FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2114, 882 aa 1>>>pF1KE2114 882 - 882 aa - 882 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8968+/- 0.001; mu= 18.5648+/- 0.060 mean_var=88.4350+/-18.022, 0's: 0 Z-trim(106.9): 192 B-trim: 266 in 2/49 Lambda= 0.136384 statistics sampled from 9082 (9282) to 9082 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16 Scan time: 2.650 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 882) 5857 1163.1 0 CCDS10868.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 829) 3045 609.8 6.4e-174 CCDS82005.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 821) 2945 590.1 5.3e-168 CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 784) 2617 525.6 1.4e-148 CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 ( 906) 1804 365.7 2.2e-100 CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 ( 875) 1758 356.6 1.1e-97 CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 842) 1600 325.5 2.5e-88 CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 916) 1600 325.5 2.7e-88 CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16 ( 814) 1283 263.1 1.5e-69 CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 840) 1266 259.8 1.5e-68 CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 894) 1266 259.8 1.6e-68 CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 713) 1229 252.4 2.1e-66 CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 760) 1229 252.5 2.2e-66 CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 847) 1213 249.3 2.1e-65 CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 901) 1213 249.4 2.2e-65 CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18 ( 896) 1132 233.4 1.4e-60 CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 674) 1120 231.0 5.7e-60 CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5 ( 788) 1060 219.2 2.3e-56 CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18 (1118) 1021 211.6 6.2e-54 CCDS11994.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18 ( 772) 985 204.5 6.3e-52 CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18 ( 999) 981 203.7 1.3e-51 CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 630) 911 189.8 1.3e-47 CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5 ( 790) 911 189.9 1.5e-47 CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20 ( 832) 907 189.1 2.8e-47 CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1040) 894 186.6 2e-46 CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1059) 894 186.6 2e-46 CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5 ( 789) 889 185.6 3.1e-46 CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 794) 846 177.1 1.1e-43 CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 781) 835 175.0 4.8e-43 CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18 (1049) 824 172.9 2.8e-42 CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 574) 813 170.5 7.6e-42 CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 575) 812 170.3 8.7e-42 CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 693) 805 169.0 2.6e-41 CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 790) 803 168.7 3.8e-41 CCDS82991.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 754) 686 145.6 3.2e-34 CCDS59325.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18 ( 490) 635 135.5 2.3e-31 CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 785) 603 129.3 2.7e-29 CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16 ( 799) 578 124.4 8.2e-28 CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 670) 571 123.0 1.9e-27 CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 796) 571 123.0 2.1e-27 CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 819) 491 107.3 1.2e-22 CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18 ( 801) 476 104.3 9.1e-22 CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 732) 461 101.3 6.5e-21 CCDS10823.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 829) 461 101.4 7.2e-21 CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16 ( 784) 442 97.6 9.2e-20 CCDS4244.1 PCDHB2 gene_id:56133|Hs108|chr5 ( 798) 434 96.1 2.8e-19 CCDS3785.1 DCHS2 gene_id:54798|Hs108|chr4 (2916) 434 96.4 7.9e-19 CCDS75192.1 PCDH10 gene_id:57575|Hs108|chr4 ( 896) 426 94.5 9.1e-19 CCDS34063.1 PCDH10 gene_id:57575|Hs108|chr4 (1040) 426 94.6 1e-18 CCDS3732.3 FAT4 gene_id:79633|Hs108|chr4 (4981) 429 95.6 2.4e-18 >>CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 (882 aa) initn: 5857 init1: 5857 opt: 5857 Z-score: 6225.7 bits: 1163.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5857; 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CCDS10 AVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGG 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDV ::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.: ::: .:: ..: :::::..: : CCDS10 DDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHV 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 LDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINP ::::::.:::: : :::.: . .:. . :::..:: .:::.::: :: :.:: ..: CCDS10 EDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQKISYRILRDPAGWLAMDP 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 DTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEP :.: ... . ::::: . :.:. : ....: ::::: .:::::::: : ::::..:.::: CCDS10 DSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEP 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 RTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMA : : .:...: ::.:: : :: :.:::: :.:: .. :: . :. ....:. : CCDS10 RQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKF 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 LEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGI :. : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .: : ..:. .: .::.. CCDS10 LKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETC--PGPWKGGFILP----VLGAV 610 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 LALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLD ::::.:.:.:::..:.. .::::: :::::::::.:: ::::::::::.:..::::::. CCDS10 LALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLE 670 680 690 700 710 720 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 ARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYE :::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: ::::::.:::::::::.::::::: CCDS10 ARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYE 730 740 750 760 770 780 840 850 860 870 880 pF1KE2 GSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD ::::.:::::::.:: ::.:::::::::::.::::::::::::::: CCDS10 GSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD 790 800 810 820 >>CCDS82005.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 (821 aa) initn: 2937 init1: 2937 opt: 2945 Z-score: 3129.6 bits: 590.1 E(32554): 5.3e-168 Smith-Waterman score: 5329; 93.1% identity (93.1% similar) in 882 aa overlap (1-882:1-821) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFEDC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFEDC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNTVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 TGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNTVG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 HHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 HHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 NKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 NKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 AVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 AVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 AVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILNDDG ::::::::::::::::::: CCDS82 AVITVTDTNDNPPIFNPTT----------------------------------------- 370 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 GQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 --------------------GLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDV 380 390 400 410 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 NEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 NEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTG 420 430 440 450 460 470 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 AISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 AISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTI 480 490 500 510 520 530 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 FFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 FFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEV 540 550 560 570 580 590 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 GDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 GDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILAL 600 610 620 630 640 650 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 LILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 LILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARP 660 670 680 690 700 710 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 EVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 EVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGS 720 730 740 750 760 770 850 860 870 880 pF1KE2 EAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 EAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD 780 790 800 810 820 >>CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 (784 aa) initn: 2292 init1: 1602 opt: 2617 Z-score: 2781.1 bits: 525.6 E(32554): 1.4e-148 Smith-Waterman score: 2666; 52.1% identity (74.0% similar) in 808 aa overlap (10-813:9-760) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWL-CQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFED : :::::: :: : :::. : :. . . : :..::.: : CCDS82 MGLPRGPLASLLLLQVC-WLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKV-FMG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 CTGRQRTAYFSLDTR-FKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNT : : :. : :: :. : : . .. .: :. .:: CCDS82 CPG-QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNP------------------------ 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 VGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQI : :: :. :::.:::::. ::: ::: :::::. : :. CCDS82 --------------------LKIFP-SKRILRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQL 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 KSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSN :::::.. :.:::::: :::.:: ::: .:.::::: ...:::::.:: : ::.:::: : CCDS82 KSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSEN 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNA : .:::::.: : ::::::.::.:::..:.:::.::.:::::::.::::: :: . :::. CCDS82 GASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNG 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 AIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTT ..::.: ::.:. : ::::.:.::.:::...:::::. : :::..::.:..:.: .:: CCDS82 VVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTT 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 ATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILN- :.::. . :.::: :.:.: :...:::: .. . : ::: ::::.:::.:.: :.. CCDS82 AVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGG 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDV ::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.: ::: .:: ..: :::::..: : CCDS82 DDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHV 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 LDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINP ::::::.:::: : :::.: . .:. . :::..:: .:::.::: :: :.:: ..: CCDS82 EDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQKISYRILRDPAGWLAMDP 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 DTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEP :.: ... . ::::: . :.:. : ....: ::::: .:::::::: : ::::..:.::: CCDS82 DSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEP 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 RTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMA : : .:...: ::.:: : :: :.:::: :.:: .. :: . :. ....:. : CCDS82 RQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKF 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 LEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGI :. : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .: : ..:. .: .::.. CCDS82 LKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETC--PGPWKGGFILP----VLGAV 610 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 LALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLD ::::.:.:.:::..:.. .::::: :::::::::.:: ::::::::::.:..::::::. CCDS82 LALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLE 670 680 690 700 710 720 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 ARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYE :::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: : CCDS82 ARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIEGRGERGSQRGNGGLQLARGRTRR 730 740 750 760 770 780 840 850 860 870 880 pF1KE2 GSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD CCDS82 S >>CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (906 aa) initn: 1857 init1: 609 opt: 1804 Z-score: 1915.7 bits: 365.7 E(32554): 2.2e-100 Smith-Waterman score: 2537; 47.3% identity (72.3% similar) in 910 aa overlap (6-881:9-906) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGPWSRSLSALLL-LLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVN :.: :: :::.: : :. :: . :. .: . ...:. : :. CCDS11 MCRIAGALRTLLPLLAALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYS-AVLSKDVHEGQPLLNVK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 FEDCTGRQRTAYFSLD-TRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDS-TYRKFSTKV : .:.:.... : : . . ::: ::.. . : . . . . .::.:: :. : .:... : CCDS11 FSNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 TLNTVGHHHRPPPHQASVS-GIQAELLTFPNS----SPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKG :. .: . ::. . ..: ..:: . : :.:::::::::::. ::: .: CCDS11 KLSL-----KPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRG 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 PFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYT :::..::.:.:..::. .. ::.:: ::: ::.:.:::. .: :.::.:::::.:: . CCDS11 PFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFH 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LFSHAVSSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDA : .:::. ::: ::.:..:.:.: :.:::.::: ..:..:.: ::. ::: :: ::: :: CCDS11 LRAHAVDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 DDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAAD :: :. :. . : :.:: : :. :::::: .:: : .:..:::::. :::..::.: CCDS11 DDP-NALNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATD 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 LQGE---GLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNT ..:. :::.::::::::::.::::: :. :. :.::::........: ::: : :.: CCDS11 MEGNPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHT 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 PAWEAVYTILNDDG-GQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVS :::.::: : . : :.:.. :.: .:::.. ..: .:::......: ::. : ::. . CCDS11 PAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKG 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 LT---TSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKIT . :::::.: :.:::: : :.: : .. : . .: .:..:::.:: .:.:.: CCDS11 IQHPPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIR 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 YRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLL : : ::::.:.: .: :.: : ::::. .:::. :.: ..:.::: : .::::: CCDS11 YTKLSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRES-PNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQ 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 pF1KE2 LILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINI--IDADLPPNTSPFTAELTHGASA---N . : :.::::: :. :: .: :. ::: .: :. ::..::. .: . . : CCDS11 IYLLDINDNAPQVLPQEAETCE-TPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRN 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 WTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQN--KDQVTTLEVSVCDCEGAAGVC ::: . .. :: :. ::.: :.. . . :. : :.... :.:.::.:. . : : CCDS11 WTITRLNGDFAQLNLKIKF-LEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCD-SNGDC 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 RKA-QPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAV---VKEPLLPPEDDTRDN . . : ::: ::..:: :. ::::.:.......:: .:. :. ::::.::: CCDS11 TDVDRIVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDN 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 pF1KE2 VYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPE------VTRNDVAPTLMSVPRYLPRPA--N . ::::::::::::.:::::.. ..:. . : : : . . :.: : : . CCDS11 ILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERP-IHAEPQYPVRSAAPH 770 780 790 800 810 820 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 PDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLN : .::.::.:.:::::.:::::::::::::::::::: :.:::::::: : .::::::: CCDS11 PGDIGDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLN 830 840 850 860 870 880 870 880 pF1KE2 EWGNRFKKLADMYGGGEDD .:: ::::::::::::.: CCDS11 DWGPRFKKLADMYGGGDD 890 900 >>CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (875 aa) initn: 1857 init1: 609 opt: 1758 Z-score: 1867.0 bits: 356.6 E(32554): 1.1e-97 Smith-Waterman score: 2491; 47.6% identity (72.8% similar) in 876 aa overlap (39-881:11-875) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 SALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFEDCTGRQRTAY :: .. . :. :.: .:.:.... : CCDS77 MFLLRRYVCIFTEKLKNQAELYVFLSVKFSNCNGKRKVQY 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 FSLD-TRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDS-TYRKFSTKVTLNTVGHHHRPP : . . ::: ::.. . : . . . . .::.:: :. : .:... : :. .: CCDS77 ESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVKLSL-----KPT 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 PHQASVS-GIQAELLTFPNS----SPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKSN . ::. . ..: ..:: . : :.:::::::::::. ::: .::::..::.:.:. CCDS77 LTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSD 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 KDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGNA .::. .. ::.:: ::: ::.:.:::. .: :.::.:::::.:: . : .:::. ::: CCDS77 RDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQ 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 VEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAIA ::.:..:.:.: :.:::.::: ..:..:.: ::. ::: :: ::: :::: :. :. . CCDS77 VENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDP-NALNGMLR 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KE2 YTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGE---GLSTT : :.:: : :. :::::: .:: : .:..:::::. :::..::.:..:. :::.: CCDS77 YRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTYGLSNT 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 ATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILND :::::::::.::::: :. :. :.::::........: ::: : :.::::.::: : . CCDS77 ATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGG 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 DG-GQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLT---TSTATVT : :.:.. :.: .:::.. ..: .:::......: ::. : ::. .. :::::. CCDS77 DPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTATVS 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 VDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLE : :.:::: : :.: : .. : . .: .:..:::.:: .:.:.: : : ::::. CCDS77 VTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPANWLK 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 INPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPI :.: .: :.: : ::::. .:::. :.: ..:.::: : .::::: . : :.::::: CCDS77 IDPVNGQITTIAVLDRES-PNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNAPQ 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 pF1KE2 PEPRTIFFCERNPKPQVINI--IDADLPPNTSPFTAELTHGASA---NWTIQYNDPTQES :. :: .: :. ::: .: :. ::..::. .: . . :::: . . CCDS77 VLPQEAETCE-TPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGDFAQ 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 IILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQN--KDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKA-QPVEAGLQ . :: :. ::.: :.. . . :. : :.... :.:.::.:. . : : . . : ::: CCDS77 LNLKIKF-LEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCD-SNGDCTDVDRIVGAGLG 640 650 660 670 680 690 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 IPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAV---VKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEE ::..:: :. ::::.:.......:: .:. :. ::::.:::. ::::::::: CCDS77 TGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEE 700 710 720 730 740 750 770 780 790 800 810 pF1KE2 DQDFDLSQLHRGLDARPE------VTRNDVAPTLMSVPRYLPRPA--NPDEIGNFIDENL :::.:::::.. ..:. . : : : . . :.: : : .: .::.::.:.: CCDS77 DQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERP-IHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGL 760 770 780 790 800 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 KAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADM ::::.:::::::::::::::::::: :.:::::::: : .:::::::.:: :::::::: CCDS77 KAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADM 810 820 830 840 850 860 880 pF1KE2 YGGGEDD ::::.: CCDS77 YGGGDD 870 >>CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 (842 aa) initn: 1972 init1: 587 opt: 1600 Z-score: 1699.2 bits: 325.5 E(32554): 2.5e-88 Smith-Waterman score: 2376; 47.1% identity (72.0% similar) in 847 aa overlap (75-882:3-842) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 HLERGRVLGRVNFEDCTGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWD ::::.::.. . : :. . :. : : ::: CCDS58 MDFKVGADGTVFATRELQVPSEQVAFTVTAWD 10 20 30 110 120 130 140 150 pF1KE2 S-TYRKFSTKVTL---NTVGHH--HRPPPHQASVS-----GIQAELLTFPN--SSPGLRR : : .:... : : .: . : :.: . :. . :: .:. .. :::: CCDS58 SQTAEKWDAVVRLLVAQTSSPHSGHKPQKGKKVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLRR 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 QKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERET .:::::::::. ::: .::::..::.:.:.::.. . ::::: ::: ::. :: :. . CCDS58 RKRDWVIPPINVPENSRGPFPQQLVRIRSDKDNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSMS 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 GWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSV : . ::.:.:::. :.: : .:::. ::: ::.:... : : :.:::.::: ..:..::: CCDS58 GRMYVTRPMDREEHASYHLRAHAVDMNGNKVENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGSV 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 MEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTT ::. ::: :: :::.::::.. : :. . : :..: :. :..:::::: .:: : .:.. CCDS58 DEGSKPGTYVMTVTANDADDST-TANGMVRYRIVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVAA 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 pF1KE2 GLDRESFPTYTLVVQAADLQGE---GLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENE :::::. ::..:::.:..:. :::.::::.:::::.::::: :. .:. :.::::. CCDS58 GLDREKVQQYTVIVQATDMEGNLNYGLSNTATAIITVTDVNDNPPEFTASTFAGEVPENR 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 ANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILNDD-GGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAK ...:...: : : : :..: :.::: :.. : .:.: : :.::.:.:.. ..:..:.: . CCDS58 VETVVANLTVMDRDQPHSPNWNAVYRIISGDPSGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELN 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 QQYILHVAVTNVVPFEVSLTTS---TATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQE . ..: : :.: .:. .. : :: ::....:.:::: : .: ... : : CCDS58 RAFMLTVMVSNQAPLASGIQMSFQSTAGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTV 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 ITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTAL .:...: .:: ::.: . : : :.::.:: .: :.: : ::::.. ..::..: : CCDS58 LTTFSAVDPDRFMQQAVRYSKLSDPASWLHINATNGQITTAAVLDRESL-YTKNNVYEAT 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 IIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINII--DADLPPN ..:.::: : :.::::: . : :.::::: :. .::. :. ..::: :::. :: CCDS58 FLAADNGIPPASGTGTLQIYLIDINDNAPELLPKEAQICEK-PNLNAINITAADADVDPN 520 530 540 550 560 630 640 650 660 670 pF1KE2 TSPFTAELTHGASA---NWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNK--DQ .:.. :: .: :::: . .. :. . ::.: : . . . :. : .. CCDS58 IGPYVFELPFVPAAVRKNWTITRLNGDYAQLSLRI-LYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSN 570 580 590 600 610 620 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 VTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEA-GLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAV .. ..:.:: :. : : : : :: ::..:: :: :: ..::......:: CCDS58 TSIIKVKVCPCDDN-GDCTTIGAVAAAGLGTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREK 630 640 650 660 670 680 740 750 760 770 780 pF1KE2 ---VKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRG-----LDAR-PEVTRNDV .:. :. ::::.:::. ::::::::::::.:::::.. . .. : : : : CCDS58 ERHTKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPEAMGHVPSKAPGVRRVDE 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 APTLMSVPRYLPRPA--NPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASL : . . :.: :: .: .::.::.:.:.:::.:::::::::::::::::::: :.:. CCDS58 RP-VGAEPQYPIRPMVPHPGDIGDFINEGLRAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSV 750 760 770 780 790 800 850 860 870 880 pF1KE2 SSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD :::::: :. ::::::::.:: :::::::::::::.: CCDS58 SSLNSS-SSGDQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGEED 810 820 830 840 >>CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 (916 aa) initn: 1972 init1: 587 opt: 1600 Z-score: 1698.7 bits: 325.5 E(32554): 2.7e-88 Smith-Waterman score: 2463; 46.0% identity (70.9% similar) in 917 aa overlap (11-882:8-916) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEP------CHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGR :::::..:. : . : :. ::. ..:: . . :: :. : . CCDS13 MTAGAGVLLLLLSLSGALRAHNEDLTTRETCKAGFSEDDYTALISQNILE-GEKLLQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 VNFEDCTGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDS-TYRKFSTK :.: .:.: . : : . . ::::.::.. . : :. . :. : : :::: : .:... CCDS13 VKFSSCVGTKGTQYETNSMDFKVGADGTVFATRELQVPSEQVAFTVTAWDSQTAEKWDAV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 VTL---NTVGHH--HRPPPHQASVS-----GIQAELLTFPN--SSPGLRRQKRDWVIPPI : : .: . : :.: . :. . :: .:. .. ::::.::::::::: CCDS13 VRLLVAQTSSPHSGHKPQKGKKVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLRRRKRDWVIPPI 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 SCPENEKGPFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLD . ::: .::::..::.:.:.::.. . ::::: ::: ::. :: :. .: . ::.:.: CCDS13 NVPENSRGPFPQQLVRIRSDKDNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSMSGRMYVTRPMD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 RERIATYTLFSHAVSSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSV ::. :.: : .:::. ::: ::.:... : : :.:::.::: ..:..::: ::. ::: : CCDS13 REEHASYHLRAHAVDMNGNKVENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGSVDEGSKPGTYV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 MEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTY : :::.::::.. : :. . : :..: :. :..:::::: .:: : .:..:::::. : CCDS13 MTVTANDADDST-TANGMVRYRIVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVAAGLDREKVQQY 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 pF1KE2 TLVVQAADLQGE---GLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKV :..:::.:..:. :::.::::.:::::.::::: :. .:. :.::::....:...: : CCDS13 TVIVQATDMEGNLNYGLSNTATAIITVTDVNDNPPEFTASTFAGEVPENRVETVVANLTV 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 TDADAPNTPAWEAVYTILNDD-GGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVT : : :..: :.::: :.. : .:.: : :.::.:.:.. ..:..:.: .. ..: : :. CCDS13 MDRDQPHSPNWNAVYRIISGDPSGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELNRAFMLTVMVS 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 NVVPFEVSLTTS---TATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPD : .:. .. : :: ::....:.:::: : .: ... : : .:...: .:: CCDS13 NQAPLASGIQMSFQSTAGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTVLTTFSAVDPD 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 TFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPV ::.: . : : :.::.:: .: :.: : ::::.. ..::..: : ..:.::: : CCDS13 RFMQQAVRYSKLSDPASWLHINATNGQITTAAVLDRESL-YTKNNVYEATFLAADNGIPP 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 ATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINII--DADLPPNTSPFTAELTH :.::::: . : :.::::: :. .::. :. ..::: :::. :: .:.. :: CCDS13 ASGTGTLQIYLIDINDNAPELLPKEAQICEK-PNLNAINITAADADVDPNIGPYVFELPF 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 pF1KE2 GASA---NWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNK--DQVTTLEVSVCD .: :::: . .. :. . ::.: : . . . :. : .... ..:.:: CCDS13 VPAAVRKNWTITRLNGDYAQLSLRI-LYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSNTSIIKVKVCP 660 670 680 690 700 710 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 CEGAAGVCRKAQPVEA-GLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAV---VKEPLLP :. : : : : :: ::..:: :: :: ..::......:: .:. :. CCDS13 CDDN-GDCTTIGAVAAAGLGTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREKERHTKQLLID 720 730 740 750 760 770 750 760 770 780 790 pF1KE2 PEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRG-----LDAR-PEVTRNDVAPTLMSVPRY ::::.:::. ::::::::::::.:::::.. . .. : : : : : . . :.: CCDS13 PEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPEAMGHVPSKAPGVRRVDERP-VGAEPQY 780 790 800 810 820 830 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 LPRPA--NPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDK :: .: .::.::.:.:.:::.:::::::::::::::::::: :.:.:::::: : CCDS13 PIRPMVPHPGDIGDFINEGLRAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSVSSLNSSSSG- 840 850 860 870 880 860 870 880 pF1KE2 DQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD ::::::::.:: :::::::::::::.: CCDS13 DQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGEED 890 900 910 >>CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16 (814 aa) initn: 1312 init1: 389 opt: 1283 Z-score: 1362.3 bits: 263.1 E(32554): 1.5e-69 Smith-Waterman score: 1753; 40.7% identity (67.3% similar) in 776 aa overlap (132-877:22-781) 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 AWDSTYRKFSTKVTLNTVGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFP-NSSPGLRRQKRDWVIPP : : . .: .:.: : .: ::::: CCDS10 MDAAFLLVLGLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPWRRAPALSRVRRAWVIPP 10 20 30 40 50 170 180 190 200 210 pF1KE2 ISCPENEKG-PFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEP :: ::.: :.: ::::::.:.. :.:.::: : :.: : ::: :.. :: . .. CCDS10 ISVSENHKRLPYP--LVQIKSDKQQLGSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAM 60 70 80 90 100 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 LDRERIATYTLFSHAVSSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGT ::::. . : . :.. .:...::: .. :.:.:::::.: : ::.: : :.:::.::: CCDS10 LDREKTDRFRLRAFALDLGGSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGT 110 120 130 140 150 160 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 SVMEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQ-DPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESF : .. :::::: .: :::. ..::.: .::: :.:.. :: : .: .::::: CCDS10 YVTRAEATDADDP-ETDNAALRFSILQQGSPEL-----FSIDELTGEIRTVQVGLDREVV 170 180 190 200 210 220 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 PTYTLVVQAADLQGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKV .:.:..:.::..:.::..::.:.::. : ::: : :. . .. : ..: . :.: CCDS10 AVYNLTLQVADMSGDGLTATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVSGVDVGRLEV 230 240 250 260 270 280 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 TDADAPNTPAWEAVYTILNDD-GGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVT : : :..: : : .:::. : :::.. :.: .:.:.:. .:.::.:. ..: :.:.: CCDS10 EDRDLPGSPNWVARFTILEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQ 290 300 310 320 330 340 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 NVVPFEVSLTTST---ATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPD : .:.... . : : : : :.:: :.: :. ..: : .....:..:: CCDS10 NEAPLQAAALRAERGQAKVRVHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPD 350 360 370 380 390 400 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 TFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPV : . :...: : .::... :: :.:. :. . .:.. : :...: :..: CCDS10 TEQLQRLSYSKDYDPEDWLQVDAATGRIQTQHVLSPAS-PFLKGGWYRAIVLAQDDASQP 410 420 430 440 450 460 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 ATGTGTLLLILSDVNDNAPI--PEPRTIFFCERNPKPQVI-NIIDADLPPNTSPFTAELT :.:::: . . .:::.::. : : . : . : .. . : ::::. .:: .:. CCDS10 RTATGTLSIEILEVNDHAPVLAPPPPGSLCSEPHQGPGLLLGATDEDLPPHGAPFHFQLS 470 480 490 500 510 520 640 650 660 670 680 pF1KE2 HGASA---NWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDN----QNKDQVTTLEVS ::... . .. :.:. . : ....: : :. :...: :.:. CCDS10 PRLPELGRNWSLSQVNVSHAR--LRPRHQVPEGLHRLSLLLRDSGQPPQQREQ--PLNVT 530 540 550 560 570 690 700 710 720 730 pF1KE2 VCDCEGAAGVCRK-AQPVEAG---LQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLR--RRAVVK :: : : ::: : . :: :.. :.. .:.. : ::.:.::. : : ... : CCDS10 VCRC-GKDGVCLPGAAALLAGGTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLLVALRARFWKQSRGK 580 590 600 610 620 630 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 EPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQD-FDLSQLHR----GLDARPEVTRNDVAPTLMS : :.:: :::: :::.:::::::: .:.:::.. .: : : : :: CCDS10 GLLHGPQDDLRDNVLNYDEQGGGEEDQDAYDISQLRHPTALSLPLGPPPLRRD-APQGRL 640 650 660 670 680 690 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 VPRYLPR--PANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSS :. :: :..: .:..::...:.:::.::..::::. :..::::.:: :..:::. :: CCDS10 HPQP-PRVLPTSPLDIADFINDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSS 700 710 720 730 740 750 860 870 880 pF1KE2 ESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD ..:.::::::: .:: :: .:::::: CCDS10 QGDEDQDYDYLRDWGPRFARLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA 760 770 780 790 800 810 >>CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 (840 aa) initn: 574 init1: 412 opt: 1266 Z-score: 1344.1 bits: 259.8 E(32554): 1.5e-68 Smith-Waterman score: 1332; 33.3% identity (62.3% similar) in 774 aa overlap (3-763:8-744) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRV : : . ::. : : . :: . :. . . :: ::. ..:.: CCDS11 MALASAAPGSIFCKQLLFSLLVLTLLC---DACQKVY------LRVPS-HLQAETLVGKV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 NFEDCTGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVT :.:.: .. . : : :.. :: : . . : . . . : .. :. :. . .. CCDS11 NLEECL-KSASLIRSSDPAFRILEDGSIYTTHDLILSSERKSFSIFLSDGQ-RREQQEIK 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LNTVGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNL . ..... : .. . .. .:.:.:: :. : : :: ::::... CCDS11 VVLSARENKSPKKRHT-------------KDTALKRSKRRWAPIPASLMENSLGPFPQHV 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAV ::.:. .. .::::.: :.: : ..: ::..:: . :. .:::. ..:...:. CCDS11 QQIQSDAAQNYTIFYSISGPGVDKEPFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYAT 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 SSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNT ...: : : :. ..: . :.::: : : ..: .: :. :::: .::::: :. .: CCDS11 TADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDNAPYFEHRVTIFTVPENCRSGTSVGKVTATDLDEP-DT 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 YNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGE-- .. . : ::.: :. : . :.:. .::::...: ::::. :: :.... :. :. 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CCDS11 KTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDRHGLVATHMLTVRVCDC-STPSECRMKDKSTRDVRP 630 640 650 660 670 680 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 PAILG---ILGGILA--LLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGE .::: ::. .:. ::. ::. . . . .::. . ::: ...:. . :: :: CCDS11 NVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFCVTAKRTVKKCF--PEDIAQQNLIVSNTEGPGE 690 700 710 720 730 740 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 EDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDP : CCDS11 EVTEANIRLPMQTSNICDTSMSVGTVGGQGIKTQQSFEMVKGGYTLDSNKGGGHQTLESV 750 760 770 780 790 800 882 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Sep 11 12:00:43 2017 done: Mon Sep 11 12:00:43 2017 Total Scan time: 2.650 Total Display time: 0.230 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]