FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1989, 565 aa 1>>>pF1KE1989 565 - 565 aa - 565 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 64369986 residues in 92320 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7371+/-0.00033; mu= 8.8543+/- 0.021 mean_var=148.9074+/-30.333, 0's: 0 Z-trim(120.3): 32 B-trim: 600 in 1/51 Lambda= 0.105103 statistics sampled from 36761 (36793) to 36761 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.399), width: 16 Scan time: 5.200 The best scores are: opt bits E(92320) NP_001457 (OMIM: 164745,600667) frizzled-2 precurs ( 565) 3966 613.0 8.4e-175 NP_003498 (OMIM: 603410) frizzled-7 precursor [Hom ( 574) 3118 484.5 4.4e-136 NP_003496 (OMIM: 603408) frizzled-1 [Homo sapiens] ( 647) 3088 479.9 1.1e-134 NP_003459 (OMIM: 601723) frizzled-5 precursor [Hom ( 585) 1856 293.1 1.8e-78 XP_024308898 (OMIM: 601723) frizzled-5 isoform X1 ( 585) 1856 293.1 1.8e-78 XP_016869330 (OMIM: 606143) frizzled-3 isoform X1 ( 599) 1295 208.0 7.4e-53 NP_059108 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Hom ( 666) 1295 208.1 8e-53 NP_665873 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Hom ( 666) 1295 208.1 8e-53 NP_001158088 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 674) 1259 202.6 3.6e-51 NP_003497 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isoform ( 706) 1259 202.6 3.7e-51 NP_001158087 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 706) 1259 202.6 3.7e-51 NP_009128 (OMIM: 606147) frizzled-10 precursor [Ho ( 581) 1233 198.6 4.9e-50 XP_016869332 (OMIM: 606143) frizzled-3 isoform X3 ( 491) 1167 188.6 4.4e-47 XP_016869331 (OMIM: 606143) frizzled-3 isoform X2 ( 502) 1167 188.6 4.4e-47 XP_016869333 (OMIM: 606143) frizzled-3 isoform X4 ( 470) 1160 187.5 8.8e-47 NP_003499 (OMIM: 601766) frizzled-9 precursor [Hom ( 591) 1161 187.7 9.5e-47 NP_036325 (OMIM: 133780,604579) frizzled-4 precurs ( 537) 1073 174.4 9.1e-43 NP_114072 (OMIM: 606146) frizzled-8 precursor [Hom ( 694) 1027 167.4 1.4e-40 NP_001304725 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 401) 709 119.1 3e-26 XP_024302659 (OMIM: 601500,601707,605462) smoothen ( 657) 522 90.9 1.5e-17 NP_005622 (OMIM: 601500,601707,605462) smoothened ( 787) 522 90.9 1.8e-17 NP_001454 (OMIM: 165720,605083) secreted frizzled- ( 325) 441 78.4 4.3e-14 NP_003005 (OMIM: 265900,606570) secreted frizzled- ( 346) 407 73.2 1.6e-12 NP_003006 (OMIM: 604158) secreted frizzled-related ( 317) 364 66.7 1.4e-10 NP_003003 (OMIM: 604156) secreted frizzled-related ( 314) 357 65.6 2.8e-10 NP_003004 (OMIM: 604157) secreted frizzled-related ( 295) 356 65.5 3e-10 NP_001265515 (OMIM: 605236,614595) atrial natriure ( 734) 349 64.7 1.3e-09 NP_001265514 (OMIM: 605236,614595) atrial natriure ( 938) 349 64.7 1.6e-09 NP_006578 (OMIM: 605236,614595) atrial natriuretic (1042) 349 64.8 1.7e-09 NP_113621 (OMIM: 606227,609549,611040) membrane fr ( 579) 281 54.3 1.4e-06 NP_003643 (OMIM: 603105) carboxypeptidase Z isofor ( 641) 260 51.1 1.4e-05 NP_001014447 (OMIM: 603105) carboxypeptidase Z iso ( 652) 247 49.2 5.4e-05 >>NP_001457 (OMIM: 164745,600667) frizzled-2 precursor [ (565 aa) initn: 3966 init1: 3966 opt: 3966 Z-score: 3259.8 bits: 613.0 E(92320): 8.4e-175 Smith-Waterman score: 3966; 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NP_003 QNLNSLRGFVLGPLVLYLLVGTLFLLAGFVSLFRIRSVIKQGGTKTDKLEKLMIRIGIFT 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KE1 VLYTVPATIVIACYFYEQAFREHWERSWVSQHCKSLAIPCPAHYT--PRMSPDFTVYMIK .::::::.::.:::.::: .:: :: .:. ::.: : :: .:.. : :.: NP_003 LLYTVPASIVVACYLYEQHYRESWE--------AALTCACPGHDTGQPRAKPEYWVLMLK 460 470 480 490 500 530 540 550 560 pF1KE1 YLMTLIVGITSGFWIWSGKTLHSWRKFYTRLTNSRHGETTV :.: :.:::::: :::::::..:::.: .: NP_003 YFMCLVVGITSGVWIWSGKTVESWRRFTSRCCCRPRRGHKSGGAMAAGDYPEASAALTGR 510 520 530 540 550 560 >>XP_024308898 (OMIM: 601723) frizzled-5 isoform X1 [Hom (585 aa) initn: 1864 init1: 839 opt: 1856 Z-score: 1530.5 bits: 293.1 E(92320): 1.8e-78 Smith-Waterman score: 1915; 51.6% identity (73.2% similar) in 568 aa overlap (2-554:3-536) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRPRSALPRLLLPLLLLPAAGPAQFHGEKGISIPDHGFCQPISIPLCTDIAYNQTIMPN :: . : :: ::: ::. : .. . :: :..:.: :.:: : ::: XP_024 MARPDPSAPPSLLLLLL------AQLVG-RAAAASKAPVCQEITVPMCRGIGYNLTHMPN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LLGHTNQEDAGLEVHQFYPLVKVQCSPELRFFLCSMYAPVCTV-LEQAIPPCRSICERAR ..: .:..::::::::.:::..::::.:::::::::.:.: .. .:::::.::::. XP_024 QFNHDTQDEAGLEVHQFWPLVEIQCSPDLRFFLCSMYTPICLPDYHKPLPPCRSVCERAK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 QGCEALMNKFGFQWPERLRCEHFPRHG--AEQICVGQNHSEDGAPALLTTAPPPGL--QP :: :: ..:: ::::. :...: : :: .:. :.:: ::::: . .: XP_024 AGCSPLMRQYGFAWPERMSCDRLPVLGRDAEVLCMDYNRSEA------TTAPPRPFPAKP 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE1 GAGGTPGGPGGGGA-P---PRYATLEHPFHCPRVLKV--PSYLSYKFLGERDCAAPC-EP : ::.:..:: : : ..:: : .:: : : . . .::.:: .: XP_024 TLPGPPGAPASGGECPAGGPFVCKCREPF-VP-ILKESHPLYNKVRTGQVPNCAVPCYQP 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 ARPDGSMFFSQEETRFARLWILTWSVLCCASTFFTVTTYLVDMQRFRYPERPIIFLSGCY . :: .: :: .:: ::::: :: ::.:.:.::.:::::::::::::.:: XP_024 S-------FSADERTFATFWIGLWSVLCFISTSTTVATFLIDMERFRYPERPIIFLSACY 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 TMVSVAYIAGFVL-QERVVCNERFSEDGYRTVVQGTKKEGCTILFMMLYFFSMASSIWWV ::..... .:. . :.:... .. :.: : :::.:...:::.:::::::: XP_024 LCVSLGFLVRLVVGHASVACSREHNHIHYET----TGPALCTIVFLLVYFFGMASSIWWV 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 ILSLTWFLAAGMKWGHEAIEANSQYFHLAAWAVPAVKTITILAMGQIDGDLLSGVCFVGL :::::::::::::::.::: . .:::::::: .:.::.:: ::....::: ..:.:.:: XP_024 ILSLTWFLAAGMKWGNEAIAGYAQYFHLAAWLIPSVKSITALALSSVDGDPVAGICYVGN 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 NSLDPLRGFVLAPLFVYLFIGTSFLLAGFVSLFRIRTIMKHDGTKTEKLERLMVRIGVFS ..:. ::::::.:: .::..:: :::::::::::::...:. ::::.:::.::.:::.:. 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NP_665 KKALLFHASAWGIPGTLTIILLAMNKIEGDNISGVCFVGLYDVDALRYFVLAPLCLYVVV 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 GTSFLLAGFVSLFRIRTIMKHDGTKTEKLERLMVRIGVFSVLYTVPATIVIACYFYEQAF :.:.::::..:: :.: . . . .:: ..:.::::::.:: :: .::.:::::::. NP_665 GVSLLLAGIISLNRVRIEIPLEKENQDKLVKFMIRIGVFSILYLVPLLVVIGCYFYEQAY 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 REHWERSWVSQHCKSLAIPCPAHYTPRMSPDFTVYMIKYLMTLIVGITSGFWIWSGKTLH : :: .:....:. :::: . : ::. ....::::.::::: : ::. : :: NP_665 RGIWETTWIQERCREYHIPCPYQVTQMSRPDLILFLMKYLMALIVGIPSVFWVGSKKTCF 450 460 470 480 490 500 550 560 pF1KE1 SWRKFYTRLTNSRHGETTV : .:. 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