Result of FASTA (ccds) for pF1KE2311
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2311, 1821 aa
  1>>>pF1KE2311 1821 - 1821 aa - 1821 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7065+/-0.00126; mu= 3.9553+/- 0.075
 mean_var=274.6644+/-57.132, 0's: 0 Z-trim(108.2): 104  B-trim: 231 in 1/52
 Lambda= 0.077388
 statistics sampled from 9936 (10031) to 9936 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.308), width:  16
 Scan time:  4.650

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4987.1 PHIP gene_id:55023|Hs108|chr6           (1821) 12218 1379.7       0
CCDS13663.1 BRWD1 gene_id:54014|Hs108|chr21        (2269) 5681 650.0  3e-185
CCDS13662.1 BRWD1 gene_id:54014|Hs108|chr21        (2320) 5681 650.0  3e-185
CCDS14447.1 BRWD3 gene_id:254065|Hs108|chrX        (1802) 3678 426.2 5.2e-118
CCDS33557.1 BRWD1 gene_id:54014|Hs108|chr21        ( 120)  468 66.9 5.2e-11


>>CCDS4987.1 PHIP gene_id:55023|Hs108|chr6                (1821 aa)
 initn: 12218 init1: 12218 opt: 12218  Z-score: 7385.1  bits: 1379.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12218; 99.9% identity (99.9% similar) in 1821 aa overlap (1-1821:1-1821)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MSCERKGLSELRSELYFLIARFLEDGPCQQAAQVLIREVAEKELLPRRTDWTGKEHPRTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MSCERKGLSELRSELYFLIARFLEDGPCQQAAQVLIREVAEKELLPRRTDWTGKEHPRTY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 QNLVKYYRHLAPDHLLQICHRLGPLLEQEIPQSVPGVQTLLGAGRQSLLRTNKSCKHVVW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QNLVKYYRHLAPDHLLQICHRLGPLLEQEIPQSVPGVQTLLGAGRQSLLRTNKSCKHVVW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 KGSALAALHCGRPPESPVNYGSPPSIADTLFSRKLNGKYRLERLVPTAVYQHMKMHKRIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KGSALAALHCGRPPESPVNYGSPPSIADTLFSRKLNGKYRLERLVPTAVYQHMKMHKRIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 GHLSSVYCVTFDRTGRRIFTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHAAEISDMAVNYENTMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GHLSSVYCVTFDRTGRRIFTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHAAEISDMAVNYENTMI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 AAGSCDKMIRVWCLRTCAPLAVLQGHSASITSLQFSPLCSGSKRYLSSTGADGTICFWLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 AAGSCDKMIRVWCLRTCAPLAVLQGHSASITSLQFSPLCSGSKRYLSSTGADGTICFWLW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 DAGTLKINPRPAKFTERPRPGVQMICSSFSAGGMFLATGSTDHIIRVYFFGSGQPEKISE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 DAGTLKINPRPAKFTERPRPGVQMICSSFSAGGMFLATGSTDHIIRVYFFGSGQPEKISE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LEFHTDKVDSIQFSNTSNRFVSGSRDGTARIWQFKRREWKSILLDMATRPAGQNLQGIED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LEFHTDKVDSIQFSNTSNRFVSGSRDGTARIWQFKRREWKSILLDMATRPAGQNLQGIED
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 KITKMKVTMVAWDRHDNTVITAVNNMTLKVWNSYTGQLIHVLMGHEDEVFVLEPHPFDPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KITKMKVTMVAWDRHDNTVITAVNNMTLKVWNSYTGQLIHVLMGHEDEVFVLEPHPFDPR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 VLFSAGHDGNVIVWDLARGVKIRSYFNMIEGQGHGAVFDCKCSPDGQHFACTDSHGHLLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 VLFSAGHDGNVIVWDLARGVKIRSYFNMIEGQGHGAVFDCKCSPDGQHFACTDSHGHLLI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 FGFGSSSKYDKIADQMFFHSDYRPLIRDANNFVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNPHPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 FGFGSSSKYDKIADQMFFHSDYRPLIRDANNFVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNPHPS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 RYQRLVPGRENCREEQLIPQMGVTSSGLNQVLSQQANQEISPLDSMIQRLQQEQDLRRSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 RYQRLVPGRENCREEQLIPQMGVTSSGLNQVLSQQANQEISPLDSMIQRLQQEQDLRRSG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 EAGISNTSRLSRGSISSTSEVHSPPNVGLRRSGQIEGVRQMHSNAPRSEIATERDLVAWS
       :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 EAVISNTSRLSRGSISSTSEVHSPPNVGLRRSGQIEGVRQMHSNAPRSEIATERDLVAWS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 RRVVVPELSAGVASRQEEWRTAKGEEEIKTYRSEEKRKHLTVPKENKIPTVSKNHAHEHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 RRVVVPELSAGVASRQEEWRTAKGEEEIKTYRSEEKRKHLTVPKENKIPTVSKNHAHEHF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 LDLGESKKQQTNQHNYRTRSALEETPRPSEEIENGSSSSDEGEVVAVSGGTSEEEERAWH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LDLGESKKQQTNQHNYRTRSALEETPRPSEEIENGSSSSDEGEVVAVSGGTSEEEERAWH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 SDGSSSDYSSDYSDWTADAGINLQPPKKVPKNKTKKAESSSDEEEESEKQKQKQIKKEKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SDGSSSDYSSDYSDWTADAGINLQPPKKVPKNKTKKAESSSDEEEESEKQKQKQIKKEKK
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 KVNEEKDGPISPKKKKPKERKQKRLAVGELTENGLTLEEWLPSTWITDTIPRRCPFVPQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KVNEEKDGPISPKKKKPKERKQKRLAVGELTENGLTLEEWLPSTWITDTIPRRCPFVPQM
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 GDEVYYFRQGHEAYVEMARKNKIYSINPKKQPWHKMELREQELMKIVGIKYEVGLPTLCC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GDEVYYFRQGHEAYVEMARKNKIYSINPKKQPWHKMELREQELMKIVGIKYEVGLPTLCC
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 LKLAFLDPDTGKLTGGSFTMKYHDMPDVIDFLVLRQQFDDAKYRRWNIGDRFRSVIDDAW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LKLAFLDPDTGKLTGGSFTMKYHDMPDVIDFLVLRQQFDDAKYRRWNIGDRFRSVIDDAW
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 WFGTIESQEPLQLEYPDSLFQCYNVCWDNGDTEKMSPWDMELIPNNAVFPEELGTSVPLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 WFGTIESQEPLQLEYPDSLFQCYNVCWDNGDTEKMSPWDMELIPNNAVFPEELGTSVPLT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 DGECRSLIYKPLDGEWGTNPRDEECERIVAGINQLMTLDIASAFVAPVDLQAYPMYCTVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 DGECRSLIYKPLDGEWGTNPRDEECERIVAGINQLMTLDIASAFVAPVDLQAYPMYCTVV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 AYPTDLSTIKQRLENRFYRRVSSLMWEVRYIEHNTRTFNEPGSPIVKSAKFVTDLLLHFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 AYPTDLSTIKQRLENRFYRRVSSLMWEVRYIEHNTRTFNEPGSPIVKSAKFVTDLLLHFI
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 KDQTCYNIIPLYNSMKKKVLSDSEDEEKDADVPGTSTRKRKDHQPRRRLRNRAQSYDIQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KDQTCYNIIPLYNSMKKKVLSDSEDEEKDADVPGTSTRKRKDHQPRRRLRNRAQSYDIQA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE2 WKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYPDYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 WKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYPDYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPME
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE2 LCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLSAFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRNTITKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLSAFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRNTITKR
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE2 RKKRNRSSSVSSSAASSPERKKRILKPQLKSESSTSAFSTPTRSIPPRHNAAQINGKTES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 RKKRNRSSSVSSSAASSPERKKRILKPQLKSESSTSAFSTPTRSIPPRHNAAQINGKTES
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE2 SSVVRTRSNRVVVDPVVTEQPSTSSAAKTFITKANASAIPGKTILENSVKHSKALNTLSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SSVVRTRSNRVVVDPVVTEQPSTSSAAKTFITKANASAIPGKTILENSVKHSKALNTLSS
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE2 PGQSSFSHGTRNNSAKENMEKEKPVKRKMKSSVLPKASTLSKSSAVIEQGDCKNNALVPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 PGQSSFSHGTRNNSAKENMEKEKPVKRKMKSSVLPKASTLSKSSAVIEQGDCKNNALVPG
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE2 TIQVNGHGGQPSKLVKRGPGRKPKVEVNTNSGEIIHKKRGRKPKKLQYAKPEDLEQNNVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 TIQVNGHGGQPSKLVKRGPGRKPKVEVNTNSGEIIHKKRGRKPKKLQYAKPEDLEQNNVH
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE2 PIRDEVLPSSTCNFLSETNNVKEDLLQKKNRGGRKPKRKMKTQKLDADLLVPASVKVLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 PIRDEVLPSSTCNFLSETNNVKEDLLQKKNRGGRKPKRKMKTQKLDADLLVPASVKVLRR
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE2 SNRKKIDDPIDEEEEFEELKGSEPHMRTRNQGRRTAFYNEDDSEEEQRQLLFEDTSLTFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SNRKKIDDPIDEEEEFEELKGSEPHMRTRNQGRRTAFYNEDDSEEEQRQLLFEDTSLTFG
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820 
pF1KE2 TSSRGRVRKLTEKAKANLIGW
       :::::::::::::::::::::
CCDS49 TSSRGRVRKLTEKAKANLIGW
             1810      1820 

>>CCDS13663.1 BRWD1 gene_id:54014|Hs108|chr21             (2269 aa)
 initn: 5429 init1: 2048 opt: 5681  Z-score: 3439.4  bits: 650.0 E(32554): 3e-185
Smith-Waterman score: 6202; 53.1% identity (76.1% similar) in 1817 aa overlap (2-1770:5-1764)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE2    MSCERKGLSELRSELYFLIARFLEDGPCQQAAQVLIREVAEKELLPRRTDWTGKEHP
           :  :. .  ..:::::::::.:  :::..:::::..:. . .:::.: :: :.:: 
CCDS13 MAEPSSARRPVPLIESELYFLIARYLSAGPCRRAAQVLVQELEQYQLLPKRLDWEGNEHN
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 RTYQNLVKYYRHLAPDHLLQICHRLGPLLEQEIPQSVPGVQTLLGAGRQSLLRTNKSCKH
       :.:..::   .:.:::::::::.:.::.:..::: :.  : .:::::::::::: :.:.:
CCDS13 RSYEELVLSNKHVAPDHLLQICQRIGPMLDKEIPPSISRVTSLLGAGRQSLLRTAKDCRH
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 VVWKGSALAALHCGRPPESPVNYGSPPSIADTLFSRKLNGKYRLERLVPTAVYQHMKMHK
       .::::::.:::: ::::: ::::::::....   ...:.:   .    : ..:::.:::.
CCDS13 TVWKGSAFAALHRGRPPEMPVNYGSPPNLVEIHRGKQLTGCSTFSTAFPGTMYQHIKMHR
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE2 RILGHLSSVYCVTFDRTGRRIFTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHAAEISDMAVNYEN
       :::::::.::::.:::::.::::::::::::::.: .::::.:::::.::::::::::::
CCDS13 RILGHLSAVYCVAFDRTGHRIFTGSDDCLVKIWSTHNGRLLSTLRGHSAEISDMAVNYEN
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE2 TMIAAGSCDKMIRVWCLRTCAPLAVLQGHSASITSLQFSPLCSGSKRYLSSTGADGTICF
       ::::::::::.:::::::::::.::::::..:::::::::. .::.::. :::::::.::
CCDS13 TMIAAGSCDKIIRVWCLRTCAPVAVLQGHTGSITSLQFSPMAKGSQRYMVSTGADGTVCF
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 WLWDAGTLKINPRPAKFTERPRPGVQMICSSFSAGGMFLATGSTDHIIRVYFFGSGQPEK
       : ::  .::..::: ::::.:::::::.:::::.::::::::::::.::.::.:   :::
CCDS13 WQWDLESLKFSPRPLKFTEKPRPGVQMLCSSFSVGGMFLATGSTDHVIRMYFLGFEAPEK
              310       320       330       340       350       360

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 ISELEFHTDKVDSIQFSNTSNRFVSGSRDGTARIWQFKRREWKSILLDMATRPAGQNLQG
       :.::: :::::::::: :...::.:::::::::::.:.. ::.::::::::: .: .:..
CCDS13 IAELESHTDKVDSIQFCNNGDRFLSGSRDGTARIWRFEQLEWRSILLDMATRISG-DLSS
              370       380       390       400       410          

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE2 IEDKITKMKVTMVAWDRHDNTVITAVNNMTLKVWNSYTGQLIHVLMGHEDEVFVLEPHPF
        :... : ::::.::...:. :.::::. .:::::::::::.: :::: ::::::: :::
CCDS13 EEERFMKPKVTMIAWNQNDSIVVTAVNDHVLKVWNSYTGQLLHNLMGHADEVFVLETHPF
     420       430       440       450       460       470         

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE2 DPRVLFSAGHDGNVIVWDLARGVKIRSYFNMIEGQGHGAVFDCKCSPDGQHFACTDSHGH
       : :...::::::....::...:.:.. ::::::::::::::::: : :::::::::::::
CCDS13 DSRIMLSAGHDGSIFIWDITKGTKMKHYFNMIEGQGHGAVFDCKFSQDGQHFACTDSHGH
     480       490       500       510       520       530         

       540       550       560       570       580       590       
pF1KE2 LLIFGFGSSSKYDKIADQMFFHSDYRPLIRDANNFVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNP
       ::::::: :. :.:: ::::::.::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLIFGFGCSKPYEKIPDQMFFHTDYRPLIRDSNNYVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNP
     540       550       560       570       580       590         

       600       610       620           630         640           
pF1KE2 HPSRYQRLVPGRENCREEQLIPQMG--VTSSG--LNQVLSQQANQ--EISP----LDSMI
       ::..::::::::::  .:.::::.:  .::.:  ..:..: :.:.  : ::    ::.::
CCDS13 HPTKYQRLVPGRENSADEHLIPQLGYVATSDGEVIEQIISLQTNDNDERSPESSILDGMI
     600       610       620       630       640       650         

       650       660            670        680       690       700 
pF1KE2 QRLQQEQDLRRSGEA-----GISNTSRLSRGSISSTS-EVHSPPNVGLRRSGQIEGVRQM
       ..:::.:: : ...      :.::  .  : ..   : ...::::.:::::::.::::::
CCDS13 RQLQQQQDQRMGADQDTIPRGLSNGEETPRRGFRRLSLDIQSPPNIGLRRSGQVEGVRQM
     660       670       680       690       700       710         

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pF1KE2 HSNAPRSEIATERDLVAWSRRVVVPELSAGVASRQEEWRTAKGEEEIKTYRSEEKRKHLT
       :.:::::.::::::: ::.:::::::.  :.  . :..:  ::::: . :   .::: : 
CCDS13 HQNAPRSQIATERDLQAWKRRVVVPEVPLGIFRKLEDFRLEKGEEERNLYIIGRKRKTLQ
     720       730       740       750       760       770         

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pF1KE2 VP-KENKIPTVSKNHAHEHFLDLGESKKQQTNQHNYRTRSALE-ETPRPSEEIENGSSSS
       .  : ...  ::... .        . ...  ... :.::  :  .   :       .: 
CCDS13 LSHKSDSVVLVSQSRQR--------TCRRKYPNYGRRNRSWRELSSGNESSSSVRHETSC
     780       790               800       810       820       830 

     820       830       840              850       860       870  
pF1KE2 DEGEVVAVSGGTSEEEERAWHSDG-------SSSDYSSDYSDWTADAGINLQPPKKVP-K
       :..:    ..:.:::.:  :.::        :::: :: ::::::::::::::: ..  .
CCDS13 DQSE----GSGSSEEDE--WRSDRKSESYSESSSDSSSRYSDWTADAGINLQPPLRTSCR
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pF1KE2 NKTKKAESSSDEEEESEKQKQKQIKKEKKKVNEEKDGPISPKKKKPKERKQKRLAVGELT
        .  .  :::..:  .:. .  . ....:: :            :::... .:.. .::.
CCDS13 RRITRFCSSSEDEISTENLSPPKRRRKRKKEN------------KPKKENLRRMTPAELA
         890       900       910                   920       930   

             940       950       960       970       980       990 
pF1KE2 ENGLTLEEWLPSTWITDTIPRRCPFVPQMGDEVYYFRQGHEAYVEMARKNKIYSINPKKQ
        :   : :. : .:::::  :. :::::::::: :::::::::.: .:.:.:: .::.:.
CCDS13 -NMEHLYEFHPPVWITDTTLRKSPFVPQMGDEVIYFRQGHEAYIEAVRRNNIYELNPNKE
            940       950       960       970       980       990  

            1000      1010      1020      1030      1040      1050 
pF1KE2 PWHKMELREQELMKIVGIKYEVGLPTLCCLKLAFLDPDTGKLTGGSFTMKYHDMPDVIDF
       ::.::.::.:::.:::::.:::: ::::::::::.:: ::::   ::...::::::::::
CCDS13 PWRKMDLRDQELVKIVGIRYEVGPPTLCCLKLAFIDPATGKLMDKSFSIRYHDMPDVIDF
           1000      1010      1020      1030      1040      1050  

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pF1KE2 LVLRQQFDDAKYRRWNIGDRFRSVIDDAWWFGTIESQEPLQLEYPDSLFQCYNVCWDNGD
       ::::: .:.:. : :.  :::::.:::::::::. :::: : .:::: :::: : ::: .
CCDS13 LVLRQFYDEARQRNWQSCDRFRSIIDDAWWFGTVLSQEPYQPQYPDSHFQCYIVRWDNTE
           1060      1070      1080      1090      1100      1110  

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pF1KE2 TEKMSPWDMELIPNNAVFPEELGTSVPLTDGECRSLIYKPLDGEWGTNPRDEECERIVAG
        ::.:::::: ::.:.  :::::.:. .:  : ..:.:::  :::: . :::::.::..:
CCDS13 IEKLSPWDMEPIPDNVDPPEELGASISVTTDELEKLLYKPQAGEWGQKSRDEECDRIISG
           1120      1130      1140      1150      1160      1170  

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pF1KE2 INQLMTLDIASAFVAPVDLQAYPMYCTVVAYPTDLSTIKQRLENRFYRRVSSLMWEVRYI
       :.::..::::.::..:::: .:: ::::::::::: ::..:: ::::::.:.:.::::::
CCDS13 IDQLLNLDIAAAFAGPVDLCTYPKYCTVVAYPTDLYTIRMRLVNRFYRRLSALVWEVRYI
           1180      1190      1200      1210      1220      1230  

            1240      1250      1260      1270      1280      1290 
pF1KE2 EHNTRTFNEPGSPIVKSAKFVTDLLLHFIKDQTCYNIIPLYNSMKKKVLSDSEDEEKDAD
       :::.:::::: : :..::: .:: ::.:::.: : ::  : :. ..   ...:: . :.:
CCDS13 EHNARTFNEPESVIARSAKKITDQLLKFIKNQHCTNISELSNTSENDE-QNAEDLD-DSD
           1240      1250      1260      1270      1280        1290

            1300      1310      1320      1330      1340      1350 
pF1KE2 VPGTSTRKRKDHQPRRRLRNRAQSYDIQAWKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYP
       .: ::. .:. :. .. .  :: .:  . :::::.::.::::::::::::::::::.:::
CCDS13 LPKTSSGRRRVHDGKKSI--RATNYVESNWKKQCKELVNLIFQCEDSEPFRQPVDLVEYP
             1300        1310      1320      1330      1340        

            1360      1370      1380      1390      1400      1410 
pF1KE2 DYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPMELCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLS
       ::::::::::::.::::::.::::.::.:.:::.::::::.:::::.:::.::::.::::
CCDS13 DYRDIIDTPMDFGTVRETLDAGNYDSPLEFCKDIRLIFSNAKAYTPNKRSKIYSMTLRLS
     1350      1360      1370      1380      1390      1400        

            1420      1430      1440      1450      1460       1470
pF1KE2 AFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRNTITKRRKKRNRSSSVSSSAASSPERKKRILKPQ-LK
       :.:::..... ::.: . .:...   ..: :.:.     . .. :.:... : :::. ::
CCDS13 ALFEEKMKKISSDFKIGQKFNEKLRRSQRFKQRQ-----NCKGDSQPNKSIRNLKPKRLK
     1410      1420      1430      1440           1450      1460   

             1480      1490      1500      1510      1520      1530
pF1KE2 SESSTSAFSTPTRSIPPRHNAAQINGKTESSSVVRTRSNRVVVDPVVTEQPSTSSAAKTF
       :...          : :.  ..  .. .  .. . :... . ..  ::   :..:: .. 
CCDS13 SQTK----------IIPELVGSPTQSTSSRTAYLGTHKTSAGISSGVTSGDSSDSAESSE
                    1470      1480      1490      1500      1510   

             1540      1550      1560      1570                    
pF1KE2 ITKANASAIPGKTILENSVKHSKALNTLSSPGQSSFSHGTRNNSAKEN------------
         : :     :.:. :. :. : : ..::: ..::  .. ... :.:.            
CCDS13 RRKRNRPITNGSTLSESEVEDSLA-TSLSSSASSSSEESKESSRARESSSRSGLSRSSNL
          1520      1530       1540      1550      1560      1570  

      1580      1590      1600      1610      1620      1630       
pF1KE2 -MEKEKPVKRKMKSSVLPKASTLSKSSAVIEQGDCKNNALVPGTIQVNGHGGQPSKLVKR
        . . . ..::     : ..   . .   .  .:  ::.:  : : .....:.  :....
CCDS13 RVTRTRAAQRKTGPVSLANGCGRKATRKRVYLSDSDNNSLETGEI-LKARAGNNRKVLRK
           1580      1590      1600      1610       1620      1630 

      1640       1650      1660      1670      1680      1690      
pF1KE2 GPGRKP-KVEVNTNSGEIIHKKRGRKPKKLQYAKPEDLEQNNVHPIRDEVLPSSTCNFLS
         .    :... ..  :   ..   . .:: .       .:     : ..: .:  .  :
CCDS13 CAAVAANKIKLMSDVEENSSSESVCSGRKLPH-------RNASAVARKKLLHNSE-DEQS
            1640      1650      1660             1670       1680   

       1700      1710          1720      1730      1740            
pF1KE2 ETNNVKEDLLQKKNR----GGRKPKRKMKTQKLDADLLVPASVKVLRRS---NRKKIDDP
         ....:. :. .:.    .. .  ..   .. . :    ....: :..   :  :   :
CCDS13 LKSEIEEEELKDENQLLPVSSSHTAQSNVDESENRDSESESDLRVARKNWHANGYKSHTP
          1690      1700      1710      1720      1730      1740   

    1750      1760      1770      1780      1790      1800         
pF1KE2 IDEEEEFEELKGSEPHMRTRNQGRRTAFYNEDDSEEEQRQLLFEDTSLTFGTSSRGRVRK
          . .: ....::   ....                                       
CCDS13 APSKTKFLKIESSEEDSKSHDSDHACNRTAGPSTSVQKLKAESISEEADSEPGRSGGRKY
          1750      1760      1770      1780      1790      1800   

>>CCDS13662.1 BRWD1 gene_id:54014|Hs108|chr21             (2320 aa)
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pF1KE2    MSCERKGLSELRSELYFLIARFLEDGPCQQAAQVLIREVAEKELLPRRTDWTGKEHP
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CCDS13 MAEPSSARRPVPLIESELYFLIARYLSAGPCRRAAQVLVQELEQYQLLPKRLDWEGNEHN
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE2 RTYQNLVKYYRHLAPDHLLQICHRLGPLLEQEIPQSVPGVQTLLGAGRQSLLRTNKSCKH
       :.:..::   .:.:::::::::.:.::.:..::: :.  : .:::::::::::: :.:.:
CCDS13 RSYEELVLSNKHVAPDHLLQICQRIGPMLDKEIPPSISRVTSLLGAGRQSLLRTAKDCRH
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 VVWKGSALAALHCGRPPESPVNYGSPPSIADTLFSRKLNGKYRLERLVPTAVYQHMKMHK
       .::::::.:::: ::::: ::::::::....   ...:.:   .    : ..:::.:::.
CCDS13 TVWKGSAFAALHRGRPPEMPVNYGSPPNLVEIHRGKQLTGCSTFSTAFPGTMYQHIKMHR
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE2 RILGHLSSVYCVTFDRTGRRIFTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHAAEISDMAVNYEN
       :::::::.::::.:::::.::::::::::::::.: .::::.:::::.::::::::::::
CCDS13 RILGHLSAVYCVAFDRTGHRIFTGSDDCLVKIWSTHNGRLLSTLRGHSAEISDMAVNYEN
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE2 TMIAAGSCDKMIRVWCLRTCAPLAVLQGHSASITSLQFSPLCSGSKRYLSSTGADGTICF
       ::::::::::.:::::::::::.::::::..:::::::::. .::.::. :::::::.::
CCDS13 TMIAAGSCDKIIRVWCLRTCAPVAVLQGHTGSITSLQFSPMAKGSQRYMVSTGADGTVCF
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 WLWDAGTLKINPRPAKFTERPRPGVQMICSSFSAGGMFLATGSTDHIIRVYFFGSGQPEK
       : ::  .::..::: ::::.:::::::.:::::.::::::::::::.::.::.:   :::
CCDS13 WQWDLESLKFSPRPLKFTEKPRPGVQMLCSSFSVGGMFLATGSTDHVIRMYFLGFEAPEK
              310       320       330       340       350       360

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 ISELEFHTDKVDSIQFSNTSNRFVSGSRDGTARIWQFKRREWKSILLDMATRPAGQNLQG
       :.::: :::::::::: :...::.:::::::::::.:.. ::.::::::::: .: .:..
CCDS13 IAELESHTDKVDSIQFCNNGDRFLSGSRDGTARIWRFEQLEWRSILLDMATRISG-DLSS
              370       380       390       400       410          

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE2 IEDKITKMKVTMVAWDRHDNTVITAVNNMTLKVWNSYTGQLIHVLMGHEDEVFVLEPHPF
        :... : ::::.::...:. :.::::. .:::::::::::.: :::: ::::::: :::
CCDS13 EEERFMKPKVTMIAWNQNDSIVVTAVNDHVLKVWNSYTGQLLHNLMGHADEVFVLETHPF
     420       430       440       450       460       470         

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE2 DPRVLFSAGHDGNVIVWDLARGVKIRSYFNMIEGQGHGAVFDCKCSPDGQHFACTDSHGH
       : :...::::::....::...:.:.. ::::::::::::::::: : :::::::::::::
CCDS13 DSRIMLSAGHDGSIFIWDITKGTKMKHYFNMIEGQGHGAVFDCKFSQDGQHFACTDSHGH
     480       490       500       510       520       530         

       540       550       560       570       580       590       
pF1KE2 LLIFGFGSSSKYDKIADQMFFHSDYRPLIRDANNFVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNP
       ::::::: :. :.:: ::::::.::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLIFGFGCSKPYEKIPDQMFFHTDYRPLIRDSNNYVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNP
     540       550       560       570       580       590         

       600       610       620           630         640           
pF1KE2 HPSRYQRLVPGRENCREEQLIPQMG--VTSSG--LNQVLSQQANQ--EISP----LDSMI
       ::..::::::::::  .:.::::.:  .::.:  ..:..: :.:.  : ::    ::.::
CCDS13 HPTKYQRLVPGRENSADEHLIPQLGYVATSDGEVIEQIISLQTNDNDERSPESSILDGMI
     600       610       620       630       640       650         

       650       660            670        680       690       700 
pF1KE2 QRLQQEQDLRRSGEA-----GISNTSRLSRGSISSTS-EVHSPPNVGLRRSGQIEGVRQM
       ..:::.:: : ...      :.::  .  : ..   : ...::::.:::::::.::::::
CCDS13 RQLQQQQDQRMGADQDTIPRGLSNGEETPRRGFRRLSLDIQSPPNIGLRRSGQVEGVRQM
     660       670       680       690       700       710         

             710       720       730       740       750       760 
pF1KE2 HSNAPRSEIATERDLVAWSRRVVVPELSAGVASRQEEWRTAKGEEEIKTYRSEEKRKHLT
       :.:::::.::::::: ::.:::::::.  :.  . :..:  ::::: . :   .::: : 
CCDS13 HQNAPRSQIATERDLQAWKRRVVVPEVPLGIFRKLEDFRLEKGEEERNLYIIGRKRKTLQ
     720       730       740       750       760       770         

              770       780       790       800        810         
pF1KE2 VP-KENKIPTVSKNHAHEHFLDLGESKKQQTNQHNYRTRSALE-ETPRPSEEIENGSSSS
       .  : ...  ::... .        . ...  ... :.::  :  .   :       .: 
CCDS13 LSHKSDSVVLVSQSRQR--------TCRRKYPNYGRRNRSWRELSSGNESSSSVRHETSC
     780       790               800       810       820       830 

     820       830       840              850       860       870  
pF1KE2 DEGEVVAVSGGTSEEEERAWHSDG-------SSSDYSSDYSDWTADAGINLQPPKKVP-K
       :..:    ..:.:::.:  :.::        :::: :: ::::::::::::::: ..  .
CCDS13 DQSE----GSGSSEEDE--WRSDRKSESYSESSSDSSSRYSDWTADAGINLQPPLRTSCR
                 840         850       860       870       880     

             880       890       900       910       920       930 
pF1KE2 NKTKKAESSSDEEEESEKQKQKQIKKEKKKVNEEKDGPISPKKKKPKERKQKRLAVGELT
        .  .  :::..:  .:. .  . ....:: :            :::... .:.. .::.
CCDS13 RRITRFCSSSEDEISTENLSPPKRRRKRKKEN------------KPKKENLRRMTPAELA
         890       900       910                   920       930   

             940       950       960       970       980       990 
pF1KE2 ENGLTLEEWLPSTWITDTIPRRCPFVPQMGDEVYYFRQGHEAYVEMARKNKIYSINPKKQ
        :   : :. : .:::::  :. :::::::::: :::::::::.: .:.:.:: .::.:.
CCDS13 -NMEHLYEFHPPVWITDTTLRKSPFVPQMGDEVIYFRQGHEAYIEAVRRNNIYELNPNKE
            940       950       960       970       980       990  

            1000      1010      1020      1030      1040      1050 
pF1KE2 PWHKMELREQELMKIVGIKYEVGLPTLCCLKLAFLDPDTGKLTGGSFTMKYHDMPDVIDF
       ::.::.::.:::.:::::.:::: ::::::::::.:: ::::   ::...::::::::::
CCDS13 PWRKMDLRDQELVKIVGIRYEVGPPTLCCLKLAFIDPATGKLMDKSFSIRYHDMPDVIDF
           1000      1010      1020      1030      1040      1050  

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pF1KE2 LVLRQQFDDAKYRRWNIGDRFRSVIDDAWWFGTIESQEPLQLEYPDSLFQCYNVCWDNGD
       ::::: .:.:. : :.  :::::.:::::::::. :::: : .:::: :::: : ::: .
CCDS13 LVLRQFYDEARQRNWQSCDRFRSIIDDAWWFGTVLSQEPYQPQYPDSHFQCYIVRWDNTE
           1060      1070      1080      1090      1100      1110  

            1120      1130      1140      1150      1160      1170 
pF1KE2 TEKMSPWDMELIPNNAVFPEELGTSVPLTDGECRSLIYKPLDGEWGTNPRDEECERIVAG
        ::.:::::: ::.:.  :::::.:. .:  : ..:.:::  :::: . :::::.::..:
CCDS13 IEKLSPWDMEPIPDNVDPPEELGASISVTTDELEKLLYKPQAGEWGQKSRDEECDRIISG
           1120      1130      1140      1150      1160      1170  

            1180      1190      1200      1210      1220      1230 
pF1KE2 INQLMTLDIASAFVAPVDLQAYPMYCTVVAYPTDLSTIKQRLENRFYRRVSSLMWEVRYI
       :.::..::::.::..:::: .:: ::::::::::: ::..:: ::::::.:.:.::::::
CCDS13 IDQLLNLDIAAAFAGPVDLCTYPKYCTVVAYPTDLYTIRMRLVNRFYRRLSALVWEVRYI
           1180      1190      1200      1210      1220      1230  

            1240      1250      1260      1270      1280      1290 
pF1KE2 EHNTRTFNEPGSPIVKSAKFVTDLLLHFIKDQTCYNIIPLYNSMKKKVLSDSEDEEKDAD
       :::.:::::: : :..::: .:: ::.:::.: : ::  : :. ..   ...:: . :.:
CCDS13 EHNARTFNEPESVIARSAKKITDQLLKFIKNQHCTNISELSNTSENDE-QNAEDLD-DSD
           1240      1250      1260      1270      1280        1290

            1300      1310      1320      1330      1340      1350 
pF1KE2 VPGTSTRKRKDHQPRRRLRNRAQSYDIQAWKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYP
       .: ::. .:. :. .. .  :: .:  . :::::.::.::::::::::::::::::.:::
CCDS13 LPKTSSGRRRVHDGKKSI--RATNYVESNWKKQCKELVNLIFQCEDSEPFRQPVDLVEYP
             1300        1310      1320      1330      1340        

            1360      1370      1380      1390      1400      1410 
pF1KE2 DYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPMELCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLS
       ::::::::::::.::::::.::::.::.:.:::.::::::.:::::.:::.::::.::::
CCDS13 DYRDIIDTPMDFGTVRETLDAGNYDSPLEFCKDIRLIFSNAKAYTPNKRSKIYSMTLRLS
     1350      1360      1370      1380      1390      1400        

            1420      1430      1440      1450      1460       1470
pF1KE2 AFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRNTITKRRKKRNRSSSVSSSAASSPERKKRILKPQ-LK
       :.:::..... ::.: . .:...   ..: :.:.     . .. :.:... : :::. ::
CCDS13 ALFEEKMKKISSDFKIGQKFNEKLRRSQRFKQRQ-----NCKGDSQPNKSIRNLKPKRLK
     1410      1420      1430      1440           1450      1460   

             1480      1490      1500      1510      1520      1530
pF1KE2 SESSTSAFSTPTRSIPPRHNAAQINGKTESSSVVRTRSNRVVVDPVVTEQPSTSSAAKTF
       :...          : :.  ..  .. .  .. . :... . ..  ::   :..:: .. 
CCDS13 SQTK----------IIPELVGSPTQSTSSRTAYLGTHKTSAGISSGVTSGDSSDSAESSE
                    1470      1480      1490      1500      1510   

             1540      1550      1560      1570                    
pF1KE2 ITKANASAIPGKTILENSVKHSKALNTLSSPGQSSFSHGTRNNSAKEN------------
         : :     :.:. :. :. : : ..::: ..::  .. ... :.:.            
CCDS13 RRKRNRPITNGSTLSESEVEDSLA-TSLSSSASSSSEESKESSRARESSSRSGLSRSSNL
          1520      1530       1540      1550      1560      1570  

      1580      1590      1600      1610      1620      1630       
pF1KE2 -MEKEKPVKRKMKSSVLPKASTLSKSSAVIEQGDCKNNALVPGTIQVNGHGGQPSKLVKR
        . . . ..::     : ..   . .   .  .:  ::.:  : : .....:.  :....
CCDS13 RVTRTRAAQRKTGPVSLANGCGRKATRKRVYLSDSDNNSLETGEI-LKARAGNNRKVLRK
           1580      1590      1600      1610       1620      1630 

      1640       1650      1660      1670      1680      1690      
pF1KE2 GPGRKP-KVEVNTNSGEIIHKKRGRKPKKLQYAKPEDLEQNNVHPIRDEVLPSSTCNFLS
         .    :... ..  :   ..   . .:: .       .:     : ..: .:  .  :
CCDS13 CAAVAANKIKLMSDVEENSSSESVCSGRKLPH-------RNASAVARKKLLHNSE-DEQS
            1640      1650      1660             1670       1680   

       1700      1710          1720      1730      1740            
pF1KE2 ETNNVKEDLLQKKNR----GGRKPKRKMKTQKLDADLLVPASVKVLRRS---NRKKIDDP
         ....:. :. .:.    .. .  ..   .. . :    ....: :..   :  :   :
CCDS13 LKSEIEEEELKDENQLLPVSSSHTAQSNVDESENRDSESESDLRVARKNWHANGYKSHTP
          1690      1700      1710      1720      1730      1740   

    1750      1760      1770      1780      1790      1800         
pF1KE2 IDEEEEFEELKGSEPHMRTRNQGRRTAFYNEDDSEEEQRQLLFEDTSLTFGTSSRGRVRK
          . .: ....::   ....                                       
CCDS13 APSKTKFLKIESSEEDSKSHDSDHACNRTAGPSTSVQKLKAESISEEADSEPGRSGGRKY
          1750      1760      1770      1780      1790      1800   

>>CCDS14447.1 BRWD3 gene_id:254065|Hs108|chrX             (1802 aa)
 initn: 4701 init1: 1845 opt: 3678  Z-score: 2232.2  bits: 426.2 E(32554): 5.2e-118
Smith-Waterman score: 6446; 54.3% identity (76.7% similar) in 1881 aa overlap (9-1821:6-1800)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MSCERKGLSELRSELYFLIARFLEDGPCQQAAQVLIREVAEKELLPRRTDWTGKEHPRTY
               .....:::.::::::..:::...::::..:. :..:.::: :: :::: :..
CCDS14    MAAAPTQIEAELYYLIARFLQSGPCNKSAQVLVQELEEHQLIPRRLDWEGKEHRRSF
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 QNLVKYYRHLAPDHLLQICHRLGPLLEQEIPQSVPGVQTLLGAGRQSLLRTNKSCKHVVW
       ..::    :. ::.::.::.:.::::..::::::::::::::.:::::::  :.:: ..:
CCDS14 EDLVAANAHIPPDYLLKICERIGPLLDKEIPQSVPGVQTLLGVGRQSLLRDAKDCKSTLW
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 KGSALAALHCGRPPESPVNYGSPPSIADTLFSRKLNGKYRLERLVPTAVYQHMKMHKRIL
       .:::.:::: ::::: :::: .::....   .:.:.:  :. .. :...:::.:::::::
CCDS14 NGSAFAALHRGRPPELPVNYVKPPNVVNITSARQLTGCSRFGHIFPSSAYQHIKMHKRIL
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 GHLSSVYCVTFDRTGRRIFTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHAAEISDMAVNYENTMI
       :::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:
CCDS14 GHLSSVYCVAFDRSGRRIFTGSDDCLVKIWATDDGRLLATLRGHSAEISDMAVNYENTLI
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 AAGSCDKMIRVWCLRTCAPLAVLQGHSASITSLQFSPLCSGSKRYLSSTGADGTICFWLW
       :::::::..::::::::::.::::::::::::.:: :  .:..:::.::::::::::: :
CCDS14 AAGSCDKVVRVWCLRTCAPVAVLQGHSASITSIQFCPSTKGTNRYLTSTGADGTICFWQW
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 DAGTLKINPRPAKFTERPRPGVQMICSSFSAGGMFLATGSTDHIIRVYFFGSGQPEKISE
        . :.:.  ::.::::: :::::. :::::.::::..::::::.::.:..::  ::::.:
CCDS14 HVKTMKFRDRPVKFTERSRPGVQISCSSFSSGGMFITTGSTDHVIRIYYLGSEVPEKIAE
       300       310       320       330       340       350       

              370         380       390       400       410        
pF1KE2 LEFHTDKVDSIQFSNTSN--RFVSGSRDGTARIWQFKRREWKSILLDMATRPAGQNLQGI
       :: ::::: ..:: :...  :::::::::::::::....:::::.:::::. .:.:: . 
CCDS14 LESHTDKVVAVQFCNNGDSLRFVSGSRDGTARIWQYQQQEWKSIVLDMATKMTGNNLPSG
       360       370       380       390       400       410       

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE2 EDKITKMKVTMVAWDRHDNTVITAVNNMTLKVWNSYTGQLIHVLMGHEDEVFVLEPHPFD
       ::::::.:::::::::.:.::::::::. :::::: ::::.:.: ::.::::::: ::::
CCDS14 EDKITKLKVTMVAWDRYDTTVITAVNNFLLKVWNSITGQLLHTLSGHDDEVFVLEAHPFD
       420       430       440       450       460       470       

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE2 PRVLFSAGHDGNVIVWDLARGVKIRSYFNMIEGQGHGAVFDCKCSPDGQHFACTDSHGHL
        :...:::::::...::: ::.:::.::::::::::::::::: ::::.:::::::::::
CCDS14 QRIILSAGHDGNIFIWDLDRGTKIRNYFNMIEGQGHGAVFDCKFSPDGNHFACTDSHGHL
       480       490       500       510       520       530       

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE2 LIFGFGSSSKYDKIADQMFFHSDYRPLIRDANNFVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNPH
       :.:::: :. :.:: ::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLFGFGCSKYYEKIPDQMFFHTDYRPLIRDANNYVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDVDGNPH
       540       550       560       570       580       590       

      600       610       620           630        640       650   
pF1KE2 PSRYQRLVPGRENCREEQLIPQMGVTSSG----LNQVLSQQAN-QEISPLDSMIQRLQQE
       :...::::::::::..::::::.: ...:    ..::..::.: :. : ::..:..::.:
CCDS14 PTKFQRLVPGRENCKDEQLIPQLGYVANGDGEVVEQVIGQQTNDQDESILDGIIRELQRE
       600       610       620       630       640       650       

           660           670        680       690        700       
pF1KE2 QDLRRSGEAGIS----NTSRLSRGSISSTS-EVHSPPNVGLRR-SGQIEGVRQMHSNAPR
       ::::  .:. .     : .    :.. : . .. : ::. ::: :.:::::::::.::::
CCDS14 QDLRLINEGDVPHLPVNRAYSVNGALRSPNMDISSSPNIRLRRHSSQIEGVRQMHNNAPR
       660       670       680       690       700       710       

       710       720       730       740       750        760      
pF1KE2 SEIATERDLVAWSRRVVVPELSAGVASRQEEWRTAKGEEEIKTYRSEEKRK-HLTVPKEN
       :..::::::.:::::::: ::. ::.  ::: :::::. ::. :  :.:.:   :. ...
CCDS14 SQMATERDLMAWSRRVVVNELNNGVSRVQEECRTAKGDIEISLYTVEKKKKPSYTTQRND
       720       730       740       750       760       770       

        770       780       790       800       810           820  
pF1KE2 KIPTVSKNHAHEHFLDLGESKKQQTNQHNYRTRSALEETPRPSEEI----ENGSSSSDEG
         :. ...            . :.  ::.:.::: .:.. . : .     :...:::.: 
CCDS14 YEPSCGRSL----------RRTQRKRQHTYQTRSNIEHNSQASCQNSGVQEDSDSSSEED
       780                 790       800       810       820       

            830       840       850       860       870       880  
pF1KE2 EVVAVSGGTSEEEERAWHSDGSSSDYSSDYSDWTADAGINLQPPKKVPKNKTKKAESSSD
       :.:..: .. :.    :.:..:::: ::.::::::::::::::::.  .. :.:  ::::
CCDS14 ETVGTSDASVEDPVVEWQSESSSSDSSSEYSDWTADAGINLQPPKRQTRQTTRKICSSSD
       830       840       850       860       870       880       

            890       900       910       920       930       940  
pF1KE2 EEEESEKQKQKQIKKEKKKVNEEKDGPISPKKKKPKERKQKRLAVGELTENGLTLEEWLP
       ::.              :...:        ..::::. ..:.   : ..  :   :::. 
CCDS14 EENL-------------KSLEE--------RQKKPKQTRKKK--GGLVSIAGEPNEEWFA
       890                            900         910       920    

            950       960       970       980       990      1000  
pF1KE2 STWITDTIPRRCPFVPQMGDEVYYFRQGHEAYVEMARKNKIYSINPKKQPWHKMELREQE
         :: :::::: :::::::::. ::::::::::. .::.::::.: .::::.::.:::::
CCDS14 PQWILDTIPRRSPFVPQMGDELIYFRQGHEAYVRAVRKSKIYSVNLQKQPWNKMDLREQE
          930       940       950       960       970       980    

           1010      1020      1030      1040      1050      1060  
pF1KE2 LMKIVGIKYEVGLPTLCCLKLAFLDPDTGKLTGGSFTMKYHDMPDVIDFLVLRQQFDDAK
       ..:::::::::: ::::::::::::: .::.:: ::..::::::::::::::.: ...::
CCDS14 FVKIVGIKYEVGPPTLCCLKLAFLDPISGKMTGESFSIKYHDMPDVIDFLVLHQFYNEAK
          990      1000      1010      1020      1030      1040    

           1070      1080      1090      1100      1110      1120  
pF1KE2 YRRWNIGDRFRSVIDDAWWFGTIESQEPLQLEYPDSLFQCYNVCWDNGDTEKMSPWDMEL
        : :.:::::::.:::::::::.:::.:.: ::::: ::::.: :::.. ::::::::: 
CCDS14 ERNWQIGDRFRSIIDDAWWFGTVESQQPFQPEYPDSSFQCYSVHWDNNEREKMSPWDMEP
         1050      1060      1070      1080      1090      1100    

           1130      1140      1150      1160      1170      1180  
pF1KE2 IPNNAVFPEELGTSVPLTDGECRSLIYKPLDGEWGTNPRDEECERIVAGINQLMTLDIAS
       ::....::.:.:..::... :  .:.::: .::::.. :::::::.. :::.:..::.::
CCDS14 IPEGTAFPDEVGAGVPVSQEELTALLYKPQEGEWGAHSRDEECERVIQGINHLLSLDFAS
         1110      1120      1130      1140      1150      1160    

           1190      1200      1210      1220      1230      1240  
pF1KE2 AFVAPVDLQAYPMYCTVVAYPTDLSTIKQRLENRFYRRVSSLMWEVRYIEHNTRTFNEPG
        :..::::.:::.:::::::::::.::..:::::::::.:.:::::::::::.:::::: 
CCDS14 PFAVPVDLSAYPLYCTVVAYPTDLNTIRRRLENRFYRRISALMWEVRYIEHNARTFNEPD
         1170      1180      1190      1200      1210      1220    

           1250      1260      1270        1280          1290      
pF1KE2 SPIVKSAKFVTDLLLHFIKDQTCYNIIPLYNSMK--KKVLSDSEDEEK----DADVPGTS
       :::::.::.:::.::.:: ::.: .:.  ::..:  ..  .:.:.. .    :.: ::::
CCDS14 SPIVKAAKIVTDVLLRFIGDQSCTDILDTYNKIKAEERNSTDAEEDTEIVDLDSDGPGTS
         1230      1240      1250      1260      1270      1280    

       1300      1310        1320      1330      1340      1350    
pF1KE2 TRKRKDHQPRRRLRNRAQSY--DIQAWKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYP---
       . ..       . :.: ::   . .::::::.:::.::.. :::::::::.::: ::   
CCDS14 SGRKV------KCRGRRQSLKCNPDAWKKQCKELLSLIYEREDSEPFRQPADLLSYPGHQ
               1290      1300      1310      1320      1330        

                                  1360      1370      1380         
pF1KE2 ----------------------DYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPMELCKDVRLIF
                             ::.:.::::.::.::.:::::::: ::.:. :::: ::
CCDS14 EQEGESSESVVPERQQDSSLSEDYQDVIDTPVDFSTVKETLEAGNYGSPLEFYKDVRQIF
     1340      1350      1360      1370      1380      1390        

    1390      1400      1410      1420      1430      1440         
pF1KE2 SNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLSAFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRNTITKRRKKRNRSSS
       .:::::: .:.:::::: :::::.:: ::....:.::::.. .::     :.. :. :::
CCDS14 NNSKAYTSNKKSRIYSMMLRLSALFESHIKNIISEYKSAIQSQKRRRPRYRKRLRSSSSS
     1400      1410      1420      1430      1440      1450        

    1450      1460      1470      1480      1490      1500         
pF1KE2 VSSSAASSPERKKRILKPQLKSESSTSAFSTPTRSIPPRHNAAQINGKTESSSVVRTRSN
       .:::.: ::. :.. .: : :....::.  . .:.  :   .. ..  .:. :.    . 
CCDS14 LSSSGAPSPKGKQKQMKLQPKNDQNTSV--SHARTSSPF--SSPVSDAAEGLSLYLLDD-
     1460      1470      1480        1490        1500      1510    

    1510      1520      1530      1540       1550      1560        
pF1KE2 RVVVDPVVTEQPSTSSAAKTFITKANASAIPGKTI-LENSVKHSKALNTLSSPGQSSFSH
           .:   . : .::.   . .... :  :::.  ..: :   :  ..:..:  .. ..
CCDS14 ----EP---DGPFSSSSFGGY-SRSGNSHDPGKAKSFRNRVLPVKQDHSLDGPLTNGDGR
                 1520       1530      1540      1550      1560     

     1570               1580      1590       1600      1610        
pF1KE2 GTRNN------SAKE---NMEKEKPVKRKMK-SSVLPKASTLSKSSAVIEQGDCKNNALV
         :..      ::.:   ::  :   :.. : .: :  . .   .:..  .. : ...  
CCDS14 EPRTGIKRKLLSASEEDENMGGEDKEKKETKEKSHLSTSESGELGSSLSSESTCGSDSDS
        1570      1580      1590      1600      1610      1620     

     1620         1630       1640      1650      1660      1670    
pF1KE2 PGTIQVNGH---GGQP-SKLVKRGPGRKPKVEVNTNSGEIIHKKRGRKPKKLQYAKPEDL
        .: ...     : .  ::...  : :  :.. . ..:.   : ::   .  ....    
CCDS14 ESTSRTDQDYVDGDHDYSKFIQTRPKR--KLRKQHGNGKRNWKTRGTGGRG-RWGRWGRW
        1630      1640      1650        1660      1670       1680  

         1680      1690      1700      1710      1720      1730    
pF1KE2 EQNNVHPIRDEVLPSSTCNFLSETNNVKEDLLQKKNRGGRKPKRKMKTQKLDADLLVPAS
        ...    :     .:     . : .      . ..::::  .:                
CCDS14 SRGGRG--RGGRGRGSRGRGGGGTRG------RGRGRGGRGASRGAT-------------
             1690      1700            1710      1720              

         1740      1750      1760       1770      1780      1790   
pF1KE2 VKVLRRSNRKKIDDPIDEEEEFEELKGSE-PHMRTRNQGRRTAFYNEDDSEEEQRQLLFE
            :..: .: :  :: . .   . :. :...::::::::..:: :::...  ...  
CCDS14 -----RAKRARIAD--DEFDTMFSGRFSRLPRIKTRNQGRRTVLYN-DDSDND--NFVST
                 1730        1740      1750      1760         1770 

          1800      1810       1820   
pF1KE2 DTSLTFGTSSRGRVRKLTEKAK-ANLIGW  
       .  :..:::  :::::.::::. ..:.::  
CCDS14 EDPLNLGTSRSGRVRKMTEKARVSHLMGWNY
            1780      1790      1800  

>>CCDS33557.1 BRWD1 gene_id:54014|Hs108|chr21             (120 aa)
 initn: 458 init1: 458 opt: 468  Z-score: 311.1  bits: 66.9 E(32554): 5.2e-11
Smith-Waterman score: 468; 58.9% identity (82.1% similar) in 112 aa overlap (2-113:5-116)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE2    MSCERKGLSELRSELYFLIARFLEDGPCQQAAQVLIREVAEKELLPRRTDWTGKEHP
           :  :. .  ..:::::::::.:  :::..:::::..:. . .:::.: :: :.:: 
CCDS33 MAEPSSARRPVPLIESELYFLIARYLSAGPCRRAAQVLVQELEQYQLLPKRLDWEGNEHN
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 RTYQNLVKYYRHLAPDHLLQICHRLGPLLEQEIPQSVPGVQTLLGAGRQSLLRTNKSCKH
       :.:..::   .:.:::::::::.:.::.:..::: :.  : .:::::::::::: :    
CCDS33 RSYEELVLSNKHVAPDHLLQICQRIGPMLDKEIPPSISRVTSLLGAGRQSLLRTAKGTLI
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 VVWKGSALAALHCGRPPESPVNYGSPPSIADTLFSRKLNGKYRLERLVPTAVYQHMKMHK




1821 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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