FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1986, 550 aa 1>>>pF1KE1986 550 - 550 aa - 550 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0155+/-0.000845; mu= 15.9635+/- 0.051 mean_var=87.8965+/-17.158, 0's: 0 Z-trim(107.8): 24 B-trim: 2 in 1/53 Lambda= 0.136801 statistics sampled from 9886 (9908) to 9886 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16 Scan time: 1.510 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS81374.1 PIP5K1A gene_id:8394|Hs109|chr1 ( 550) 3644 729.3 2.8e-210 CCDS990.1 PIP5K1A gene_id:8394|Hs109|chr1 ( 549) 3627 726.0 2.9e-209 CCDS44219.1 PIP5K1A gene_id:8394|Hs109|chr1 ( 562) 3392 679.6 2.7e-195 CCDS44221.1 PIP5K1A gene_id:8394|Hs109|chr1 ( 500) 2922 586.8 2.1e-167 CCDS44220.1 PIP5K1A gene_id:8394|Hs109|chr1 ( 522) 2438 491.3 1.2e-138 CCDS56074.1 PIP5K1C gene_id:23396|Hs109|chr19 ( 640) 2280 460.2 3.5e-129 CCDS32872.1 PIP5K1C gene_id:23396|Hs109|chr19 ( 668) 2280 460.2 3.6e-129 CCDS74257.1 PIP5K1C gene_id:23396|Hs109|chr19 ( 707) 2280 460.2 3.8e-129 CCDS65063.1 PIP5K1B gene_id:8395|Hs109|chr9 ( 502) 2010 406.8 3.2e-113 CCDS6624.1 PIP5K1B gene_id:8395|Hs109|chr9 ( 540) 2010 406.8 3.3e-113 CCDS7141.1 PIP4K2A gene_id:5305|Hs109|chr10 ( 406) 555 119.6 7.4e-27 CCDS11329.1 PIP4K2B gene_id:8396|Hs109|chr17 ( 416) 537 116.1 8.8e-26 CCDS81443.1 PIP4K2A gene_id:5305|Hs109|chr10 ( 347) 534 115.4 1.1e-25 CCDS8946.1 PIP4K2C gene_id:79837|Hs109|chr12 ( 421) 479 104.6 2.5e-22 CCDS55839.1 PIP4K2C gene_id:79837|Hs109|chr12 ( 403) 433 95.5 1.3e-19 CCDS53808.1 PIP4K2C gene_id:79837|Hs109|chr12 ( 373) 305 70.2 4.9e-12 >>CCDS81374.1 PIP5K1A gene_id:8394|Hs109|chr1 (550 aa) initn: 3644 init1: 3644 opt: 3644 Z-score: 3888.8 bits: 729.3 E(33420): 2.8e-210 Smith-Waterman score: 3644; 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70.4% identity (85.1% similar) in 510 aa overlap (20-514:16-523) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MASASSGPSSSVGFSSFDPAVPS----CTLSSAASGI--KRPMASEVPYASGMPI----K :::: . :.::.:. :. .:: ...: : CCDS56 MELEVPDEAESAEAGAVPSEAAWAAESGAAAGLAQKKAAPTEVLSMTAQPGPGHGK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 KIGHRSVDSSGETTYKKTTSSALKGAIQLGITHTVGSLSTKPERDVLMQDFYVVESIFFP :.:::.::.::::::::::::.::::::::: .::: ::.:::::::::::::::::::: CCDS56 KLGHRGVDASGETTYKKTTSSTLKGAIQLGIGYTVGHLSSKPERDVLMQDFYVVESIFFP 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 SEGSNLTPAHHYNDFRFKTYAPVAFRYFRELFGIRPDDYLYSLCSEPLIELCSSGASGSL :::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: . :::::: CCDS56 SEGSNLTPAHHFQDFRFKTYAPVAFRYFRELFGIRPDDYLYSLCNEPLIELSNPGASGSL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 FYVSSDDEFIIKTVQHKEAEFLQKLLPGYYMNLNQNPRTLLPKFYGLYCVQAGGKNIRIV :::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.: CCDS56 FYVTSDDEFIIKTVMHKEAEFLQKLLPGYYMNLNQNPRTLLPKFYGLYCVQSGGKNIRVV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VMNNLLPRSVKMHIKYDLKGSTYKRRASQKEREKPLPTFKDLDFLQDIPDGLFLDADMYN ::::.::: ::::.:.::::::::::::.::.:: .::.:::::.::.:.::.:::: .. 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