Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2301
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2301, 2177 aa
1>>>pF1KE2301 2177 - 2177 aa - 2177 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1047+/-0.00125; mu= -5.3890+/- 0.075
mean_var=432.4071+/-88.146, 0's: 0 Z-trim(112.6): 114 B-trim: 14 in 1/53
Lambda= 0.061678
statistics sampled from 13264 (13359) to 13264 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.41), width: 16
Scan time: 7.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43970.1 MED12 gene_id:9968|Hs108|chrX (2177) 14683 1323.0 0
CCDS33876.1 MED12L gene_id:116931|Hs108|chr3 (2145) 2175 210.0 9.1e-53
>>CCDS43970.1 MED12 gene_id:9968|Hs108|chrX (2177 aa)
initn: 14683 init1: 14683 opt: 14683 Z-score: 7075.8 bits: 1323.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 14683; 100.0% identity (100.0% similar) in 2177 aa overlap (1-2177:1-2177)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 NVSFNPAKISSNFSSIIAEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NVSFNPAKISSNFSSIIAEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AGTKPLTQLAKKVPIFSKKEEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAISETKVKKRHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AGTKPLTQLAKKVPIFSKKEEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAISETKVKKRHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DPFMEWTQIITKYLWEQLQKMAEYYRPGPAGSGGCGSTIGPLPHDVEVAIRQWDYTEKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DPFMEWTQIITKYLWEQLQKMAEYYRPGPAGSGGCGSTIGPLPHDVEVAIRQWDYTEKLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 MFMFQDGMLDRHEFLTWVLECFEKIRPGEDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MFMFQDGMLDRHEFLTWVLECFEKIRPGEDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAYF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CTRRLALQLDGVSSHSSHVISAQSTSTLPTTPAPQPPTSSTPSTPFSDLLMCPQHRPLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CTRRLALQLDGVSSHSSHVISAQSTSTLPTTPAPQPPTSSTPSTPFSDLLMCPQHRPLVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIKTGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIKTGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 CNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGRHRAMVVAKLLEKRQAEIEAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGRHRAMVVAKLLEKRQAEIEAER
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 CGESEAADEKGSIASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTDPRSESERVEFFNLVLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CGESEAADEKGSIASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTDPRSESERVEFFNLVLLF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 CELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGAPGPRPPSPFDDPADDPEHKEAEGSSSSKLEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGAPGPRPPSPFDDPADDPEHKEAEGSSSSKLEDP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKEVKPPPKEKIEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKEVKPPPKEKIEG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 TLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITKDILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITKDILK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 QHQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QHQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 SVVEAELLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SVVEAELLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 RSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKNKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKNKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 FMIDTLENPAAHTFTYTGLGKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FMIDTLENPAAHTFTYTGLGKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 LTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 LLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEPGARLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDGNKPTVGIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEPGARLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDGNKPTVGIR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 SSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAELKGSGFTVTGGTEELPEEEGGGGSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAELKGSGFTVTGGTEELPEEEGGGGSGG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 RRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSICQQEWVGERCLKSLCEDSNDLQDPVLSSAQAQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSICQQEWVGERCLKSLCEDSNDLQDPVLSSAQAQRL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 MQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTMRQSSLELQLMIKQTPNNEMNSLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTMRQSSLELQLMIKQTPNNEMNSLLE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 NIAKATIEVFQRSAETGSSSGSTASNMPSSSKTKPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQ
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NIAKATIEVFQQSAETGSSSGSTASNMPSSSKTKPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 GHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 TSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAML
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 LLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLAKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLAKKL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 QKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 TKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLE
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 PLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPEPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPEPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTE
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 DYGMGPGRSGPYGVTVPPDLLHHPNPGSITHLNYRQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DYGMGPGRSGPYGVTVPPDLLHHPNPGSITHLNYRQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRP
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 VRLPMQKLPTRPTYPGVLPTTMTGVMGLEPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQQSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VRLPMQKLPTRPTYPGVLPTTMTGVMGLEPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQQSQG
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 MLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYTPYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYTPYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPST
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE2 NPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTSTQRFSHQTLQQTPMISTMTPMSAQGVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTSTQRFSHQTLQQTPMISTMTPMSAQGVQA
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE2 GVRSTAILPEQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQYHIRQQQQQQILRQQQQQQQQQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GVRSTAILPEQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQYHIRQQQQQQILRQQQQQQQQQQQ
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE2 QQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQQQAAPPQPQPQSQPQFQRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQQQAAPPQPQPQSQPQFQRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQQ
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170
pF1KE2 QLSNTQPQPSTNIFGRY
:::::::::::::::::
CCDS43 QLSNTQPQPSTNIFGRY
2170
>>CCDS33876.1 MED12L gene_id:116931|Hs108|chr3 (2145 aa)
initn: 7659 init1: 1845 opt: 2175 Z-score: 1060.8 bits: 210.0 E(32554): 9.1e-53
Smith-Waterman score: 8239; 59.7% identity (78.7% similar) in 2246 aa overlap (1-2175:1-2140)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAK
:::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: .:::::::.
CCDS33 MAAFGLLSYEQRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTAVNVKQGFNNQPAFTGDEHGSAR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 NVSFNPAKISSNFSSIIAEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDL
:. .::.::.. ::::.::::. ::. :::..::::: :::.:::::::::::..::.::
CCDS33 NIVINPSKIGAYFSSILAEKLKLNTFQDTGKKKPQVNAKDNYWLVTARSQSAIHSWFSDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AGTKPLTQLAKKVPIFSKKEEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAISETKVKKRHV
::.:::. :::::::.::::.::.:::::.::..::.::::::::::.::::.:.:::..
CCDS33 AGNKPLSILAKKVPILSKKEDVFAYLAKYSVPMVRATWLIKMTCAYYSAISEAKIKKRQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE2 -DPFMEWTQIITKYLWEQLQKMAEYYRPGPAGSGGCGSTIGPLPHDVEVAIRQWDYTEKL
:: .::::: :.:: ::: :....:. :.: : : . :.: .:: :..::.:.:::
CCDS33 PDPNLEWTQISTRYLREQLAKISDFYHM--ASSTGDGPV--PVPPEVEQAMKQWEYNEKL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 AMFMFQDGMLDRHEFLTWVLECFEKIRPGEDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAY
:. :::.:::..::.:::.:. .::::: .:.::::::::.:.:: ::::::::::::::
CCDS33 AFHMFQEGMLEKHEYLTWILDVLEKIRPMDDDLLKLLLPLMLQYSDEFVQSAYLSRRLAY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FCTRRLALQLDG----VSSHSSHVISAQSTSTLPT-TPAPQPPTSSTPSTPFSDLLMCPQ
::.:::.: :. ...:: :.. . ..:.. . .:.: : : . :::.: : :
CCDS33 FCARRLSLLLSDSPNLLAAHSPHMMIGPNNSSIGAPSPGPPGPGMSPVQLAFSDFLSCAQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 HRPLVFGLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSR-IKTGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAF
: :::.::::.:::. :::::::::.:: .... . ::::: : .:::.:::: ::.::
CCDS33 HGPLVYGLSCMLQTVTLCCPSALVWNYSTNENKSANPGSPLDLLQVAPSSLPMPGGNTAF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 TQQVRAKLREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDF
.:::::.. :.:::::.::.:::::::::::::.::: ::.:::::::::: : :.:.:
CCDS33 NQQVRARIYEVEQQIKQRGRAVEVRWSFDKCQESTAGVTISRVLHTLEVLDRHCFDRTDS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 SNSLDSLCNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGRHRAMVVAKLLEKRQ
:::...: ..:: . .::..:.. .:.:::.:::::::::::::.::::.:::::::::
CCDS33 SNSMETLYHKIFWANQNKDNQEVAPNDEAVVTLLCEWAVSCKRSGKHRAMAVAKLLEKRQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 AEIEAERCGESEAADEKGSIASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTDPRSESERVEF
::::::::::::. ::: ::.:.::.. : :.::.:::.::::::: :.:: :: :.:::
CCDS33 AEIEAERCGESEVLDEKESISSSSLAGSSLPVFQNVLLRFLDTQAPSLSDPNSECEKVEF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 FNLVLLFCELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGAPGPRPPSPFDDPADDPEHKEAEGSS
::::::::.::::::::. : :::::::::. : . :: :: . :: ::
CCDS33 VNLVLLFCEFIRHDVFSHDAYMCTLISRGDLSVTA-STRPRSPVGENAD--EH-------
600 610 620 630 640
660 670 680 690 700
pF1KE2 SSKLEDPGLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMP---CEGKGSPSPEKPDV--EK
:.. :. :: .::: :: ::. .. .. .: ::
CCDS33 --------YSKDHDVK---------ME-----IFSP-MPGESCENANTSLGRRMSVNCEK
650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 EVK-PPPKEKIEGTLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDA
:: :.: : . :: ::.::::::::: .:: ::::::: ..:.::::.::.:
CCDS33 LVKREKPRELIFPSN---YDLLRHLQYATHFPIPLDESSSHECNQRTILLYGVGKERDEA
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 RHAIKKITKDILKVLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAE
:: .:::::::::.::.:.:.:: :..::: :.:. :.::: :
CCDS33 RHQLKKITKDILKILNKKSTTETGV----------------GDEGQKARKNKQETFPTLE
750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 DIFAKFQHLSHYDQHQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSIS
.:.:.: ::..::::::.:.: :::::::::: : ::::::..:.:.:::::: .:.:.
CCDS33 TVFTKLQLLSYFDQHQVTSQISNNVLEQITSFASGTSYHLPLAHHIQLIFDLMEPALNIN
790 800 810 820 830 840
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 GLIDFAIQLLNELSVVEAELLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQV
:::::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:::::::.::.::::: :: :::
CCDS33 GLIDFAIQLLNELSVVEAELLLKSSSLAGSYTTGLCVCIVAVLRRYHSCLILNPDQTAQV
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pF1KE2 FEGLCGVVKHGMNRSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKNKFGELFSDFCSKVKNTIYCN
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CCDS33 FEGLCGVVKHVVNPSECSSPERCILAYLYDLYVSCSHLRSKFGDLFSSACSKVKQTIYNN
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pF1KE2 VEPSESNMRWAPEFMIDTLENPAAHTFTYTGLGKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHD
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CCDS33 VMPANSNLRWDPDFMMDFIENPSARSINYSMLGKILSDNAANRYSFVCNTLMNVCMGHQD
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CCDS33 LATFIAILIARQCFSLEDVVQHVALPSLLAAACGDADAEPGARMTCRLLLHLFRAPQACF
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CCDS33 LPQATGKPFPGIRSSCDRHLLAAAHNSIEVGAVFAVLKAIMMLGDAKIGNNSVSSLKNDD
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CCDS33 FTMRGLRCDGNADDIWTASQNPKSCGKSISIETANLREYARYVLRTICQQEWVGEHCLKE
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pF1KE2 ---LCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTM
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CCDS33 LFTTVLDMLGVLINGTLASDLSNASPGGSEENKRAYMNLVKKLKKELGDKRSESIDKVRQ
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CCDS33 LLPLPKQTCDVITCEPMGSLIDTKGNKIAGFDSIDKKQGLQVSTKQKVSPWDLFEGQKNP
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CCDS33 APLSWAWFGTVRVDRRVIKYEEQHHLLLYHTHPMPKPRSYYLQPLPLPPEEEEEEPTSPV
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CCDS33 SQEPERKSAE--LSDQ---GKTTTDEEKK--TKGRKRKTKSSSRVDEYPQSNIYRVPPNY
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pF1KE2 VTVPPDLLHHPNPGSITHLNY--RQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRPVRLPMQKLPTR
. ...:::. ... : . . :.. ::: : :: :.:: .: . :.
CCDS33 SPISSQMMHHPQ-STLWGYNLVGQPQQPGFFLQNQSLTPGGSRLDPAGSF-VPTN---TK
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pF1KE2 PTYPGVLPTTMTGVMGLEPSSYKTSVYRQQQPAVP-----QGQRLRQQLQQ---SQGMLG
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CCDS33 QALSNMLQRR-SGAM-MQPPSLHAITSQQQLIQMKLLQQQQQQRLLRQAQTRPFQQGQPG
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pF1KE2 -QSSVH--QMTPSSSY----GLQTSQ----GYTPYVSHVGLQQHTGP-AGTMV-PPSYSS
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CCDS33 DQAALFAAQARPSPQLPQYPGLQQAQTMPQGYTMYGTQMPLQQTSQQQAGSVVLSPSYNS
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pF1KE2 QPYQSTHPSTNPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGLTSTQRFSHQTLQQTPMISTM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]