FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2329, 1313 aa 1>>>pF1KE2329 1313 - 1313 aa - 1313 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.0162+/-0.00047; mu= -31.1869+/- 0.029 mean_var=682.6198+/-140.254, 0's: 0 Z-trim(125.1): 80 B-trim: 0 in 0/61 Lambda= 0.049089 statistics sampled from 48031 (48159) to 48031 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.796), E-opt: 0.2 (0.565), width: 16 Scan time: 20.680 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002964 (OMIM: 168600,183090,601517) ataxin-2 is (1313) 9035 655.8 5.7e-187 NP_001297050 (OMIM: 168600,183090,601517) ataxin-2 (1073) 6735 492.9 5.2e-138 NP_001297052 (OMIM: 168600,183090,601517) ataxin-2 (1006) 5570 410.3 3.4e-113 XP_005255124 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1086) 1492 121.5 3.1e-26 XP_005255125 (OMIM: 607931) PREDICTED: ataxin-2-li (1086) 1492 121.5 3.1e-26 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