSVVSDPKNRKAIENQIQQW
630 640 650 660 670 680
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 EQNLEQFQMDLFRFRCYLASLQGGELPNPKRLLAFASRPTKVAMGRLGIFSVSSFHALVA
:::::.:.:::::.:::::::::::::::: ::: ::::.:.:.:::::.:::::::::
CCDS34 EQNLEKFHMDLFRMRCYLASLQGGELPNPKSLLAAASRPSKLALGRLGILSVSSFHALVC
690 700 710 720 730 740
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 ARTGETGVRRRTQAMSRSASKRRSRFSSLWGLDTTSKK-KQGRPSINQVFGEGTEAVKKS
.: ....:.:: .... . .... :::: :::: ..: :. ::::.::
CCDS34 SRD-DSALRKRTLSLTQRGRNKKGIFSSLKGLDTLARKGKEKRPSITQV---------DE
750 760 770 780 790
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 LEGIFDDIVPDGKREKEVVLPNVHQHNPDCDIWVHEYFTPSWFCLPNNQPALTVVRPGDT
: :. . : :: .: ... . . .:: . .:. . . ..:
CCDS34 LLHIYGSTV-DG-------VP--RDNAWEIQTYVH---------FQDNHGVTVGIKPEHR
800 810 820 830
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 ARDTLELICKTHQLDHSAHYLRLKFLIENKMQLYVPQPEEDIYELLYKEIEICPKVTQSI
..: : : :: .::. : . :.:. :...... .: : : . . .: :::. : . ..
CCDS34 VEDILTLACKMRQLEPSHYGLQLRKLVDDNVEYCIPAPYEYMQQQVYDEIEVFPLNVYDV
840 850 860 870 880 890
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 HIEKSDTAADTYGFSLSS-VEE-DGIRRLYVNSVKETGLASKKGLKAGDEILEINNRAAD
.. :. .. : .::.... :.: . . :.....: ::: .::. :.::. .:..:..
CCDS34 QLTKTGSVCD-FGFAVTAQVDERQHLSRIFISDVLPDGLAYGEGLRKGNEIMTLNGEAVS
900 910 920 930 940 950
910 920 930 940 950
pF1KE1 ALNSSMLKDFLSQPSLGL-LVRTYPELEEGV-------ELLESPPHRVDGPADLGESPLA
:. .... ..:. :.:: :. :. . . .:. . . : . ..
CCDS34 DLDLKQMEALFSEKSVGLTLIARPPDTKATLCTSWSDSDLFSRDQKSLLPPPNQSQLLEE
960 970 980 990 1000 1010
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 FLTS---NPGHSLCSEQGSSAETAPEETEGP-DLESSDET-DHSSKSTEQVAAFCRSLHE
:: . : .... . .. .:.: : : : ... .:.::..:.:::...
CCDS34 FLDNFKKNTANDFSNVPDITTGLKRSQTDGTLDQVSHREKMEQTFRSAEQITALCRSFND
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE1 MNPSDQSPSPQDSTGPQLATMRQLSDADKLRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQ
. . . ... : . :.:::::.::::: ::..::..:::::.::.: ::.:::
CCDS34 SQANGMEGPRENQDPPPRSLARHLSDADRLRKVIQELVDTEKSYVKDLSCLFELYLEPLQ
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE1 KETFLTQDELDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTLEDGVRLVPDLEKLEKVDQFKKVLFSLGGS
.::::::::.. :::.: ::.::: ::.:::::. :.. :: .::.:.:::::::
CCDS34 NETFLTQDEMESLFGSLPEMLEFQKVFLETLEDGISASSDFNTLETPSQFRKLLFSLGGS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE1 FLYYADRFKLYSAFCASHTKVPKVLVKAKTDTAFKAFLDAQNPKQQHSSTLESYLIKPIQ
::::::.:::::.:::.: :: ::: .:::: ::::::::.:: .:::::::::::::.:
CCDS34 FLYYADHFKLYSGFCANHIKVQKVLERAKTDKAFKAFLDARNPTKQHSSTLESYLIKPVQ
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE1 RILKYPLLLRELFALTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHINEMQKIHEEFGAVFDQLIAE
:.:::::::.:: .::: :::::::: :.:.:.::::::::::::.:..:.:::::.::
CCDS34 RVLKYPLLLKELVSLTDQESEEHYHLTEALKAMEKVASHINEMQKIYEDYGTVFDQLVAE
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE1 QTGEKKEVADLSMGDLLLHTTVIWLNPPASLGKWKKEPELAAFVFKTAVVLVYKDGSKQK
:.: .:::..::::.::.:.:: :::: :::: .:. ::..:::: ::.::::.. : :
CCDS34 QSGTEKEVTELSMGELLMHSTVSWLNPFLSLGKARKDLELTVFVFKRAVILVYKENCKLK
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE1 KKLVGSHRLS-IYEDWDPFRFRHMIPTEALQVRALASADAEANAVCEIVHVKSESEGRPE
::: .. : . : :::.:: .:: ::::: : .: :.. :..:.::: :::::
CCDS34 KKLPSNSRPAHNSTDLDPFKFRWLIPISALQVRLGNPAGTENNSIWELIHTKSEIEGRPE
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE1 RVFHLCCSSPESRKDFLKAVHSILRDKHRRQLLKTESLPSSQQYVPFGGKRLCALKGARP
.:.::::. ::. ...:...::::.. ::.. : : :: . :: ::. :
CCDS34 TIFQLCCSDSESKTNIVKVIRSILRENFRRHI-KCE-LPLEKT----CKDRLVPLKNRVP
1440 1450 1460 1470 1480
1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE1 AMSRAVSAPSKSLGRRRRRLARNRFT--------IDSDAVSASSPEKESQQPPGGG--DT
. .. .: :.:: . . . :..: .::: : :: . : : . : :.
CCDS34 VSAKLAS--SRSL-KVLKNSSSNEWTGETGKGTLLDSDEGSLSSGTQSSGCPTAEGRQDS
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE1 DRWVEEQFD---LAQYEEQDDIKETDILSD-DDEFCESVKGASVDRDLQERLQATSISQR
.. ::.. . . :::.::::: ::. ..:: .: .:.. ..: ::.
CCDS34 KSTSPGKYPHPGLADFAD-NLIKESDILSDEDDDHRQTVKQGSPTKDIEIQFQRLRISED
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KE1 ERGRKTLDSHASRMAQLKKQAALSGINGGLESASEEVIWVRREDFAPSRKLNTEI
CCDS34 PDVHPEAEQQPGPESGEGQKGGEQPKLVRGHFCPIKRKANSTKRDRGTLLKAQIRHQSLD
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