Result of FASTA (ccds) for pF1KE2317
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2317, 1051 aa
  1>>>pF1KE2317 1051 - 1051 aa - 1051 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8593+/-0.000918; mu= 19.4331+/- 0.056
 mean_var=82.6216+/-16.426, 0's: 0 Z-trim(107.2): 32  B-trim: 162 in 1/52
 Lambda= 0.141100
 statistics sampled from 9378 (9410) to 9378 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.289), width:  16
 Scan time:  4.130

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17         (1051) 7114 1458.6       0
CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3           (1035) 1010 216.0 3.3e-55
CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2          (1032)  962 206.3 2.9e-52
CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12         (1044)  953 204.4   1e-51
CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2           (1048)  948 203.4 2.1e-51
CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2          (1002)  901 193.8 1.5e-48
CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10         (1063)  863 186.1 3.4e-46
CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2          (1012)  847 182.9 3.1e-45
CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17        (1039)  722 157.4 1.5e-37
CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16         (1170)  679 148.7 6.9e-35
CCDS76204.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1         (1024)  670 146.8 2.2e-34
CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12          (1049)  670 146.8 2.3e-34
CCDS72869.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1         (1167)  670 146.9 2.5e-34
CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15       (1188)  656 144.0 1.8e-33
CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16         (1086)  655 143.8 1.9e-33
CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17         (1179)  621 136.9 2.5e-31
CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16         (1161)  573 127.1 2.2e-28
CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16         (1153)  556 123.6 2.4e-27
CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12          (1137)  549 122.2 6.3e-27
CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16         (1152)  549 122.2 6.3e-27
CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12         (1141)  534 119.2 5.2e-26
CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16         (1163)  509 114.1 1.8e-24
CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16         (1169)  509 114.1 1.8e-24
CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs108|chr5           (1181)  461 104.3 1.6e-21
CCDS82534.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2          ( 954)  454 102.8 3.6e-21
CCDS2249.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2           (1073)  454 102.9   4e-21
CCDS46451.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2          (1091)  454 102.9   4e-21


>>CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17              (1051 aa)
 initn: 7114 init1: 7114 opt: 7114  Z-score: 7819.9  bits: 1458.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7114; 99.9% identity (100.0% similar) in 1051 aa overlap (1-1051:1-1051)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGYSVALHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGYSVALHR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 QTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDDCERMNITVKNDPGHHIIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDDCERMNITVKNDPGHHIIE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 DMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRMVGKCYVRGNDLELDSSDDWQTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRMVGKCYVRGNDLELDSSDDWQTY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 HNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMIQRKEWDLSEYSYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMIQRKEWDLSEYSYK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 DPEDQGNLYIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DPEDQGNLYIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFERKEEVGGAIYVFMNQAGTSFPAHPSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFERKEEVGGAIYVFMNQAGTSFPAHPSLL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LHGPSGSAFGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEGLGKVYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LHGPSGSAFGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEGLGKVYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 KLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSLSDHIVLLRARPVINIVHKTLVPRPAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSLSDHIVLLRARPVINIVHKTLVPRPAVL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 DPALCTATSCVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYTLEADRDRRPPRLRFAGSESAVFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DPALCTATSCVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYTLEADRDRRPPRLRFAGSESAVFH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 GFFSMPEMRCQKLELLLMDNLRDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GFFSMPEMRCQKLELLLMDNLRDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 QALENHTEVQFQKECGPDNKCESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QALENHTEVQFQKECGPDNKCESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 RTSERSGEDAHEALLTLVVPPALLLSSVRPPGACQANETIFCELGNPFKRNQRMELLITF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS11 RTSERSGEDAHEALLTLVVPPALLLSSVRPPGACQANETIFCELGNPFKRNQRMELLIAF
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 EVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVNHRLQSFFGGTVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVNHRLQSFFGGTVM
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 GESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPTEITVHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPTEITVHG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 NGSWPCRPPGDLINPLNLTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NGSWPCRPPGDLINPLNLTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSET
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 VLTCATGRAHCVWLECPIPDAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLFLRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLTCATGRAHCVWLECPIPDAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLFLRT
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 SIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPAEIELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPAEIELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFFK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050 
pF1KE2 RARTRALYEAKRQKAEMKSQPSETERLTDDY
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RARTRALYEAKRQKAEMKSQPSETERLTDDY
             1030      1040      1050 

>>CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3                (1035 aa)
 initn: 366 init1: 265 opt: 1010  Z-score: 1104.7  bits: 216.0 E(32554): 3.3e-55
Smith-Waterman score: 1103; 26.7% identity (57.5% similar) in 1085 aa overlap (1-1036:1-1023)

               10         20        30        40        50         
pF1KE2 MGPGPSRAPR-APRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGYSVALH
       :: ::. ::: : ::    :::.::  :  ..:.::: .   :.  :   :.:::.:  :
CCDS26 MG-GPA-APRGAGRLRALLLALVVA--GIPAGAYNLDPQR-PVHFQGPADSFFGYAVLEH
                 10        20          30         40        50     

      60        70        80        90       100        110        
pF1KE2 RQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDD-CERMNITVKNDPG---
        . .   :..:. :::.  .  .  ..  :::. : . .. :  : .....  .. :   
CCDS26 FHDNT--RWVLV-GAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGKNRGTSC
          60           70        80        90       100       110  

             120       130        140       150       160       170
pF1KE2 ----HHIIEDMWLGVTVASQGPA-GRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRMVGKCYVRGNDLE
           ..  .: :.::..: :  : ::::.::::. .. . .  :.    : ::.  ..:.
CCDS26 GKTCREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACAHRWKNIYYEA--DHILPHGFCYIIPSNLQ
            120       130       140       150         160       170

              180       190       200       210       220       230
pF1KE2 LDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMIQRK
         .      :. :. ..  .  : : :: : .: ::.. : .::::.. : :.  ..   
CCDS26 AKGRTLIPCYE-EYKKKYGE--EHGSCQAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTIKVL---
              180          190       200       210       220       

              240            250       260       270       280     
pF1KE2 EWDLSEYSYKDPEDQGNL-----YIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVFLL-
         .:.. .:   .:.  .     :.::.. .: :  ::..: .: :::. . .: :... 
CCDS26 --NLTDNTYLKLNDEVIMNRRYTYLGYAVTAGHFS-HPSTIDVVGGAPQDKGIGKVYIFR
            230       240       250        260       270       280 

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE2 SQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFERKEEVGGAIYV
       ... .: : .     :...:.::::..  .:::.:: .:::::::.. : ..:  : . :
CCDS26 ADRRSGTLIKIFQASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMFSEIRDE--GQVTV
             290       300       310       320       330           

          350       360       370       380       390         400  
pF1KE2 FMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSAFGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEG--LGKVYIY
       ..:... ..  . .:   :  .. :: :.::. :...::: :.:.::: :    : ::::
CCDS26 YINRGNGALEEQLALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKEDDFAGAVYIY
     340       350       360       370       380       390         

            410       420       430       440       450        460 
pF1KE2 HSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGS-LSDHIVLLR
       :... :.. : .. . :.:.. : :  :: :.:: .:.: : :::. ::. .:: .::::
CCDS26 HGDAGGIVPQYSMKLSGQKIN-PVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFMSDSVVLLR
     400       410       420        430       440       450        

             470       480           490       500       510       
pF1KE2 ARPVINIVHKTLVPRPAVLDPALC----TATSCVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYT
       :::::..  . ..:    .    :      ..:..:  ::... .   :.   .: : :.
CCDS26 ARPVITVDVSIFLPGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSFH-GKHVPG---EIGLNYV
      460       470       480       490       500           510    

       520           530          540        550       560         
pF1KE2 LEADRDRRP----PRLRFA--G-SESAVFHGF-FSMPEMRCQKLELLLMDNLRDKLRPII
       : ::  ..     ::. :.  : . . : . . ... :  :..    .   ..: . ::.
CCDS26 LMADVAKKEKGQMPRVYFVLLGETMGQVTEKLQLTYMEETCRHYVAHVKRRVQDVISPIV
          520       530       540       550       560       570    

     570       580       590         600       610       620       
pF1KE2 ISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPIL--NQAQALENHTEVQFQKECGPDNKCESNLQM
       .   :::  ..  . .  :  :   :.:  ...: . ..... :...:  .. : ..::.
CCDS26 FEAAYSLSEHVTGEEERELPPLT--PVLRWKKGQKIAQKNQTVFERNCRSED-CAADLQL
          580       590         600       610       620        630 

       630        640       650       660       670       680      
pF1KE2 RAAFV-SEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVPPALLLS
       .. .. : ...:   :  .  :... :.:...:       :.::..: ... :   :.. 
CCDS26 QGKLLLSSMDEKTLYLALGA-VKNISLNISISNL------GDDAYDANVSFNVSRELFFI
             640       650        660             670       680    

           690        700         710        720       730         
pF1KE2 SV---RPPG-ACQANETIF--CELGNPFKRNQ-RMELLITFEVIGVTLHTRDLQ--VQLQ
       ..   .  : .:.  :. :  : .: :: :.. ..:. . :..  .. . . :.  :  :
CCDS26 NMWQKEEMGISCELLESDFLKCSVGFPFMRSKSKYEFSVIFDTSHLSGEEEVLSFIVTAQ
          690       700       710       720       730       740    

       740       750       760        770       780       790      
pF1KE2 LSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVN-HRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVG---S
        ... ....:    :.:.:    ... :...     ::  :  .  ...  ..:.    .
CCDS26 SGNTERSESLHDNTLVLMVPLMHEVDTSITGIMSPTSFVYGESVDAANFIQLDDLECHFQ
          750       760       770       780       790       800    

           800       810       820       830       840       850   
pF1KE2 PLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPTEITVHGNGSWPCRPPGDLI
       :..  .::   : . .  :. : .. .: ..:.:   .. ..  : :. .  :       
CCDS26 PINITLQVYNTGPSTLP-GSSV-SISFPNRLSSGGAEMFHVQEMVVGQEKGNCSFQK---
          810       820         830       840       850            

           860       870       880       890       900       910   
pF1KE2 NPLNLTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSETVLTCATGRAHCVW
       ::    .         ::...  .           :. :    ... :: :      :. 
CCDS26 NPTPCII---------PQEQENIFH----------TIFAFFTKSGRKVLDCEKPGISCLT
     860                870                 880       890       900

           920       930       940       950       960       970   
pF1KE2 LECPIPDAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTW
        .: .       . :.   .  .: :    . . ..  . : . .  .. .... . .  
CCDS26 AHCNFSALAKEESRTIDIYMLLNTEILKKDSSSVIQFMSRAKVKVDPALRVVEIAHGNPE
              910       920       930       940       950       960

           980         990      1000      1010      1020      1030 
pF1KE2 FSVDIDSELVEELPAE--IELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFFKRARTRALYEAK
         : .  : ...:  .  .  :.. ... .:.:.. :. .:::: :::.: : . . ::.
CCDS26 -EVTVVFEALHNLEPRGYVVGWIIAISLLVGILIFLLLAVLLWKMGFFRR-RYKEIIEAE
               970       980       990      1000       1010        

            1040      1050 
pF1KE2 RQKAEMKSQPSETERLTDDY
       ... :               
CCDS26 KNRKENEDSWDWVQKNQ   
     1020      1030        

>>CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2               (1032 aa)
 initn: 483 init1: 243 opt: 962  Z-score: 1051.9  bits: 206.3 E(32554): 2.9e-52
Smith-Waterman score: 1048; 27.4% identity (56.3% similar) in 1076 aa overlap (3-1033:9-1019)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE2       MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGY
               ::: ::     .::  : : : .:      .:.::.  .. . :  ..::::
CCDS42 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLL-LCLGVPTG----RPYNVDTESALLYQ-GPHNTLFGY
               10        20         30            40         50    

           60        70        80        90       100        110   
pF1KE2 SVALHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDD-CERMNITVKN-
       ::.::  ..  .:.::. :::    . .. .   ::.: : .  .  . ::....   : 
CCDS42 SVVLH--SHGANRWLLV-GAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNG
             60         70        80        90       100       110 

             120          130        140       150       160       
pF1KE2 DP-GHHIIED---MWLGVTVASQ-GPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRMVGKCYVRGN
       .: :.  .:.   .:::::.. : :  : ...:.::. ....  .:. .  .: ::    
CCDS42 EPCGKTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNEN-KLPTGGCYGVPP
             120       130       140       150        160       170

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE2 DLELDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMI
       ::. . :      .... ..  . . .  :: : :. .:.. . .::::.  : :. .. 
CCDS42 DLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFAS--CQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFV-
              180       190         200       210       220        

       230       240            250       260       270       280  
pF1KE2 QRKEWDLSEYSYK---DPEDQGNL--YIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVF
           ....  .::   : ..: ..  :.::.. .: :    ..  .: :::.:...: ..
CCDS42 ----YNITTNKYKAFLDKQNQVKFGSYLGYSVGAGHF-RSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAY
           230       240       250       260        270       280  

            290       300       310       320       330       340  
pF1KE2 LLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFERKEEVGGAI
       ..: .   .:   . ..:...:.:::...  .::: ::..:::::::.    .::  : .
CCDS42 IFSIDEK-ELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREE--GRV
             290       300       310       320       330           

             350       360        370       380       390          
pF1KE2 YVFMNQ-AGTSFPAHPSLLLHGPSGSA-FGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEG--LGK
       .:..:. .:. . :  . :. . . .: :: :....:::..:::.:.:.::: :    : 
CCDS42 FVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGA
     340       350       360       370       380       390         

      400       410       420       430       440       450        
pF1KE2 VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSL-SDHI
       .:::.. . :.    .: :.: ...  .:. :: :.:::.:.:.: : :. ::.. ::  
CCDS42 IYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQIS-KSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSA
     400       410       420        430       440       450        

       460       470        480           490       500       510  
pF1KE2 VLLRARPVINIVHKTLV-PRPAVLDPALCTATS----CVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNI
       ::::.:::. ::  .:  :. .      :. ..    :... :::.: ..   :.:   :
CCDS42 VLLRTRPVV-IVDASLSHPESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSY-KGKEVPGY---I
      460        470       480       490       500        510      

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pF1KE2 TLAYTLEADRDRR---PPRLRFAGS-ESAVFHGFFSMP--EMRCQKLELLLMDNLRDKLR
       .: :..  : .:.   :::. :...  : :. : ...   :  :.  . ..  ..:: : 
CCDS42 VLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILT
           520       530       540       550       560       570   

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pF1KE2 PIIISMNYSL-PLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQALENHTE-VQFQKECGPDNKCESN
       :: :   : : :  .  :    .  :.  :::.: .  .   . ..: . :. .: : ..
CCDS42 PIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ--PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSAD
           580       590       600         610       620        630

            630       640       650       660       670       680  
pF1KE2 LQMRA--AFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVPPA
       ::. :  .:.. ...: . :  . ... :.:.... :      .:.::.:. : . .: .
CCDS42 LQVSAKIGFLKPHENK-TYLAVG-SMKTLMLNVSLFN------AGDDAYETTLHVKLPVG
              640        650        660             670       680  

            690       700       710       720       730        740 
pF1KE2 LLLSSVRPPGACQANETIFCELGNPFKRNQRMELLITFEVIGVTLHTR-DLQVQLQLSTS
       : . ..      : :    ::. .    .  ..:  ..  : :   .: :..  :..:. 
CCDS42 LYFIKILELEEKQIN----CEVTD---NSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFLLDVSSL
            690           700          710       720       730     

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pF1KE2 SHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVNHRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQV
       :. ..     :.. :  : ..   : : . .    .  .      ::.   .: .. .  
CCDS42 SRAEE----DLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGS
         740           750       760       770       780       790 

             810       820       830          840       850        
pF1KE2 GPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPT---EITVHGNGSWPCRPPGD-LINPLN
       .  .:  .    .:  ..  ..: :    . :.   :: : .. :    :  : :.: :.
CCDS42 NDENEPET---CMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFS----PQTDKLFNILD
                800       810       820       830           840    

       860       870       880       890       900          910    
pF1KE2 LTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSET---VLTCATGRAHCVWL
       .  .  :.      .:   :.    :     :: .  .  :.:   .: :  .  ::. .
CCDS42 VQTTT-GECHFENYQRVCALEQ---QKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF
           850       860          870       880       890       900

          920       930       940       950       960       970    
pF1KE2 ECPIPDAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTWF
        : .       ...:. .. .   : .. . . .. .  :: : . . : .   ::    
CCDS42 LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPN-PRVIELNKDE--
              910       920       930       940        950         

          980       990      1000      1010           1020         
pF1KE2 SVDIDSELVEELPAEIELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLL-----WKCGFFKRARTRALYE
         ..   :.: :  .       ... .. ::::::.:::     :: :::::     : :
CCDS42 --NVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQE
         960       970       980       990      1000      1010     

    1030      1040      1050 
pF1KE2 AKRQKAEMKSQPSETERLTDDY
        .:.                  
CCDS42 ENRRDSWSYINSKSNDD     
        1020      1030       

>>CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12              (1044 aa)
 initn: 1260 init1: 348 opt: 953  Z-score: 1041.9  bits: 204.4 E(32554): 1e-51
Smith-Waterman score: 1850; 36.7% identity (64.4% similar) in 986 aa overlap (140-1043:43-1000)

     110       120       130       140             150       160   
pF1KE2 VKNDPGHHIIEDMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYT------QVLWSGSEDQRRMVGKCY
                                     :::::       :.:     . : :.:.:.
CCDS44 TTTRIQRQAEGFQCWRECGTRRSPFEGKETCAHRYEARQRVDQIL-----ETRDMIGRCF
             20        30        40        50             60       

               170       180       190        200       210        
pF1KE2 VRGNDL----ELDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLET-GMCQLGTSGGFTQNTVY--FGAPG
       : ..::    :::... :.     .:..  .  :  :.:: ::...:. .. :  :::::
CCDS44 VLSQDLAIRDELDGGE-WK-----FCEGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPG
        70        80              90       100       110       120 

        220         230                 240          250       260 
pF1KE2 AYNWKGNSY--MIQRKEWDLSEYS---Y-------KDPED---QGNLYIGYTMQVGSFIL
       .:::::..   .  .   ::.. .   :       .::.     .: :.:.... :. ..
CCDS44 TYNWKGTARVELCAQGSADLAHLDDGPYEAGGEKEQDPRLIPVPANSYFGFSIDSGKGLV
             130       140       150       160       170       180 

             270       280       290       300       310       320 
pF1KE2 HPKNITIVTGAPRHRHMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGW
       . .....:.::::  : ::: .: ..... :  . .: : .. . :: ..:.::::.:::
CCDS44 RAEELSFVAGAPRANHKGAVVILRKDSASRLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGW
             190       200       210       220       230       240 

             330       340       350       360       370       380 
pF1KE2 QDLLVGAPYYFERKEEVGGAIYVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSAFGLSVASIGDINQ
        ::.:::::.:::.::.:::.::..::.:      : : : :   : ::.:.: .::.::
CCDS44 PDLIVGAPYFFERQEELGGAVYVYLNQGGHWAGISP-LRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQ
             250       260       270        280       290       300

             390       400       410       420       430       440 
pF1KE2 DGFQDIAVGAPFEGLGKVYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVD
       ::: ::::::::.: :::.:::.:: :.. .:.::..:: .:.    .:::::::..:.:
CCDS44 DGFPDIAVGAPFDGDGKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVGIK---SFGYSLSGSLDMD
              310       320       330       340          350       

             450       460       470        480         490        
pF1KE2 ENFYPDLLVGSLSDHIVLLRARPVINIVHK-TLVPRPAVLDPALCTA--TSCVQVELCFA
        : :::::::::.:  ::.::::.... :. ...::   :.   :..  . ::....::.
CCDS44 GNQYPDLLVGSLADTAVLFRARPILHVSHEVSIAPRSIDLEQPNCAGGHSVCVDLRVCFS
       360       370       380       390       400       410       

      500       510       520           530             540        
pF1KE2 YNQSAGNPNYRRNITLAYTLEADRDRR----PPRLRFAG------SESAVFHGFFSMPEM
       :   :   .:  ...: :.:.:: :::     ::. : .      ...:    ...  . 
CCDS44 YI--AVPSSYSPTVALDYVLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHD
         420       430       440       450       460       470     

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pF1KE2 R-CQKLELLLMDNLRDKLRPIIISMNYSL--PLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQALEN
       : :    . :..:..:::: :.....:::  :    . :  ::  .   ::::  :   .
CCDS44 RVCGDAMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVA--PILNAHQPSTQ
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pF1KE2 HTEVQFQKE-CGPDNKCESNLQM-RAAFVSE-QQQKLSRLQYSRDVRKLLLSIN------
       ..:..: :. :: :. :.::::. :: : .. .. ... : .. :    :....      
CCDS44 RAEIHFLKQGCGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIG
           540       550       560       570       580       590   

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pF1KE2 ----VTNTRTS----ERSGEDAHEALLTLVVPPALLLSSVRP--PGA---CQANET---I
           :::  ..    . .:.::::: : ...: .:  :.::   :.    : .::.   .
CCDS44 LELMVTNLPSDPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDSLHYSGVRALDPAEKPLCLSNENASHV
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pF1KE2 FCELGNPFKRNQRMELLITFEVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTL
        ::::::.::. .. . . . . :....: .:.:.: :.: :.:. : :.     :   :
CCDS44 ECELGNPMKRGAQVTFYLILSTSGISIETTELEVELLLATISEQE-LHPVSARARVFIEL
           660       670       680       690        700       710  

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pF1KE2 QTSLSMVNHRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEW
         :.. .    : ::.:.: :: .:.. .:::: .:::  :. .:..:  ::.  :.. :
CCDS44 PLSIAGMAIPQQLFFSGVVRGERAMQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMW
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pF1KE2 PYEVSNGKWLLYPTEITVHGNGSWPCRPPGDLINPL-NLTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDP
       :.:..:::::::: .. ..: :. : .    : .:  :.   :  .:    .::::.:.:
CCDS44 PHEIANGKWLLYPMQVELEG-GQGPGQK--GLCSPRPNILHLDVDSR----DRRRRELEP
            780       790          800       810           820     

     880               890       900       910       920       930 
pF1KE2 GGGQGP-----PPVT---LAAAKKAKSETVLTCATGRAHCVWLECPIPDAPVVTNVTVKA
          : :     : ..   ...:.: :. : : :: : :.:: . ::. .   .. . : .
CCDS44 PEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEKKKNIT-LDCARGTANCVVFSCPLYSFDRAAVLHVWG
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pF1KE2 RVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPAEIE
       :.:::::.:.:     ..:   :.. ...:: .. ... .: . : .  . .  .   . 
CCDS44 RLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIKNLMLRDASTVIPVMVYLDPMAVVAEGVP
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            1000      1010      1020          1030      1040       
pF1KE2 LWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFFKRAR----TRALYEAKRQKAEMKSQPSETERL
        :..:.:: ::::.:.:..::::: ::::::.    :   :.: .   : ..: .:    
CCDS44 WWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAKHPEATVPQYHAVKIPREDRQQFKEEKTG
          950       960       970       980       990      1000    

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pF1KE2 TDDY                                    
                                               
CCDS44 TILRNNWGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPDGHPGPGTA
         1010      1020      1030      1040    

>>CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2                (1048 aa)
 initn: 600 init1: 158 opt: 948  Z-score: 1036.4  bits: 203.4 E(32554): 2.1e-51
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pF1KE2     MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGYSV
                   ::.  :.: .: : .    :   :::::.    .. .:  :: ::..:
CCDS22 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPL----C--RAFNLDVDS-PAEYSGPEGSYFGFAV
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pF1KE2 ALHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDDCERMNITV------
        .   .  ..:..::.:::.  ..  : ..  : :  :  .. .  :. ... .      
CCDS22 DFFVPSA-SSRMFLLVGAPKANTTQPGIVE-GGQVLKCDWSSTRR-CQPIEFDATGNRDY
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pF1KE2 -KNDPGHHIIEDMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRM-VGKCYVRGND
        :.::  ..   .:.:..: :.    ..:.::  :    :     :.:  :: :...   
CCDS22 AKDDP-LEFKSHQWFGASVRSK--QDKILACAPLYH---WRTEMKQEREPVGTCFLQ---
               120       130         140          150       160    

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pF1KE2 LELDSSDDWQTYHNEMCNS-NTDYLETGMCQLGTSGGFTQ-NTVYFGAPGAYNWKGNSYM
             :  .: .   : : . :    :.:: : :  ::. . : .:.::.. :.:.   
CCDS22 ------DGTKTVEYAPCRSQDIDADGQGFCQGGFSIDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQLIS
                   170       180       190       200       210     

        230           240                250       260        270  
pF1KE2 IQRKE----WDLSEYSYKDPEDQG---------NLYIGYTMQVGSFILHPKNIT-IVTGA
        :  :    .: . :: :  .. .         . :.::.. ::.:  .  .:  .:.:.
CCDS22 DQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDF--NGDGIDDFVSGV
         220       230       240       250       260         270   

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pF1KE2 PRH-RHMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYY
       ::  : .: :.. .   : ..     . : :..:::: ..: .:.:.: . :...::: .
CCDS22 PRAARTLGMVYIYD---GKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLF
           280          290       300       310       320       330

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pF1KE2 FER----KEEVGGAIYVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSA-FGLSVASIGDINQDGFQD
       ..:    : .  : . : ...:. .:    .  :.:    : :: ..: .::..::::.:
CCDS22 MDRGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQ---TTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFND
              340       350          360       370       380       

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pF1KE2 IAVGAPFEGLGK---VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDEN
       ::..::. :  :   :::... : ::   :.:...:.  .     .::::..:  :.:.:
CCDS22 IAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKN
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pF1KE2 FYPDLLVGSLS-DHIVLLRARPVINIVHKTLVPRPAVL--DPALCT------ATSCVQVE
        ::::.::... :. .: ::::::. :.  :   :..:  :   :.       .:: .:.
CCDS22 GYPDLIVGAFGVDRAILYRARPVIT-VNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVR
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pF1KE2 LCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYTLEADRDRRPPRLR---FAGSESAVFHGFFSMPE---M
       .:.   .. :.    :....   :  :. ..   .:   :  :.:      ... .   :
CCDS22 FCL---KADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLM
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pF1KE2 RCQKLELLLMDN--LRDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQALENH
       .:..:   : :.  .:::: :: : :.: :  :       ::.     :::::    .  
CCDS22 QCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAA-DTTGLQ-----PILNQFTPANIS
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pF1KE2 TEVQFQKECGPDNKCESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERS
        ....  .:: :: :. .:..    :. .:.:.    :  :   : : ... :      .
CCDS22 RQAHILLDCGEDNVCKPKLEVS---VDSDQKKI----YIGDDNPLTLIVKAQN------Q
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pF1KE2 GEDAHEALLTLVVP-PALLLSSVRPPGA-----CQ---ANET--IFCELGNPFKRNQRME
       :: :.:: : . .:  : ... ::   :     :     :.:  . :.::::.: . .. 
CCDS22 GEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLL
          670       680       690       700       710       720    

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pF1KE2 LLITFEVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSM--VNHRLQS
         . : :   .    ... .::...:.  :.. :.. .  :: .. ... .  :.   . 
CCDS22 AGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPVV-SHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHV
          730       740       750       760        770       780   

            780       790       800       810       820       830  
pF1KE2 FFG-GTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLY
       :.   .   . . .: ::::  ... ...   ..:  ...  .: :.:::. .:.  :::
CCDS22 FLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYEL--RNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNT-LLY
           790       800       810         820       830        840

            840       850        860       870       880       890 
pF1KE2 PTEITVHGNGSWPCRPPGDL-INPLNLTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLA
         .  . :    :    .:. :::: . .:       : :  ... :  .:::     ..
CCDS22 ILHYDIDG----PMNCTSDMEINPLRIKIS-------SLQTTEKN-DTVAGQGERDHLIT
                  850       860              870        880        

              900       910         920       930       940        
pF1KE2 AAKKAKSE-TVLTCATGRAHCVWLECPIP--DAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRV
           : ::  . : . : :.:. . : .   :    . . ::. .:. ::..   .    
CCDS22 KRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSY
      890       900       910       920       930       940        

      950           960       970       980       990      1000    
pF1KE2 RVNGWATL----FLRTSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPAEIELWLVLVAVGAGLL
        ... :..    :   ..:  .. : .:  .... .  ..  :  . .:....:: ::::
CCDS22 SLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITN-STLVTTNV-TWGIQPAPMPVPVWVIILAVLAGLL
      950       960       970        980        990      1000      

         1010      1020      1030      1040      1050 
pF1KE2 LLGLIILLLWKCGFFKRARTRALYEAKRQKAEMKSQPSETERLTDDY
       ::......... :::::.:       .... . . :: :        
CCDS22 LLAVLVFVMYRMGFFKRVRP-----PQEEQEREQLQPHENGEGNSET
       1010      1020           1030      1040        

>>CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2               (1002 aa)
 initn: 557 init1: 158 opt: 901  Z-score: 985.0  bits: 193.8 E(32554): 1.5e-48
Smith-Waterman score: 1060; 27.6% identity (55.3% similar) in 1049 aa overlap (67-1043:17-994)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE2 TRFLVVKEAGNPGSLFGYSVALHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPL
                                     :..::.:::.  ..  : ..  : :  :  
CCDS46               MLLGTLLLILYILMLCRMFLLVGAPKANTTQPGIVE-GGQVLKCDW
                             10        20        30         40     

        100       110              120       130       140         
pF1KE2 TAHKDDCERMNITV-------KNDPGHHIIEDMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYTQVLW
       .. .  :. ... .       :.::  ..   .:.:..: :.    ..:.::  :    :
CCDS46 SSTRR-CQPIEFDATGNRDYAKDDP-LEFKSHQWFGASVRSK--QDKILACAPLYH---W
          50         60         70        80          90           

     150        160       170       180        190       200       
pF1KE2 SGSEDQRRM-VGKCYVRGNDLELDSSDDWQTYHNEMCNS-NTDYLETGMCQLGTSGGFTQ
            :.:  :: :...         :  .: .   : : . :    :.:: : :  ::.
CCDS46 RTEMKQEREPVGTCFLQ---------DGTKTVEYAPCRSQDIDADGQGFCQGGFSIDFTK
      100       110                120       130       140         

        210       220       230           240                250   
pF1KE2 -NTVYFGAPGAYNWKGNSYMIQRKE----WDLSEYSYKDPEDQG---------NLYIGYT
        . : .:.::.. :.:.    :  :    .: . :: :  .. .         . :.::.
CCDS46 ADRVLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYS
     150       160       170       180       190       200         

           260        270        280       290       300       310 
pF1KE2 MQVGSFILHPKNIT-IVTGAPRH-RHMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAI
       . ::.:  .  .:  .:.:.::  : .: :.. .   : ..     . : :..:::: ..
CCDS46 VAVGDF--NGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIYD---GKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSV
     210         220       230       240          250       260    

             320       330           340       350       360       
pF1KE2 ALADLNNDGWQDLLVGAPYYFER----KEEVGGAIYVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGS
       : .:.:.: . :...::: ...:    : .  : . : ...:. .:    .  :.:    
CCDS46 AATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQ---TTKLNGFEVF
          270       280       290       300       310          320 

        370       380       390          400       410       420   
pF1KE2 A-FGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEGLGK---VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLG
       : :: ..: .::..::::.:::..::. :  :   :::... : ::   :.:...:.  .
CCDS46 ARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAA
             330       340       350       360       370       380 

           430       440       450        460       470       480  
pF1KE2 LPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSLS-DHIVLLRARPVINIVHKTLVPRPAVL--
            .::::..:  :.:.: ::::.::... :. .: ::::::. :.  :   :..:  
CCDS46 RSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRARPVIT-VNAGLEVYPSILNQ
             390       400       410       420        430       440

                    490       500       510       520       530    
pF1KE2 DPALCT------ATSCVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYTLEADRDRRPPRLR---F
       :   :.       .:: .:..:.   .. :.    :....   :  :. ..   .:   :
CCDS46 DNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCL---KADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALF
              450       460          470       480       490       

             540          550       560         570       580      
pF1KE2 AGSESAVFHGFFSMPE---MRCQKLELLLMDN--LRDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRL
         :.:      ... .   :.:..:   : :.  .:::: :: : :.: :  :       
CCDS46 LYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAA-DTT
       500       510       520       530       540       550       

        590       600       610       620       630       640      
pF1KE2 GLRSLDAYPILNQAQALENHTEVQFQKECGPDNKCESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSR
       ::.     :::::    .   ....  .:: :: :. .:..    :. .:.:.    :  
CCDS46 GLQ-----PILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLEVS---VDSDQKKI----YIG
             560       570       580       590          600        

        650       660       670       680        690               
pF1KE2 DVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVP-PALLLSSVRPPGA-----CQ---AN
       :   : : ... :      .:: :.:: : . .:  : ... ::   :     :     :
CCDS46 DDNPLTLIVKAQN------QGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTEN
          610             620       630       640       650        

         700       710       720       730       740       750     
pF1KE2 ET--IFCELGNPFKRNQRMELLITFEVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLL
       .:  . :.::::.: . ..   . : :   .    ... .::...:.  :.. : ...  
CCDS46 QTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSP-VVSHK
      660       670       680       690       700       710        

         760         770        780       790       800       810  
pF1KE2 VDYTLQTSLSM--VNHRLQSFFG-GTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLG
       :: .. ... .  :.   . :.   .   . . .: ::::  ... ...   ..:  ...
CCDS46 VDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYEL--RNNGPSSFS
       720       730       740       750       760         770     

            820       830       840       850        860       870 
pF1KE2 TLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPTEITVHGNGSWPCRPPGDL-INPLNLTLSDPGDRPSSPQ
         .: :.:::. .:.  :::  .  . :    :    .:. :::: . .:       : :
CCDS46 KAMLHLQWPYKYNNNT-LLYILHYDIDG----PMNCTSDMEINPLRIKIS-------SLQ
         780       790        800           810       820          

             880       890        900       910         920        
pF1KE2 RRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSE-TVLTCATGRAHCVWLECPIP--DAPVVTNVT
         ... :  .:::     ..    : ::  . : . : :.:. . : .   :    . . 
CCDS46 TTEKN-DTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILY
            830       840       850       860       870       880  

      930       940       950           960       970       980    
pF1KE2 VKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATL----FLRTSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVE
       ::. .:. ::..   .     ... :..    :   ..:  .. : .:  .... .  ..
CCDS46 VKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITN-STLVTTNV-TWGIQ
            890       900       910       920        930        940

          990      1000      1010      1020      1030      1040    
pF1KE2 ELPAEIELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFFKRARTRALYEAKRQKAEMKSQPSET
         :  . .:....:: ::::::......... :::::.:       .... . . :: : 
CCDS46 PAPMPVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRP-----PQEEQEREQLQPHEN
              950       960       970       980            990     

         1050 
pF1KE2 ERLTDDY
              
CCDS46 GEGNSET
        1000  

>>CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10              (1063 aa)
 initn: 779 init1: 157 opt: 863  Z-score: 942.8  bits: 186.1 E(32554): 3.4e-46
Smith-Waterman score: 1194; 28.0% identity (55.8% similar) in 1102 aa overlap (1-1023:1-1043)

               10                20        30        40        50  
pF1KE2 MGPGPSRAPR---APRLM-LC----ALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLF
       :.:: ::.::   :: .  ::    ::.... . .:  .:::::.. :.:  .:  :: :
CCDS31 MSPGASRGPRGSQAPLIAPLCCAAAALGMLLWSPAC--QAFNLDVEKLTVY-SGPKGSYF
               10        20        30          40         50       

             60        70         80        90       100           
pF1KE2 GYSVALHRQTERQQRYLLLAGAPR-ELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKD-DCERM----
       ::.: .:    :     .:.:::. . . ::    . :::: ::  :. . .:...    
CCDS31 GYAVDFHIPDARTAS--VLVGAPKANTSQPD--IVEGGAVYYCPWPAEGSAQCRQIPFDT
        60        70          80          90       100       110   

          110       120          130       140       150       160 
pF1KE2 --NITVKNDPGHHIIE---DMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRMVGK
         :  .. .  .. ::   ..:.:.:: ..   :.:..::  :     . . . .  :: 
CCDS31 TNNRKIRVNGTKEPIEFKSNQWFGATVKAH--KGKVVACAPLYHWRTLKPTPE-KDPVGT
           120       130       140         150       160        170

             170       180         190       200        210        
pF1KE2 CYVRGNDLELDSSDDWQTYHN-EMC-NSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQN-TVYFGAPGAY
       :::        . .....: .   : :::.:    :.:: : :  : .:  .  :.::..
CCDS31 CYV--------AIQNFSAYAEFSPCRNSNADPEGQGYCQAGFSLDFYKNGDLIVGGPGSF
                      180       190       200       210       220  

      220       230        240                     250       260   
pF1KE2 NWKGNSYMIQRKEWDL-SEYSYKD--------------PEDQGNLYIGYTMQVGSFILHP
        :.:.  .:  .  :. ..::.::              : .  . :.::.. .: :    
CCDS31 YWQGQ--VITASVADIIANYSFKDILRKLAGEKQTEVAPASYDDSYLGYSVAAGEFTGDS
              230       240       250       260       270       280

           270        280       290       300       310       320  
pF1KE2 KNITIVTGAPRH-RHMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQ
       ..  .:.: ::  ...: : ....    :.   : . : :...::: .....:.:.:: .
CCDS31 QQ-ELVAGIPRGAQNFGYVSIINST---DMTFIQNFTGEQMASYFGYTVVVSDVNSDGLD
               290       300          310       320       330      

            330           340       350       360       370        
pF1KE2 DLLVGAPYYFERKEEVG----GAIYVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSAFGLSVASIGD
       :.::::: ..::. : .    : ::... :... .   :..:    . . :: ..: .::
CCDS31 DVLVGAPLFMEREFESNPREVGQIYLYL-QVSSLLFRDPQILTGTETFGRFGSAMAHLGD
        340       350       360        370       380       390     

      380       390          400       410       420       430     
pF1KE2 INQDGFQDIAVGAPFEGL---GKVYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLS
       .::::..:::.:.:: :    ::: ::.... ::  .:.::..:   .    . ::..: 
CCDS31 LNQDGYNDIAIGVPFAGKDQRGKVLIYNGNKDGLNTKPSQVLQGVWASHAVPSGFGFTLR
         400       410       420       430       440       450     

         440       450        460       470        480       490   
pF1KE2 GQMDVDENFYPDLLVGSL-SDHIVLLRARPVINIVHKTLV-PRPAVLDPALCTATSCVQV
       :. :.:.: ::::.::.. . .... :::::...  . :. :    :.   : . . .  
CCDS31 GDSDIDKNDYPDLIVGAFGTGKVAVYRARPVVTVDAQLLLHPMIINLENKTCQVPDSMTS
         460       470       480       490       500       510     

           500         510       520          530       540        
pF1KE2 ELCFAYN--QSAGNPNYRRNITLAYTLEADRDRRP---PRLRFAGSESAVFHGFFSMPEM
         ::.     :. . .   .:.:   .. :  ..     :  :  ...:  :  : .   
CCDS31 AACFSLRVCASVTGQSIANTIVLMAEVQLDSLKQKGAIKRTLFLDNHQA--HRVFPLVIK
         520       530       540       550       560         570   

           550       560         570       580       590       600 
pF1KE2 R-----CQKLELLLMDN--LRDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQ
       :     :: . . : :.  .:::: :: ::.::::     :.  .  ..:.. ::::  .
CCDS31 RQKSHQCQDFIVYLRDETEFRDKLSPINISLNYSL-----DESTFK-EGLEVKPILNYYR
           580       590       600            610        620       

             610       620       630       640       650       660 
pF1KE2 ALENHTEVQFQKECGPDNKCESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTR
             ....  .:: :: :  .:.. :    ...: .       :  .:.: ::. :  
CCDS31 ENIVSEQAHILVDCGEDNLCVPDLKLSAR--PDKHQVIIG-----DENHLMLIINARNE-
       630       640       650         660            670          

             670       680       690                  700       710
pF1KE2 TSERSGEDAHEALLTLVVPPALLLSSVRP------PGACQ-----ANETIFCELGNPFKR
            :: :.:: : ...:      ...       : .:.     ... . :.::::.  
CCDS31 -----GEGAYEAELFVMIPEEADYVGIERNNKGFRPLSCEYKMENVTRMVVCDLGNPMVS
          680       690       700       710       720       730    

              720       730       740       750       760          
pF1KE2 NQRMELLITFEVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTL--QTSLSMVN
       .  . : . : :  .   . ... .::.  ::..::    ...: .. :   :. .  :.
CCDS31 GTNYSLGLRFAVPRLEKTNMSINFDLQIR-SSNKDNPDSNFVSLQINITAVAQVEIRGVS
          740       750       760        770       780       790   

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pF1KE2 HRLQSFFG-GTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNG
       :  :  .   .   :   .  :.::  ... ...  .: . ..   : .:  ::. . . 
CCDS31 HPPQIVLPIHNWEPEEEPHKEEEVGPLVEHIYELHNIGPSTISDTILEVG--WPFSARD-
           800       810       820       830       840         850 

       830       840       850        860       870       880      
pF1KE2 KWLLYPTEITVHGNGSWPCRPPGDLINPLNLT-LSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPP
       ..:::  .: .   :   :.:  . ::: ..   ..: : :      : .  :   .   
CCDS31 EFLLYIFHIQTL--GPLQCQPNPN-INPQDIKPAASPEDTPELSAFLRNSTIPHLVR-KR
              860         870        880       890       900       

        890       900       910         920       930       940    
pF1KE2 PVTLAAAKKAKSETVLTCATGRAHCVWLECPIP--DAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRD
        : ..  .. .   .:.:..   .:. . : .   ..   . . :..:.:  ::..  : 
CCDS31 DVHVVEFHRQSPAKILNCTN--IECLQISCAVGRLEGGESAVLKVRSRLWAHTFLQ--RK
        910       920         930       940       950       960    

          950       960       970       980          990      1000 
pF1KE2 FDRVRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPA---EIELWLVLVAVGA
        :   . . ... .. ..:  ..  :    :. : . ..   :     : ::....:.  
CCDS31 NDPYALASLVSFEVK-KMPYTDQPAKLPEGSIVIKTSVIWATPNVSFSIPLWVIILAILL
            970        980       990      1000      1010      1020 

            1010      1020      1030      1040      1050 
pF1KE2 GLLLLGLIILLLWKCGFFKRARTRALYEAKRQKAEMKSQPSETERLTDDY
       :::.:... : ::::::: :::                            
CCDS31 GLLVLAILTLALWKCGFFDRARPPQEDMTDREQLTNDKTPEA        
            1030      1040      1050      1060           

>>CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2               (1012 aa)
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Smith-Waterman score: 1019; 27.2% identity (54.6% similar) in 1092 aa overlap (9-1043:13-1004)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE2     MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGYSV
                   ::.  :.: .: : .    :   :::::.    .. .:  :: ::..:
CCDS46 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPL----C--RAFNLDVDS-PAEYSGPEGSYFGFAV
               10        20              30         40        50   

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pF1KE2 ALHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDDCERMNITV------
        .   .  ..:..::.:::.  ..  : ..  : :  :  .. .  :. ... .      
CCDS46 DFFVPSA-SSRMFLLVGAPKANTTQPGIVE-GGQVLKCDWSSTRR-CQPIEFDATGNRDY
            60         70        80         90        100       110

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pF1KE2 -KNDPGHHIIEDMWLGVTVASQGPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRM-VGKCYVRGND
        :.::  ..   .:.:..: :.    ..:.::  :    :     :.:  :: :...   
CCDS46 AKDDP-LEFKSHQWFGASVRSK--QDKILACAPLYH---WRTEMKQEREPVGTCFLQ---
               120       130         140          150       160    

      170       180       190       200       210       220        
pF1KE2 LELDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMIQ
             :  .: .   : :          ::  :   .. .  .  :..:. : :. .  
CCDS46 ------DGTKTVEYAPCRSR---------QL-ISDQVAEIVSKYD-PNVYSIKYNNQLAT
                   170                 180       190        200    

      230       240       250       260        270        280      
pF1KE2 RKEWDLSEYSYKDPEDQGNLYIGYTMQVGSFILHPKNIT-IVTGAPRH-RHMGAVFLLSQ
       :    . . ::          .::.. ::.:  .  .:  .:.:.::  : .: :.. . 
CCDS46 RTAQAIFDDSY----------LGYSVAVGDF--NGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIYD-
          210                 220         230       240       250  

        290       300       310       320       330           340  
pF1KE2 EAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFER----KEEVGGAI
         : ..     . : :..:::: ..: .:.:.: . :...::: ...:    : .  : .
CCDS46 --GKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQV
               260       270       280       290       300         

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pF1KE2 YVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSA-FGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEGLGK---
        : ...:. .:    .  :.:    : :: ..: .::..::::.:::..::. :  :   
CCDS46 SVSLQRASGDFQ---TTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGI
     310       320          330       340       350       360      

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pF1KE2 VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSLS-DHI
       :::... : ::   :.:...:.  .     .::::..:  :.:.: ::::.::... :. 
CCDS46 VYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRA
        370       380       390       400       410       420      

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pF1KE2 VLLRARPVINIVHKTLVPRPAVL--DPALCT------ATSCVQVELCFAYNQSAGNPNYR
       .: ::::::. :.  :   :..:  :   :.       .:: .:..:.   .. :.    
CCDS46 ILYRARPVIT-VNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCL---KADGKGVLP
        430        440       450       460       470          480  

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pF1KE2 RNITLAYTLEADRDRRPPRLR---FAGSESAVFHGFFSMPE---MRCQKLELLLMDN--L
       :....   :  :. ..   .:   :  :.:      ... .   :.:..:   : :.  .
CCDS46 RKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEF
            490       500       510       520       530       540  

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pF1KE2 RDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQALENHTEVQFQKECGPDNKC
       :::: :: : :.: :  :       ::.     :::::    .   ....  .:: :: :
CCDS46 RDKLTPITIFMEYRLDYRTAA-DTTGLQ-----PILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVC
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pF1KE2 ESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVP-
       . .:..    :. .:.:.    :  :   : : ... :      .:: :.:: : . .: 
CCDS46 KPKLEVS---VDSDQKKI----YIGDDNPLTLIVKAQN------QGEGAYEAELIVSIPL
        600          610           620             630       640   

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pF1KE2 PALLLSSVRPPGA-----CQ---ANET--IFCELGNPFKRNQRMELLITFEVIGVTLHTR
        : ... ::   :     :     :.:  . :.::::.: . ..   . : :   .    
CCDS46 QADFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDT
           650       660       670       680       690       700   

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pF1KE2 DLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSM--VNHRLQSFFG-GTVMGESGMKT
       ... .::...:.  :.. :.. .  :: .. ... .  :.   . :.   .   . . .:
CCDS46 SVKFDLQIQSSNLFDKVSPVV-SHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPET
           710       720        730       740       750       760  

       790       800       810       820       830       840       
pF1KE2 VEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPTEITVHGNGSWPCR
        ::::  ... ...   ..:  ...  .: :.:::. .:.  :::  .  . :    :  
CCDS46 EEDVGPVVQHIYEL--RNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNT-LLYILHYDIDG----PMN
            770         780       790       800        810         

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pF1KE2 PPGDL-INPLNLTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSE-TVLTCA
         .:. :::: . .:       : :  ... :  .:::     ..    : ::  . : .
CCDS46 CTSDMEINPLRIKIS-------SLQTTEKN-DTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLG
         820       830               840       850       860       

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pF1KE2 TGRAHCVWLECPIP--DAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATL----FLR
        : :.:. . : .   :    . . ::. .:. ::..   .     ... :..    :  
CCDS46 CGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPY
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pF1KE2 TSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPAEIELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFF
        ..:  .. : .:  .... .  ..  :  . .:....:: ::::::......... :::
CCDS46 KNLPIEDITN-STLVTTNV-TWGIQPAPMPVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFF
       930        940        950       960       970       980     

    1020      1030      1040      1050 
pF1KE2 KRARTRALYEAKRQKAEMKSQPSETERLTDDY
       ::.:       .... . . :: :        
CCDS46 KRVRP-----PQEEQEREQLQPHENGEGNSET
         990           1000      1010  

>>CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17             (1039 aa)
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Smith-Waterman score: 1086; 28.8% identity (56.5% similar) in 1093 aa overlap (21-1023:17-1028)

               10        20        30           40        50       
pF1KE2 MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVS---AFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGYSVA
                           ...  : :..    :.:::   :.   ::  :: ::.:. 
CCDS32     MARALCPLQALWLLEWVLLLLGPCAAPPAWALNLDPVQLTFY-AGPNGSQFGFSLD
                   10        20        30        40         50     

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 LHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDDCERMNITVKNDP---
       .:...  . :  ...:::: :. :.   ..::.:.:::  :.  .:  . . ....    
CCDS32 FHKDS--HGRVAIVVGAPRTLG-PS--QEETGGVFLCPWRAEGGQCPSLLFDLRDETRNV
          60          70           80        90       100       110

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pF1KE2 GHHIIEDMW----LGVTVASQGPAGRVLVCAH-RYTQVLWSGSEDQRRMVGKCYVRGNDL
       : . .. .     ::..:.: . .  ...::  .. .:: .  : ..  ::.:.      
CCDS32 GSQTLQTFKARQGLGASVVSWSDV--IVACAPWQHWNVLEKTEEAEKTPVGSCF------
              120       130         140       150       160        

     170       180       190                200        210         
pF1KE2 ELDSSDDWQTYHNEMCNSNTD---YLETGM------CQLGTSGGFTQ-NTVYFGAPGAYN
        : . .. .  .   : .::    :.:. .      :. : :.  :: . . .::::.: 
CCDS32 -LAQPESGRRAEYSPCRGNTLSRIYVENDFSWDKRYCEAGFSSVVTQAGELVLGAPGGYY
             170       180       190       200       210       220 

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pF1KE2 WKG-----------NSYMIQRKEWDLSEYSYK----DPEDQGNLYIGYTMQVGSFILHPK
       . :           .::      : .:  : .    .::   . : ::.. :: :    .
CCDS32 FLGLLAQAPVADIFSSYRPGILLWHVSSQSLSFDSSNPE-YFDGYWGYSVAVGEFDGDLN
             230       240       250       260        270       280

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pF1KE2 NITIVTGAPRHR-HMGAVFLLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQD
       .   :.:::     .::: .:..      .: . :.: :...::: ..:..:.:.:: .:
CCDS32 TTEYVVGAPTWSWTLGAVEILDSY----YQRLHRLRGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHD
              290       300           310       320       330      

           330           340       350       360        370        
pF1KE2 LLVGAPYYFE----RKEEVGGAIYVFMNQAGTSFPAHPSLLLHGPS-GSAFGLSVASIGD
       :::::: :.:    ::    : .:.:..  :    . ::::: : .  . :: ..: .::
CCDS32 LLVGAPLYMESRADRKLAEVGRVYLFLQPRGPHALGAPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGD
        340       350       360       370       380       390      

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pF1KE2 INQDGFQDIAVGAPF---EGLGKVYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLS
       ...::..::::.::.    : :.: .. ..:.::  .:.::. .    .:  ..::.:: 
CCDS32 LDRDGYNDIAVAAPYGGPSGRGQVLVFLGQSEGLRSRPSQVLDSP---FPTGSAFGFSLR
        400       410       420       430       440          450   

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pF1KE2 GQMDVDENFYPDLLVGSL-SDHIVLLRARPVINIVHKTLVP---RPAVLD---PALCTAT
       : .:.:.: ::::.::.  ...... ::.::..   . ::     ::: .   :   : .
CCDS32 GAVDIDDNGYPDLIVGAYGANQVAVYRAQPVVKASVQLLVQDSLNPAVKSCVLPQTKTPV
           460       470       480       490       500       510   

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pF1KE2 SCVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYTLEADRD--RRPPRLRFAGSESAVFHGFFSMP
       :: ....:     .: . :  ....:   :. ::.  :.  :. . ::..:     ... 
CCDS32 SCFNIQMCV----GATGHNIPQKLSLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLGSQQAGTTLNLDLG
           520           530       540       550       560         

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pF1KE2 EMR---CQKLELLLMD--NLRDKLRPIIISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQ
         .   :.    .: :  ..:::: ::..:.: :::   : .  ..       :    : 
CCDS32 GKHSPICHTTMAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLP---PTEAGMA-------P----AV
     570       580       590       600          610                

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pF1KE2 ALENHTEVQFQK----ECGPDNKCESNLQMRAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINV
       .:.. :.:: :     .:: :. :  .::. :. ..      : :  . :   : :....
CCDS32 VLHGDTHVQEQTRIVLDCGEDDVCVPQLQLTASVTG------SPLLVGAD-NVLELQMDA
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pF1KE2 TNTRTSERSGEDAHEALLTLVVPPAL----LLSSVR--PPGAC---QANET--IFCELGN
       .:       :: :.:: :.. .: .      ::.:.      :   . :::  ..:::::
CCDS32 ANE------GEGAYEAELAVHLPQGAHYMRALSNVEGFERLICNQKKENETRVVLCELGN
      670             680       690       700       710       720  

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pF1KE2 PFKRNQRMELLITFEVIGVTLHTRDLQVQLQLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSM
       :.:.: .. . .   : ..    .... :::. ... :.   :    .:.:  ...  ..
CCDS32 PMKKNAQIGIAMLVSVGNLEEAGESVSFQLQIRSKNSQN---PNSKIVLLDVPVRAE-AQ
            730       740       750       760          770         

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pF1KE2 VNHRLQSFFGGTVM----GESGMKTVEDVGSPLKYEFQVGPMGEGLVGLGTLVLGLEWPY
       :. : .:: .. :.    ::  ...... :  ... ...   : : :. : : :... : 
CCDS32 VELRGNSFPASLVVAAEEGEREQNSLDSWGPKVEHTYELHNNGPGTVN-G-LHLSIHLPG
      780       790       800       810       820         830      

            830       840         850         860       870        
pF1KE2 EVSNGKWLLYPTEITVHGNGSWPC--RPPGDLINPLNLT--LSDPGDRPSSP---QRRRR
       . :. . :::  .:  . .:.  :  .::   .:::..   :  :.  :  :   .: ::
CCDS32 Q-SQPSDLLYILDI--QPQGGLQCFPQPP---VNPLKVDWGLPIPSPSPIHPAHHKRDRR
         840         850       860          870       880       890

         880       890       900       910       920         930   
pF1KE2 QLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSETVLTCATGRAHCVWLECPIPDAPV--VTNVTVKARV
       :.       : :      .. .. ....: .  : :. ..: . .      . ::: : .
CCDS32 QI-----FLPEP---EQPSRLQDPVLVSCDS--APCTVVQCDLQEMARGQRAMVTVLAFL
                      900       910         920       930       940

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pF1KE2 WNSTFIEDYRDFDR--VRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTWFSVDIDSELVEELPAE-I
       :  .. .  : .:.  .. ..:   :  .:.:      .     ... ..:.. :  . :
CCDS32 WLPSLYQ--RPLDQFVLQSHAW---FNVSSLPYAVPPLSLPRGEAQVWTQLLRALEERAI
                950       960          970       980       990     

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KE2 ELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLLWKCGFFKRARTRALYEAKRQKAEMKSQPSETERLTDD
        .: :::.: .::::: ...: .:: ::::: :                           
CCDS32 PIWWVLVGVLGGLLLLTILVLAMWKVGFFKRNRPPLEEDDEEGE                
        1000      1010      1020      1030                         

        
pF1KE2 Y

>>CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16              (1170 aa)
 initn: 361 init1: 195 opt: 679  Z-score: 739.8  bits: 148.7 E(32554): 6.9e-35
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     170       180       190       200       210       220         
pF1KE2 ELDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMIQR
                                     : :. .... .  :: :: .: :.   .. 
CCDS32 LFTELQKKIYVIEGTSKQDLTSFNMELSSSGISADLSRGHAVVGAVGAKDWAGGFLDLKA
            330       340       350       360       370       380  

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pF1KE2 KEWDLSEYSYKD--PEDQGNLYIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVFLLSQ-
          : .  . .   :: ... :.:::  :  .  . :.  ...::::..::: :.:... 
CCDS32 DLQDDTFIGNEPLTPEVRAG-YLGYT--VTWLPSRQKTSLLASGAPRYQHMGRVLLFQEP
            390       400          410       420       430         

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pF1KE2 EAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLL-VGAPYYFERKEEVGGAIYVF
       ..::   . :...:.:.:.:::. .  .:...::  .:: .::: ..   :. :: ....
CCDS32 QGGGHWSQVQTIHGTQIGSYFGGELCGVDVDQDGETELLLIGAPLFY--GEQRGGRVFIY
     440       450       460       470       480         490       

          350       360          370       380       390       400 
pF1KE2 MN-QAGTSFPAHPSLLLHGPSG---SAFGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEGLGKVYI
       .  : :    ..    :.:  :   . :: ..... ::: ::. :.:::::.:  : :::
CCDS32 QRRQLGFEEVSE----LQGDPGYPLGRFGEAITALTDINGDGLVDVAVGAPLEEQGAVYI
       500           510       520       530       540       550   

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pF1KE2 YHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSLSDHIVLLR
       ...   ::  ::.: :.: .. : :.  :: :. :  :.. .   :. ::. :. :::  
CCDS32 FNGRHGGLSPQPSQRIEGTQV-LSGIQWFGRSIHGVKDLEGDGLADVAVGAESQMIVL-S
           560       570        580       590       600       610  

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pF1KE2 ARPVINIVH-KTLVPRPAVLDPALCTATSC------VQVELCFAYNQSAGNPNYRRNITL
       .:::...:   .. :    .  . :. ..       :.. .::  ..   . . :   .:
CCDS32 SRPVVDMVTLMSFSPAEIPVHEVECSYSTSNKMKEGVNITICFQIKSLIPQFQGRLVANL
             620       630       640       650       660       670 

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pF1KE2 AYTLEADRDRRPPRLRFAGSESAVFHGFFSMPEMRCQKLELLLMDNLRDKLRPIIISMNY
       .:::. :  :   :  : :..  . ...     : :  . . .   ..: . :: .:.:.
CCDS32 TYTLQLDGHRTRRRGLFPGGRHELRRNIAVTTSMSCTDFSFHFPVCVQDLISPINVSLNF
             680       690       700       710       720       730 

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pF1KE2 SLPLRMPDRPR-LGLRSLDAYPILNQAQALENHT-EVQFQKECGPDNKCESNLQMRAAFV
       ::  .    ::    .. :  :::  .  :...: :. :.:.:: :.:::.::  :..: 
CCDS32 SL-WEEEGTPRDQRAQGKDIPPILRPS--LHSETWEIPFEKNCGEDKKCEANL--RVSFS
              740       750         760       770       780        

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pF1KE2 SEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVPPALLLSSV---R
         ... :    ..    .: . ....: .      :::. . : :  ::.: . .:   .
CCDS32 PARSRALRLTAFA----SLSVELSLSNLE------EDAYWVQLDLHFPPGLSFRKVEMLK
        790           800       810             820       830      

     690                   700        710       720       730      
pF1KE2 P----PGACQA--------NETIFCELGNP-FKRNQRMELLITFEVIGVTLHTRDLQVQL
       :    : .:.         .... :....: :: .. . : . :...             
CCDS32 PHSQIPVSCEELPEESRLLSRALSCNVSSPIFKAGHSVALQMMFNTLVNSSWGDSVELHA
        840       850       860       870       880       890      

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pF1KE2 QLSTSSHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVNHRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVGSPLK
                                                                   
CCDS32 NVTCNNEDSDLLEDNSATTIIPILYPINILIQDQEDSTLYVSFTPKGPKIHQVKHMYQVR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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