Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2078
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2078, 748 aa
1>>>pF1KE2078 748 - 748 aa - 748 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6528+/-0.00102; mu= 15.8859+/- 0.062
mean_var=153.4946+/-28.175, 0's: 0 Z-trim(110.6): 89 B-trim: 40 in 1/50
Lambda= 0.103521
statistics sampled from 11678 (11768) to 11678 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.361), width: 16
Scan time: 2.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10167.1 ADAM10 gene_id:102|Hs108|chr15 ( 748) 5277 800.6 0
CCDS1665.1 ADAM17 gene_id:6868|Hs108|chr2 ( 824) 727 121.1 7.2e-27
CCDS60282.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 633) 397 71.7 4.1e-12
CCDS1088.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 772) 397 71.8 4.7e-12
CCDS58032.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 796) 397 71.8 4.8e-12
CCDS1084.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 814) 397 71.8 4.9e-12
CCDS58031.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 824) 397 71.8 4.9e-12
CCDS1086.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 838) 397 71.8 5e-12
CCDS1085.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 839) 397 71.8 5e-12
CCDS44236.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 862) 397 71.8 5.1e-12
CCDS1087.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 863) 397 71.8 5.1e-12
CCDS63219.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 ( 812) 373 68.2 5.9e-11
CCDS13058.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 ( 813) 373 68.2 5.9e-11
CCDS83287.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 ( 715) 368 67.4 9e-11
>>CCDS10167.1 ADAM10 gene_id:102|Hs108|chr15 (748 aa)
initn: 5277 init1: 5277 opt: 5277 Z-score: 4268.9 bits: 800.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5277; 100.0% identity (100.0% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVLLRVLILLLSWAAGMGGQYGNPLNKYIRHYEGLSYNVDSLHQKHQRAKRAVSHEDQFL
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CCDS10 MVLLRVLILLLSWAAGMGGQYGNPLNKYIRHYEGLSYNVDSLHQKHQRAKRAVSHEDQFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RLDFHAHGRHFNLRMKRDTSLFSDEFKVETSNKVLDYDTSHIYTGHIYGEEGSFSHGSVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RLDFHAHGRHFNLRMKRDTSLFSDEFKVETSNKVLDYDTSHIYTGHIYGEEGSFSHGSVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DGRFEGFIQTRGGTFYVEPAERYIKDRTLPFHSVIYHEDDINYPHKYGPQGGCADHSVFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DGRFEGFIQTRGGTFYVEPAERYIKDRTLPFHSVIYHEDDINYPHKYGPQGGCADHSVFE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RMRKYQMTGVEEVTQIPQEEHAANGPELLRKKRTTSAEKNTCQLYIQTDHLFFKYYGTRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RMRKYQMTGVEEVTQIPQEEHAANGPELLRKKRTTSAEKNTCQLYIQTDHLFFKYYGTRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AVIAQISSHVKAIDTIYQTTDFSGIRNISFMVKRIRINTTADEKDPTNPFRFPNIGVEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AVIAQISSHVKAIDTIYQTTDFSGIRNISFMVKRIRINTTADEKDPTNPFRFPNIGVEKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LELNSEQNHDDYCLAYVFTDRDFDDGVLGLAWVGAPSGSSGGICEKSKLYSDGKKKSLNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LELNSEQNHDDYCLAYVFTDRDFDDGVLGLAWVGAPSGSSGGICEKSKLYSDGKKKSLNT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GIITVQNYGSHVPPKVSHITFAHEVGHNFGSPHDSGTECTPGESKNLGQKENGNYIMYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GIITVQNYGSHVPPKVSHITFAHEVGHNFGSPHDSGTECTPGESKNLGQKENGNYIMYAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ATSGDKLNNNKFSLCSIRNISQVLEKKRNNCFVESGQPICGNGMVEQGEECDCGYSDQCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATSGDKLNNNKFSLCSIRNISQVLEKKRNNCFVESGQPICGNGMVEQGEECDCGYSDQCK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DECCFDANQPEGRKCKLKPGKQCSPSQGPCCTAQCAFKSKSEKCRDDSDCAREGICNGFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DECCFDANQPEGRKCKLKPGKQCSPSQGPCCTAQCAFKSKSEKCRDDSDCAREGICNGFT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ALCPASDPKPNFTDCNRHTQVCINGQCAGSICEKYGLEECTCASSDGKDDKELCHVCCMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALCPASDPKPNFTDCNRHTQVCINGQCAGSICEKYGLEECTCASSDGKDDKELCHVCCMK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KMDPSTCASTGSVQWSRHFSGRTITLQPGSPCNDFRGYCDVFMRCRLVDADGPLARLKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KMDPSTCASTGSVQWSRHFSGRTITLQPGSPCNDFRGYCDVFMRCRLVDADGPLARLKKA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 IFSPELYENIAEWIVAHWWAVLLMGIALIMLMAGFIKICSVHTPSSNPKLPPPKPLPGTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IFSPELYENIAEWIVAHWWAVLLMGIALIMLMAGFIKICSVHTPSSNPKLPPPKPLPGTL
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KE2 KRRRPPQPIQQPQRQRPRESYQMGHMRR
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KRRRPPQPIQQPQRQRPRESYQMGHMRR
730 740
>>CCDS1665.1 ADAM17 gene_id:6868|Hs108|chr2 (824 aa)
initn: 739 init1: 240 opt: 727 Z-score: 595.9 bits: 121.1 E(32554): 7.2e-27
Smith-Waterman score: 979; 28.0% identity (56.2% similar) in 778 aa overlap (16-742:25-757)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MVLLRVLILLLSWAAGMGG-QYGNPLNKYIRHYEGLSYNVDSLHQKHQRAK
:.: : . :.. . :. :: . . :. ..:
CCDS16 MRQSLLFLTSVVPFVLAPRPPDDPGFGPHQRLEKLDSLLSDYDILSLSNIQQHSVRKRDL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE2 RAVSHEDQFLRLDFHAHGRHFNLRMKRDTSLFSDEFKV---ETSNKVLDYDTS--HIYTG
.. .: . .: : : :::.: . .: ::..::: . .:. .: .. ..::
CCDS16 QTSTHVETLL--TFSALKRHFKLYLTSSTERFSQNFKVVVVDGKNES-EYTVKWQDFFTG
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 HIYGEEGSFSHGSVIDGRFEGFIQTRGGTFYVEPAERYIKDRTLPFHSVIYHEDDINYPH
:. :: : . . : :.: :. . .:: :...: : . ..:. .::.
CCDS16 HVVGEPDSRVLAHIRDDDVIIRINTDGAEYNIEPLWRFVND-TKDKRMLVYKSEDIKNVS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 KYGPQGGCADHSVFERMRKYQMTGVEEVTQIPQEEHAANGPELLRKKRTTSAEKNTCQLY
. :. . .. . .. : . : :: . . .... . ::::.:
CCDS16 RLQSPKVCG----YLKVDNEELLPKGLVDREPPEELV----HRVKRRADPDPMKNTCKLL
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 IQTDHLFFKYYGTRE--AVIAQISSHVKAIDTIYQTT--DFSGIRNISFMVKRIRINTTA
. .:: :..:.: : .. . . .: ::..: : .:... ......::: .
CCDS16 VVADHRFYRYMGRGEESTTTNYLIELIDRVDDIYRNTSWDNAGFKGYGIQIEQIRILKSP
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320
pF1KE2 DEKDPTNPFR-----FPN-----IGVEKFLE---LNSEQNHDDYCLAYVFTDRDFDDGVL
.: : . .:: :. .:: .. .. . :::..:: .::: :.:
CCDS16 QEVKPGEKHYNMAKSYPNEEKDAWDVKMLLEQFSFDIAEEASKVCLAHLFTYQDFDMGTL
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 GLAWVGAPSGSS-GGICEKSKLYSDGKKK-SLNTGIITVQNYGSHVPPKVSHITFAHEVG
:::.::.: ..: ::.: :. :::. ::.:. ...:::. . : . .. .::.:
CCDS16 GLAYVGSPRANSHGGVCPKAYYSPVGKKNIYLNSGLTSTKNYGKTILTKEADLVTTHELG
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 HNFGSPHDSG--TECTPGESKNLGQKENGNYIMYARATSGDKLNNNKFSLCSIRNISQVL
::::. :: .::.:.:.. .:.:.:: :.:::. ::. :: :: ..: ...
CCDS16 HNFGAEHDPDGLAECAPNEDQ------GGKYVMYPIAVSGDHENNKMFSNCSKQSIYKTI
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 EKKRNNCFVESGQPICGNGMVEQGEECDCGYSDQCKDECCFDANQPEGRKCKLKPGKQCS
:.: ..:: : .. .:::. :..::::: : .: :: . : :: : :::
CCDS16 ESKAQECFQERSNKVCGNSRVDEGEECDPGIMYLNNDTCC-------NSDCTLKEGVQCS
470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 PSQGPCCTAQCAFKSKSEKCRD--DSDCAREGICNGFTALCPASDPKPNFTDCNRHTQVC
..::: .: :.. ..::.. .. : . :.: .. :: . : : . :
CCDS16 DRNSPCCK-NCQFETAQKKCQEAINATCKGVSYCTGNSSECPPPGNAEDDTVCLDLGK-C
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 INGQCAGSICEK-YGLEECTCASSDGKDDKELCHVCCMKKMDPSTCASTGSVQWSRHFSG
.:.: .::. :: :.: .:.. :.::: . .. . :. ... . :
CCDS16 KDGKCI-PFCEREQQLESCACNETDNS-----CKVCC-RDLS-GRCVPYVDAEQKNLF--
580 590 600 610 620
630 640 650 660 670
pF1KE2 RTITLQPGSPCNDFRGYCDVFMRC--RLVDAD----GPLARLKKAIFSPELYENIAEWIV
:. :.::. :.::. .: :. :. . .:. :. : .::. ..
CCDS16 ----LRKGKPCT--VGFCDMNGKCEKRVQDVIERFWDFIDQLSINTFGKFLADNIVGSVL
630 640 650 660 670
680 690 700 710 720
pF1KE2 AH---WW---AVLLMGI---------ALIMLMAGFIKICSVHTPSSNPKLPPPKPLPGTL
. .: ..:. . .: .. . ... : :.. .. : : : :
CCDS16 VFSLIFWIPFSILVHCVDKKLDKQYESLSLFHPSNVEMLS-SMDSASVRIIKPFPAPQTP
680 690 700 710 720 730
730 740
pF1KE2 KRRRPPQPIQQPQRQRPRESYQMGHMRR
: .: :. :. ..:
CCDS16 GRLQPA-PVIPSAPAAPKLDHQRMDTIQEDPSTDSHMDEDGFEKDPFPNSSTAAKSFEDL
740 750 760 770 780 790
>>CCDS60282.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 (633 aa)
initn: 294 init1: 145 opt: 397 Z-score: 330.9 bits: 71.7 E(32554): 4.1e-12
Smith-Waterman score: 437; 27.8% identity (50.3% similar) in 431 aa overlap (162-568:134-509)
140 150 160 170 180
pF1KE2 GGTFYVEPAERYIKDRTLPFHSVIYHEDDINYPHKYGPQGGCADHSVFERMRKYQMTG--
.: . :: : .. :.. .. :
CCDS60 QGRVRGYAGSWVSICTCSGLRGLVVLTPERSYTLEQGP-GDLQGPPIISRIQDLHLPGHT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 -----VEEV-TQIPQEEHAANGPELLRKKRTTSAEKNTCQLYIQTDHLFFKYYGTREAVI
: : :: : : : : . .:..: . .: .: .: : .:: . : . ..
CCDS60 CALSWRESVHTQKPPE-HPL-GQRHIRRRRDVVTETKTVELVIVADHSEAQKYRDFQHLL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AQISSHVKAIDTIYQTTDFSGIRNISFMVKRIRINTTAD--EKDPTNPFRFPNIGVEKFL
. . .::... :. . .. : : : .:. : . .:.::
CCDS60 NRTLEVALLLDTFFRPL------NVRVALVGLEAWTQRDLVEISPN-----PAVTLENFL
230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE2 E-----LNSEQNHDDYCLAYVFTDRDFDDGVLGLAWVGAPSGSSGGICEKSKLYSDGKKK
. : . ::. : . : .:. ..:.: ...:: : .: : .
CCDS60 HWRRAHLLPRLPHDS---AQLVTGTSFSGPTVGMAI-------QNSIC--SPDFSGGVNM
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SLNTGIITVQNYGSHVPPKVSHITFAHEVGHNFGSPHD-SGTECT-PGESKNLGQKENGN
. .:.:. : . ..:::.::..: :: :. : :: . .
CCDS60 DHSTSILGVAS------------SIAHELGHSLGLDHDLPGNSCPCPGPAPA------KT
320 330 340 350
420 430 440 450 460
pF1KE2 YIMYARATSGDKLNNNKFSLCSIRNISQVLEKKRNNCFVE---SGQPI---CGNGMVEQG
:: : : : : . .:: :: : . ..: ..:. : : :. ::: .:: :
CCDS60 CIMEA---STDFLPGLNFSNCSRRALEKALLDGMGSCLFERLPSLPPMAAFCGNMFVEPG
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 EECDCGYSDQCKDECCFDANQPEGRKCKLKPGKQCSPSQGPCCTAQCAFKSKSEKCRDD-
:.::::. :.: : :: .. :.:.:: ::. :.:::: .: .. .. .::
CCDS60 EQCDCGFLDDCVDPCC------DSLTCQLRPGAQCA-SDGPCCQ-NCQLRPSGWQCRPTR
420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 SDCAREGICNGFTALCPASDPKPNFTDCNRHTQVCINGQCAGSICEKYGLEECTCASSDG
.:: .: : .. :: . . : ::..:.::
CCDS60 GDCDLPEFCPGDSSQCPPDVSLGDGEPCAGGQAVCMHGRCASYAQQCQSLWGPGAQPAAP
470 480 490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 KDDKELCHVCCMKKMDPSTCASTGSVQWSRHFSGRTITLQPGSPCNDFRGYCDVFMRCRL
CCDS60 LCLQTANTRGNAFGSCGRNPSGSYVSCTPRDAICGQLQCQTGRTQPLLGSIRDLLWETID
530 540 550 560 570 580
>>CCDS1088.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 (772 aa)
initn: 294 init1: 145 opt: 397 Z-score: 329.8 bits: 71.8 E(32554): 4.7e-12
Smith-Waterman score: 437; 27.8% identity (50.3% similar) in 431 aa overlap (162-568:150-525)
140 150 160 170 180
pF1KE2 GGTFYVEPAERYIKDRTLPFHSVIYHEDDINYPHKYGPQGGCADHSVFERMRKYQMTG--
.: . :: : .. :.. .. :
CCDS10 QGRVRGYAGSWVSICTCSGLRGLVVLTPERSYTLEQGP-GDLQGPPIISRIQDLHLPGHT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 -----VEEV-TQIPQEEHAANGPELLRKKRTTSAEKNTCQLYIQTDHLFFKYYGTREAVI
: : :: : : : : . .:..: . .: .: .: : .:: . : . ..
CCDS10 CALSWRESVHTQKPPE-HPL-GQRHIRRRRDVVTETKTVELVIVADHSEAQKYRDFQHLL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AQISSHVKAIDTIYQTTDFSGIRNISFMVKRIRINTTAD--EKDPTNPFRFPNIGVEKFL
. . .::... :. . .. : : : .:. : . .:.::
CCDS10 NRTLEVALLLDTFFRPL------NVRVALVGLEAWTQRDLVEISPN-----PAVTLENFL
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE2 E-----LNSEQNHDDYCLAYVFTDRDFDDGVLGLAWVGAPSGSSGGICEKSKLYSDGKKK
. : . ::. : . : .:. ..:.: ...:: : .: : .
CCDS10 HWRRAHLLPRLPHDS---AQLVTGTSFSGPTVGMAI-------QNSIC--SPDFSGGVNM
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SLNTGIITVQNYGSHVPPKVSHITFAHEVGHNFGSPHD-SGTECT-PGESKNLGQKENGN
. .:.:. : . ..:::.::..: :: :. : :: . .
CCDS10 DHSTSILGVAS------------SIAHELGHSLGLDHDLPGNSCPCPGPAPA------KT
340 350 360 370
420 430 440 450 460
pF1KE2 YIMYARATSGDKLNNNKFSLCSIRNISQVLEKKRNNCFVE---SGQPI---CGNGMVEQG
:: : : : : . .:: :: : . ..: ..:. : : :. ::: .:: :
CCDS10 CIMEA---STDFLPGLNFSNCSRRALEKALLDGMGSCLFERLPSLPPMAAFCGNMFVEPG
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 EECDCGYSDQCKDECCFDANQPEGRKCKLKPGKQCSPSQGPCCTAQCAFKSKSEKCRDD-
:.::::. :.: : :: .. :.:.:: ::. :.:::: .: .. .. .::
CCDS10 EQCDCGFLDDCVDPCC------DSLTCQLRPGAQCA-SDGPCCQ-NCQLRPSGWQCRPTR
440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 SDCAREGICNGFTALCPASDPKPNFTDCNRHTQVCINGQCAGSICEKYGLEECTCASSDG
.:: .: : .. :: . . : ::..:.::
CCDS10 GDCDLPEFCPGDSSQCPPDVSLGDGEPCAGGQAVCMHGRCASYAQQCQSLWGPGAQPAAP
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 KDDKELCHVCCMKKMDPSTCASTGSVQWSRHFSGRTITLQPGSPCNDFRGYCDVFMRCRL
CCDS10 LCLQTANTRGNAFGSCGRNPSGSYVSCTPRDAICGQLQCQTGRTQPLLGSIRDLLWETID
550 560 570 580 590 600
>>CCDS58032.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 (796 aa)
initn: 294 init1: 145 opt: 397 Z-score: 329.7 bits: 71.8 E(32554): 4.8e-12
Smith-Waterman score: 437; 27.8% identity (50.3% similar) in 431 aa overlap (162-568:150-525)
140 150 160 170 180
pF1KE2 GGTFYVEPAERYIKDRTLPFHSVIYHEDDINYPHKYGPQGGCADHSVFERMRKYQMTG--
.: . :: : .. :.. .. :
CCDS58 QGRVRGYAGSWVSICTCSGLRGLVVLTPERSYTLEQGP-GDLQGPPIISRIQDLHLPGHT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
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