Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1794
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1794, 309 aa
1>>>pF1KE1794 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6050+/-0.000726; mu= 13.6400+/- 0.044
mean_var=58.5443+/-11.971, 0's: 0 Z-trim(107.7): 31 B-trim: 411 in 2/49
Lambda= 0.167622
statistics sampled from 9830 (9859) to 9830 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 1.120
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs109|chr8 ( 309) 2167 532.1 2.1e-151
CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs109|chr5 ( 309) 2123 521.5 3.4e-148
CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs109|chr16 ( 307) 1470 363.6 1.1e-100
CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs109|chr9 ( 305) 1257 312.0 3.7e-85
CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs109|chr9 ( 342) 1199 298.0 6.8e-81
CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs109|chr12 ( 323) 1023 255.5 4.2e-68
CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs109|chr12 ( 337) 1023 255.5 4.4e-68
CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs109|chr11 ( 330) 1010 252.3 3.8e-67
CCDS31618.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs109|chr11 ( 341) 1010 252.3 3.9e-67
CCDS33169.1 PPP1CB gene_id:5500|Hs109|chr2 ( 327) 978 244.6 8e-65
CCDS48019.1 PPP6C gene_id:5537|Hs109|chr9 ( 283) 943 236.1 2.5e-62
CCDS8161.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs109|chr11 ( 286) 908 227.6 8.8e-60
CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs109|chr19 ( 499) 799 201.3 1.3e-51
CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs109|chr4 ( 469) 708 179.3 5.1e-45
CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs109|chr4 ( 511) 708 179.3 5.5e-45
CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs109|chr4 ( 521) 708 179.3 5.6e-45
CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs109|chr10 ( 515) 695 176.2 4.9e-44
CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs109|chr10 ( 524) 695 176.2 5e-44
CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs109|chr10 ( 525) 695 176.2 5e-44
CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs109|chr8 ( 502) 675 171.3 1.4e-42
CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs109|chr8 ( 512) 675 171.3 1.4e-42
CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs109|chr8 ( 521) 675 171.3 1.4e-42
CCDS34013.1 PPEF2 gene_id:5470|Hs109|chr4 ( 753) 382 100.5 4.3e-21
CCDS43920.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs109|chrX ( 591) 338 89.9 5.4e-18
CCDS14188.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs109|chrX ( 653) 338 89.9 6e-18
>>CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs109|chr8 (309 aa)
initn: 2167 init1: 2167 opt: 2167 Z-score: 2831.8 bits: 532.1 E(33420): 2.1e-151
Smith-Waterman score: 2167; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITILRGNHES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITILRGNHES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHV
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TRRTPDYFL
:::::::::
CCDS60 TRRTPDYFL
>>CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs109|chr5 (309 aa)
initn: 2123 init1: 2123 opt: 2123 Z-score: 2774.3 bits: 521.5 E(33420): 3.4e-148
Smith-Waterman score: 2123; 97.4% identity (99.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
::.:.::::::::.:::::::::.:.::..::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITILRGNHES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS41 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPRRGEPHV
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TRRTPDYFL
:::::::::
CCDS41 TRRTPDYFL
>>CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs109|chr16 (307 aa)
initn: 1468 init1: 1446 opt: 1470 Z-score: 1921.0 bits: 363.6 E(33420): 1.1e-100
Smith-Waterman score: 1470; 65.5% identity (86.6% similar) in 307 aa overlap (5-309:2-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
: ..::. .::: .:. ..:..:..:: ::.:::..:::::.: :::::::.::
CCDS10 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITILRGNHES
::.:: ::::.:: :.::::::::.::::.::::: ::.:::::::.:::..::::::
CCDS10 QFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
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CCDS10 RQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
:..:: :::::.:::::::::::.: :::.::::::: ::.:. :: :: . .. ::
CCDS10 RTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE1 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPR--RGEP
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CCDS10 HQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIP
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE1 HVTRRTPDYFL
. . ::::
CCDS10 S-KKPVADYFL
300
>>CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs109|chr9 (305 aa)
initn: 1256 init1: 1256 opt: 1257 Z-score: 1642.6 bits: 312.0 E(33420): 3.7e-85
Smith-Waterman score: 1257; 59.1% identity (80.2% similar) in 303 aa overlap (9-309:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
.::..:: :: : ::... ::. . ..: .::::: : :::::::.::
CCDS68 MAPLDLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITILRGNHES
::.:: :::: ::. :::::.::::.:::::::.:: : :.:::...:.:::.:::::::
CCDS68 QFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
::::::::::::: ::::::.:.: : .::.: ..::.: ::.:.::::::.: :::.:
CCDS68 RQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
:...: ::.::.: .:::.::::.: :.:::::::. :: ... : : :.: :. ::
CCDS68 RTIERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE1 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDD--TLKYSFLQFDPAPRRGEP
:::: :::.. :...::..::::::::::: :.:: . : : . .... : .: :
CCDS68 HQLVHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIP
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE1 HVTRRTPDYFL
: : :::
CCDS68 --PRTTTPYFL
300
>>CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs109|chr9 (342 aa)
initn: 1241 init1: 1198 opt: 1199 Z-score: 1566.0 bits: 298.0 E(33420): 6.8e-81
Smith-Waterman score: 1199; 60.5% identity (81.1% similar) in 281 aa overlap (31-309:64-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
::. . ..: .::::: : :::::::.::
CCDS48 PSGCGAPAGRPFLSPGPPPVFHFLRFLKERLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHG
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITILRGNHES
::.:: :::: ::. :::::.::::.:::::::.:: : :.:::...:.:::.:::::::
CCDS48 QFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHES
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
::::::::::::: ::::::.:.: : .::.: ..::.: ::.:.::::::.: :::.:
CCDS48 RQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQI
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
:...: ::.::.: .:::.::::.: :.:::::::. :: ... : : :.: :. ::
CCDS48 RTIERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRA
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290
pF1KE1 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDD--TLKYSFLQFDPAPRRGEP
:::: :::.. :...::..::::::::::: :.:: . : : . .... : .: :
CCDS48 HQLVHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIP
280 290 300 310 320 330
300
pF1KE1 HVTRRTPDYFL
: : :::
CCDS48 --PRTTTPYFL
340
>>CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs109|chr12 (323 aa)
initn: 673 init1: 673 opt: 1023 Z-score: 1336.4 bits: 255.5 E(33420): 4.2e-68
Smith-Waterman score: 1023; 50.0% identity (77.7% similar) in 282 aa overlap (22-302:29-308)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVT
::.::..: :: :..::. .. . :.. :.
CCDS91 MADLDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 VCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITI
.:::.:::..::..::. :: :..::::.::::::: :.::. ::.: :..::: . .
CCDS91 ICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPS
:::::: .:...::::::: :.: : ..:: ::: :. ::..:.:: .::: ::::::.
CCDS91 LRGNHECASINRIYGFYDECKRRY-NIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPD-DRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHAN
......:: . : .:: .: .::::::::: : ::: . ::...::: .. : : .
CCDS91 LQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPA
: :. ::::.: .::.. :..::.::::::: . : .:.: .:.:: :: . ::
CCDS91 DLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPA
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE1 PRRGEPHVTRRTPDYFL
.. .:..::
CCDS91 EKK-KPNATRPVTPPRGMITKQAKK
300 310 320
>>CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs109|chr12 (337 aa)
initn: 673 init1: 673 opt: 1023 Z-score: 1336.1 bits: 255.5 E(33420): 4.4e-68
Smith-Waterman score: 1023; 50.0% identity (77.7% similar) in 282 aa overlap (22-302:29-308)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVT
::.::..: :: :..::. .. . :.. :.
CCDS58 MADLDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 VCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITI
.:::.:::..::..::. :: :..::::.::::::: :.::. ::.: :..::: . .
CCDS58 ICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPS
:::::: .:...::::::: :.: : ..:: ::: :. ::..:.:: .::: ::::::.
CCDS58 LRGNHECASINRIYGFYDECKRRY-NIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPD-DRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHAN
......:: . : .:: .: .::::::::: : ::: . ::...::: .. : : .
CCDS58 LQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPA
: :. ::::.: .::.. :..::.::::::: . : .:.: .:.:: :: . ::
CCDS58 DLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPA
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE1 PRRGEPHVTRRTPDYFL
.. .:..::
CCDS58 EKK-KPNATRPVTPPRVASGLNPSIQKASNYRNNTVLYE
300 310 320 330
>>CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs109|chr11 (330 aa)
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Smith-Waterman score: 1010; 50.4% identity (77.4% similar) in 274 aa overlap (22-294:29-301)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]