FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1797, 843 aa 1>>>pF1KE1797 843 - 843 aa - 843 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0313+/-0.000778; mu= 9.4680+/- 0.047 mean_var=153.9561+/-31.080, 0's: 0 Z-trim(113.7): 48 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.103366 statistics sampled from 14430 (14478) to 14430 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.762), E-opt: 0.2 (0.433), width: 16 Scan time: 2.220 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS11662.1 AXIN2 gene_id:8313|Hs109|chr17 ( 843) 5752 869.8 0 CCDS86634.1 AXIN2 gene_id:8313|Hs109|chr17 ( 778) 3885 591.3 2.2e-168 CCDS10405.1 AXIN1 gene_id:8312|Hs109|chr16 ( 862) 1441 226.9 1.2e-58 CCDS10406.1 AXIN1 gene_id:8312|Hs109|chr16 ( 826) 417 74.2 1.1e-12 >>CCDS11662.1 AXIN2 gene_id:8313|Hs109|chr17 (843 aa) initn: 5752 init1: 5752 opt: 5752 Z-score: 4641.0 bits: 869.8 E(33420): 0 Smith-Waterman score: 5752; 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CCDS10 TLNEDEEWKCDQDMDEDDGRDAAPPGRL-PQKLLLETAAPRVSSSRRYSEGREFRYGSWR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 RSDPVNPYHIGSGYVFAPATSANDSEISSDALTDDSMSMTDSSVDGIPPYRVGSKKQLQR .:::::....::..:::::::::: .: . :..:.::::::::::::. .:: .: CCDS10 --EPVNPYYVNAGYALAPATSANDSEQQSLSSDADTLSLTDSSVDGIPPYRI--RKQHRR 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 EMHRSVKANGQVSLPHFPRTHRLPKEMTPVEPATFAAELISRLEKLKLELESRHSLEERL ::..::..::.: :::.:::.:.:::. ::: :: ::: ::: .. :....::::: CCDS10 EMQESVQVNGRVPLPHIPRTYRVPKEVR-VEPQKFAEELIHRLEAVQRTREAEEKLEERL 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 pF1KE1 QQIREDEERE------GSELTLNSREGAPTQH--PLSLLPSG------SYEEDPQTILDD ...: .:: : : .. ::. : : . : ..::.:..:::. CCDS10 KRVRMEEEGEDGDPSSGPPGPCHKLPPAPAWHHFPPRCVDMGCAGLRDAHEENPESILDE 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 HLSRVLKTPGCQSPGVGRYSPRSRSPDHHHHHHSQYHSLLPPGGKLPPAAASPGA-CPLL :..:::.::: :::: : :::: : . .: . : ::.. : : CCDS10 HVQRVLRTPGRQSPG-----PGHRSPDSGHV------AKMPVA--LGGAASGHGKHVPKS 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 pF1KE1 GGK-GFVTKQTTKHVHHHYIHHHAVPKTKEEIEAEATQRVHCFCPGGSEYYCY-SKCKSH :.: . . .::::: ::.. . ::..:::::.:.. : : . . .. ... CCDS10 GAKLDAAGLHHHRHVHHHV--HHSTARPKEQVEAEATRRAQSSFAWGLEPHSHGARSRGY 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 610 pF1KE1 SKAPETMPSEQFGGSRGSTLP---KRNGKGTEPGLALPAREGGAPGGAGALQLPREEGDR :.. . :. . : .... . :::.: .: : . .. .::.. :.... CCDS10 SESVGAAPNASDGLAHSGKVGVACKRNAKKAESGKSASTE---VPGAS-------EDAEK 580 590 600 610 620 620 630 640 650 660 670 pF1KE1 SQDVWQWMLESERQ-SKPK--PHSAQSTKKAYPLESARSSPGERASRHHLWGGNSGHPRT .: . ::..:.:.. :. . :....:.: : :..: : : .: :.: . . . CCDS10 NQKIMQWIIEGEKEISRHRRTGHGSSGTRKPQPHENSR--P---LSLEHPWAGPQLRTSV 630 640 650 660 670 680 680 690 700 710 720 730 pF1KE1 TPRAHLFTQDPAMPPLTPPNTLAQLEEACRRLAEVSKPPKQRCCVASQQRDRNHSATVQT : .::: :::.::: :: :.::::: ::: : : .. . :.:: :.. CCDS10 QP-SHLFIQDPTMPPHPAPNPLTQLEEARRRLEEEEKRASR---APSKQRTRSQ------ 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE1 GATPFSNPSLAPEDHKEPKKLAGVHALQASELVVTYFFCGEEIPYRRMLKAQSLTLGHFK .:..: : . .::.:.:::: :::: .......:::.:: CCDS10 ------------------RKVGGGSAQPCDSIVVAYYFCGEPIPYRTLVRGRAVTLGQFK 740 750 760 770 800 810 820 830 840 pF1KE1 EQLSKKGNYRYYFKKASDEFACGAVFEEIWEDETVLPMYEGRILGKVERID : :.:::.:::::::.:::: ::.::::. :::.:::..: .:.::::..: CCDS10 ELLTKKGSYRYYFKKVSDEFDCGVVFEEVREDEAVLPVFEEKIIGKVEKVD 780 790 800 810 820 843 residues in 1 query sequences 18921897 residues in 33420 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Jul 16 15:50:41 2019 done: Tue Jul 16 15:50:41 2019 Total Scan time: 2.220 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]