Result of FASTA (ccds) for pF1KE1598
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1598, 1432 aa
  1>>>pF1KE1598 1432 - 1432 aa - 1432 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9756+/-0.00137; mu= 9.4173+/- 0.082
 mean_var=108.9022+/-21.121, 0's: 0 Z-trim(102.3): 63  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.122901
 statistics sampled from 6829 (6887) to 6829 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.212), width:  16
 Scan time:  4.020

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6082.1 WRN gene_id:7486|Hs108|chr8             (1432) 9451 1687.8       0
CCDS31756.1 RECQL gene_id:5965|Hs108|chr12         ( 649)  841 161.2 9.1e-39
CCDS10363.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15            (1417)  653 127.9 2.1e-28
CCDS73782.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15            (1286)  640 125.6 9.5e-28
CCDS42380.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17        ( 991)  567 112.6 5.8e-24
CCDS45777.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17        ( 410)  547 109.0 2.8e-23
CCDS32735.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17        ( 435)  547 109.0   3e-23


>>CCDS6082.1 WRN gene_id:7486|Hs108|chr8                  (1432 aa)
 initn: 9451 init1: 9451 opt: 9451  Z-score: 9054.0  bits: 1687.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9451; 99.9% identity (99.9% similar) in 1432 aa overlap (1-1432:1-1432)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MSEKKLETTAQQRKCPEWMNVQNKRCAVEERKACVRKSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSEKKLETTAQQRKCPEWMNVQNKRCAVEERKACVRKSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHISSMSVF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS60 DCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 PQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 VKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILDDTVQRFAIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILDDTVQRFAIN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 KEEEILLSDMNKQLTSISEEVMDLAKHLPHAFSKLENPRRVSILLKDISENLYSLRRMII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KEEEILLSDMNKQLTSISEEVMDLAKHLPHAFSKLENPRRVSILLKDISENLYSLRRMII
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 GSTNIETELRPSNNLNLLSFEDSTTGGVQQKQIREHEVLIHVEDETWDPTLDHLAKHDGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GSTNIETELRPSNNLNLLSFEDSTTGGVQQKQIREHEVLIHVEDETWDPTLDHLAKHDGE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 DVLGNKVERKEDGFEDGVEDNKLKENMERACLMSLDITEHELQILEQQSQEEYLSDIAYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DVLGNKVERKEDGFEDGVEDNKLKENMERACLMSLDITEHELQILEQQSQEEYLSDIAYK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 STEHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKSLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 STEHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKSLE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 NLNSGTVEPTHSKCLKMERNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDKDFLWPAPNEEQVTCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NLNSGTVEPTHSKCLKMERNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDKDFLWPAPNEEQVTCL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 KMYFGHSSFKPVQWKVIHSVLEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KMYFGHSSFKPVQWKVIHSVLEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLIS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 LMEDQVLQLKMSNIPACFLGSAQSENVLTDIKLGKYRIVYVTPEYCSGNMGLLQQLEADI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LMEDQVLQLKMSNIPACFLGSAQSENVLTDIKLGKYRIVYVTPEYCSGNMGLLQQLEADI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 GITLIAVDEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTATASSSIREDIVRCLNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GITLIAVDEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTATASSSIREDIVRCLNL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 RNPQITCTGFDRPNLYLEVRRKTGNILQDLQPFLVKTSSHWEFEGPTIIYCPSRKMTQQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RNPQITCTGFDRPNLYLEVRRKTGNILQDLQPFLVKTSSHWEFEGPTIIYCPSRKMTQQV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE1 TGELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFVRDEIQCVIATIAFGMGINKADIRQVIHYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TGELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFVRDEIQCVIATIAFGMGINKADIRQVIHYG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE1 APKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADINLNRHLLTEIRNEKFRLYKLKMMAKME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 APKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADINLNRHLLTEIRNEKFRLYKLKMMAKME
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE1 KYLHSSRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLDHCYSMDDSEDTSWDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KYLHSSRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLDHCYSMDDSEDTSWDFG
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE1 PQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRGSNSQRLADQYRRHSLFGTGKDQTESWWKAFSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRGSNSQRLADQYRRHSLFGTGKDQTESWWKAFSR
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE1 QLITEGFLVEVSRYNKFMKICALTKKGRNWLHKANTESQSLILQANEELCPKKLLLPSSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QLITEGFLVEVSRYNKFMKICALTKKGRNWLHKANTESQSLILQANEELCPKKLLLPSSK
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE1 TVSSGTKEHCYNQVPVELSTEKKSNLEKLYSYKPCDKISSGSNISKKSIMVQSPEKAYSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TVSSGTKEHCYNQVPVELSTEKKSNLEKLYSYKPCDKISSGSNISKKSIMVQSPEKAYSS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE1 SQPVISAQEQETQIVLYGKLVEARQKHANKMDVPPAILATNKILVDMAKMRPTTVENVKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SQPVISAQEQETQIVLYGKLVEARQKHANKMDVPPAILATNKILVDMAKMRPTTVENVKR
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE1 IDGVSEGKAAMLAPLLEVIKHFCQTNSVQTDLFSSTKPQEEQKTSLVAKNKICTLSQSMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IDGVSEGKAAMLAPLLEVIKHFCQTNSVQTDLFSSTKPQEEQKTSLVAKNKICTLSQSMA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE1 ITYSLFQEKKMPLKSIAESRILPLMTIGMHLSQAVKAGCPLDLERAGLTPEVQKIIADVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ITYSLFQEKKMPLKSIAESRILPLMTIGMHLSQAVKAGCPLDLERAGLTPEVQKIIADVI
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE1 RNPPVNSDMSKISLIRMLVPENIDTYLIHMAIEILKHGPDSGLQPSRDVNKRRCFPGSEE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS60 RNPPVNSDMSKISLIRMLVPENIDTYLIHMAIEILKHGPDSGLQPSCDVNKRRCFPGSEE
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430  
pF1KE1 ICSSSKRSKEEVGINTETSSAERKRRLPVWFAKGSDTSKKLMDKTKRGGLFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ICSSSKRSKEEVGINTETSSAERKRRLPVWFAKGSDTSKKLMDKTKRGGLFS
             1390      1400      1410      1420      1430  

>>CCDS31756.1 RECQL gene_id:5965|Hs108|chr12              (649 aa)
 initn: 841 init1: 343 opt: 841  Z-score: 809.5  bits: 161.2 E(32554): 9.1e-39
Smith-Waterman score: 855; 34.6% identity (64.0% similar) in 483 aa overlap (509-977:51-510)

      480       490       500       510       520           530    
pF1KE1 LENLNSGTVEPTHSKCLKMERNLGLPTKEEEEDDENEANEGEED----DDKDFLWPAPNE
                                     :..: . .:: . .    . .:: : .  .
CCDS31 VEIQIQELTERQQELIQKKKVLTKKIKQCLEDSDAGASNEYDSSPAAWNKEDFPWSGKVK
               30        40        50        60        70        80

          540       550       560       570       580       590    
pF1KE1 EQVTCLKMYFGHSSFKPVQWKVIHSVLEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLV
       .    :.  :   .:.:.: ..:. :    ..   :: :: :::::.: : .    . ::
CCDS31 D---ILQNVFKLEKFRPLQLETIN-VTMAGKEVFLVMPTGGGKSLCYQLPALCSDGFTLV
                  90       100        110       120       130      

          600       610       620           630         640        
pF1KE1 ISPLISLMEDQVLQLKMSNIPACFLGSAQSEN----VLTDI--KLGKYRIVYVTPEYCSG
       : :::::::::.. ::. .: : .:....:..    : ...  : .. ...:::::  . 
CCDS31 ICPLISLMEDQLMVLKQLGISATMLNASSSKEHVKWVHAEMVNKNSELKLIYVTPEKIAK
        140       150       160       170       180       190      

      650       660          670       680       690       700     
pF1KE1 NMGLLQQLEADIG---ITLIAVDEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTAT
       .  ....::       .: :::::.:: :.:::::: ... :: ::  .: . ...::::
CCDS31 SKMFMSRLEKAYEARRFTRIAVDEVHCCSQWGHDFRPDYKALGILKRQFPNASLIGLTAT
        200       210       220       230       240       250      

         710       720       730       740       750       760     
pF1KE1 ASSSIREDIVRCLNLRNPQITCTGFDRPNLYLEVRRKTGNILQDLQPFLVKTSSHWEFEG
       :.. .  :  . : ...     ..:.::::: :::.: .:  .:.   .::  .  ...:
CCDS31 ATNHVLTDAQKILCIEKCFTFTASFNRPNLYYEVRQKPSNT-EDFIEDIVKLING-RYKG
        260       270       280       290        300       310     

          770       780       790       800       810       820    
pF1KE1 PT-IIYCPSRKMTQQVTGELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFVRDEIQCVIATIAF
        . :::: :.: ..:::  :..:..  :.:::..    .  .:...  .::: :.::.::
CCDS31 QSGIIYCFSQKDSEQVTVSLQNLGIHAGAYHANLEPEDKTTVHRKWSANEIQVVVATVAF
          320       330       340       350       360       370    

          830       840       850       860       870       880    
pF1KE1 GMGINKADIRQVIHYGAPKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADINLNRHLLTEIR
       ::::.: :.: :::..  :.::.:::: :::::: ....: . .. .::    .. . . 
CCDS31 GMGIDKPDVRFVIHHSMSKSMENYYQESGRAGRDDMKADCILYYGFGDI---FRISSMVV
          380       390       400       410       420          430 

          890       900       910       920       930       940    
pF1KE1 NEKFRLYKLKMMAKMEKYLHSSRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLD
        :.    ::  :... . .  :.::: .. .::..   ..:       .: :::: .  :
CCDS31 MENVGQQKLYEMVSYCQNI--SKCRRVLMAQHFDEVWNSEAC------NKMCDNCCK--D
             440       450         460       470             480   

          950       960       970       980       990      1000    
pF1KE1 HCYSMDDSEDTSWDFGPQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRGSNSQRLADQYRRHSLF
         .   .  .   :.    .:.:. .. :.::.                           
CCDS31 SAFERKNITEYCRDL----IKILKQAEELNEKLTPLKLIDSWMGKGAAKLRVAGVVAPTL
             490           500       510       520       530       

         1010      1020      1030      1040      1050      1060    
pF1KE1 GTGKDQTESWWKAFSRQLITEGFLVEVSRYNKFMKICALTKKGRNWLHKANTESQSLILQ
                                                                   
CCDS31 PREDLEKIIAHFLIQQYLKEDYSFTAYATISYLKIGPKANLLNNEAHAITMQVTKSTQNS
       540       550       560       570       580       590       

>>CCDS10363.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15                 (1417 aa)
 initn: 720 init1: 251 opt: 653  Z-score: 623.4  bits: 127.9 E(32554): 2.1e-28
Smith-Waterman score: 824; 29.5% identity (61.5% similar) in 650 aa overlap (414-1030:525-1157)

           390       400       410       420         430           
pF1KE1 KENMERACLMSLDITEHELQILEQQSQEEYLSDIAYKS-TEHL-SPNDNENDT--SYVIE
                                     :.. : :. ..:  : :: : .:  :: :.
CCDS10 HLQKSFVSSNWAETPRLGKKNESSYFPGNVLTSTAVKDQNKHTASINDLERETQPSYDID
          500       510       520       530       540       550    

     440             450       460       470        480         490
pF1KE1 S------DEDLEMEMLKHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKSL-ENLNSGTVE--PT
       .      :.: . : . :    .. . ..:    .   : . .::. : :.:. ..  :.
CCDS10 NFDIDDFDDDDDWEDIMHNLAASKSSTAAY----QPIKEGRPIKSVSERLSSAKTDCLPV
          560       570       580           590       600       610

              500       510       520       530       540       550
pF1KE1 HSKCLKMERNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDKDFLWPAPNEEQVTCLKMYFGHSSFK
        :   ... . .. .  .. . .: :... . .  . :    ..:..  ..  ::  .:.
CCDS10 SSTAQNINFSESIQNYTDK-SAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKEMMKIFHKKFGLHNFR
              620        630       640       650       660         

              560       570       580       590       600       610
pF1KE1 PVQWKVIHSVLEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLISLMEDQVLQLK
         : ..:...:  . :   .: :: :::::.: :      . .::::: ::. ::: .: 
CCDS10 TNQLEAINAALLGE-DCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLIVDQVQKLT
     670       680        690       700       710       720        

              620       630             640          650       660 
pF1KE1 MSNIPACFLGSAQSENVLTDI--KLGK----YRIVYVTPE-YCSGN--MGLLQQLEADIG
         .::: .: . ....  :.:  .:.:     ...:::::  :..:  .. :..:     
CCDS10 SLDIPATYLTGDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTLENLYERKL
      730       740       750       760       770       780        

             670       680       690       700       710       720 
pF1KE1 ITLIAVDEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTATASSSIREDIVRCLNLR
       .. ...:::::.:.::::::....... :.  .: ::..::::::.  ...::.  :.. 
CCDS10 LARFVIDEAHCVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKDILTQLKIL
      790       800       810       820       830       840        

             730        740       750       760       770       780
pF1KE1 NPQITCTGFDRPNL-YLEVRRKTGNILQDLQPFLVKTSSHWEFEGPTIIYCPSRKMTQQV
        ::.   .:.: :: :  . .:  ..  :   .. :   :  ...  :::: ::.  . .
CCDS10 RPQVFSMSFNRHNLKYYVLPKKPKKVAFDCLEWIRK---HHPYDSG-IIYCLSRRECDTM
      850       860       870       880          890        900    

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pF1KE1 TGELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFV-RDEIQCVIATIAFGMGINKADIRQVIHY
       .  :.. .:.  .::::.: :.: ....... .:  : . :::::::::.: :.: ::: 
CCDS10 ADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRFVIHA
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     840       850       860       870        880        890       
pF1KE1 GAPKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADIN-LNRHLLTEIR-NEKFRLYKLKMMA
       . ::..:.:::: :::::::  : : ....  :.. :.: .. :   :.. :  ... . 
CCDS10 SLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLIMMEKDGNHHTRETHFNNLY
          970       980       990      1000      1010      1020    

       900        910       920       930       940        950     
pF1KE1 KMEKYLHS-SRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLDH-CYSMDDSEDT
       .: .: .. ..:::  .:..: ..  .  ..     .  :::: .  :.   .. :.  .
CCDS10 SMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGFNP-DFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVTDDVKS
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              960       970       980       990      1000      1010
pF1KE1 SWDF-----GPQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRGSNSQRLADQYRRHSLFGTGKDQ
          :     . :... .. :   : .: ... . .. ::.: ..     . ..:: :.  
CCDS10 IVRFVQEHSSSQGMRNIKHVGPSG-RFTMNMLVDIFLGSKSAKI-----QSGIFGKGSAY
          1090      1100       1110      1120           1130       

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KE1 TESWWKAFSRQLITEGFLVEVSRYNKFMKICALTKKGRNWLHKANTESQSLILQANEELC
       ..   . . ..:: . .: :                                        
CCDS10 SRHNAERLFKKLILDKILDEDLYINANDQAIAYVMLGNKAQTVLNGNLKVDFMETENSSS
      1140      1150      1160      1170      1180      1190       

>>CCDS73782.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15                 (1286 aa)
 initn: 720 init1: 251 opt: 640  Z-score: 611.7  bits: 125.6 E(32554): 9.5e-28
Smith-Waterman score: 811; 31.5% identity (62.5% similar) in 568 aa overlap (414-954:525-1079)

           390       400       410       420         430           
pF1KE1 KENMERACLMSLDITEHELQILEQQSQEEYLSDIAYKS-TEHL-SPNDNENDT--SYVIE
                                     :.. : :. ..:  : :: : .:  :: :.
CCDS73 HLQKSFVSSNWAETPRLGKKNESSYFPGNVLTSTAVKDQNKHTASINDLERETQPSYDID
          500       510       520       530       540       550    

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pF1KE1 S------DEDLEMEMLKHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKSL-ENLNSGTVE--PT
       .      :.: . : . :    .. . ..:    .   : . .::. : :.:. ..  :.
CCDS73 NFDIDDFDDDDDWEDIMHNLAASKSSTAAY----QPIKEGRPIKSVSERLSSAKTDCLPV
          560       570       580           590       600       610

              500       510       520       530       540       550
pF1KE1 HSKCLKMERNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDKDFLWPAPNEEQVTCLKMYFGHSSFK
        :   ... . .. .  .. . .: :... . .  . :    ..:..  ..  ::  .:.
CCDS73 SSTAQNINFSESIQNYTDK-SAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKEMMKIFHKKFGLHNFR
              620        630       640       650       660         

              560       570       580       590       600       610
pF1KE1 PVQWKVIHSVLEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLISLMEDQVLQLK
         : ..:...:  . :   .: :: :::::.: :      . .::::: ::. ::: .: 
CCDS73 TNQLEAINAALLGE-DCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLIVDQVQKLT
     670       680        690       700       710       720        

              620       630             640          650       660 
pF1KE1 MSNIPACFLGSAQSENVLTDI--KLGK----YRIVYVTPE-YCSGN--MGLLQQLEADIG
         .::: .: . ....  :.:  .:.:     ...:::::  :..:  .. :..:     
CCDS73 SLDIPATYLTGDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTLENLYERKL
      730       740       750       760       770       780        

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pF1KE1 ITLIAVDEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTATASSSIREDIVRCLNLR
       .. ...:::::.:.::::::....... :.  .: ::..::::::.  ...::.  :.. 
CCDS73 LARFVIDEAHCVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKDILTQLKIL
      790       800       810       820       830       840        

             730        740       750       760       770       780
pF1KE1 NPQITCTGFDRPNL-YLEVRRKTGNILQDLQPFLVKTSSHWEFEGPTIIYCPSRKMTQQV
        ::.   .:.: :: :  . .:  ..  :   .. :   :  ...  :::: ::.  . .
CCDS73 RPQVFSMSFNRHNLKYYVLPKKPKKVAFDCLEWIRK---HHPYDSG-IIYCLSRRECDTM
      850       860       870       880          890        900    

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pF1KE1 TGELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFV-RDEIQCVIATIAFGMGINKADIRQVIHY
       .  :.. .:.  .::::.: :.: ....... .:  : . :::::::::.: :.: ::: 
CCDS73 ADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRFVIHA
          910       920       930       940       950       960    

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pF1KE1 GAPKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADIN-LNRHLLTEIR-NEKFRLYKLKMMA
       . ::..:.:::: :::::::  : : ....  :.. :.: .. :   :.. :  ... . 
CCDS73 SLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLIMMEKDGNHHTRETHFNNLY
          970       980       990      1000      1010      1020    

       900        910       920       930       940       950      
pF1KE1 KMEKYLHS-SRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLDHCYSMDDSEDTS
       .: .: .. ..:::  .:..: ..  .  ..     .  :::: .  :  :.  :  :  
CCDS73 SMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGFNP-DFCKKHPDVSCDNCCKTKD--YKTRDVTDDV
         1030      1040      1050       1060      1070        1080 

        960       970       980       990      1000      1010      
pF1KE1 WDFGPQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRGSNSQRLADQYRRHSLFGTGKDQTESWWK
                                                                   
CCDS73 KSIVRFVQEHSSSQGMRNIKHVGPSGRFTMNMLVDIFLESLSSDPEVLLQIDGVTEDKLE
            1090      1100      1110      1120      1130      1140 

>>CCDS42380.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17             (991 aa)
 initn: 632 init1: 293 opt: 567  Z-score: 543.7  bits: 112.6 E(32554): 5.8e-24
Smith-Waterman score: 764; 28.0% identity (56.8% similar) in 690 aa overlap (529-1176:8-644)

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pF1KE1 RNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDKDFLWPAPNEEQV-TCLKMYFGHSSFK-PVQWKV
                                     .:   :..: . ::  :: .::: :.: ..
CCDS42                        MSSHHTTFPFDPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQESA
                                      10        20        30       

        560       570       580       590       600            610 
pF1KE1 IHSVLEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLISLMEDQV-----LQLKM
         .:..  .:  . : :: :::::.: : . .  : .:.::::.:..:::     :....
CCDS42 TMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHLLTLKVRV
        40        50        60        70        80        90       

             620       630         640         650       660       
pF1KE1 SNIPACFLGSAQSENVLTDIKLGK--YRIVYVTPEYCSGN--MGLLQQLEADIGITLIAV
       :.. .  :.. . ...:.:..  :   .:.:.:::. ...  .  :..: .   .. ..:
CCDS42 SSLNSK-LSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPEMAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLVV
       100        110       120       130       140       150      

       670       680       690       700       710       720       
pF1KE1 DEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTATASSSIREDIVRCLNLRNP-QIT
       :::::.:.:::::: .. .::.:.. :  .: :::::::. ...::.   :.:..:  : 
CCDS42 DEAHCVSQWGHDFRPDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAIF
        160       170       180       190       200       210      

        730       740         750       760          770       780 
pF1KE1 CTGFDRPNLYLEVRRKT--GNILQDLQPFLVKTSSHWEFEGPT---IIYCPSRKMTQQVT
        :   : ::. .:. :   ..   .:. : .:. ..   .: .   :.:: .:.  .:..
CCDS42 KTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKALGQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQLA
        220       230       240       250       260       270      

             790       800       810       820       830       840 
pF1KE1 GELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFVRDEIQCVIATIAFGMGINKADIRQVIHYGA
        ::   ...  .::::.. : :  ... ......  ..:::.::::..::..: : :.. 
CCDS42 IELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWMEEKVPVIVATISFGMGVDKANVRFVAHWNI
        280       290       300       310       320       330      

             850       860       870              880       890    
pF1KE1 PKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADINLNRHL-------LTEIRNEKFRLYKLK
        :.: .:::: :::::::  : :.. ..  : .    :       : : :..:    :  
CCDS42 AKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKAS-DKAT
        340       350       360       370       380       390      

            900       910       920       930       940       950  
pF1KE1 MMA--KMEKYLHSSRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLDHCYSMDDS
       .::   .  . .   ::.  : ..: :        .. .  : ::.:..       ..  
CCDS42 IMAFDALVTFCEELGCRHAAIAKYFGD--------ALPACAKGCDHCQNPTAVRRRLEAL
         400       410       420               430       440       

             960       970       980        990      1000      1010
pF1KE1 E-DTSWDFGPQAFKLLSAVDILGEKFGIGL-PILFLRGSNSQRLADQYRRHSLFGTGKDQ
       : ..::           .   .: . : :. : :.  :   ..   .. :..  :.: . 
CCDS42 ERSSSW-----------SKTCIGPSQGNGFDPELYEGG---RKGYGDFSRYDE-GSGGSG
       450                  460       470          480        490  

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KE1 TESWWKAFSRQLITEGFLVEVSRYNKFMKICALTKKGRNWLHKANTESQSLILQANEELC
        :.  .: .:.            .: :..     .::.      . . . ..    .: :
CCDS42 DEGRDEAHKRE------------WNLFYQKQMQLRKGK------DPKIEEFV--PPDENC
            500                   510             520         530  

             1080         1090      1100         1110              
pF1KE1 PKKLLLPSSKTVSSGT---KEHCYNQVPVELSTEKKSNL---EKLYSYKPCD------KI
       : :    ::. .   :   .:::   .   ::....:.    :     :  .      . 
CCDS42 PLKE--ASSRRIPRLTVKAREHCLRLLEEALSSNRQSTRTADEADLRAKAVELEHETFRN
              540       550       560       570       580       590

     1120      1130        1140      1150      1160      1170      
pF1KE1 SSGSNISKKSIM--VQSPEKAYSSSQPVISAQEQETQIVLYGKLVEARQKHANKMDVPPA
       .. .:. : :..  : . ..: ...::   .   ..  .      .:.  . :..:.:::
CCDS42 AKVANLYKASVLKKVADIHRASKDGQPYDMGGSAKSCSA------QAEPPEPNEYDIPPA
              600       610       620             630       640    

       1180      1190      1200      1210      1220      1230      
pF1KE1 ILATNKILVDMAKMRPTTVENVKRIDGVSEGKAAMLAPLLEVIKHFCQTNSVQTDLFSST
                                                                   
CCDS42 SHVYSLKPKRVGAGFPKGSCPFQTATELMETTRIREQAPQPERGGEHEPPSRPCGLLDED
          650       660       670       680       690       700    

>>CCDS45777.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17             (410 aa)
 initn: 652 init1: 284 opt: 547  Z-score: 531.3  bits: 109.0 E(32554): 2.8e-23
Smith-Waterman score: 736; 35.7% identity (68.4% similar) in 361 aa overlap (529-872:8-367)

      500       510       520       530        540       550       
pF1KE1 RNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDKDFLWPAPNEEQV-TCLKMYFGHSSFK-PVQWKV
                                     .:   :..: . ::  :: .::: :.: ..
CCDS45                        MSSHHTTFPFDPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQESA
                                      10        20        30       

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pF1KE1 IHSVLEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLISLMEDQV-----LQLKM
         .:..  .:  . : :: :::::.: : . .  : .:.::::.:..:::     :....
CCDS45 TMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHLLTLKVRV
        40        50        60        70        80        90       

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pF1KE1 SNIPACFLGSAQSENVLTDIKLGK--YRIVYVTPEYCSGN--MGLLQQLEADIGITLIAV
       :.. .  :.. . ...:.:..  :   .:.:.:::. ...  .  :..: .   .. ..:
CCDS45 SSLNSK-LSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPEMAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLVV
       100        110       120       130       140       150      

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pF1KE1 DEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTATASSSIREDIVRCLNLRNP-QIT
       :::::.:.:::::: .. .::.:.. :  .: :::::::. ...::.   :.:..:  : 
CCDS45 DEAHCVSQWGHDFRPDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAIF
        160       170       180       190       200       210      

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pF1KE1 CTGFDRPNLYLEVRRKT--GNILQDLQPFLVKTSSHWEFEGPT---IIYCPSRKMTQQVT
        :   : ::. .:. :   ..   .:. : .:. ..   .: .   :.:: .:.  .:..
CCDS45 KTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKALGQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQLA
        220       230       240       250       260       270      

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pF1KE1 GELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFVRDEIQCVIATIAFGMGINKADIRQVIHYGA
        ::   ...  .::::.. : :  ... ......  ..:::.::::..::..: : :.. 
CCDS45 IELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWMEEKVPVIVATISFGMGVDKANVRFVAHWNI
        280       290       300       310       320       330      

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pF1KE1 PKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADINLNRHLLTEIRNEKFRLYKLKMMAKMEK
        :.: .:::: :::::::  : :.. ..  :                             
CCDS45 AKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKASDKATI
        340       350       360       370       380       390      

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pF1KE1 YLHSSRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLDHCYSMDDSEDTSWDFGP
                                                                   
CCDS45 MAFDALVTFCEELG                                              
        400       410                                              

>>CCDS32735.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17             (435 aa)
 initn: 652 init1: 284 opt: 547  Z-score: 530.8  bits: 109.0 E(32554): 3e-23
Smith-Waterman score: 736; 35.7% identity (68.4% similar) in 361 aa overlap (529-872:8-367)

      500       510       520       530        540       550       
pF1KE1 RNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDKDFLWPAPNEEQV-TCLKMYFGHSSFK-PVQWKV
                                     .:   :..: . ::  :: .::: :.: ..
CCDS32                        MSSHHTTFPFDPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQESA
                                      10        20        30       

        560       570       580       590       600            610 
pF1KE1 IHSVLEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLISLMEDQV-----LQLKM
         .:..  .:  . : :: :::::.: : . .  : .:.::::.:..:::     :....
CCDS32 TMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHLLTLKVRV
        40        50        60        70        80        90       

             620       630         640         650       660       
pF1KE1 SNIPACFLGSAQSENVLTDIKLGK--YRIVYVTPEYCSGN--MGLLQQLEADIGITLIAV
       :.. .  :.. . ...:.:..  :   .:.:.:::. ...  .  :..: .   .. ..:
CCDS32 SSLNSK-LSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPEMAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLVV
       100        110       120       130       140       150      

       670       680       690       700       710       720       
pF1KE1 DEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTATASSSIREDIVRCLNLRNP-QIT
       :::::.:.:::::: .. .::.:.. :  .: :::::::. ...::.   :.:..:  : 
CCDS32 DEAHCVSQWGHDFRPDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAIF
        160       170       180       190       200       210      

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pF1KE1 CTGFDRPNLYLEVRRKT--GNILQDLQPFLVKTSSHWEFEGPT---IIYCPSRKMTQQVT
        :   : ::. .:. :   ..   .:. : .:. ..   .: .   :.:: .:.  .:..
CCDS32 KTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKALGQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQLA
        220       230       240       250       260       270      

             790       800       810       820       830       840 
pF1KE1 GELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFVRDEIQCVIATIAFGMGINKADIRQVIHYGA
        ::   ...  .::::.. : :  ... ......  ..:::.::::..::..: : :.. 
CCDS32 IELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWMEEKVPVIVATISFGMGVDKANVRFVAHWNI
        280       290       300       310       320       330      

             850       860       870       880       890       900 
pF1KE1 PKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADINLNRHLLTEIRNEKFRLYKLKMMAKMEK
        :.: .:::: :::::::  : :.. ..  :                             
CCDS32 AKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKASDKATI
        340       350       360       370       380       390      

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pF1KE1 YLHSSRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLDHCYSMDDSEDTSWDFGP
                                                                   
CCDS32 MAFDALVTFCEELGRWGRGHGKSLRAAWCSQVVSRHAEL                     
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1432 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 16:10:35 2016 done: Sun Nov  6 16:10:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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