Result of FASTA (ccds) for pF1KE2334
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2334, 1555 aa
  1>>>pF1KE2334 1555 - 1555 aa - 1555 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9121+/-0.00135; mu= 19.6292+/- 0.080
 mean_var=64.3025+/-12.969, 0's: 0 Z-trim(99.7): 37  B-trim: 304 in 1/47
 Lambda= 0.159941
 statistics sampled from 5827 (5831) to 5827 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.179), width:  16
 Scan time:  5.470

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2154.1 UGGT1 gene_id:56886|Hs108|chr2          (1555) 10282 2382.5       0
CCDS9480.1 UGGT2 gene_id:55757|Hs108|chr13         (1516) 3401 794.7       0


>>CCDS2154.1 UGGT1 gene_id:56886|Hs108|chr2               (1555 aa)
 initn: 10282 init1: 10282 opt: 10282  Z-score: 12807.0  bits: 2382.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10282; 100.0% identity (100.0% similar) in 1555 aa overlap (1-1555:1-1555)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGCKGDASGACAAGALPVTGVCYKMGVLVVLTVLWLFSSVKADSKAITTSLTTKWFSTPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MGCKGDASGACAAGALPVTGVCYKMGVLVVLTVLWLFSSVKADSKAITTSLTTKWFSTPL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 LLEASEFLAEDSQEKFWNFVEASQNIGSSDHDGTDYSYYHAILEAAFQFLSPLQQNLFKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LLEASEFLAEDSQEKFWNFVEASQNIGSSDHDGTDYSYYHAILEAAFQFLSPLQQNLFKF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 CLSLRSYSATIQAFQQIAADEPPPEGCNSFFSVHGKKTCESDTLEALLLTASERPKPLLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 CLSLRSYSATIQAFQQIAADEPPPEGCNSFFSVHGKKTCESDTLEALLLTASERPKPLLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 KGDHRYPSSNPESPVVIFYSEIGSEEFSNFHRQLISKSNAGKINYVFRHYIFNPRKEPVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KGDHRYPSSNPESPVVIFYSEIGSEEFSNFHRQLISKSNAGKINYVFRHYIFNPRKEPVY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 LSGYGVELAIKSTEYKAKDDTQVKGTEVNTTVIGENDPIDEVQGFLFGKLRDLHPDLEGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LSGYGVELAIKSTEYKAKDDTQVKGTEVNTTVIGENDPIDEVQGFLFGKLRDLHPDLEGQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 LKELRKHLVESTNEMAPLKVWQLQDLSFQTAARILASPVELALVVMKDLSQNFPTKARAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LKELRKHLVESTNEMAPLKVWQLQDLSFQTAARILASPVELALVVMKDLSQNFPTKARAI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 TKTAVSSELRTEVEENQKYFKGTLGLQPGDSALFINGLHMDLDTQDIFSLFDVLRNEARV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 TKTAVSSELRTEVEENQKYFKGTLGLQPGDSALFINGLHMDLDTQDIFSLFDVLRNEARV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 MEGLHRLGIEGLSLHNVLKLNIQPSEADYAVDIRSPAISWVNNLEVDSRYNSWPSSLQEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MEGLHRLGIEGLSLHNVLKLNIQPSEADYAVDIRSPAISWVNNLEVDSRYNSWPSSLQEL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 LRPTFPGVIRQIRKNLHNMVFIVDPAHETTAELMNTAEMFLSNHIPLRIGFIFVVNDSED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LRPTFPGVIRQIRKNLHNMVFIVDPAHETTAELMNTAEMFLSNHIPLRIGFIFVVNDSED
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 VDGMQDAGVAVLRAYNYVAQEVDDYHAFQTLTHIYNKVRTGEKVKVEHVVSVLEKKYPYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 VDGMQDAGVAVLRAYNYVAQEVDDYHAFQTLTHIYNKVRTGEKVKVEHVVSVLEKKYPYV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 EVNSILGIDSAYDRNRKEARGYYEQTGVGPLPVVLFNGMPFEREQLDPDELETITMHKIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 EVNSILGIDSAYDRNRKEARGYYEQTGVGPLPVVLFNGMPFEREQLDPDELETITMHKIL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 ETTTFFQRAVYLGELPHDQDVVEYIMNQPNVVPRINSRILTAERDYLDLTASNNFFVDDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ETTTFFQRAVYLGELPHDQDVVEYIMNQPNVVPRINSRILTAERDYLDLTASNNFFVDDY
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 ARFTILDSQGKTAAVANSMNYLTKKGMSSKEIYDDSFIRPVTFWIVGDFDSPSGRQLLYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ARFTILDSQGKTAAVANSMNYLTKKGMSSKEIYDDSFIRPVTFWIVGDFDSPSGRQLLYD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 AIKHQKSSNNVRISMINNPAKEISYENTQISRAIWAALQTQTSNAAKNFITKMAKEGAAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 AIKHQKSSNNVRISMINNPAKEISYENTQISRAIWAALQTQTSNAAKNFITKMAKEGAAE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 ALAAGADIAEFSVGGMDFSLFKEVFESSKMDFILSHAVYCRDVLKLKKGQRAVISNGRII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ALAAGADIAEFSVGGMDFSLFKEVFESSKMDFILSHAVYCRDVLKLKKGQRAVISNGRII
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 GPLEDSELFNQDDFHLLENIILKTSGQKIKSHIQQLRVEEDVASDLVMKVDALLSAQPKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GPLEDSELFNQDDFHLLENIILKTSGQKIKSHIQQLRVEEDVASDLVMKVDALLSAQPKG
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 DPRIEYQFFEDRHSAIKLRPKEGETYFDVVAVVDPVTREAQRLAPLLLVLAQLINMNLRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 DPRIEYQFFEDRHSAIKLRPKEGETYFDVVAVVDPVTREAQRLAPLLLVLAQLINMNLRV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 FMNCQSKLSDMPLKSFYRYVLEPEISFTSDNSFAKGPIAKFLDMPQSPLFTLNLNTPESW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 FMNCQSKLSDMPLKSFYRYVLEPEISFTSDNSFAKGPIAKFLDMPQSPLFTLNLNTPESW
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 MVESVRTPYDLDNIYLEEVDSVVAAEYELEYLLLEGHCYDITTGQPPRGLQFTLGTSANP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MVESVRTPYDLDNIYLEEVDSVVAAEYELEYLLLEGHCYDITTGQPPRGLQFTLGTSANP
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 VIVDTIVMANLGYFQLKANPGAWILRLRKGRSEDIYRIYSHDGTDSPPDADEVVIVLNNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 VIVDTIVMANLGYFQLKANPGAWILRLRKGRSEDIYRIYSHDGTDSPPDADEVVIVLNNF
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 KSKIIKVKVQKKADMVNEDLLSDGTSENESGFWDSFKWGFTGQKTEEVKQDKDDIINIFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KSKIIKVKVQKKADMVNEDLLSDGTSENESGFWDSFKWGFTGQKTEEVKQDKDDIINIFS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 VASGHLYERFLRIMMLSVLKNTKTPVKFWFLKNYLSPTFKEFIPYMANEYNFQYELVQYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 VASGHLYERFLRIMMLSVLKNTKTPVKFWFLKNYLSPTFKEFIPYMANEYNFQYELVQYK
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE2 WPRWLHQQTEKQRIIWGYKILFLDVLFPLVVDKFLFVDADQIVRTDLKELRDFNLDGAPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 WPRWLHQQTEKQRIIWGYKILFLDVLFPLVVDKFLFVDADQIVRTDLKELRDFNLDGAPY
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE2 GYTPFCDSRREMDGYRFWKSGYWASHLAGRKYHISALYVVDLKKFRKIAAGDRLRGQYQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GYTPFCDSRREMDGYRFWKSGYWASHLAGRKYHISALYVVDLKKFRKIAAGDRLRGQYQG
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE2 LSQDPNSLSNLDQDLPNNMIHQVPIKSLPQEWLWCETWCDDASKKRAKTIDLCNNPMTKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LSQDPNSLSNLDQDLPNNMIHQVPIKSLPQEWLWCETWCDDASKKRAKTIDLCNNPMTKE
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550     
pF1KE2 PKLEAAVRIVPEWQDYDQEIKQLQIRFQKEKETGALYKEKTKEPSREGPQKREEL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 PKLEAAVRIVPEWQDYDQEIKQLQIRFQKEKETGALYKEKTKEPSREGPQKREEL
             1510      1520      1530      1540      1550     

>>CCDS9480.1 UGGT2 gene_id:55757|Hs108|chr13              (1516 aa)
 initn: 5585 init1: 1661 opt: 3401  Z-score: 4226.2  bits: 794.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5730; 55.1% identity (83.8% similar) in 1514 aa overlap (32-1540:17-1515)

              10        20        30           40        50        
pF1KE2 GCKGDASGACAAGALPVTGVCYKMGVLVVLTVLWLF---SSVKADSKAITTSLTTKWFST
                                     :.:::    :.. : ::..:. :..::  :
CCDS94               MAPAKATNVVRLLLGSTALWLSQLGSGTVAASKSVTAHLAAKWPET
                             10        20        30        40      

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE2 PLLLEASEFLAEDSQEKFWNFVEASQNIGSSDHDGTDYSYYHAILEAAFQFLSPLQQNLF
       :::::::::.::.:.::::.:.:. :...   .  .:::::. ::. : :::. :. ::.
CCDS94 PLLLEASEFMAEESNEKFWQFLETVQELAIYKQTESDYSYYNLILKKAGQFLDNLHINLL
         50        60        70        80        90       100      

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE2 KFCLSLRSYSATIQAFQQIAADEPPPEGCNSFFSVHGKKTCESDTLEALLLTASERPKPL
       :: .:.:.:: .:: :::::::::::.:::.:  .: :.::. . .. ::  :. : .: 
CCDS94 KFAFSIRAYSPAIQMFQQIAADEPPPDGCNAFVVIHKKHTCKINEIKKLLKKAASRTRPY
        110       120       130       140       150       160      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE2 LFKGDHRYPSSNPESPVVIFYSEIGSEEFSNFHRQLISKSNAGKINYVFRHYIFNPRKEP
       ::::::..:... . ::::.:.:.:.. :: ::. :  :..  .: ::.:::: .: .. 
CCDS94 LFKGDHKFPTNKENLPVVILYAEMGTRTFSAFHKVLSEKAQNEEILYVLRHYIQKPSSRK
        170       180       190       200       210       220      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE2 VYLSGYGVELAIKSTEYKAKDDTQVKGTEVNTTVIGENDPIDEVQGFLFGKLRDLHPDLE
       .:::::::::::::::::: :::::: : .::::  :..  .::::::::::.... ::.
CCDS94 MYLSGYGVELAIKSTEYKALDDTQVK-TVTNTTVEDETET-NEVQGFLFGKLKEIYSDLR
        230       240       250        260        270       280    

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE2 GQLKELRKHLVESTNEMAPLKVWQLQDLSFQTAARILASPVELALVVMKDLSQNFPTKAR
        .:  ..:.:.::...: :::::.:::::::.:..:...::  .. .:::.::::: :::
CCDS94 DNLTAFQKYLIESNKQMMPLKVWELQDLSFQAASQIMSAPVYDSIKLMKDISQNFPIKAR
          290       300       310       320       330       340    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE2 AITKTAVSSELRTEVEENQKYFKGTLGLQPGDSALFINGLHMDLDTQDIFSLFDVLRNEA
       ..:. ::....: :..:::: ..  . .::::. ::::::..:.:. : ::..:.:. :.
CCDS94 SLTRIAVNQHMREEIKENQKDLQVRFKIQPGDARLFINGLRVDMDVYDAFSILDMLKLEG
          350       360       370       380       390       400    

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE2 RVMEGLHRLGIEGLSLHNVLKLNIQPSEADYAVDIRSPAISWVNNLEVDSRYNSWPSSLQ
       ..:.::. :::.: .. . :::: .  :  :..:::  .: :.:.:: :. : .::.: :
CCDS94 KMMNGLRNLGINGEDMSKFLKLNSHIWEYTYVLDIRHSSIMWINDLENDDLYITWPTSCQ
          410       420       430       440       450       460    

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE2 ELLRPTFPGVIRQIRKNLHNMVFIVDPAHETTAELMNTAEMFLSNHIPLRIGFIFVVNDS
       .::.:.::: . .::.:.::.:...:::.: : .... :..: :...::::::.:..: .
CCDS94 KLLKPVFPGSVPSIRRNFHNLVLFIDPAQEYTLDFIKLADVFYSHEVPLRIGFVFILNTD
          470       480       490       500       510       520    

      540       550       560       570       580        590       
pF1KE2 EDVDGMQDAGVAVLRAYNYVAQEVDDYHAFQTLTHIYNKVRTGEKV-KVEHVVSVLEKKY
       ..::: .:::::. ::.::.:.: :  .:: ...:.:.::.  ...  :..: :::.. .
CCDS94 DEVDGANDAGVALWRAFNYIAEEFDISEAFISIVHMYQKVKKDQNILTVDNVKSVLQNTF
          530       540       550       560       570       580    

       600       610       620       630       640       650       
pF1KE2 PYVEVNSILGIDSAYDRNRKEARGYYEQTGVGPLPVVLFNGMPFEREQLDPDELETITMH
       :.... .:::: : ::..:: . ..:..::.:::: .:.:: ::..:...  ::.  ...
CCDS94 PHANIWDILGIHSKYDEERKAGASFYKMTGLGPLPQALYNGEPFKHEEMNIKELKMAVLQ
          590       600       610       620       630       640    

       660       670       680       690       700        710      
pF1KE2 KILETTTFFQRAVYLGELPHDQDVVEYIMNQPNVVPRINSRILTAERDYLDL-TASNNFF
       .........:: :.:: :    ......:.. :::::::. :: ....::.: ..: .  
CCDS94 RMMDASVYLQREVFLGTLNDRTNAIDFLMDRNNVVPRINTLILRTNQQYLNLISTSVTAD
          650       660       670       680       690       700    

        720       730       740       750       760       770      
pF1KE2 VDDYARFTILDSQGKTAAVANSMNYLTKKGMSSKEIYDDSFIRPVTFWIVGDFDSPSGRQ
       :.:.. : .:::: :.:..:..: :::.         :.:.:  ::.::..:::.::::.
CCDS94 VEDFSTFFFLDSQDKSAVIAKNMYYLTQD--------DESIISAVTLWIIADFDKPSGRK
          710       720       730               740       750      

        780       790       800       810       820       830      
pF1KE2 LLYDAIKHQKSSNNVRISMINNPAKEISYENTQISRAIWAALQTQTSNAAKNFITKMAKE
       ::..:.::.:.: . :...: ::...:. ::: :::.: ::. :: .   ..:. ..:::
CCDS94 LLFNALKHMKTSVHSRLGIIYNPTSKINEENTAISRGILAAFLTQKNMFLRSFLGQLAKE
        760       770       780       790       800       810      

        840       850       860       870       880       890      
pF1KE2 GAAEALAAGADIAEFSVGGMDFSLFKEVFESSKMDFILSHAVYCRDVLKLKKGQRAVISN
         : :. .:  :  : . ::: . :.. ...  .... .: ..:.:::::. :. ...::
CCDS94 EIATAIYSGDKIKTFLIEGMDKNAFEKKYNTVGVNIFRTHQLFCQDVLKLRPGEMGIVSN
        820       830       840       850       860       870      

        900       910       920       930       940       950      
pF1KE2 GRIIGPLEDSELFNQDDFHLLENIILKTSGQKIKSHIQQLRVEEDVASDLVMKVDALLSA
       ::..:::...  :  .::.:::.: ... :.:::. .... .. .  ::..::::::.:.
CCDS94 GRFLGPLDED--FYAEDFYLLEKITFSNLGEKIKGIVENMGINANNMSDFIMKVDALMSS
        880         890       900       910       920       930    

        960       970       980       990      1000      1010      
pF1KE2 QPKGDPRIEYQFFEDRHSAIKLRPKEGETYFDVVAVVDPVTREAQRLAPLLLVLAQLINM
        ::   : .  :... ::.::  :.:.. .:.:.:.:::.:::::..: ::.::...:::
CCDS94 VPKRASRYDVTFLRENHSVIKTNPQENDMFFNVIAIVDPLTREAQKMAQLLVVLGKIINM
          940       950       960       970       980       990    

       1020      1030      1040      1050      1060      1070      
pF1KE2 NLRVFMNCQSKLSDMPLKSFYRYVLEPEISFTSDNSFAKGPIAKFLDMPQSPLFTLNLNT
       ....::::...::. ::.::::.:::::.   ...  . ::.:::::.:.:::. ::. :
CCDS94 KIKLFMNCRGRLSEAPLESFYRFVLEPELMSGANDVSSLGPVAKFLDIPESPLLILNMIT
         1000      1010      1020      1030      1040      1050    

       1080      1090      1100      1110      1120      1130      
pF1KE2 PESWMVESVRTPYDLDNIYLEEVDSVVAAEYELEYLLLEGHCYDITTGQPPRGLQFTLGT
       ::.:.::.:..  :::::.:......:.::::::::::::.:.: .: ::::::::::::
CCDS94 PEGWLVETVHSNCDLDNIHLKDTEKTVTAEYELEYLLLEGQCFDKVTEQPPRGLQFTLGT
         1060      1070      1080      1090      1100      1110    

       1140      1150      1160      1170      1180      1190      
pF1KE2 SANPVIVDTIVMANLGYFQLKANPGAWILRLRKGRSEDIYRIYSHDGTDSPPDADEVVIV
       . .:..:::::::. ::::::::::::::::..:.:::::.: .:.::::  : .....:
CCDS94 KNKPAVVDTIVMAHHGYFQLKANPGAWILRLHQGKSEDIYQIVGHEGTDSQADLEDIIVV
         1120      1130      1140      1150      1160      1170    

       1200      1210      1220      1230      1240      1250      
pF1KE2 LNNFKSKIIKVKVQKKADMVNEDLLSDGTSENESGFWDSFKWGFTGQKTEEVKQDKDDII
       ::.:::::.::::.:..: ..::.:.:  .:. .:.:::.: .:: .  .: :..:: ..
CCDS94 LNSFKSKILKVKVKKETDKIKEDILTD-EDEKTKGLWDSIK-SFTVSLHKENKKEKD-VL
         1180      1190      1200       1210       1220       1230 

       1260      1270      1280      1290      1300      1310      
pF1KE2 NIFSVASGHLYERFLRIMMLSVLKNTKTPVKFWFLKNYLSPTFKEFIPYMANEYNFQYEL
       :::::::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::: ::.::.::.:.:::
CCDS94 NIFSVASGHLYERFLRIMMLSVLRNTKTPVKFWLLKNYLSPTFKEVIPHMAKEYGFRYEL
            1240      1250      1260      1270      1280      1290 

       1320      1330      1340      1350      1360      1370      
pF1KE2 VQYKWPRWLHQQTEKQRIIWGYKILFLDVLFPLVVDKFLFVDADQIVRTDLKELRDFNLD
       :::.:::::.::::.::::::::::::::::::.:::..::::::::: ::::::::.::
CCDS94 VQYRWPRWLRQQTERQRIIWGYKILFLDVLFPLAVDKIIFVDADQIVRHDLKELRDFDLD
            1300      1310      1320      1330      1340      1350 

       1380      1390      1400      1410      1420      1430      
pF1KE2 GAPYGYTPFCDSRREMDGYRFWKSGYWASHLAGRKYHISALYVVDLKKFRKIAAGDRLRG
       :::::::::::::::::::::::.:::::::  :::::::::::::::::.:.::::::.
CCDS94 GAPYGYTPFCDSRREMDGYRFWKTGYWASHLLRRKYHISALYVVDLKKFRRIGAGDRLRS
            1360      1370      1380      1390      1400      1410 

       1440      1450      1460      1470      1480      1490      
pF1KE2 QYQGLSQDPNSLSNLDQDLPNNMIHQVPIKSLPQEWLWCETWCDDASKKRAKTIDLCNNP
       :::.::::::::::::::::::::.:: ::::::.:::::::::: ::.:::::::::::
CCDS94 QYQALSQDPNSLSNLDQDLPNNMIYQVAIKSLPQDWLWCETWCDDESKQRAKTIDLCNNP
            1420      1430      1440      1450      1460      1470 

       1500      1510      1520      1530      1540      1550     
pF1KE2 MTKEPKLEAAVRIVPEWQDYDQEIKQLQIRFQKEKETGALYKEKTKEPSREGPQKREEL
        ::: ::.::.:::::: .:: ::.::  .....:.   : ...               
CCDS94 KTKESKLKAAARIVPEWVEYDAEIRQLLDHLENKKQDTILTHDEL              
            1480      1490      1500      1510                    




1555 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 18:16:25 2016 done: Sun Nov  6 18:16:26 2016
 Total Scan time:  5.470 Total Display time:  0.160

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com