FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2188, 423 aa
1>>>pF1KE2188 423 - 423 aa - 423 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9127+/-0.000856; mu= 20.0739+/- 0.052
mean_var=75.0604+/-15.536, 0's: 0 Z-trim(107.8): 71 B-trim: 192 in 1/48
Lambda= 0.148036
statistics sampled from 9735 (9814) to 9735 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 2.690
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 474) 606 138.8 1e-32
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CCDS82565.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 439) 538 124.3 2.3e-28
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CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 273 68.0 4.3e-11
>>CCDS5432.1 GHRHR gene_id:2692|Hs108|chr7 (423 aa)
initn: 2954 init1: 2954 opt: 2954 Z-score: 3411.5 bits: 640.3 E(32554): 1.1e-183
Smith-Waterman score: 2954; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDRRMWGAHVFCVLSPLPTVLGHMHPECDFITQLREDESACLQAAEEMPNTTLGCPATWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MDRRMWGAHVFCVLSPLPTVLGHMHPECDFITQLREDESACLQAAEEMPNTTLGCPATWD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GLLCWPTAGSGEWVTLPCPDFFSHFSSESGAVKRDCTITGWSEPFPPYPVACPVPLELLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GLLCWPTAGSGEWVTLPCPDFFSHFSSESGAVKRDCTITGWSEPFPPYPVACPVPLELLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EEESYFSTVKIIYTVGHSISIVALFVAITILVALRRLHCPRNYVHTQLFTTFILKAGAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EEESYFSTVKIIYTVGHSISIVALFVAITILVALRRLHCPRNYVHTQLFTTFILKAGAVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LKDAALFHSDDTDHCSFSTVLCKVSVAASHFATMTNFSWLLAEAVYLNCLLASTSPSSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKDAALFHSDDTDHCSFSTVLCKVSVAASHFATMTNFSWLLAEAVYLNCLLASTSPSSRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AFWWLVLAGWGLPVLFTGTWVSCKLAFEDIACWDLDDTSPYWWIIKGPIVLSVGVNFGLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AFWWLVLAGWGLPVLFTGTWVSCKLAFEDIACWDLDDTSPYWWIIKGPIVLSVGVNFGLF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LNIIRILVRKLEPAQGSLHTQSQYWRLSKSTLFLIPLFGIHYIIFNFLPDNAGLGIRLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LNIIRILVRKLEPAQGSLHTQSQYWRLSKSTLFLIPLFGIHYIIFNFLPDNAGLGIRLPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 ELGLGSFQGFIVAILYCFLNQEVRTEISRKWHGHDPELLPAWRTRAKWTTPSRSAAKVLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ELGLGSFQGFIVAILYCFLNQEVRTEISRKWHGHDPELLPAWRTRAKWTTPSRSAAKVLT
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SMC
:::
CCDS54 SMC
>>CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 (457 aa)
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Smith-Waterman score: 1233; 45.5% identity (72.8% similar) in 404 aa overlap (14-412:23-422)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MDRRMWGAHVFCVLSPLPTVLGHMHPECDFITQLREDESACLQAAEEMPNT
:.: .... :::.. ... ... ::. :. . :
CCDS26 MRPPSPLPARWLCVLAGALAWALGPAGGQAARLQEECDYVQMIEVQHKQCLEEAQ-LENE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE2 TLGCPATWDGLLCWPTAGSGEWVTLPCPDFFSHFSSESG-AVKRDCTITGWSEPFP-PYP
:.:: ::.: :::.. :. :.: :: .:. ::: .: :.:.:: ::.. : :::
CCDS26 TIGCSKMWDNLTCWPATPRGQVVVLACPLIFKLFSSIQGRNVSRSCTDEGWTHLEPGPYP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 VACPVPLEL--LAEEESYF-STVKIIYTVGHSISIVALFVAITILVALRRLHCPRNYVHT
.:: . . : :....: ..:: ::.:...:...:.:: .:: .:.::: :::.:
CCDS26 IACGLDDKAASLDEQQTMFYGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHM
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 QLFTTFILKAGAVFLKDAALFHSDDTDHCSFSTVLCKVSVAASHFATMTNFSWLLAEAVY
.:: .:::.:.:::.:: ::: : ..:.:: ..: ::.... .. .:.:: :::.:..:
CCDS26 HLFISFILRAAAVFIKDLALFDSGESDQCSEGSVGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LNCLLASTSPSSRRAFWWLVLAGWGLPVLFTGTWVSCKLAFEDIACWDLDDTSPYWWIIK
: ::: . : :. :: .: :::.: :: .:. .. ::: .::: ..: :::::
CCDS26 LYTLLAVSFFSERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWDTINSS-LWWIIK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 GPIVLSVGVNFGLFLNIIRILVRKLEPAQGSLHTQSQYWRLSKSTLFLIPLFGIHYIIFN
:::. :. ::: ::. :::::..::.: . .: : ::..:::.::::::.:::.:
CCDS26 GPILTSILVNFILFICIIRILLQKLRPPDIRKSDSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 FLPDNAGLGIRLPLELGLGSFQGFIVAILYCFLNQEVRTEISRKWHGHDPELLPAWRTRA
:.::: ... .:: .::::::.::::::::: ::..:. :::. . . .:
CCDS26 FFPDNFKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHLQGVLGWN--P
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE2 KWTTPSRSAAKVLTSMC
:. ::
CCDS26 KYRHPSGGSNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
420 430 440 450
>>CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 (416 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KE2 FCVLSPLPTVLGHMHPECDFITQLREDESACLQAAEEMPNTTLGCPATWDGLLCWPTAGS
::. :. . : :.:: ::.: :::..
CCDS58 MIEVQHKQCLEEAQ-LENETIGCSKMWDNLTCWPATPR
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KE2 GEWVTLPCPDFFSHFSSESG-AVKRDCTITGWSEPFP-PYPVACPVPLEL--LAEEESYF
:. :.: :: .:. ::: .: :.:.:: ::.. : :::.:: . . : :....:
CCDS58 GQVVVLACPLIFKLFSSIQGRNVSRSCTDEGWTHLEPGPYPIACGLDDKAASLDEQQTMF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 -STVKIIYTVGHSISIVALFVAITILVALRRLHCPRNYVHTQLFTTFILKAGAVFLKDAA
..:: ::.:...:...:.:: .:: .:.::: :::.: .:: .:::.:.:::.:: :
CCDS58 YGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRAAAVFIKDLA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LFHSDDTDHCSFSTVLCKVSVAASHFATMTNFSWLLAEAVYLNCLLASTSPSSRRAFWWL
:: : ..:.:: ..: ::.... .. .:.:: :::.:..:: ::: . : :. ::
CCDS58 LFDSGESDQCSEGSVGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLYLYTLLAVSFFSERKYFWGY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VLAGWGLPVLFTGTWVSCKLAFEDIACWDLDDTSPYWWIIKGPIVLSVGVNFGLFLNIIR
.: :::.: :: .:. .. ::: .::: ..: ::::::::. :. ::: ::. :::
CCDS58 ILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWDTINSS-LWWIIKGPILTSILVNFILFICIIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 ILVRKLEPAQGSLHTQSQYWRLSKSTLFLIPLFGIHYIIFNFLPDNAGLGIRLPLELGLG
::..::.: . .: : ::..:::.::::::.:::.: :.::: ... .:: .:
CCDS58 ILLQKLRPPDIRKSDSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFAFFPDNFKPEVKMVFELVVG
280 290 300 310 320 330
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pF1KE2 SFQGFIVAILYCFLNQEVRTEISRKWHGHDPELLPAWRTRAKWTTPSRSAAKVLTSMC
:::::.::::::::: ::..:. :::. . . .: :. ::
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CCDS58 MLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
400 410
>>CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 (447 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MDRRMWGAHVFCVLSPLPTVLGHMHPECDFITQLREDESACL---QAAEEM---PNTTLG
:: .: : ..... :: : :.:. ... :
CCDS56 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIF----KKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPG
10 20 30 40 50
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pF1KE2 CPATWDGLLCWPTAGSGEWVTLPCPDFFSHFSSES--GAVKRDCTITGWSEPFPPYPVAC
::. ::.. :: : :: : . ::..: :. .. :.:.:.:: ::::::: : ::
CCDS56 CPGMWDNITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQDMGVVSRNCTEDGWSEPFPHYFDAC
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 PVPLELLAE---EESYFSTVKIIYTVGHSISIVALFVAITILVALRRLHCPRNYVHTQLF
: .: .. :. .:: .::::.: :.:.: .:..:: .:.::: ::..: .::
CCDS56 GFD-EYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRKLHCTRNFIHMNLF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 TTFILKAGAVFLKDAALFHSDDTDHCSFSTVLCKVSVAASHFATMTNFSWLLAEAVYLNC
..:.:.: .::.:: :. .:..:: .::: ::. .. :. ...:. ::. :..::
CCDS56 VSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVFFHYCVVSNYFWLFIEGLYLFT
180 190 200 210 220 230
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::. : :: :.: .. ::: :.. . .:.. .: :.: .:::..:.. ::.::::.
CCDS56 LLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMNDSTALWWVIKGPV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
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: :. ::: ::..:: :::.::. : .:. . .: : ::..:::.::::::::: .: :
CCDS56 VGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGG-NESSIYLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 PDNAGLGIRLPLELGLGSFQGFIVAILYCFLNQEVRTEISRKWHGHDPELLPAWRTRAKW
:.:.. :: .::::::::::.::.:::::: ::..::.:::
CCDS56 PENVSKRERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRH
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE2 TTPSRSAAKVLTSMC
CCDS56 PSLASSGVNGGTQLSILSKSSSQIRMSGLPADNLAT
420 430 440
>>CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 (409 aa)
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Smith-Waterman score: 1170; 47.7% identity (73.0% similar) in 363 aa overlap (54-412:15-374)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 MHPECDFITQLREDESACLQAAEEMPNTTLGCPATWDGLLCWPTAGSGEWVTLPCPDFFS
:: ::.: :::.. :. :.: :: .:.
CCDS58 MRAGRRPRLGPWAGGCSKMWDNLTCWPATPRGQVVVLACPLIFK
10 20 30 40
90 100 110 120 130
pF1KE2 HFSSESG-AVKRDCTITGWSEPFP-PYPVACPVPLEL--LAEEESYFSTVKIIYTVGHSI
::: .: :.:.:: ::.. : :::.:: . . : :. ....:: ::.:...
CCDS58 LFSSIQGRNVSRSCTDEGWTHLEPGPYPIACGLDDKAASLDEQTMFYGSVKTGYTIGYGL
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 SIVALFVAITILVALRRLHCPRNYVHTQLFTTFILKAGAVFLKDAALFHSDDTDHCSFST
:...:.:: .:: .:.::: :::.: .:: .:::.:.:::.:: ::: : ..:.:: ..
CCDS58 SLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRAAAVFIKDLALFDSGESDQCSEGS
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 VLCKVSVAASHFATMTNFSWLLAEAVYLNCLLASTSPSSRRAFWWLVLAGWGLPVLFTGT
: ::.... .. .:.:: :::.:..:: ::: . : :. :: .: :::.: :: .
CCDS58 VGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLYLYTLLAVSFFSERKYFWGYILIGWGVPSTFTMV
170 180 190 200 210 220
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pF1KE2 WVSCKLAFEDIACWDLDDTSPYWWIIKGPIVLSVGVNFGLFLNIIRILVRKLEPAQGSLH
:. .. ::: .::: ..: ::::::::. :. ::: ::. :::::..::.: .
CCDS58 WTIARIHFEDYGCWDTINSS-LWWIIKGPILTSILVNFILFICIIRILLQKLRPPDIRKS
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 TQSQYWRLSKSTLFLIPLFGIHYIIFNFLPDNAGLGIRLPLELGLGSFQGFIVAILYCFL
.: : ::..:::.::::::.:::.: :.::: ... .:: .::::::.::::::::
CCDS58 DSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFAFFPDNFKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFL
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420
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: ::..:. :::. . . .: :. ::
CCDS58 NGEVQAELRRKWRRWHLQGVLGWNP--KYRHPSGGSNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSS
350 360 370 380 390 400
CCDS58 FQAEVSLV
>>CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 (438 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MDRRMWGAHVFC-VLSPLPTVLGHMHPECDFITQLREDESACLQAAEEMPNTTLGCPATW
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CCDS59 MRTLLPPALLTCWLLAPVNSI----HPECRFHLEIQEEETKCAELLRSQTEKHKACSGVW
10 20 30 40 50
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:.. :: :. :: ::.::: ::.: :..: ....:: :::: :: . ::
CCDS59 DNITCWRPANVGETVTVPCPKVFSNFYSKAGNISKNCTSDGWSETFPDFVDACGYSDPED
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 AEEESYFSTVKIIYTVGHSISIVALFVAITILVALRRLHCPRNYVHTQLFTTFILKAGAV
. ... :: :::.:.:.:...: .. :: .:.::: :::.: .:: .:::.: .:
CCDS59 ESKITFYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIILCLFRKLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
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..:: .:. :. : :: : : ::.:.. .. :.:: :::.:..::. ::.. :
CCDS59 LVKDDVLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQYCIMANFFWLLVEGLYLHTLLVAMLP
180 190 200 210 220 230
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CCDS59 P-RRCFLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVN
240 250 260 270 280 290
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CCDS59 QILFELCLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGS
360 370 380 390 400 410
420
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.
CCDS59 EGALQFHRGSRAQSFLQTETSVI
420 430
>>CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs108|chr2 (440 aa)
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10 20 30 40 50
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: . :: . : :... ::: . . ::
CCDS21 MRPHLSPPLQQLLLPVLLACAAHSTGALPRLCDVLQVLWEEQDQCLQELSREQTGDLGTE
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pF1KE2 -----CPATWDGLLCWPTAGSGEWVTLPCPDFFSHFSSESGAVKRDCTITGWSEPFPPYP
: . ::.. :::.. :. : . :: :. ..:..:.. :.:: :::: ::
CCDS21 QPVPGCEGMWDNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLRMLTSRNGSLFRNCTQDGWSETFPRPN
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110 120 130 140 150 160
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.:: : .. ..:. ::. .:..::::.: :.: :.::. :: :.::::: :::.: .
CCDS21 LACGVNVNDSSNEKRHSYLLKLKVMYTVGYSSSLVMLLVALGILCAFRRLHCTRNYIHMH
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170 180 190 200 210 220
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::..:::.: . :.:::.:: :::. .:. . ::. .. .. :.:.::::.:..::
CCDS21 LFVSFILRALSNFIKDAVLFSSDDVTYCDAHRAGCKLVMVLFQYCIMANYSWLLVEGLYL
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230 240 250 260 270 280
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. ::: . : :. . .: ::: :..:.. :. . .::..:::.. .. ::::.:
CCDS21 HTLLAISFFSERKYLQGFVAFGWGSPAIFVALWAIARHFLEDVGCWDINANASIWWIIRG
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290 300 310 320 330 340
pF1KE2 PIVLSVGVNFGLFLNIIRILVRKLEPAQGSLHTQSQYWRLSKSTLFLIPLFGIHYIIFNF
:..::. .:: ::.::.:::.:::. . . :.: ::..:::.::::::::::.: :
CCDS21 PVILSILINFILFINILRILMRKLRTQETRGNEVSHYKRLARSTLLLIPLFGIHYIVFAF
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350 360 370 380 390 400
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:..: . :.: .::.::::::..::.:::::: ::. :...::.
CCDS21 SPEDA-MEIQLFFELALGSFQGLVVAVLYCFLNGEVQLEVQKKWQQWHLREFPLHPVASF
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410 420
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CCDS21 SNSTKASHLEQSQGTCRTSII
420 430 440
>>CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 (468 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MDRRMWGAHVFCVLSPLPTVLGHMHPECDFITQLREDESACL---QAAEEM---PNTTLG
:: .: : ..... :: : :.:. ... :
CCDS54 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIF----KKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPG
10 20 30 40 50
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pF1KE2 CPATWDGLLCWPTAGSGEWVTLPCPDFFSHFS-----------------------SESGA
::. ::.. :: : :: : . ::..: :. :. :.
CCDS54 CPGMWDNITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGV
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 VKRDCTITGWSEPFPPYPVACPVPLELLAE---EESYFSTVKIIYTVGHSISIVALFVAI
:.:.:: ::::::: : :: : .: .. :. .:: .::::.: :.:.: .:.
CCDS54 VSRNCTEDGWSEPFPHYFDACGFD-EYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAM
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150 160 170 180 190 200
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.:: .:.::: ::..: .::..:.:.: .::.:: :. .:..:: .::: ::. ..
CCDS54 VILCRFRKLHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVF
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
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:. ...:. ::. :..:: ::. : :: :.: .. ::: :.. . .:.. .: :.
CCDS54 FHYCVVSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFD
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270 280 290 300 310 320
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: .:::..:.. ::.::::.: :. ::: ::..:: :::.::. : .:. . .: : ::
CCDS54 DTGCWDMNDSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGG-NESSIYLRL
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
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CCDS54 ARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEI
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.:::
CCDS54 KRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKSSSQIRMSGLPADNLAT
420 430 440 450 460
>>CCDS78295.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 (422 aa)
initn: 794 init1: 573 opt: 883 Z-score: 1021.1 bits: 198.0 E(32554): 1.5e-50
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pF1KE2 VKRDCTITGWSEPFPPYPVACPVPLELLAEEESYFSTVKIIYTVGHSISIVALFVAITIL
: ... :: :::.:.:.:...: .. ::
CCDS78 IGSSSDGNGDSKAATERVVSAMDTVRRKHPEITFYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIIL
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.:.::: :::.: .:: .:::.: .:..:: .:. :. : :: : : ::.:..
CCDS78 CLFRKLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISVLVKDDVLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVF
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 SHFATMTNFSWLLAEAVYLNCLLASTSPSSRRAFWWLVLAGWGLPVLFTGTWVSCKLAFE
.. :.:: :::.:..::. ::.. : :: : .: :::::.. :.:.. .: .:
CCDS78 LQYCIMANFFWLLVEGLYLHTLLVAMLPP-RRCFLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLE
200 210 220 230 240 250
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pF1KE2 DIACWDLDDTSPYWWIIKGPIVLSVGVNFGLFLNIIRILVRKLEPAQGSLHTQSQYWRLS
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CCDS78 DTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFISIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQYKRLA
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CCDS78 RKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGALQFHRGSRAQSFLQTETSVI
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>>CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 (466 aa)
initn: 709 init1: 311 opt: 801 Z-score: 925.9 bits: 180.5 E(32554): 3e-45
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pF1KE2 MWGAHVFCVLSPLPTVLGHMHPECDFITQLREDESACLQAAEEMPNTTLGCPATWDGLLC
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CCDS12 LSLCGLLLQRAETGSKGQTAGELYQRWERYRRECQETLAAAE--PPSGLACNGSFDMYVC
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CCDS12 WDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQWGLWRDHTQCENPEKNEAFLDQ
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. . ....::::.:.:...:..:. :: .::::: :::.: .:::.:.:.:.:.. .
CCDS12 RLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTRNYIHINLFTSFMLRAAAILSR
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pF1KE2 DAALFHSD----DTDHCSFSTVL--CKVSVAASHFATMTNFSWLLAEAVYLNCLLASTSP
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CCDS12 DRLLPRPGPYLGDQALALWNQALAACRTAQIVTQYCVGANYTWLLVEGVYLHSLLVLVGG
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CCDS12 SEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENTQCWERNEVKAIWWIIRTPILMTILIN
260 270 280 290 300 310
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CCDS12 FLIFIRILGILLSKLRTRQ--MRCRDYRLRLARSTLTLVPLLGVHEVVFAPVTEEQARGA
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.: .:. :.:::::.:..::::.:.::..:: : ::
CCDS12 LRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRRGWHHCRLRRSLGEEQRQLPERAF
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420
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CCDS12 RALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELESYC
430 440 450 460
423 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 16:24:40 2016 done: Sun Nov 6 16:24:40 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]