Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2347, 738 aa
1>>>pF1KE2347 738 - 738 aa - 738 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1187+/-0.00102; mu= 13.7578+/- 0.061
mean_var=166.8506+/-33.291, 0's: 0 Z-trim(110.5): 82 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.099291
statistics sampled from 11596 (11678) to 11596 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.359), width: 16
Scan time: 4.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 ( 738) 4827 704.1 1.9e-202
CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 718) 1445 219.6 1.3e-56
CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 735) 1445 219.7 1.3e-56
CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 630) 1428 217.2 6.5e-56
CCDS9241.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 766) 1380 210.4 8.7e-54
CCDS64800.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 ( 693) 1302 199.1 1.9e-50
CCDS58287.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 681) 1195 183.8 7.6e-46
CCDS58288.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 683) 1191 183.2 1.1e-45
CCDS5607.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1232) 1176 181.3 7.6e-45
CCDS5605.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1279) 1176 181.4 7.9e-45
CCDS5606.1 ABCB4 gene_id:5244|Hs108|chr7 (1286) 1176 181.4 7.9e-45
CCDS5608.1 ABCB1 gene_id:5243|Hs108|chr7 (1280) 1175 181.2 8.7e-45
CCDS78129.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 686) 1147 176.9 9e-44
CCDS4758.1 TAP1 gene_id:6890|Hs108|chr6 ( 808) 1147 177.0 1e-43
CCDS55090.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 (1257) 1093 169.5 2.9e-41
CCDS46444.1 ABCB11 gene_id:8647|Hs108|chr2 (1321) 1069 166.0 3.3e-40
CCDS4755.1 TAP2 gene_id:6891|Hs108|chr6 ( 653) 1050 163.0 1.3e-39
CCDS2436.1 ABCB6 gene_id:10058|Hs108|chr2 ( 842) 818 129.9 1.6e-29
CCDS65291.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 752) 801 127.4 8e-29
CCDS14428.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 753) 801 127.4 8e-29
CCDS65290.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 712) 765 122.2 2.7e-27
CCDS75994.1 ABCB7 gene_id:22|Hs108|chrX ( 713) 765 122.2 2.7e-27
CCDS42122.1 ABCC1 gene_id:4363|Hs108|chr16 (1531) 645 105.4 7e-22
CCDS5371.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 812) 622 101.8 4.4e-21
CCDS7484.1 ABCC2 gene_id:1244|Hs108|chr10 (1545) 624 102.4 5.7e-21
CCDS4896.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1464) 623 102.2 6.1e-21
CCDS56430.1 ABCC10 gene_id:89845|Hs108|chr6 (1492) 623 102.2 6.1e-21
CCDS10568.1 ABCC6 gene_id:368|Hs108|chr16 (1503) 605 99.6 3.7e-20
CCDS31437.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1581) 603 99.4 4.7e-20
CCDS73264.1 ABCC8 gene_id:6833|Hs108|chr11 (1582) 603 99.4 4.7e-20
CCDS32681.1 ABCC3 gene_id:8714|Hs108|chr17 (1527) 593 97.9 1.2e-19
CCDS58286.1 ABCB9 gene_id:23457|Hs108|chr12 ( 703) 572 94.6 5.7e-19
CCDS8693.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 576 95.5 6.7e-19
CCDS8694.1 ABCC9 gene_id:10060|Hs108|chr12 (1549) 555 92.5 5.4e-18
CCDS10732.1 ABCC11 gene_id:85320|Hs108|chr16 (1382) 540 90.3 2.2e-17
CCDS43176.1 ABCC5 gene_id:10057|Hs108|chr3 (1437) 540 90.3 2.3e-17
CCDS9474.1 ABCC4 gene_id:10257|Hs108|chr13 (1325) 511 86.1 3.8e-16
CCDS10730.1 ABCC12 gene_id:94160|Hs108|chr16 (1359) 502 84.8 9.5e-16
CCDS55092.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 126) 466 78.7 6.3e-15
CCDS55091.1 ABCB5 gene_id:340273|Hs108|chr7 ( 131) 466 78.7 6.5e-15
>>CCDS1580.1 ABCB10 gene_id:23456|Hs108|chr1 (738 aa)
initn: 4827 init1: 4827 opt: 4827 Z-score: 3747.9 bits: 704.1 E(32554): 1.9e-202
Smith-Waterman score: 4827; 100.0% identity (100.0% similar) in 738 aa overlap (1-738:1-738)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRGPPAWPLRLLEPPSPAEPGRLLPVACVWAAASRVPGSLSPFTGLRPARLWGAGPALLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MRGPPAWPLRLLEPPSPAEPGRLLPVACVWAAASRVPGSLSPFTGLRPARLWGAGPALLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GVGAARRWRSGCRGGGPGASRGVLGLARLLGLWARGPGSCRCGAFAGPGAPRLPRARFPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GVGAARRWRSGCRGGGPGASRGVLGLARLLGLWARGPGSCRCGAFAGPGAPRLPRARFPG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GPAAAAWAGDEAWRRGPAAPPGDKGRLRPAAAGLPEARKLLGLAYPERRRLAAAVGFLTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GPAAAAWAGDEAWRRGPAAPPGDKGRLRPAAAGLPEARKLLGLAYPERRRLAAAVGFLTM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVDYSDNLTRLCLGLSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVDYSDNLTRLCLGLSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTGELINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLRAGAQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 QRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTGELINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLRAGAQA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLARKEAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLARKEAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 MGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSSFYSELMKGLGAGGRLWELLEREPKLPFNEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSSFYSELMKGLGAGGRLWELLEREPKLPFNEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPIFQDFSLSIPSGSVTALVGPSGSGKSTVLSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPIFQDFSLSIPSGSVTALVGPSGSGKSTVLSLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSKIGTVSQEPILFSCSIAENIAYGADDPSSVTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSKIGTVSQEPILFSCSIAENIAYGADDPSSVTA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEKGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 EEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEKGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 TSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAHRLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 TSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAHRLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEELLS
670 680 690 700 710 720
730
pF1KE2 KPNGIYRKLMNKQSFISA
::::::::::::::::::
CCDS15 KPNGIYRKLMNKQSFISA
730
>>CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 (718 aa)
initn: 1377 init1: 796 opt: 1445 Z-score: 1129.8 bits: 219.6 E(32554): 1.3e-56
Smith-Waterman score: 1447; 37.7% identity (68.9% similar) in 716 aa overlap (45-735:13-695)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 PSPAEPGRLLPVACVWAAASRVPGSLSPFTGLRPARLWGAGPALLWGVGAARRWRSGCRG
: :.:: : : . . .: :. .: :
CCDS59 MLVHLFRVGIRGGPFPGRLL---PPLRFQTFSAVRYSDGYR-
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 GGPGASRGVLGLARLLG-LWARGPGSCRCGAFAGPGAPRLPRARFPGGPAAAAWAGDE--
.: . ..:.: . :::. : . : ::: .:.: :.:
CCDS59 ----SSSLLRAVAHLRSQLWAHLPRA--------PLAPRW-------SPSAWCWVGGALL
40 50 60 70
140 150 160 170
pF1KE2 ---AWRRGP-----------AAPPGDKGRLRPAAAGLPEARKLL-GLAYPERRRLAAAVG
. . : :::... : ..: ::. . .:. :..::
CCDS59 GPMVLSKHPHLCLVALCEAEEAPPASS---TPHVVGSRFNWKLFWQFLHPHLLVLGVAVV
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FLTMSSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVDYSDNLTRLCLGLSA--VFLCGAAANAIRVY
. ....... :..::....:. .. : :. .. .::. ..: :. . :
CCDS59 LALGAALVNVQIPLLLGQLVEVV-AKYTRDHVGSFMTESQNLSTHLLILYGVQGLLTFGY
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LMQTS--GQRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTGELINRLSSDTALLGRSVTENLSD
:. : :.:.. .: .::::.:::...::: ..::.:..::..:. . : .:.
CCDS59 LVLLSHVGERMAVDMRRALFSSLLRQDITFFDANKTGQLVSRLTTDVQEFKSSFKLVISQ
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 GLRAGAQASVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQ
:::. .:.. . . ..: :. ... ..: . .....: ::::.. :...:.:
CCDS59 GLRSCTQVAGCLVSLSMLSTRLTLLLMVATPALMGVGTLMGSGLRKLSRQCQEQIARAMG
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360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LAEERIGNVRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLARKEAFAR--AGFFGATGLSGNLIV
.:.: .:::::::::. :. : :.:..... : : ..: : : : .... : .:
CCDS59 VADEALGNVRTVRAFAMEQREEERYGAELEACR--CRAEELGRGIALFQGLSNIAFNCMV
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSSFYSELMKGLGAGGRLWELLE
:..:. :: :... ..: :.: :::. . : :...:: .......::.::.:..: .
CCDS59 LGTLFIGGSLVAGQQLTGGDLMSFLVASQTVQRSMANLSVLFGQVVRGLSAGARVFEYMA
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 REPKLPFNEGVILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPIFQDFSLSIPSGSVTALVGPSG
.: .:.. : . .....:.. :.:: :.:: :: ...::.:..: :...:::: ::
CCDS59 LNPCIPLSGGCCVPKEQLRGSVTFQNVCFSYPCRPGFEVLKDFTLTLPPGKIVALVGQSG
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580
pF1KE2 SGKSTVLSLLLRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSKI-GTVSQEPILFSCSIAENIA
.::.:: ::: :.:::..:.. :::.:.: :.: :::... : .::::.::. .: :::
CCDS59 GGKTTVASLLERFYDPTAGVVMLDGRDLRTLDPSWLRGQVVGFISQEPVLFGTTIMENIR
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 YGADDPSSVTAEEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEKGVLLSGGQKQRIAIARALL
.: . :. ::. .:. ::: :: .::.:.::::::.:. ::::::::.::::::.
CCDS59 FGKLEASD---EEVYTAAREANAHEFITSFPEGYNTVVGERGTTLSGGQKQRLAIARALI
560 570 580 590 600 610
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pF1KE2 KNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAHRLSTIKNANMVAVLDQGKI
:.: .:.:::::::::::.: .::::::: :::::::::::::...:. ..:. .:..
CCDS59 KQPTVLILDEATSALDAESERVVQEALDRASAGRTVLVIAHRLSTVRGAHCIVVMADGRV
620 630 640 650 660 670
710 720 730
pF1KE2 TEYGKHEELLSKPNGIYRKLMNKQSFISA
: : :::::.: .:.: .:. .:..
CCDS59 WEAGTHEELLKK-GGLYAELIRRQALDAPRTAAPPPKKPEGPRSHQHKS
680 690 700 710
>>CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7 (735 aa)
initn: 1377 init1: 796 opt: 1445 Z-score: 1129.6 bits: 219.7 E(32554): 1.3e-56
Smith-Waterman score: 1454; 37.6% identity (68.7% similar) in 718 aa overlap (45-735:13-712)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 PSPAEPGRLLPVACVWAAASRVPGSLSPFTGLRPARLWGAGPALLWGVGAARR--WRSGC
: :.:: : : . . .: : ::.:
CCDS64 MLVHLFRVGIRGGPFPGRLL---PPLRFQTFSAVRNTWRNG-
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 RGGGPGASRGVLGLARLLGLWARGPGSCRCGAFAG-PGAPRLPRARFPGGPAAAAWAGDE
. : ..: . . . :. . : .: : :: :: .:.: :.:
CCDS64 KTGQLHKAEGEYSDGYRSSSLLRAVAHLRSQLWAHLPRAPLAPR----WSPSAWCWVGGA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170
pF1KE2 -----AWRRGP-----------AAPPGDKGRLRPAAAGLPEARKLL-GLAYPERRRLAAA
. . : :::... : ..: ::. . .:. :..:
CCDS64 LLGPMVLSKHPHLCLVALCEAEEAPPASS---TPHVVGSRFNWKLFWQFLHPHLLVLGVA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VGFLTMSSVISMSAPFFLGKIIDVIYTNPTVDYSDNLTRLCLGLSA--VFLCGAAANAIR
: . ....... :..::....:. .. : :. .. .::. ..: :. .
CCDS64 VVLALGAALVNVQIPLLLGQLVEVV-AKYTRDHVGSFMTESQNLSTHLLILYGVQGLLTF
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 VYLMQTS--GQRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTGELINRLSSDTALLGRSVTENL
::. : :.:.. .: .::::.:::...::: ..::.:..::..:. . : .
CCDS64 GYLVLLSHVGERMAVDMRRALFSSLLRQDITFFDANKTGQLVSRLTTDVQEFKSSFKLVI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 SDGLRAGAQASVGISMMFFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQA
:.:::. .:.. . . ..: :. ... ..: . .....: ::::.. :...:.:
CCDS64 SQGLRSCTQVAGCLVSLSMLSTRLTLLLMVATPALMGVGTLMGSGLRKLSRQCQEQIARA
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KE2 TQLAEERIGNVRTVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLARKEAFAR--AGFFGATGLSGNL
.:.: .:::::::::. :. : :.:..... : : ..: : : : .... :
CCDS64 MGVADEALGNVRTVRAFAMEQREEERYGAELEACR--CRAEELGRGIALFQGLSNIAFNC
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 IVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIGGLSSFYSELMKGLGAGGRLWEL
.::..:. :: :... ..: :.: :::. . : :...:: .......::.::.:..:
CCDS64 MVLGTLFIGGSLVAGQQLTGGDLMSFLVASQTVQRSMANLSVLFGQVVRGLSAGARVFEY
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LEREPKLPFNEGVILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPIFQDFSLSIPSGSVTALVGP
. .: .:.. : . .....:.. :.:: :.:: :: ...::.:..: :...::::
CCDS64 MALNPCIPLSGGCCVPKEQLRGSVTFQNVCFSYPCRPGFEVLKDFTLTLPPGKIVALVGQ
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 SGSGKSTVLSLLLRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWLRSKI-GTVSQEPILFSCSIAEN
::.::.:: ::: :.:::..:.. :::.:.: :.: :::... : .::::.::. .: ::
CCDS64 SGGGKTTVASLLERFYDPTAGVVMLDGRDLRTLDPSWLRGQVVGFISQEPVLFGTTIMEN
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 IAYGADDPSSVTAEEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTVVGEKGVLLSGGQKQRIAIARA
: .: . :. ::. .:. ::: :: .::.:.::::::.:. ::::::::.:::::
CCDS64 IRFGKLEASD---EEVYTAAREANAHEFITSFPEGYNTVVGERGTTLSGGQKQRLAIARA
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 LLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAHRLSTIKNANMVAVLDQG
:.:.: .:.:::::::::::.: .::::::: :::::::::::::...:. ..:. .:
CCDS64 LIKQPTVLILDEATSALDAESERVVQEALDRASAGRTVLVIAHRLSTVRGAHCIVVMADG
630 640 650 660 670 680
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CCDS92 HNEPVANGSHKA
760
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390 400 410 420 430 440
pF1KE2 LARKEAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVGISIG
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CCDS58 LNRKEAAAYMYYVWGSGLTLLVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCME
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450 460 470 480 490 500
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CCDS58 SVGSVYSGLMQGVGAAEKVFEFIDRQPTM-VHDGS-LAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPH
470 480 490 500 510
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pF1KE2 VPIFQDFSLSIPSGSVTALVGPSGSGKSTVLSLLLRLYDPASGTISLDGHDIRQLNPVWL
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CCDS58 TQVLQNVSFSLSPGKVTALVGPSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYL
520 530 540 550 560 570
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pF1KE2 RSKIGTVSQEPILFSCSIAENIAYGADDPSSVTAEEIQRVAEVANAVAFIRNFPQGFNTV
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CCDS58 HRVISLVSQEPVLFARSITDNISYGL--PT-VPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTE
580 590 600 610 620 630
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pF1KE2 VGEKGVLLSGGQKQRIAIARALLKNPKILLLDEATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVL
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CCDS58 TGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLCAG
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CCDS56 QVSFWTLAAGRQIRKIRQKFFHAILRQEIGWFDINDTTELNTRLTDDISKISEGIGDKVG
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CCDS56 MFFQAVATFFAGFIVGFIRGWKLTLVIMAISPILGLSAAVWAKILSAFSDKELAAYAKAG
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CCDS56 AVAEEALGAIRTVIAFGGQNKELERYQKHLENAKEIGIKKAIS-ANI--SMGIAFLLIYA
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pF1KE2 S---VLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVG-ISIGGLSSFYSELMKGLGAGGRLWE
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CCDS56 SYALAFWYGSTLVISKEYTIGNAMT-VFFSILIGAFSVGQAAPCIDAFANARGAAYVIFD
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pF1KE2 LLEREPKLP-FNE-GVILNEKSFQGALEFKNVHFAYPARPEVPIFQDFSLSIPSGSVTAL
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CCDS56 ENICYGR---GNVTMDEIKKAVKEANAYEFIMKLPQKFDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIA
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CCDS56 RALVRNPKILLLDEATSALDTESEAEVQAALDKAREGRTTIVIAHRLSTVRNADVIAGFE
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CCDS56 DGVIVEQGSHSELMKK-EGVYFKLVNMQTSGSQIQSEEFELNDEKAATRMAPNGWKSRLF
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:.::: .. .: .:. : : . . : : :.:.. :.
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CCDS56 SEEGLKPDKFEGNITFNEVVFNYPTRANVPVLQGLSLEVKKGQTLALVGSSGCGKSTVVQ
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CCDS56 LLERFYDPLAGTVLLDGQEAKKLNVQWLRAQLGIVSQEPILFDCSIAENIAYG-DNSRVV
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CCDS56 SQDEIVSAAKAANIHPFIETLPHKYETRVGDKGTQLSGGQKQRIAIARALIRQPQILLLD
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pF1KE2 EATSALDAENEYLVQEALDRLMDGRTVLVIAHRLSTIKNANMVAVLDQGKITEYGKHEEL
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CCDS56 EATSALDTESEKVVQEALDKAREGRTCIVIAHRLSTIQNADLIVVFQNGRVKEHGTHQQL
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CCDS56 LAQ-KGIYFSMVSVQAGTQNL
1220 1230
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CCDS56 QVSFWTLAAGRQIRKIRQKFFHAILRQEIGWFDINDTTELNTRLTDDISKISEGIGDKVG
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CCDS56 MFFQAVATFFAGFIVGFIRGWKLTLVIMAISPILGLSAAVWAKILSAFSDKELAAYAKAG
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CCDS56 SYALAFWYGSTLVISKEYTIGNAMT-VFFSILIGAFSVGQAAPCIDAFANARGAAYVIFD
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CCDS56 IIDNNPKIDSFSERG--HKPDSIKGNLEFNDVHFSYPSRANVKILKGLNLKVQSGQTVAL
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CCDS56 VGSSGCGKSTTVQLIQRLYDPDEGTINIDGQDIRNFNVNYLREIIGVVSQEPVLFSTTIA
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CCDS56 EILTRRLRSMAFKAMLRQDMSWFDDHKNSTGALSTRLATDAAQVQGATGTRLALIAQNIA
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CCDS56 NLGTGIIISFIYGWQLTLLLLAVVPIIAVSGIVEMKLLAGNAKRDKKELEAAGKIATEAI
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CCDS56 ENIRTVVSLTQE----RKFESMYVEKLYGPYRNSVQKAHIYGITFSISQAFMYFSYAGCF
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CCDS56 RFGAYLIVNGHMRFRDVILVFSAIVFGAVALGHASSFAPDYAKAKLSAAHLFMLFERQPL
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CCDS56 HQQLLAQ-KGIYFSMVSVQAGTQNL
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738 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]