FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2317, 1051 aa 1>>>pF1KE2317 1051 - 1051 aa - 1051 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8593+/-0.000918; mu= 19.4331+/- 0.056 mean_var=82.6216+/-16.426, 0's: 0 Z-trim(107.2): 32 B-trim: 162 in 1/52 Lambda= 0.141100 statistics sampled from 9378 (9410) to 9378 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16 Scan time: 4.130 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17 (1051) 7114 1458.6 0 CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3 (1035) 1010 216.0 3.3e-55 CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 (1032) 962 206.3 2.9e-52 CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1044) 953 204.4 1e-51 CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1048) 948 203.4 2.1e-51 CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1002) 901 193.8 1.5e-48 CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10 (1063) 863 186.1 3.4e-46 CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1012) 847 182.9 3.1e-45 CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17 (1039) 722 157.4 1.5e-37 CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1170) 679 148.7 6.9e-35 CCDS76204.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1024) 670 146.8 2.2e-34 CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12 (1049) 670 146.8 2.3e-34 CCDS72869.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1167) 670 146.9 2.5e-34 CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15 (1188) 656 144.0 1.8e-33 CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1086) 655 143.8 1.9e-33 CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17 (1179) 621 136.9 2.5e-31 CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161) 573 127.1 2.2e-28 CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153) 556 123.6 2.4e-27 CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1137) 549 122.2 6.3e-27 CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152) 549 122.2 6.3e-27 CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1141) 534 119.2 5.2e-26 CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163) 509 114.1 1.8e-24 CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1169) 509 114.1 1.8e-24 CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs108|chr5 (1181) 461 104.3 1.6e-21 CCDS82534.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 ( 954) 454 102.8 3.6e-21 CCDS2249.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 (1073) 454 102.9 4e-21 CCDS46451.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 (1091) 454 102.9 4e-21 >>CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17 (1051 aa) initn: 7114 init1: 7114 opt: 7114 Z-score: 7819.9 bits: 1458.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7114; 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CCDS26 GKTCREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACAHRWKNIYYEA--DHILPHGFCYIIPSNLQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMIQRK . :. :. .. . : : :: : .: ::.. : .::::.. : :. .. CCDS26 AKGRTLIPCYE-EYKKKYGE--EHGSCQAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTIKVL--- 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KE2 EWDLSEYSYKDPEDQGNL-----YIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVFLL- .:.. .: .:. . :.::.. .: : ::..: .: :::. . .: :... CCDS26 --NLTDNTYLKLNDEVIMNRRYTYLGYAVTAGHFS-HPSTIDVVGGAPQDKGIGKVYIFR 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 SQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFERKEEVGGAIYV ... .: : . :...:.::::.. .:::.:: .:::::::.. : ..: : . : CCDS26 ADRRSGTLIKIFQASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMFSEIRDE--GQVTV 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 FMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSAFGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEG--LGKVYIY ..:... .. . .: : .. :: :.::. :...::: :.:.::: : : :::: CCDS26 YINRGNGALEEQLALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKEDDFAGAVYIY 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 HSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGS-LSDHIVLLR :... :.. : .. . :.:.. : : :: :.:: .:.: : :::. ::. .:: .:::: CCDS26 HGDAGGIVPQYSMKLSGQKIN-PVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFMSDSVVLLR 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 pF1KE2 ARPVINIVHKTLVPRPAVLDPALC----TATSCVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYT :::::.. . ..: . : ..:..: ::... . :. .: : :. CCDS26 ARPVITVDVSIFLPGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSFH-GKHVPG---EIGLNYV 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 LEADRDRRP----PRLRFA--G-SESAVFHGF-FSMPEMRCQKLELLLMDNLRDKLRPII : :: .. ::. :. : . . : . . ... : :.. . ..: . ::. CCDS26 LMADVAKKEKGQMPRVYFVLLGETMGQVTEKLQLTYMEETCRHYVAHVKRRVQDVISPIV 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 ISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPIL--NQAQALENHTEVQFQKECGPDNKCESNLQM . ::: .. . . : : :.: ...: . ..... :...: .. : ..::. CCDS26 FEAAYSLSEHVTGEEERELPPLT--PVLRWKKGQKIAQKNQTVFERNCRSED-CAADLQL 580 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 RAAFV-SEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVPPALLLS .. .. : ...: : . :... :.:...: :.::..: ... : :.. CCDS26 QGKLLLSSMDEKTLYLALGA-VKNISLNISISNL------GDDAYDANVSFNVSRELFFI 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 SV---RPPG-ACQANETIF--CELGNPFKRNQ-RMELLITFEVIGVTLHTRDLQ--VQLQ .. . : .:. :. : : .: :: :.. ..:. . :.. .. . . :. : : CCDS26 NMWQKEEMGISCELLESDFLKCSVGFPFMRSKSKYEFSVIFDTSHLSGEEEVLSFIVTAQ 690 700 710 720 730 740 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 LSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVN-HRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVG---S ... ....: :.:.: ... :... :: : . ... ..:. . CCDS26 SGNTERSESLHDNTLVLMVPLMHEVDTSITGIMSPTSFVYGESVDAANFIQLDDLECHFQ 750 760 770 780 790 800 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 PLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPTEITVHGNGSWPCRPPGDLI :.. .:: : . . :. : .. .: ..:.: .. .. : :. . : CCDS26 PINITLQVYNTGPSTLP-GSSV-SISFPNRLSSGGAEMFHVQEMVVGQEKGNCSFQK--- 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 pF1KE2 NPLNLTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSETVLTCATGRAHCVW :: . ::... . :. : ... :: : :. CCDS26 NPTPCII---------PQEQENIFH----------TIFAFFTKSGRKVLDCEKPGISCLT 860 870 880 890 900 920 930 940 950 960 970 pF1KE2 LECPIPDAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTW .: . . :. . .: : . . .. . : . . .. .... . . CCDS26 AHCNFSALAKEESRTIDIYMLLNTEILKKDSSSVIQFMSRAKVKVDPALRVVEIAHGNPE 910 920 930 940 950 960 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE2 FSVDIDSELVEELPAE--IELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFFKRARTRALYEAK : . : ...: . . :.. ... .:.:.. :. .:::: :::.: : . . ::. CCDS26 -EVTVVFEALHNLEPRGYVVGWIIAISLLVGILIFLLLAVLLWKMGFFRR-RYKEIIEAE 970 980 990 1000 1010 1040 1050 pF1KE2 RQKAEMKSQPSETERLTDDY ... : CCDS26 KNRKENEDSWDWVQKNQ 1020 1030 >>CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 (1032 aa) initn: 483 init1: 243 opt: 962 Z-score: 1051.9 bits: 206.3 E(32554): 2.9e-52 Smith-Waterman score: 1048; 27.4% identity (56.3% similar) in 1076 aa overlap (3-1033:9-1019) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGY ::: :: .:: : : : .: .:.::. .. . : ..:::: CCDS42 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLL-LCLGVPTG----RPYNVDTESALLYQ-GPHNTLFGY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SVALHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDD-CERMNITVKN- ::.:: .. .:.::. ::: . .. . ::.: : . . . ::.... : CCDS42 SVVLH--SHGANRWLLV-GAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 DP-GHHIIED---MWLGVTVASQ-GPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRMVGKCYVRGN .: :. .:. .:::::.. : : : ...:.::. .... .:. . .: :: CCDS42 EPCGKTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNEN-KLPTGGCYGVPP 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 DLELDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMI ::. . : .... .. . . . :: : :. .:.. . .::::. : :. .. CCDS42 DLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFAS--CQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFV- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 QRKEWDLSEYSYK---DPEDQGNL--YIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVF .... .:: : ..: .. :.::.. .: : .. .: :::.:...: .. CCDS42 ----YNITTNKYKAFLDKQNQVKFGSYLGYSVGAGHF-RSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAY 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 LLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFERKEEVGGAI ..: . .: . ..:...:.:::... .::: ::..:::::::. .:: : . CCDS42 IFSIDEK-ELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREE--GRV 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 pF1KE2 YVFMNQ-AGTSFPAHPSLLLHGPSGSA-FGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEG--LGK .:..:. .:. . : . :. . . .: :: :....:::..:::.:.:.::: : : CCDS42 FVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGA 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSL-SDHI .:::.. . :. .: :.: ... .:. :: :.:::.:.:.: : :. ::.. :: CCDS42 IYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQIS-KSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSA 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 VLLRARPVINIVHKTLV-PRPAVLDPALCTATS----CVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNI ::::.:::. :: .: :. . :. .. :... :::.: .. :.: : CCDS42 VLLRTRPVV-IVDASLSHPESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSY-KGKEVPGY---I 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 TLAYTLEADRDRR---PPRLRFAGS-ESAVFHGFFSMP--EMRCQKLELLLMDNLRDKLR .: :.. : .:. :::. :... : :. : ... : :. . .. ..:: : CCDS42 VLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILT 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 PIIISMNYSL-PLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQALENHTE-VQFQKECGPDNKCESN :: : : : : . : . :. :::.: . . . ..: . :. .: : .. CCDS42 PIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ--PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSAD 580 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 LQMRA--AFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVPPA ::. : .:.. ...: . : . ... :.:.... : .:.::.:. : . .: . CCDS42 LQVSAKIGFLKPHENK-TYLAVG-SMKTLMLNVSLFN------AGDDAYETTLHVKLPVG 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 LLLSSVRPPGACQANETIFCELGNPFKRNQRMELLITFEVIGVTLHTR-DLQVQLQLSTS : . .. : : ::. . . ..: .. : : .: :.. :..:. CCDS42 LYFIKILELEEKQIN----CEVTD---NSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFLLDVSSL 690 700 710 720 730 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 SHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVNHRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQV :. .. :.. : : .. : : . . . . ::. .: .. . CCDS42 SRAEE----DLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGS 740 750 760 770 780 790 810 820 830 840 850 pF1KE2 GPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPT---EITVHGNGSWPCRPPGD-LINPLN . .: . .: .. ..: : . :. :: : .. : : : :.: :. CCDS42 NDENEPET---CMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFS----PQTDKLFNILD 800 810 820 830 840 860 870 880 890 900 910 pF1KE2 LTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSET---VLTCATGRAHCVWL . . :. .: :. : :: . . :.: .: : . ::. . CCDS42 VQTTT-GECHFENYQRVCALEQ---QKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF 850 860 870 880 890 900 920 930 940 950 960 970 pF1KE2 ECPIPDAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTWF : . ...:. .. . : .. . . .. . :: : . . : . :: CCDS42 LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPN-PRVIELNKDE-- 910 920 930 940 950 980 990 1000 1010 1020 pF1KE2 SVDIDSELVEELPAEIELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLL-----WKCGFFKRARTRALYE .. :.: : . ... .. ::::::.::: :: ::::: : : CCDS42 --NVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQE 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 pF1KE2 AKRQKAEMKSQPSETERLTDDY .:. CCDS42 ENRRDSWSYINSKSNDD 1020 1030 >>CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1044 aa) initn: 1260 init1: 348 opt: 953 Z-score: 1041.9 bits: 204.4 E(32554): 1e-51 Smith-Waterman score: 1850; 36.7% identity (64.4% similar) in 986 aa overlap (140-1043:43-1000) 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 VKNDPGHHIIEDMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYT------QVLWSGSEDQRRMVGKCY ::::: :.: . : :.:.:. CCDS44 TTTRIQRQAEGFQCWRECGTRRSPFEGKETCAHRYEARQRVDQIL-----ETRDMIGRCF 20 30 40 50 60 170 180 190 200 210 pF1KE2 VRGNDL----ELDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLET-GMCQLGTSGGFTQNTVY--FGAPG : ..:: :::... :. .:.. . : :.:: ::...:. .. : ::::: CCDS44 VLSQDLAIRDELDGGE-WK-----FCEGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPG 70 80 90 100 110 120 220 230 240 250 260 pF1KE2 AYNWKGNSY--MIQRKEWDLSEYS---Y-------KDPED---QGNLYIGYTMQVGSFIL .:::::.. . . ::.. . : .::. .: :.:.... :. .. CCDS44 TYNWKGTARVELCAQGSADLAHLDDGPYEAGGEKEQDPRLIPVPANSYFGFSIDSGKGLV 130 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 HPKNITIVTGAPRHRHMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGW . .....:.:::: : ::: .: ..... : . .: : .. . :: ..:.::::.::: CCDS44 RAEELSFVAGAPRANHKGAVVILRKDSASRLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGW 190 200 210 220 230 240 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 QDLLVGAPYYFERKEEVGGAIYVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSAFGLSVASIGDINQ ::.:::::.:::.::.:::.::..::.: : : : : : ::.:.: .::.:: CCDS44 PDLIVGAPYFFERQEELGGAVYVYLNQGGHWAGISP-LRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQ 250 260 270 280 290 300 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 DGFQDIAVGAPFEGLGKVYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVD ::: ::::::::.: :::.:::.:: :.. .:.::..:: .:. .:::::::..:.: CCDS44 DGFPDIAVGAPFDGDGKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVGIK---SFGYSLSGSLDMD 310 320 330 340 350 450 460 470 480 490 pF1KE2 ENFYPDLLVGSLSDHIVLLRARPVINIVHK-TLVPRPAVLDPALCTA--TSCVQVELCFA : :::::::::.: ::.::::.... :. ...:: :. :.. . ::....::. CCDS44 GNQYPDLLVGSLADTAVLFRARPILHVSHEVSIAPRSIDLEQPNCAGGHSVCVDLRVCFS 360 370 380 390 400 410 500 510 520 530 540 pF1KE2 YNQSAGNPNYRRNITLAYTLEADRDRR----PPRLRFAG------SESAVFHGFFSMPEM : : .: ...: :.:.:: ::: ::. : . ...: ... . CCDS44 YI--AVPSSYSPTVALDYVLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHD 420 430 440 450 460 470 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 R-CQKLELLLMDNLRDKLRPIIISMNYSL--PLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQALEN : : . :..:..:::: :.....::: : . : :: . :::: : . CCDS44 RVCGDAMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVA--PILNAHQPSTQ 480 490 500 510 520 530 610 620 630 640 650 pF1KE2 HTEVQFQKE-CGPDNKCESNLQM-RAAFVSE-QQQKLSRLQYSRDVRKLLLSIN------ ..:..: :. :: :. :.::::. :: : .. .. ... : .. : :.... CCDS44 RAEIHFLKQGCGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIG 540 550 560 570 580 590 660 670 680 690 700 pF1KE2 ----VTNTRTS----ERSGEDAHEALLTLVVPPALLLSSVRP--PGA---CQANET---I ::: .. . .:.::::: : ...: .: :.:: :. : .::. . CCDS44 LELMVTNLPSDPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDSLHYSGVRALDPAEKPLCLSNENASHV 600 610 620 630 640 650 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 FCELGNPFKRNQRMELLITFEVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTL ::::::.::. .. . . . . :....: .:.:.: :.: :.:. : :. : : CCDS44 ECELGNPMKRGAQVTFYLILSTSGISIETTELEVELLLATISEQE-LHPVSARARVFIEL 660 670 680 690 700 710 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 QTSLSMVNHRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEW :.. . : ::.:.: :: .:.. .:::: .::: :. .:..: ::. :.. : CCDS44 PLSIAGMAIPQQLFFSGVVRGERAMQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMW 720 730 740 750 760 770 830 840 850 860 870 pF1KE2 PYEVSNGKWLLYPTEITVHGNGSWPCRPPGDLINPL-NLTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDP :.:..:::::::: .. ..: :. : . : .: :. : .: .::::.:.: CCDS44 PHEIANGKWLLYPMQVELEG-GQGPGQK--GLCSPRPNILHLDVDSR----DRRRRELEP 780 790 800 810 820 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 GGGQGP-----PPVT---LAAAKKAKSETVLTCATGRAHCVWLECPIPDAPVVTNVTVKA : : : .. ...:.: :. : : :: : :.:: . ::. . .. . : . CCDS44 PEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEKKKNIT-LDCARGTANCVVFSCPLYSFDRAAVLHVWG 830 840 850 860 870 880 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 RVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPAEIE :.:::::.:.: ..: :.. ...:: .. ... .: . : . . . . . CCDS44 RLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIKNLMLRDASTVIPVMVYLDPMAVVAEGVP 890 900 910 920 930 940 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 LWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFFKRAR----TRALYEAKRQKAEMKSQPSETERL :..:.:: ::::.:.:..::::: ::::::. : :.: . : ..: .: CCDS44 WWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAKHPEATVPQYHAVKIPREDRQQFKEEKTG 950 960 970 980 990 1000 1050 pF1KE2 TDDY CCDS44 TILRNNWGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPDGHPGPGTA 1010 1020 1030 1040 >>CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1048 aa) initn: 600 init1: 158 opt: 948 Z-score: 1036.4 bits: 203.4 E(32554): 2.1e-51 Smith-Waterman score: 1107; 27.8% identity (55.3% similar) in 1107 aa overlap (9-1043:13-1040) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGYSV ::. :.: .: : . : :::::. .. .: :: ::..: CCDS22 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPL----C--RAFNLDVDS-PAEYSGPEGSYFGFAV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ALHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDDCERMNITV------ . . ..:..::.:::. .. : .. : : : .. . :. ... . CCDS22 DFFVPSA-SSRMFLLVGAPKANTTQPGIVE-GGQVLKCDWSSTRR-CQPIEFDATGNRDY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 -KNDPGHHIIEDMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRM-VGKCYVRGND :.:: .. .:.:..: :. ..:.:: : : :.: :: :... CCDS22 AKDDP-LEFKSHQWFGASVRSK--QDKILACAPLYH---WRTEMKQEREPVGTCFLQ--- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 LELDSSDDWQTYHNEMCNS-NTDYLETGMCQLGTSGGFTQ-NTVYFGAPGAYNWKGNSYM : .: . : : . : :.:: : : ::. . : .:.::.. :.:. CCDS22 ------DGTKTVEYAPCRSQDIDADGQGFCQGGFSIDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQLIS 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 pF1KE2 IQRKE----WDLSEYSYKDPEDQG---------NLYIGYTMQVGSFILHPKNIT-IVTGA : : .: . :: : .. . . :.::.. ::.: . .: .:.:. CCDS22 DQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDF--NGDGIDDFVSGV 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 PRH-RHMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYY :: : .: :.. . : .. . : :..:::: ..: .:.:.: . :...::: . CCDS22 PRAARTLGMVYIYD---GKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLF 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 FER----KEEVGGAIYVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSA-FGLSVASIGDINQDGFQD ..: : . : . : ...:. .: . :.: : :: ..: .::..::::.: CCDS22 MDRGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQ---TTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFND 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 IAVGAPFEGLGK---VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDEN ::..::. : : :::... : :: :.:...:. . .::::..: :.:.: CCDS22 IAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKN 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 FYPDLLVGSLS-DHIVLLRARPVINIVHKTLVPRPAVL--DPALCT------ATSCVQVE ::::.::... :. .: ::::::. :. : :..: : :. .:: .:. CCDS22 GYPDLIVGAFGVDRAILYRARPVIT-VNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVR 450 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 pF1KE2 LCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYTLEADRDRRPPRLR---FAGSESAVFHGFFSMPE---M .:. .. :. :.... : :. .. .: : :.: ... . : CCDS22 FCL---KADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLM 510 520 530 540 550 560 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 RCQKLELLLMDN--LRDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQALENH .:..: : :. .:::: :: : :.: : : ::. ::::: . CCDS22 QCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAA-DTTGLQ-----PILNQFTPANIS 570 580 590 600 610 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 TEVQFQKECGPDNKCESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERS .... .:: :: :. .:.. :. .:.:. : : : : ... : . CCDS22 RQAHILLDCGEDNVCKPKLEVS---VDSDQKKI----YIGDDNPLTLIVKAQN------Q 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 GEDAHEALLTLVVP-PALLLSSVRPPGA-----CQ---ANET--IFCELGNPFKRNQRME :: :.:: : . .: : ... :: : : :.: . :.::::.: . .. CCDS22 GEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLL 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 LLITFEVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSM--VNHRLQS . : : . ... .::...:. :.. :.. . :: .. ... . :. . CCDS22 AGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPVV-SHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHV 730 740 750 760 770 780 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 FFG-GTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLY :. . . . .: :::: ... ... ..: ... .: :.:::. .:. ::: CCDS22 FLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYEL--RNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNT-LLY 790 800 810 820 830 840 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 PTEITVHGNGSWPCRPPGDL-INPLNLTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLA . . : : .:. :::: . .: : : ... : .::: .. CCDS22 ILHYDIDG----PMNCTSDMEINPLRIKIS-------SLQTTEKN-DTVAGQGERDHLIT 850 860 870 880 900 910 920 930 940 pF1KE2 AAKKAKSE-TVLTCATGRAHCVWLECPIP--DAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRV : :: . : . : :.:. . : . : . . ::. .:. ::.. . CCDS22 KRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSY 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 pF1KE2 RVNGWATL----FLRTSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPAEIELWLVLVAVGAGLL ... :.. : ..: .. : .: .... . .. : . .:....:: :::: CCDS22 SLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITN-STLVTTNV-TWGIQPAPMPVPVWVIILAVLAGLL 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 LLGLIILLLWKCGFFKRARTRALYEAKRQKAEMKSQPSETERLTDDY ::......... :::::.: .... . . :: : CCDS22 LLAVLVFVMYRMGFFKRVRP-----PQEEQEREQLQPHENGEGNSET 1010 1020 1030 1040 >>CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1002 aa) initn: 557 init1: 158 opt: 901 Z-score: 985.0 bits: 193.8 E(32554): 1.5e-48 Smith-Waterman score: 1060; 27.6% identity (55.3% similar) in 1049 aa overlap (67-1043:17-994) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 TRFLVVKEAGNPGSLFGYSVALHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPL :..::.:::. .. : .. : : : CCDS46 MLLGTLLLILYILMLCRMFLLVGAPKANTTQPGIVE-GGQVLKCDW 10 20 30 40 100 110 120 130 140 pF1KE2 TAHKDDCERMNITV-------KNDPGHHIIEDMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYTQVLW .. . :. ... . :.:: .. .:.:..: :. ..:.:: : : CCDS46 SSTRR-CQPIEFDATGNRDYAKDDP-LEFKSHQWFGASVRSK--QDKILACAPLYH---W 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 SGSEDQRRM-VGKCYVRGNDLELDSSDDWQTYHNEMCNS-NTDYLETGMCQLGTSGGFTQ :.: :: :... : .: . : : . : :.:: : : ::. CCDS46 RTEMKQEREPVGTCFLQ---------DGTKTVEYAPCRSQDIDADGQGFCQGGFSIDFTK 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 pF1KE2 -NTVYFGAPGAYNWKGNSYMIQRKE----WDLSEYSYKDPEDQG---------NLYIGYT . : .:.::.. :.:. : : .: . :: : .. . . :.::. CCDS46 ADRVLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYS 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 MQVGSFILHPKNIT-IVTGAPRH-RHMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAI . ::.: . .: .:.:.:: : .: :.. . : .. . : :..:::: .. CCDS46 VAVGDF--NGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIYD---GKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSV 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 pF1KE2 ALADLNNDGWQDLLVGAPYYFER----KEEVGGAIYVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGS : .:.:.: . :...::: ...: : . : . : ...:. .: . :.: CCDS46 AATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQ---TTKLNGFEVF 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 A-FGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEGLGK---VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLG : :: ..: .::..::::.:::..::. : : :::... : :: :.:...:. . CCDS46 ARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAA 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 LPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSLS-DHIVLLRARPVINIVHKTLVPRPAVL-- .::::..: :.:.: ::::.::... :. .: ::::::. :. : :..: CCDS46 RSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRARPVIT-VNAGLEVYPSILNQ 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 pF1KE2 DPALCT------ATSCVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYTLEADRDRRPPRLR---F : :. .:: .:..:. .. :. :.... : :. .. .: : CCDS46 DNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCL---KADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALF 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 pF1KE2 AGSESAVFHGFFSMPE---MRCQKLELLLMDN--LRDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRL :.: ... . :.:..: : :. .:::: :: : :.: : : CCDS46 LYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAA-DTT 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 GLRSLDAYPILNQAQALENHTEVQFQKECGPDNKCESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSR ::. ::::: . .... .:: :: :. .:.. :. .:.:. : CCDS46 GLQ-----PILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLEVS---VDSDQKKI----YIG 560 570 580 590 600 650 660 670 680 690 pF1KE2 DVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVP-PALLLSSVRPPGA-----CQ---AN : : : ... : .:: :.:: : . .: : ... :: : : : CCDS46 DDNPLTLIVKAQN------QGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTEN 610 620 630 640 650 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 ET--IFCELGNPFKRNQRMELLITFEVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLL .: . :.::::.: . .. . : : . ... .::...:. :.. : ... CCDS46 QTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSP-VVSHK 660 670 680 690 700 710 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 VDYTLQTSLSM--VNHRLQSFFG-GTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLG :: .. ... . :. . :. . . . .: :::: ... ... ..: ... CCDS46 VDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYEL--RNNGPSSFS 720 730 740 750 760 770 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 TLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPTEITVHGNGSWPCRPPGDL-INPLNLTLSDPGDRPSSPQ .: :.:::. .:. ::: . . : : .:. :::: . .: : : CCDS46 KAMLHLQWPYKYNNNT-LLYILHYDIDG----PMNCTSDMEINPLRIKIS-------SLQ 780 790 800 810 820 880 890 900 910 920 pF1KE2 RRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSE-TVLTCATGRAHCVWLECPIP--DAPVVTNVT ... : .::: .. : :: . : . : :.:. . : . : . . CCDS46 TTEKN-DTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILY 830 840 850 860 870 880 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 VKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATL----FLRTSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVE ::. .:. ::.. . ... :.. : ..: .. : .: .... . .. CCDS46 VKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITN-STLVTTNV-TWGIQ 890 900 910 920 930 940 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 ELPAEIELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFFKRARTRALYEAKRQKAEMKSQPSET : . .:....:: ::::::......... :::::.: .... . . :: : CCDS46 PAPMPVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRP-----PQEEQEREQLQPHEN 950 960 970 980 990 1050 pF1KE2 ERLTDDY CCDS46 GEGNSET 1000 >>CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10 (1063 aa) initn: 779 init1: 157 opt: 863 Z-score: 942.8 bits: 186.1 E(32554): 3.4e-46 Smith-Waterman score: 1194; 28.0% identity (55.8% similar) in 1102 aa overlap (1-1023:1-1043) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGPGPSRAPR---APRLM-LC----ALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLF :.:: ::.:: :: . :: ::.... . .: .:::::.. :.: .: :: : CCDS31 MSPGASRGPRGSQAPLIAPLCCAAAALGMLLWSPAC--QAFNLDVEKLTVY-SGPKGSYF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 GYSVALHRQTERQQRYLLLAGAPR-ELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKD-DCERM---- ::.: .: : .:.:::. . . :: . :::: :: :. . .:... CCDS31 GYAVDFHIPDARTAS--VLVGAPKANTSQPD--IVEGGAVYYCPWPAEGSAQCRQIPFDT 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 --NITVKNDPGHHIIE---DMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRMVGK : .. . .. :: ..:.:.:: .. :.:..:: : . . . . :: CCDS31 TNNRKIRVNGTKEPIEFKSNQWFGATVKAH--KGKVVACAPLYHWRTLKPTPE-KDPVGT 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KE2 CYVRGNDLELDSSDDWQTYHN-EMC-NSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQN-TVYFGAPGAY ::: . .....: . : :::.: :.:: : : : .: . :.::.. CCDS31 CYV--------AIQNFSAYAEFSPCRNSNADPEGQGYCQAGFSLDFYKNGDLIVGGPGSF 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 pF1KE2 NWKGNSYMIQRKEWDL-SEYSYKD--------------PEDQGNLYIGYTMQVGSFILHP :.:. .: . :. ..::.:: : . . :.::.. .: : CCDS31 YWQGQ--VITASVADIIANYSFKDILRKLAGEKQTEVAPASYDDSYLGYSVAAGEFTGDS 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 KNITIVTGAPRH-RHMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQ .. .:.: :: ...: : .... :. : . : :...::: .....:.:.:: . CCDS31 QQ-ELVAGIPRGAQNFGYVSIINST---DMTFIQNFTGEQMASYFGYTVVVSDVNSDGLD 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 pF1KE2 DLLVGAPYYFERKEEVG----GAIYVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSAFGLSVASIGD :.::::: ..::. : . : ::... :... . :..: . . :: ..: .:: CCDS31 DVLVGAPLFMEREFESNPREVGQIYLYL-QVSSLLFRDPQILTGTETFGRFGSAMAHLGD 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 INQDGFQDIAVGAPFEGL---GKVYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLS .::::..:::.:.:: : ::: ::.... :: .:.::..: . . ::..: CCDS31 LNQDGYNDIAIGVPFAGKDQRGKVLIYNGNKDGLNTKPSQVLQGVWASHAVPSGFGFTLR 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 GQMDVDENFYPDLLVGSL-SDHIVLLRARPVINIVHKTLV-PRPAVLDPALCTATSCVQV :. :.:.: ::::.::.. . .... :::::... . :. : :. : . . . CCDS31 GDSDIDKNDYPDLIVGAFGTGKVAVYRARPVVTVDAQLLLHPMIINLENKTCQVPDSMTS 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 pF1KE2 ELCFAYN--QSAGNPNYRRNITLAYTLEADRDRRP---PRLRFAGSESAVFHGFFSMPEM ::. :. . . .:.: .. : .. : : ...: : : . CCDS31 AACFSLRVCASVTGQSIANTIVLMAEVQLDSLKQKGAIKRTLFLDNHQA--HRVFPLVIK 520 530 540 550 560 570 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 R-----CQKLELLLMDN--LRDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQ : :: . . : :. .:::: :: ::.:::: :. . ..:.. :::: . CCDS31 RQKSHQCQDFIVYLRDETEFRDKLSPINISLNYSL-----DESTFK-EGLEVKPILNYYR 580 590 600 610 620 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 ALENHTEVQFQKECGPDNKCESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTR .... .:: :: : .:.. : ...: . : .:.: ::. : CCDS31 ENIVSEQAHILVDCGEDNLCVPDLKLSAR--PDKHQVIIG-----DENHLMLIINARNE- 630 640 650 660 670 670 680 690 700 710 pF1KE2 TSERSGEDAHEALLTLVVPPALLLSSVRP------PGACQ-----ANETIFCELGNPFKR :: :.:: : ...: ... : .:. ... . :.::::. CCDS31 -----GEGAYEAELFVMIPEEADYVGIERNNKGFRPLSCEYKMENVTRMVVCDLGNPMVS 680 690 700 710 720 730 720 730 740 750 760 pF1KE2 NQRMELLITFEVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTL--QTSLSMVN . . : . : : . . ... .::. ::..:: ...: .. : :. . :. CCDS31 GTNYSLGLRFAVPRLEKTNMSINFDLQIR-SSNKDNPDSNFVSLQINITAVAQVEIRGVS 740 750 760 770 780 790 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 HRLQSFFG-GTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNG : : . . : . :.:: ... ... .: . .. : .: ::. . . CCDS31 HPPQIVLPIHNWEPEEEPHKEEEVGPLVEHIYELHNIGPSTISDTILEVG--WPFSARD- 800 810 820 830 840 850 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 KWLLYPTEITVHGNGSWPCRPPGDLINPLNLT-LSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPP ..::: .: . : :.: . ::: .. ..: : : : . : . CCDS31 EFLLYIFHIQTL--GPLQCQPNPN-INPQDIKPAASPEDTPELSAFLRNSTIPHLVR-KR 860 870 880 890 900 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 PVTLAAAKKAKSETVLTCATGRAHCVWLECPIP--DAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRD : .. .. . .:.:.. .:. . : . .. . . :..:.: ::.. : CCDS31 DVHVVEFHRQSPAKILNCTN--IECLQISCAVGRLEGGESAVLKVRSRLWAHTFLQ--RK 910 920 930 940 950 960 950 960 970 980 990 1000 pF1KE2 FDRVRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPA---EIELWLVLVAVGA : . . ... .. ..: .. : :. : . .. : : ::....:. CCDS31 NDPYALASLVSFEVK-KMPYTDQPAKLPEGSIVIKTSVIWATPNVSFSIPLWVIILAILL 970 980 990 1000 1010 1020 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 GLLLLGLIILLLWKCGFFKRARTRALYEAKRQKAEMKSQPSETERLTDDY :::.:... : ::::::: ::: CCDS31 GLLVLAILTLALWKCGFFDRARPPQEDMTDREQLTNDKTPEA 1030 1040 1050 1060 >>CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1012 aa) initn: 600 init1: 158 opt: 847 Z-score: 925.5 bits: 182.9 E(32554): 3.1e-45 Smith-Waterman score: 1019; 27.2% identity (54.6% similar) in 1092 aa overlap (9-1043:13-1004) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGYSV ::. :.: .: : . : :::::. .. .: :: ::..: CCDS46 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPL----C--RAFNLDVDS-PAEYSGPEGSYFGFAV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ALHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDDCERMNITV------ . . ..:..::.:::. .. : .. : : : .. . :. ... . CCDS46 DFFVPSA-SSRMFLLVGAPKANTTQPGIVE-GGQVLKCDWSSTRR-CQPIEFDATGNRDY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 -KNDPGHHIIEDMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRM-VGKCYVRGND :.:: .. .:.:..: :. ..:.:: : : :.: :: :... CCDS46 AKDDP-LEFKSHQWFGASVRSK--QDKILACAPLYH---WRTEMKQEREPVGTCFLQ--- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 LELDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMIQ : .: . : : :: : .. . . :..:. : :. . CCDS46 ------DGTKTVEYAPCRSR---------QL-ISDQVAEIVSKYD-PNVYSIKYNNQLAT 170 180 190 200 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 RKEWDLSEYSYKDPEDQGNLYIGYTMQVGSFILHPKNIT-IVTGAPRH-RHMGAVFLLSQ : . . :: .::.. ::.: . .: .:.:.:: : .: :.. . CCDS46 RTAQAIFDDSY----------LGYSVAVGDF--NGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIYD- 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 EAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFER----KEEVGGAI : .. . : :..:::: ..: .:.:.: . :...::: ...: : . : . CCDS46 --GKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQV 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 pF1KE2 YVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSA-FGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEGLGK--- : ...:. .: . :.: : :: ..: .::..::::.:::..::. : : CCDS46 SVSLQRASGDFQ---TTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGI 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSLS-DHI :::... : :: :.:...:. . .::::..: :.:.: ::::.::... :. CCDS46 VYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRA 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 pF1KE2 VLLRARPVINIVHKTLVPRPAVL--DPALCT------ATSCVQVELCFAYNQSAGNPNYR .: ::::::. :. : :..: : :. .:: .:..:. .. :. CCDS46 ILYRARPVIT-VNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCL---KADGKGVLP 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 RNITLAYTLEADRDRRPPRLR---FAGSESAVFHGFFSMPE---MRCQKLELLLMDN--L :.... : :. .. .: : :.: ... . :.:..: : :. . CCDS46 RKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEF 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 RDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQALENHTEVQFQKECGPDNKC :::: :: : :.: : : ::. ::::: . .... .:: :: : CCDS46 RDKLTPITIFMEYRLDYRTAA-DTTGLQ-----PILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVC 550 560 570 580 590 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 ESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVP- . .:.. :. .:.:. : : : : ... : .:: :.:: : . .: CCDS46 KPKLEVS---VDSDQKKI----YIGDDNPLTLIVKAQN------QGEGAYEAELIVSIPL 600 610 620 630 640 690 700 710 720 730 pF1KE2 PALLLSSVRPPGA-----CQ---ANET--IFCELGNPFKRNQRMELLITFEVIGVTLHTR : ... :: : : :.: . :.::::.: . .. . : : . CCDS46 QADFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDT 650 660 670 680 690 700 740 750 760 770 780 pF1KE2 DLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSM--VNHRLQSFFG-GTVMGESGMKT ... .::...:. :.. :.. . :: .. ... . :. . :. . . . .: CCDS46 SVKFDLQIQSSNLFDKVSPVV-SHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPET 710 720 730 740 750 760 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 VEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPTEITVHGNGSWPCR :::: ... ... ..: ... .: :.:::. .:. ::: . . : : CCDS46 EEDVGPVVQHIYEL--RNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNT-LLYILHYDIDG----PMN 770 780 790 800 810 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 PPGDL-INPLNLTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSE-TVLTCA .:. :::: . .: : : ... : .::: .. : :: . : . CCDS46 CTSDMEINPLRIKIS-------SLQTTEKN-DTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLG 820 830 840 850 860 910 920 930 940 950 pF1KE2 TGRAHCVWLECPIP--DAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATL----FLR : :.:. . : . : . . ::. .:. ::.. . ... :.. : CCDS46 CGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPY 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 TSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPAEIELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFF ..: .. : .: .... . .. : . .:....:: ::::::......... ::: CCDS46 KNLPIEDITN-STLVTTNV-TWGIQPAPMPVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFF 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 KRARTRALYEAKRQKAEMKSQPSETERLTDDY ::.: .... . . :: : CCDS46 KRVRP-----PQEEQEREQLQPHENGEGNSET 990 1000 1010 >>CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17 (1039 aa) initn: 589 init1: 169 opt: 722 Z-score: 787.8 bits: 157.4 E(32554): 1.5e-37 Smith-Waterman score: 1086; 28.8% identity (56.5% similar) in 1093 aa overlap (21-1023:17-1028) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVS---AFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGYSVA ... : :.. :.::: :. :: :: ::.:. CCDS32 MARALCPLQALWLLEWVLLLLGPCAAPPAWALNLDPVQLTFY-AGPNGSQFGFSLD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDDCERMNITVKNDP--- .:... . : ...:::: :. :. ..::.:.::: :. .: . . .... CCDS32 FHKDS--HGRVAIVVGAPRTLG-PS--QEETGGVFLCPWRAEGGQCPSLLFDLRDETRNV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 GHHIIEDMW----LGVTVASQGPAGRVLVCAH-RYTQVLWSGSEDQRRMVGKCYVRGNDL : . .. . ::..:.: . . ...:: .. .:: . : .. ::.:. CCDS32 GSQTLQTFKARQGLGASVVSWSDV--IVACAPWQHWNVLEKTEEAEKTPVGSCF------ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 ELDSSDDWQTYHNEMCNSNTD---YLETGM------CQLGTSGGFTQ-NTVYFGAPGAYN : . .. . . : .:: :.:. . :. : :. :: . . .::::.: CCDS32 -LAQPESGRRAEYSPCRGNTLSRIYVENDFSWDKRYCEAGFSSVVTQAGELVLGAPGGYY 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 pF1KE2 WKG-----------NSYMIQRKEWDLSEYSYK----DPEDQGNLYIGYTMQVGSFILHPK . : .:: : .: : . .:: . : ::.. :: : . CCDS32 FLGLLAQAPVADIFSSYRPGILLWHVSSQSLSFDSSNPE-YFDGYWGYSVAVGEFDGDLN 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 NITIVTGAPRHR-HMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQD . :.::: .::: .:.. .: . :.: :...::: ..:..:.:.:: .: CCDS32 TTEYVVGAPTWSWTLGAVEILDSY----YQRLHRLRGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHD 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 pF1KE2 LLVGAPYYFE----RKEEVGGAIYVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPS-GSAFGLSVASIGD :::::: :.: :: : .:.:.. : . ::::: : . . :: ..: .:: CCDS32 LLVGAPLYMESRADRKLAEVGRVYLFLQPRGPHALGAPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGD 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 INQDGFQDIAVGAPF---EGLGKVYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLS ...::..::::.::. : :.: .. ..:.:: .:.::. . .: ..::.:: CCDS32 LDRDGYNDIAVAAPYGGPSGRGQVLVFLGQSEGLRSRPSQVLDSP---FPTGSAFGFSLR 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 pF1KE2 GQMDVDENFYPDLLVGSL-SDHIVLLRARPVINIVHKTLVP---RPAVLD---PALCTAT : .:.:.: ::::.::. ...... ::.::.. . :: ::: . : : . CCDS32 GAVDIDDNGYPDLIVGAYGANQVAVYRAQPVVKASVQLLVQDSLNPAVKSCVLPQTKTPV 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 SCVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYTLEADRD--RRPPRLRFAGSESAVFHGFFSMP :: ....: .: . : ....: :. ::. :. :. . ::..: ... CCDS32 SCFNIQMCV----GATGHNIPQKLSLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLGSQQAGTTLNLDLG 520 530 540 550 560 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 EMR---CQKLELLLMD--NLRDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQ . :. .: : ..:::: ::..:.: ::: : . .. : : CCDS32 GKHSPICHTTMAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLP---PTEAGMA-------P----AV 570 580 590 600 610 610 620 630 640 650 pF1KE2 ALENHTEVQFQK----ECGPDNKCESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINV .:.. :.:: : .:: :. : .::. :. .. : : . : : :.... CCDS32 VLHGDTHVQEQTRIVLDCGEDDVCVPQLQLTASVTG------SPLLVGAD-NVLELQMDA 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 pF1KE2 TNTRTSERSGEDAHEALLTLVVPPAL----LLSSVR--PPGAC---QANET--IFCELGN .: :: :.:: :.. .: . ::.:. : . ::: ..::::: CCDS32 ANE------GEGAYEAELAVHLPQGAHYMRALSNVEGFERLICNQKKENETRVVLCELGN 670 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 PFKRNQRMELLITFEVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSM :.:.: .. . . : .. .... :::. ... :. : .:.: ... .. CCDS32 PMKKNAQIGIAMLVSVGNLEEAGESVSFQLQIRSKNSQN---PNSKIVLLDVPVRAE-AQ 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 VNHRLQSFFGGTVM----GESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPY :. : .:: .. :. :: ...... : ... ... : : :. : : :... : CCDS32 VELRGNSFPASLVVAAEEGEREQNSLDSWGPKVEHTYELHNNGPGTVN-G-LHLSIHLPG 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 pF1KE2 EVSNGKWLLYPTEITVHGNGSWPC--RPPGDLINPLNLT--LSDPGDRPSSP---QRRRR . :. . ::: .: . .:. : .:: .:::.. : :. : : .: :: CCDS32 Q-SQPSDLLYILDI--QPQGGLQCFPQPP---VNPLKVDWGLPIPSPSPIHPAHHKRDRR 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 QLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSETVLTCATGRAHCVWLECPIPDAPV--VTNVTVKARV :. : : .. .. ....: . : :. ..: . . . ::: : . 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CCDS32 LFTELQKKIYVIEGTSKQDLTSFNMELSSSGISADLSRGHAVVGAVGAKDWAGGFLDLKA 330 340 350 360 370 380 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 KEWDLSEYSYKD--PEDQGNLYIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVFLLSQ- : . . . :: ... :.::: : . . :. ...::::..::: :.:... CCDS32 DLQDDTFIGNEPLTPEVRAG-YLGYT--VTWLPSRQKTSLLASGAPRYQHMGRVLLFQEP 390 400 410 420 430 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 EAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLL-VGAPYYFERKEEVGGAIYVF ..:: . :...:.:.:.:::. . .:...:: .:: .::: .. :. :: .... 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CCDS32 PHSQIPVSCEELPEESRLLSRALSCNVSSPIFKAGHSVALQMMFNTLVNSSWGDSVELHA 840 850 860 870 880 890 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 QLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVNHRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVGSPLK CCDS32 NVTCNNEDSDLLEDNSATTIIPILYPINILIQDQEDSTLYVSFTPKGPKIHQVKHMYQVR 900 910 920 930 940 950 1051 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 13:47:19 2016 done: Sun Nov 6 13:47:19 2016 Total Scan time: 4.130 Total Display time: 0.430 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]