Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2119
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2119, 912 aa
1>>>pF1KE2119 912 - 912 aa - 912 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7410+/-0.0012; mu= 0.1860+/- 0.071
mean_var=305.4474+/-67.052, 0's: 0 Z-trim(111.0): 642 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.073385
statistics sampled from 11345 (12070) to 11345 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.371), width: 16
Scan time: 4.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9637.1 PRKD1 gene_id:5587|Hs108|chr14 ( 912) 6162 667.3 3.7e-191
CCDS81796.1 PRKD1 gene_id:5587|Hs108|chr14 ( 920) 6136 664.5 2.5e-190
CCDS1789.1 PRKD3 gene_id:23683|Hs108|chr2 ( 890) 3291 363.3 1.1e-99
CCDS59401.1 PRKD2 gene_id:25865|Hs108|chr19 ( 721) 2605 290.6 7.2e-78
CCDS12689.1 PRKD2 gene_id:25865|Hs108|chr19 ( 878) 2605 290.7 8.3e-78
CCDS13843.1 CHEK2 gene_id:11200|Hs108|chr22 ( 543) 648 83.3 1.4e-15
CCDS33629.1 CHEK2 gene_id:11200|Hs108|chr22 ( 586) 648 83.3 1.5e-15
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 622 80.6 1.1e-14
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 606 78.7 2.2e-14
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 606 78.7 2.4e-14
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 589 76.9 8e-14
CCDS34076.1 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 766) 594 77.7 9.3e-14
CCDS47142.2 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 783) 594 77.7 9.4e-14
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 583 76.3 1.5e-13
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 562 74.1 6.9e-13
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 558 73.6 7.6e-13
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 558 73.6 8.6e-13
CCDS43263.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 556 73.5 1.1e-12
CCDS3704.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 556 73.5 1.1e-12
CCDS54797.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 489) 556 73.5 1.1e-12
CCDS47127.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 492) 556 73.5 1.1e-12
CCDS82950.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 498) 556 73.5 1.1e-12
CCDS3703.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 499) 556 73.5 1.1e-12
CCDS82948.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 512) 550 72.9 1.8e-12
CCDS82949.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 533) 550 72.9 1.8e-12
CCDS7336.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 495) 546 72.4 2.3e-12
CCDS7337.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 527) 546 72.5 2.4e-12
CCDS73153.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 539) 546 72.5 2.4e-12
CCDS7338.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 556) 546 72.5 2.5e-12
CCDS43386.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 478) 541 71.9 3.2e-12
CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 489) 541 71.9 3.3e-12
CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 422) 538 71.5 3.7e-12
CCDS55895.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 433) 538 71.5 3.8e-12
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 535 71.2 4.6e-12
CCDS9354.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 729) 538 71.7 5.5e-12
CCDS81762.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 740) 538 71.8 5.5e-12
CCDS5470.1 STK17A gene_id:9263|Hs108|chr7 ( 414) 532 70.9 5.7e-12
CCDS48094.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 897) 536 71.6 7.3e-12
CCDS48095.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 898) 536 71.6 7.3e-12
CCDS14257.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 921) 536 71.6 7.5e-12
CCDS34330.1 MYLK4 gene_id:340156|Hs108|chr6 ( 388) 523 69.9 1e-11
CCDS5489.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 449) 520 69.6 1.4e-11
CCDS5488.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 479) 520 69.7 1.5e-11
CCDS5487.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 492) 520 69.7 1.5e-11
CCDS5486.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 503) 520 69.7 1.6e-11
CCDS43573.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 517) 520 69.7 1.6e-11
CCDS5485.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 518) 520 69.7 1.6e-11
CCDS5484.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 542) 520 69.7 1.7e-11
CCDS11213.1 ULK2 gene_id:9706|Hs108|chr17 (1036) 525 70.5 1.8e-11
CCDS2315.1 STK17B gene_id:9262|Hs108|chr2 ( 372) 515 69.0 1.8e-11
>>CCDS9637.1 PRKD1 gene_id:5587|Hs108|chr14 (912 aa)
initn: 6162 init1: 6162 opt: 6162 Z-score: 3545.4 bits: 667.3 E(32554): 3.7e-191
Smith-Waterman score: 6162; 100.0% identity (100.0% similar) in 912 aa overlap (1-912:1-912)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSAPPVLRPPSPLLPVAAAAAAAAAALVPGSGPGPAPFLAPVAAPVGGISFHLQIGLSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 MSAPPVLRPPSPLLPVAAAAAAAAAALVPGSGPGPAPFLAPVAAPVGGISFHLQIGLSRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PVLLLQDSSGDYSLAHVREMACSIVDQKFPECGFYGMYDKILLFRHDPTSENILQLVKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 PVLLLQDSSGDYSLAHVREMACSIVDQKFPECGFYGMYDKILLFRHDPTSENILQLVKAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SDIQEGDLIEVVLSASATFEDFQIRPHALFVHSYRAPAFCDHCGEMLWGLVRQGLKCEGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 SDIQEGDLIEVVLSASATFEDFQIRPHALFVHSYRAPAFCDHCGEMLWGLVRQGLKCEGC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GLNYHKRCAFKIPNNCSGVRRRRLSNVSLTGVSTIRTSSAELSTSAPDEPLLQKSPSESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 GLNYHKRCAFKIPNNCSGVRRRRLSNVSLTGVSTIRTSSAELSTSAPDEPLLQKSPSESF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IGREKRSNSQSYIGRPIHLDKILMSKVKVPHTFVIHSYTRPTVCQYCKKLLKGLFRQGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 IGREKRSNSQSYIGRPIHLDKILMSKVKVPHTFVIHSYTRPTVCQYCKKLLKGLFRQGLQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CKDCRFNCHKRCAPKVPNNCLGEVTINGDLLSPGAESDVVMEEGSDDNDSERNSGLMDDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 CKDCRFNCHKRCAPKVPNNCLGEVTINGDLLSPGAESDVVMEEGSDDNDSERNSGLMDDM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EEAMVQDAEMAMAECQNDSGEMQDPDPDHEDANRTISPSTSNNIPLMRVVQSVKHTKRKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 EEAMVQDAEMAMAECQNDSGEMQDPDPDHEDANRTISPSTSNNIPLMRVVQSVKHTKRKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 STVMKEGWMVHYTSKDTLRKRHYWRLDSKCITLFQNDTGSRYYKEIPLSEILSLEPVKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 STVMKEGWMVHYTSKDTLRKRHYWRLDSKCITLFQNDTGSRYYKEIPLSEILSLEPVKTS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ALIPNGANPHCFEITTANVVYYVGENVVNPSSPSPNNSVLTSGVGADVARMWEIAIQHAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 ALIPNGANPHCFEITTANVVYYVGENVVNPSSPSPNNSVLTSGVGADVARMWEIAIQHAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 MPVIPKGSSVGTGTNLHRDISVSISVSNCQIQENVDISTVYQIFPDEVLGSGQFGIVYGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 MPVIPKGSSVGTGTNLHRDISVSISVSNCQIQENVDISTVYQIFPDEVLGSGQFGIVYGG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KHRKTGRDVAIKIIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHPGVVNLECMFETPERVFVVME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 KHRKTGRDVAIKIIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHPGVVNLECMFETPERVFVVME
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KLHGDMLEMILSSEKGRLPEHITKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 KLHGDMLEMILSSEKGRLPEHITKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRNKGYNRSLDMWSVGVIIYVSLSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 PQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRNKGYNRSLDMWSVGVIIYVSLSGT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 FPFNEDEDIHDQIQNAAFMYPPNPWKEISHEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKTLSHPWLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 FPFNEDEDIHDQIQNAAFMYPPNPWKEISHEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKTLSHPWLQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 DYQTWLDLRELECKIGERYITHESDDLRWEKYAGEQGLQYPTHLINPSASHSDTPETEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 DYQTWLDLRELECKIGERYITHESDDLRWEKYAGEQGLQYPTHLINPSASHSDTPETEET
850 860 870 880 890 900
910
pF1KE2 EMKALGERVSIL
::::::::::::
CCDS96 EMKALGERVSIL
910
>>CCDS81796.1 PRKD1 gene_id:5587|Hs108|chr14 (920 aa)
initn: 6148 init1: 4592 opt: 6136 Z-score: 3530.5 bits: 664.5 E(32554): 2.5e-190
Smith-Waterman score: 6136; 99.1% identity (99.1% similar) in 920 aa overlap (1-912:1-920)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSAPPVLRPPSPLLPVAAAAAAAAAALVPGSGPGPAPFLAPVAAPVGGISFHLQIGLSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MSAPPVLRPPSPLLPVAAAAAAAAAALVPGSGPGPAPFLAPVAAPVGGISFHLQIGLSRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PVLLLQDSSGDYSLAHVREMACSIVDQKFPECGFYGMYDKILLFRHDPTSENILQLVKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PVLLLQDSSGDYSLAHVREMACSIVDQKFPECGFYGMYDKILLFRHDPTSENILQLVKAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SDIQEGDLIEVVLSASATFEDFQIRPHALFVHSYRAPAFCDHCGEMLWGLVRQGLKCEGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SDIQEGDLIEVVLSASATFEDFQIRPHALFVHSYRAPAFCDHCGEMLWGLVRQGLKCEGC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE2 GLNYHKRCAFKIPNNCSGVRRRRLSNVSLTGVSTIRTSSAELSTSAPDEPLL--------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GLNYHKRCAFKIPNNCSGVRRRRLSNVSLTGVSTIRTSSAELSTSAPDEPLLSPVSPGFE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 QKSPSESFIGREKRSNSQSYIGRPIHLDKILMSKVKVPHTFVIHSYTRPTVCQYCKKLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QKSPSESFIGREKRSNSQSYIGRPIHLDKILMSKVKVPHTFVIHSYTRPTVCQYCKKLLK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 GLFRQGLQCKDCRFNCHKRCAPKVPNNCLGEVTINGDLLSPGAESDVVMEEGSDDNDSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GLFRQGLQCKDCRFNCHKRCAPKVPNNCLGEVTINGDLLSPGAESDVVMEEGSDDNDSER
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 NSGLMDDMEEAMVQDAEMAMAECQNDSGEMQDPDPDHEDANRTISPSTSNNIPLMRVVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NSGLMDDMEEAMVQDAEMAMAECQNDSGEMQDPDPDHEDANRTISPSTSNNIPLMRVVQS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VKHTKRKSSTVMKEGWMVHYTSKDTLRKRHYWRLDSKCITLFQNDTGSRYYKEIPLSEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VKHTKRKSSTVMKEGWMVHYTSKDTLRKRHYWRLDSKCITLFQNDTGSRYYKEIPLSEIL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 SLEPVKTSALIPNGANPHCFEITTANVVYYVGENVVNPSSPSPNNSVLTSGVGADVARMW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SLEPVKTSALIPNGANPHCFEITTANVVYYVGENVVNPSSPSPNNSVLTSGVGADVARMW
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 EIAIQHALMPVIPKGSSVGTGTNLHRDISVSISVSNCQIQENVDISTVYQIFPDEVLGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EIAIQHALMPVIPKGSSVGTGTNLHRDISVSISVSNCQIQENVDISTVYQIFPDEVLGSG
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 QFGIVYGGKHRKTGRDVAIKIIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHPGVVNLECMFETP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QFGIVYGGKHRKTGRDVAIKIIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHPGVVNLECMFETP
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 ERVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPEHITKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ERVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPEHITKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENV
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 LLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRNKGYNRSLDMWSVGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRNKGYNRSLDMWSVGVI
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 IYVSLSGTFPFNEDEDIHDQIQNAAFMYPPNPWKEISHEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IYVSLSGTFPFNEDEDIHDQIQNAAFMYPPNPWKEISHEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDK
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 TLSHPWLQDYQTWLDLRELECKIGERYITHESDDLRWEKYAGEQGLQYPTHLINPSASHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TLSHPWLQDYQTWLDLRELECKIGERYITHESDDLRWEKYAGEQGLQYPTHLINPSASHS
850 860 870 880 890 900
900 910
pF1KE2 DTPETEETEMKALGERVSIL
::::::::::::::::::::
CCDS81 DTPETEETEMKALGERVSIL
910 920
>>CCDS1789.1 PRKD3 gene_id:23683|Hs108|chr2 (890 aa)
initn: 4094 init1: 2005 opt: 3291 Z-score: 1902.8 bits: 363.3 E(32554): 1.1e-99
Smith-Waterman score: 4144; 70.1% identity (84.2% similar) in 900 aa overlap (2-893:17-889)
10 20 30 40
pF1KE2 MSAPPVLRPPSPLLPVAAAAAAAAAALVPGSGPGPAPFLAPVAAP
.: :.. : . : .. .. .: : :: :: :. .
CCDS17 MSANNSPPSAQKSVLPTAIPAVLPAAS--PCSSPKTGLSARLSNGSFS--APSLTNSRGS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 VGGISFHLQIGLSREPVLLLQDSSGDYSLAHVREMACSIVDQKFPECGFYGMYDKILLFR
: .:: :::::.:: : . . . ::. :....:::: ::::::::.::::::::::
CCDS17 VHTVSFLLQIGLTRESVTI---EAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFR
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 HDPTSENILQLVKAASDIQEGDLIEVVLSASATFEDFQIRPHALFVHSYRAPAFCDHCGE
:: .:::::::. .:..:.::::.:::::: :: ::::::::.:.::::.::.:::.:::
CCDS17 HDMNSENILQLITSADEIHEGDLVEVVLSALATVEDFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 MLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRRRRLSNVSLTGVSTIRTSSAELSTS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: : . ::.
CCDS17 MLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPG--------LSVP
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 APDEPLLQKSPSE-SFIGREKRSNSQSYIGRPIHLDKILMSKVKVPHTFVIHSYTRPTVC
: .: ::: : . .: . :. :::: ..:..: .:::::::..:::::::.:
CCDS17 RPLQPEYVALPSEESHVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTIC
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 QYCKKLLKGLFRQGLQCKDCRFNCHKRCAPKVPNNCLGEVTINGDLLSPGAESDVVMEEG
::::.:::::::::.:::::.:::::::: ::: .::::::.::. : :...:. :.
CCDS17 QYCKRLLKGLFRQGMQCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPSSLGTDTDIPMDID
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 SDDNDSERNSGLMDDMEEAMVQDAEMAMAECQNDSGEMQDPDPDHEDANRTISPSTSNNI
..: .:. . :: :: :: . .: . : ... : . : :.: .::::::::::
CCDS17 NNDINSDSSRGL-DDTEEPSPPEDKMFFL----DPSDL-DVERD-EEAVKTISPSTSNNI
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 PLMRVVQSVKHTKRKSSTVMKEGWMVHYTSKDTLRKRHYWRLDSKCITLFQNDTGSRYYK
::::::::.:::::::::..::::::::::.:.:::::::::::::.:::::..::.:::
CCDS17 PLMRVVQSIKHTKRKSSTMVKEGWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKCLTLFQNESGSKYYK
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 EIPLSEILSLEPVKTSALIPNGANPHCFEITTANVVYYVGENVVNPSSPSPNNSVLT-SG
:::::::: . . . : .:.::::::: : ..::.:::: .. : .: ::. .:
CCDS17 EIPLSEILRISSPRDFTNISQGSNPHCFEIITDTMVYFVGEN----NGDSSHNPVLAATG
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 VGADVARMWEIAIQHALMPVIPKGS---SVGTGTNLHRDISVSISVSNCQIQENVDISTV
:: :::. :: ::..::::: :..: : : : . :.:.:.::::::::::::::::::
CCDS17 VGLDVAQSWEKAIRQALMPVTPQASVCTSPGQGKD-HKDLSTSISVSNCQIQENVDISTV
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 YQIFPDEVLGSGQFGIVYGGKHRKTGRDVAIKIIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHP
:::: :::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::
CCDS17 YQIFADEVLGSGQFGIVYGGKHRKTGRDVAIKVIDKMRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHP
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 GVVNLECMFETPERVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPEHITKFLITQILVALRHLHFK
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::..::::::::.::::
CCDS17 GIVNLECMFETPERVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKSRLPERITKFMVTQILVALRNLHFK
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 NIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRNKGY
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS17 NIVHCDLKPENVLLASAEPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRSKGY
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 NRSLDMWSVGVIIYVSLSGTFPFNEDEDIHDQIQNAAFMYPPNPWKEISHEAIDLINNLL
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::: ::::::::::
CCDS17 NRSLDMWSVGVIIYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPPNPWREISGEAIDLINNLL
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 QVKMRKRYSVDKTLSHPWLQDYQTWLDLRELECKIGERYITHESDDLRWEKYAGEQGLQY
::::::::::::.:::::::::::::::::.: .:::::::::::: ::: .: ..: :
CCDS17 QVKMRKRYSVDKSLSHPWLQDYQTWLDLREFETRIGERYITHESDDARWEIHAYTHNLVY
820 830 840 850 860 870
890 900 910
pF1KE2 PTHLI---NPSASHSDTPETEETEMKALGERVSIL
: :.: ::. . :
CCDS17 PKHFIMAPNPDDMEEDP
880 890
>>CCDS59401.1 PRKD2 gene_id:25865|Hs108|chr19 (721 aa)
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Smith-Waterman score: 3390; 68.7% identity (84.7% similar) in 754 aa overlap (166-912:1-721)
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 SATFEDFQIRPHALFVHSYRAPAFCDHCGEMLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNN
::.:::::::::.::::::::::::.::::
CCDS59 MLFGLVRQGLKCDGCGLNYHKRCAFSIPNN
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 CSGVRRRRLSNVSLTGVSTIRTSSAELSTSAPDEPLLQKSPSESFIGREKRSNSQS----
:::.:.::::..::.. ..: ...: . .: :..: .: . : :.:.:
CCDS59 CSGARKRRLSSTSLASGHSVRLGTSESLPCTAEE--LSRSTTELLPRRPPSSSSSSSASS
40 50 60 70 80
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 YIGRPIHLDKILMSKVKVPHTFVIHSYTRPTVCQYCKKLLKGLFRQGLQCKDCRFNCHKR
: ::::.:::.:.:::::::::.::::::::::: ::::::::::::::::::.::::::
CCDS59 YTGRPIELDKMLLSKVKVPHTFLIHSYTRPTVCQACKKLLKGLFRQGLQCKDCKFNCHKR
90 100 110 120 130 140
320 330 340 350 360
pF1KE2 CAPKVPNNCLGEVTINGDLLSPGAESDVVMEEGSDDNDSERNSGLMDDMEEAMV---QDA
:: .:::.::::. :::: : :::..: ..... :.:::. :.. : . .
CCDS59 CATRVPNDCLGEALINGD---------VPMEEATDFSEADK-SALMDESEDSGVIPGSHS
150 160 170 180 190
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EMAMAECQNDSGEMQDPDPDHEDANRTISPSTSNNIPLMRVVQSVKHTKRKSSTVMKEGW
: :. ... :: . :. . ::::::::::.:: :::::...:::
CCDS59 ENALHASEEEEGEGGK------------AQSSLGYIPLMRVVQSVRHTTRKSSTTLREGW
200 210 220 230 240
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 MVHYTSKDTLRKRHYWRLDSKCITLFQNDTGSRYYKEIPLSEILSLEPVKTSALIPNGAN
.:::..::::::::::::: ::::::::.: .::::::::::::..: ... .:.: :.:
CCDS59 VVHYSNKDTLRKRHYWRLDCKCITLFQNNTTNRYYKEIPLSEILTVESAQNFSLVPPGTN
250 260 270 280 290 300
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PHCFEITTANVVYYVGENVVNPSSPSPNNSVLTSGVGADVARMWEIAIQHALMPVIPKGS
::::::.:::..:.::: :.. .:.. :: ::..:: :: ::..:::::: . .
CCDS59 PHCFEIVTANATYFVGE---MPGG-TPGG---PSGQGAEAARGWETAIRQALMPVILQDA
310 320 330 340 350
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SVGTGTNLHRDISVSISVSNCQIQENVDISTVYQIFPDEVLGSGQFGIVYGGKHRKTGRD
. : ::. :.:::::: ::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS59 PSAPGHAPHRQASLSISVSNSQIQENVDIATVYQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRD
360 370 380 390 400 410
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VAIKIIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHPGVVNLECMFETPERVFVVMEKLHGDMLE
::.:.::::::::::::::::::::::.:.:::.:::::::::::.::::::::::::::
CCDS59 VAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQSLRHPGIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLE
420 430 440 450 460 470
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 MILSSEKGRLPEHITKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDF
::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MILSSEKGRLPERLTKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDF
480 490 500 510 520 530
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 GFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRNKGYNRSLDMWSVGVIIYVSLSGTFPFNEDED
::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS59 GFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLLNQGYNRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDED
540 550 560 570 580 590
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 IHDQIQNAAFMYPPNPWKEISHEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKTLSHPWLQDYQTWLDL
:.::::::::::: .::..:: :::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::
CCDS59 INDQIQNAAFMYPASPWSHISAGAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQEYQTWLDL
600 610 620 630 640 650
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 RELECKIGERYITHESDDLRWEKYAGEQGLQYPTHLINPSASHSDTPETEETEMKALGER
:::: :.::::::::::: :::..:.:. : : . . . . . .. .:..:.::
CCDS59 RELEGKMGERYITHESDDARWEQFAAEHPL--PGSGLPTDRDLGGACPPQDHDMQGLAER
660 670 680 690 700 710
910
pF1KE2 VSIL
.:.:
CCDS59 ISVL
720
>>CCDS12689.1 PRKD2 gene_id:25865|Hs108|chr19 (878 aa)
initn: 4046 init1: 2056 opt: 2605 Z-score: 1510.4 bits: 290.7 E(32554): 8.3e-78
Smith-Waterman score: 4081; 68.4% identity (83.8% similar) in 914 aa overlap (19-912:2-878)
10 20 30 40
pF1KE2 MSAPPVLRPPSPLLPVAAAAAAAAAALVPGS-GPG------------PAPFLAPVAAPVG
:.: . : .::: ::: : :.: . :: .
CCDS12 MATAPSYPAGLPGSPGPGSPPPPGGLELQSPPPLLPQIPAPGS
10 20 30 40
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 GISFHLQIGLSREPVLLLQDSSGDYSLAHVREMACSIVDQKFPECGFYGMYDKILLFRHD
:.:::.::::.:: ::: : ::::...::::::::::::::::.:::::::.::
CCDS12 GVSFHIQIGLTREFVLLPAASE----LAHVKQLACSIVDQKFPECGFYGLYDKILLFKHD
50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 PTSENILQLVKAASDIQEGDLIEVVLSASATFEDFQIRPHALFVHSYRAPAFCDHCGEML
::: :.::::....:::::::.:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS12 PTSANLLQLVRSSGDIQEGDLVEVVLSASATFEDFQIRPHALTVHSYRAPAFCDHCGEML
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 WGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRRRRLSNVSLTGVSTIRTSSAELSTSAP
.:::::::::.::::::::::::.:::::::.:.::::..::.. ..: ...: .
CCDS12 FGLVRQGLKCDGCGLNYHKRCAFSIPNNCSGARKRRLSSTSLASGHSVRLGTSESLPCTA
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 DEPLLQKSPSESFIGREKRSNSQS----YIGRPIHLDKILMSKVKVPHTFVIHSYTRPTV
.: :..: .: . : :.:.: : ::::.:::.:.:::::::::.:::::::::
CCDS12 EE--LSRSTTELLPRRPPSSSSSSSASSYTGRPIELDKMLLSKVKVPHTFLIHSYTRPTV
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 CQYCKKLLKGLFRQGLQCKDCRFNCHKRCAPKVPNNCLGEVTINGDLLSPGAESDVVMEE
:: ::::::::::::::::::.:::::::: .:::.::::. :::: : :::
CCDS12 CQACKKLLKGLFRQGLQCKDCKFNCHKRCATRVPNDCLGEALINGD---------VPMEE
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 GSDDNDSERNSGLMDDMEEAMV---QDAEMAMAECQNDSGEMQDPDPDHEDANRTISPST
..: ..... :.:::. :.. : . .: :. ... :: . :.
CCDS12 ATDFSEADK-SALMDESEDSGVIPGSHSENALHASEEEEGEGGK------------AQSS
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 SNNIPLMRVVQSVKHTKRKSSTVMKEGWMVHYTSKDTLRKRHYWRLDSKCITLFQNDTGS
. ::::::::::.:: :::::...:::.:::..::::::::::::: ::::::::.: .
CCDS12 LGYIPLMRVVQSVRHTTRKSSTTLREGWVVHYSNKDTLRKRHYWRLDCKCITLFQNNTTN
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 RYYKEIPLSEILSLEPVKTSALIPNGANPHCFEITTANVVYYVGENVVNPSSPSPNNSVL
::::::::::::..: ... .:.: :.:::::::.:::..:.::: :.. .:..
CCDS12 RYYKEIPLSEILTVESAQNFSLVPPGTNPHCFEIVTANATYFVGEM---PGG-TPGG---
440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 TSGVGADVARMWEIAIQHALMPVIPKGSSVGTGTNLHRDISVSISVSNCQIQENVDISTV
:: ::..:: :: ::..:::::: . . . : ::. :.:::::: ::::::::.::
CCDS12 PSGQGAEAARGWETAIRQALMPVILQDAPSAPGHAPHRQASLSISVSNSQIQENVDIATV
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 YQIFPDEVLGSGQFGIVYGGKHRKTGRDVAIKIIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHP
:::::::::::::::.::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.:.::
CCDS12 YQIFPDEVLGSGQFGVVYGGKHRKTGRDVAVKVIDKLRFPTKQESQLRNEVAILQSLRHP
550 560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 GVVNLECMFETPERVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPEHITKFLITQILVALRHLHFK
:.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::
CCDS12 GIVNLECMFETPEKVFVVMEKLHGDMLEMILSSEKGRLPERLTKFLITQILVALRHLHFK
610 620 630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 NIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLRNKGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::
CCDS12 NIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFRRSVVGTPAYLAPEVLLNQGY
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 NRSLDMWSVGVIIYVSLSGTFPFNEDEDIHDQIQNAAFMYPPNPWKEISHEAIDLINNLL
::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::: .::..:: :::::::::
CCDS12 NRSLDMWSVGVIMYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPASPWSHISAGAIDLINNLL
730 740 750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 QVKMRKRYSVDKTLSHPWLQDYQTWLDLRELECKIGERYITHESDDLRWEKYAGEQGLQY
::::::::::::.:::::::.::::::::::: :.::::::::::: :::..:.:. :
CCDS12 QVKMRKRYSVDKSLSHPWLQEYQTWLDLRELEGKMGERYITHESDDARWEQFAAEHPL--
790 800 810 820 830 840
890 900 910
pF1KE2 PTHLINPSASHSDTPETEETEMKALGERVSIL
: . . . . . .. .:..:.::.:.:
CCDS12 PGSGLPTDRDLGGACPPQDHDMQGLAERISVL
850 860 870
>>CCDS13843.1 CHEK2 gene_id:11200|Hs108|chr22 (543 aa)
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Smith-Waterman score: 659; 37.2% identity (70.3% similar) in 317 aa overlap (550-841:175-488)
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 LTSGVGADVARMWEIAIQHALMPVIPKGSSVGTGTN--LHRDISVSISVSNCQI----QE
:: : :. . ...:.: .. .
CCDS13 RIFREVGPKNSYIAYIEDHSGNGTFVNTELVGKGKRRPLNNNSEIALSLSRNKVFVFFDL
150 160 170 180 190 200
580 590 600 610 620
pF1KE2 NVDISTVY-QIFPDE-----VLGSGQFGIVYGGKHRKTGRDVAIKIIDKLRFP--TKQES
.:: ..:: . . :: .:::: : : . .::: . ::::::.: .: . .:.
CCDS13 TVDDQSVYPKALRDEYIMSKTLGSGACGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKRKFAIGSAREA
210 220 230 240 250 260
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 Q----LRNEVAILQNLHHPGVVNLECMFETPERVFVVMEKLHG-DMLEMILSSEKGRLPE
. ...:. ::..:.:: ..... .:.. : ..:.: ..: .... ..... :: :
CCDS13 DPALNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDA-EDYYIVLELMEGGELFDKVVGNK--RLKE
270 280 290 300 310 320
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pF1KE2 HITKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFR
:. . :.:.:...:: ..:.: :::::::::.: . .:. ::: ..:.:: :.
CCDS13 ATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLM
330 340 350 360 370 380
750 760 770 780 790
pF1KE2 RSVVGTPAYLAPEVLRN---KGYNRSLDMWSVGVIIYVSLSGTFPFNEDE---DIHDQIQ
:.. :::.::::::: . ::::..: ::.:::... ::: ::.: . ...:::
CCDS13 RTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQIT
390 400 410 420 430 440
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 NAAFMYPPNPWKEISHEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKTLSHPWLQDYQTWLDLRELECK
.. . . :. : :.:..:.::...:: : . :......: ::::::
CCDS13 SGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSE
450 460 470 480 490 500
860 870 880 890 900 910
pF1KE2 IGERYITHESDDLRWEKYAGEQGLQYPTHLINPSASHSDTPETEETEMKALGERVSIL
CCDS13 ENESTALPQVLAQPSTSRKRPREGEAEGAETTKRPAVCAAVL
510 520 530 540
>>CCDS33629.1 CHEK2 gene_id:11200|Hs108|chr22 (586 aa)
initn: 623 init1: 261 opt: 648 Z-score: 392.9 bits: 83.3 E(32554): 1.5e-15
Smith-Waterman score: 659; 37.2% identity (70.3% similar) in 317 aa overlap (550-841:218-531)
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 LTSGVGADVARMWEIAIQHALMPVIPKGSSVGTGTN--LHRDISVSISVSNCQI----QE
:: : :. . ...:.: .. .
CCDS33 RIFREVGPKNSYIAYIEDHSGNGTFVNTELVGKGKRRPLNNNSEIALSLSRNKVFVFFDL
190 200 210 220 230 240
580 590 600 610 620
pF1KE2 NVDISTVY-QIFPDE-----VLGSGQFGIVYGGKHRKTGRDVAIKIIDKLRFP--TKQES
.:: ..:: . . :: .:::: : : . .::: . ::::::.: .: . .:.
CCDS33 TVDDQSVYPKALRDEYIMSKTLGSGACGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKRKFAIGSAREA
250 260 270 280 290 300
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 Q----LRNEVAILQNLHHPGVVNLECMFETPERVFVVMEKLHG-DMLEMILSSEKGRLPE
. ...:. ::..:.:: ..... .:.. : ..:.: ..: .... ..... :: :
CCDS33 DPALNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDA-EDYYIVLELMEGGELFDKVVGNK--RLKE
310 320 330 340 350 360
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 HITKFLITQILVALRHLHFKNIVHCDLKPENVLLASADPFPQVKLCDFGFARIIGEKSFR
:. . :.:.:...:: ..:.: :::::::::.: . .:. ::: ..:.:: :.
CCDS33 ATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLM
370 380 390 400 410 420
750 760 770 780 790
pF1KE2 RSVVGTPAYLAPEVLRN---KGYNRSLDMWSVGVIIYVSLSGTFPFNEDE---DIHDQIQ
:.. :::.::::::: . ::::..: ::.:::... ::: ::.: . ...:::
CCDS33 RTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQIT
430 440 450 460 470 480
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 NAAFMYPPNPWKEISHEAIDLINNLLQVKMRKRYSVDKTLSHPWLQDYQTWLDLRELECK
.. . . :. : :.:..:.::...:: : . :......: ::::::
CCDS33 SGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSE
490 500 510 520 530 540
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pF1KE2 IGERYITHESDDLRWEKYAGEQGLQYPTHLINPSASHSDTPETEETEMKALGERVSIL
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CCDS70 LVMQLVSGGELFDRIV--EKGFYTEKDASTLIRQVLDAVYYLHRMGIVHRDLKPENLLYY
100 110 120 130 140 150
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]