Result of FASTA (omim) for
pF1KE1565
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1565, 732 aa
1>>>pF1KE1565 732 - 732 aa - 732 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
61127809 residues in 85815 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4442+/-0.000489; mu= 18.8959+/- 0.030
mean_var=62.3242+/-12.415, 0's: 0 Z-trim(107.7): 34 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.162460
statistics sampled from 15750 (15779) to 15750 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 7.920
The best scores are: opt bits E(85815)
NP_000120 (OMIM: 134570,188050,608446,613225) coag ( 732) 4934 1165.9 0
NP_000350 (OMIM: 190195,242300) protein-glutamine ( 817) 1959 468.6 4.3e-131
NP_004604 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-g ( 687) 1446 348.4 5.8e-95
XP_011527330 (OMIM: 190196) PREDICTED: protein-glu ( 687) 1446 348.4 5.8e-95
NP_001310245 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 687) 1446 348.4 5.8e-95
NP_003236 (OMIM: 600238) protein-glutamine gamma-g ( 693) 1432 345.1 5.7e-94
NP_003232 (OMIM: 600585) protein-glutamine gamma-g ( 684) 1380 332.9 2.6e-90
XP_011532344 (OMIM: 600585) PREDICTED: protein-glu ( 729) 1380 332.9 2.8e-90
NP_945189 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-g ( 548) 1346 324.9 5.4e-88
NP_001310247 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 627) 1341 323.7 1.4e-87
NP_001241663 (OMIM: 613900,613908) protein-glutami ( 625) 1240 300.1 1.8e-80
NP_945345 (OMIM: 613900,613908) protein-glutamine ( 706) 1240 300.1 2e-80
NP_963925 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine ( 720) 1238 299.6 2.9e-80
NP_001310246 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 606) 1228 297.2 1.3e-79
NP_443187 (OMIM: 606776) protein-glutamine gamma-g ( 710) 1175 284.9 7.9e-76
XP_016877392 (OMIM: 606776) PREDICTED: protein-glu ( 711) 1175 284.9 7.9e-76
NP_004236 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine ( 638) 1056 256.9 1.8e-67
NP_001107606 (OMIM: 177070,612690) erythrocyte mem ( 691) 855 209.8 2.9e-53
XP_011519652 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 855 209.9 3e-53
NP_000110 (OMIM: 177070,612690) erythrocyte membra ( 721) 855 209.9 3e-53
XP_011519651 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 855 209.9 3e-53
XP_011519653 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 855 209.9 3e-53
XP_011519654 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 709) 705 174.7 1.1e-42
XP_011519656 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 536) 658 163.6 1.9e-39
XP_005254282 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 656) 524 132.3 6.3e-30
XP_011519655 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 686) 524 132.3 6.6e-30
XP_011520532 (OMIM: 603805,609796) PREDICTED: prot ( 377) 355 92.6 3.3e-18
XP_016878218 (OMIM: 603805,609796) PREDICTED: prot ( 377) 355 92.6 3.3e-18
>>NP_000120 (OMIM: 134570,188050,608446,613225) coagulat (732 aa)
initn: 4934 init1: 4934 opt: 4934 Z-score: 6243.7 bits: 1165.9 E(85815): 0
Smith-Waterman score: 4934; 99.9% identity (99.9% similar) in 732 aa overlap (1-732:1-732)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSETSRTAFGGRRAVPPNNSNAAEDDLPTVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MSETSRTAFGGRRAVPPNNSNAAEDDLPTVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFSRPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFSRPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 PIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 YVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLVGSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLVGSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 VNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 GHVCFQFDAPFVFAEVNSDLIYITAKKDGTHVVENVDATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GHVCFQFDAPFVFAEVNSDLIYITAKKDGTHVVENVDATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKPLNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKPLNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 RNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 EQASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
NP_000 EQASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVTVEFTNPLKET
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 LRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCRPWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCRPWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYG
670 680 690 700 710 720
730
pF1KE1 ELDVQIQRRPSM
::::::::::::
NP_000 ELDVQIQRRPSM
730
>>NP_000350 (OMIM: 190195,242300) protein-glutamine gamm (817 aa)
initn: 1772 init1: 1374 opt: 1959 Z-score: 2474.5 bits: 468.6 E(85815): 4.3e-131
Smith-Waterman score: 1959; 43.2% identity (70.3% similar) in 723 aa overlap (10-730:76-790)
10 20 30
pF1KE1 MSETSRTAFGGRRAVPPNNSNAAEDDLPTVELQGVVPRG
: :: :. : .... :. . .:: :
NP_000 RCCGCCSCRNAADDDWGPEPSDSRGRGSSSGTRR---PG-SRGSDSRRPVSRGSGVNAAG
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 VN-LQE-FLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFSRPYDPRR
. ..: .: :..: :.. : : :. .::::.:: ..::::::: :.. . .:: :.
NP_000 DGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDELIVRRGQPFHMLLLLSRTYESS-
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 DLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSSPKCIVGK
: . .: .:: :. .:::.. .: :.. :: : :..: ... : ...::. :.::
NP_000 DRITLELLIGNNPEVGKGTHVIIP-VGKGGSGGWKAQVVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGK
170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 FRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDIGVIFYGE
:.. : . . : .. .:... :::::::: .: ::.:.: :.:::::. : :.::
NP_000 FQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLV
.: :.:.::::. :.::.:::..:: : .:::.:..:::: :::::. ::.:::.
NP_000 EAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLI
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 GSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVT
:.:.. :. :. ::::.:::.::: : . : :::::::::: .: :::::. .: ::
NP_000 GNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVT
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 NYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVD
:. ::::.:..: :::...:. . .:..:::::.: ::. :: ::::: :: :::.::
NP_000 NFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVD
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 STPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLIYITAKKDGTHVVENVD
.::::.:.:.. ::: ::..::.: : ...:.::.::::::: .: . ::. . :.
NP_000 ATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVE
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 ATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKPLNTEGVMKSRS
:: ::::: :... ::: :: ::.. :: :.::: .:.: : :. . :
NP_000 EKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPEGSDAERKAVETAAAHGSK-P-NVYANRGSAE
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 NVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVT
.: :. :...::.:.:. .:. . :.: .: :. .: ..:::::: . ::. .:
NP_000 DVAMQVEAQDAVMGQDLMVSVMLINHSSSRRTVKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVE
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 LEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKV
: : . . .. . :: .:..:... . :.....:. .:::::.. : :.. . .
NP_000 LAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLVDQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTL
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 RGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCR
:. :::.. : . : ::: :: :: .:.: :. :: .: : :: ..
NP_000 LGAAVVGQECEVQIVFKNPLPVTLTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQSFV
700 710 720 730 740 750
700 710 720 730
pF1KE1 PWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQRRPSM
: : :.::::..: .: .:.: ..:.. :
NP_000 PVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGVIQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
760 770 780 790 800 810
>>NP_004604 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-gluta (687 aa)
initn: 1184 init1: 603 opt: 1446 Z-score: 1825.9 bits: 348.4 E(85815): 5.8e-95
Smith-Waterman score: 1446; 38.9% identity (62.8% similar) in 689 aa overlap (59-726:15-684)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 TVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQID
.:: :::: .::.::::: :.. .
NP_004 MAEELVLERCDLELETNGRDHHTADLCREKLVVRRGQPFWLTLH
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 F-SRPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSI
: .: :. : . : : :... :: :. . .. : : : .: ..: .. :..
NP_004 FEGRNYEASVDSLTFSVVTGPAPSQEAGTKARFPLRDAVEEGDWTATVVDQQDCTLSLQL
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 QSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVL
. . .: .:. . . : : . : .::: :: ::::::.:.::.::::
NP_004 TTPANAPIGLYRLSLEASTGY---QGSSFVLGHFILLFNAWCPADAVYLDSEEERQEYVL
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 NDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMD-------RAQMDLSGRGNPIKVS
.. : :. : .. ::. :..::::::::: :: ..: : : : :..:. :.
NP_004 TQQGFIYQGSAKFIKNIPWNFGQFEDGILDICLILLDVNPKFLKNAGRDCSRRSSPVYVG
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310
pF1KE1 RVGSAMVNAKDDEGVLVGSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRS-SENPVRYGQCWVFA
:: :.::: .::.:::.: ::: :. :: : .: :::::: .... . . :.::::::::
NP_004 RVVSGMVNCNDDQGVLLGRWDNNYGDGVSPMSWIGSVDILRRWKNHGCQRVKYGQCWVFA
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 GVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEA
.: : :::::::.:.:::: ::::...:: .. : .: :.... .. .::.::: :.
NP_004 AVACTVLRCLGIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGEIQGD-KSEMIWNFHCWVES
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 WMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSD
::::::: :. ::::.: ::::.:.: : :::. :.:::.: . ..::::::::::.:
NP_004 WMTRPDLQPGYEGWQALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTKYDAPFVFAEVNAD
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 LIYITAKKDGTHVVENVDATHI-GKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETA
.. . ::. : .... . : : : ::..: : ::: :::. ::. ::: :. :
NP_004 VVDWIQQDDGS-VHKSINRSLIVGLKISTKSVGRDEREDITHTYKYPEGSSEEREAFTRA
410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 --LMYGAKKPLNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSA
: :.: .: .:. : . .:. .:.:: . . ::. ..:. : :
NP_004 NHLNKLAEKE-ETGMAMRIRVGQSMN-------MGSDFDVFAHITNNTAEEYVCRLLLCA
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE1 NITFYTGVPKAEF-KKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLH---FFVTAR
. :.:. : : ....:::.: :. . : .: : :. .. ..:
NP_004 RTVSYNGILGPECGTKYLLNLNLEPFSEKSVPLCILYEKYRDCLTESNLIKVRALLVEPV
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE1 INETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPG
:: . : ... : ::: :.. : ... : . ::: .:.. ..: :
NP_004 IN---SYLLAERDLYLENPEIKIRILGEPKQKRKLVAEVSLQNPLPVALEGCTFTVEGAG
580 590 600 610 620
680 690 700 710 720
pF1KE1 VTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEV-CR----PWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQ
.:. .: . :: :. . ::: : : : .::.... ::.:. : : .: :
NP_004 LTEEQKTV--EI-PDPVEAGEEVKVRMDLLPLHMGLHKLVVNFESDKLKAVKGFRNVIIG
630 640 650 660 670 680
730
pF1KE1 RRPSM
NP_004 PA
>>XP_011527330 (OMIM: 190196) PREDICTED: protein-glutami (687 aa)
initn: 1184 init1: 603 opt: 1446 Z-score: 1825.9 bits: 348.4 E(85815): 5.8e-95
Smith-Waterman score: 1446; 38.9% identity (62.8% similar) in 689 aa overlap (59-726:15-684)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 TVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQID
.:: :::: .::.::::: :.. .
XP_011 MAEELVLERCDLELETNGRDHHTADLCREKLVVRRGQPFWLTLH
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 F-SRPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSI
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XP_011 FEGRNYEASVDSLTFSVVTGPAPSQEAGTKARFPLRDAVEEGDWTATVVDQQDCTLSLQL
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 QSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVL
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XP_011 TTPANAPIGLYRLSLEASTGY---QGSSFVLGHFILLFNAWCPADAVYLDSEEERQEYVL
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 NDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMD-------RAQMDLSGRGNPIKVS
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XP_011 TQQGFIYQGSAKFIKNIPWNFGQFEDGILDICLILLDVNPKFLKNAGRDCSRRSSPVYVG
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XP_011 RVVSGMVNCNDDQGVLLGRWDNNYGDGVSPMSWIGSVDILRRWKNHGCQRVKYGQCWVFA
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pF1KE1 GVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEA
.: : :::::::.:.:::: ::::...:: .. : .: :.... .. .::.::: :.
XP_011 AVACTVLRCLGIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGEIQGD-KSEMIWNFHCWVES
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pF1KE1 WMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSD
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XP_011 WMTRPDLQPGYEGWQALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTKYDAPFVFAEVNAD
350 360 370 380 390 400
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pF1KE1 LIYITAKKDGTHVVENVDATHI-GKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETA
.. . ::. : .... . : : : ::..: : ::: :::. ::. ::: :. :
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pF1KE1 --LMYGAKKPLNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSA
: :.: .: .:. : . .:. .:.:: . . ::. ..:. : :
XP_011 NHLNKLAEKE-ETGMAMRIRVGQSMN-------MGSDFDVFAHITNNTAEEYVCRLLLCA
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pF1KE1 NITFYTGVPKAEF-KKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLH---FFVTAR
. :.:. : : ....:::.: :. . : .: : :. .. ..:
XP_011 RTVSYNGILGPECGTKYLLNLNLEPFSEKSVPLCILYEKYRDCLTESNLIKVRALLVEPV
520 530 540 550 560 570
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pF1KE1 INETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPG
:: . : ... : ::: :.. : ... : . ::: .:.. ..: :
XP_011 IN---SYLLAERDLYLENPEIKIRILGEPKQKRKLVAEVSLQNPLPVALEGCTFTVEGAG
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pF1KE1 VTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEV-CR----PWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQ
.:. .: . :: :. . ::: : : : .::.... ::.:. : : .: :
XP_011 LTEEQKTV--EI-PDPVEAGEEVKVRMDLLPLHMGLHKLVVNFESDKLKAVKGFRNVIIG
630 640 650 660 670 680
730
pF1KE1 RRPSM
XP_011 PA
>>NP_001310245 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-gl (687 aa)
initn: 1184 init1: 603 opt: 1446 Z-score: 1825.9 bits: 348.4 E(85815): 5.8e-95
Smith-Waterman score: 1446; 38.9% identity (62.8% similar) in 689 aa overlap (59-726:15-684)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 TVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQID
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NP_001 MAEELVLERCDLELETNGRDHHTADLCREKLVVRRGQPFWLTLH
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pF1KE1 F-SRPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSI
: .: :. : . : : :... :: :. . .. : : : .: ..: .. :..
NP_001 FEGRNYEASVDSLTFSVVTGPAPSQEAGTKARFPLRDAVEEGDWTATVVDQQDCTLSLQL
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pF1KE1 QSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVL
. . .: .:. . . : : . : .::: :: ::::::.:.::.::::
NP_001 TTPANAPIGLYRLSLEASTGY---QGSSFVLGHFILLFNAWCPADAVYLDSEEERQEYVL
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pF1KE1 NDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMD-------RAQMDLSGRGNPIKVS
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NP_001 TQQGFIYQGSAKFIKNIPWNFGQFEDGILDICLILLDVNPKFLKNAGRDCSRRSSPVYVG
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pF1KE1 RVGSAMVNAKDDEGVLVGSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRS-SENPVRYGQCWVFA
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NP_001 RVVSGMVNCNDDQGVLLGRWDNNYGDGVSPMSWIGSVDILRRWKNHGCQRVKYGQCWVFA
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pF1KE1 GVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEA
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NP_001 AVACTVLRCLGIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGEIQGD-KSEMIWNFHCWVES
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pF1KE1 WMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSD
::::::: :. ::::.: ::::.:.: : :::. :.:::.: . ..::::::::::.:
NP_001 WMTRPDLQPGYEGWQALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTKYDAPFVFAEVNAD
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pF1KE1 LIYITAKKDGTHVVENVDATHI-GKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETA
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NP_001 VVDWIQQDDGS-VHKSINRSLIVGLKISTKSVGRDEREDITHTYKYPEGSSEEREAFTRA
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pF1KE1 --LMYGAKKPLNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSA
: :.: .: .:. : . .:. .:.:: . . ::. ..:. : :
NP_001 NHLNKLAEKE-ETGMAMRIRVGQSMN-------MGSDFDVFAHITNNTAEEYVCRLLLCA
460 470 480 490 500 510
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pF1KE1 NITFYTGVPKAEF-KKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLH---FFVTAR
. :.:. : : ....:::.: :. . : .: : :. .. ..:
NP_001 RTVSYNGILGPECGTKYLLNLNLEPFSEKSVPLCILYEKYRDCLTESNLIKVRALLVEPV
520 530 540 550 560 570
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pF1KE1 INETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPG
:: . : ... : ::: :.. : ... : . ::: .:.. ..: :
NP_001 IN---SYLLAERDLYLENPEIKIRILGEPKQKRKLVAEVSLQNPLPVALEGCTFTVEGAG
580 590 600 610 620
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pF1KE1 VTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEV-CR----PWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQ
.:. .: . :: :. . ::: : : : .::.... ::.:. : : .: :
NP_001 LTEEQKTV--EI-PDPVEAGEEVKVRMDLLPLHMGLHKLVVNFESDKLKAVKGFRNVIIG
630 640 650 660 670 680
730
pF1KE1 RRPSM
NP_001 PA
>>NP_003236 (OMIM: 600238) protein-glutamine gamma-gluta (693 aa)
initn: 588 init1: 451 opt: 1432 Z-score: 1808.1 bits: 345.1 E(85815): 5.7e-94
Smith-Waterman score: 1433; 35.0% identity (66.6% similar) in 697 aa overlap (58-726:11-691)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 PTVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDT--NKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYV
:.: :. :::::. ...::.::::.: :
NP_003 MAALGVQSINWQTAFNRQAHHTDKFSSQELILRRGQNFQV
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pF1KE1 QIDFSRPYDPRRDLFRVEYVI--GRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSV
. ... . :.:... : ::.:. : :. :. .:: :.: . . ..
NP_003 LMIMNKGLGSNE---RLEFIVSTGPYPSESAMTKAVFPL-SNGSSGGWSAVLQASNGNTL
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pF1KE1 RLSIQSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYIL-FNPWCEDDAVYLDNEKER
.::.: . .:.. : . ... :. . . :.:: :::: . :.:.. :. ::
NP_003 TISISSPASAPIGRYTMALQIFSQGGI----SSVKLGTFILLFNPWLNVDSVFMGNHAER
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pF1KE1 EEYVLNDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMDR-------AQMDLSGRGN
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NP_003 EEYVQEDAGIIFVGSTNRIGMIGWNFGQFEEDILSICLSILDRSLNFRRDAATDVASRND
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pF1KE1 PIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLVGSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRSSE-NPVRYGQ
: :.:: :::.:..::.:::.:.:.. :. : : .:.:::.:: ....: .::::::
NP_003 PKYVGRVLSAMINSNDDNGVLAGNWSGTYTGGRDPRSWNGSVEILKNWKKSGFSPVRYGQ
220 230 240 250 260 270
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pF1KE1 CWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYH
::::::..:: :: ::::.:..::. ::::.: ::..:.. . :: .: .:::::.:
NP_003 CWVFAGTLNTALRSLGIPSRVITNFNSAHDTDRNLSVDVYYDPMGNPLDK-GSDSVWNFH
280 290 300 310 320 330
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pF1KE1 CWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFA
:::.:..: :: ..::::..:.:::: :.:...:::::: ....: : ..:: ::.::
NP_003 VWNEGWFVRSDLGPSYGGWQVLDATPQERSQGVFQCGPASVIGVREGDVQLNFDMPFIFA
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pF1KE1 EVNSDLI-YITAKKDGTHVVENVDATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERL
:::.: : .. . : . ..:.. ::. : :: .:... ::.:: ::. ::...::
NP_003 EVNADRITWLYDNTTGKQWKNSVNSHTIGRYISTKAVGSNARMDVTDKYKYPEGSDQERQ
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pF1KE1 ALETALMYGAKKPLNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGK-----------DFKLSITFRN
... :: : :: :: . : ... . : : ...:: . .: . ..:
NP_003 VFQKAL--GKLKP-NTPFAATSSMGLETE-EQEPSIIGKLKVAGMLAVGKEVNLVLLLKN
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pF1KE1 NSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQ
:.. :.:. ..: .:.:. : :.. ..:.: .. . :. ..: : .
NP_003 LSRDTKTVTVNMTAWTIIYNGTLVHEVWKDSATMSLDPEEEAEHPIKISYAQYEKYLKSD
510 520 530 540 550 560
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pF1KE1 ASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKETLR
... .. .. . .:.. ... .: : . ..: . : . ..: . :.::: : .:
NP_003 NMIRITAVCKVPDESEVVV-ERDIILDNPTLTLEVLNEARVRKPVNVQMLFSNPLDEPVR
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pF1KE1 NVWVHLDGPGVTRPMKKM-FREIRPN--STVQWEEVCRPWVSGHRKLIASMSSDSLRHVY
. . ..: :. :. . :. : :... . : :: ..:.:..: ... .
NP_003 DCVLMVEGSGLLLGNLKIDVPTLGPKEGSRVRFDIL--PSRSGTKQLLADFSCNKFPAIK
630 640 650 660 670 680
720 730
pF1KE1 GELDVQIQRRPSM
. :....
NP_003 AMLSIDVAE
690
>>NP_003232 (OMIM: 600585) protein-glutamine gamma-gluta (684 aa)
initn: 1159 init1: 951 opt: 1380 Z-score: 1742.3 bits: 332.9 E(85815): 2.6e-90
Smith-Waterman score: 1380; 32.8% identity (66.4% similar) in 676 aa overlap (61-728:20-684)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 ELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFS
: :.::: ...... . :::: :.... ..
NP_003 MMDASKELQVLHIDFLNQDNAVSHHTWEFQTSSPVFRRGQVFHLRLVLN
10 20 30 40
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pF1KE1 RPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSS
.: . ..: ..:. : :. : : . . . . .: : . . . : ... ::
NP_003 QPLQSYHQL-KLEFSTGPNPSIAKHTLVVLDPRTPSDHYNWQATLQNESGKEVTVAVTSS
50 60 70 80 90 100
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pF1KE1 PKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDI
:. :.::... : : .:.. .: :.::::::..: :.. .: ::.::.:::
NP_003 PNAILGKYQLNVK--TGNHILKSEENI---LYLLFNPWCKEDMVFMPDEDERKEYILNDT
110 120 130 140 150 160
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pF1KE1 GVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAK
: . : . .:: . :..:::: ..:: :. .. .... . : .:. : :. ::.. .
NP_003 GCHYVGAARSIKCKPWNFGQFEKNVLDCCISLLTESSLKPTDRRDPVLVCRAMCAMMSFE
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 DDEGVLVGSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLG
.:::.:.: . : :. : ::::. :: .: .... : .::::::::...: :: ::
NP_003 KGQGVLIGNWTGDYEGGTAPYKWTGSAPILQQYYNTKQAVCFGQCWVFAGILTTVLRALG
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 IPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGF
:::: ::.. ::::.. :: .: ...:.:. ...:.:::::.: :..::: ::::: :.
NP_003 IPARSVTGFDSAHDTERNLTVDTYVNENGEKITSMTHDSVWNFHVWTDAWMKRPDLPKGY
290 300 310 320 330 340
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pF1KE1 GGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSD-LIYITAKKDG
::::::.:::: :.:.. :::. . ::..: . . .:. :::.:::.: ::... .:
NP_003 DGWQAVDATPQERSQGVFCCGPSPLTAIRKGDIFIVYDTRFVFSEVNGDRLIWLVKMVNG
350 360 370 380 390 400
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pF1KE1 T---HVVENVDATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKP
::. ....: ::: : :: .: : ::: ::. ::. ::: ... :.. ...
NP_003 QEELHVI-SMETTSIGKNISTKAVGQDRRRDITYEYKYPEGSSEERQVMDHAFLLLSSER
410 420 430 440 450 460
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pF1KE1 LNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPK
. . : .. . :. . ....::.. .... .. .. ... : .. .::: :
NP_003 EHRRPVKENF--LHMSVQSDDVLLGNSVNFTVILKRKTAALQNVNILGSFELQLYTG--K
470 480 490 500 510
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pF1KE1 AEFKKETFDVTLEPLSFKKEAVL-IQAGEYMGQLL---EQASLHFFVTARINETRDVLAK
: .. : . . .:..: ... :...: .. .. :. :.: :.....:.
NP_003 KMAKLCDLNKTSQIQGQVSEVTLTLDSKTYINSLAILDDEPVIRGFIIAEIVESKEIMAS
520 530 540 550 560 570
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pF1KE1 QKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFR
. : . ::. :.. .: .:. .. : : : : .: :.. :.. . .
NP_003 EVFTSFQYPEFSIELPNTGRIGQLLVCNCIFKNTLAIPLTDVKFSLESLGISSLQTSDHG
580 590 600 610 620 630
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pF1KE1 EIRPNSTVQWEEVCRPWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQRRPSM
..:. :.: . : : .: .:.:...:: ..... .. : : .
NP_003 TVQPGETIQSQIKCTPIKTGPKKFIVKLSSKQVKEINAQKIVLITK
640 650 660 670 680
>>XP_011532344 (OMIM: 600585) PREDICTED: protein-glutami (729 aa)
initn: 1159 init1: 951 opt: 1380 Z-score: 1741.9 bits: 332.9 E(85815): 2.8e-90
Smith-Waterman score: 1380; 32.8% identity (66.4% similar) in 676 aa overlap (61-728:65-729)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 ELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFS
: :.::: ...... . :::: :.... ..
XP_011 LGSSDSPTSVSRVTGITELQVLHIDFLNQDNAVSHHTWEFQTSSPVFRRGQVFHLRLVLN
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 RPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSS
.: . ..: ..:. : :. : : . . . . .: : . . . : ... ::
XP_011 QPLQSYHQL-KLEFSTGPNPSIAKHTLVVLDPRTPSDHYNWQATLQNESGKEVTVAVTSS
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 PKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDI
:. :.::... : : .:.. .: :.::::::..: :.. .: ::.::.:::
XP_011 PNAILGKYQLNVK--TGNHILKSEENI---LYLLFNPWCKEDMVFMPDEDERKEYILNDT
160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 GVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAK
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XP_011 GCHYVGAARSIKCKPWNFGQFEKNVLDCCISLLTESSLKPTDRRDPVLVCRAMCAMMSFE
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280 290 300 310 320 330
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XP_011 KGQGVLIGNWTGDYEGGTAPYKWTGSAPILQQYYNTKQAVCFGQCWVFAGILTTVLRALG
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pF1KE1 IPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGF
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XP_011 IPARSVTGFDSAHDTERNLTVDTYVNENGEKITSMTHDSVWNFHVWTDAWMKRPDLPKGY
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XP_011 DGWQAVDATPQERSQGVFCCGPSPLTAIRKGDIFIVYDTRFVFSEVNGDRLIWLVKMVNG
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pF1KE1 T---HVVENVDATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKP
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pF1KE1 LNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPK
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XP_011 EHRRPVKENF--LHMSVQSDDVLLGNSVNFTVILKRKTAALQNVNILGSFELQLYTG--K
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pF1KE1 AEFKKETFDVTLEPLSFKKEAVL-IQAGEYMGQLL---EQASLHFFVTARINETRDVLAK
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XP_011 KMAKLCDLNKTSQIQGQVSEVTLTLDSKTYINSLAILDDEPVIRGFIIAEIVESKEIMAS
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pF1KE1 QKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVIVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFR
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XP_011 EVFTSFQYPEFSIELPNTGRIGQLLVCNCIFKNTLAIPLTDVKFSLESLGISSLQTSDHG
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pF1KE1 EIRPNSTVQWEEVCRPWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQRRPSM
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XP_011 TVQPGETIQSQIKCTPIKTGPKKFIVKLSSKQVKEINAQKIVLITK
690 700 710 720
>>NP_945189 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-gluta (548 aa)
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NP_945 RVVSGMVNCNDDQGVLLGRWDNNYGDGVSPMSWIGSVDILRRWKNHGCQRVKYGQCWVFA
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pF1KE1 NITFYTGVPKAEF-KKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLHFFVTARINE
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NP_945 RTVSYNGILGPECGTKYLLNLNLEPFSGKALCSWSIC
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>>NP_001310247 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-gl (627 aa)
initn: 1099 init1: 603 opt: 1341 Z-score: 1693.5 bits: 323.7 E(85815): 1.4e-87
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pF1KE1 VRRGQSFYVQIDFSRPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIV
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pF1KE1 MREDRSVRLSIQSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYL
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NP_001 RVKYGQCWVFAAVACTVLRCLGIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGEIQGD-KSE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]