Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2065
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2065, 719 aa
1>>>pF1KE2065 719 - 719 aa - 719 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5452+/-0.000855; mu= 19.0787+/- 0.052
mean_var=74.0596+/-14.916, 0's: 0 Z-trim(106.6): 22 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.149033
statistics sampled from 9196 (9213) to 9196 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 1.820
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS31906.1 OAS2 gene_id:4939|Hs109|chr12 ( 719) 4912 1065.9 0
CCDS41839.1 OAS2 gene_id:4939|Hs109|chr12 ( 687) 4666 1013.0 0
CCDS31905.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 ( 414) 1299 288.9 1.1e-77
CCDS44980.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 ( 364) 1267 282.0 1.1e-75
CCDS81742.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 ( 360) 1264 281.3 1.8e-75
CCDS41838.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 ( 400) 1264 281.4 1.9e-75
CCDS44981.1 OAS3 gene_id:4940|Hs109|chr12 (1087) 1061 238.0 6.1e-62
CCDS44982.1 OAS2 gene_id:4939|Hs109|chr12 ( 172) 996 223.5 2.1e-58
CCDS9211.1 OASL gene_id:8638|Hs109|chr12 ( 514) 796 180.8 4.7e-45
CCDS73536.1 OASL gene_id:8638|Hs109|chr12 ( 384) 436 103.3 7.3e-22
CCDS9212.1 OASL gene_id:8638|Hs109|chr12 ( 255) 263 66.0 8.2e-11
>>CCDS31906.1 OAS2 gene_id:4939|Hs109|chr12 (719 aa)
initn: 4912 init1: 4912 opt: 4912 Z-score: 5703.3 bits: 1065.9 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4912; 100.0% identity (100.0% similar) in 719 aa overlap (1-719:1-719)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGNGESQLSSVPAQKLGWFIQEYLKPYEECQTLIDEMVNTICDVLQEPEQFPLVQGVAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGNGESQLSSVPAQKLGWFIQEYLKPYEECQTLIDEMVNTICDVLQEPEQFPLVQGVAIG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GSYGRKTVLRGNSDGTLVLFFSDLKQFQDQKRSQRDILDKTGDKLKFCLFTKWLKNNFEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSYGRKTVLRGNSDGTLVLFFSDLKQFQDQKRSQRDILDKTGDKLKFCLFTKWLKNNFEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QKSLDGFTIQVFTKNQRISFEVLAAFNALSLNDNPSPWIYRELKRSLDKTNASPGEFAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QKSLDGFTIQVFTKNQRISFEVLAAFNALSLNDNPSPWIYRELKRSLDKTNASPGEFAVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FTELQQKFFDNRPGKLKDLILLIKHWHQQCQKKIKDLPSLSPYALELLTVYAWEQGCRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FTELQQKFFDNRPGKLKDLILLIKHWHQQCQKKIKDLPSLSPYALELLTVYAWEQGCRKD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NFDIAEGVRTVLELIKCQEKLCIYWMVNYNFEDETIRNILLHQLQSARPVILDPVDPTNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NFDIAEGVRTVLELIKCQEKLCIYWMVNYNFEDETIRNILLHQLQSARPVILDPVDPTNN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VSGDKICWQWLKKEAQTWLTSPNLDNELPAPSWNVLPAPLFTTPGHLLDKFIKEFLQPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSGDKICWQWLKKEAQTWLTSPNLDNELPAPSWNVLPAPLFTTPGHLLDKFIKEFLQPNK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 CFLEQIDSAVNIIRTFLKENCFRQSTAKIQIVRGGSTAKGTALKTGSDADLVVFHNSLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CFLEQIDSAVNIIRTFLKENCFRQSTAKIQIVRGGSTAKGTALKTGSDADLVVFHNSLKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 YTSQKNERHKIVKEIHEQLKAFWREKEEELEVSFEPPKWKAPRVLSFSLKSKVLNESVSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YTSQKNERHKIVKEIHEQLKAFWREKEEELEVSFEPPKWKAPRVLSFSLKSKVLNESVSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DVLPAFNALGQLSSGSTPSPEVYAGLIDLYKSSDLPGGEFSTCFTVLQRNFIRSRPTKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DVLPAFNALGQLSSGSTPSPEVYAGLIDLYKSSDLPGGEFSTCFTVLQRNFIRSRPTKLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 DLIRLVKHWYKECERKLKPKGSLPPKYALELLTIYAWEQGSGVPDFDTAEGFRTVLELVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DLIRLVKHWYKECERKLKPKGSLPPKYALELLTIYAWEQGSGVPDFDTAEGFRTVLELVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 QYQQLCIFWKVNYNFEDETVRKFLLSQLQKTRPVILDPAEPTGDVGGGDRWCWHLLAKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QYQQLCIFWKVNYNFEDETVRKFLLSQLQKTRPVILDPAEPTGDVGGGDRWCWHLLAKEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE2 KEWLSSPCFKDGTGNPIPPWKVPTMQTPGSCGARIHPIVNEMFSSRSHRILNNNSKRNF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KEWLSSPCFKDGTGNPIPPWKVPTMQTPGSCGARIHPIVNEMFSSRSHRILNNNSKRNF
670 680 690 700 710
>>CCDS41839.1 OAS2 gene_id:4939|Hs109|chr12 (687 aa)
initn: 4666 init1: 4666 opt: 4666 Z-score: 5417.7 bits: 1013.0 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4666; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGNGESQLSSVPAQKLGWFIQEYLKPYEECQTLIDEMVNTICDVLQEPEQFPLVQGVAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MGNGESQLSSVPAQKLGWFIQEYLKPYEECQTLIDEMVNTICDVLQEPEQFPLVQGVAIG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GSYGRKTVLRGNSDGTLVLFFSDLKQFQDQKRSQRDILDKTGDKLKFCLFTKWLKNNFEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GSYGRKTVLRGNSDGTLVLFFSDLKQFQDQKRSQRDILDKTGDKLKFCLFTKWLKNNFEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QKSLDGFTIQVFTKNQRISFEVLAAFNALSLNDNPSPWIYRELKRSLDKTNASPGEFAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QKSLDGFTIQVFTKNQRISFEVLAAFNALSLNDNPSPWIYRELKRSLDKTNASPGEFAVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FTELQQKFFDNRPGKLKDLILLIKHWHQQCQKKIKDLPSLSPYALELLTVYAWEQGCRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FTELQQKFFDNRPGKLKDLILLIKHWHQQCQKKIKDLPSLSPYALELLTVYAWEQGCRKD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NFDIAEGVRTVLELIKCQEKLCIYWMVNYNFEDETIRNILLHQLQSARPVILDPVDPTNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NFDIAEGVRTVLELIKCQEKLCIYWMVNYNFEDETIRNILLHQLQSARPVILDPVDPTNN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VSGDKICWQWLKKEAQTWLTSPNLDNELPAPSWNVLPAPLFTTPGHLLDKFIKEFLQPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VSGDKICWQWLKKEAQTWLTSPNLDNELPAPSWNVLPAPLFTTPGHLLDKFIKEFLQPNK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 CFLEQIDSAVNIIRTFLKENCFRQSTAKIQIVRGGSTAKGTALKTGSDADLVVFHNSLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CFLEQIDSAVNIIRTFLKENCFRQSTAKIQIVRGGSTAKGTALKTGSDADLVVFHNSLKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 YTSQKNERHKIVKEIHEQLKAFWREKEEELEVSFEPPKWKAPRVLSFSLKSKVLNESVSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YTSQKNERHKIVKEIHEQLKAFWREKEEELEVSFEPPKWKAPRVLSFSLKSKVLNESVSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DVLPAFNALGQLSSGSTPSPEVYAGLIDLYKSSDLPGGEFSTCFTVLQRNFIRSRPTKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DVLPAFNALGQLSSGSTPSPEVYAGLIDLYKSSDLPGGEFSTCFTVLQRNFIRSRPTKLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 DLIRLVKHWYKECERKLKPKGSLPPKYALELLTIYAWEQGSGVPDFDTAEGFRTVLELVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DLIRLVKHWYKECERKLKPKGSLPPKYALELLTIYAWEQGSGVPDFDTAEGFRTVLELVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 QYQQLCIFWKVNYNFEDETVRKFLLSQLQKTRPVILDPAEPTGDVGGGDRWCWHLLAKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QYQQLCIFWKVNYNFEDETVRKFLLSQLQKTRPVILDPAEPTGDVGGGDRWCWHLLAKEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE2 KEWLSSPCFKDGTGNPIPPWKVPTMQTPGSCGARIHPIVNEMFSSRSHRILNNNSKRNF
:::::::::::::::::::::::
CCDS41 KEWLSSPCFKDGTGNPIPPWKVPVKVI
670 680
>>CCDS31905.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 (414 aa)
initn: 1144 init1: 563 opt: 1299 Z-score: 1508.5 bits: 288.9 E(33420): 1.1e-77
Smith-Waterman score: 1299; 53.6% identity (77.3% similar) in 362 aa overlap (340-697:4-356)
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 WLKKEAQTWLTSPNLDNELPAPSWNVLPAPLFTTPGHLLDKFIKEFLQPNKCFLEQIDSA
: .::.. :::::...: :. :: ::. :
CCDS31 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHA
10 20 30
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VNIIRTFLKENCFRQSTAKI---QIVRGGSTAKGTALKTGSDADLVVFHNSLKSYTSQKN
..:: :::: ::: :. . ..:.:::..:::.:. :::::::: . : .. .: :
CCDS31 IDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVKGGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLN
40 50 60 70 80 90
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ERHKIVKEIHEQLKAFWREKEEELEVSFEPPKWKAPRVLSFSLKSKVLNESVSFDVLPAF
.: ....::..::.: ::. .. . :.: ::.::: :.: :.:.: :::::::
CCDS31 RRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFEVQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAF
100 110 120 130 140 150
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NALGQLSSGSTPSPEVYAGLIDLYKSSDLPG-GEFSTCFTVLQRNFIRSRPTKLKDLIRL
.:::::..: :.:..:. ::. . .:: :::::::: :::.:...::::::.::::
CCDS31 DALGQLTGGYKPNPQIYVKLIE--ECTDLQKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRL
160 170 180 190 200 210
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VKHWYKECERKLKPKGSLPPKYALELLTIYAWEQGSGVPDFDTAEGFRTVLELVTQYQQL
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CCDS31 VKHWYQNCKKKL---GKLPPQYALELLTVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQL
220 230 240 250 260
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 CIFWKVNYNFEDETVRKFLLSQLQKTRPVILDPAEPTGDVGGGDRWCWHLLAKEAKEWLS
::.: :.:.. ..:.: :: : ::::::::.:::..:::: :. ::.::. ::.
CCDS31 CIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILDPADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLN
270 280 290 300 310 320
670 680 690 700 710
pF1KE2 SPCFKDGTGNPIPPWKVPTMQTPGSCGARIHPIVNEMFSSRSHRILNNNSKRNF
::::. :.:. : . :..:::: :::
CCDS31 YPCFKNWDGSPVSSWILLTQHTPGS----IHPTGRRGLDLHHPLNASASWGKGLQCYLDQ
330 340 350 360 370 380
CCDS31 FLHFQVGLLIQRGQSSSVSWCIIQDRTQVS
390 400 410
>>CCDS44980.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 (364 aa)
initn: 1316 init1: 525 opt: 1267 Z-score: 1472.1 bits: 282.0 E(33420): 1.1e-75
Smith-Waterman score: 1267; 53.0% identity (77.5% similar) in 355 aa overlap (340-690:4-352)
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 WLKKEAQTWLTSPNLDNELPAPSWNVLPAPLFTTPGHLLDKFIKEFLQPNKCFLEQIDSA
: .::.. :::::...: :. :: ::. :
CCDS44 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHA
10 20 30
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VNIIRTFLKENCFRQSTAKI---QIVRGGSTAKGTALKTGSDADLVVFHNSLKSYTSQKN
..:: :::: ::: :. . ..:.:::..:::.:. :::::::: . : .. .: :
CCDS44 IDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVKGGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLN
40 50 60 70 80 90
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ERHKIVKEIHEQLKAFWREKEEELEVSFEPPKWKAPRVLSFSLKSKVLNESVSFDVLPAF
.: ....::..::.: ::. .. . :.: ::.::: :.: :.:.: :::::::
CCDS44 RRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFEVQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAF
100 110 120 130 140 150
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NALGQLSSGSTPSPEVYAGLIDLYKSSDLPG-GEFSTCFTVLQRNFIRSRPTKLKDLIRL
.:::::..: :.:..:. ::. . .:: :::::::: :::.:...::::::.::::
CCDS44 DALGQLTGGYKPNPQIYVKLIE--ECTDLQKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRL
160 170 180 190 200 210
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VKHWYKECERKLKPKGSLPPKYALELLTIYAWEQGSGVPDFDTAEGFRTVLELVTQYQQL
:::::..:..:: :.:::.:::::::.::::.:: :.::.::::::::: .::::
CCDS44 VKHWYQNCKKKL---GKLPPQYALELLTVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQL
220 230 240 250 260
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 CIFWKVNYNFEDETVRKFLLSQLQKTRPVILDPAEPTGDVGGGDRWCWHLLAKEAKEWLS
::.: :.:.. ..:.: :: : ::::::::.:::..:::: :. ::.::. ::.
CCDS44 CIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILDPADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLN
270 280 290 300 310 320
670 680 690 700 710
pF1KE2 SPCFKDGTGNPIPPWKVPTMQTPGSCGARIHPIVNEMFSSRSHRILNNNSKRNF
::::. :.:. : . .. :.:
CCDS44 YPCFKNWDGSPVSSW-ILLVRPPASSLPFIPAPLHEA
330 340 350 360
>>CCDS81742.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 (360 aa)
initn: 1316 init1: 525 opt: 1264 Z-score: 1468.7 bits: 281.3 E(33420): 1.8e-75
Smith-Waterman score: 1264; 53.9% identity (78.0% similar) in 345 aa overlap (340-680:4-343)
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 WLKKEAQTWLTSPNLDNELPAPSWNVLPAPLFTTPGHLLDKFIKEFLQPNKCFLEQIDSA
: .::.. :::::...: :. :: ::. :
CCDS81 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHA
10 20 30
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VNIIRTFLKENCFRQSTAKI---QIVRGGSTAKGTALKTGSDADLVVFHNSLKSYTSQKN
..:: :::: ::: :. . ..:.:::..:::.:. :::::::: . : .. .: :
CCDS81 IDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVKGGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLN
40 50 60 70 80 90
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ERHKIVKEIHEQLKAFWREKEEELEVSFEPPKWKAPRVLSFSLKSKVLNESVSFDVLPAF
.: ....::..::.: ::. .. . :.: ::.::: :.: :.:.: :::::::
CCDS81 RRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFEVQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAF
100 110 120 130 140 150
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NALGQLSSGSTPSPEVYAGLIDLYKSSDLPG-GEFSTCFTVLQRNFIRSRPTKLKDLIRL
.:::::..: :.:..:. ::. . .:: :::::::: :::.:...::::::.::::
CCDS81 DALGQLTGGYKPNPQIYVKLIE--ECTDLQKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRL
160 170 180 190 200 210
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VKHWYKECERKLKPKGSLPPKYALELLTIYAWEQGSGVPDFDTAEGFRTVLELVTQYQQL
:::::..:..:: :.:::.:::::::.::::.:: :.::.::::::::: .::::
CCDS81 VKHWYQNCKKKL---GKLPPQYALELLTVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQL
220 230 240 250 260
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 CIFWKVNYNFEDETVRKFLLSQLQKTRPVILDPAEPTGDVGGGDRWCWHLLAKEAKEWLS
::.: :.:.. ..:.: :: : ::::::::.:::..:::: :. ::.::. ::.
CCDS81 CIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILDPADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLN
270 280 290 300 310 320
670 680 690 700 710
pF1KE2 SPCFKDGTGNPIPPWKVPTMQTPGSCGARIHPIVNEMFSSRSHRILNNNSKRNF
::::. :.:. :
CCDS81 YPCFKNWDGSPVSSWILLVNLTLVGRRNYTNN
330 340 350 360
>>CCDS41838.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 (400 aa)
initn: 1316 init1: 525 opt: 1264 Z-score: 1468.0 bits: 281.4 E(33420): 1.9e-75
Smith-Waterman score: 1264; 53.9% identity (78.0% similar) in 345 aa overlap (340-680:4-343)
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 WLKKEAQTWLTSPNLDNELPAPSWNVLPAPLFTTPGHLLDKFIKEFLQPNKCFLEQIDSA
: .::.. :::::...: :. :: ::. :
CCDS41 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHA
10 20 30
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VNIIRTFLKENCFRQSTAKI---QIVRGGSTAKGTALKTGSDADLVVFHNSLKSYTSQKN
..:: :::: ::: :. . ..:.:::..:::.:. :::::::: . : .. .: :
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.: ....::..::.: ::. .. . :.: ::.::: :.: :.:.: :::::::
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.:::::..: :.:..:. ::. . .:: :::::::: :::.:...::::::.::::
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CCDS41 YPCFKNWDGSPVSSWILLAESNSADDETDDPRRYQKYGYIGTHEYPHFSHRPSTLQAAST
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10 20 30
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CCDS44 IQPWPVKAAV
1080
>--
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CCDS44 HPCFLRGMGDPVQSWKGPGLPRAG-CSGLGHPIQLDPNQKTPENSKSLNAVYPRAGSKPP
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CCDS44 SCPAPGPTGAASIVPSVPGMALDLSQIPTKELDRFIQDHLKPSPQFQEQVKKAIDIILRC
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CCDS44 MGNGESQLSSVPAQKLGWFIQEYLKPYEECQTLIDEMVNTICDVLQEPEQFPLVQGVAIG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSYGRKTVLRGNSDGTLVLFFSDLKQFQDQKRSQRDILDKTGDKLKFCLFTKWLKNNFEI
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CCDS44 QKSLDGFTIQVFTKNQRISFEVLAAFNALSKHC----WV------SGEKSQRSGCQTALC
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CCDS44 NL
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: .. ::... :. :.. ...:. :: ..::.:.. ...::.: . ..:.
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CCDS92 SLLRLVKHWYQQYVKARSPRANLPPLYALELLTIYAWEMGTEEDENFMLDEGFTTVMDLL
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CCDS92 ASQCLKQDCCYDNRENPISSWNVKRARDIHLTVEQRGYPDFNLIVNPYEPIRKVKEKIRR
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CCDS73 MALMQELYSTPASRLDSFVAQWLQPHREWKEEVLDA
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CCDS73 VRTVEEFLRQEHFQGKRGLDQDVRVLKVVKVGSFGNGTVLRSTREVELVAFLSCFHSF--
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:. .:. :.. . . :..: .... :....: . ..: .: :..... : ..
CCDS73 QEAAKHH--KDVLRLIWKTMW-QSQDLLDLGLEDLRMEQRVPDALVFTIQTRGTAEPITV
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pF1KE2 DVLPAFNALGQLSSGSTPSPEVYAGLIDLYKSSDLPGGEFSTCFTVLQRNFIRSRPTKLK
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CCDS73 TIVPAYRALGPSLPNSQPPPEVYVSLI---KACGGPGN-FCPSFSELQRNFVKHRPTKLK
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CCDS73 SLLRLVKHWYQQRARDIHLTVEQRGYPDFNLIVNPYEPIRKVKEKIRRTRGYSGLQRLSF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]