FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2110, 906 aa 1>>>pF1KE2110 906 - 906 aa - 906 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8785+/-0.00104; mu= -7.2094+/- 0.063 mean_var=406.8637+/-82.615, 0's: 0 Z-trim(115.6): 19 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.063584 statistics sampled from 16322 (16335) to 16322 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.489), width: 16 Scan time: 2.480 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS8418.1 CBL gene_id:867|Hs109|chr11 ( 906) 6275 590.4 5.2e-168 CCDS2948.1 CBLB gene_id:868|Hs109|chr3 ( 982) 2585 251.9 4.4e-66 CCDS87116.1 CBLB gene_id:868|Hs109|chr3 (1010) 2585 251.9 4.5e-66 CCDS12643.1 CBLC gene_id:23624|Hs109|chr19 ( 474) 1367 139.9 1.1e-32 CCDS46109.1 CBLC gene_id:23624|Hs109|chr19 ( 428) 672 76.1 1.6e-13 >>CCDS8418.1 CBL gene_id:867|Hs109|chr11 (906 aa) initn: 6275 init1: 6275 opt: 6275 Z-score: 3130.0 bits: 590.4 E(33420): 5.2e-168 Smith-Waterman score: 6275; 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CCDS87 LDLIQKGIVRSPCGSPTGSPKSSPCMVRKQDKPLPAPPPPLRD-PPPPPPERPPPIPPDN 540 550 560 570 580 590 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 RPQRRPLPCTPGDCPSRDKLPPVPSSRLGDSWLPRPI----PKVPVSAPSSSDPWTG--- : .:. . :::: ::.: ..: :: . : . ..: : CCDS87 RLSRHIHHVE--SVPSRD--PPMPL----EAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGEGSPKPGITA 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 pF1KE2 -RELTNRHSLPFSLPSQMEP--RPDVPRLGS-TFSLDT--SMSMNSSPLVGPECDHPKIK ....::: : : :. : :.: :. .:: : .. : ..: . CCDS87 SSNVNGRHSRVGSDPVLMRKHRRHDLPLEGAKVFSNGHLGSEEYDVPPRLSPPPPVTTLL 650 660 670 680 690 700 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 PSSSANAIYSLAARPLPVPKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRACDCDQQ :: . .. : : : : :.: :: :::.:. :. :: :. . CCDS87 PSIKCTGPL---ANSLSEKTRDPVE----EDDDEYKIPSSHPVS-LN-SQPSHCHNVKPP 710 720 730 740 750 760 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 IDSCTY-EAMYNIQSQAPSITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPPVPAV . :: . : : ...:: ..:.. . .. . : .: . ::: CCDS87 VRSCDNGHCMLN-GTHGPSSEKKSNIPDLSIYL------------KGDVFDSASDPVPLP 770 780 790 800 790 800 810 820 830 pF1KE2 LARRTLSDISNASSSFGWLSLDGD----PTTNVTEGSQVPERPPKPFPRR---INSERKA :: : . .::.. : : : . . . : :: : : : :. . CCDS87 PARPPTRDNPKHGSSLNRTPSDYDLLIPPLGEDAFDALPPSLPPPPPPARHSLIEHSKPP 810 820 830 840 850 860 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 GSCQQGSGPAASAATASPQLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVS :: .. : CCDS87 GSSSRPSSGQDLFLLPSDPFVDLASGQVPLPPARRLPGENVKTNRTSQDYDQLPSCSDGS 870 880 890 900 910 920 >>CCDS12643.1 CBLC gene_id:23624|Hs109|chr19 (474 aa) initn: 1442 init1: 1307 opt: 1367 Z-score: 700.6 bits: 139.9 E(33420): 1.1e-32 Smith-Waterman score: 1449; 46.6% identity (71.3% similar) in 474 aa overlap (61-522:23-472) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 DAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCWKLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPD ...... . : .:.:.. ::: . :::: CCDS12 MALAVAPWGRQWEEARALGRAVRMLQRLEEQCVDPRLSV--SPPSLRDLLPR 10 20 30 40 50 100 110 120 130 140 pF1KE2 TYQHLRTIL-SRYE----GKMETLGENEYFRVFMENLMKKTKQTISLF-----KEGKERM : : :: . :: : : .... ... :: :..:. .:. . ..... CCDS12 TAQLLREVAHSRRAAGGGGPGGPGGSGDFLLIYLANLEAKSRQVAALLPPRGRRSANDEL 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 YEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDTFRITKADAAEFWRKAFGEKTIV .. .:. ::.:.::..::::: :::...::.: . : ...::: : :::.. : . .. CCDS12 FRAGSRLRRQLAKLAIIFSHMHAELHALFPGGKYCGHMYQLTKAPAHTFWRESCGARCVL 120 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 PWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNS :: :.. : ::. : :.::..::::::. ..:.::::.:::::::: .::.::. 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CCDS46 TAQLLREVAHSRRAAGGGGPGGPGGSGDFLLIYLANLEAKSRQVAALLPPRGRRSANDEL 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 YEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDTFRITKADAAEFWRKAFGEKTIV .. .:. ::.:.::..::::: :::...::.: . : ...::: : :::.. : . .. CCDS46 FRAGSRLRRQLAKLAIIFSHMHAELHALFPGGKYCGHMYQLTKAPAHTFWRESCGARCVL 120 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 PWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNS :: :.. : ::. : :.::..::::::. ..:.::::.:::::::: .::.::. 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