Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1993
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1993, 572 aa
1>>>pF1KE1993 572 - 572 aa - 572 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8357+/-0.00085; mu= 16.5241+/- 0.052
mean_var=75.5656+/-14.823, 0's: 0 Z-trim(107.2): 15 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.147541
statistics sampled from 9517 (9530) to 9517 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 1.580
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS6051.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs109|chr8 ( 572) 3795 817.3 0
CCDS83268.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs109|chr8 ( 677) 3714 800.1 0
CCDS59096.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs109|chr8 ( 536) 3559 767.1 0
CCDS43207.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs109|chr4 ( 572) 3063 661.5 7.9e-190
CCDS43381.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs109|chr5 ( 570) 3062 661.3 9.1e-190
CCDS7665.1 DPYSL4 gene_id:10570|Hs109|chr10 ( 572) 3015 651.3 9.4e-187
CCDS75102.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs109|chr4 ( 570) 2990 646.0 3.7e-185
CCDS33950.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs109|chr4 ( 686) 2990 646.0 4.4e-185
CCDS56387.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs109|chr5 ( 684) 2984 644.8 1.1e-184
CCDS6302.1 DPYS gene_id:1807|Hs109|chr8 ( 519) 2123 461.4 1.2e-129
CCDS1730.1 DPYSL5 gene_id:56896|Hs109|chr2 ( 564) 1967 428.2 1.3e-119
>>CCDS6051.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs109|chr8 (572 aa)
initn: 3795 init1: 3795 opt: 3795 Z-score: 4363.8 bits: 817.3 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 3795; 100.0% identity (100.0% similar) in 572 aa overlap (1-572:1-572)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 HSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 FVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE1 LSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
550 560 570
>>CCDS83268.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs109|chr8 (677 aa)
initn: 3709 init1: 3709 opt: 3714 Z-score: 4269.5 bits: 800.1 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 3714; 98.6% identity (99.1% similar) in 570 aa overlap (5-572:108-677)
10 20 30
pF1KE1 MSYQGKKNIPRIT--SDRLLIKGGKIVNDDQSFY
::. . :. :::::::::::::::::::
CCDS83 PQPPYSRQGRRAGGEPSVESGRKVEIRRASGKEALQNINDQSDRLLIKGGKIVNDDQSFY
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 ADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQG
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 TKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEM
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 EALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRI
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 LDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGT
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 VVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSA
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 HCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVF
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 NLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKI
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 VLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKT
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 VTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
620 630 640 650 660 670
>>CCDS59096.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs109|chr8 (536 aa)
initn: 3559 init1: 3559 opt: 3559 Z-score: 4092.8 bits: 767.1 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 3559; 100.0% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (37-572:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 KNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREW
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIW
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 DKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARS
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQI
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KE1 DDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
520 530
>>CCDS43207.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs109|chr4 (572 aa)
initn: 3063 init1: 3063 opt: 3063 Z-score: 3521.7 bits: 661.5 E(33420): 7.9e-190
Smith-Waterman score: 3063; 76.2% identity (94.4% similar) in 572 aa overlap (1-572:1-572)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
:::::::.::.:::::::::::.:.:::::.:::.:.:::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 HSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAF
..::::::::::.: .: :.::::.::::::::.:::.:::::::::::::::.:::..:
CCDS43 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQ
..:.: ::.::::::::::::. :. :..::.:.::.:.::::: ::::.:: .:..: :
CCDS43 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAI
.::... .. .::. :::::::.::.::.:::..::::::::.::::::.::::: :::
CCDS43 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
:::.. :::.:::::::::.:..:: ::::: .:.::::.:::::::.::::::::::::
CCDS43 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEE
:::::::::::::::.:.:::.:::::::::.:: ..:::::::::::::::::.:: ::
CCDS43 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTI
::.:.:::::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::..:::
CCDS43 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYK
.::.:.:..::::::::::.:::::::::::::.:::...:..: ::.:::: ::. .:.
CCDS43 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFS
:.: :... :.:: ::.::::: :: .::: .::: :::.::.:.: ::.::::::.::
CCDS43 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE1 LSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
::::::::: :::: .:::::::::.::::::
CCDS43 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
550 560 570
>>CCDS43381.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs109|chr5 (570 aa)
initn: 3067 init1: 2862 opt: 3062 Z-score: 3520.6 bits: 661.3 E(33420): 9.1e-190
Smith-Waterman score: 3062; 76.7% identity (94.7% similar) in 571 aa overlap (1-571:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS43 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 HSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAF
...:::::::::::.:::: .:::..:::::::::::::::::::::::::: .:: :.
CCDS43 NGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQ
..::::::.::::::.:::::..:. ....:.. :.::.:::::.::::.:: .:... .
CCDS43 EKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAI
.::... . ..:::::::::::::::.:: :.:..:::::::::::::::.::::: :::
CCDS43 LYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
:::.:::::::.:::::::.:..:.::::::.::.::::::::: ::.::::::::::::
CCDS43 TIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEE
:::::::::::::::..::::. ::::..:::::::.:::::.:::::: :::::::.::
CCDS43 FVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTI
::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::.::::.::::::::.:: .
CCDS43 RMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYK
:::.:.:. ::::::::: ::.::::: ::::.::::.::::.:.::.:: .:: :.:::
CCDS43 SAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFS
::::: ..:.:..::::.::::: ....::: :::.::. ::.. . ::::::::::::
CCDS43 RIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSARGSPTRPN-PPVRNLHQSGFS
490 500 510 520 530
550 560 570
pF1KE1 LSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
:::.:.:... : ...:::::::::.:::::
CCDS43 LSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
540 550 560 570
>>CCDS7665.1 DPYSL4 gene_id:10570|Hs109|chr10 (572 aa)
initn: 3015 init1: 3015 opt: 3015 Z-score: 3466.5 bits: 651.3 E(33420): 9.4e-187
Smith-Waterman score: 3015; 75.7% identity (92.6% similar) in 571 aa overlap (1-571:1-571)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
::.::::.:::::::::::.::.:::::::::::...:::::::::::::::::.:::.:
CCDS76 MSFQGKKSIPRITSDRLLIRGGRIVNDDQSFYADVHVEDGLIKQIGENLIVPGGIKTIDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 HSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAF
:. ::.:::.:::::.::: ::: :::: ::::::::::::::.::: :. :.:::::.
CCDS76 HGLMVLPGGVDVHTRLQMPVLGMTPADDFCQGTKAALAGGTTMILDHVFPDTGVSLLAAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQ
.:::: ::: .::::::::::..::..:.::.:::::..:::::::.::.::: : .: :
CCDS76 EQWRERADSAACCDYSLHVDITRWHESIKEELEALVKEKGVNSFLVFMAYKDRCQCSDSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAI
.::..:.:::.::.::::::::::. :::.:.:.::::::::::::.::::::::: ::.
CCDS76 MYEIFSIIRDLGALAQVHAENGDIVEEEQKRLLELGITGPEGHVLSHPEEVEAEAVYRAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
:::.:.:::::.::::::..:..::::...:.::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TIAKQANCPLYVTKVMSKGAADAIAQAKRRGVVVFGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEE
::::::..::::: : :. ::: :::::::::::::.:::::::::::.:::::::: ::
CCDS76 FVTSPPVNPDPTTADHLTCLLSSGDLQVTGSAHCTFTTAQKAVGKDNFALIPEGTNGIEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTI
:::..:.: :..::::::.:::::::::::.::.::::::.:::::::::::.: ..: :
CCDS76 RMSMVWEKCVASGKMDENEFVAVTSTNAAKIFNFYPRKGRVAVGSDADLVIWNPKATKII
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYK
:::::: ..:::::::.::::.: ::::::...:::: . :: :.::..::: :::::::
CCDS76 SAKTHNLNVEYNIFEGVECRGAPAVVISQGRVALEDGKMFVTPGAGRFVPRKTFPDFVYK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFS
:::::.::::..::::::::::: :: : : . : . . :.: ..::::::::::::
CCDS76 RIKARNRLAEIHGVPRGLYDGPVHEVMVPAKPGSGAPARASCPGKISVPPVRNLHQSGFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE1 LSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
:::.: ::.: :::.:.:.::::::.:::::
CCDS76 LSGSQADDHIARRTAQKIMAPPGGRSNITSLS
550 560 570
>>CCDS75102.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs109|chr4 (570 aa)
initn: 2990 init1: 2990 opt: 2990 Z-score: 3437.8 bits: 646.0 E(33420): 3.7e-185
Smith-Waterman score: 2990; 76.0% identity (94.3% similar) in 559 aa overlap (14-572:12-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
:::::::::.:.:::::.:::.:.:::::::::::::::::::::::
CCDS75 MQKMNNEVVDKSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 HSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAF
..::::::::::.: .: :.::::.::::::::.:::.:::::::::::::::.:::..:
CCDS75 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQ
..:.: ::.::::::::::::. :. :..::.:.::.:.::::: ::::.:: .:..: :
CCDS75 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAI
.::... .. .::. :::::::.::.::.:::..::::::::.::::::.::::: :::
CCDS75 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
:::.. :::.:::::::::.:..:: ::::: .:.::::.:::::::.::::::::::::
CCDS75 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEE
:::::::::::::::.:.:::.:::::::::.:: ..:::::::::::::::::.:: ::
CCDS75 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTI
::.:.:::::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::..:::
CCDS75 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYK
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CCDS75 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFS
:.: :... :.:: ::.::::: :: .::: .::: :::.::.:.: ::.::::::.::
CCDS75 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
480 490 500 510 520 530
550 560 570
pF1KE1 LSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
::::::::: :::: .:::::::::.::::::
CCDS75 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
540 550 560 570
>>CCDS33950.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs109|chr4 (686 aa)
initn: 2990 init1: 2990 opt: 2990 Z-score: 3436.5 bits: 646.0 E(33420): 4.4e-185
Smith-Waterman score: 2990; 76.0% identity (94.3% similar) in 559 aa overlap (14-572:128-686)
10 20 30 40
pF1KE1 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIK
:::::::::.:.:::::.:::.:.::::::
CCDS33 SPGERDERPPTLRIRRPAPRDLPLGRDNGQSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIK
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 QIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTM
:::::::::::::::::..::::::::::.: .: :.::::.::::::::.:::.:::::
CCDS33 QIGENLIVPGGVKTIEANGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTM
160 170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 IIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNS
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CCDS33 IIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNS
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 FLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGH
: ::::.:: .:..: :.::... .. .::. :::::::.::.::.:::..::::::::
CCDS33 FQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGH
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 VLSRPEEVEAEAVNRAITIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASL
.::::::.::::: ::::::.. :::.:::::::::.:..:: ::::: .:.::::.:::
CCDS33 ALSRPEELEAEAVFRAITIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASL
340 350 360 370 380 390
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 GTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAV
::::.:::::::::::::::::::::::::::.:.:::.:::::::::.:: ..::::::
CCDS33 GTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAV
400 410 420 430 440 450
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 GKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAV
:::::::::::.:: ::::.:.:::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS33 GKDNFTLIPEGVNGIEERMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAV
460 470 480 490 500 510
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 GSDADLVIWDPDSVKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTE
:::::.::::::..:::.::.:.:..::::::::::.:::::::::::::.:::...:..
CCDS33 GSDADVVIWDPDKLKTITAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNK
520 530 540 550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSP
: ::.:::: ::. .:.:.: :... :.:: ::.::::: :: .::: .::: :::.::
CCDS33 GMGRFIPRKAFPEHLYQRVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSP
580 590 600 610 620 630
530 540 550 560 570
pF1KE1 AKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
.:.: ::.::::::.::::::::::: :::: .:::::::::.::::::
CCDS33 SKHQPPPIRNLHQSNFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
640 650 660 670 680
>>CCDS56387.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs109|chr5 (684 aa)
initn: 3009 init1: 2776 opt: 2984 Z-score: 3429.7 bits: 644.8 E(33420): 1.1e-184
Smith-Waterman score: 2984; 75.8% identity (94.3% similar) in 562 aa overlap (10-571:124-683)
10 20 30
pF1KE1 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMED
:. :::::::::.::::::::::::::::
CCDS56 ESREPAPASPAPAGVEIRSATGKEVLQNLGPKDKSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMED
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 GLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAG
:::::::.:::::::::::::...:::::::::::.:::: .:::..:::::::::::::
CCDS56 GLIKQIGDNLIVPGGVKTIEANGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAG
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 GTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDH
::::::::::::: .:: :...::::::.::::::.:::::..:. ....:.. :.::.
CCDS56 GTTMIIDHVVPEPESSLTEAYEKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDK
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 GVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITG
:::::.::::.:: .:... ..::... . ..:::::::::::::::.:: :.:..::::
CCDS56 GVNSFMVYMAYKDLYQVSNTELYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITG
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 PEGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPI
:::::::::::.::::: ::::::.:::::::.:::::::.:..:.::::::.::.::::
CCDS56 PEGHVLSRPEELEAEAVFRAITIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPI
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 TASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTA
::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::..::::. ::::..:::::::.::
CCDS56 TASLGIDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTA
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 QKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKG
:::.:::::: :::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::
CCDS56 QKAIGKDNFTAIPEGTNGVEERMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKG
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 RIAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTL
::.::::.::::::::.:: .:::.:.:. ::::::::: ::.::::: ::::.::::.:
CCDS56 RISVGSDSDLVIWDPDAVKIVSAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNL
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 HVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSA
:::.:.::.:: .:: :.:::::::: ..:.:..::::.::::: ....::: :::.::
CCDS56 HVTQGAGRFIPCSPFSDYVYKRIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSA
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 KTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
. ::.. . :::::::::::::::.:.:... : ...:::::::::.:::::
CCDS56 RGSPTRPN-PPVRNLHQSGFSLSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
640 650 660 670 680
>>CCDS6302.1 DPYS gene_id:1807|Hs109|chr8 (519 aa)
initn: 2100 init1: 1927 opt: 2123 Z-score: 2441.0 bits: 461.4 E(33420): 1.2e-129
Smith-Waterman score: 2123; 59.9% identity (83.0% similar) in 519 aa overlap (16-530:6-519)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGG----VK
::::.::..:::: : ::. .:::... .:..:. ::: ..
CCDS63 MAAPSRLLIRGGRVVNDDFSEVADVLVEDGVVRALGHDLLPPGGAPAGLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 TIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSL
...: ...:.:::::.::..:.: .: : ::: :::::::.:::::::: ..:. : ::
CCDS63 VLDAAGKLVLPGGIDTHTHMQFPFMGSRSIDDFHQGTKAALSGGTTMIIDFAIPQKGGSL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQL
. ::. :: ::: : :::::::: .. : ..:::. ::.:.::::: ..::.:: ...
CCDS63 IEAFETWRSWADPKVCCDYSLHVAVTWWSDQVKEEMKILVQDKGVNSFKMFMAYKDLYMV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 TDCQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAV
:: ..::..: ..:::::::::::::.::: ...: ::::::::: : ::: :::::.
CCDS63 TDLELYEAFSRCKEIGAIAQVHAENGDLIAEGAKKMLALGITGPEGHELCRPEAVEAEAT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NRAITIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWA
::::::. .::::::..:::::.:.:::.::. : :::::::.:::::::.:::.:.:
CCDS63 LRAITIASAVNCPLYIVHVMSKSAAKVIADARRDGKVVYGEPIAASLGTDGTHYWNKEWH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTN
.:: : .::: :::.::::: .::. :: .::. .::::: :::.:::.:: ::.:.:
CCDS63 HAAHHVMGPPLRPDPSTPDFLMNLLANDDLTTTGTDNCTFNTCQKALGKDDFTKIPNGVN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 GTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDS
:.:.::::::.:.: .::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::.::::: .
CCDS63 GVEDRMSVIWEKGVHSGKMDENRFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADIVIWDPKG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 VKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPD
..:::::::......:::::: :.: :::.::.::.: : :.. :: :.:..:::::: .
CCDS63 TRTISAKTHHQAVNFNIFEGMVCHGVPLVTISRGKVVYEAGVFSVTAGDGKFIPRKPFAE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 FVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQ
..::::: :.: : :. : : ::.. . :: .. :. ...:: :
CCDS63 YIYKRIKQRDRTCTPTPVERAPYKG---EVATLKSRVTKEDA--TAGTRKQAHP
480 490 500 510
540 550 560 570
pF1KE1 SGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
572 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Oct 24 21:42:05 2019 done: Thu Oct 24 21:42:05 2019
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]