FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2327, 979 aa 1>>>pF1KE2327 979 - 979 aa - 979 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1011+/-0.00138; mu= 10.7136+/- 0.083 mean_var=255.3087+/-51.740, 0's: 0 Z-trim(108.4): 76 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.080268 statistics sampled from 10149 (10205) to 10149 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16 Scan time: 4.680 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 4916 584.0 5.2e-166 CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 3463 415.7 2.3e-115 CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 856 114.0 2.2e-24 CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 842 112.4 6.6e-24 CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 840 112.1 7.4e-24 CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 748 101.5 1.3e-20 CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 734 99.8 3.5e-20 CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143) 666 91.9 8e-18 CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041) 621 86.6 2.8e-16 CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220) 622 86.8 2.9e-16 CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181) 587 82.7 4.6e-15 CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 672) 558 79.1 3.3e-14 CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 703) 558 79.1 3.4e-14 CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 ( 795) 522 75.0 6.6e-13 CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227) 511 74.0 2.1e-12 CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 ( 707) 498 72.2 4.2e-12 CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 702) 489 71.1 8.6e-12 CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 779) 489 71.2 9.2e-12 >>CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008 aa) initn: 4909 init1: 4909 opt: 4916 Z-score: 3093.9 bits: 584.0 E(32554): 5.2e-166 Smith-Waterman score: 6489; 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CCDS41 TKLRDLLQKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGY 330 340 350 360 370 380 410 420 430 pF1KE2 ---EKIRYVPE-QKEHRCQF--------KRGFMQGHVNRQ-------------------- : ..: : :.:.. : ... .. . .:: CCDS41 TNKEMLKYKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAV 390 400 410 420 430 440 440 pF1KE2 -----EKE----------EKEAIYKERW---------------------PDY-------- ::. : .: .. : :: CCDS41 FSQLTEKDVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSAT 450 460 470 480 490 500 450 pF1KE2 ---------------------------------------------VRELRRRYSAS---- . .: . :::. 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CCDS41 RLFSRLRFQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNA 750 760 770 780 790 800 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 IRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP .. : ..:.: :.:: :: ::: ::::::.:::.: .... ::::.:::: .:...:: CCDS41 VQMLKTIDAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDP 810 820 830 840 850 860 740 750 pF1KE2 FVIPL-------------------------------GWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSS ::.: .:..:: : .:. .: . :::. CCDS41 FVLPTQASQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDG--WERAFCEKNFLSQ 870 880 890 900 910 920 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 NTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPES-NINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKI- :.... .:. :. .: ..::: .:. : .. : ::.: ..::.. ::.::..... CCDS41 ATMEIIIGMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVD 930 940 950 960 970 980 820 830 840 850 860 pF1KE2 RLNL---GKKRKMVKVYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTD--------FHYNWLIYHLKMRTS : :: : :.: :. . . : .:. .. .. . .:::: :. CCDS41 RENLVLTGPKEKKVRFHPAS---VLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAH 990 1000 1010 1020 1030 1040 870 880 890 pF1KE2 SIY-LYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDNDQE---------------------------T : . :. :.: .: : : . .. :: . CCDS41 RIANIRCCSAVTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAA 1050 1060 1070 1080 1090 1100 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 IAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLI . .:::. : . : :. .::.. :. .....: :. CCDS41 LKLDEWLHFTLEPEAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSK-PWSQVDEATIRAIIAVLSTE 1110 1120 1130 1140 1150 1160 960 970 pF1KE2 KTQEKATPRNFPPRFQDGYYS CCDS41 EQSAGLQQPSGIGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPS 1170 1180 1190 1200 1210 1220 >>CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369 aa) initn: 1467 init1: 586 opt: 842 Z-score: 542.7 bits: 112.4 E(32554): 6.6e-24 Smith-Waterman score: 1878; 38.8% identity (67.3% similar) in 886 aa overlap (138-961:497-1367) 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 KESEAQISWFAPEDHGYGTEVSTKNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDS ::: :... :... :. : ..: CCDS34 LEWSDAEKKREELNKMETNKPRDLFIAKLLNKLKQQQQQ---QQQHSENKRENSEDPEES 470 480 490 500 510 520 170 180 190 200 210 pF1KE2 -EYLLQENEPDG-TLDQKLLEDLQKKKNDLR-------YIEMQHFREKLPSYGMQKELVN : :..... .. .:.. .:::. .: .: : .. . :..:: . . .:. CCDS34 WENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVE 530 540 550 560 570 580 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 LIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYI-ERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVA . :.:.:..:::: ::.::: .:.:.. . .. ..: : :::::::::::.:.:.:: CCDS34 TLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVC 590 600 610 620 630 640 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 AERAESCGSG--NST-GYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLD : . : : :: :::::..:: .. .::::::..:. :: : ::.:::...: CCDS34 DELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESR-ACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVD 650 660 670 680 690 700 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 EIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVV :.:::..::: :. ..:..:. ::::..::::::...:::: :: .::...: : ..:: CCDS34 EVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVE 710 720 730 740 750 760 400 410 420 430 440 pF1KE2 EYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRCQ-FKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDY------V . :::.::. .: :. . :: : . . .: : :.: : . CCDS34 VFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADL 770 780 790 800 810 820 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 RELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYI----VLEEEDGAILVFLPGWDNIST . ..::. : .: .:. :..:.::. :. :. ... .::.:.:::: .:. CCDS34 NPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQ 830 840 850 860 870 880 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 LHDLLMSQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDV :.::: .. : :... .: :::.. : .:. .: ::::::::.:::::::.::: :: CCDS34 LYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDV 890 900 910 920 930 940 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 VYVIDGGKIKETHFDTQNNNSTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLL :.::: :. ::... ... :.. .::::.: ::.::::::. : :...:. : . CCDS34 VFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGF 950 960 970 980 990 1000 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 DDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQ ::..:::::.:::::::.: ::. :::. .:::. ... .. : ...: . . CCDS34 MDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELN 1010 1020 1030 1040 1050 1060 690 700 710 720 730 pF1KE2 E-ELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIP-------- : .::::: ::: :::. .::::..:::.: ::::: :.:: .. :.::. : CCDS34 EPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEAD 1070 1080 1090 1100 1110 1120 740 750 760 770 pF1KE2 --------------------LGWEEARRRG-FRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFA :::..::..: .: : :: . ::. ..: :...: .. CCDS34 LAKSALAMADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELI 1130 1140 1150 1160 1170 1180 780 790 800 810 820 pF1KE2 EHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNEK-----IIKAVICAGLYPKVAKI--RLNLGKKRK . . .::: :: . . :.: :.. . ..:::. :::: .:.:: .. .: CCDS34 KLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEK 1190 1200 1210 1220 1230 1240 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 MVKVYTKTDGLVAVHPKSVNVE-QTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFG .. . ..: . :::.::: . :: ..::.:. :.: . .:: . : ..:. .:.:: CCDS34 LACIVETAQGKAQVHPSSVNRDLQT---HGWLLYQEKIRYARVYLRETTLITPFPVLLFG 1250 1260 1270 1280 1290 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 GDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTKS ::: .: . .. ...: :: ::.:..:: . :.:: .: .:..:.:.:. :: CCDS34 GDIEVQ--HRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLEND--- 1300 1310 1320 1330 1340 1350 950 960 970 pF1KE2 RDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS .:. : .::::. CCDS34 ---KILQIITELIKTENN 1360 >>CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270 aa) initn: 1402 init1: 833 opt: 840 Z-score: 541.8 bits: 112.1 E(32554): 7.4e-24 Smith-Waterman score: 1645; 37.3% identity (65.5% similar) in 814 aa overlap (161-942:345-1125) 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 KNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQK : ::. . .. . : ..:. .:.. CCDS41 LAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQISMDLKNELMYQLEQ 320 330 340 350 360 370 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 KKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIE .::. : .:. :: :: ...:... :....:..: : ::::::::: :::::..:. CCDS41 D-HDLQAI-LQE-RELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQ 380 390 400 410 420 430 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 RGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYC ... : :: ::::::::.::::::: ::.: :.: ::..:..: ::: ..::..: CCDS41 NDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEE--PGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFC 440 450 460 470 480 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 TTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLN :.:..:. :.. . ..::...::::::....: :..:..:... .....:::::.. CCDS41 TVGVLLRKLEAG--IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATID 490 500 510 520 530 540 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 AEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRCQFKRGFMQGHVNRQ . : ::: :::.:.. : :.:: ::.::: :. ..:: :... . : . . CCDS41 TSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDK--------DDD 550 560 570 580 590 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 EKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGA :. .: . : .:. : . .... .. ..:: ::..:: . :: CCDS41 GGEDDDANCNLICGD-------EYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGA 600 610 620 630 640 650 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 ILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIA .:::::::. : :.. : . : : .. :.:::: .: .: .:: .: :: :.... CCDS41 VLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILS 660 670 680 690 700 710 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 TNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNNSTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGH ::::::::::.:::::::. : : : ..:: ..... :.::.: .:::::::::.:: CCDS41 TNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGF 720 730 740 750 760 770 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 CYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLS :.:: . : :. .. ::..::::.:. :.::.::::::. ::.. ..:: .::. . CCDS41 CFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEA 780 790 800 810 820 830 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 IRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP . : ::.::: ..:::::: ::.::.::..:::...: .: : . ::::. : .: CCDS41 EHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEP 840 850 860 870 880 890 740 750 760 pF1KE2 FVIP---LG-----------------------WEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQM :. :: :..:: : . : .: . :. ::.: CCDS41 FINEGKRLGYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRM 900 910 920 930 940 950 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 LHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNE-KIIKAVICAGLYPKVAKIRLNLGK . : :. : :...:: . . .: . ::. .. ... :.::.: . . CCDS41 TWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHK----E 960 970 980 990 1000 830 840 850 860 870 pF1KE2 KRKMVKVYTKTDGLVA-VHPKSVNVE--QTDFHYN--WLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSP :::.. :.: : .: .::: . :..: .... :.:: .: : :.: CCDS41 KRKIL----TTEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTP 1010 1020 1030 1040 1050 1060 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 YCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPV ::.:. : . ..: . . ::.:: .: . : . :: .. :. : ..: . CCDS41 LQLLLFA---SKKVQSDGQIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII 1070 1080 1090 1100 1110 1120 940 950 960 970 pF1KE2 DWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS . : CCDS41 SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYS 1130 1140 1150 1160 1170 1180 >>CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386 aa) initn: 1927 init1: 399 opt: 748 Z-score: 483.8 bits: 101.5 E(32554): 1.3e-20 Smith-Waterman score: 1881; 40.6% identity (66.9% similar) in 859 aa overlap (157-918:491-1345) 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 EVSTKNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYID---RDSEYLLQENEPDGTLDQK ..:.::.. . :. . . . . : CCDS18 NSFVSNQIPEVEKASESEESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGK 470 480 490 500 510 520 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 LLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQF . .... :. . .. . . :..::.. .. ..::. .:::.:::: ::::::::. :: CCDS18 ICKQFRMKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQF 530 540 550 560 570 580 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 ILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRK :::. .. .. :.::::::::::::::::: :::: : ..::::::.: . . CCDS18 ILDDSLNGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVGL--TVGYQIRLES-VKSS 590 600 610 620 630 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 QGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVI .::::::..:. :..: :..::::..::.:::. .:: :. :.::... : :.:: CCDS18 ATRLLYCTTGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVI 640 650 660 670 680 690 370 380 390 400 410 pF1KE2 LMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYV-----PEQKEHRCQF ::::::::: ::.::..::.: ::: :::: ...:::.: ::: : .. . :. CCDS18 LMSATLNAELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMK-QI 700 710 720 730 740 750 420 430 440 450 460 pF1KE2 KRGFMQGHVNRQEKEEKE-----AIY-------KERWPDY---VRELRRRY---SASTVD .. .... :: :: : ... :. :: ..: :: : :.. CCDS18 SKEKLKARRNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIK 760 770 780 790 800 810 470 480 490 500 510 pF1KE2 VIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEED---GAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMF--- .. .:. .::.:.:: ::...:: ... ::::::::: .:. :.. :.:. .: CCDS18 TMSIMDFEKVNLELIEALLEWIVDGKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNR 820 830 840 850 860 870 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 KSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKE .:.. .: :::: . . .: :: . : :: ::.:.::::::::::::::::::.::.:: CCDS18 RSNRCVIHPLHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKE 880 890 900 910 920 930 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 THFDTQNNNSTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRAS-LLDDYQLPEILR ..:.... .. .::.::: ::::::::: : :.::... . . : ::::: : CCDS18 KRYDASKGMESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQR 940 950 960 970 980 990 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 TPLEELCLQIKILRL---GGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLG .:::.:::.::::.. .. .:::..:: .... : .: .:.:: .:.::::: CCDS18 VPLEQLCLRIKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLG 1000 1010 1020 1030 1040 1050 700 710 720 730 pF1KE2 VHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPL--------------- ::: :::. .:::..:::..: ::::.:::::::.::.::: : CCDS18 YHLASLPVDVRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAF 1060 1070 1080 1090 1100 1110 740 750 760 770 780 pF1KE2 -------------GWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGF- ::. . ..: : .:: . :::. .:: . ..: ::.: : :: CCDS18 ANSDYLALLQAYKGWQLSTKEGVRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFA 1120 1130 1140 1150 1160 1170 790 800 810 820 pF1KE2 --------VSSR--------NPKDPESNINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLNLGKKR . .: . :.: :..: :.:.:..::.:::.:.... :: . CCDS18 REGLRAREIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQ 1180 1190 1200 1210 1220 1230 830 840 850 860 870 pF1KE2 KM-------------VKVYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYD : .: ::.:: : .::.::: . : .:.:: :..:: ... : CCDS18 KTSTGAVRMQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIRD 1240 1250 1260 1270 1280 1290 880 890 900 910 920 pF1KE2 CTEVSPYCLLFFGG-DISIQKDNDQETIAVDE-WIVFQSPA-RIAHLVKELRKELDILLQ :. :: : :..::: ....: . . ....:. :: : . . ..:.::: CCDS18 CSMVSVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQ 1300 1310 1320 1330 1340 1350 930 940 950 960 970 pF1KE2 EKIESPHPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS CCDS18 DKIKNPSIDLCTCPRGSRIISTIVKLVTTQ 1360 1370 1380 >>CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194 aa) initn: 1396 init1: 555 opt: 734 Z-score: 475.8 bits: 99.8 E(32554): 3.5e-20 Smith-Waterman score: 1561; 35.2% identity (65.2% similar) in 799 aa overlap (180-934:413-1155) 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 QEKKMFRIRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPS :.:.::: : .... . . .:: CCDS27 ILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLE-LWRRRGPV-----WQEAPQLPV 390 400 410 420 430 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 YGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISA . ..: :..: :.::::.:::::::.. :..:. :. .:.:. : .. :::::::: CCDS27 DPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGARCNVIITQPRRISA 440 450 460 470 480 490 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 ISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVS .:::.::. : . : ..:.:.::.:. : . :..:.::.::.:. :::.: : .:: CCDS27 VSVAQRVSHELGPSLR--RNVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLEGVS 500 510 520 530 540 550 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 HIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGF :...::.:::....: :. ..: : . :...::::: . :.::.:::.::.:..::: CCDS27 HVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYFGGCPVIKVPGF 560 570 580 590 600 610 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 TFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRCQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRE .:: :. :::.. :. :. ... : ..:.:.. :. CCDS27 MYPVKEHYLEDILAKLG------------KHQYLHRH-RHHESEDECAL----------- 620 630 640 650 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 LRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDLLM ::.:.. :. .: . : :.:: :::::..:. ... :. CCDS27 ---------------------DLDLVTDLVLHIDARGEPGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQ 660 670 680 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 SQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDG . .. .:.::.:.:: .: ..: .:.. : ::::::.:::::::::::.:.:.:.:. CCDS27 EALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDS 690 700 710 720 730 740 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 GKIKETHFDTQNNNSTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLLDDYQLP : :: ..: ... : . . :::.::. ::.::::: : : :::. : . .:.: CCDS27 GLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAYHLFPRSRLEKMVPFQVP 750 760 770 780 790 800 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 EILRTPLEELCLQIKI-LRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTP ::::::::.: :: :: . . :::. .: :. .:: .. :.:...::..: :: CCDS27 EILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPNIKAVDEAVILLQEIGVLDQREYLTT 810 820 830 840 850 860 690 700 710 720 730 pF1KE2 LGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPL------------- :: .::.. ..:...: :...:.: :: :.:.... :. .::: : CCDS27 LGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALL 870 880 890 900 910 920 740 750 760 770 pF1KE2 ----------------GWEEARRRGFRYEKD-YCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLG ::::. : : .. : : .: . .:...:.. ::.:.. CCDS27 SHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYE 930 940 950 960 970 980 780 790 800 810 820 pF1KE2 AGFVSSRNPKD-----PESNINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLN----LGKKRKMVK : .:.. :.: . : :..:...:.:. :::::.. ..: . :: . CCDS27 AFLVGK--PSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLMAGLYPNLIQVRQGKVTRQGKFKPNSV 990 1000 1010 1020 1030 1040 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 VYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTS-SIYLYDCTEVSPYC-LLFFGGD .: .: . .: ...: : : .. :: : . .... :... : ..: : ::. :: CCDS27 TYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSRWLTYFMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGD 1050 1060 1070 1080 1090 1100 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 ISIQKDNDQETIAVDE--WIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTKS . :. :. . ::.... . ... .: ..:.::::. : .......: CCDS27 VHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRLLKELRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQE 1110 1120 1130 1140 1150 1160 950 960 970 pF1KE2 RDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS CCDS27 EHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD 1170 1180 1190 >>CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143 aa) initn: 892 init1: 414 opt: 666 Z-score: 433.5 bits: 91.9 E(32554): 8e-18 Smith-Waterman score: 1086; 32.6% identity (59.8% similar) in 682 aa overlap (187-836:142-747) 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 IRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKEL :. .:. : ..:. : :: . ... CCDS12 GPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRI 120 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 VNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERV .. . .:::.:..:.:::::.::: :..: .. ...:::::::. ::.:.:: CCDS12 LQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLL-------AAGFSHVACTQPRRIACISLAKRV 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 AAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGS-ILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDE . : . :: ..:::::..: :. .. :.. :.:..:. .: .: : . ...:: CCDS12 GFESLSQYGS--QVGYQIRFEST--RSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDE 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 IHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVE .:::.:..: :. :.. :: : ::::::::::.: :: ::.: :....:: ::.. CCDS12 VHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPIT- 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 YLLEDVIEKIRYVPEQKEHRCQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYS . : :.. : ....:: . : : . : CCDS12 ---------VVYQPQEAEPT-----------TSKSEKLD---------P---RPFLR--- 340 350 360 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 ASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFK :.: . : : :: : .:::: : .::.. . .. . . CCDS12 -----VLESI-DHKYP-------------PEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYAS-H 370 380 390 400 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 SDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKET .......:::: . ...: .:: .:::::: ...:::::::.::: . .:.:.::.:: CCDS12 TQRWVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEM 410 420 430 440 450 460 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 HFDTQNNNSTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTP .: : . . .. :.:.:.:.::::::::. :: :..:: . . : .::: :. CCDS12 SYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIRRVA 470 480 490 500 510 520 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 LEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLGVHLAR :. : ::.: . .: : ...:: .. .: .: . .:::..: :::.: ::. CCDS12 LDSLVLQMKSMSVGDPRTF--PFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQ 530 540 550 560 570 580 700 710 720 730 pF1KE2 LPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVI-------------PL------- :::. ::::...:..: ..:::::::.:: ..::. :: CCDS12 LPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDP 590 600 610 620 630 640 740 750 760 770 780 pF1KE2 --------GWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNP .: ... . : . .: . . . : . :.. :: : : :.... . CCDS12 FTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQA 650 660 670 680 690 700 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 K---DPESNINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLNLGKKRKMVKVYTKTDGLVAVHPKS : : ... :. .: :. . . . :..::.... . :: CCDS12 AQVGDSYSRLQQRRER--RA-----LHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRA 710 720 730 740 750 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 VNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEW CCDS12 GPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLAQLQAAASSAQDLSREQLALLKLVLGRGLYPQLAVP 760 770 780 790 800 810 >>CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041 aa) initn: 997 init1: 286 opt: 621 Z-score: 405.8 bits: 86.6 E(32554): 2.8e-16 Smith-Waterman score: 1015; 29.0% identity (57.3% similar) in 845 aa overlap (60-882:277-1009) 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 HGGNRGSGGGGGGGGGGRGGRGRHPGHLKGREIGMWYAKKQGQKNKEAERQERAVVHMDE :... : . :...: : .: :: . CCDS46 EAELADEEFLFGDVELSRHERQELKYKRRVRDLAREY-RAAGEQEK-LEATNR--YHMPK 250 260 270 280 290 300 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 RREEQIVQLLNSVQAKNDKESEAQISWFAPEDHGYGTEVSTKNTPCSENKLDIQEKKLIN . . : .. .. :. .. .: : : . . . . ..... .: : .:. CCDS46 ETRGQPARAVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKY-----QLVL 310 320 330 340 350 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 QEKKMFRIRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPS .:.. ... . .. : : : .: : ::.. .: :..:: CCDS46 EEEETIEFVRATQLQGDEE---PSAPPTSTQAQ------QKES-------IQAVRRSLPV 360 370 380 390 400 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 YGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDN-YIERGKGSACRIVCTQPRRIS . ...::. : :::: .: :::: :::::. :..... : ..: .:.::::::.. CCDS46 FPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGM----KIACTQPRRVA 410 420 430 440 450 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 AISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSIL-YCTTGIILQWLQSDPYLSS :.::: ::: : . :: .::.::... .. ..: : : :..:. . :.: :.: CCDS46 AMSVAARVA--REMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSER--TVLRYMTDGMLLREFLSEPDLAS 460 470 480 490 500 510 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 VSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIP : ...:: :::.:..:.:. ..::. :: .:::.. :::... .:: .: . :...:: CCDS46 YSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIP 520 530 540 550 560 570 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 GFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRCQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDYV : ::: :.. .:: ::. CCDS46 GRRFPV------DIF--YTKAPEA---------------------------------DYL 580 590 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 RELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDL . : .:.:... . . : ::::: : ..: . .. CCDS46 E-------ACVVSVLQIH------------------VTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEM 600 610 620 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 LMSQVMFKSDK---FLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVV :... ..: .:..:... .:. :...:. ::::.::.:.::::::::.::. .. CCDS46 LQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGII 630 640 650 660 670 680 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 YVIDGGKIKETHFDTQNNNSTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGL-RASLL ::.: : :. .. ... .... :::.:.:: :::::: :.:..::.. : CCDS46 YVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHEL 690 700 710 720 730 740 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 DDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQ .. .::: :: : .. : .: : . . .: ..::: :..::....:. :.::.. CCDS46 EETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHF--DFLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHL 750 760 770 780 790 800 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 EELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP-FVIPLGWEEARR ::: : ..:.:::.: ..:::: . . : . .::.:: :: .. : : . 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