FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1565, 732 aa
1>>>pF1KE1565 732 - 732 aa - 732 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6985+/-0.00118; mu= 17.2693+/- 0.071
mean_var=59.5832+/-11.679, 0's: 0 Z-trim(101.0): 19 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.166155
statistics sampled from 6333 (6345) to 6333 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.195), width: 16
Scan time: 3.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4496.1 F13A1 gene_id:2162|Hs108|chr6 ( 732) 4934 1191.8 0
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CCDS13302.1 TGM2 gene_id:7052|Hs108|chr20 ( 687) 1446 355.7 1.4e-97
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CCDS32212.1 TGM5 gene_id:9333|Hs108|chr15 ( 720) 1238 305.8 1.5e-82
CCDS32213.1 TGM7 gene_id:116179|Hs108|chr15 ( 710) 1175 290.7 5.1e-78
CCDS32211.1 TGM5 gene_id:9333|Hs108|chr15 ( 638) 1056 262.2 1.8e-69
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CCDS10093.1 EPB42 gene_id:2038|Hs108|chr15 ( 721) 855 214.0 6.4e-55
>>CCDS4496.1 F13A1 gene_id:2162|Hs108|chr6 (732 aa)
initn: 4934 init1: 4934 opt: 4934 Z-score: 6383.7 bits: 1191.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4934; 99.9% identity (99.9% similar) in 732 aa overlap (1-732:1-732)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSETSRTAFGGRRAVPPNNSNAAEDDLPTVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDT
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CCDS44 MSETSRTAFGGRRAVPPNNSNAAEDDLPTVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFSRPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFSRPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 PIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 YVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLVGSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLVGSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 VNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 GHVCFQFDAPFVFAEVNSDLIYITAKKDGTHVVENVDATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GHVCFQFDAPFVFAEVNSDLIYITAKKDGTHVVENVDATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKPLNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKPLNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 RNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 EQASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS44 EQASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVTVEFTNPLKET
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 LRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCRPWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCRPWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYG
670 680 690 700 710 720
730
pF1KE1 ELDVQIQRRPSM
::::::::::::
CCDS44 ELDVQIQRRPSM
730
>>CCDS9622.1 TGM1 gene_id:7051|Hs108|chr14 (817 aa)
initn: 1772 init1: 1374 opt: 1959 Z-score: 2528.8 bits: 478.7 E(32554): 1.6e-134
Smith-Waterman score: 1959; 43.2% identity (70.3% similar) in 723 aa overlap (10-730:76-790)
10 20 30
pF1KE1 MSETSRTAFGGRRAVPPNNSNAAEDDLPTVELQGVVPRG
: :: :. : .... :. . .:: :
CCDS96 RCCGCCSCRNAADDDWGPEPSDSRGRGSSSGTRR---PG-SRGSDSRRPVSRGSGVNAAG
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 VN-LQE-FLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFSRPYDPRR
. ..: .: :..: :.. : : :. .::::.:: ..::::::: :.. . .:: :.
CCDS96 DGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDELIVRRGQPFHMLLLLSRTYESS-
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 DLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSSPKCIVGK
: . .: .:: :. .:::.. .: :.. :: : :..: ... : ...::. :.::
CCDS96 DRITLELLIGNNPEVGKGTHVIIP-VGKGGSGGWKAQVVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGK
170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 FRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDIGVIFYGE
:.. : . . : .. .:... :::::::: .: ::.:.: :.:::::. : :.::
CCDS96 FQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLV
.: :.:.::::. :.::.:::..:: : .:::.:..:::: :::::. ::.:::.
CCDS96 EAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLI
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 GSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVT
:.:.. :. :. ::::.:::.::: : . : :::::::::: .: :::::. .: ::
CCDS96 GNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVT
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 NYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVD
:. ::::.:..: :::...:. . .:..:::::.: ::. :: ::::: :: :::.::
CCDS96 NFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVD
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 STPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLIYITAKKDGTHVVENVD
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CCDS96 ATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVE
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 ATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKPLNTEGVMKSRS
:: ::::: :... ::: :: ::.. :: :.::: .:.: : :. . :
CCDS96 EKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPEGSDAERKAVETAAAHGSK-P-NVYANRGSAE
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 NVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVT
.: :. :...::.:.:. .:. . :.: .: :. .: ..:::::: . ::. .:
CCDS96 DVAMQVEAQDAVMGQDLMVSVMLINHSSSRRTVKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVE
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 LEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKV
: : . . .. . :: .:..:... . :.....:. .:::::.. : :.. . .
CCDS96 LAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLVDQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTL
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 RGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCR
:. :::.. : . : ::: :: :: .:.: :. :: .: : :: ..
CCDS96 LGAAVVGQECEVQIVFKNPLPVTLTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQSFV
700 710 720 730 740 750
700 710 720 730
pF1KE1 PWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQRRPSM
: : :.::::..: .: .:.: ..:.. :
CCDS96 PVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGVIQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
760 770 780 790 800 810
>>CCDS13302.1 TGM2 gene_id:7052|Hs108|chr20 (687 aa)
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Smith-Waterman score: 1446; 38.9% identity (62.8% similar) in 689 aa overlap (59-726:15-684)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 TVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQID
.:: :::: .::.::::: :.. .
CCDS13 MAEELVLERCDLELETNGRDHHTADLCREKLVVRRGQPFWLTLH
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 F-SRPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSI
: .: :. : . : : :... :: :. . .. : : : .: ..: .. :..
CCDS13 FEGRNYEASVDSLTFSVVTGPAPSQEAGTKARFPLRDAVEEGDWTATVVDQQDCTLSLQL
50 60 70 80 90 100
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pF1KE1 QSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVL
. . .: .:. . . : : . : .::: :: ::::::.:.::.::::
CCDS13 TTPANAPIGLYRLSLEASTGY---QGSSFVLGHFILLFNAWCPADAVYLDSEEERQEYVL
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 NDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMD-------RAQMDLSGRGNPIKVS
.. : :. : .. ::. :..::::::::: :: ..: : : : :..:. :.
CCDS13 TQQGFIYQGSAKFIKNIPWNFGQFEDGILDICLILLDVNPKFLKNAGRDCSRRSSPVYVG
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310
pF1KE1 RVGSAMVNAKDDEGVLVGSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRS-SENPVRYGQCWVFA
:: :.::: .::.:::.: ::: :. :: : .: :::::: .... . . :.::::::::
CCDS13 RVVSGMVNCNDDQGVLLGRWDNNYGDGVSPMSWIGSVDILRRWKNHGCQRVKYGQCWVFA
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 GVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEA
.: : :::::::.:.:::: ::::...:: .. : .: :.... .. .::.::: :.
CCDS13 AVACTVLRCLGIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGEIQGD-KSEMIWNFHCWVES
290 300 310 320 330 340
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pF1KE1 WMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSD
::::::: :. ::::.: ::::.:.: : :::. :.:::.: . ..::::::::::.:
CCDS13 WMTRPDLQPGYEGWQALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTKYDAPFVFAEVNAD
350 360 370 380 390 400
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pF1KE1 LIYITAKKDGTHVVENVDATHI-GKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETA
.. . ::. : .... . : : : ::..: : ::: :::. ::. ::: :. :
CCDS13 VVDWIQQDDGS-VHKSINRSLIVGLKISTKSVGRDEREDITHTYKYPEGSSEEREAFTRA
410 420 430 440 450
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pF1KE1 --LMYGAKKPLNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSA
: :.: .: .:. : . .:. .:.:: . . ::. ..:. : :
CCDS13 NHLNKLAEKE-ETGMAMRIRVGQSMN-------MGSDFDVFAHITNNTAEEYVCRLLLCA
460 470 480 490 500 510
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pF1KE1 NITFYTGVPKAEF-KKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLH---FFVTAR
. :.:. : : ....:::.: :. . : .: : :. .. ..:
CCDS13 RTVSYNGILGPECGTKYLLNLNLEPFSEKSVPLCILYEKYRDCLTESNLIKVRALLVEPV
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE1 INETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPG
:: . : ... : ::: :.. : ... : . ::: .:.. ..: :
CCDS13 IN---SYLLAERDLYLENPEIKIRILGEPKQKRKLVAEVSLQNPLPVALEGCTFTVEGAG
580 590 600 610 620
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pF1KE1 VTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEV-CR----PWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQ
.:. .: . :: :. . ::: : : : .::.... ::.:. : : .: :
CCDS13 LTEEQKTV--EI-PDPVEAGEEVKVRMDLLPLHMGLHKLVVNFESDKLKAVKGFRNVIIG
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730
pF1KE1 RRPSM
CCDS13 PA
>>CCDS33435.1 TGM3 gene_id:7053|Hs108|chr20 (693 aa)
initn: 588 init1: 451 opt: 1432 Z-score: 1847.2 bits: 352.3 E(32554): 1.4e-96
Smith-Waterman score: 1433; 35.0% identity (66.6% similar) in 697 aa overlap (58-726:11-691)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 PTVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDT--NKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYV
:.: :. :::::. ...::.::::.: :
CCDS33 MAALGVQSINWQTAFNRQAHHTDKFSSQELILRRGQNFQV
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 QIDFSRPYDPRRDLFRVEYVI--GRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSV
. ... . :.:... : ::.:. : :. :. .:: :.: . . ..
CCDS33 LMIMNKGLGSNE---RLEFIVSTGPYPSESAMTKAVFPL-SNGSSGGWSAVLQASNGNTL
50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 RLSIQSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYIL-FNPWCEDDAVYLDNEKER
.::.: . .:.. : . ... :. . . :.:: :::: . :.:.. :. ::
CCDS33 TISISSPASAPIGRYTMALQIFSQGGI----SSVKLGTFILLFNPWLNVDSVFMGNHAER
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KE1 EEYVLNDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMDR-------AQMDLSGRGN
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CCDS33 EEYVQEDAGIIFVGSTNRIGMIGWNFGQFEEDILSICLSILDRSLNFRRDAATDVASRND
160 170 180 190 200 210
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: :.:: :::.:..::.:::.:.:.. :. : : .:.:::.:: ....: .::::::
CCDS33 PKYVGRVLSAMINSNDDNGVLAGNWSGTYTGGRDPRSWNGSVEILKNWKKSGFSPVRYGQ
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 CWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYH
::::::..:: :: ::::.:..::. ::::.: ::..:.. . :: .: .:::::.:
CCDS33 CWVFAGTLNTALRSLGIPSRVITNFNSAHDTDRNLSVDVYYDPMGNPLDK-GSDSVWNFH
280 290 300 310 320 330
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pF1KE1 CWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFA
:::.:..: :: ..::::..:.:::: :.:...:::::: ....: : ..:: ::.::
CCDS33 VWNEGWFVRSDLGPSYGGWQVLDATPQERSQGVFQCGPASVIGVREGDVQLNFDMPFIFA
340 350 360 370 380 390
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pF1KE1 EVNSDLI-YITAKKDGTHVVENVDATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERL
:::.: : .. . : . ..:.. ::. : :: .:... ::.:: ::. ::...::
CCDS33 EVNADRITWLYDNTTGKQWKNSVNSHTIGRYISTKAVGSNARMDVTDKYKYPEGSDQERQ
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500 510 520 530 540
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... :: : :: :: . : ... . : : ...:: . .: . ..:
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:.. :.:. ..: .:.:. : :.. ..:.: .. . :. ..: : .
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... .. .. . .:.. ... .: : . ..: . : . ..: . :.::: : .:
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. . ..: :. :. . :. : :... . : :: ..:.:..: ... .
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CCDS33 AMLSIDVAE
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CCDS27 TVQPGETIQSQIKCTPIKTGPKKFIVKLSSKQVKEINAQKIVLITK
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CCDS58 PV
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CCDS13 PEGSRKERQVYSKAVNRLFGVEASGRRIWIRRAGGRCLWRDDLLEPATKPSIAGKFKVLE
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CCDS32 CAPPTAAVGRYLLKIHIDSFQGSVTAYQLGEF--ILLFNPWCPEDAVYLDSEPQRQEYVM
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CCDS32 NDYGFIYQGSKNWIRPCPWNYGQFEDKIIDICLKLLDKSLHFQTDPATDCALRGSPVYVS
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CCDS32 RVVCAMINSNDDNGVLNGNWSENYTDGANPAEWTGSVAILKQWNATGCQPVRYGQCWVFA
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CCDS32 AVMCTVMRCLGIPTRVITNFDSGHDTDGNLIIDEYYDNTGRILGNKKKDTIWNFHVWNEC
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CCDS32 WMARKDLPPAYGGWQVLDATPQEMSNGVYCCGPASVRAIKEGEVDLNYDTPFVFSMVNAD
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CCDS32 CMSWLVQ-GGKEQKLHQDTSSVGNFISTKSIQSDERDDITENYKYEEGSLQERQVFLKAL
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CCDS32 QKLKARSFHGSQRGAELQPSRPTSLSQDSPRSLHTPSLRPSDVVQVSLKFKLLDPPNMGQ
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CCDS32 DICFVLLALNMSSQFKDLKVNLSAQSLLHDGSPLSPFWQDTAFITLSPKEAKTYPCKISY
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CCDS32 SQYSQYLSTDKLIRISALGEEKSSPEKILVNKIITLSYPSITINVLGAAVVNQPLSIQVI
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CCDS32 WVFAAVMCTVMRCLGIPTRVITNFDSGHDTDGNLIIDEYYDNTGRILGNKKKDTIWNFHV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]