FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1597, 3080 aa 1>>>pF1KE1597 3080 - 3080 aa - 3080 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5101+/-0.00166; mu= 6.1057+/- 0.099 mean_var=217.5798+/-44.864, 0's: 0 Z-trim(102.4): 144 B-trim: 5 in 1/50 Lambda= 0.086949 statistics sampled from 6820 (6951) to 6820 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16 Scan time: 8.210 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 19545 2467.6 0 CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 987) 1683 226.7 5.6e-58 CCDS55376.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 993) 1683 226.7 5.6e-58 CCDS43921.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 995) 1683 226.7 5.6e-58 CCDS55378.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1001) 1683 226.7 5.6e-58 CCDS43922.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1003) 1683 226.7 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CCDS55 DMELASRVQFNFFETPALFQDPSLENLSLISYVISSSVAN-LTVRNLTRNVTVTLKHINP 480 490 500 510 520 530 2680 2690 2700 2710 2720 2730 pF1KE1 NQNYGQVHCAFWDFENNNGLGGWNSSGCKVKETNVNYTICQCDHLTHFGVLMDLSRSTVD .:. :.:.:::. :.: :::...::.::. .: ::: :.::: ::::.::::..: CCDS55 SQDELTVRCVFWDLGRNGGRGGWSDNGCSVKDRRLNETICTCSHLTSFGVLLDLSRTSVL 540 550 560 570 580 590 2740 2750 2760 2770 2780 2790 pF1KE1 SVNEQILALITYTGCGISSIFLGVAVVTYIAFHKLRKDYPAKILINLCTALLMLNLVFLI .. . :..::: :::.:::::.:..::::::.:.:.:::.::::.::.:::.::::::. 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CCDS43 DMELASRVQFNFFETPALFQDPSLENLSLISYVISSSVAN-LTVRNLTRNVTVTLKHINP 510 520 530 540 550 560 2680 2690 2700 2710 2720 2730 pF1KE1 NQNYGQVHCAFWDFENNNGLGGWNSSGCKVKETNVNYTICQCDHLTHFGVLMDLSRSTVD .:. :.:.:::. :.: :::...::.::. .: ::: :.::: ::::.::::..: CCDS43 SQDELTVRCVFWDLGRNGGRGGWSDNGCSVKDRRLNETICTCSHLTSFGVLLDLSRTSVL 570 580 590 600 610 620 2740 2750 2760 2770 2780 2790 pF1KE1 SVNEQILALITYTGCGISSIFLGVAVVTYIAFHKLRKDYPAKILINLCTALLMLNLVFLI .. . :..::: :::.:::::.:..::::::.:.:.:::.::::.::.:::.::::::. 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CCDS55 SSPMPQTHVSGTPPPVKASFSSPTVSAPANVNTTSAPPVQTDIVNTSSISDLENQVLQME 330 340 350 360 370 380 2510 2520 2530 2540 2550 2560 pF1KE1 MNLT------HVMLQIINVVLEKQNNSASDLHEISNEILRIIERTGHKMEFSGQIANLTV :. .. ..:: : . .. . : .....:.... : ...::. .:: CCDS55 KALSLGSLEPNLAGEMINQVSRLLHSPPDMLAPLAQRLLKVVDDIGLQLNFSNTTISLTS 390 400 410 420 430 440 2570 2580 2590 2600 2610 2620 pF1KE1 AGLALAVLRGD-HTFDGMAFSIHSYEEGTDPEIFLGNVPVGGILASIYLPKSLTERIPLS .:::::.: . .:. .: .. .. .. : . . ...: ::.:: . .: CCDS55 PSLALAVIRVNASSFNTTTFVA---QDPANLQVSLETQAPENSIGTITLPSSLMNNLPAH 450 460 470 480 490 500 2630 2640 2650 2660 2670 pF1KE1 NLQT---ILFNFFGQTSLFKTKNVTK-ALTTYVVSASISDDMFIQNLADPVVITLQHIGG ... . :::: .::. .. . .: .::.:.:... . ..::. :..::.::. 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CCDS55 PAQMMALTFITYIGCGLSSIFLSVTLVTYIAFEKIRRDYPSKILIQLCAALLLLNLVFLL 630 640 650 660 670 680 2800 2810 2820 2830 2840 2850 pF1KE1 NSWLSSFQKVGVCITAAVALHYFLLVSFTWMGLEAVHMYLALVKVFNIYIPNYILKFCLV .::.. .. :.::..:: :::::::::::::::: ::::::::::: :: .::::::.: CCDS55 DSWIALYKMQGLCISVAVFLHYFLLVSFTWMGLEAFHMYLALVKVFNTYIRKYILKFCIV 690 700 710 720 730 740 2860 2870 2880 2890 2900 pF1KE1 GWGIPAIMVAITVSVKKDLYGTLS----PT-TP--FCWIKDDSIFYISVVAYFCLIFLMN :::.::..:.: .... : :: : :. .: ::::.....:::.::.:::.:::.: CCDS55 GWGVPAVVVTIILTISPDNYGLGSYGKFPNGSPDDFCWINNNAVFYITVVGYFCVIFLLN 750 760 770 780 790 800 2910 2920 2930 2940 2950 2960 pF1KE1 LSMFCTVLVQLNSVKSQIQ-KTRRKMILHDLKGTMSLTFLLGLTWGFAFFAWGPMRNFFL .::: .::::: .:.. : ..:: ..::.. .::::::.:::::::::::. :. CCDS55 VSMFIVVLVQLCRIKKKKQLGAQRKTSIQDLRSIAGLTFLLGITWGFAFFAWGPVNVTFM 810 820 830 840 850 860 2970 2980 2990 3000 3010 3020 pF1KE1 YLFAIFNTLQGFFIFVFHCVMKESVREQWQIHLCCGWLRLDNSSDGSSRCQIKVGYK-QE :::::::::::::::.:.:: ::.::.::. .:::: ::: ..: ..: . :... :. CCDS55 YLFAIFNTLQGFFIFIFYCVAKENVRKQWRRYLCCGKLRLAENSGNASTERNGVSFSVQN 870 880 890 900 910 920 3030 3040 3050 3060 3070 3080 pF1KE1 GLKKIFEHKLLTPSLKSTATSSTFKSLGSAQGTPSEISFPNDDFDKDPYCSSP : CCDS55 GDVCLHDFTGKQHMFNEKEDSCNGKGRMALRRTSKRGSLHFIEQM 930 940 950 960 >>CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193 aa) initn: 1304 init1: 615 opt: 1613 Z-score: 1105.7 bits: 218.0 E(32554): 2.9e-55 Smith-Waterman score: 1642; 36.5% identity (68.5% similar) in 835 aa overlap (2246-3057:384-1153) 2220 2230 2240 2250 2260 2270 pF1KE1 FETTWLDSTPSFLSTEASTSPTATKSTVSFYNVEMSFSVFVEEPRIPITSVINEFTENSL : . . .. ....:.. . : . :. : CCDS47 LSCGSYLIPLPAAELASCADLGTLCQDGIIYRISVVIQNILRHPEVKVQSKVAEW----L 360 370 380 390 400 2280 2290 2300 2310 2320 2330 pF1KE1 NSIFQNSEFSLATLETQIKSRDISEEEMVMDRAILEQREGQEMATISYVPYSCVCQVIIK :: ::: .... ... ... . .:... . :.. .. . : . : CCDS47 NSTFQNWNYTVYVVNISFHL-SAGEDKIKVKRSLEDEPRLVLWALLVY------------ 410 420 430 440 450 2340 2350 2360 2370 2380 2390 pF1KE1 ASSSLASSELMRKIKSKIHGNFTHGNFTQDQLTLLVNCEHVAVKKLEPGNCKADETASKY .. ...: :: :. .. ..: . :. : . : :..: :.: : : . 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CCDS47 VDISNCL---KEANEVANQILNLTADGQNLTSANITNIVEQVKRIVNKEENIDITLGSTL 550 560 570 580 590 600 2520 2530 2540 2550 2560 2570 pF1KE1 LQIINVVLEKQNNSASDLHEISNEILRIIERTGHKMEF-SGQIANLTVAGLALAV---LR ..:.. .: ..: ::: : :.: :. :.. . :... : . .:.:. .:::.: : CCDS47 MNIFSNIL---SSSDSDLLESSSEALKTIDELAFKIDLNSTSHVNITTRNLALSVSSLLP 610 620 630 640 650 660 2580 2590 2600 2610 2620 pF1KE1 GDHTFDGMAFSIHSYEEGTDPEIFLGNVPVGGI--LASIYLPKSLTERIPLSNLQTIL-- : .......... : .:. : . : . :::. :: .: : :: ...: CCDS47 GTNAISNFSIGLPSNNES----YFQMDFESGQVDPLASVILPPNLLEN--LSPEDSVLVR 670 680 690 700 710 2630 2640 2650 2660 2670 2680 pF1KE1 ---FNFFGQTSLFKTKNVT-KALTTYVVSASISDDMFIQNLADPVVITLQHIGGNQNYGQ :.::..:.::. . :.:..::.. ::.. . :::: ::: : ..: .. . 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CCDS47 IVVMVQICGRNGKRSNRTLREEVLRNLRSVVSLTFLLGMTWGFAFFAWGPLNIPFMYLFS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 2980 2990 3000 3010 3020 3030 pF1KE1 IFNTLQGFFIFVFHCVMKESVREQWQIHLCCGWLRLDNSSDGSSRCQIKVGYKQEGLKKI :::.:::.:::.:::.:::.:..::. ::::: .:: ..:: :. . ....: : CCDS47 IFNSLQGLFIFIFHCAMKENVQKQWRQHLCCGRFRLADNSDWSKTATNIIKKSSDNLGK- 1080 1090 1100 1110 1120 1130 3040 3050 3060 3070 3080 pF1KE1 FEHKLLTPSLKSTATSSTFKSLGSAQGTPSEISFPNDDFDKDPYCSSP .: . :. :..: : :: .:. CCDS47 ---SLSSSSIGSNSTYLTSKSKSSSTTYFKRNSHTDNVSYEHSFNKSGSLRQCFHGQVLV 1140 1150 1160 1170 1180 3080 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 11:12:07 2016 done: Sun Nov 6 11:12:09 2016 Total Scan time: 8.210 Total Display time: 1.230 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]