FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2110, 906 aa
1>>>pF1KE2110 906 - 906 aa - 906 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
64369986 residues in 92320 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.9985+/-0.000413; mu= -14.3186+/- 0.026
mean_var=465.0065+/-94.461, 0's: 0 Z-trim(123.7): 36 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.059476
statistics sampled from 45830 (45868) to 45830 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.783), E-opt: 0.2 (0.497), width: 16
Scan time: 7.770
The best scores are: opt bits E(92320)
NP_005179 (OMIM: 165360,607785,613563) E3 ubiquiti ( 906) 6275 553.6 1.7e-156
XP_011511561 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 894) 2585 236.9 3.6e-61
NP_001308717 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 982) 2585 237.0 3.8e-61
XP_011511559 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 982) 2585 237.0 3.8e-61
NP_733762 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein liga ( 982) 2585 237.0 3.8e-61
XP_016862884 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l (1004) 2585 237.0 3.9e-61
NP_001308715 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l (1010) 2585 237.0 3.9e-61
NP_001308726 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 889) 2580 236.5 4.8e-61
NP_001308727 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 889) 2580 236.5 4.8e-61
NP_001308720 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 938) 2551 234.0 2.8e-60
NP_001308722 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 938) 2551 234.0 2.8e-60
NP_001308719 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 960) 2551 234.0 2.8e-60
XP_016862885 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 966) 2551 234.0 2.9e-60
NP_001308724 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 933) 2542 233.3 4.7e-60
NP_001308723 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 933) 2542 233.3 4.7e-60
NP_001308718 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 961) 2542 233.3 4.9e-60
NP_001308725 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 933) 1798 169.4 7.8e-41
XP_016862888 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 933) 1798 169.4 7.8e-41
XP_016862887 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 955) 1798 169.4 8e-41
XP_016862886 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 961) 1798 169.4 8e-41
NP_001308728 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 889) 1764 166.5 5.7e-40
XP_016862889 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 917) 1764 166.5 5.8e-40
XP_011524990 (OMIM: 608453) E3 ubiquitin-protein l ( 493) 1386 133.9 2.1e-30
XP_005258753 (OMIM: 608453) E3 ubiquitin-protein l ( 431) 1367 132.2 5.9e-30
NP_036248 (OMIM: 608453) E3 ubiquitin-protein liga ( 474) 1367 132.2 6.3e-30
NP_001308736 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 722) 1340 130.0 4.3e-29
NP_001308735 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 722) 1340 130.0 4.3e-29
NP_001308745 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 629) 1335 129.6 5.3e-29
NP_001308737 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 678) 1306 127.1 3.1e-28
NP_001308740 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 673) 1297 126.3 5.3e-28
NP_001308742 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 673) 1297 126.3 5.3e-28
NP_001124324 (OMIM: 608453) E3 ubiquitin-protein l ( 428) 672 72.5 5.2e-12
XP_011524991 (OMIM: 608453) E3 ubiquitin-protein l ( 447) 672 72.6 5.4e-12
XP_011524992 (OMIM: 608453) E3 ubiquitin-protein l ( 283) 451 53.4 1.9e-06
NP_001308749 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 542) 369 46.6 0.00042
NP_001308751 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein l ( 539) 336 43.8 0.003
>>NP_005179 (OMIM: 165360,607785,613563) E3 ubiquitin-pr (906 aa)
initn: 6275 init1: 6275 opt: 6275 Z-score: 2931.0 bits: 553.6 E(92320): 1.7e-156
Smith-Waterman score: 6275; 100.0% identity (100.0% similar) in 906 aa overlap (1-906:1-906)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRYEGKMETLGENEYFRVFME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRYEGKMETLGENEYFRVFME
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDTFR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISVFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCTRL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 GQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQDH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPFCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPFCR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDTLFMMKELAGAKVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDTLFMMKELAGAKVER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PPSPFSMAPQASLPPVPPRLDLLPQRVCVPSSASALGTASKAASGSLHKDKPLPVPPTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PPSPFSMAPQASLPPVPPRLDLLPQRVCVPSSASALGTASKAASGSLHKDKPLPVPPTLR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 DLPPPPPPDRPYSVGAESRPQRRPLPCTPGDCPSRDKLPPVPSSRLGDSWLPRPIPKVPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DLPPPPPPDRPYSVGAESRPQRRPLPCTPGDCPSRDKLPPVPSSRLGDSWLPRPIPKVPV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 SAPSSSDPWTGRELTNRHSLPFSLPSQMEPRPDVPRLGSTFSLDTSMSMNSSPLVGPECD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SAPSSSDPWTGRELTNRHSLPFSLPSQMEPRPDVPRLGSTFSLDTSMSMNSSPLVGPECD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 HPKIKPSSSANAIYSLAARPLPVPKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HPKIKPSSSANAIYSLAARPLPVPKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRAC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 DCDQQIDSCTYEAMYNIQSQAPSITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DCDQQIDSCTYEAMYNIQSQAPSITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VPAVLARRTLSDISNASSSFGWLSLDGDPTTNVTEGSQVPERPPKPFPRRINSERKAGSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VPAVLARRTLSDISNASSSFGWLSLDGDPTTNVTEGSQVPERPPKPFPRRINSERKAGSC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 QQGSGPAASAATASPQLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVSISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QQGSGPAASAATASPQLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVSISS
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 PAHVAT
::::::
NP_005 PAHVAT
>>XP_011511561 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein ligas (894 aa)
initn: 2610 init1: 2118 opt: 2585 Z-score: 1219.9 bits: 236.9 E(92320): 3.6e-61
Smith-Waterman score: 2765; 53.7% identity (69.0% similar) in 877 aa overlap (13-844:39-874)
10 20 30 40
pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHH
:: : :. .: ..:.. ::.:
XP_011 IWFLGITTHRVDLKKELKFQMANSMNGRNPGGRG-GNPRKGRILGII-DAIQDA------
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 LSPHPPGTVDKKMVEKCWKLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRY
..: ...:.. ::: :::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:
XP_011 VGPPKQAAADRRTVEKTWKLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 EG--KMETLGENEYFRVFMENLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSH
. :. :.:::::......::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::
XP_011 DDNQKLAQLSENEYFKIYIDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSH
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 MLAELKGIFPSGLFQGDTFRITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLE
::::.:.:::.: ::::.:::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::
XP_011 MLAEIKAIFPNGQFQGDNFRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 AMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKAR
:::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::: ::::::::::::::::::::
XP_011 AMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKAR
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 LQKFIHKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFP
:::. :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.:
XP_011 LQKYSTKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTGDGNILQTIPHNKPLFQALIDGSREGFYLYP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 DGRNQNPDLTGLCEPTPQDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLM
:::. ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DGRSYNPDLTGLCEPTPHDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLM
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 CTSCLTSWQESEGQGCPFCRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDD
::::::.::::.:::::::::::::::::.::::::: :: . . : : :::
XP_011 CTSCLTAWQESDGQGCPFCRCEIKGTEPIIVDPFDPRDEGSRCCSIIDPFGMPMLDLDDD
430 440 450 460 470 480
470 480 490
pF1KE2 ERADDTLFMMKELAG--------------------AKVERP-PSPFSMAPQASLPPVPPR
. ...: ::..::. :. ..: :.:... :. ::::::::
XP_011 DDREESL-MMNRLANVRKCTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPQPDPLQI-PHLSLPPVPPR
490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 LDLLPQRVCVPSSASALGTASKAASGSLHKDKPLPVPPT-LRDLPPPPPPDRPYSVGAES
:::. . . .: :. ... ..:::::.:: ::: ::::::.:: . ..
XP_011 LDLIQKGIVRSPCGSPTGSPKSSPCMVRKQDKPLPAPPPPLRD-PPPPPPERPPPIPPDN
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 RPQRRPLPCTPGDCPSRDKLPPVPSSRLGDSWLPRPI----PKVPVSAPSSSDPWTG---
: .:. . :::: ::.: ..: :: . : . ..: :
XP_011 RLSRHIHHVE--SVPSRD--PPMPL----EAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGEGSPKPGITA
600 610 620 630 640
620 630 640 650 660
pF1KE2 -RELTNRHSLPFSLPSQMEP--RPDVPRLGS-TFSLDT--SMSMNSSPLVGPECDHPKIK
....::: : : :. : :.: :. .:: : .. : ..: .
XP_011 SSNVNGRHSRVGSDPVLMRKHRRHDLPLEGAKVFSNGHLGSEEYDVPPRLSPPPPVTTLL
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 PSSSANAIYSLAARPLPVPKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRACDCDQQ
:: . .. : : : : :.: :: :::.:. :. :: :. .
XP_011 PSIKCTGPL---ANSLSEKTRDPVE----EDDDEYKIPSSHPVS-LN-SQPSHCHNVKPP
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 IDSCTY-EAMYNIQSQAPSITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPPVPAV
. :: . : : ...:: ..:.. . .. . : .: . :::
XP_011 VRSCDNGHCMLN-GTHGPSSEKKSNIPDLSIYL------------KGDVFDSASDPVPLP
770 780 790 800
790 800 810 820 830
pF1KE2 LARRTLSDISNASSSFGWLSLDGD----PTTNVTEGSQVPERPPKPFPRR---INSERKA
:: : . .::.. : : : . . . : :: : : : :. .
XP_011 PARPPTRDNPKHGSSLNRTPSDYDLLIPPLGEDAFDALPPSLPPPPPPARHSLIEHSKPP
810 820 830 840 850 860
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 GSCQQGSGPAASAATASPQLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVS
:: .. :
XP_011 GSSSRPSSGQDLFLLPSESPVYPMADK
870 880 890
>>NP_001308717 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein ligas (982 aa)
initn: 2823 init1: 2118 opt: 2585 Z-score: 1219.3 bits: 237.0 E(92320): 3.8e-61
Smith-Waterman score: 2765; 53.7% identity (69.0% similar) in 877 aa overlap (13-844:11-846)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCW
:: : :. .: ..:.. ::.: ..: ...:.. ::: :
NP_001 MANSMNGRNPGGRG-GNPRKGRILGII-DAIQDA------VGPPKQAAADRRTVEKTW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 KLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRYEG--KMETLGENEYFRVF
::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:. :. :.:::::...
NP_001 KLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKYDDNQKLAQLSENEYFKIY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 MENLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDT
...::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::::::.:.:::.: ::::.
NP_001 IDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSHMLAEIKAIFPNGQFQGDN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FRITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
:::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 FEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCT
:::::::::::::.:.::::: :::::::::::::::::::::::. ::::::::::::
NP_001 FEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKYSTKPGSYIFRLSCT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQ
:::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.::::. ::::::::::::.
NP_001 RLGQWAIGYVTGDGNILQTIPHNKPLFQALIDGSREGFYLYPDGRSYNPDLTGLCEPTPH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 DHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::
NP_001 DHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTAWQESDGQGCPF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 CRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDTLFMMKELAG---
:::::::::::.::::::: :: . . : : :::. ...: ::..::.
NP_001 CRCEIKGTEPIIVDPFDPRDEGSRCCSIIDPFGMPMLDLDDDDDREESL-MMNRLANVRK
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pF1KE2 -----------------AKVERP-PSPFSMAPQASLPPVPPRLDLLPQRVCVPSSASALG
:. ..: :.:... :. :::::::::::. . . .: :
NP_001 CTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPQPDPLQI-PHLSLPPVPPRLDLIQKGIVRSPCGSPTG
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520 530 540 550 560 570
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. ... ..:::::.:: ::: ::::::.:: . ..: .:. . ::::
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580 590 600 610 620
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::.: ..: :: . : . ..: : ....::: : : :
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. : :.: :. .:: : .. : ..: . :: . .. : :
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pF1KE2 PKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRACDCDQQIDSCTY-EAMYNIQSQAP
: : :.: :: :::.:. :. :: :. . . :: . : : ...:
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: ..:.. . .. . : .: . ::: :: : . .::..
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: : : . . . : :: : : : :. . :: .. :
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:: : :. .: ..:.. ::.: ..: ...:.. ::: :
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::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:. :. :.:::::...
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...::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::::::.:.:::.: ::::.
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:::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::.:.::::: :::::::::::::::::::::::. ::::::::::::
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:::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.::::. ::::::::::::.
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::
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:::::::::::.::::::: :: . . : : :::. ...: ::..::.
XP_011 CRCEIKGTEPIIVDPFDPRDEGSRCCSIIDPFGMPMLDLDDDDDREESL-MMNRLANVRK
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pF1KE2 -----------------AKVERP-PSPFSMAPQASLPPVPPRLDLLPQRVCVPSSASALG
:. ..: :.:... :. :::::::::::. . . .: :
XP_011 CTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPQPDPLQI-PHLSLPPVPPRLDLIQKGIVRSPCGSPTG
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. ... ..:::::.:: ::: ::::::.:: . ..: .:. . ::::
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pF1KE2 KLPPVPSSRLGDSWLPRPI----PKVPVSAPSSSDPWTG----RELTNRHSLPFSLPSQM
::.: ..: :: . : . ..: : ....::: : : :
XP_011 --PPMPL----EAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGEGSPKPGITASSNVNGRHSRVGSDPVLM
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. : :.: :. .:: : .. : ..: . :: . .. : :
XP_011 RKHRRHDLPLEGAKVFSNGHLGSEEYDVPPRLSPPPPVTTLLPSIKCTGPL---ANSLSE
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pF1KE2 PKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRACDCDQQIDSCTY-EAMYNIQSQAP
: : :.: :: :::.:. :. :: :. . . :: . : : ...:
XP_011 KTRDPVE----EDDDEYKIPSSHPVS-LN-SQPSHCHNVKPPVRSCDNGHCMLN-GTHGP
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pF1KE2 SITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPPVPAVLARRTLSDISNASSSFGW
: ..:.. . .. . : .: . ::: :: : . .::..
XP_011 SSEKKSNIPDLSIYL------------KGDVFDSASDPVPLPPARPPTRDNPKHGSSLNR
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pF1KE2 LSLDGD----PTTNVTEGSQVPERPPKPFPRR---INSERKAGSCQQGSGPAASAATASP
: : : . . . : :: : : : :. . :: .. :
XP_011 TPSDYDLLIPPLGEDAFDALPPSLPPPPPPARHSLIEHSKPPGSSSRPSSGQDLFLLPSD
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pF1KE2 QLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVSISSPAHVAT
XP_011 PFVDLASGQVPLPPARRLPGENVKTNRTSQDYDQLPSCSDGSQAPARPPKPRPRRTAPEI
860 870 880 890 900 910
>>NP_733762 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein ligase C (982 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCW
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::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:. :. :.:::::...
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...::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::::::.:.:::.: ::::.
NP_733 IDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSHMLAEIKAIFPNGQFQGDN
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:::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_733 FRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
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:::::::::::::.:.::::: :::::::::::::::::::::::. ::::::::::::
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pF1KE2 RLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQ
:::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.::::. ::::::::::::.
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::
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:::::::::::.::::::: :: . . : : :::. ...: ::..::.
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pF1KE2 -----------------AKVERP-PSPFSMAPQASLPPVPPRLDLLPQRVCVPSSASALG
:. ..: :.:... :. :::::::::::. . . .: :
NP_733 CTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPQPDPLQI-PHLSLPPVPPRLDLIQKGIVRSPCGSPTG
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 TASKAASGSLHKDKPLPVPPT-LRDLPPPPPPDRPYSVGAESRPQRRPLPCTPGDCPSRD
. ... ..:::::.:: ::: ::::::.:: . ..: .:. . ::::
NP_733 SPKSSPCMVRKQDKPLPAPPPPLRD-PPPPPPERPPPIPPDNRLSRHIHHVE--SVPSRD
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pF1KE2 KLPPVPSSRLGDSWLPRPI----PKVPVSAPSSSDPWTG----RELTNRHSLPFSLPSQM
::.: ..: :: . : . ..: : ....::: : : :
NP_733 --PPMPL----EAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGEGSPKPGITASSNVNGRHSRVGSDPVLM
590 600 610 620 630
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pF1KE2 EP--RPDVPRLGS-TFSLDT--SMSMNSSPLVGPECDHPKIKPSSSANAIYSLAARPLPV
. : :.: :. .:: : .. : ..: . :: . .. : :
NP_733 RKHRRHDLPLEGAKVFSNGHLGSEEYDVPPRLSPPPPVTTLLPSIKCTGPL---ANSLSE
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pF1KE2 PKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRACDCDQQIDSCTY-EAMYNIQSQAP
: : :.: :: :::.:. :. :: :. . . :: . : : ...:
NP_733 KTRDPVE----EDDDEYKIPSSHPVS-LN-SQPSHCHNVKPPVRSCDNGHCMLN-GTHGP
700 710 720 730 740
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pF1KE2 SITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPPVPAVLARRTLSDISNASSSFGW
: ..:.. . .. . : .: . ::: :: : . .::..
NP_733 SSEKKSNIPDLSIYL------------KGDVFDSASDPVPLPPARPPTRDNPKHGSSLNR
750 760 770 780 790
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pF1KE2 LSLDGD----PTTNVTEGSQVPERPPKPFPRR---INSERKAGSCQQGSGPAASAATASP
: : : . . . : :: : : : :. . :: .. :
NP_733 TPSDYDLLIPPLGEDAFDALPPSLPPPPPPARHSLIEHSKPPGSSSRPSSGQDLFLLPSD
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pF1KE2 QLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVSISSPAHVAT
NP_733 PFVDLASGQVPLPPARRLPGENVKTNRTSQDYDQLPSCSDGSQAPARPPKPRPRRTAPEI
860 870 880 890 900 910
>>XP_016862884 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein ligas (1004 aa)
initn: 2823 init1: 2118 opt: 2585 Z-score: 1219.2 bits: 237.0 E(92320): 3.9e-61
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pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHH
:: : :. .: ..:.. ::.:
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pF1KE2 LSPHPPGTVDKKMVEKCWKLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRY
..: ...:.. ::: :::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:
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. :. :.:::::......::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::
XP_016 DDNQKLAQLSENEYFKIYIDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSH
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::::.:.:::.: ::::.:::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::
XP_016 MLAEIKAIFPNGQFQGDNFRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLE
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pF1KE2 AMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKAR
:::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::: ::::::::::::::::::::
XP_016 AMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKAR
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pF1KE2 LQKFIHKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFP
:::. :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.:
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pF1KE2 DGRNQNPDLTGLCEPTPQDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLM
:::. ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 CTSCLTSWQESEGQGCPFCRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDD
::::::.::::.:::::::::::::::::.::::::: :: . . : : :::
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pF1KE2 ERADDTLFMMKELAG--------------------AKVERP-PSPFSMAPQASLPPVPPR
. ...: ::..::. :. ..: :.:... :. ::::::::
XP_016 DDREESL-MMNRLANVRKCTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPQPDPLQI-PHLSLPPVPPR
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pF1KE2 LDLLPQRVCVPSSASALGTASKAASGSLHKDKPLPVPPT-LRDLPPPPPPDRPYSVGAES
:::. . . .: :. ... ..:::::.:: ::: ::::::.:: . ..
XP_016 LDLIQKGIVRSPCGSPTGSPKSSPCMVRKQDKPLPAPPPPLRD-PPPPPPERPPPIPPDN
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560 570 580 590 600 610
pF1KE2 RPQRRPLPCTPGDCPSRDKLPPVPSSRLGDSWLPRPI----PKVPVSAPSSSDPWTG---
: .:. . :::: ::.: ..: :: . : . ..: :
XP_016 RLSRHIHHVE--SVPSRD--PPMPL----EAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGEGSPKPGITA
600 610 620 630 640
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pF1KE2 -RELTNRHSLPFSLPSQMEP--RPDVPRLGS-TFSLDT--SMSMNSSPLVGPECDHPKIK
....::: : : :. : :.: :. .:: : .. : ..: .
XP_016 SSNVNGRHSRVGSDPVLMRKHRRHDLPLEGAKVFSNGHLGSEEYDVPPRLSPPPPVTTLL
650 660 670 680 690 700
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pF1KE2 PSSSANAIYSLAARPLPVPKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRACDCDQQ
:: . .. : : : : :.: :: :::.:. :. :: :. .
XP_016 PSIKCTGPL---ANSLSEKTRDPVE----EDDDEYKIPSSHPVS-LN-SQPSHCHNVKPP
710 720 730 740 750
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pF1KE2 IDSCTY-EAMYNIQSQAPSITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPPVPAV
. :: . : : ...:: ..:.. . .. . : .: . :::
XP_016 VRSCDNGHCMLN-GTHGPSSEKKSNIPDLSIYL------------KGDVFDSASDPVPLP
760 770 780 790 800
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pF1KE2 LARRTLSDISNASSSFGWLSLDGD----PTTNVTEGSQVPERPPKPFPRR---INSERKA
:: : . .::.. : : : . . . : :: : : : :. .
XP_016 PARPPTRDNPKHGSSLNRTPSDYDLLIPPLGEDAFDALPPSLPPPPPPARHSLIEHSKPP
810 820 830 840 850 860
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 GSCQQGSGPAASAATASPQLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVS
:: .. :
XP_016 GSSSRPSSGQDLFLLPSDPFVDLASGQVPLPPARRLPGENVKTNRTSQDYDQLPSCSDGS
870 880 890 900 910 920
>>NP_001308715 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein ligas (1010 aa)
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10 20 30 40
pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHH
:: : :. .: ..:.. ::.:
NP_001 IWFLGITTHRVDLKKELKFQMANSMNGRNPGGRG-GNPRKGRILGII-DAIQDA------
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 LSPHPPGTVDKKMVEKCWKLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRY
..: ...:.. ::: :::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:
NP_001 VGPPKQAAADRRTVEKTWKLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 EG--KMETLGENEYFRVFMENLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSH
. :. :.:::::......::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::
NP_001 DDNQKLAQLSENEYFKIYIDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSH
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170 180 190 200 210 220
pF1KE2 MLAELKGIFPSGLFQGDTFRITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLE
::::.:.:::.: ::::.:::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::
NP_001 MLAEIKAIFPNGQFQGDNFRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 AMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKAR
:::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 AMALKSTIDLTCNDYISVFEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKAR
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 LQKFIHKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFP
:::. :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.:
NP_001 LQKYSTKPGSYIFRLSCTRLGQWAIGYVTGDGNILQTIPHNKPLFQALIDGSREGFYLYP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 DGRNQNPDLTGLCEPTPQDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLM
:::. ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGRSYNPDLTGLCEPTPHDHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLM
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 CTSCLTSWQESEGQGCPFCRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDD
::::::.::::.:::::::::::::::::.::::::: :: . . : : :::
NP_001 CTSCLTAWQESDGQGCPFCRCEIKGTEPIIVDPFDPRDEGSRCCSIIDPFGMPMLDLDDD
430 440 450 460 470 480
470 480 490
pF1KE2 ERADDTLFMMKELAG--------------------AKVERP-PSPFSMAPQASLPPVPPR
. ...: ::..::. :. ..: :.:... :. ::::::::
NP_001 DDREESL-MMNRLANVRKCTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPQPDPLQI-PHLSLPPVPPR
490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 LDLLPQRVCVPSSASALGTASKAASGSLHKDKPLPVPPT-LRDLPPPPPPDRPYSVGAES
:::. . . .: :. ... ..:::::.:: ::: ::::::.:: . ..
NP_001 LDLIQKGIVRSPCGSPTGSPKSSPCMVRKQDKPLPAPPPPLRD-PPPPPPERPPPIPPDN
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 RPQRRPLPCTPGDCPSRDKLPPVPSSRLGDSWLPRPI----PKVPVSAPSSSDPWTG---
: .:. . :::: ::.: ..: :: . : . ..: :
NP_001 RLSRHIHHVE--SVPSRD--PPMPL----EAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGEGSPKPGITA
600 610 620 630 640
620 630 640 650 660
pF1KE2 -RELTNRHSLPFSLPSQMEP--RPDVPRLGS-TFSLDT--SMSMNSSPLVGPECDHPKIK
....::: : : :. : :.: :. .:: : .. : ..: .
NP_001 SSNVNGRHSRVGSDPVLMRKHRRHDLPLEGAKVFSNGHLGSEEYDVPPRLSPPPPVTTLL
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 PSSSANAIYSLAARPLPVPKLPPGEQCEGEEDTEYMTPSSRPLRPLDTSQSSRACDCDQQ
:: . .. : : : : :.: :: :::.:. :. :: :. .
NP_001 PSIKCTGPL---ANSLSEKTRDPVE----EDDDEYKIPSSHPVS-LN-SQPSHCHNVKPP
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 IDSCTY-EAMYNIQSQAPSITESSTFGEGNLAAAHANTGPEESENEDDGYDVPKPPVPAV
. :: . : : ...:: ..:.. . .. . : .: . :::
NP_001 VRSCDNGHCMLN-GTHGPSSEKKSNIPDLSIYL------------KGDVFDSASDPVPLP
770 780 790 800
790 800 810 820 830
pF1KE2 LARRTLSDISNASSSFGWLSLDGD----PTTNVTEGSQVPERPPKPFPRR---INSERKA
:: : . .::.. : : : . . . : :: : : : :. .
NP_001 PARPPTRDNPKHGSSLNRTPSDYDLLIPPLGEDAFDALPPSLPPPPPPARHSLIEHSKPP
810 820 830 840 850 860
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 GSCQQGSGPAASAATASPQLSSEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVS
:: .. :
NP_001 GSSSRPSSGQDLFLLPSDPFVDLASGQVPLPPARRLPGENVKTNRTSQDYDQLPSCSDGS
870 880 890 900 910 920
>>NP_001308726 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein ligas (889 aa)
initn: 2823 init1: 2118 opt: 2580 Z-score: 1217.6 bits: 236.5 E(92320): 4.8e-61
Smith-Waterman score: 2876; 52.5% identity (70.4% similar) in 925 aa overlap (13-895:11-877)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCW
:: : :. .: ..:.. ::.: ..: ...:.. ::: :
NP_001 MANSMNGRNPGGRG-GNPRKGRILGII-DAIQDA------VGPPKQAAADRRTVEKTW
10 20 30 40 50
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pF1KE2 KLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRYEG--KMETLGENEYFRVF
::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:. :. :.:::::...
NP_001 KLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKYDDNQKLAQLSENEYFKIY
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pF1KE2 MENLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDT
...::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::::::.:.:::.: ::::.
NP_001 IDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSHMLAEIKAIFPNGQFQGDN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FRITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
:::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 FEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCT
:::::::::::::.:.::::: :::::::::::::::::::::::. ::::::::::::
NP_001 FEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKYSTKPGSYIFRLSCT
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 RLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQ
:::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.::::. ::::::::::::.
NP_001 RLGQWAIGYVTGDGNILQTIPHNKPLFQALIDGSREGFYLYPDGRSYNPDLTGLCEPTPH
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 DHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::
NP_001 DHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTAWQESDGQGCPF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 CRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDTLFMMKELAG---
:::::::::::.::::::: :: . . : : :::. ...: ::..::.
NP_001 CRCEIKGTEPIIVDPFDPRDEGSRCCSIIDPFGMPMLDLDDDDDREESL-MMNRLANVRK
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pF1KE2 -----------------AKVERP-PSPFSMAPQASLPPVPPRLDLLPQRVCVPSSASALG
:. ..: :.:... :. :::::::::::. . . .: :
NP_001 CTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPQPDPLQI-PHLSLPPVPPRLDLIQKGIVRSPCGSPTG
470 480 490 500 510 520
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pF1KE2 TASKAASGSLHKDKPLPVPPT-LRDLPPPPPPDRPYSVGAESRPQRRPLPCTPGDCPSRD
. ... ..:::::.:: ::: ::::::.:: . ..: .:. . ::::
NP_001 SPKSSPCMVRKQDKPLPAPPPPLRD-PPPPPPERPPPIPPDNRLSRHIHHVE--SVPSRD
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620
pF1KE2 KLPPVPSSRLGDSWLPRPI----PKVPVSAPSSSDPWTG----RELTNRHSLPFSLPSQM
::.: ..: :: . : . ..: : ....::: : : :
NP_001 --PPMPL----EAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGEGSPKPGITASSNVNGRHSRVGSDPVLM
590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 EP--RPDVPRLGSTFSLDTSMSMNSSPLVGPECD-HPKIKPSSSANAIYSLAARPLPVPK
. : :.: :. . .... : . : : :...: : ::
NP_001 RKHRRHDLP-------LEGAKVFSNGHLGSEEYDVPPRLSP-------------PPPVTT
640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 LPPG-EQCEGEEDTEYMT--PSSRPLRPL-DTSQSSRACDCDQQIDSCTYEAMYNIQSQA
: :. ..:.. . : :::. . : : .. : ...:.
NP_001 LLPSIKSCDNGHCMLNGTHGPSSEKKSNIPDLSIYLKGED--------AFDALPPSLPPP
680 690 700 710 720 730
750 760 770 780 790
pF1KE2 PSITESSTFGEGNL--AAAHANTGPEESENEDDGY-DVPKPPVPAVLARRTLSDISNASS
: .. : . ... .... ..: . .: . :. . :: ::: .. ...
NP_001 PPPARHSLIEHSKPPGSSSRPSSGQDLFLLPSDPFVDLASGQVPLPPARRLPGENVKTNR
740 750 760 770 780 790
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 SFGWLSLDGDPTTNVTEGSQVPERPPKPFPRRINSERKAGSCQQGSGPAASAATASPQLS
. : : : . ..:::.: ::::: ::: : . .. :: : : ...
NP_001 T----SQDYDQLPSCSDGSQAPARPPKPRPRRTAPEIHH---RKPHGPEA----ALENVD
800 810 820 830 840
860 870 880 890 900
pF1KE2 SEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVSISSPAHVAT
..: .::..::.......:: :::::.:.:..:::::
NP_001 AKIAKLMGEGYAFEEVKRALEIAQNNVEVARSILREFAFPPPVSPRLNL
850 860 870 880
>>NP_001308727 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein ligas (889 aa)
initn: 2823 init1: 2118 opt: 2580 Z-score: 1217.6 bits: 236.5 E(92320): 4.8e-61
Smith-Waterman score: 2876; 52.5% identity (70.4% similar) in 925 aa overlap (13-895:11-877)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCW
:: : :. .: ..:.. ::.: ..: ...:.. ::: :
NP_001 MANSMNGRNPGGRG-GNPRKGRILGII-DAIQDA------VGPPKQAAADRRTVEKTW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 KLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRYEG--KMETLGENEYFRVF
::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:. :. :.:::::...
NP_001 KLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKYDDNQKLAQLSENEYFKIY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 MENLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDT
...::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::::::.:.:::.: ::::.
NP_001 IDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSHMLAEIKAIFPNGQFQGDN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FRITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
:::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 FEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCT
:::::::::::::.:.::::: :::::::::::::::::::::::. ::::::::::::
NP_001 FEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKYSTKPGSYIFRLSCT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQ
:::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.::::. ::::::::::::.
NP_001 RLGQWAIGYVTGDGNILQTIPHNKPLFQALIDGSREGFYLYPDGRSYNPDLTGLCEPTPH
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 DHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTSWQESEGQGCPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::
NP_001 DHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTAWQESDGQGCPF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 CRCEIKGTEPIVVDPFDPRGSGSLLRQGAEGAPSPNYDDDDDERADDTLFMMKELAG---
:::::::::::.::::::: :: . . : : :::. ...: ::..::.
NP_001 CRCEIKGTEPIIVDPFDPRDEGSRCCSIIDPFGMPMLDLDDDDDREESL-MMNRLANVRK
420 430 440 450 460
480 490 500 510
pF1KE2 -----------------AKVERP-PSPFSMAPQASLPPVPPRLDLLPQRVCVPSSASALG
:. ..: :.:... :. :::::::::::. . . .: :
NP_001 CTDRQNSPVTSPGSSPLAQRRKPQPDPLQI-PHLSLPPVPPRLDLIQKGIVRSPCGSPTG
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 TASKAASGSLHKDKPLPVPPT-LRDLPPPPPPDRPYSVGAESRPQRRPLPCTPGDCPSRD
. ... ..:::::.:: ::: ::::::.:: . ..: .:. . ::::
NP_001 SPKSSPCMVRKQDKPLPAPPPPLRD-PPPPPPERPPPIPPDNRLSRHIHHVE--SVPSRD
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620
pF1KE2 KLPPVPSSRLGDSWLPRPI----PKVPVSAPSSSDPWTG----RELTNRHSLPFSLPSQM
::.: ..: :: . : . ..: : ....::: : : :
NP_001 --PPMPL----EAWCPRDVFGTNQLVGCRLLGEGSPKPGITASSNVNGRHSRVGSDPVLM
590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 EP--RPDVPRLGSTFSLDTSMSMNSSPLVGPECD-HPKIKPSSSANAIYSLAARPLPVPK
. : :.: :. . .... : . : : :...: : ::
NP_001 RKHRRHDLP-------LEGAKVFSNGHLGSEEYDVPPRLSP-------------PPPVTT
640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 LPPG-EQCEGEEDTEYMT--PSSRPLRPL-DTSQSSRACDCDQQIDSCTYEAMYNIQSQA
: :. ..:.. . : :::. . : : .. : ...:.
NP_001 LLPSIKSCDNGHCMLNGTHGPSSEKKSNIPDLSIYLKGED--------AFDALPPSLPPP
680 690 700 710 720 730
750 760 770 780 790
pF1KE2 PSITESSTFGEGNL--AAAHANTGPEESENEDDGY-DVPKPPVPAVLARRTLSDISNASS
: .. : . ... .... ..: . .: . :. . :: ::: .. ...
NP_001 PPPARHSLIEHSKPPGSSSRPSSGQDLFLLPSDPFVDLASGQVPLPPARRLPGENVKTNR
740 750 760 770 780 790
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 SFGWLSLDGDPTTNVTEGSQVPERPPKPFPRRINSERKAGSCQQGSGPAASAATASPQLS
. : : : . ..:::.: ::::: ::: : . .. :: : : ...
NP_001 T----SQDYDQLPSCSDGSQAPARPPKPRPRRTAPEIHH---RKPHGPEA----ALENVD
800 810 820 830 840
860 870 880 890 900
pF1KE2 SEIENLMSQGYSYQDIQKALVIAQNNIEMAKNILREFVSISSPAHVAT
..: .::..::.......:: :::::.:.:..:::::
NP_001 AKIAKLMGEGYAFEEVKRALEIAQNNVEVARSILREFAFPPPVSPRLNL
850 860 870 880
>>NP_001308720 (OMIM: 604491) E3 ubiquitin-protein ligas (938 aa)
initn: 2811 init1: 2106 opt: 2551 Z-score: 1203.8 bits: 234.0 E(92320): 2.8e-60
Smith-Waterman score: 2916; 52.6% identity (68.8% similar) in 956 aa overlap (13-895:11-926)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAGNVKKSSGAGGGSGSGGSGSGGLIGLMKDAFQPHHHHHHHLSPHPPGTVDKKMVEKCW
:: : :. .: ..:.. ::.: ..: ...:.. ::: :
NP_001 MANSMNGRNPGGRG-GNPRKGRILGII-DAIQDA------VGPPKQAAADRRTVEKTW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 KLMDKVVRLCQNPKLALKNSPPYILDLLPDTYQHLRTILSRYEG--KMETLGENEYFRVF
::::::::::::::: ::::::::::.::::::::: :::.:. :. :.:::::...
NP_001 KLMDKVVRLCQNPKLQLKNSPPYILDILPDTYQHLRLILSKYDDNQKLAQLSENEYFKIY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 MENLMKKTKQTISLFKEGKERMYEENSQPRRNLTKLSLIFSHMLAELKGIFPSGLFQGDT
...::::.:..: ::::::::::::.:: :::::::::::::::::.:.:::.: ::::.
NP_001 IDSLMKKSKRAIRLFKEGKERMYEEQSQDRRNLTKLSLIFSHMLAEIKAIFPNGQFQGDN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FRITKADAAEFWRKAFGEKTIVPWKSFRQALHEVHPISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
:::::::::::::: ::.::::::: ::: ::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRITKADAAEFWRKFFGDKTIVPWKVFRQCLHEVHQISSGLEAMALKSTIDLTCNDYISV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 FEFDIFTRLFQPWSSLLRNWNSLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKFIHKPGSYIFRLSCT
:::::::::::::.:.::::: :::::::::::::::::::::::. ::::::::::::
NP_001 FEFDIFTRLFQPWGSILRNWNFLAVTHPGYMAFLTYDEVKARLQKYSTKPGSYIFRLSCT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RLGQWAIGYVTADGNILQTIPHNKPLFQALIDGFREGFYLFPDGRNQNPDLTGLCEPTPQ
:::::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::.::::. ::::::::::::.
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NP_001 DHIKVTQEQYELYCEMGSTFQLCKICAENDKDVKIEPCGHLMCTSCLTAWQESDGQGCPF
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. ... ..:::::.:: ::: ::::::.:: . ..: .:. . ::::
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