Result of FASTA (ccds) for pF1KE2310
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2310, 1308 aa
  1>>>pF1KE2310 1308 - 1308 aa - 1308 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4396+/-0.00166; mu= 9.0243+/- 0.098
 mean_var=391.1409+/-85.889, 0's: 0 Z-trim(108.5): 549  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.064850
 statistics sampled from 9614 (10276) to 9614 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.316), width:  16
 Scan time:  5.010

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2           (1308) 9147 872.5       0
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2          (1292) 7348 704.2 5.9e-202
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1255) 3812 373.3 2.2e-102
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1240) 3808 372.9 2.9e-102
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1055) 3798 371.9 5.1e-102
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1225) 3776 369.9 2.3e-101
CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs108|chr12         (1342) 3601 353.6   2e-96
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7            (1210) 3166 312.8 3.4e-84
CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7            ( 628) 2194 221.5 5.7e-57
CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7            ( 705) 2194 221.6 6.1e-57
CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         ( 603) 1655 171.0 8.4e-42
CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7           ( 405) 1353 142.5 2.2e-33
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8           (1009)  767 88.3 1.1e-16
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8           (1065)  766 88.2 1.3e-16
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8            (1052)  756 87.3 2.4e-16
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             ( 542)  731 84.5 8.4e-16
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8           ( 967)  732 85.0 1.1e-15
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1            ( 976)  732 85.0 1.1e-15
CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3          (1038)  731 84.9 1.2e-15
CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3          (1040)  731 84.9 1.2e-15
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1043)  731 84.9 1.2e-15
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1058)  731 84.9 1.2e-15
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1064)  731 84.9 1.2e-15
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1079)  731 85.0 1.2e-15
CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3          (1086)  731 85.0 1.2e-15
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1161)  731 85.0 1.3e-15
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1167)  731 85.0 1.3e-15
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1182)  731 85.0 1.3e-15
CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9            ( 612)  715 83.1 2.5e-15
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3          ( 984)  719 83.8 2.5e-15
CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9             ( 635)  715 83.1 2.6e-15
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9             (1130)  717 83.7 3.1e-15
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9             (1149)  717 83.7 3.1e-15
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2           ( 986)  710 82.9 4.5e-15
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3           ( 983)  704 82.4 6.7e-15
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2          ( 312)  687 80.0 1.1e-14
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1004)  695 81.5 1.2e-14
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1015)  695 81.5 1.2e-14
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1016)  695 81.5 1.2e-14
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1037)  695 81.6 1.2e-14
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1038)  695 81.6 1.2e-14
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7           ( 976)  691 81.1 1.5e-14
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2          ( 619)  687 80.5 1.6e-14
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 986)  687 80.8   2e-14
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 987)  687 80.8   2e-14
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7           ( 987)  687 80.8   2e-14
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1          (1055)  687 80.8 2.1e-14
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7            (1390)  685 80.8 2.8e-14
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7            (1408)  685 80.8 2.8e-14
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4             ( 631)  678 79.6 2.8e-14


>>CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2                (1308 aa)
 initn: 9147 init1: 9147 opt: 9147  Z-score: 4648.8  bits: 872.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9147; 100.0% identity (100.0% similar) in 1308 aa overlap (1-1308:1-1308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LNYRKDGNFGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LNYRKDGNFGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVST
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 NGSSGCGRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 NGSSGCGRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 PKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVVD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 KINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 KINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFST
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 INQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 INQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 GEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 GEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 NSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 NSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 LFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 VKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 VRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 HRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 HRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 SDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMID
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 ADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 ADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 EYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQFVYRDGGFAAEQGVSVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 EYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQFVYRDGGFAAEQGVSVP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 YRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 PRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAED
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 EYVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 EYVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQ
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300        
pF1KE2 EYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 EYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
             1270      1280      1290      1300        

>>CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2               (1292 aa)
 initn: 7328 init1: 7328 opt: 7348  Z-score: 3739.2  bits: 704.2 E(32554): 5.9e-202
Smith-Waterman score: 8988; 98.8% identity (98.8% similar) in 1308 aa overlap (1-1308:1-1292)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LNYRKDGNFGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LNYRKDGNFGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVST
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 NGSSGCGRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NGSSGCGRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 PKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVVD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 KINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFST
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 INQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 INQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 GEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 NSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 LFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 VKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 VRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 HRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 SDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMID
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 ADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 EYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQFVYRDGGFAAEQGVSVP
       :::::::::::::::::::::::::                :::::::::::::::::::
CCDS42 EYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNR----------------NQFVYRDGGFAAEQGVSVP
             1030      1040                      1050      1060    

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 YRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERS
         1070      1080      1090      1100      1110      1120    

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 PRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAED
         1130      1140      1150      1160      1170      1180    

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 EYVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EYVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQ
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

             1270      1280      1290      1300        
pF1KE2 EYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
         1250      1260      1270      1280      1290  

>>CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17              (1255 aa)
 initn: 3489 init1: 1665 opt: 3812  Z-score: 1951.4  bits: 373.3 E(32554): 2.2e-102
Smith-Waterman score: 3932; 47.2% identity (70.3% similar) in 1303 aa overlap (10-1285:9-1249)

               10        20         30        40        50         
pF1KE2 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQP-SDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVV
                : .::.:   . : . : .::.::. ::   .. : .   ::. :..:.::
CCDS32  MELAALCRW-GLLLA--LLPPGAASTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVV
                 10          20        30        40        50      

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE2 MGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAI
       .::::.: .  : .::::....:: ::::.: :: : .::. :::.:::.:.:: ::::.
CCDS32 QGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAV
         60        70        80        90       100       110      

     120                130       140       150       160       170
pF1KE2 FLNYRKDGNF---------GLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNP
       . :    .:          ::.:: :..:::::.::: ...:  ::: ::: :.:: .. 
CCDS32 LDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKN
        120       130       140       150       160       170      

              180       190        200       210       220         
pF1KE2 WPSNLTLVSTNGSSGCGRCHKSCTG-RCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDC
           :::..:: : .:  :   : : :::: . . ::.:::::::  : .:: ::  .::
CCDS32 NQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGC-ARCKGPLPTDC
        180       190       200       210       220        230     

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE2 CHRECAGGCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFC
       ::..::.::.::: .::.::..:: :: :  .::   .::  ::.   : ...::.:: :
CCDS32 CHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASC
         240       250       260       270       280       290     

     290        300       310        320       330       340       
pF1KE2 VKKCPHNFV-VDSSSCVRACPSSKMEVE-ENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQT
       :  ::.:.. .: .::. .::  ..::  :.: . :. :.  : ..: :.:   :  ...
CCDS32 VTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRA
         300       310       320       330       340       350     

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE2 VDSSNIDKFINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSW
       : :.::..: .: :: :.: ::  .. ::: .    ..::.:.::.:..::::.: :..:
CCDS32 VTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAW
         360       370       380       390       400       410     

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE2 PPNMTDFSVFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLC
       : .. :.:::.:: .: ::.:..:   : :.  ::. : ..::.:...:   :  :..::
CCDS32 PDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLC
         420       430       440       450       460       470     

       470       480       490       500       510       520       
pF1KE2 YYHTINWTTLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFS
       . ::. :  :: . .: ..   ::  ..:..::..:..::.   :::::: ::..: .: 
CCDS32 FVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFL
         480       490       500       510       520       530     

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pF1KE2 RGRICIESCNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGP
       ::. :.: : . .:  ::. :.  :. : :.:.  ..: .:: ::  :.:. :.:.:: :
CCDS32 RGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQP-QNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPP
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pF1KE2 NCVEKCPDGLQGANSF--IFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLP
        :: .::.:..   :.  :.:. : .  :.::  :::..:    .. :           :
CCDS32 FCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGC-----------P
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pF1KE2 QHAR-TPL--IAAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIK-KKRALRRFL-ETELVEPLTP
        . : .::  : ..:.: ....:..:..:.. ..:.. : .: ..::.: ::::::::::
CCDS32 AEQRASPLTSIISAVVG-ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTP
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pF1KE2 SGTAPNQAQLRILKETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPK
       ::. :::::.::::::::..:::::::::::::::::.:.::.::::::::.: :.:.::
CCDS32 SGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPK
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pF1KE2 ANVEFMDEALIMASMDHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLL
       :: :..::: .::..  :.. ::::.::. :.::::::::.::::..:.:..  .::: :
CCDS32 ANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDL
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pF1KE2 LNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGG
       ::::.:::::: :::. :::::::::::::::::::::::::::::::. :: ::.::::
CCDS32 LNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGG
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pF1KE2 KMPIKWMALECIHYRKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLP
       :.:::::::: :  :.:::::::::::::.:::::::.:::::::.::::::::::::::
CCDS32 KVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLP
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pF1KE2 QPPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPND
       :::::::::::.::::::::.. ::.:.::..:::::::::::..:::..: .   :: :
CCDS32 QPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNED-LGPASPLD
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pF1KE2 SKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYLVPQ-AFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPM
       : :...::...:. :..::::::::: .:  : :         .  . . :    . :  
CCDS32 STFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPA-------PGAGGMVHHRHRSSST--
            1010      1020      1030             1040      1050    

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pF1KE2 SGNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHV
              :.::     :.  : .  .   : :: ..:: ...:: .   :. .   .  .
CCDS32 -------RSGGGDLTLGLE-PSEEEAPRSPLAP-SEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPT
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pF1KE2 QEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGD
       .. :  :::: ::::  :     .: :  ::..:.  .:. ::.:  .  :     ..: 
CCDS32 HDPSPLQRYSEDPTVPLP-----SETD--GYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGP
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pF1KE2 LQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPLY-LNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKA-----
       : :   :   .:.   ::. .   :  .  . .:.... . :::  .  . :.       
CCDS32 LPAA-RPA--GATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAF
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pF1KE2 KKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPG
       . ::::  ::... : :..   :. ..   :              :::::::        
CCDS32 SPAFDNLYYWDQDPPERGA--PPSTFKGTPT--------------AENPEYLGLDVPV  
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          1300        
pF1KE2 TVLPPPPYRHRNTVV

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pF1KE2 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM
                        :. .:    .::.::. ::   .. : .   ::. :..:.::.
CCDS74               MPRGSWKP----QVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQ
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pF1KE2 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
       ::::.: .  : .::::....:: ::::.: :: : .::. :::.:::.:.:: ::::..
CCDS74 GNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVL
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pF1KE2 LNYRKDGNF---------GLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPW
        :    .:          ::.:: :..:::::.::: ...:  ::: ::: :.:: ..  
CCDS74 DNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNN
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pF1KE2 PSNLTLVSTNGSSGCGRCHKSCTG-RCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCC
          :::..:: : .:  :   : : :::: . . ::.:::::::  : .:: ::  .:::
CCDS74 QLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGC-ARCKGPLPTDCC
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pF1KE2 HRECAGGCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCV
       :..::.::.::: .::.::..:: :: :  .::   .::  ::.   : ...::.:: ::
CCDS74 HEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCV
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pF1KE2 KKCPHNFV-VDSSSCVRACPSSKMEVE-ENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTV
         ::.:.. .: .::. .::  ..::  :.: . :. :.  : ..: :.:   :  ...:
CCDS74 TACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAV
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pF1KE2 DSSNIDKFINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWP
        :.::..: .: :: :.: ::  .. ::: .    ..::.:.::.:..::::.: :..::
CCDS74 TSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWP
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pF1KE2 PNMTDFSVFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCY
        .. :.:::.:: .: ::.:..:   : :.  ::. : ..::.:...:   :  :..::.
CCDS74 DSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCF
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pF1KE2 YHTINWTTLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSR
        ::. :  :: . .: ..   ::  ..:..::..:..::.   :::::: ::..: .: :
CCDS74 VHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLR
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pF1KE2 GRICIESCNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPN
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CCDS74 GQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQP-QNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPF
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pF1KE2 CVEKCPDGLQGANSF--IFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQ
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CCDS74 CVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGC-----------PA
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pF1KE2 HAR-TPL--IAAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIK-KKRALRRFL-ETELVEPLTPS
       . : .::  : ..:.: ....:..:..:.. ..:.. : .: ..::.: :::::::::::
CCDS74 EQRASPLTSIISAVVG-ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPS
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pF1KE2 GTAPNQAQLRILKETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKA
       :. :::::.::::::::..:::::::::::::::::.:.::.::::::::.: :.:.:::
CCDS74 GAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKA
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pF1KE2 NVEFMDEALIMASMDHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLL
       : :..::: .::..  :.. ::::.::. :.::::::::.::::..:.:..  .::: ::
CCDS74 NKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLL
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       :::.:::::: :::. :::::::::::::::::::::::::::::::. :: ::.:::::
CCDS74 NWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGK
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       .:::::::: :  :.:::::::::::::.:::::::.:::::::.:::::::::::::::
CCDS74 VPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQ
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pF1KE2 PPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDS
       ::::::::::.::::::::.. ::.:.::..:::::::::::..:::..: .   :: ::
CCDS74 PPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNED-LGPASPLDS
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pF1KE2 KFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYLVPQ-AFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMS
        :...::...:. :..::::::::: .:  : :         .  . . :    . :  .
CCDS74 TFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPA-------PGAGGMVHHRHRSSSTRSG
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pF1KE2 GNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQ
       :....   :   .:.      .:: :  : :: ..:: ...:: .   :. .   .  ..
CCDS74 GGDLTL--GLEPSEE------EAPRS--PLAP-SEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTH
               1050              1060       1070      1080         

             1130      1140      1150      1160      1170      1180
pF1KE2 EDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDL
       . :  :::: ::::  :     .: :  ::..:.  .:. ::.:  .  :     ..: :
CCDS74 DPSPLQRYSEDPTVPLP-----SETD--GYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPL
    1090      1100           1110        1120      1130      1140  

             1190      1200       1210      1220      1230         
pF1KE2 QALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPLY-LNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKA-----K
        :   :   .:.   ::. .   :  .  . .:.... . :::  .  . :.       .
CCDS74 PAA-RPA--GATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFS
              1150      1160      1170      1180      1190         

         1240      1250      1260      1270      1280      1290    
pF1KE2 KAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGT
        ::::  ::... : :..   :. ..   :              :::::::         
CCDS74 PAFDNLYYWDQDPPERGA--PPSTFKGTPT--------------AENPEYLGLDVPV   
    1200      1210        1220                    1230      1240   

         1300        
pF1KE2 VLPPPPYRHRNTVV

>>CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17              (1055 aa)
 initn: 3420 init1: 1665 opt: 3798  Z-score: 1945.1  bits: 371.9 E(32554): 5.1e-102
Smith-Waterman score: 3798; 52.6% identity (76.3% similar) in 1045 aa overlap (10-1033:9-1035)

               10        20         30        40        50         
pF1KE2 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQP-SDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVV
                : .::.:   . : . : .::.::. ::   .. : .   ::. :..:.::
CCDS77  MELAALCRW-GLLLA--LLPPGAASTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVV
                 10          20        30        40        50      

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE2 MGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAI
       .::::.: .  : .::::....:: ::::.: :: : .::. :::.:::.:.:: ::::.
CCDS77 QGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAV
         60        70        80        90       100       110      

     120                130       140       150       160       170
pF1KE2 FLNYRKDGNF---------GLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNP
       . :    .:          ::.:: :..:::::.::: ...:  ::: ::: :.:: .. 
CCDS77 LDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKN
        120       130       140       150       160       170      

              180       190        200       210       220         
pF1KE2 WPSNLTLVSTNGSSGCGRCHKSCTG-RCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDC
           :::..:: : .:  :   : : :::: . . ::.:::::::  : .:: ::  .::
CCDS77 NQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGC-ARCKGPLPTDC
        180       190       200       210       220        230     

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE2 CHRECAGGCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFC
       ::..::.::.::: .::.::..:: :: :  .::   .::  ::.   : ...::.:: :
CCDS77 CHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASC
         240       250       260       270       280       290     

     290        300       310        320       330       340       
pF1KE2 VKKCPHNFV-VDSSSCVRACPSSKMEVE-ENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQT
       :  ::.:.. .: .::. .::  ..::  :.: . :. :.  : ..: :.:   :  ...
CCDS77 VTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRA
         300       310       320       330       340       350     

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE2 VDSSNIDKFINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSW
       : :.::..: .: :: :.: ::  .. ::: .    ..::.:.::.:..::::.: :..:
CCDS77 VTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAW
         360       370       380       390       400       410     

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE2 PPNMTDFSVFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLC
       : .. :.:::.:: .: ::.:..:   : :.  ::. : ..::.:...:   :  :..::
CCDS77 PDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLC
         420       430       440       450       460       470     

       470       480       490       500       510       520       
pF1KE2 YYHTINWTTLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFS
       . ::. :  :: . .: ..   ::  ..:..::..:..::.   :::::: ::..: .: 
CCDS77 FVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFL
         480       490       500       510       520       530     

       530       540       550       560       570       580       
pF1KE2 RGRICIESCNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGP
       ::. :.: : . .:  ::. :.  :. : :.:.  ..: .:: ::  :.:. :.:.:: :
CCDS77 RGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQP-QNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPP
         540       550       560        570       580       590    

       590       600         610       620       630       640     
pF1KE2 NCVEKCPDGLQGANSF--IFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLP
        :: .::.:..   :.  :.:. : .  :.::  :::..:    .. :           :
CCDS77 FCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGC-----------P
          600       610       620       630       640              

          650         660       670       680        690        700
pF1KE2 QHAR-TPL--IAAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIK-KKRALRRFL-ETELVEPLTP
        . : .::  : ..:.: ....:..:..:.. ..:.. : .: ..::.: ::::::::::
CCDS77 AEQRASPLTSIISAVVG-ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTP
           650       660        670       680       690       700  

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pF1KE2 SGTAPNQAQLRILKETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPK
       ::. :::::.::::::::..:::::::::::::::::.:.::.::::::::.: :.:.::
CCDS77 SGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPK
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pF1KE2 ANVEFMDEALIMASMDHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLL
       :: :..::: .::..  :.. ::::.::. :.::::::::.::::..:.:..  .::: :
CCDS77 ANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDL
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pF1KE2 LNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGG
       ::::.:::::: :::. :::::::::::::::::::::::::::::::. :: ::.::::
CCDS77 LNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGG
            830       840       850       860       870       880  

              890       900       910       920       930       940
pF1KE2 KMPIKWMALECIHYRKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLP
       :.:::::::: :  :.:::::::::::::.:::::::.:::::::.::::::::::::::
CCDS77 KVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLP
            890       900       910       920       930       940  

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pF1KE2 QPPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPND
       :::::::::::.::::::::.. ::.:.::..:::::::::::..:::..: .   :: :
CCDS77 QPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNED-LGPASPLD
            950       960       970       980       990       1000 

             1010      1020       1030      1040      1050         
pF1KE2 SKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYLVPQ-AFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPM
       : :...::...:. :..::::::::: .:  : :                          
CCDS77 STFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRNM      
            1010      1020      1030      1040      1050           

    1060      1070      1080      1090      1100      1110         
pF1KE2 SGNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHV

>>CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17              (1225 aa)
 initn: 3454 init1: 1665 opt: 3776  Z-score: 1933.3  bits: 369.9 E(32554): 2.3e-101
Smith-Waterman score: 3896; 47.4% identity (70.4% similar) in 1269 aa overlap (43-1285:10-1219)

             20        30        40        50        60        70  
pF1KE2 LLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVMGNLEITSIEHNR
                                     : .   ::. :..:.::.::::.: .  : 
CCDS45                      MKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNA
                                    10        20        30         

             80        90       100       110       120            
pF1KE2 DLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIFLNYRKDGNF---
       .::::....:: ::::.: :: : .::. :::.:::.:.:: ::::.. :    .:    
CCDS45 SLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNGDPLNNTTPV
      40        50        60        70        80        90         

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE2 ------GLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVSTNGS
             ::.:: :..:::::.::: ...:  ::: ::: :.:: ..     :::..:: :
CCDS45 TGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRS
     100       110       120       130       140       150         

           190        200       210       220       230       240  
pF1KE2 SGCGRCHKSCTG-RCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSGPK
        .:  :   : : :::: . . ::.:::::::  : .:: ::  .::::..::.::.:::
CCDS45 RACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGC-ARCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPK
     160       170       180       190        200       210        

            250       260       270       280       290        300 
pF1KE2 DTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFV-VDS
        .::.::..:: :: :  .::   .::  ::.   : ...::.:: ::  ::.:.. .: 
CCDS45 HSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACPYNYLSTDV
      220       230       240       250       260       270        

             310        320       330       340       350       360
pF1KE2 SSCVRACPSSKMEVE-ENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCT
       .::. .::  ..::  :.: . :. :.  : ..: :.:   :  ...: :.::..: .: 
CCDS45 GSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCK
      280       290       300       310       320       330        

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 KINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNL
       :: :.: ::  .. ::: .    ..::.:.::.:..::::.: :..:: .. :.:::.::
CCDS45 KIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNL
      340       350       360       370       380       390        

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFST
        .: ::.:..:   : :.  ::. : ..::.:...:   :  :..::. ::. :  :: .
CCDS45 QVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRN
      400       410       420       430       440       450        

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 INQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYD
        .: ..   ::  ..:..::..:..::.   :::::: ::..: .: ::. :.: : . .
CCDS45 PHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQ
      460       470       480       490       500       510        

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pF1KE2 GEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGA
       :  ::. :.  :. : :.:.  ..: .:: ::  :.:. :.:.:: : :: .::.:..  
CCDS45 GLPREYVNARHCLPCHPECQP-QNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARCPSGVKPD
      520       530        540       550       560       570       

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pF1KE2 NSF--IFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHAR-TPL--IAA
        :.  :.:. : .  :.::  :::..:    .. :           : . : .::  : .
CCDS45 LSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGC-----------PAEQRASPLTSIIS
       580       590       600       610                  620      

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pF1KE2 GVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIK-KKRALRRFL-ETELVEPLTPSGTAPNQAQLRIL
       .:.: :.. :..:..:.. ..:.. : .: ..::.: ::::::::::::. :::::.:::
CCDS45 AVVGILLV-VVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRIL
        630        640       650       660       670       680     

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pF1KE2 KETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMA
       :::::..:::::::::::::::::.:.::.::::::::.: :.:.:::: :..::: .::
CCDS45 KETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMA
         690       700       710       720       730       740     

           780       790       800       810       820       830   
pF1KE2 SMDHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMY
       ..  :.. ::::.::. :.::::::::.::::..:.:..  .::: :::::.:::::: :
CCDS45 GVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSY
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pF1KE2 LEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIH
       ::. :::::::::::::::::::::::::::::::. :: ::.:::::.:::::::: : 
CCDS45 LEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESIL
         810       820       830       840       850       860     

           900       910       920       930       940       950   
pF1KE2 YRKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVM
        :.:::::::::::::.:::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::.:
CCDS45 RRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIM
         870       880       890       900       910       920     

           960       970       980       990      1000      1010   
pF1KE2 VKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDL
       :::::::.. ::.:.::..:::::::::::..:::..: .   :: :: :...::...:.
CCDS45 VKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNED-LGPASPLDSTFYRSLLEDDDM
         930       940       950       960        970       980    

          1020       1030      1040      1050      1060      1070  
pF1KE2 EDMMDAEEYLVPQ-AFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQFVYRDGGFA
        :..::::::::: .:  : :         .  . . :    . :         :.::  
CCDS45 GDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPA-------PGAGGMVHHRHRSSST---------RSGGGD
          990      1000             1010      1020                 

           1080      1090      1100      1110      1120      1130  
pF1KE2 AEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADP
          :.  : .  .   : :: ..:: ...:: .   :. .   .  ... :  :::: ::
CCDS45 LTLGLE-PSEEEAPRSPLAP-SEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDP
     1030       1040       1050      1060      1070      1080      

           1140      1150      1160      1170      1180      1190  
pF1KE2 TVFAPERSPRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNAS
       ::  : ..       .::..:.  .:. ::.:  .  :     ..: : :   :   .:.
CCDS45 TVPLPSET-------DGYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAA-RPA--GAT
       1090             1100      1110      1120      1130         

           1200       1210      1220      1230           1240      
pF1KE2 NGPPKAEDEYVNEPLY-LNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKA-----KKAFDNPDYWNHS
          ::. .   :  .  . .:.... . :::  .  . :.       . ::::  ::...
CCDS45 LERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQD
       1140      1150      1160      1170      1180      1190      

       1250      1260      1270      1280      1290      1300      
pF1KE2 LPPRSTLQHPDYLQEYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNT
        : :..   :. ..   :              :::::::                     
CCDS45 PPERGA--PPSTFKGTPT--------------AENPEYLGLDVPV               
       1200        1210                    1220                    

         
pF1KE2 VV

>>CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs108|chr12              (1342 aa)
 initn: 2971 init1: 1332 opt: 3601  Z-score: 1844.5  bits: 353.6 E(32554): 2e-96
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               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM
       :.   .: :   :.  :   . ..::.:: :: : ::  .: :.::..: : :: :::::
CCDS31 MRANDALQVLGLLFSLARGSEVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEVVM
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE2 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
       :::::.   :: :::::. .::::::::::.:.:  ::: :::..:::..:. ..:. ..
CCDS31 GNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIFVM
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE2 LNYRKDGNFGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVST
       :::  ... .:..: : .:::::.::::...:  ::. ::: :.::::.   .   .:. 
CCDS31 LNYNTNSSHALRQLRLTQLTEILSGGVYIEKNDKLCHMDTIDWRDIVRD--RDAEIVVKD
              130       140       150       160         170        

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pF1KE2 NGSSGCGRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSG
       :: : :  ::. : ::::::  . :::::.:.:: ::.:.:.::  ..::: ::::::::
CCDS31 NGRS-CPPCHEVCKGRCWGPGSEDCQTLTKTICAPQCNGHCFGPNPNQCCHDECAGGCSG
      180        190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 PKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVVD
       :.::::::: .:::::::: .::: .:::  ::::: : ..:: ::. :: .::::::::
CCDS31 PQDTDCFACRHFNDSGACVPRCPQPLVYNKLTFQLEPNPHTKYQYGGVCVASCPHNFVVD
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCT
       ..::::::: .::::..::.:::.::  .:::::.: :.:: .  ::::::::: :.:::
CCDS31 QTSCVRACPPDKMEVDKNGLKMCEPCGGLCPKACEGTGSGSRF--QTVDSSNIDGFVNCT
       300       310       320       330       340         350     

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 KINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNL
       :: ::: ::.::..:::.. : :.::::::::::::::::.::::::::.: .:::::::
CCDS31 KILGNLDFLITGLNGDPWHKIPALDPEKLNVFRTVREITGYLNIQSWPPHMHNFSVFSNL
         360       370       380       390       400       410     

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pF1KE2 VTIGGRVLYS-GLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT-TLF
       .::::: ::. :.::::.:. ..::: :.:::::::: :::. : .:::.:..::: .: 
CCDS31 TTIGGRSLYNRGFSLLIMKNLNVTSLGFRSLKEISAGRIYISANRQLCYHHSLNWTKVLR
         420       430       440       450       460       470     

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pF1KE2 STINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNL
       .  ..:. :. ::  ..:.::: ::. :::: ::::::: :::::: .::: .:.  ::.
CCDS31 GPTEERLDIKHNRPRRDCVAEGKVCDPLCSSGGCWGPGPGQCLSCRNYSRGGVCVTHCNF
         480       490       500       510       520       530     

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pF1KE2 YDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQ
        .:: ::: . . :  : :.:. :: :  ::.: : :.:..:.::.:::.:: .:: :. 
CCDS31 LNGEPREFAHEAECFSCHPECQPME-GTATCNGSGSDTCAQCAHFRDGPHCVSSCPHGVL
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pF1KE2 GANSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPL-IAAGV
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CCDS31 GAKGPIYKYPDVQNECRPCHENCTQGCKGPELQDCL-----GQ-TLVLIGKTHLTMALTV
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pF1KE2 IGGLFIL-VIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLET-ELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKE
       :.:: .. ...: :: .: : . :..:::.::.::  : .::: ::  : :..  ::.::
CCDS31 IAGLVVIFMMLGGTF-LYWRGRRIQNKRAMRRYLERGESIEPLDPSEKA-NKVLARIFKE
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pF1KE2 TELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASM
       :::...::::::.::::.::.:.::::..:::: ::.... .: ..     :. : ..:.
CCDS31 TELRKLKVLGSGVFGTVHKGVWIPEGESIKIPVCIKVIEDKSGRQSFQAVTDHMLAIGSL
        710       720       730       740       750       760      

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pF1KE2 DHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLE
       :: :.:::::.: . ..::::: .: : ::..:..:.  .: :::::: :::::::.:::
CCDS31 DHAHIVRLLGLCPGSSLQLVTQYLPLGSLLDHVRQHRGALGPQLLLNWGVQIAKGMYYLE
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pF1KE2 ERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYR
       :. .:::.:::::::.:::..:...:::.: ::  :.:.   . .: :::::::: ::. 
CCDS31 EHGMVHRNLAARNVLLKSPSQVQVADFGVADLLPPDDKQLLYSEAKTPIKWMALESIHFG
        830       840       850       860       870       880      

         900       910       920       930       940       950     
pF1KE2 KFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVK
       :.::::::::::::.:::::::..:: :.   :.:::::::::: :: ::::::::::::
CCDS31 KYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAEPYAGLRLAEVPDLLEKGERLAQPQICTIDVYMVMVK
        890       900       910       920       930       940      

         960       970       980       990       1000      1010    
pF1KE2 CWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKL-PSPNDSKFFQNLLDEEDLE
       ::::: . :: ::::: ::.:::::: :::::. ..   . :.:.   . .. :.: .::
CCDS31 CWMIDENIRPTFKELANEFTRMARDPPRYLVIKRESGPGIAPGPEPHGLTNKKLEEVELE
        950       960       970       980       990      1000      

         1020      1030      1040            1050      1060        
pF1KE2 DMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDS---NR---SEIGHSPPPAYTPMS-GNQFVYR
         .: .  :  .  :.      :   .     ::   :.   ::  .: ::. ::  . .
CCDS31 PELDLDLDLEAEEDNLATTTLGSALSLPVGTLNRPRGSQSLLSPSSGYMPMNQGN--LGE
       1010      1020      1030      1040      1050      1060      

      1070        1080      1090              1100       1110      
pF1KE2 DGGFAAEQGVS--VPYRAPTSTIPEAPVAQ--------GATAEIFDD-SCCNGTLRKPVA
       .   .: .: :   :  .    .:.. .:.        :. ::. .  : : .  :.  .
CCDS31 SCQESAVSGSSERCPRPVSLHPMPRGCLASESSEGHVTGSEAELQEKVSMCRSRSRSR-S
         1070      1080      1090      1100      1110      1120    

       1120        1130      1140        1150           1160       
pF1KE2 PHVQEDSS--TQRYSADPTVFAPERSPRG--ELDEEGYMTP---MRDKP--KQEYLNPVE
       :. . ::.  .::.:    : .:  :: :  : : .::. :   ..  :  ..  :. : 
CCDS31 PRPRGDSAYHSQRHSLLTPV-TPL-SPPGLEEEDVNGYVMPDTHLKGTPSSREGTLSSVG
          1130      1140        1150      1160      1170      1180 

      1170         1180      1190       1200      1210       1220  
pF1KE2 ENPFVSRRKNGD---LQALDNPEYHNASNGP-PKAEDEYVNEPLYLNT-FANTLGKAEYL
        .  .. ... .    . ..  . :.  . : :.. .:   : . ... .. .::...  
CCDS31 LSSVLGTEEEDEDEEYEYMNRRRRHSPPHPPRPSSLEELGYEYMDVGSDLSASLGSTQSC
            1190      1200      1210      1220      1230      1240 

            1230      1240      1250      1260      1270      1280 
pF1KE2 K-NNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKYFYKQNGRIRPIVAEN
         . .  ::  .    .. .: :                                     
CCDS31 PLHPVPIMPTAGTTPDEDYEYMNRQRDGGGPGGDYAAMGACPASEQGYEEMRAFQGPGHQ
            1250      1260      1270      1280      1290      1300 

>>CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7                 (1210 aa)
 initn: 2953 init1: 1893 opt: 3166  Z-score: 1625.0  bits: 312.8 E(32554): 3.4e-84
Smith-Waterman score: 4332; 50.6% identity (73.8% similar) in 1292 aa overlap (1-1285:1-1198)

                10        20         30        40        50        
pF1KE2 MKPA-TGLWVWVSLLVAAGTVQPS-DSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV
       :.:. :.  . ..::.:   .. . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE2 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
       :.:::::: ...: :::::....::.::::.:::  . .:::::.::::.  ::. ::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
               70        80        90       100       110       120

      120        130       140       150       160       170       
pF1KE2 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
       .. ::  :.:  ::.:: ..:: :::.:.:  ..:  :: ...:.:.::: . . ::...
CCDS55 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
                130       140       150       160       170        

       180       190        200       210       220       230      
pF1KE2 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG
          :  ..: .:  :: .: :::  :..:: ::. .::.::.::: :   ::::: .::.
CCDS55 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA
      180       190       200       210       220       230        

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE2 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
       ::.::...::..: .: : ..:   ::  ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.:
CCDS55 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
      240       250       260       270       280       290        

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE2 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
       .:: : .:::::: ....:.::.:.. :: :   : :.:.::: : . .. .....:: .
CCDS55 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
      300       310       320       330       340       350        

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE2 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS
       : :::.:.:.: .: ....:: ..    .::..:....::.:::::: ::.:: : ::. 
CCDS55 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
      360       370       380       390       400       410        

         420       430       440       450       460       470     
pF1KE2 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT
       .: ::  : ::.   :   : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .:::: 
CCDS55 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KE2 TLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIES
        ::.: .:.  : .::  ..: : :.::. ::: .::::: : .:.:::  :::: :...
CCDS55 KLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDK
      480       490       500       510       520       530        

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pF1KE2 CNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPD
       ::: .:: ::: ..: :..: :.:  .  .. :: : ::::: .:.:. :::.::. :: 
CCDS55 CNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNI-TCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPA
      540       550       560        570       580       590       

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pF1KE2 GLQGAN-SFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIA
       :..: : ....::::  . :: :::::: ::.::  . :   : .:    :   . : ::
CCDS55 GVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGC---PTNG----P---KIPSIA
       600       610       620       630          640              

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pF1KE2 AGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFL-ETELVEPLTPSGTAPNQAQLRIL
       .:..:.:..:..:.: .....::. : .::.:::.: : :::::::::: ::::: ::::
CCDS55 TGMVGALLLLLVVALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRIL
       650       660       670       680       690       700       

           720       730       740       750       760       770   
pF1KE2 KETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMA
       ::::.:..::::::::::::::.:.:::: :::::::: : :.:.:::: :..::: .::
CCDS55 KETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMA
       710       720       730       740       750       760       

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pF1KE2 SMDHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMY
       :.:.::. ::::.::. :.::.::::: ::::.::.::::::::: :::::::::::: :
CCDS55 SVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNY
       770       780       790       800       810       820       

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pF1KE2 LEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIH
       ::.::::::::::::::::.:.::::::::::.:: ..::::.:.:::.:::::::: : 
CCDS55 LEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESIL
       830       840       850       860       870       880       

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pF1KE2 YRKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVM
       .: .::::::::::::.:::::::.:::::::. :: ..:::::::::::::::::::.:
CCDS55 HRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIM
       890       900       910       920       930       940       

           960       970       980       990      1000      1010   
pF1KE2 VKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDL
       ::::::::::::::.::  :::.::::::::::::::.::.::::.::.:.. :.::::.
CCDS55 VKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDM
       950       960       970       980       990      1000       

          1020      1030      1040      1050      1060      1070   
pF1KE2 EDMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQFVYRDGGFAA
       .:..::.:::.::   .  :  :::. . :. :  ...   :    .: :          
CCDS55 DDVVDADEYLIPQQGFFSSP-STSRTPLLSSLSATSNNSTVACIDRNGLQ----------
      1010      1020       1030      1040      1050                

          1080      1090      1100      1110      1120      1130   
pF1KE2 EQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPT
                                      ::       :.    .:::  ::::.:::
CCDS55 -------------------------------SC-------PI----KEDSFLQRYSSDPT
                                             1060          1070    

          1140      1150      1160      1170      1180      1190   
pF1KE2 VFAPERSPRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASN
                : : :..    .   :  ::.:       : .:  :..:   :: :::   
CCDS55 ---------GALTEDSIDDTFLPVP--EYINQS-----VPKRPAGSVQ---NPVYHNQPL
                  1080      1090             1100         1110     

          1200      1210      1220      1230      1240      1250   
pF1KE2 GPPKAEDEYVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTL
       .:  ..:     : : .  ....:. ::: :..  .:  ....::.: .: ..   . .:
CCDS55 NPAPSRD-----PHYQDPHSTAVGNPEYL-NTV--QPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISL
        1120           1130       1140        1150      1160       

          1260      1270      1280      1290      1300        
pF1KE2 QHPDYLQEYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
       ..::: :..  :   : :: ..  .::: :::                       
CCDS55 DNPDYQQDFFPKE-AKPNGIFKGSTAENAEYLRVAPQSSEFIGA           
      1170      1180       1190      1200      1210           

>>CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7                 (628 aa)
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                10        20         30        40        50        
pF1KE2 MKPA-TGLWVWVSLLVAAGTVQPS-DSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV
       :.:. :.  . ..::.:   .. . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE2 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
       :.:::::: ...: :::::....::.::::.:::  . .:::::.::::.  ::. ::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
               70        80        90       100       110       120

      120        130       140       150       160       170       
pF1KE2 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
       .. ::  :.:  ::.:: ..:: :::.:.:  ..:  :: ...:.:.::: . . ::...
CCDS55 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
                130       140       150       160       170        

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pF1KE2 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG
          :  ..: .:  :: .: :::  :..:: ::. .::.::.::: :   ::::: .::.
CCDS55 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA
      180       190       200       210       220       230        

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE2 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
       ::.::...::..: .: : ..:   ::  ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.:
CCDS55 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
      240       250       260       270       280       290        

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE2 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
       .:: : .:::::: ....:.::.:.. :: :   : :.:.::: : . .. .....:: .
CCDS55 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
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pF1KE2 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS
       : :::.:.:.: .: ....:: ..    .::..:....::.:::::: ::.:: : ::. 
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       .: ::  : ::.   :   : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .:::: 
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        ::.: .:.  : .::  ..: : :.::. ::: .::::: : .:.:::  :::: :...
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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